De overmethylated gener i Helicobacter pylori-infisert mageslimhinnen blir demetylert i mage cancers

de overmethylated gener i Helicobacter pylori
-infected mageslimhinnen blir demetylert i mage kreft
Abstract
Bakgrunn Bedrifter Den overgangs-CpG områder mellom svakt denaturert gener og tett denaturert retroelements er overmethylated i mageslimhinnen infisert med Helicobacter pylori plakater (H. pylori
) og de er undermethylated i mage kreft, avhengig av nivået på tap av heterozygositet (LOH) arrangementer. Denne studien avgrenset overgangs-CpG metylering mønstre av CpG-øy-holdige og -lacking gener i lys av retroelements.
Metoder
Overgangs-CpG områder av åtte CpG-øy inneholder gener og seks CpG-øy -lacking gener ble semi-kvantitativt undersøkt ved å utføre radioaktiv isotop-merking metylering-spesifikk PCR under stringente betingelser. Nivået av LOH i mage kreft ble beregnet ved hjelp av de 40 mikro markørene på åtte kreft-assosiert kromosomer. Hvert gen ble scoret som overmethylated eller undermethylated basert på et middels nivå av overgangs-CpG metylering vanlig i H. pylori
-negative mageslimhinnen.
Resultater
De åtte CpG-øya gener ble undersøkt ble overmethylated avhengig nærhet til nærmeste retroelement i H. pylori
-positivt mageslimhinnen. De seks CpG-øy-mangler gener ble likeledes metylert i H. pylori
-positivt og -negative mageslimhinnen. I mage kreft, lange overgangs-CpG segmenter av CpG-øya gener fjernt fra retroelements forble overmethylated, mens overmethylation korte overgangs-CpG segmenter i nærheten av de retroelements var ikke signifikant. Både CpG-øy-holdige og -lacking gener tendens til å være avtagende denaturert i et LOH-nivå-avhengig måte
Konklusjoner
Den overmethylated gener under påvirkning av retroelement metylering i H. pylori
. - infisert magen blir demetylert i mage kreft påvirket av LOH.
Bakgrunn, En mus modell smittet med Helicobacter pylori plakater (H. pylori
) har vist at benmarg stamceller migrere til mageslimhinnen og da de differensiere i mage epitelceller [1]. Ifølge en selvorganisasjonsmodell, kan høyt uttrykte mestre gener danner en transkripsjon hub for å koordinere uttrykket av mange andre gener [2]. En dose kompensasjon mekanisme foreslår at det er en invers korrelasjon mellom husholdningsgener som inneholder CpG-øyer og vevsspesifikke gener de mangler CpG-øyer, som begge deler en begrenset mengde av kjernefysiske proteiner i atom plass [3, 4]. Både selvorganisering og dosering kompensasjon modeller markere at epigenetisk co-regulering av svært aktive mage-spesifikke gener og svakt aktive housekeeping gener forenkler trans-differensiering av marg-avledet celler i magen.
Personer smittet med H. pylori
ofte gjennomgå en rekke av mage slimhinneforandringer, inkludert forstadier og til kreft [5]. Selv CpG-øy overmethylation som kan føre til inaktivering av kreft-assosiert gener er vanlig i H. pylori
-infected mageslimhinnen, er tvetydig en sammenheng mellom overmethylation og uttrykk for individuelle CpG-øy gener [6]. Gastric forstadier og til kreft har vist CpG-øy overmethylation samt genome-wide undermethylation, men de to distinkte metylering endringer viste ingen samarbeid for sekvensiell utvikling av forstadier til kreft og kreft [7]. I tillegg har de høyt uttrykte mage-spesifikke gener som spiller en rolle i hoved ko-regulering av en rekke gener påvist noen metylering endringer i gastrisk kreft [4, 8]. Med hensyn til å koordinere genekspresjon, er det nødvendig å avgrense hvis magen spesifikke gener og husholdningsgener gjennomgå samtidige over- og under-metylering endringer.
Den retroelements er selvreproduserende parasittiske DNA som opptar halvparten av den humane genom [ ,,,0],

• Mindre vanlige slimhinnemetastaser til magen
• CD44 men ikke CD24 ekspresjon er relatert til dårlig prognose i ikke-cardia adenokarsinom i magen