Promotor metilacija in izražanje TIMP3 gena v želodcu cancer

Promotor metilacije in izražanja TIMP3 gena raka želodca
Abstract
ozadju
želodca razvoj karcinoma je proces, večstopenjska, ki vključuje več kot en gen. Neobičajne spremembe v metilacije DNA, se štejejo kot tretji mehanizem, ki vodi do anti-onkogena inaktivacije, ki ima ključno vlogo pri razvoju tumorjev. V tej študiji smo ocenili odnos med odklonskega metilacije promotorja CpG otoki zaviralec tkiva metalo 3 (TIMP3) gena, svoje beljakovin izražanja ter clinicopathological značilnosti adenokarcinomom želodca.
Metode
metilacijskega statusa od promotorja CpG otokov in izražanje proteinov TIMP3 gena v tumorjih in sosednjih normalnih tkivih sluzničnih 78 bolnikov z adenokarcinomom želodca so odkrile metilacije specifične PCR (PPN) in imunohistokemijo.
Rezultati
CPG otoku metitiranjem TIMP3 je bila odkrita v tumorskih tkivih, rakom, ki mejijo tkiv in bezgavke z metastazami. V naraščajočem vrstnem redu, so bili hypermethylation pogostost teh tkiv 35,9% (28 od 78 ne-neoplastične tkiva), 85% (17 od 20 primerov v zgodnji fazi), 89,7% (52 od 58 primerov progresivne faze), in 100% (78 78 metastatskega bezgavke). Označena Razlika je bilo med tumorjev in ne-neoplastičnih tkiv (P
< 0,05), vendar pa ni nobene razlike med podskupinami tumorjev obstajala (P
> 0,05). Analiza Imunohistokemija potrdili TIMP3 down-regulacije v tumorskih tkivih. Stopnja TIMP3 izražanja genov v ne-neoplastične tkiva je 100%, ampak očitno je zmanjšal na različnem obsegu v različnih fazah, kar pomeni, zmanjšal na 30% (6/20) v zgodnji fazi, na 3,4% (2/58) na progresivni stopnji, in na 0% (0/78) v metastatskih bezgavk. Med 70 tumorskih tkiv z negativno TIMP3 izražanja, 64 (91,4%) so bili hypermethylated in 6 so nemetiliran (8,6%), kar kaže na pomembno povezavo med hypermethylation in zmanjša ali negativni TIMP3 izraz (P
< 0,01).
Zaključek
hypermethylation promotorja regiji CpG otokov je glavni mehanizem TIMP3 izražanju genov in lahko predloži dokaze za diagnostiko in fazi evalvacije molekularne raka želodca.
Virtualni drsi
virtualne diapozitivov za to članek najdete tukaj: http:... //www diagnosticpathol vili diagnomx eu /vs /1756134016954958
Ključne besede
adenokarcinomom želodca tkiva zaviralec metalo-3 (TIMP3) metilacije Ozadje
želodca raka (ali karcinom želodca) je eden izmed najpogostejših malignih sprememb v svetu. Razvoj bolezen raka želodca je postopek večstopenjska, ki vključuje več kot en gen. Bolezni dejavniki navsezadnje delujejo na različnih genov v različnih fazah, povzroči spremembo genske strukture in izražanja ravni, ki vodijo k razvoju želodca karcinogeneze. Izgubo funkcije anti-onkogena lahko pride po različnih poteh. Poleg izbrise in mutacije so neobičajne spremembe v metilacije DNA obravnava kot tretja mehanizem, ki vodi do anti-onkogena inaktivacijo [1, 2], ki ima ključno vlogo pri razvoju tumorjev. CpG otokov, ki so CpG bogati zaporedji, ki se nahajajo v smeri proti toku promotorski regiji gena gospodinjstvu, so regije, pri katerih običajno ne pojavljajo citozin metilacija, čeprav stimulacijo z nekaterimi dejavniki vodi v njeno metilacije. Zato je ekspresija DNK inhibiran v tej regiji [3]. Inaktivacijo mnogih tumor povezan genov kot P16, THBS1, TIMP3, hMLH1 in MGMT so povezani z metiliranjem njunih promotorskih regijah [4-8]. Tkivo zaviralec metalo-3 (TIMP3) je povezano z razvojem tumorja, zlasti antagonizira dejavnost matriksnih metaloproteinaz, kot tudi inhibira rast tumorja, angiogenezo, invazijo in metastaz [9].
V tem delu, smo odkrili metilacije od TIMP3 promotor gena CpG otoku in izražanja proteinov v normalnih želodčne sluznice tkiv, želodčnih rakavih tkiv in metastatskih bezgavk 78 bolnikov z rakom želodca uporabo metilacijo specifični PCR (PPN) in imunohistokemično. Raziskovali smo korelacijo gen promotorja metilacije z ustrezno izražanje proteinov in nato analiziral odnos nenormalno TIMP3 gen CpG otoku metilacije z razvojem, kot tudi klinične in patološke značilnosti, za adenokarcinomom želodca.
Materiali in metode
materiali
vseh 78 primerov želodčnega normalnega tkiva, karcinom želodca in metastatskih bezgavk so bili preverjeni s patološko diagnozo. Vzorce tumor so bili pridobljeni od marca 1998 do maja 2005, na prvi odvisnimi Bolnice in Liaoning Provincial tumor bolnišnici od pooperacijskih bolnikih z rakom želodca (moški: n
= 54; ženske: n
= 24) s povprečno starostjo od 56,2 ± 7,5 let. Med vzorcev, dobljenih, 20 je bilo od zgodnjega raka želodca, 58 so bili napredovalim rakom želodca, 44 je bilo diferenciacije, in 14 so nediferencirani. Tumor uprizoritev je temeljila na počivališčih standardih Mednarodne zveze proti raku TNM, pisanjem želodčnega raka rast Way in statutom uprizoritev in želodčnega raka tipkanje na Japonskem [10-12] iz Kitajske Medical University Cancer Institute. Hidrokinon (10 mmol /l) in natrijev bisulfat (3,9 mol /L) smo nabavili pri Sigma. DNA Clean-up sistem je bila kupljena od Promega. TIMP3 protitelesa in SP kit bili kupljeni od Boster biološki Engineering Co, Ltd (Dalian). Vsi osebki so ravna in je anonimen po etičnih in pravnih standardov. Protokol je odobril Odbor za etiko Medicinske tumorskih Hospital Liaoning deželne in China Medical University.
PPN
Pri metodi PPN [13], je bila predelava methylase izvedena na normalnih perifernih krvnih celic in se uporablja kot pozitivne kontrole. Neobdelane celice smo uporabili kot negativni kontroli. Sekvence metiliranega (TIMP3-U) primerji (TIMP3 M) in nemetiliran so bili, kot sledi: (1) TIMP3-M grundirne sekvence, 5'CGTTTCGTTATTTTTTGTTTTTCGGTTTTC-3 'in 5'-CCGAAAACCCCGCCTCG-3'; in (2) TIMP3-U oligonukleotidov zaporedja, 5'-TTTTGTTTTGTTATTTTTTGTTTTTGGTTTT-3 'in 5'-CCCCCCAAAAACCCCACCTCA-3'. Reakcijski pogoji PCR so bili naslednji: 95 ° C začetno denaturacijo za 5 min, 95 ° C denaturacija 30 sekund (40 ciklov), 59 ° C žarjenje za 60s (40 ciklov), 72 ° C podaljšek 60. (40 ciklov ) in 72 podaljšek ° C za 10 minut. Agaroznega gela elektroforeza in EB obarvanje smo nato izvedli. Podatki iz geli so bili zbrani s skenerjem z gostoto laser (Pharmacia LKB Ultroscan) in nato analizirali. Vse poskuse smo ponovili trikrat, in srednja vrednost je bila uporabljena za statistično analizo.
Imunohistokemija
Za imunohistokemijo, smo uporabili metodo barvanja streptomycesavidin peroksidazo. Imunohistokemijsko smo izvedli po navodilih proizvajalca. Kot diagnostični kriterij, je bila opazovanje rjavkasto rumen citoplazmi po obarvanju velja za pozitiven rezultat za TIMP3 izražanja. Za nadzor, je običajna območje tkiva obarvali kot pozitivno kontrolo in normalno odsek tkivo smo uporabili kot negativno kontrolo in obarvamo s PBS namesto primarnega protitelesa. Točkovanje Standard je bila izvedena v skladu z metodo, ki jo Shimizu [14] opisanega. Ugotovili smo intenzivnost in porazdelitev pozitivnih celic pri visoki povečavi barvila; no obarvanje je dosegel kot 0, šibko madeži pa precej močnejši, kot je bila negativna kontrola dosegel kot 1, je jasno madež dosegel kot 2, in močan madež je dosegel kot 3. Ne pozitivna kontrola celica Zadel kot 0. Potrebno število pozitivnih celic, kar pomeni, < 30%, 30% -60%, in > 60%, smo ocenili kot 1, 2 in 3, oz. Na osnovi celotnih točk, smo ocenili vzorce za TIMP3 ekspresijo. Rezultatom ≤2 je bil razvrščen kot negativen, je bil rezultat 3 šibko pozitiven, če je ocena segajo od 4 do 5 je bil pozitiven, in rezultat 6 je bil zelo pozitiven.
Statistična analiza
Razlike med TIMP3 genski promotor stopnja metilacija in beljakovin izraz vzorcih so bile ugotovljene statistično analizirajo χ
2 in Fisher metod. Vsi podatki so bili analizirani z statistične programske opreme SPSS12.
Rezultati
TIMP3 genske analize promotor metilacija PODJETJA
Izvleček genomske DNA iz vzorca je bila dopolnjena s PPN. Velikosti metilirane in nemetiliran PCR produkta je bilo 116 in 122 bp oz. TIMP3 genski promotor metilacija pojav, so na splošno opažali v normalnih želodčnih tkivih, karcinom želodca in vzorcev bezgavk metastaz. Stopnje pozitivne zaznavanja so bili naslednji: 85% (17/20) za zgodnjega raka želodca, 89,7% (52/58) za napredovalega raka želodca, 98,7% (77/78) za metastatskih bezgavk, in le 35,9% (28 /78) za normalno želodčnega tkiva. Znatno povečanje TIMP3 promotor gena metilacije so opazili pri vseh želodčnih skupinah z rakom (P
< 0,01; slika 1 in tabela 1), kar kaže, da se metilacija TIMP3 gena lahko sodelujejo v kancerogenosti in metastaz želodčnih tumorjev raka in metastatskih bezgavk tkiva. Slika 1 Metiliranje specifični PCR (PPN): 1, normalna kontrola (normalna želodčni tkivo); 2, zgodnje rak želodca; 3, napredovalega raka želodca; 4, prenos bezgavke. M, Marker DL2000; m, Metiliranje pomnoževanje fragmenta; u, unmethylation ojačanje fragment.
Tabela 1 želodca karcinom TIMP3 promotor metilacija in izražanje proteina
organizacij
n (%)
TIMP3 promotor metilacija
TIMP3 protein izraz
Positive
Positive
Normalno želodec
78
28 (35,9)
78 (100,0)
Zgodnje želodcu raka
20
17 (85,0)
9 (45,0)
Napredovali rak želodca
58
52 (89,7)
21 (36,2)
bezgavkah
78
77 (98,7)
12 (15,4)
imunohistokemija analizo izražanja TIMP3 beljakovin
izražanja TIMP3 beljakovin je bila pozitivna v vseh 78 primerih normalnega želodčnega tkiva (100%). Med želodčnih primerov karcinoma, je bilo 9 od 20 bolnikov pozitiven zgodnjega raka želodca; 11 primerov so bili negativni (55%), 21 pa jih je bilo pozitivno, in 37 so bili negativni (63,8%), v 58 primerih napredovalim rakom želodca; in 12 primerov je bilo pozitivnih in 66 primerih so bili negativni (84,6%) pri 78 bolnikih z metastatskim želodca bezgavke. Znižana TIMP3 izraz, ki so ga opazili pri želodčnih skupin raka je bilo ugotovljeno, da je statistično značilna (P
< 0,01; Slika 2 in tabela 1), kar kaže, da TIMP3 protein stopnja izraz zmanjšala v želodčnih tumorjev raka in metastatskih bezgavk tkiv . To zmanjša ekspresijo gena proteina lahko posledica prej opaziti povečanje TIMP3 metilacije v želodcu vzorcih rakavih saj metilacija znano zatreti izražanje proteinov. TIMP3 protein izraz je v glavnem nahaja v citoplazmi normalnih žlez. V nekaterih celicah, je majhna količina izražanja najdemo v celičnih membranah (slika 2). V normalnih želodčnih celic sluznice, ni bilo opaziti žleznega uničenje strukture in barvanje ni bistveno zmanjšala. Zgodnje želodca raka žleze pokazala strukturne poškodbe in šibek rakavih celic barve. Napredne želodca raka tkiva pokazali velike površine masivni rasti (nediferenciran karcinom), in razen posameznih celic, ostali niso bili obarvani. Slika 2 TIMP3 protein immunohistochemisty (SP 400 ×): a, normalno želodca tkivo; b, zgodnje rak želodca; c napredovalega raka želodca; d, prenos bezgavke.
Razmerje med TIMP3 promotor gena metilacije in izražanja TIMP3 beljakovin
V naprednem želodca skupine raka, je bila stopnja TIMP3 metilacije bistveno višji od lumpish in ugnezdene rastočih tkiv (100% v primerjavi z 77,8%, v tem zaporedju; P
< 0,01). Stopnja metilacije TIMP3 v metastatskih bezgavk v skupini ≥7 tkiva je bistveno višja od < 7 tkivo skupina (100% v primerjavi s 83,3%, v tem zaporedju; P
< 0,05). Subserosal in serozne tkivo skupina je bila bistveno višja od skupini Submukozno in miometrija tkiva (91,3% in 96,6% v primerjavi s 50%, v tem zaporedju; P
< 0,05). Povečana stopnja TIMP3 gen metilacija so na splošno opažali pri difuzni podobno rast, bezgavkah (≥ 7), in subserosal in seroznih tumorjev, kar pomeni, da ni povezave obstajala med TIMP3 genov metilacije in velikost tumorja, makroskopski vrsto in histološki tip. Pozitivna stopnja 58 primerov naprednih želodčnih tkiv rakom bila 36,2% (21). TIMP3 protein izraz v masivnih in ugnezdene rastočih tkiv je bila bistveno višja od tiste, ki tkiv rasti razpršenih podobno (55,6% vs.19.4%, v tem zaporedju; P
< 0,01). TIMP3 protein izraz v metastatskega bezgavke ≥ 7 tkiva je bila bistveno višja od < 7 tkiva (47,2% proti 18,2%, v tem zaporedju; P
< 0,05) (tabela 2). Ti rezultati kažejo, da je zmanjšala TIMP3 protein stopnja izražanja so pogostejši pri rasti in bezgavk metastatskega razpršenega podobno (≥ 7) tumorji, vendar zmanjšal ekspresijo ni bila povezana z velikostjo tumorja, bruto tipa, histološki tip in globine invasion.Table 2 razmerje med napredno želodčni rak patologija TIMP3 metilacije in njegov beljakovinski izražanja vodne tehtnice
indeks
n
TIMP3 promotor metilacije
TIMP3 protein velikost tumorja

velikost tumorja (cm)
< 5
5
3 (60,0)
1 (20,0)
: 5 - 10
45
42 (93.3)
18 (40,0)
> 10
8
7 (87,5)
2 (25,0)
splošne vrste
Borr.2
12
10 (83,3 )
4 (33,3)
Borr.3
37
33 (89,2)
15 (40,5)
Borr.4
9
9 (100,0)
2 (22,2)
histološki razlikovanje
diferencirana
44
39 (88,6)
17 (38,6)
Raznovrstna
14
13 (92,9)
4 (28,6)
vzorec rasti
kepe + ugnezdeni
27
21 (77,8)
15 (55,6)
razpršenih podobnih
31
31 (100.0 ) b
6 (19,4) b
bezgavko metastaze
< 7
36
30 (83,3)
17 (47,2)
≥7
22
22 (100,0)
4 (18.2) Za
infiltracijo
Submukozno muscularis
6
3 (50,0)
1 (16,7)
Subserosal
23
21 (91,3)
9 (39,1)
korena
29
28 (96,6)
11 (37,9)
AP
< 0,05, BP
< 0.01.
Razprava
tvorbe malignih bolezni je več dejavnikov in se pojavlja v več fazah. Biološke značilnosti malignih tumorjev vključujejo invazivne rasti in metastaze. Mehanizem za razvoj tumorjev vključuje nenormalne spremembe v genski strukturi in funkciji v notranjost celice. Sodobni teoretiki menijo, da je proces nastanka tumorjev obsega dve veliki mehanizmov: prva je na genetski ravni, to je genska mutacija povzroči DNA nukleotidna sekvenca spreminja; in drugi je na epigenetske ravni. Prejšnje študije so se osredotočili na spremembe v izražanju genov, ki so podedovane skozi mejozo in ne vključujejo spremembe v zaporedju DNK, vendar vplivajo na izraz in genov regulacijsko funkcijo DNA, predvsem s kemično modifikacijo. Ta mehanizem se pridobiva vedno večjo pozornost raziskovalcev s procesom nastanka tumorjev [15, 16].
V DNA tumorskih tkivih, so abberant methylations pogosto opazili pri promotor gena regijah, vključno hipometilacije v onkogena. Ta gen je tesno povezana s ciklusom celične proliferacije in hypermethylation v zaviralnih genov. Te neobičajne spremembe metilacije lahko aktivirate onkogeni [17-19] in zavirajo mRNA transkripcijo zaviralnih genov [20], ki vodi do genske inaktivacijo. Aberrant metilacije v DNK se pojavi zaradi prisotnosti zelo metilni CpG otokov na 5 'koncu kontrolnega promotor regije a. Družina TIMP ima štiri člane proteinske: TIMP-1, 2, 3 in 4. TIMP-1, 2 in 4 so topni sekrecijska proteini. Nasprotno, TIMP-3 protein ni topen, ki združuje z zunajceličnega matriksa, ki se nahaja v zunanji membrani celic [21], in se lahko tesno povezana z bazilarne membrano. Funkcija TIMPs je inhibicija faktorja tumorske nekroze-a (TNF-alfa) konvertiranje encimov in indukcijo programirane celične smrti preko stabilnega celičnega površinskega TNF-alfa receptor [22]. Indukcija apoptoze preko TIMP se zgodi po dveh poteh: MMP odvisnih in neodvisnih. Čeprav TIMP-3 in 4 imajo visoko afiniteto za MMP-2, proteini učinkovito inhibira MT1-MMP, s čimer se aktivira proces MMP-2 zimogeni in inhibira rast celic tumorja in metastaz. Smith et al. [23] ugotovljeno, da so izraz TIMP-3 v rak debelega črevesa humanih celičnih linijah redka mitozo. Večina celice aretiran v fazi G1, čeprav je uporaba TNF-alfa protitelesa zmanjša mitotićno aretaciji 70%.
Za raziskovanje odnosa med TIMP3 in rak želodca, kot tudi njegov mehanizem v želodcu inaktivacije smo zaznali TIMP3 gen 5 'CpG otok hypermethylation v normalnem želodčne sluznice, karcinom želodca in metastatskih bezgavk. Ugotovili smo, da v > 85% vseh želodčnih tkiv raka, gena TIMP3 5 'otok CpG razstavljena zmotne metilacije, ki je bila bistveno višja (P
< 0,01) kot običajne želodca skupine tkiva, kar je pomenilo, da TIMP3 genski promotor otok CpG metilacija zmanjša TIMP3 izražanje genov in je bil tako glavni mehanizem zaviralnih-inaktivacija raka želodca. Gagnon sod. [24] poroča, da je v vseh MCF-7 pljuč linij rakavih celic z TIMP3 mRNA izgubo izražanja in TIMP3 gen promotorja CpG otoku metilacije, je demetilacija povzročena s 5-aza-CdR. TIMP3 izraz pred in po tem, ko je bil 5-AZA-CdR indukcija ocenil RT-PCR, kar kaže, da metabolizira povzročilo TIMP3 ponovno izražanje genov, skladne z našimi rezultati.
V tej študiji vseh 78 primerov normalno želodčnega tkiva so bili pozitivni za izražanje TIMP3 beljakovin. Med temi 78 primerih je bilo le 28 (35,9%) pozitiven metilacije. Med 20 bolnikih z zgodnjim rakom želodca, 9 so bili pozitivni za TIMP3 proteinsko ekspresijo in 17 (85%) so bili pozitivni za metilacijo. Med 58 primerov napredovalega raka želodca, je bilo 21 pozitivnih na TIMP3 beljakovin izražanja in 52 (89,7%) so bili pozitivni za metilacije. Med 78 primeri metastatskih bezgavk, 12 je bilo pozitivnih na TIMP3 beljakovin izražanja in 77 primerih (98,7%) so bili pozitivni za metilacije. Povečana stopnja metilacije je med zgodnjega raka, napredovalega raka, in metastatskih vzorcev bezgavk pomemben v primerjavi z običajnimi vzorci tkiva (P
< 0,01), ki potrjuje, da je bila izguba izražanja TIMP3 beljakovin tesno povezana z TIMP3 gen promotorja CpG otoku metilacija. Feng HF sod. [25] poročajo enake rezultate JAR in Ja-3 horiokarcinom celičnih linijah. Zato je naša raziskava potrdila, da TIMP3 genski promotor CpG otok metilacija je bil glavni razlog za manjšo TIMP3 beljakovin izražanja raka želodca.
Med 58. naprednih želodca vzorcev rakom, 52 je bilo pozitivnih na TIMP3 promotorja CpG otoku metilacije in 21 so bili pozitivni za izražanje TIMP3 beljakovin. Ta ugotovitev je predlagal, da poleg CpG otoku metilacije, drugi dejavniki, kot so genetske variacije povzročila odsotnost TIMP3 genske ekspresije. V naših eksperimentih je bilo 34 vzorcev pozitivnih na metilacije in unmethylation je običajno razlagajo takole: nepopolno stanje metilacija genov lahko obstajajo, in če je tumorsko tkivo zmešamo z ne-tumorskih celic, pozitivnega PCR produkta za unmethylation (s PPN z opazimo lahko nemetiliran oligonukleotid). TIMP3 protein izraz vzorec je bil negativen, zato ti vzorci so bili opredeljeni kot metilacije pozitiven.
Na Kitajskem, 5-letno preživetje bolnikov želodca karcinomom je le okoli 40% po resekciji. Revni prognoza je povezana z veliko lokalno invazijo in /ali regionalnih bezgavkah metastaze [26]. Lokalni ponovitve ostaja glavni vzrok smrti zaradi raka po resekcijo pri bolnikih želodca z rakom [27]. Zato je treba vzpostaviti zanesljivi kriteriji za napovedovanje ponovitve in opredelitev tumorjev razumeti molekularne in celične procese, kot tudi odkrivanje novih in možne terapevtske molekularnih ciljev [28].
Kerbel [29] je poročal, da subkloniranje tumorske celice z metastatskega potenciala imajo prednost rasti v zgodnji fazi primarnega žarišča. Razlog za takšno prednost rasti je, da lahko metastatski populacija subkloniramo celica izloča posebno faktor ali lokalno rastni faktor celic, kar povzroča posebno reakcijo, ki ima za posledico selektivno rast. Ugotavljanje ravni molekularnih označevalcev v primarnih tumorjev osebkov lahko odraža splošne metastaznih značilnosti celotnega tumorja. V tej skupini so stopnje metilacije bilo le 35,9% pri običajnih želodčnega tkiva, 85% in 89,7% za prvih in naprednih raka, oziroma 98,7% za metastatskih bezgavk. Dosledno je visoko TIMP3 beljakovin izraz opazili samo v normalnih želodčnih tkivih. Zgodnje in napredne želodčni rak razstavljena goriščno šibko izražanje in metastatskih bezgavk pokazala skoraj nobenega pozitivnega izražanja. Ta ugotovitev je predlagal, da TIMP3 metilacija povečala z napredovanja tumorja in ta izraz beljakovine postopoma znižuje. Zato je metastatskega potenciala in rasti prednost celic postopoma povečuje, kar nazadnje pomeni metastaz. Yegnasubramanian sod. [30] je poročal, da je bil tumor metastaze, povezane z TIMP3 metilacije v prostati raka celičnih linijah, ki jih je v realnem času PPN vzorcev je pokazala od 73 bolnikov z zgodnjim rakom prostate, 91 bolnikov z metastatskim rakom prostate, in 25 primeri z tkiva prostate. Ta rezultat je pomenilo razmerje med CpG metilacije in razvrščanje in napredovanju raka na prostati. TIMP3 gen metilacija menda igra pomembno vlogo v vzorcu širjenja in odkrivanje TIMP3 CpG metilacije ima določeno praktično vrednost pri napovedovanju metastatskega potenciala primarnega tumorja.
TIMP3 ima visoko frekvenco genetske variacije v številnih vrstah človeških malignih tumorjev, vključno z mutacijami, izbrisov, metilacije, kromosomske translokacije, in tako naprej [31]. Te mutacije povzročijo izgubo normalno delovanje gena supresor tumorja, in sicer zaviranje celične proliferacije (tj gen inaktivacije) in so tesno povezana z razvojem raka [32]. Vendar pa je bilo nekaj študij o TIMP3 genske spremembe v primarnim rakom želodca, in rezultati teh študij kažejo neskladnih rezultatov iz nizko stopnjo gena za izbris, da brez mutacije sploh. V skladu s tem so preiskovali druge inaktivacije mehanizmi raka želodca, ki vključujejo TIMP3 gen [33]. Tako je kompleksnost tumorja patogeneze ni le odraz genske spremembe, ki ga mutaciji ali izbris, ampak tudi odraz epigenetske spremembe, kot so metilacija DNK. Študija poglobljeno razmerja med metilacije DNA in izražanje genov, kot tudi njene ustrezen mehanizem, se priporoča, saj se lahko rezultati vodijo klinično zdravljenje raka.
Izjave
Financiranje
Raziskava je bila financirana National Natural Science Foundation Kitajske (št 30271477) in projekta, ki ga Znanstvenoraziskovalnega fundacije za vrnjeno čezmorskih kitajskih Štipendisti, državno šolstvo Ministrstvo Sponsored (št 2002-247). izvirnih predloženih spisov
avtorskih za slike
Spodaj so povezave do prvotna predloženih spisov avtorjev za slike. "Izvirno datoteko na sliki 1 13000_2013_791_MOESM2_ESM.tiff avtorjev 13000_2013_791_MOESM1_ESM.jpeg avtorjev prvotne datoteke za sliko 2 Konkurenca interes
avtorjev izjavljamo, da nimajo konkurenčnih interesov med seboj. Prispevkov
avtorjev
ZG in JZ izvajajo patoloških in PCR preglede, DD in ZG analizirala podatke, in ZG pripravila rokopis. Vsi avtorji prebrali in potrdil končni rokopis.

• Primerjava endoskopske Submukozno seciranje (ESD) in radikalno operacijo zgodnjega raka želodca: retrospektivna študija
• Korelacija hK6 izražanja z tumorja ponovitve in prognozo pri napredovalem raku želodca