Xpert MTB /rifas tyrimas gali būti naudojamas ant archyvą skrandžio išsiurbimo ir sukeliama skreplių mėginius jautriai diagnozuoti vaikų tuberkuliozės pervežimas tezės
Background pervežimas nuo tuberkuliozės (TB) vaikams yra apleisti, daugiausia dėl jautrių diagnostikos įrankių stokos , Neseniai Xpert MTB /rifas tyrimas sukėlė revoliuciją diagnostikos srityje, bet jos naudingumas vaikų TB nebuvo pranešta iš Indijos ir ne ataskaita galima susipažinti jos naudojimo ilgalaikes archyve pavyzdžius.
Metodai
Mes įdarbinti 130 sergantys su galimu intratorakaliniuose tuberkuliozės ir jų skrandžio išsiurbimo (GA) ir indukuotos skreplių (IS) mėginiai apie 2 dienas iš eilės buvo renkami nuo 2009 metų sausio iki 2012 gruodžio Visi mėginiai (n = 520) buvo atliktas tepinėlis tyrimą, BACTEC-MGIT kultūrą ir -house
Multiplex PGR. Kiekvieno mėginio alikvotinė buvo laikomi -80 ° C ir išbandyti Xpert MTB /rifas tyrimas 2013 m
rezultatai
Imties protingas ir kantrus protinga aptikimo norma tepinėlio mikroskopija buvo 4,4% ir 10%, o už BACTEC -MGIT kultūra šis rodiklis buvo 24,4% ir 46,9%, atitinkamai. Iš 130 dienos 1 GA mėginių, 31,5% ir 27,7% dienos 2 GA mėginiai buvo kultūra teigiamas. Tik 17,7% GA mėginiai buvo teigiami abiejų dienų. Iš 130 mėginius surinktus 1 dieną ir 2 diena, 15,4% ir 23,1% mėginių buvo kultūra teigiamas. Iš GA derinys ir davė geriausius rezultatus. Derinant GA ir bendras jautrumas Xpert MTB /RIS ant tepinėlio ir kultūros teigiamų mėginių buvo 95,6%. Be tepinėlio neigiamų ir kultūra teigiamų mėginių jo jautrumas buvo 62,5%. Iš mėginio laikymo trukmė paveikė Xpert MTB /RIF testo rezultatus (p = 0,0001). Be saugomi už 650-849 dienų tepinėlio teigiamų mėginių, jo jautrumas buvo 85,7% ir 77,1% už yra GA mėginių, kurie nukrito iki 33,3% ir 50%, atitinkamai, jei saugomi ilgiau nei 1050 dienų.
Diskusijos
diagnozės patvirtinimui tuberkuliozės ypač vaikams yra medicinos iššūkis. Nėra laboratorija arba radiologinis tyrimas gali pasiekti patenkinamo lygio diagnostinio jautrumo. Tačiau šiame tyrime mes foundthat derinys kelių pavyzdžių ir keliais diagnostinius tyrimus gali suteikti daug geresnį derlių, nors notoptimum. Be šio tyrimo, derinys 2 skrandžio aspiratų (GA) ir 2 sukeltas skreplių (IS) bandiniai, surinkti dvi dienas iš eilės, ir išbandyti trijų diagnostinių metodų davė žymiai aukštą aptikimo lygis. Nepaisant ilgalaikiam saugojimui, bendras jautrumas Xpert MTB /RIS ant tepinėlio ir -culture teigiamų mėginių išliko labai aukštas. Tačiau po šių pavyzdžių saugojimui pagal subfreezing sąlygos thesensitivity iš Xpert MTB /RIS žymiai sumažėjo. Tikimasi, nes net jei mėginys yra tepinėlis ir kultūra teigiamas, išgyventi mikobakterijų skaičius krinta, po kelių metų šis skaičius gali pasiekti iki neišmatuojamo lygio.
Išvada
Ši ataskaita rodo, kad tepinėlio ir kultūros teigiamus mėginius saugomi subfreezing sąlygas kelerius metus gali būti naudojamas Xpert MTB /RIF tyrimą, išlaikant pastebimo Diagnostinio tyrimo jautris ir specifiškumas.
Raktiniai žodžiai
Pediatrija Tuberkuliozė Indija Skrandžio Ištraukite sukeltas Skreplių Archived Pavyzdžiai mPCR MGIT kultūra, Xpert MTB /Rif fone
Pasaulio sveikatos organizacija (PSO) apskaičiavo, kad pasaulio naštą nuo tuberkuliozės (TB), 9 milijonai naujų ligos atvejų ir 1,5 mln mirčių 2013 m [1]. Tai apėmė iki 15% našta vaikams atvejais. Apie 74.000 vaikų miršta nuo tuberkuliozės kasmet ir yra maždaug pusė milijono naujų atvejų per metus [2]. Kaip ir suaugusiems, dauguma (70-80%) ir vaikų tuberkuliozės atvejų dabartinių sergantiems plaučių tuberkulioze (PTB). Tuberkuliozė vaikams buvo gana apleista, daugiausia dėl iššūkių veiksmingų diagnostikos įrankiai [3] prieinamumą. Indija yra 17. Tarp 22 didele našta šalių, kalbant apie bendrą TB sergamumo, bet labai mažai informacijos apie epidemiologijos TB vaikams, jo diagnostika ir valdymo [4, 5].
Daugeliu parametrų diagnostika vaikų tuberkuliozės yra daromos remiantis kontaktų atsekamumo pagrindu, ir labai mažai buvo bandoma aktyviam nustatyti ligos atvejų. Tai daugiausia dėl to, kad per patognominiu klinikinę būklę pediatrijos TB ir jautrių diagnostikos įrankių trūkumas [3, 4, 6, 7] stokos.
Su ribotomis įrankiai kartotinę laboratorinės diagnostikos, vertinimo medicininės istorijos, tuberkulino odos bandymų, krūtinės rentgeno ir atsako antibiotikams trūksta padėti atlikti klinikinį diagnozę. Tepinėlio mikroskopija ir mikrobiologinė patvirtinimas retai pasiekiama dėl prastos jautrumo šių bandymų, iš dalies dėl to, kad paucibacillary ligos pobūdį ir nesugebėjimas mažiems vaikams suteikti optimalią skreplių pavyzdys [6]. Pakaitinis mėginiai yra skrandžio aspiracija (GA), sukeltas skreplių (IS), nosiaryklės aspiracija, bronchio-alveolių plovimą, gerklų tamponu, styginių testą ir išmatų mėginius [3, 7-10]. Priklausomai nuo naudojamo diagnostinio testo, šie mėginiai parodė, kintamą jautrumą ir specifiškumą. Buvo pranešta, kad skrandžio plovimas mėginiai suteikti didžiausią (40-92%) aptikimo lygis, priklausomai nuo priimto laboratorinio bandymo jautrumą. Kitos mėginiai parodė skurdesnių aptikimo kainos svyruoja nuo 4-43% už bronchoalveolinio plovimas, 24-30% už nosiaryklės aspiracija, 27-63 už gerklų tamponu ir 20-30% naudojant sukeltas skreplių. Kai kurie darbuotojai taip pat naudojami stygų testas, bet rezultatų nebuvo skatinant [3, 7, 11-13].
Neseniai įdiegti į Xpert MTB /RIF tyrime (CEPHEID, JAV) gerokai transformuota tuberkuliozės diagnostika suaugusiems , bet jo prašymas dėl vaikų tuberkuliozės diagnozė pagal vertinimą. Šiam testui yra greitas ir teikia rezultatus per 2 val [14]. Be politikos pareiškimo Pasaulio sveikatos organizacija (PSO) 2011 m rekomendavo Xpert MTB /RIF tyrimo naudojimą, kaip priimti prejudicinį diagnostikos priemonė tarp vaikų, sergančių suaugusiųjų įtariamo žmogaus imunodeficito virusu (ŽIV), susijusių su tuberkulioze ir visose MDR TB įtariamų atvejų [ ,,,0],15]. Vėliau keletas darbuotojų pradėjo naudoti Xpert MTB /RIF tyrimą dėl vaikų tuberkuliozės [10, 16-18] diagnozę. Tačiau plačiai paplitęs naudojimas Xpert MTB /RIS už vaikų tuberkuliozės diagnostikai atlikti įprastine tvarka išlieka tolima galimybė. Iki šiol, yra tik keli tyrimai dėl Xpert MTB /RIS taikymo už vaikų tuberkuliozės diagnozę. Du tyrimai pranešti apie Xpert MTB /RIS naudoti sukeltas skreplių dviejų jos naudoti plaunant skrandį pavyzdžius. Nėra atlikta tyrimų, kad pranešti apie naudojimo Xpert MTB /RIS abiejose GA ir mėginių vienu metu tam pačiam pacientui. Be to, nėra jokio tyrimas iš Indijos nuo Xpert MTB /RIS vertinimo dėl vaikų plaučių tuberkuliozės diagnozę. Be to, Xpert MTB /RIS Utility "archyvo GA ir mėginių nebuvo anksčiau išnagrinėti. Kadangi Xpert MTB /rifas tapo prieinama tik po 2011 m, yra niekas kitas greitasis tyrimas, kuris gali aptikti tuberkulioze ir RIF atsparumą vienu metu mėginių, kurie buvo surinkti prieš 2011 Šis tyrimas taip pat nagrinėja ilgalaikiam saugojimui klinikinių mėginių poveikį už aptikimas TB pagal Xpert MTB /RIF tyrimą.
Mes anksčiau pranešė, kad GA mėginiai teikti geresnes derlių, negu pavyzdžiai [19]. Vėlesniu ataskaitoje taip pat parodė, kad neutralizuoti skrandžio išsiurbimo pH prieš apdorojimas veda į aukštesnį kursą užteršimo be pagerinti aptikimo lygis [20]. Šiame tyrime mes pranešti apie Xpert MTB /RIS našumą archyvą GA ir kaupiami mėginiai dvi dienas iš eilės nuo vaikų su galimu intratorakaliniuose TB, įdarbino kaip dvigubai aklas atsitiktinių imčių kontroliuojamo tyrimo metu mokytis, kad mikroelementų papildų vaidmenį vaikų, sergančių vidaus krūtinės tuberkulioze.
metodai
tyrimo dizainas ir laikantis įdarbinimo pervežimas Tyrimas buvo atliktas tarp 2009 metų sausio iki 2012 gruodžio mėn visą Indiją instituto medicinos mokslų (AIIMS) ir Kalawati Saran vaikų ligoninė ( KSCH), tiek Naujajame Delyje, Indijoje. Šis darbas buvo dalis dvigubu aklu atsitiktinių imčių kontroliuojamo tyrimo studijuoti į mikroelementų papildų vaidmenį vaikų su vidaus krūtinės tuberkuliozės [19-22]. Iš 403 vaikų (58,2% mergaičių), vaikams nuo 6 mėnesių iki 14 metų [vidutinis amžius, 120 mėnesių iš viso; interkvartilinis diapazonas (IQR), 7-168 mėnesių], su tikėtinu vidaus krūtinės TB buvo įtraukti. Standartiniai klinikos-radiologinis kriterijai įtarti viduje krūtinės tuberkulioze buvo naudojamas šiame tyrime kaip paskelbta anksčiau [19-22]. Iš intratorakaliniuose tuberkuliozės diagnozė buvo pagrįsta rekomendacijų Indijos pediatrų akademija. Bet kuris vaikas, su kosuliu ir karščiavimu daugiau nei 2 savaites nepagerėja per septynių iki dešimties dienų amoksicilinu kurso metu ir neseniai nepaaiškinamas svorio netekimas ar istorijos sąlyčio su TB pacientui pastaruosius dvejus metus. Visi tuberkuliozė įtariamieji buvo atlikta krūtinės ląstos rentgenograma (šoninės ir užpakalinės-priekinė). Dalyvaujant patvarių rentgeno sutrikimų, su klinikinių simptomų ne rezoliucijos ir ne kita priežastis, simptomus ir krūtinės rentgeno rezultatai, tikėtina diagnozė intratorakaliniuose tuberkuliozės buvo padaryta. Visi vaikai su galimu tuberkuliozės buvo atliktas tuberkulino odos testą (TST), ambulatorinė skrandžio aspiratų (GA) ir indukuotos skreplių (IS) egzamino AFB tepinėlis ir kultūrą. Vaikai buvo pradėtas PGS, kaip už rekomendacijas RNTCP [5]. Trumpas aprašymas: Visi vaikai su tikėtinu vidaus krūtinės tuberkuliozės buvo atliktas skrandžio aspiracijos (GA) ir indukuotos skreplių (IS) surinkimo dvi dienas iš eilės (D1 & D2). Vaikai buvo paprašyta pranešti apie 6 val nevalgius ryte į paskirtą klinikoje. Po paaiškinti procedūrą ir gauti sutikimą iš tėvų ir žodinį pritarimą iš vaikų, tinkamas dydžio padavimo vamzdis (10-12G) buvo įterptas per vieną šnervę, kol jis pasiekė skrandį. Iš vamzdžio padėtis buvo tikrinama įpūtimo orą į skrandį. Skrandžio turinys buvo pripūtimo visiškai, laikomi sterilų konteinerį. renkami įprasta apimtis buvo apie 10 ml. Mėginiai buvo gabenami į laboratoriją tolimesniam perdirbimui per 1-2 val.
Tais pačiais sėdi skrandžio aspiracijos buvo po sukeltos skreplių su maždaug pusvalandį spragą. Dėl skreplių indukcijos, vaikas buvo gruntuoti 2 pūkinės salbutamolio inhaliacijos dozuojamuose inhaliatorių (MDI Asthalin, 100 g /stovai, Cipla, Indija)) ir tarpiklių (Zeroastat VT tarpiklis, Cipla, Indija), po to purškiami 3 ml 3 % fiziologinio tirpalo virš kito 15-20 min. Visi mėginiai buvo suteikta unikalus kodas numerius; ir siunčiamas į laboratoriją be nuorodos į klinikinių ir paciento informacijos. Mėginiai buvo apdorojami tą pačią dieną AFB tepinėlis, BACTEC-MGIT kultūros ir in-house pervežimas PGR [23]. Klinikiniai ir kiti paciento duomenys buvo įrašyti į Excel lape apdorojant pediatras ir laboratorijos nežinojo apie klinikinę diagnozę dalykų.
Etiniai motyvai
Tyrimas buvo patvirtintas tarnybinės etikos komitetui apie visus Indija instituto medicinos mokslų Naujasis Delis ir Kalawati Saran vaikų ligoninė, Naujasis Delis, Indija, ir tyrimas buvo įregistruota clinicaltrials.gov (NCT 00.801.606). Parašė informuotas sutikimas buvo gautas iš tėvų /globėjų kiekvienam vaikui.
Laboratoriniai metodai
Sample apdorojimą
IS ir G. (pH ne neutralizuoti) mėginiai buvo apdorotos, kaip nurodyta anksčiau [19, 21, 23, 24] , Trumpai tariant, mėginiai buvo centrifuguojamas 10.000 x g 10 min, esant 4 ° C temperatūroje; supernatantas nupilamas ir nuosėdos pakartotinai suspenduotas vienodo tūrio 0,5% NALC-4% NaOH 50-tyje ml kraigo uždengiamos apvalių iš apačios į perdirbimo vamzdžių. Suspensiją, ją kruopščiai (4 x 10 -ai kiekvienas intervalas) pavartomas, siekiant užtikrinti tinkamą maišymo ir buvo inkubuojamos 37 ° C temperatūroje 10 min. Po inkubacijos, šarminės pH neutralizuoti su fosfatinio buferinio [PBS (pH 6,8, bendro 50 ml tūrio)] ir po to 10.000 x g 10 min iki galutinio centrifuguojant, esant 4 ° C temperatūroje. Supernatantas nupilamas; granulių iš naujo sustabdytas 2 ml PBS ir 0,5 ml talpos padalinamas alikvotinėmis dalimis 4 sterilius mėgintuvėlius. Vienas alikvotinė buvo naudojamas tepinėlio paruošimo, vieną kultūrą ir kitas testuoti in-house
daugkartinis PGR (M-PGR). Vienas mėginys, esantis prie -80 ° C tolesniam naudojimui. Iš vienos alikvotinės dalies, 500 mikrol pakaba paskiepyta BACTEC MGIT-960 skystų kultūros sistemos (BACTEC
TM MGIT, Becton Dickinson, Sparks, JAV), naudojant standartinį protokolą [25]. Nepriklausomai nuo to, teigiamas arba neigiamas uždėtinį rezultatas, visos kultūros išnagrinėjo Ziehl-Neelsen dažymo. Diferenciacija izoliatų į Mycobacterium tuberculosis
(MTB) arba ne tuberkuliozinio mikobakterijų (NTM) buvo atliktas konkretus in-house rūšių
M-PGR [23]. IS ir GA mėginio alikvotinės, saugomas -80 ° C, Retrospektyviai išnagrinėti atsižvelgiant Xpert MTB /RIF tyrimu.
Xpert MTB /rifas testas
2013, saugomi mėginiai buvo tiriami Xpert MTB /RIF bandymai , Nebuvo 520 nukenksminami GA ir suporuotas mėginių (130x2 GA & 130x2 IS), kad buvo tinkami bandymai, o kiti buvo arba nepakanka kiekio ar kokybės (užterštos). Mėginys reagentas buferis, kurių sudėtyje yra NaOH ir izopropanolio buvo pridėta į santykiu 3: 1 (iš viso 2 ml), ir inkubuojami 15 min kambario temperatūroje. Išvalytos pavyzdys (2 ml), tada buvo perkeltas į Xpert MTB /RIF kasetės, kuriame plovimo buferio, liofilizuotas Reagentai DNR išskyrimo ir PGR. Po tinkamo maišymo kasetė buvo pakrautas į Xpert MTB /RIF priemonę, pagal gamintojo nurodymus (CEPHEID, JAV). Prietaisas atlieka pavyzdys maišymo, ultragarsu, kad mikobakterijų bakterijų ir vidaus kontrolės (sporos), DNR išleidimo ir maišymo su PGR reagentų, automatiškai. Tai po to hemikalciui-įdėtos realaus laiko PGR, nukreipti aptikti penkių spalvų fluorescencijos molekulinės radijo švyturiai zondų ir vidaus kontrolės in-situ
. Rezultatai sukurtas po 2 h ir pranešė, kaip M. tuberculosis UAB - neigiamas arba teigiamas su pusiau kiekybiškai bacillary apkrovai, kaip aukštas, vidutinis tarpinės ar mažą, ir jei patogenas yra RIF jautrus arba atspariu [14]. Paciento duomenys buvo susiję su tirtų tik baigus Xpert MTB /RIF vertinimo pavyzdžių.
Statistinė analizė
jautrumas Xpert MTB /RIS nulėmė atsižvelgiant MGIT kultūrą patvirtino pavyzdžių tikrai teigiami. Norėdami nustatyti Xpert MTB /RIS, tepinėlio, MGIT kultūros specifiką ir in-house
M-PGR neigiami mėginiai buvo laikomi tikraisiais neigiamų mėginių. Teigiama prognostinė vertės (PPV), neigiama prognostinė vertė (GDV) ir tikimybė santykis teigiamas (LRP) Xpert MTB /RIS buvo apskaičiuotos su 95% PI (pasikliautinieji intervalai). Lrp yra didesnė nei vieną rodo, kad bandomoji rezultatas yra labiausiai tikėtina, teisingo teigiamo rezultato ir mažiau nei vienas reiškia, kad bandymo rezultatas yra tikėtina, teisinga neigiamas [26]. Pearsono Chi kvadrato testas buvo atliekamas lyginant pacientų išmintingą analizė. Norėdami paneigti susitarimo atsitiktinai dalį, buvo naudojamas Cohen kapa
testą. P-vertė. ≪ 0.05.was laikomas statistiškai reikšmingas [STATA 11,0 (College Station, Teksasas, JAV) programinė įranga buvo naudojamas visoje statistinės analizės]
rezultatai
Šiame tyrime, atlikto tarp 2009 metų sausio iki gruodžio 2012. iš 403 vaikų (58,2% mergaičių), vaikams nuo 6 mėnesių iki 14 metų [vidutinis amžius, 120 mėnesių iš viso; interkvartilinis diapazonas (IQR), 7-168 mėnesių], su tikėtinu vidaus krūtinės TB buvo įtraukti. Tik tie vaikai buvo įtraukti iš kurio tiek GA ir IS mėginiai surinkti dvi dienas iš eilės buvo galima. Todėl suporuoti yra GA mėginiai, gauti dvi dienas iš eilės nuo 130 vaikams buvo analizuojami Xpert MTB /RIF tyrimu. Į nukenksminta mėginiai buvo laikomi -80 ° C 21,4 iki 51,9 mėnesių (mediana saugojimo laikotarpis 32,5 mėnesių; IQR 27-35,1) prieš tai buvo atliktas Xpert MTB /RIF analizė. Laboratorija darbo eigos ir rezultatų suvestinė yra parodyta Fig. 1. pav. 1 Srauto diagrama vaizduojanti mėginių srautui mėginių apdorojimo įtrauktį, naudojami metodai ir rezultatai, kaip už Strobe gaires
diagnostikos rezultatus surinktų dvi dienas iš eilės
Tik 23 iš 520 (4,4%) mėginiuose yra GA mėginių nuo 13 (10%) vaikai buvo AFB tepinėlis teigiamas (1 pav.). Iš šių 23 mėginių, 9 buvo D1 ir 8 buvo D2 GA mėginiai. Antroji diena (D2) GA mėginiai aptiko 3 papildomų AFB tepinėlis teigiami atvejai, o ji praleido 4 atvejai, kurie buvo teigiamas D1, taigi nebuvo grynasis padidėjimo vertė nuo D2 GA mėginyje. Tik 3 iš mėginiai buvo teigiami abiejų D1 ar D2. D2-IS pavyzdys pridedamas vieną atvejį, bet ir praleistų vieną bylą. Šešiasdešimt vienas iš 130 (46,9%) vaikams [127 520 (24,4%) pavyzdžius] buvo diagnozuota, kad kultūra patvirtinta tuberkulioze nei tepinėlis ar kultūros (1 lentelė). Iš 130 D1-GA mėginių 41 (31,5%), o 36 (27,7%) iš D2 GA mėginių buvo kultūra teigiamas. Dvidešimt trys (17,7%) vaikai turėjo kultūrą teigiamas GA abi dienas (2 lentelė). Derlius iš sukeltų skreplių mėginių buvo prasta. 130 IS mėginiai surinkti D1, tik 20 mėginiai (15,4%) buvo teigiami, o ant D2, 30 (23,1%) mėginiai buvo kultūra teigiamas (3 lentelė). Šešiolika (12,3%) vaikams buvo kultūrą teigiamų abi dienas. MGIT kultūros derlius iš GA ir pavyzdžiai surinkti dvi dienas iš eilės rodomas (2 &stalai atitinkamai 3,). Nebuvo jokių papildomų vertė antrą dieną GA mėginį tepinėlio mikroskopija (9 vs 8), kultūros (41 vs 36), arba Xpert MTB /rifas analizė (33 vs
34). Tačiau ar mėginiai surinkti dvi dienas iš eilės suteikė didelę papildomą vertę kultūroje (20 vs
30), bet nereikšmingas papildomas prieaugis per Xpert MTB /RIF tyrimas (22 vs
25). Iš vienos GA ir vienas derinys yra pavyzdys davė geriausia diagnostikos įrankis, nepriklausomai nuo to, D1 ar D2. Beveik 50% mėginių (arba GA arba IS) buvo Xpert MTB /rifas teigiamas abi dienas (2 pav.) .table 1 atlikimas Xpert MTB /rifas ištirtas bakteriologiškai teigiamų ir bakteriologiškai neigiamų mėginių [derinys skrandžio aspiratų (N
= 260) ir sukeliama sputa (N
= 260)] surinkti iš vaikų, turinčių tikėtina intratorakaliniuose tuberkuliozės
bakteriologinių kriterijus (N = 520)
pakriterijais
Nėra , (%)
Xpert MTB /rifas rezultatai
teigiamas (%)
Neigiamas (%)
bakteriologiškai teigiamas (N
= 127; 24,4%)
tepinėlį (+), kultūros (+)
23 (4,4) *, ** (95,7)
22 1 (4.3)
tepinėlį (-), kultūros ( +)
104 (20) *
65 (62,5)
39 (37,5)
Tepinėlis (+), kultūra (-)
0
0
0
Tarpinė suma
127
87 (68,5)
40 (31,5)
bakteriologiškai neigiamas (n
= 393; 75,5%)
tepinėlį (-), kultūrą (-)
393
31 (7,9)
362 (92,1)
viso
520
118 (22,7) **
402 (77,3) Viesbutis The lentelė rodo aukštą efektyvumą Xpert MTB /rifas kultūros ir tepinėlis teigiamas mėginius, bet saikingai aptikimo lygis tepinėlis neigiamas kultūros teigiamų mėginių
*, ** p
< 0.001 (+) - teigiamas, (-) - neigiamas skaičius skliaustuose nurodyti procentą
2 lentelė atlikimas MGIT 960 kultūros surinktais dvi dienas iš eilės nuo 130 vaikus su galimu intratorakaliniuose tuberkuliozės pervežimas MGIT960 Kultūros skrandžio aspiracija mėginių rezultatai
diena 1
Positive
neigiamas
viso
2 diena
teigiamą
23 (17,7%)
13 (10%)
36 (27,7%)
Neigiama
18 (13,8%)
76 (58,5%)
94 (72,3%)
viso
41 (31,5%)
89 (68,5%)
130
3 lentelė naudingumo MGIT 960 kultūros surinktais dvi dienas iš eilės nuo 130 vaikus su galimu intratorakaliniuose tuberkuliozės
MGIT 960 kultūros sukeltų skreplių mėginių rezultatai
diena 1
Positive
neigiamas
viso
2 diena
teigiamą
16 (12,3%)
14 (10,8%)
30 (23,1%)
Neigiama
4 (3,1%)
96 (73,8%)
100 (76,9%)
viso
20 (15,4%)
110 (84,6%)
130
pav. surinkti 2 dienas iš eilės
Palyginimas YRA ir GA 2 Individualios ir sutampa analizė Xpert MTB /RIF pozityvumo skrandžio išsiurbimo ir sukeliama skreplių mėginiai
Apskritai mėginiuose (IS + GA), kuris buvo teigiamas nei tepinėlis ir /ar kultūros (127/520), iš Xpert MTB /RIF tyrimo jautrumas buvo šiek tiek mažesnis (68,5%, 87/127), palyginti su bakteriologinio tyrimo (1 lentelė), tačiau ji taip pat aptikta 7,9% (31/393) PAPILDOMA atvejai per kultūrą suteikiant bendrą jautrumą 22,7% [118/520] (p
= N), tačiau žymiai didesnis (p
= 0,001) jautrumas nei tepinėlio mikroskopija (4 lentelė). Iš Xpert MTB /RIS pasirodymas buvo 95,6% (22/23) ant tepinėlio ir kultūros teigiamų archyve pavyzdžių, kaip parodyta (1 lentelė) ir srauto diagramą (1 pav.). Visi 14 mėginiai, davusios NTM rūšys tepinėlis neigiamas, tačiau kultūros ir M-PGR teigiamas. Taigi iš naujo įvertinti, kad Xpert MTB /RIS jautrumas tepinėlis neigiamas, tačiau kultūros teigiamas (tik MTB) mėginius buvo 72,2% (65/90). Bet jei visi kultūros teigiami mėginiai buvo paimti kartu nenagrinėdamas mikobakterinė rūšis, jautrumas sumažėjo iki 62,5% (65/104) dėl 14 NTM izoliatai. Iš Xpert MTB /RIS jautrumas nesiskyrė tarp GA ir IS mėginiai, jei visi bakteriologiškai (tepinėlis ir /ar kultūros) teigiamas GA (92,2%, 71/77) ir yra (94%, 47/50) mėginiai buvo palyginti , Nėra NTM teigiamas mėginys buvo klaidingai nustatė Xpert MTB /RIF tačiau ji praleido vieną tepinėlio, kultūrą ir m-PGR teigiamas pavyzdys, izoliatas buvo įvardytas kaip MTB iki m-PGR ir. Visi Xpert MTB /rifas Teigiami mėginiai taip pat buvo M-PGR teigiamas. Taigi mūsų vidaus M-PGR ir Xpert MTB /rifas parodė 100% sutapimą į NTM /MTB diferenciacijos (1 pav.) .table 4 jautrumas, specifiškumas ir prognozavimo vertybių Xpert MTB /RIF testo nuoroda į AFB tepinėlis ir Bactec- MGIT960 kultūra sukeltas skreplių (N
= 260), palyginti su skrandžio aspiracija (N
= 260) mėginiai
jautrumas
specifiškumas
PPV
GDV
LRF teigiamą testą
diagnostikos tikslumas
jautrumas (tepinėlis teigiamas)
jautrumas (tepinėlis neigiamas)
Xpert MTB /rifas analizė vs kultūra
sukeltas skreplių
35/50 (70,0%; 56,2-80,9) *
198/210 (94,3%; 90.3-96.7) ** pervežimas 74,5% (60,5 -84,6)
92,7% (88,7-95,7)
12,2% (10,2-14,8)
89,6% (85,3-92,8)
6/6 (100%)
29/44 ( 65,9%)
Skrandžio Ištraukite
52/77 (67,5%; 56.5-76.9) *
164/183 (89,6%; 84.3-93.2) **
73,2% (61.9-82.1)
87,8% (81,2-90,9)
6,5% (5,8-7,3)
83,1% (78,0-87,1)
16/17 (94,1%)
36/60 (60,0%)
AFB vs Kultūra
sukelta skreplių
6/50 (12,0%; 5,6-23,8) ***
210/210 (100%; 98.2-100)
100% (60.8-100) pervežimas 82,7% (77.5-86.8) -
83,1% (78,1-87,1)
NA
NA
Skrandžio Ištraukite
17/77 (22,1%; 14.3-32.5)
183/183 (100%; 97,9-100)
100 % (81,6-100)
75,3% (71,4-81,6) -
76,9% (71.4-81.6)
NP
na
duomenų n /n (%, 95% PI) arba% (95% PI), teigiama prognostinė vertė (PPV), neigiama prognostinė vertė (GDV), tikimybė santykis (LRF) * p
= 0,77, ** p
= 0,087, *** p
= 0,792
palyginimas Xpert MTB /RIS, kultūros ir AFB tepinėlis mikroskopijos
Xpert MTB /rifas tyrimas aptiko papildomą 31 393 (7,9%) mėginių, kurie buvo tiek AFB tepinėlis ir MGIT kultūra neigiamas, tačiau praleido 39 104 (37,5%) kultūros teigiamų mėginių (4 lentelė). Vaikams, kurių tikėtinas intratorakaliniuose tuberkuliozės, skrandžio aspiracija nustatė daugiau bylų nei sukeltas skreplių per tepinėlio mikroskopija, kultūrą ir Xpert MTB /RIF testą (6.5, 29,6, ir 27,3%, palyginti
2.3, 19,2 ir 18,0% atitinkamai). Derlingumas Xpert MTB /RIF tyrimo mažėjo ilgėjant saugojimo trukmė GA taip pat IS mėginiai. Be saugomi už 650-849 dienų pavyzdžių, aptikimo norma Xpert MTB /RIF tyrimo On mėginių buvo 85,7%, ty sumažėjo iki 33,3% per saugomi ilgiau nei 1050 dienų pavyzdžius. Be to, šios normos buvo 77,1 ir 50%, atitinkamai GA mėginių (3 pav.). Po ilgo saugojimo skirtumo tarp IS ir GA derlius buvo labai reikšmingas (p
= 0,002). Pav. 3 Mažėjančios pozityvumo normos Xpert MTB /RIF tyrimą, atsižvelgiant į trukmę saugojimo skrandžio išsiurbimo ir sukeliama skreplių mėginiai
Diskusijos
Buvo publikacijų Xpert MTB /RIS taip pat žinomas kaip GeneXpert arba kasetės srautas remiantis nukleino rūgščių amplifikacijos tyrimas (CBNAAT) per pastaruosius 3 metus. Tai pirmoji studija iš Indijos ant Xpert MTB /RIF tyrimo vartoti vaikams su intratorakaliniuose TB, taip pat pirmasis tyrimas pranešti apie šio testo naudos "archyvą GA ir IS mėginiai iš vaikų TB endeminių šalyje. Tyrimas rodo, kad net GA ir mėginiai saugomi iki 4 metų Xpert MTB /rifas tyrimas išliko naudinga kaip diagnostikos priemonė vaikystės tuberkulioze. GA ir mėginių, kurie buvo tepinėlis ir kultūra teigiamą sprendimą, Xpert MTB /RIF tyrimo jautrumas buvo 95,6%, kuris yra panašus į tą, pranešė šviežių klinikinius mėginius. Kaip ir tikėtasi iš Xpert MTB /RIS jautrumas buvo pranašesnis, kad tepinėlio mikroskopija (psl
= 0,0001). Tačiau Xpert MTB /RIF tyrimo jautrumas Kultūros teigiami, bet tepinėlis neigiami mėginiai buvo mažesnis (62,5%). Atlikimas Xpert MTB /RIF tyrimą jau anksčiau buvo įvertintas daugiausia surinktų iš pacientų suaugusiųjų tuberkuliozės [27-30], turintis gerą jautrumą tepinėlio ir kultūros teigiamų mėginių (98-100%), tačiau daug mažesnį jautrumą tepinėlis neigiamas skreplių mėginių skreplių mėginiai (43-70%). Mūsų išvados taip pat buvo panašus į šias išvadas, tačiau archyve pavyzdžius. Mažesnis jautrumas Xpert MTB /RIF tyrimu taip pat buvo pranešta ŽIV teigiamas suaugusiems pacientams [29]. Yra keletas tyrimų, kurie buvo atliekami su vaikais ir labai mažai kur spektaklis Xpert MTB /rifas tyrimą buvo įvertinta, išskyrus skreplių mėginių [4-10, 30, 31] pavyzdžius. Nicol ir kt. [8] įtraukta 452 vaikų analizei su bent viena yra pavyzdys iš kiekvieno vaiko. Jie taip pat parodė, prastos jautrumą mikroskopijos (6%), kultūros (16%) ir Xpert MTB /RIF tyrimo (13%), kad šių mėginių. Šioje studijoje, nors aptikimo lygis šių trijų metodų buvo didesnis, bet modelis buvo panašus. Kadangi mes išnagrinėjo tiek IS ir GA mėginiai dvi dienas iš eilės, palyginimu derlius iš IS pavyzdžių buvo gerokai mažesnis nei skrandžio aspiracija pavyzdžius. Nors nėra iki šiol paskelbti duomenys, kuriais tiek GA ir mėginiai buvo naudojami tuo pačiu tyrimu įvertinti jautrumą ir specifiškumą Xpert MTB /RIF tyrimo kliniškai galimų atvejų intratorakaliniuose tuberkuliozės, tačiau mūsų rezultatai buvo visiškai nuoseklūs su išvados Bates ir kt. [10], Rachow ir kt. [16] ir Sekadde ir kt. [17]. Mūsų tyrimas rodo, kad tepinėlis ir kultūra pajamingumas GA pavyzdžių yra pranašesnis tiems IS pavyzdžių, tačiau Xpert MTB jautrumas /rifas tyrimas buvo reikšmingai nesiskyrė GA ir IS pavyzdžius, mėginius saugomas -80 ° C tas pats trukmė (77,1 ir 85,7%, atitinkamai; p
= 049). Be to, mes surinkti tiek šiuos pavyzdžius dvi dienas iš eilės, ir šis protokolas šiek tiek, jei geresnį derlių visų diagnostinių metodų y tepinėlio, kultūros ir Xpert MTB /rifas tyrimu. Dėl šios dvigubos krypčių požiūrio, mes galime pasiekti aukštą diagnostikos {61 130; 46,9% vaikų (per paciento analizę)} derlių.
Dauguma leidiniai Xpert MTB /RIF arba CBNAAT buvę iš Užsachario Afrikoje [6, 8-10, 13, 16, 17]. Indija yra tuberkuliozės didele našta šalies ir centrinis TB padalinys Indijoje, kuri buvo padovanota į įgyvendinanti patikslintą nacionalinių tuberkuliozės kontrolės programą atsakomybę neseniai įdiegta daugiau nei 80 CBNAAT mašinos .. Bet Šalis konkretūs duomenys ir gairės, kaip naudotis CBNAAT mašinos diagnozuoti vaikystės tuberkulioze trūksta. Mūsų taip pat yra pirmasis tyrimas, kuriame mes naudojamas skrandžio Ištraukite ir sukeltas skreplių mėginį saugomi net iki 4.3 metų (mediana saugojimo laikotarpį 32,5 mėnesio). Be tepinėlio ir kultūros įrodyta mėginių jis parodė jautrumą 95,7%, kuris buvo ribose pranešė keli kiti darbuotojai, tačiau tik šviežių pavyzdžių [10, 17]. Šviežių mėginių kintamasis pridėtinė vertė iš Xpert MTB /RIS per MGIT kultūra buvo pranešta, tačiau mūsų tyrime ši pridėtinė vertė buvo minimalus (7,9%), tikriausiai dėl kai kurių mikobakterijų gyvybingumo praradimo dėl ilgalaikio saugojimo mėginių [32]. Papildomos aptikta per aukso standartas kultūros bandymų atvejus, buvo labai mažai tikėtina, kad klaidingai teigiamas. Mikobakterijų skaičiuoja ardančių sandėliavimo mėginių net po kelių dienų (30), bet prieštaringų pastabų Taip pat buvo kitų darbuotojų [33, 34]. Paramasivan ir kt. [33] pranešė, kad nėra ant jautrumo normos tepinėlis ir kultūros poveikis po skreplių mėginius laikyti net iki 10 dienų. Tessema ir kt. [34], pranešė, kad skreplių mėginių saugojimą net iki 80 dienų kambario temperatūroje ir šaldytų mėginių net iki 180 dienų neturėjo neigiamos įtakos kultūros derlius. Banda ir kt.