Xpert souwisou /RIF assay entschlof kann op archivéiert gastric aspirate benotzt gin an sputum Echantillon fir sensibel Diagnos vun Cabinet Tuberkulos VerfÜgung méiglech entschlof
Background VerfÜgung Tuberkulos (wuel) an Kanner vernoléissegt gëtt, haaptsächlech wéinst Manktem vun sensibel diagnostic Handwierksgeschir. Kuerzem huet Xpert souwisou /RIF assay der diagnostic Terrain revolutionéiert, mä seng Nëtzlechkeet vun Cabinet wuel nach net aus Indien a kee Rapport ass op hiren Asaz op laangfristeg archivéiert demolege gemellt ginn. VerfÜgung Method VerfÜgung Mir 130 geklaute Patienten rekrutéiert mat eventuellen intrathoracic Tuberkulos an hir gastric aspirate (GA) an entschlof sputum (ASS) Echantillon op 2 Nuechten Deeg goufen tëscht Januar 2009 an Dezember 2012. All Echantillon (n = 520) gesammelt ënnerworf waren Ënnersichung, BACTEC-MGIT Kultur ze Letztebuergeschen ged an zu -house VerfÜgung multiplex Hinnen alleguer. An aliquot vun all Prouf war bei -80 ° C a getest an Xpert souwisou /RIF assay an 2013 VerfÜgung Resultater gespäichert VerfÜgung verstänneg an Patient schlau ze erkennen Taux vun Letztebuergeschen ged microscopy Sample 4,4% an 10% huet, während fir BACTEC -MGIT Kultur war jidde 24,4% an 46,9%, respektiv. Vun der 130 Dag 1 GA Echantillonen, 31,5%, an 27,7% Dag 2 GA Echantillon waren Kultur positiv. Nëmmen 17,7% GA Echantillon waren op BDe positiv. Vun der 130 ASS Echantillon op Dag gesammelt 1 a Dag 2, 15,4%, an 23,1% Echantillon waren Kultur positiv. A Kombinatioun vun GA an ASS bescht Resultater Kriseperiod. souwuel GA an IS, de globale Empfindlechkeet vun Xpert souwisou /RIF op Letztebuergeschen ged a Kultur positive Echantillon kombinéiert war 95,6%. An Letztebuergeschen ged negativ a Kultur positive Echantillon seng Sensibilitéit war 62,5%. D'Dauer vun Prouf Stockage verkuebelt Xpert souwisou /RIF Test Leeschtung (p = 0.0001). An Letztebuergeschen ged positive Echantillon vun 650-849 Deeg gespäichert, seng Sensibilitéit war 85,7%, an 77,1% fir en Echantillon ASS an GA déi bis 33,3%, si waren nëmmen an 50%, respektiv, gespäichert wann fir méi wéi 1050 Deeg. VerfÜgung Diskussioun VerfÜgung Confirmatory Diagnos vun Tuberkulos besonnesch vun de Kanner ass e medezinesche Erausfuerderung. Nee Labo oder radiological Test kann zu engem zefriddenstellenden Niveau vun diagnostic Empfindlechkeet erreechen. Allerdéngs, an dat studéieren foundthat mir Kombinatioun vu multiple Echantillonen an Multiple diagnostic Tester kënne vill besser nozeginn ginn, wann notoptimum. Am Moment studéieren, Kombinatioun vun 2 gastric aspirates (GA) an 2 entschlof sputum (ASS) Echantillon op zwou Nuechten Deeg gesammelt, an getest op dräi diagnostic Methoden Kriseperiod eng bedeitend héich erkennen Tarif. Trotz laangfristeg Stockage, de globale Empfindlechkeet vun Xpert souwisou /RIF op Letztebuergeschen ged an -culture positive Echantillon nach ganz héich. Mä nodeems dësen Echantillon raumen ënner Konditiounen thesensitivity vun Xpert souwisou /RIF subfreezing ofgeholl bedeitend. Dëst erwaart ass, well souguer wann d'Prouf Letztebuergeschen ged ass a Kultur positiv, de Grof mycobacteria vum Liewe geet erof, no e puer Joer kann dat zielen zu engem undetectable Niveau erreecht. VerfÜgung Conclusioun VerfÜgung Dëse Rapport weist, datt Letztebuergeschen ged a Kultur positive Echantillon gespäichert um Konditiounen fir e puer Joer subfreezing kann an der Xpert souwisou /RIF assay benotzt ginn, iwwerdeems appreciable diagnostic Test Empfindlechkeet a Spezifizitéit ënnerhalen. VerfÜgung Schlësselwieder VerfÜgung Pediatrie Tuberkulos Indien Gastric Aspirate entschlof Sputum universitär Echantillon mPCR MGIT Kultur, Xpert souwisou /RIF Background VerfÜgung Weltgesondheetsorganisatioun (dÉI) geschate d'global Belaaschtung vun Tuberkulos (wuel) um 9 Milliounen nei Fäll an 1,5 Milliounen Doudesfäll am Joer 2013 [1]. Dëst abegraff zu 15% Belaaschtung vun Cabinet Fäll weider. Iwwer 74.000 Kanner stierwen vun wuel all Joer an et sinn ongeféier eng hallef Millioun nei Fäll jäerlech [2]. Wéi an Erwuessener, d'Majoritéit (70-80%) vum Kand wuel Fäll präsent mat hin Tuberkulos (PTB). Tuberkulos an Kanner huet Eurostat vernoléissegt, haaptsächlech wéinst Erausfuerderunge vun der Disponibilitéit vun effikass diagnostic Handwierksgeschir [3]. Indien ass ënnert 22 héich Belaaschtung Länner, wat d'gesamt wuel Heefegkeet Taux 17., mä ganz wéineg Informatiounen zu de Kanner iwwert epidemiology vun wuel sinn, seng Diagnos an Direktioun [4, 5]. VerfÜgung Am meeschte Astellungen Diagnos vun Cabinet wuel ass huet op der Basis vun Kontakt nogezunn, a ganz puer Versich fir aktiv Fall erkennen gemaach ginn. Dat ass virun allem wéinst Manktem vun enger pathognomonic Medeziner Presentatioun am Cabinet wuel an opgepasst sensibel diagnostic Handwierksgeschir [3, 4, 6, 7]. VerfÜgung No limitéiert Handwierksgeschir fir confirmatory Labo Diagnos, Evaluatioun vun medezinesch Geschicht, tuberculin Haut Testen, Këscht x-Ray an e Manktem vun Äntwert ze versuergen hëllefen de Medeziner Diagnos zu bruecht. Letztebuergeschen ged microscopy an microbiological Confirmatioun ass selten wéinst aarmséileg Empfindlechkeet vun dësen Tester erreecht, wéinst der paucibacillary Natur vun der Krankheet a Daf vun jonk Kanner am Deel eng optimal sputum Prouf ze bidden [6]. Ofwiesslung Echantillon och gastric aspirate (GA) entschlof sputum (ASS), nasopharyngeal aspirate, bronchio-alveolar lavage, laryngeal Swab, String Test an Hocker Echantillon [3, 7-10]. Ofhängeg vum diagnostic Test benotzt, hunn dës Echantillon Variabel Empfindlechkeet a Spezifizitéit gewisen. Et ass confirméiert datt gastric lavage Echantillon der héchster (40-92%) ze erkennen Taux déi, jee op der Empfindlechkeet vun den Labo Test adoptéiert. Aner Echantillon hunn aarmen erkennen Tariffer vun 4-43% fir bronchoalveolar lavage rangéiert gewisen, 24-30% fir nasopharyngeal Striewe, 27-63 fir laryngeal Swab an 20-30% vun entschlof sputum benotzt. Puer Aarbechter hunn och String Test benotzt mee Resultater hun net encouragéiert ginn [3, 7, 11-13]. VerfÜgung Déi rezent Aféierung vun der Xpert souwisou /RIF assay (Cepheiden, USA) huet däitlech d'Diagnos vun Tuberkulos an Erwuessener transforméiert , mee seng Demande fir d'Diagnos vun Cabinet wuel ass ënner Evaluatioun. Dëst assay ass rapid a stellt Resultater bannent 2 h [14]. An enger Politik Ausso 2011 Weltgesondheetsorganisatioun (DÉI), recommandéiert der Benotzung vun Xpert souwisou /RIF assay als virleefeg diagnostic Hëllefsprogramm ënner Kanner, an Erwuessener mat verdächtegt Mënsch immunodeficiency Virus (HIV) assoziéiert Tuberkulos an all fir Premier wuel verdächtegt Fäll [ ,,,0],15]. Duerno, hunn e puer Aarbechter mat Xpert souwisou /RIF assay fir d'Diagnos vun Cabinet Tuberkulos huet [10, 16-18]. Allerdéngs bleift déi grouss Verbreedung Benotzung vun Xpert souwisou /RIF fir d'Diagnos vun Cabinet wuel op eng Iddi Basis nach eng wäit Optioun. Fir Datum, sinn et nëmmen e puer Studien iwwert d'Applikatioun vun der Xpert souwisou /RIF fir d'Diagnos vun de geklaute wuel. Zwou Etuden Rapport iwwert de Gebrauch vun der Xpert souwisou /RIF op entschlof sputum zwee op hiren Asaz an gastric lavage Echantillon. Et gi keng Studien déi an zwee GA op Benotzung vun Xpert souwisou /RIF Rapport an ASS Echantillon gläichzäiteg op de selwechten Patient. Weider, et ass op d'Evaluatioun vun Xpert souwisou /RIF fir d'Diagnos vun Cabinet hin wuel kee Etude aus Indien. Ausserdem, huet den Déngscht vun Xpert souwisou /RIF op archivéiert GA an ASS Echantillon virdrun net iwwerpréift ginn. Zënter der Xpert souwisou /RIF nëmmen no 2011 sinn gouf, do ass keen anere rapid Test deen wuel an RIF Resistenz gläichzäiteg zu Echantillon erkennen kann wat virun 2011 gesammelt goufen och Dës Etude den Effet vun laangfristeg Späichere vun de Medeziner Echantillon fir de op wullt Detektioun vun wuel vun der Xpert souwisou /RIF assay. VerfÜgung Mir virdrun hu bericht, dass GA Echantillon wéi aSS Echantillon besser noginn bidden [19]. An enger nächster Rapport zougedréckt a mir och, datt de pH vun gastric aspirate neutralizing virun Veraarbechtung zu engem héichen Taux vu kontaminéierte féiert ouni d'Detectioun Taux verbesseren [20]. Am Moment studéieren Rapport mir op d'Leeschtung vun der Xpert souwisou /RIF op archivéiert GA an ASS Echantillon op zwou Nuechten Deeg vu Kanner mat eventuellen intrathoracic wuel gesammelt, agestallt als Deel vun enger duebeler zoufälleg kontrolléiert Prozess blinded d'Roll vun micronutrient supplementation ze studéieren vun de Kanner mat Zollformalitéiten-thoracic Tuberkulos. VerfÜgung Method VerfÜgung Sécuritéit Design a Thema Rekrutement VerfÜgung d'Etude tëscht Januar 2009 bis Dezember 2012 um All Indien Institut vun Medical Sciences (AIIMS) an Kalawati Saran Kanner d'Spidol gehaal war ( KSCH), souwuel zu New Delhi, Indien. Dëst Wierk war en Deel vun engem duebele blinded zoufälleg kontrolléiert Prozess d'Roll vun micronutrient supplementation an Kanner mat Zollformalitéiten-thoracic Tuberkulos [19-22] ze studéieren. Eng total vun 403 Kanner (58.2% Meedercher), am Alter tëschent 6 Méint an 14 Joer [Paracetamol Alter, 120 Méint; interquartile Gamme (IQR), 7-168 Méint], mat eventuellen Zollformalitéiten-thoracic wuel Coursë waren. D'Norm Klinik-radiological Critèrë fir Asklepios Zollformalitéiten-thoracic Tuberkulos huet an dëser Etude benotzt wéi virdrun publizéiert [19-22]. D'Diagnos vun intrathoracic Tuberkulos war op Rekommandatioune vun indesch Academy vun Pediatrie baséiert. All Kand mat simpel an Féiwer vu méi wéi 2 Wochen mat kee Verbesserung während siwen bis zéng Deeg Brauche natierlech an de leschte unexplained Gewiichtsverloscht oder Geschicht vun Kontakt mat wuel Patient an de leschten zwee Joer. All Tuberkulos Verdächteg mécht eng Këscht x-Ray (lateral an posterior-anterior). An Präsenz vun bestänneg x-Ray abnormalities, mat Net-Léisung vun de Medeziner Symptomer a keng Alternativ Ursaach fir Symptomer a Këscht x-Ray Conclusiounen, war en eventuellen Diagnos vun intrathoracic Tuberkulos feieren. All Kanner mat eventuellen Tuberkulos sech ze tuberculin Haut Test (sot), ambulatory gastric aspirates (GA) an entschlof sputum (ASS) Examen fir AFB Letztebuergeschen ged a Kultur ënnerworf. Kanner goufen op ATT als pro Recommandatioune vun der RNTCP [5] huet. Puer Stéchwierder: All Kanner mat eventuellen Zollformalitéiten-thoracic Tuberkulos sech ze gastric Striewe (GA) an entschlof sputum ënnerworf (ASS) Kollektioun fir zwou Nuechten Deeg (D1 & D2). Kanner goufen opgefuerdert 6 h fasting an de Moien zu der Bezeechnung Klinik ze mellen. No erkläre d'Prozedur an enger Maîtrise Zoustëmmung vun den Elteren a richteg Zoustëmmung vun de Kanner, eng adäquat Stad erofzesetzen Rouer (10-12G) duerch een nostril hin bis et de Mo. erreecht. D'Positioun vun Rouer war vun insufflation vun Loft an Mo. iwwerpréift. Den Inhalt vun Mo. sech zu steril Container misst, huet aspirated. Üblech Volumen gesammelt gouf ëm 10 ml. Echantillon sech fir weider Ofwécklung bannent 1-2 h ze Labo transportéiert. VerfÜgung An der selwechter gastric Striewe Sëtzen vun entschlof sputum mat enger Schéier vu ronn hallef Stonn duerno war. Fir sputum kopéiert, war d'Kand mat 2 hues salbutamol inhalation vun metered Portioun -inhalator (Taidy Asthalin, 100 μg /Zigrette, Cipla, Indien) primed) an spacer (Zeroastat Dofir spacer, Cipla, Indien) gefollegt vun nebulization mat 3 ml vun 3 % Salins iwwer nächst 15-20 min. All Echantillon waren eenzegaarteg Code Zuelen kritt; an ouni e Link op de Medeziner an Patient Detailer zu den Labo geschéckt. Echantillon waren op der selwechter Dag fir AFB Letztebuergeschen ged, BACTEC-MGIT Kultur Filteren an zu-Haus zu Hinnen alleguer [23]. Séminairen a aneren Patient Detailer goufen zu iwwerschratt Plack opgeholl vum Kannerdokter bestéet an de Labo war vun der Medeziner Diagnos vun de Sujeten net bewosst. VerfÜgung ethneschen Respekt VerfÜgung D'Etude vun Finanzpolitiker Ethik Comité vun All Indien Institut vun Medical Sciences ofgeseent gouf , New Delhi an Kalawati Saran Kanner Spidol, New Delhi, Indien, an de Prozess gouf um clinicaltrials.gov (NCT 00801606) registréiert. Schrëftlech informéiert Averständnes war vun Elteren /Dépositaire vun all Kand kritt. VerfÜgung schafft Methoden VerfÜgung Sample Veraarbechtung VerfÜgung ASS an GA (pH Net-neutraliséiert) Echantillon verschafft goufen als virdru beschriwwen [19, 21, 23, 24] . An dowéinst, goufen d'Echantillonen fir 10 min, bei 4 ° C bei 10.000 x g centrifuged; supernatant decanted a war PELLET zu gläicher Volume vun 0,5% NALC-4% NaOH Mëschung zu 50 ml minimal capped Ronn ënnen Veraarbechtung iech s-gespaart. D'Spär gouf grëndlech (4 x 10 ass all nolauschterer) vortexed adäquate Vermëschung ze suergen a war fir 10 min bei 37 ° C incubated. No incubation, alkaline pH war bei 4 ° C mat phosphate gefiermt [PBS (pH 6,8, total Volume vun 50 ml)] gefollegt vun final centrifugation bei 10.000 x g fir 10 min, neutraliséiert. D'supernatant war decanted; der PELLET Neiwahlen zu 2 ml vun der PBS an 0,5 ml Volumen aliquoted zu 4 steril Krunn gespaart. One aliquot war fir Letztebuergeschen ged Virbereedung, eent fir Kultur an en anere fir Testen an en zu-Haus zu multiplex Hinnen alleguer (m-Hinnen alleguer) benotzt. One aliquot war bei -80 ° C fir weider benotzt ginn. Vun ee aliquot, war eng 500 μl Ophiewe vun BACTEC MGIT-960 flësseg Kultur System (BACTEC
TM MGIT, Becton Dickinson, Sparks, USA) inoculated, de Standard Protokoll benotzt [25]. Onofhängeg vun enger positiver oder eng negativ flashed Resultat, waren all Kulturen duerch Ziehl-Neelsen staining iwwerpréift. Dat vun isolates an Mycobacterium Tuberkulos VerfÜgung (souwisou) oder Net-tuberculous mycobacteria (NTM) vun enger Planz spezifesch zu-Haus VerfÜgung m-Hinnen alleguer [23] land war. Der ASS an GA Prouf aliquots, bei -80 ° C gespäichert, goufen am Xpert souwisou /RIF assay retrospectively iwwerpréift. VerfÜgung Xpert souwisou /RIF Test VerfÜgung Am Joer 2013, huet d'gespäichert Echantillon zu Xpert souwisou /RIF Testen ënnerworf . Et goufen 520 decontaminated GA an ASS vläit Echantillon (130x2 GA & 130x2 ASS) déi fir lafend gëeegent waren, anerer waren entweder net genuch am Quantitéit oder Qualitéit (knaschtege). 1 (Ganzen 2 ml), an incubated fir 15 min bei Raumtemperatur: d'Prouf reagent gefiermt wouvun NaOH an isopropanol war am Verhältnis vun 3 notéiert. D'behandelt Prouf (2 ml) war dunn nees Xpert souwisou /RIF Patroun transferéiert der Feierbekämpfung Prellbock, lyophilized reagents fir DNA erauszéien a Hinnen alleguer amplification mat. No adäquate Vermëschung, war de Patroun vun der Xpert souwisou /RIF Instrument erausgestallt, den pro Fabrikant d'Instruktioune (Cepheiden, USA). D'Instrument stécht specimen Vermëschung, sonication vun der mycobacterial bacilli an intern Kontroll (Spore), DNA release an Vermëschung mat Hinnen alleguer reagents, automatesch. Dëst duerch eng hemi-gemaach Echtzäit-Hinnen alleguer amplification duerno ass, Zil- erkennen duerch fënnef-Faarf fluorescence molekulare Punk Ämter an intern Kontroll an-situ VerfÜgung. Resultater sinn der 2 h an Untersuchungshaft den M. Tuberkulos VerfÜgung entsteet - negativ oder positiv mat semi-laachen bacillary opbauen wéi héich, mëttelfristeg, Zuelen oder niddreg a wann de pathogen ass RIF sensibel oder méi resistent [14]. De Patient Detailer goufen un d'Echantillonen nëmmen an der Réalisatioun vun der Xpert souwisou /RIF Evaluatioun getest verbonnen. VerfÜgung statistique Analyse VerfÜgung Empfindlechkeet vun Xpert souwisou /RIF vun que MGIT Kultur bestätegt Echantillon als wouer positive sech war. Fir d'Spezifizitéit vun Xpert souwisou /RIF, Letztebuergeschen ged, MGIT Kultur bestëmmen an zu-Haus VerfÜgung m-Hinnen alleguer negativ Echantillon sech als richteg negativ Echantillon considéréiert. Positiv predictive Wäerter (PPV), negativ predictive Wäert (NPV) a Chancen Verhältnis fir positiv (LRP) Xpert souwisou /RIF sech mat 95% CI (Vertraue Intervalle) berechent. LRP vun grouss wéi ee seet, dass den Test Resultat ass Wahrscheinlechkeet richteg positiv a manner wéi een heescht dass d'Test Resultat wahrscheinlech richteg negativ ass [26]. Pearson Chi Feld Test war fir Verglach vun Patient schlau Analyse gesuergt. Fir ausschléissen war den Undeel vum Accord vun Chance, Cohen d'Kappa VerfÜgung Test benotzt. A p-Wäert vu &Si besteet;. 0.05.was als statistesch relevant [StataLanguage 11.0 (Uni Gare, Texas, USA) Software fir all statistesch Analyse benotzt gouf] VerfÜgung Resultater VerfÜgung An dëser Etude, tëscht Januar 2009 bis Dezember gehaal 2012. a Total vun 403 Kanner (58.2% Meedercher), am Alter tëschent 6 Méint an 14 Joer [Paracetamol Alter, 120 Méint; interquartile Gamme (IQR), 7-168 Méint], mat eventuellen Zollformalitéiten-thoracic wuel Coursë waren. Nëmmen waren déi Kanner och aus deenen zwou GA an ASS Echantillon gesammelt op zwou Nuechten Deeg goufen sinn. Dofir, vläit ASS an GA op zwou Nuechten Deeg aus 130 Kanner kritt en Echantillon sech duerch Xpert souwisou /RIF assay analyséiert. D'decontaminated Echantillon sech fir 21,4 op 51,9 Méint (Steiren Stockage Period 32,5 Méint; IQR 27-35.1) bei -80 ° C gespäichert ier dës ze Xpert souwisou /RIF Analyse ënnerworf waren. De Labo fort fun der Strooss an Resumé vun Resultater sinn an Lalumi gewisen. 1. Figebam. 1 Flow Charts d'Abezéiung vun Echantillon mat Bluddungen Prouf Ofwécklung vum alldeegleche Liewen, Methode benotzt a Resultater als pro Strobe Richtlinnen VerfÜgung Diagnostic Resultat vun ASS an GA op zwou Nuechten Deeg gesammelt Echantillon VerfÜgung Nëmmen 23 aus 520 (4,4%) Echantillon vu 13 (10%) Kanner sech AFB Letztebuergeschen ged positiv (Figebam. 1). Vun dësen 23 Echantillonen, waren 9 D1 an 8 sech D2 GA Echantillon. Zweeten Dag (D2) GA Echantillon fonnt 3 zousätzlech AFB Letztebuergeschen ged positiv Fäll iwwerdeems et 4 Fäll nëmmen déi op D1 positiv waren, dohier do war keen Netz fortlafend Wäert vun engem D2 GA Prouf. Nëmmen 3 ASS Echantillon sech positiv op entweder D1 oder D2. D'D2-ASS Prouf Matleed Fall mä och ee Fall. Siechzeg een aus 130 (46.9%) Kanner [127 vun 520 (24.4%) Echantillon] goufen Kultur Tuberkulos entweder duerch Letztebuergeschen ged oder Kultur (Table 1) confirméiert ze hunn diagnostizéiert. Aus 130 D1-GA Echantillon 41 (31.5%) während 36 (27.7%) vun D2-GA Echantillon waren Kultur positiv. Zwanzeg dräi (17.7%) Kanner haten eng Kultur positive GA op BDe (Table 2). De Rendement vun entschlof sputum Echantillon war aarmséileg. Vun 130 Echantillon ASS op D1 gesammelt, nëmmen 20 Echantillonen (15.4%) waren positiv iwwerdeems op D2, 30 (23.1%) Echantillon Kultur sech positiv (Table 3). Aachtelsfinalë (12,3%) Kanner haten eng Kultur positive BDe ASS op. D'MGIT Kultur noginn vum GA an ASS Echantillon op zwou Nuechten Deeg gesammelt ass am (Bedeitung 2 & 3, bzw.) gewisen. Et war keen zousätzleche Wäert vun engem zweeten Dag GA Prouf fir Letztebuergeschen ged microscopy (9 vs 8), Kultur (41 géint 36), oder Xpert souwisou /RIF assay (33 vs VerfÜgung 34). Allerdéngs, ASS Echantillon op zwou Nuechten Deeg gesammelt e wesentleche zousätzleche Wäert vun der Kultur (20 vs VerfÜgung 30) mee en gesäit zousätzlech increment an der Xpert souwisou /RIF assay (22 vs VerfÜgung 25) gëtt. A Kombinatioun vun heiten an ee ASS Prouf huet beschte diagnostic Déngscht, onofhängeg vun D1 oder D2. Bal, 50% Echantillon (entweder GA oder ASS) waren Xpert souwisou /RIF positiv op BDe (Figebam. 2) .Table 1 Performance vum Xpert souwisou /RIF assay zu bacteriologically positiv an negativ bacteriologically Echantillon [Kombinatioun vun gastric aspirates (n
= 260) an entschlof sputa (n VerfÜgung = 260)] vu Kanner mat eventuellen intrathoracic Tuberkulos VerfÜgung Bacteriological Critèren gesammelt (N = 520)
Sub-Critèren
Nee . (%)
Xpert souwisou /RIF Resultater VerfÜgung Positiv VerfÜgung (%)
Negativ (%)
Bacteriologically positiv (n VerfÜgung = 127; 24,4%) VerfÜgung Letztebuergeschen ged (+), Kultur (+) zu 23 (4,4) *, ** VerfÜgung 22 (95.7) VerfÜgung 1 (4,3) VerfÜgung Letztebuergeschen ged (-), Kultur ( +) zu 104 (20) * VerfÜgung 65 (62.5) zu 39 (37.5) VerfÜgung Letztebuergeschen ged (+), Kultur (-) VerfÜgung 0 VerfÜgung 0 VerfÜgung 0
Subtotal VerfÜgung 127 VerfÜgung 87 (68.5) zu 40 (31.5) VerfÜgung Bacteriologically negativ (n VerfÜgung = 393; 75,5%) VerfÜgung Letztebuergeschen ged (-), Kultur (-)
393 VerfÜgung 31 (7.9) VerfÜgung 362 (92.1) VerfÜgung Total VerfÜgung 520 zu 118 (22,7) ** VerfÜgung 402 (77.3) VerfÜgung Den Dësch héich Efficacitéit vun Xpert weist souwisou /RIF zu Kultur a Letztebuergeschen ged positive Echantillon mä moderéiert erkennen Tarif am Letztebuergeschen ged negativ Kultur positive Echantillon VerfÜgung *, ** P VerfÜgung &Si besteet; 0,001, (+) - positiv, (-) - Negativ, Zuel vun parenthesis weg Prozentsaz VerfÜgung Table 2 Performance vum MGIT 960 Kultur op gastric aspirate Echantillon op zwou Nuechten Deeg aus 130 Kanner mat eventuellen intrathoracic Tuberkulos VerfÜgung MGIT960 Kultur gesammelt Resultater
Day 1 VerfÜgung positiv
Negativ
Total
Day 2 VerfÜgung positiv VerfÜgung 23 (17.7%) VerfÜgung 13 (10%) zu 36 (27.7%) VerfÜgung Negativ VerfÜgung 18 (13,8%) VerfÜgung 76 (58.5%) VerfÜgung 94 (72.3%) VerfÜgung Total
(31.5%) VerfÜgung 89 (68.5%) VerfÜgung 130 VerfÜgung Table 3 Performance vum MGIT 960 Kultur op entschlof sputum Echantillon gesammelt op zwou Nuechten Deeg aus 130 Kanner mat eventuellen intrathoracic Tuberkulos VerfÜgung MGIT 960 Kultur Resultater
Day 1 VerfÜgung positiv
Negativ
Total
Day 2 VerfÜgung positiv VerfÜgung 16 (12,3%) VerfÜgung 14 (10.8%) VerfÜgung 30 (23.1%) VerfÜgung Negativ VerfÜgung 4 (3,1%) VerfÜgung 96 (73.8%) VerfÜgung 100 (76.9%) VerfÜgung Total
20 (15.4%) VerfÜgung 110 (84.6%) VerfÜgung 130 VerfÜgung Figebam. 2 individuell a iwwerlageren Analyse vun Xpert souwisou /RIF komm an gastric aspirate an entschlof sputum gesammelt Echantillon op 2 Nuechten Deeg VerfÜgung Se ASS an GA VerfÜgung, Allgemengen zu Echantillon (IS + GA) déi entweder am Letztebuergeschen ged positive sech an /oder Kultur (127/520), gouf vun der Empfindlechkeet vun Xpert souwisou /RIF assay liicht manner (68.5%, 87/127) als Verglach zu bacteriological Ënnersichung (Table 1) mee se fonnt och 7,9% (31/393) zousätzlech Fäll iwwer der Kultur eng allgemeng Empfindlechkeet vun 22,7% Féierung [118/520] (p VerfÜgung = NS) mee vill méi héich (p VerfÜgung = 0.001) Empfindlechkeet wéi Letztebuergeschen ged microscopy (Table 4). D'Performance vum Xpert souwisou /RIF war 95,6% (22/23) op Letztebuergeschen ged a Kultur positive archivéiert Echantillonen, wéi am (Table 1) an Flux Charts (Figebam. 1) gewisen. All 14 Echantillonen datt NTM Arten Kriseperiod sech Letztebuergeschen ged negativ mee Kultur a m-Hinnen alleguer positiv. Dohier op bass-Evaluatioun, der Empfindlechkeet vun Xpert souwisou /RIF op Letztebuergeschen ged negativ mee Kultur positiv (souwisou nëmmen) Echantillon war 72,2% (65/90). Mee wann all Kultur positive Echantillon zesumme geholl goufen, ouni de mycobacterial Arten que, gefall der Empfindlechkeet op 62,5% erof (65/104) wéinst 14 NTM isolates. Der Empfindlechkeet vun Xpert souwisou /RIF hutt ënnerscheeden net vill tëscht den GA an ASS Echantillon wann all bacteriologically (Letztebuergeschen ged an /oder Kultur) positiv GA (92.2%, 71/77) an ASS (94%, 47/50) Echantillon Verglach huet . Nee NTM positiv Prouf war Bunga vun Xpert souwisou /RIF identifizéiert mä et nëmmen ee Letztebuergeschen ged, Kultur a m-Hinnen alleguer positiv Prouf, war d'isoléieren wéi souwisou vum m-Hinnen alleguer an identifizéiert. All Xpert souwisou /RIF positive Echantillon waren och m-Hinnen alleguer positiv. Dofir eis zu-Haus m-Hinnen alleguer an Xpert souwisou /RIF zougedréckt 100% concordance an NTM /souwisou dat (Figebam. 1) .Table 4 Sensibilitéit, Spezifizitéit an predictive Wäerter vun Xpert souwisou /RIF assay Lokalzäit AFB Letztebuergeschen ged an Bactec- MGIT960 Kultur zu entschlof sputum (n VerfÜgung = 260) vs. gastric aspirate (n VerfÜgung = 260) Echantillon
Empfindlechkeet
Spezifizitéit
PPV VerfÜgung VerfÜgung NPV
LRF vun positiven Test
Diagnostic Genauegkeet
Empfindlechkeet (Letztebuergeschen ged positiv)
Empfindlechkeet (Letztebuergeschen ged negativ)
Xpert souwisou /RIF assay vs Kultur VerfÜgung entschlof Sputum VerfÜgung 35/50 (70.0%; 56.2-80.9) * VerfÜgung 198/210 (94.3%; 90.3-96.7) ** VerfÜgung 74,5% (60.5 -84.6) zu 92,7% (88.7-95.7) zu 12,2% (10.2-14.8) zu 89,6% (85.3-92.8) zu 6/6 (100%) VerfÜgung 29/44 ( 65,9%) VerfÜgung Gastric Aspirate VerfÜgung 52/77 (67.5%; 56.5-76.9) * VerfÜgung 164/183 (89.6%; 84.3-93.2) ** VerfÜgung 73,2% (61.9-82.1)
87,8% (81.2-90.9) zu 6,5% (5.8-7.3) zu 83,1% (78.0-87.1) VerfÜgung 16/17 (94.1%) VerfÜgung 36/60 (60.0%)
AFB vs Kultur VerfÜgung entschlof Sputum VerfÜgung 6/50 (12.0%; 5.6-23.8) *** VerfÜgung 210/210 (100%; 98.2-100) zu 100% (60.8-100) zu 82,7% (77.5-86.8) VerfÜgung - VerfÜgung 83,1% (78.1-87.1) zu NA VerfÜgung NA VerfÜgung Gastric Aspirate VerfÜgung 17/77 (22.1%; 14.3-32.5) VerfÜgung 183/183 (100%; 97.9-100) VerfÜgung 100 % (81.6-100) zu 75,3% (71.4-81.6) VerfÜgung - VerfÜgung 76,9% (71.4-81.6) zu NA NA VerfÜgung Data n /N (% VerfÜgung; 95% CI) oder% (95% CI), positiv predictive Wäert (PPV), negativ predictive Wäert (NPV), Chancen Verhältnis (LRF), * p VerfÜgung = 0.77, ** p VerfÜgung = 0,087, *** p VerfÜgung = 0,792 VerfÜgung Se Xpert souwisou /RIF, Kultur an AFB Letztebuergeschen ged microscopy VerfÜgung Xpert souwisou /RIF assay eng zousätzlech 31 vun 393 (7.9%) Echantillon fonnt déi souwuel AFB sech Letztebuergeschen ged an MGIT Kultur negativ awer nëmmen 39 vun 104 (37.5%) Kultur positive Echantillon (Table 4). An Kanner mat eventuellen intrathoracic Tuberkulos, méi Fäll wéi entschlof sputum benotzt Letztebuergeschen ged microscopy, Kultur an Xpert souwisou /RIF assay gastric aspirate identifizéiert (6.5, 29,6 an 27,3% vs VerfÜgung 2,3, 19,2 an 18,0%, respektiv). Rendement vun Xpert souwisou /RIF assay ofgeholl mat Dauer vum Stockage vun GA waarden souwéi Echantillon ASS. Am Echantillon vun 650-849 Deeg gespäichert, war d'Detectioun Taux vun Xpert souwisou /RIF assay op ASS Echantillon 85,7% déi am Echantillon zu 33,3%, si waren nëmmen fir méi wéi 1050 Deeg gespäichert. Den Zerfall, goufen dës Taux 77,1 an 50%, respektiv an GA Echantillon (Figebam. 3). No laange Stockage Ënnerscheed zu de Rendement vun ASS an GA war absolut wichteg (P VerfÜgung = 0.002). Figebam. 3 zréckgeet komm Taux vun der Xpert souwisou /RIF assay par rapport zu Dauer vum Stockage vun gastric aspirate an entschlof sputum Echantillon VerfÜgung Diskussioun VerfÜgung Et huet och als GeneXpert oder Patroun bekannt e Flux vu Publikatiounen op Xpert souwisou /RIF gouf baséiert Nukleinsaier amplification Testen (CBNAAT) an de leschten 3 Joer. Dëst ass déi éischt Etude vun Indien op d'Benotzung vun der Xpert souwisou /RIF assay an Kanner mat intrathoracic wuel an och déi éischt Etude iwwert d'Bedeitung vun dëser assay op archivéiert GA zu Rapport an ASS Echantillon vun Kanner an wuel ënner Naturschutz Land. D'Etude weist, datt och zu GA an ASS Echantillon fir bis zu 4 Joer gespäichert, déi Xpert souwisou /RIF assay als diagnostic Hëllefsprogramm fir Kandheet Tuberkulos nëtzlech bliwwen. An GA an ASS Echantillon déi sech Letztebuergeschen ged a Kultur positiv, war d'Empfindlechkeet vun Xpert souwisou /RIF assay 95,6%, wat fir datt zu frësch Medeziner Echantillon gemellt ähnlech ass. Wéi erwaart huet d'Empfindlechkeet vun Xpert souwisou /RIF ausféieren ze dass vun Letztebuergeschen ged microscopy (p VerfÜgung = 0.0001). Allerdéngs war d'Empfindlechkeet vun Xpert souwisou /RIF assay op Kultur positiv mee Letztebuergeschen ged negativ Echantillon ënneschten (62.5%). Leeschtung vun Xpert souwisou /RIF assay huet virdrun bewäert ginn haaptsächlech op sputum Echantillon vun Erwuessenen wuel Patienten gesammelt [27-30], eng héich Empfindlechkeet vun Letztebuergeschen ged a Kultur positive Echantillon (98-100%), mee eng vill méi déif Sensibilitéit am Letztebuergeschen ged weist negativ sputum Echantillon (43-70%). Eis Conclusiounen sech och ähnlech zu dëse Conclusiounen, mä op archivéiert Echantillon. A manner Empfindlechkeet vun der Xpert souwisou /RIF assay huet och vun HIV positive erwuessener Patienten [29] gemellt ginn. Et sinn e puer Studien déi an Kanner an engem ganz wéineg wou Leeschtungsfähegkeet vun Xpert souwisou /RIF assay bewäert gouf op Echantillon aner wéi sputum Echantillon gehaal goufen [4-10, 30, 31]. Nicol et al. [8] abegraff 452 Kanner fir Analyse mat enger mindestens ASS vun all Kand kennt. Si huet och en armen Empfindlechkeet vun microscopy (6%), Kultur (16%) an Xpert souwisou /RIF assay (13%) an dëse Echantillon. Am Moment studéieren, wann erkennen Taux vun deenen dräi Methoden sech héich mä d'Muster war ähnlech. Well mir souwuel iwwerpréift ASS an GA Echantillon op zwou Nuechten Deeg, op Verglach vun der Streck Echantillon ASS war méi niddreg wéi gastric aspirate Echantillon. Wann et an déi sou wäit publizéiert keng Daten ass souwuel GA an ASS Echantillon hunn an déi selwecht Etude benotzt ginn d'Sensibilitéit an Spezifizitéit vun Xpert souwisou /RIF assay zu klinesch eventuellen Fäll vun intrathoracic Tuberkulos ze diskutéieren, nach eis Resultater am Ganzen concordance mat Conclusiounen vun Bates et al. [10], Rachow et al. [16] an Sekadde et al. [17]. Eis Etude weist dass Letztebuergeschen ged a Kultur falegelooss GA Echantillon ausféieren sinn zu deene vun ASS Echantillon Ee, d'Empfindlechkeet vun Xpert souwisou /RIF assay zu GA net vill anescht war an ASS Echantillonen, an Echantillon bei -80 ° C fir d'selwecht gespäichert Dauer (77.1 an 85,7%, respektiv; P VerfÜgung = 049). Ausserdeem, fänke mer souwuel dës Echantillon op zwou Nuechten Deeg, an deem Protokoll gëtt liicht besser nozeginn zu all diagnostic Techniken i.e. Letztebuergeschen ged, Kultur an Xpert souwisou /RIF assay. Well vun dëser duebeler Dräizack Approche, kéint mer eng héich diagnostic {61 vun 130 erreechen; 46,9% Kanner (pro Patient Analyse)} nozeginn. VerfÜgung meescht Publikatiounen op Xpert souwisou /RIF oder CBNAAT goufen aus Sub-Schwaarzafrika [6, 8-10, 13, 16, 17]. Indien ass e wuel héich Belaaschtung Land an der Mëtt wuel Divisioun vun Indien, déi d'Responsabilitéit vun der Aféierung vun der iwwerschafft national wuel Kontroll Programm kuerzem installéiert Moderniséierung gouf méi wéi 80 CBNAAT Maschinen huet .. Mee Land spezifesch Donnéeën an Richtlinnen op benotzt CBNAAT Maschinen fir diagnosing Kandheet Tuberkulos sinn subtil. Eis ass och déi éischt Etude Hellef mir gastric aspirate an entschlof sputum Prouf fir upto 4,3 Joer (Steiren Stockage Period vun 32,5 Méint) gespäichert ginn hunn. An Letztebuergeschen ged a Kultur bewisen Echantillon zougedréckt et Empfindlechkeet vun 95,7%, déi am Beräich vun e puer aneren Aarbechter gemellt war awer nëmmen op frësch Echantillon [10, 17]. An frësch Echantillon eng Variabel Wäert Zousätzlech vun der Xpert souwisou /RIF iwwer d'MGIT Kultur muss gemellt ginn, mä an eiser Etude dësem Wäert Zousätzlech war minimal (7.9%), wahrscheinlech wéinst e puer Verloscht vun mycobacterial Nuetsvolen op langfristeg Stockage vun Echantillon [32]. Déi zousätzlech Fäll iwwer dem gëllenen Standard Kultur Test fonnt, waren ganz onwahrscheinlech falsch positiv ze ginn. Mycobacterial zielt alles ewech op Stockage vun Echantillon och no puer Deeg (30) mee widderspréchlech Observatioune och vun anere Aarbechter [33, 34] gemaach ginn. Paramasivan et al. [33] gemellt, dass et an der raumen sputum Echantillon upto 10 Deeg keen Effet op d'Empfindlechkeet Tariffer vun Letztebuergeschen ged a Kultur war. Tessema et al. [34] hunn déi Stockage vun sputum Echantillon upto 80 Deeg bei Raumtemperatur an gefruer Echantillon gemellt upto 180 Deeg keen negativen Effekt op Kultur nozeginn haten. Banda et al.