Antike Analyse vun fréi an fortgeschratt Bléien adenocarcinomas vun de Mo:? Bestänneg oder erauskomm VerfÜgung méiglech VerfÜgung Background VerfÜgung Ausradéiere vun fréi gastric carcinoma (GC) ass geduecht fir Reduktioun vun der veruerteelt vun GC ze bedeelegen, virausgesat, dass déi meescht vun de fréie GCs Fortschrëtt fir den fortgeschratt GCs. Allerdéngs ass fréi GC alternativ engem deenen Variant vun GC considéréiert, an et Verlaf infrequently zu fortgeschratt GC. D'Zil vun dëser Etude huet sech d'Ausmooss vun iwwerlageren vun genetesch lineages tëscht fréi an fortgeschratt Bléien adenocarcinomas (Tubs) vun de Mo ze klären. VerfÜgung Method VerfÜgung Immunohistochemical staining fir p53 Leeschtung war 28 surgically resected Mamm mat 13 intramucosal Hëllef an 15 invasiv Woch. Vun chromosome- an lackeleg-baséiert Komparativ Frankräich hybridization (CGH), war Frankräich Kopie Zuel Konstitutioun tëscht der mucosal an invasiv Deeler vun der invasiv Woch an tëscht der mucosal Deeler vun der invasiv an intramucosal Woch Verglach, mat 25 an 22 Tubs, bzw.. TP53 VerfÜgung stattfannen an exons 5-8 zu 20 Tubs iwwerpréift huet. VerfÜgung Resultater VerfÜgung Chromosomal CGH Teamchef 4q + an 11q + goufen méi heefeg an fortgeschratt a fréi Woch, respektiv hierkommen Kopie Zuel Ännerungen am 8q a 17p zougedréckt keng grouss Ënnerscheeder tëscht fréi an fortgeschratt Woch. Allerdéngs weder CGH Teamchef, vun de 13 intramucosal Woch iwwerpréift, Verloscht vun MYC VerfÜgung (MYC VerfÜgung -) an de falschen Eck vun TP53 VerfÜgung (TP53 VerfÜgung +) war an 9 Woch an MYC fonnt
+ an /oder TP53 VerfÜgung - gouf an 3 Woch erwëscht. Vun der mucosal Echantillon vun 9 invasiv Woch, zougedréckt 7 MYC VerfÜgung - /TP53 VerfÜgung + a keen huet MYC VerfÜgung + an /oder TP53 VerfÜgung -. Vun den 9 Echantillon vun der invasiv Deeler, 1 (aus submucosal Cancers) zougedréckt MYC VerfÜgung - /TP53 VerfÜgung + a 6 (1 aus submucosal a 5 aus fortgeschratt Cancers) zougedréckt MYC VerfÜgung + an /oder TP53
-. Déi lescht 6 erhéijen zougedréckt allgemeng e Mann- Muster (diffusen oder Texter) an p53 immunohistochemistry, a 4 vun de 6 erhéijen assessable fir TP53 VerfÜgung Haaptrei Analyse réischt kennen. Déi gesamt vill CGH Muster uginn, datt tëscht der mucosal an invasiv Deeler, war genetesch antike erauskomm an 5 fortgeschratt Cancers a kontinuéierlech an 3 submucosal Cancers fonnt. Konklusiounen VerfÜgung genetesch lineages oft ënnerscheet tëscht fréi an fortgeschratt Woch VerfÜgung. MYC VerfÜgung - /TP53 VerfÜgung + an MYC VerfÜgung + an /oder TP53 VerfÜgung -. Kann de Ënnerschreften vun deenen an aggressiv Woch ginn, respektiv, am Mo VerfÜgung Background VerfÜgung Gastric Kriibs bleift déi zweet Équipe gemeinsam Ursaach vum Kriibs-Zesummenhang Doudesfäll weltwäit, trotz engem rezenten geloss an hir veruerteelt an entwéckelt Länner [1]. Gastric carcinomas (GCs) sinn séiert morphologically an 2 grouss Kategorien: Bléien-administrativ Typ an diffusen Zort [2, 3] an, an haut, an fréi Cancers (mat der mucosa an der submucosa) an fortgeschratt Cancers (mat der muscularis propria oder méi déif). Fréi GC ass eng curable Kriibs als [4]; et Verlaf Berichter zu fortgeschratt GC der durations als eng fréi Etapp vun GC [5, 6] verännerlech. An Japan, kann fréi GCs endoscopically ginn souwéi surgically [7] baséiert op den Prinzipien vun fréi ze erkennen an ze behandelen aktiv resected. Wéinst dem erhalen puer pathologists datt d'Bléien-administrativ neoplastic lesions datt de mucosa agespaart sinn eng laang Zäit huelen fir oder si knapp déif Stoffer ze violéieren. Doduerch, sinn dës lesions genannt dysplasia [4]. VerfÜgung Viru Kuerzem, eng Mass-Präventiounsprogramm fir neuroblastomas an Japan [8-10] gespaart war well e erauskomm genetesch antike tëscht der early- an de spéiden-Fotoe neuroblastomas fonnt gouf. neuroblastomas negativ an spéiden-Fotoe (≥1 Joer) zougedréckt Géigend-diploidy mat Verloscht vun Uschloss 1p hierkommen positive neuroblastomas zu Puppelcher zougedréckt Géigend-triploidy ouni 1p Läschen [11, 12]. Op der aner Hand, proposéiert -based Analyse Komparativ Frankräich hybridization (CGH) déi héich-Schouljoer atypical adenomatous hyperplasia an der haett der richteg Virleefer vun bronchioloalveolar carcinoma ass [13]. Am Mo, ass et e Problem zu wéi engem Ausmooss genetesch antike zu fréi overlapped ass an GCs viraussetzt. VerfÜgung an diffusen Typ GCs, déi mir CGH datt chromosomal Copy-Nummer hire Restaurant op der intramucosal signet-Ring Zell carcinomas ze beweisen, dass dat awer engem layered Struktur [14] huet zu enger Ëmwandlung vun Pro ënnerscheet GCs um fortgeschratt Etappen [15] geierft. D'Präsenz vun engem layered Struktur vun signet Ring Zellen am mucosal Deeler vun dësen Diplôme Cancers proposéiert och, datt signet Ring Zell carcinomas eng richteg Virleefer vum schlecht ënnerscheet GCs kann. CGH-baséiert antike Analyse vun aneren Ziel vun Pro ënnerscheet fortgeschratt GCs mat Bléien Komponente awer kee layered Struktur vun der mucosal Deel Teamchef GCs vun dësem Ziel vun enger Bléien Bestanddeel vun enger entholl ofgeleet goufen a sech duerch 17p- an 8q + [16] charakteriséiert an inactivation vun der Show-Typ TP53 VerfÜgung vun stattfannen a Verloscht vun heterozygosity (Loh) [17]. Fir de fréi-Etapp Kolleg vun dëser Zort vun GC ze bestëmmen, analyséiert mir intramucosal Bléien adenocarcinomas (Tubs) benotzt CGH. Dës Etude erausfonnt, datt d'intramucosal Woch huet net nëmmen e puer chromosomal Ännerungen gemeinsam ze fortgeschratt GCs awer och gewisen dacks 8q- a 17p + datt kritesch anescht aus fortgeschratt a schlecht ënnerscheet GCs sech [18]. VerfÜgung Am Moment studéieren, copy- Zuel Ännerunge vun chromosomes an Genen huet an der mucosal an invasiv Deeler vun enger anerer Serie vun fréi an fortgeschratt Woch mat vill an chromosomal CGH iwwerpréift. Baséierend op dës Donnéeën, hien huet mir Fäll vun kontinuéierlech a erauskomm lineages tëscht intramucosal an invasiv Deeler vun eenzelne erhéijen an fonnt dass TP53 VerfÜgung an MYC VerfÜgung lues gutt antike fir gastric Woch kann. VerfÜgung Method VerfÜgung D' institutionell Kritik Verwaltungsrot op Medical Ethik um Shiga Universitéit vun Medical Science mëschten Accord fir neien Dirigent vun dëser Fuerschung op der Conditioun datt den benotzt Material anonyme ginn muss. klinescher Echantillon
dës Etude 28 abegraff surgically resected Mamm (Table 1) mat 13 intramucosal Woch an 15 invasiv Woch [6 submucosal an 9 fortgeschratt Cancers datt d'muscularis propria oder déif Stoffer (d'Bléien Bestanddeel vun all entholl évaluéieren war méi wéi 30% ze gin) agefall]. All Mo. war zu formalin an Ënnerbewosstsinn paraffin Faarwen fest. Dës goufen an eisem Departement um zoufälleg aus der vun 1996 festgestallte Material ausgewielt bis 2008. Histological Typen an entholl Etappe waren laut sech zu der japanescher Course vun Gastric Cancer [19] an pTNM Stadium, bzw.. Wann e mucosal histological Muster fonnt huet an eng individuell invasiv entholl heterogen ze ginn, gouf deen Deel mat den niddregsten Schouljoer vun atypism wéi d'mucosal Prouf geholl, dass d'Méiglechkeet Re-Invasioun vu invasiv Kriibs Zellen an der mucosa verhënneren kënnen. An invasiv Cancers, DNA Echantillon waren aus intramucosal an invasiv parts.Table 1. Satz vun de Medeziner, histopathological a molekulare genetesch Donnéeën vun 25 Bléien adenocarcinoma vun Mo kritt VerfÜgung
Case Nr
Alter /Sex
Histological Typ *
Missiounen **
Am **
Etapp **
CGH
p53 IHC
TP53mutation
M1
57/M
tub1
T1(M)
N0
IA
c/a
+
NT
M2
72/M
tub1
T1(M)
N0
IA
c/a
+
NT
M3
67/F
tub1
T1(M)
N0
IA
c/a
-
-
M4
67/M
tub1
T1(M)
N0
IA
c/a
-
-
M5
74/M
tub1
T1(M)
N0
IA
c/a
+
-
M6
65/M
tub1
T1(M)
N0
IA
c/a
+
-
M7
67/F
tub1
T1(M)
N0
IA
c/a
+
-
M8
70/F
tub1 > PAP VerfÜgung T1 (M) VerfÜgung N0 VerfÜgung IA VerfÜgung c /enger VerfÜgung - VerfÜgung - VerfÜgung M9 VerfÜgung 51 /M VerfÜgung tub1 > tub2
T1(M)
N0
IA
c/a
+
-
M10
52/M
tub2
T1(M)
N0
IA
c/a
+
-
M11
57/F
tub2
T1(M)
N0
IA
NT/a
-
-
M12
89/M
tub2
T1(M)
N0
IA
NT/a
+
+
M13
70/M
tub1
T1(M)
N0
IA
NT/a
-
NA
S1m
73/F
tub2
T1(SM)
N0
IA
c/a
+
-
S1i
Wees /enger VerfÜgung + VerfÜgung - VerfÜgung S2m VerfÜgung 81 /F VerfÜgung PAP VerfÜgung T1 (SM) VerfÜgung N1 VerfÜgung normal schwätzen VerfÜgung c /enger VerfÜgung + VerfÜgung - VerfÜgung S2i VerfÜgung Nationaléquipe /enger VerfÜgung + VerfÜgung + VerfÜgung S3m VerfÜgung 79 /M VerfÜgung tub1 VerfÜgung T1 (SM) VerfÜgung N0 VerfÜgung IA VerfÜgung c /enger VerfÜgung + VerfÜgung + VerfÜgung S3i VerfÜgung Nationaléquipe /enger VerfÜgung + VerfÜgung + VerfÜgung S4m VerfÜgung 63 /M VerfÜgung tub2 > tub1 VerfÜgung T1 (SM) VerfÜgung N0 VerfÜgung IA VerfÜgung c /Wees VerfÜgung + VerfÜgung Wees VerfÜgung S5m VerfÜgung 75 /M VerfÜgung PAP > tub2
T1(SM)
N1
IB
c/NT
+
NT
S6m
79/M
pap
T1(SM)
N1
IB
c/NT
+
NT
A1m
71/M
tub2
T2(SS)
N2
IIIA
c/a
null
-
A1i
Wees /enger VerfÜgung automatesch VerfÜgung NA VerfÜgung A2m VerfÜgung 73 /M VerfÜgung tub1 > tub2 VerfÜgung T2 (SS) VerfÜgung N0 VerfÜgung normal schwätzen VerfÜgung c /enger VerfÜgung + VerfÜgung - VerfÜgung A2i VerfÜgung Nationaléquipe /enger VerfÜgung + VerfÜgung +
A3m VerfÜgung 56 /M VerfÜgung PAP VerfÜgung T2 (SS) VerfÜgung N1 VerfÜgung II VerfÜgung c /enger VerfÜgung + VerfÜgung - VerfÜgung A3i VerfÜgung Nationaléquipe /VerfÜgung engem + VerfÜgung + VerfÜgung A4m VerfÜgung 81 /M VerfÜgung tub2 /PAP VerfÜgung T2 (SS) VerfÜgung N2 VerfÜgung IIIA VerfÜgung c /enger VerfÜgung automatesch VerfÜgung - VerfÜgung A4i VerfÜgung Nationaléquipe /enger VerfÜgung automatesch VerfÜgung + VerfÜgung A5m VerfÜgung 56 /M VerfÜgung tub1 VerfÜgung T2 (MP) VerfÜgung N0 VerfÜgung normal schwätzen VerfÜgung c /Wees VerfÜgung - VerfÜgung Wees VerfÜgung A5i VerfÜgung NT/NA
-
NA
A6m
45/F
tub2
T2(SS)
N1
IB
c/NT
+
NT
A7m
79/F
tub2
T2(MP)
N1
IB
c/NT
+/-
NT
A8m
69/M
tub1
T3(SE)
N2
IIIB
c/a
null
-
A8i
Wees /enger VerfÜgung automatesch VerfÜgung NA VerfÜgung A9m VerfÜgung 67 /F VerfÜgung tub2 VerfÜgung T2 (SS) VerfÜgung N1 VerfÜgung II VerfÜgung c /enger VerfÜgung + VerfÜgung - VerfÜgung A9i VerfÜgung Nationaléquipe /enger VerfÜgung + VerfÜgung + VerfÜgung * japanesch Klassifikatioun vun gastric carcinoma; ** PTNM klasséieren. An der Kolonn vun Case Nee, M = intramucosal Kriibs; S = Kriibs der submucosa sensibiliséieren; A = fortgeschratt Kriibs; m = mucosal Deel; i = invasiv Deel. An der Kolonn vun CGH, c = chromosomal CGH; engem = vill CGH. An der Kolonn vun p53 immunohistochemistry (IHC); "+" Bedeit diffusely (> 70%) positiv Kären "-" bedeit Bierg (&Si besteet; 5%) positiv Käre; "Automatesch" bedeit guer kee immunoreactivity. An der Kolonn vun TP53 VerfÜgung stattfannen; "+" An "-" weg Präsenz a Flichte vun stattfannen, bzw.; NA = net assessable; Wees = net getest VerfÜgung Immunohistochemistry VerfÜgung Immunohistochemical staining war mat monoclonal antibodies zu p53 FAQ gesuergt (DO-7, 1: 100; Dako, Glostrup, Dänemark).. No antigen retrieval vun Otemschwieregkeeten Rubriken an destilléiert Waasser hëlt bei 121 ° C an 5 min, war immunoreactivity vun enger indirekter biotin-streptavidin-peroxidase Method mat der Histofine Kit (Nichirei, Tokyo, Japan) an diaminobenzidine Reaktioun fonnt. D'Sektiounen sech mat haematoxylin counterstained. Drënner vun der negativ Kontroll ouni d'Primärschoul antibody an déi vun de positiven Kontroll huet an parallel Filteren. VerfÜgung Laser microdissection an DNA Virbereedung VerfÜgung klinescher Zellen sech aus 5-μm-décke Otemschwieregkeeten Rubriken kritt eng LMD6000 Laser microdissection System benotzt ( Leica Microsystems, Wetzlar, Däitschland). Fir individuell erhéijen, huet Kriibs Zellen aus Beräicher > kritt; 3 mm 2, wou Kriibs Zellen fir ≥90% vun de gesamten Zell Grof virgesin. Dës Kriibs Zellen sech zu 200 μl vun proteinase K Léisung bei enger Konzentratioun vun 200 μg /ml fir ronn 70 h op 37 ° C verdaut, gefollegt vun phenol /chloroform DNA erauszéien. VerfÜgung Lait Nepgen amplification VerfÜgung Sample DNA Implikatioune war mat den Zeien oligonucleotide-primed polymerase Kette Reaktioun (DOP-Hinnen alleguer) an 2 Phasen, wéi virdru beschriwwen [20], déi zu Hinnen alleguer Produkter duerchgesat méi wéi 2 kB zu Gréisst, gëeegent fir Nick-Iwwersetzung Etikette fir CGH. VerfÜgung fir vill CGH, Prouf DNA huet mat der GenomePlex Ray Lait Genom Amplification Kit (WGA2 Kit; Fläch, St. Louis, USA) Implikatioune [21]. Fir e puer DNA Echantillon dass net genuch Kick gin hätt, war d'WGA5 Kit (Fläch) geschafft. VerfÜgung CGH (hybridization, Studiebäihëllefe DNA Etikette an digitale Bild Analyse) VerfÜgung DOP-Hinnen alleguer-Kick entholl an normal DNA Fortgeschratten war mat fluorescein-12-dUTP an tetramethylrhodamine-5-dUTP (Roche, Mannheim, Däitschland), respektiv, vun Nick Iwwersetzung [15]. Hybridization an Bild analyséiert goufen virdrun ëmschriwwen standing [22]. Dumouriez a Verloschter vun DNA Kopie Zuelen sech duerch gréng zu roude nennen > definéiert; 1,2 an &Si besteet; 0,8, respektiv. Chromosomes 1p32-pter, 16p, 19, 22 an Y sech aus dësen Analyse ausgeschloss. VerfÜgung Singular CGH VerfÜgung Oligo CGH microarray (60 K, 60-mer) (Agilent, Santa Clara, USA) war vun dëser Etude benotzt , no der Taktik vum Produzent. An dowéinst, entholl a Kontroll DNA war Net-enzymatically Fortgeschratten mat Cy5 an Cy3, respektiv, de Genom DNA Uls Etiquetage Kit (Agilent) an competitively hybridized zu der microarray benotzt. Benotzt Spillfilmer Extraktioun Ver.9.5.3 (Agilent), de fluorescence Intensitéit vun der erhéijen an Kontrollen war vun der hybridized vill Biller berechent engem DNA microarray Scanner ageholl benotzt (Agilent). Copy-Nummer Dumouriez a Verloschter huet als Basis 2 uräicheren vun der entholl Signal Intensitéit an d'Referenz Signal Intensitéit Verhältnis méi definéiert wéi 0,3219 a manner wéi -0,3219, bzw.. VerfÜgung stattfannen Analyse fir TP53 VerfÜgung Hinnen alleguer primer baut sech bereet fir exons 5-8 vun TP53 VerfÜgung, déi un d'Kontinentaltruppe introns vun all Exon hybridize. Zréck zousätzlech Fichier 1 fir primer Message. Déi éischt Hinnen alleguer Mëschung aus engem Prellbock, 200 μM dNTPs, 1,5 mm MgCl 2, 0,8 μM primer, 1 Dummeldéng /μl Prouf DNA an 0,5 U Platin Taq (Invitrogen, Kalifornien, USA) zu engem 25-μl Finale Volume . No initial denaturation bei 94 ° C fir 2 min, 40 Zykle vun Hinnen alleguer ware fir 30 sec op 94 ° C gesuergt, 54 ° C fir 1 min an 72 ° C fir 1 min, bei 72 ° C duerch d'Finale Extensioun Schrëtt duerno fir 10 min. No der Confirmatioun vun Hinnen alleguer Produite vun agarose gelies electrophoresis, war Haaptrei Hinnen alleguer standing der BigDye Terminators v1.1 Cycle Sequencing Kit (Obwuel Biosystems, Kalifornien, USA) benotzt. D'Reaktioun Mëschung aus engem Prellbock, 2 μl vun der éischter Hinnen alleguer Produit, 0,15 μM primer an 0,5 μl BigDye Terminator V 1,1 an engem 10-μl Finale Volume. No initial denaturation bei 96 ° C fir 1 min, 25 Zykle vun Hinnen alleguer ware fir 10 sec op 96 ° C gesuergt, 50 ° C fir 5 sec a 60 ° C fir 4 min. De Stiermer an ëmgedréint Message huet de Abi PRISM 3100 genetesch Analyser (Obwuel Biosystems) alles. Kennen sech, andeems dës Echantillon fir d'Referenz DNA Haaptrei (: HSU94788 GenBank Bäitrëtt Nummer) fonnt. Allelic Zoustand war mat der Verhältnis vun Mann- zu Wildwest-Typ Héichpunkt Niveauen am sequencing Profiler alles. VerfÜgung statistique Analysë VerfÜgung weider Dëscher vun Fisher d'exakt Test an Cochran-Armitage Tester analyséiert goufen. Ënnerscheeder vun 2-eesäitegen Tester mat P &Si besteet; 0,05 considéréiert goufen statistesch relevant ze ginn. VerfÜgung Resultater VerfÜgung Immunohistochemistry fir p53 VerfÜgung Staining Musteren sech overexpressed considéréiert nëmmen wann ≥70% entholl Zellen positiv Kierchefënster Käre zougedréckt a wann an engem héich-Muecht Terrain gekuckten. Aacht vun de 13 intramucosal Cancers, all 6 submucosal Cancers a 4 vun der 9 fortgeschratt Cancers zougedréckt diffusely positive nuklear staining fir p53 (Table 1). E Mann staining Muster war am Fall # A7 observéiert. A Muster war negativ considéréiert (vertrëtt d'Wildwest-Typ TP53 VerfÜgung) wann d'Presenz vun Miguel net glécklech, sporadesch a schwaach nuklear staining observéiert gouf an &Si besteet; 5% vun de Kären. Eng automatesch staining Muster war zu Fäll observéiert # A1, # A4 a # A8, proposéiert Iech eng Net-Sënn stattfannen vun TP53 VerfÜgung [23]. VerfÜgung Chromosomal CGH VerfÜgung Twenty-fënnef Echantillon vun 25 Fäll (10 mucosal , 6 submucosal an 9 fortgeschratt Cancers) huet fir chromosomal CGH benotzt. All dës Echantillon waren aus intramucosal lesions kritt, datt déi ënnescht Schouljoer vun atypism zougedréckt. VerfÜgung Iwwerdeems 4q + an der Majoritéit ass (6/9 Fäll) vun fortgeschratt Woch, et war an der 16. fréi Woch (P = 0.0005) net fonnt. Aner vill verschidden chromosomal änneren tëscht fréi an fortgeschratt Cancers war 11q +, déi zu 11 vun den 16 fréi Cancers an 2 vun den 9 fortgeschratt Cancers (P = 0.0414) fonnt gouf. Vun der 10 intramucosal Woch iwwerpréift, huet 3 Verloscht vun 8q (8q-) an /oder gewannen vun 17p (17p +), während 7 an 2 8q zougedréckt + an 17p-, bzw.. Vun der 15 mucosal Echantillon vun invasiv Woch iwwerpréift, 3 a 4 zougedréckt 8q- a 17p +, respektiv, während 7 a 6 8q zougedréckt + an 17p-, bzw.. VerfÜgung Singular CGH VerfÜgung Drëssegjärege-een Echantillon vun 22 Fäll (13 mucosal, 3 submucosal a 6 fortgeschratt Cancers) sech mat vill CGH (Dorënner 1) évaluéieren. DNA Echantillon waren aus intramucosal an /oder invasiv lesions kritt. Figur 1 Singular CGH Donnéeën vun MYC an TP53 an TP53 sequencing Daten zu fréi an fortgeschratt Bléien adenocarcinomas vun Moo. Fréi Cancers sinn agedeelt intramucosal (m) Cancers an submucosal (SM) Cancers. Kuckt an Table 1 fir Prouf Zuelen. Numerals sinn mengen Test /Referenzmaterial nennen vun lackeleg CGH. Grouss Verloschter an Dumouriez si mat rout a gréng uginn, bzw.. Wild Typ (virstellen) an stattfannen an Exon (ex) an Matsproocherecht Haaptrei (IVS) vun TP53 VerfÜgung mat giel a gro ugewise sinn, respektiv. VerfÜgung Als zu Dorënner 1 an Table dës 2, concomitant Verloscht vun MYC
(MYC VerfÜgung -) an de falschen Eck vun TP53 VerfÜgung (TP53 + VerfÜgung) waren an 9 vun de 13 intramucosal Woch fonnt, 7 vun den 9 mucosal Echantillon vun invasiv Woch, 1 vun den 3 invasiv Echantillon vun submucosal Cancers an keent vun de 6 invasiv Echantillon vun fortgeschratt Cancers. A Muster vun MYC + VerfÜgung an /oder TP53 VerfÜgung - gouf an 3 vun de 13 intramucosal Cancers fonnt, keent vun den 9 mucosal Echantillon vun invasiv Woch, 1 vun den 3 invasiv Echantillon vun 3 submucosal Cancers a 5 vun de 6 invasiv Echantillon vu 6 fortgeschratt cancers.Table 2 hire Restaurant vun MYC VerfÜgung an TP53 VerfÜgung Zuelen am Ufank an fortgeschratt Bléien adenocarcinomas vun Mo. Kopie VerfÜgung klinescher Déift
Mucosa
Submucosa
MP oder méi déif -
zu zu zu Deel Mucosal
SM
Mucosal Deel
Deep
cCGH
(10)
aCGH
(13)
cCGH
(6)
aCGH
(3)
aCGH
(3)
cCGH
(9)
aCGH
(6)
aCGH
(6)
8q(MYC
)+
7
2 (2 *) VerfÜgung 3 VerfÜgung 0 VerfÜgung 1 (1 *) VerfÜgung 4 VerfÜgung 0 VerfÜgung 3 (2 *) VerfÜgung 8q (MYC VerfÜgung) -
3 VerfÜgung 9 (9 **) VerfÜgung 3 VerfÜgung 2 (2 **) VerfÜgung 1 (1 **) VerfÜgung 0 VerfÜgung 5 (5 **) VerfÜgung 1 (0 **) VerfÜgung 17p (TP53 VerfÜgung) + VerfÜgung 3 VerfÜgung 10 (9 **) VerfÜgung 3 VerfÜgung 2 (2 **) VerfÜgung 2 (1 ** ) VerfÜgung 1 zu 6 (5 **) VerfÜgung 1 (0 **) VerfÜgung 17p (TP53 VerfÜgung) - VerfÜgung 2 VerfÜgung 3 (2 *) VerfÜgung 2 VerfÜgung 0 VerfÜgung 1 (1 *) VerfÜgung 4 VerfÜgung 0 VerfÜgung 4 (2 *) VerfÜgung SM, déi submucosa; MP, déi muscularis propria. cCGH an aCGH, chromosome- an lackeleg-baséiert Komparativ Frankräich hybridisation; Numerals zu parentheses weg d'Gesamtzuel vun de iwwerpréift Echantillon. Kéngen Bréiwer beweist d'Resultater vun aCGH. Stärecher an parentheses weg concomitance vun MYC VerfÜgung + an TP53 VerfÜgung -. Double Stärecher concomitance vun MYC VerfÜgung weg -. An TP53 VerfÜgung + Baséierend op de globale vill VerfÜgung CGH zeréckzeféieren, sech genetesch lineages fonnt an 5 Stéck an 3 submucosal Cancers erauskomm a kontinuéierlech tëscht der mucosal an invasiv Deeler ginn bzw.. Als zu Dorënner 2 gewisen, huet d'Prouf vun der mucosal Deel vu # S3 4p-, 4q-, 8q +, 9p-, 13q +, 15q-, 18q-, 20q + an Y, iwwerdeems d'Prouf vun der invasiv Deel vu # S3 der selwechter geometrescher Figur vun der mucosal Deel verierwt, awer zousätzlech geometrescher Figur (2q-, 7P +, 8p-, 10p +, 14q + an 20q +) an verluer 4p- an 22q +. An # S1, Gewënn vun 1q, 14q, 19 a 20, an Verloscht vun 18q war zu mucosal an submucosal Echantillon gemeinsam, obwuel de Gewënn vun 1q, 14q, 19q a 20 am submucosa wéi déi bedeitendst Niveau liicht manner waren. An # S2, souwuel eng gemeinsam Démarche um mucosal an submucosal Deeler war e Gewënn vun 20p. D'submucosal Prouf zougedréckt zousätzlech Dumouriez zu 10p, 12 an 13q a Verloschter am 3q, 4, 5, 8p, 9p, 9q, 10q, 12P, 14q, 16 a 19p. D'mucosal Prouf zougedréckt a dem Verloscht vun 18q, déi am submucosal Prouf restauréiert war, méiglecherweis duerch uniparental disomy [24, 25]. An # A1, # A3, A4 #, # A8 an # A9, geometrescher Figur vun der Echantillon vun der mucosal Deeler goufen an déi vun der invasiv Deeler net fonnt. An # A2, hätt d'Kontinuitéit vun genetesch lineages net wéinst dem Fehlen vun enger grousser Copy-Nummer hire Restaurant am mucosal Deel harmoniséiert ginn. Figur 2 Singular CGH Profiler. D'chromosomal Regioune vun Kopie Zuel geometrescher Figur vun der mucosal Deel vu # S3 (S3m) si gekëmmert am invasiv Deel (S3i) an déi abegraff, wobäi déi am mucosal Deel vu # A1 (A1m) vun deene vun der invasiv Deel anescht sinn (A1i) VerfÜgung TP53 VerfÜgung stattfannen Analyse VerfÜgung kennen 7 vun der erhéijen fonnt goufen, datt fir Haaptrei Analyse vun exons 5-8 vun TP53 VerfÜgung (Dorënner 1, Table 3) iwwerpréift goufen:. 1 vun der 10 intramucosal Cancers, 2 vun den 3 submucosal Cancers an all 4 fortgeschratt Cancers (nëmmen d'invasiv Deeler). An all deene 7 erhéijen, war d'TP53 VerfÜgung allele hemizygous ausser an 1 intramucosal Kriibs (# M12) mat engem heterozygous Muster fir eng Exon-8 stattfannen (Dorënner 3) an engem diffusen oder eng automatesch Muster fir p53, uginn wéi vun immunohistochemistry. Nee TP53 VerfÜgung stattfannen war zu p53- Echantillon festgestallt, wéi an Dorënner 4. An p53 + /automatesch Echantillon gewisen, 2 vun den 15 Echantillon vun der mucosal Deel zougedréckt TP53 VerfÜgung stattfannen, hierkommen 6 vun den 7 Echantillon vun invasiv Deel TP53 zougedréckt VerfÜgung stattfannen (P = 0.0023). Am 1 vun der submucosal Cancers weist TP53 VerfÜgung + an e hemizygous stattfannen (de invasiv Deel vu # S2), TP53 VerfÜgung + kann uniparental polysomy spigelen [24, 25] .Table 3 Copy Zuel Ännerunge vun TP53 VerfÜgung an MYC VerfÜgung an p53 immunoreactivity am fir stattfannen getest Echantillonen analyséiert VerfÜgung Case Nr
MYC
TP53
stattfannen vun TP53exons 5-8
Mann- allele
MDM2
p53 IHC
M3
- VerfÜgung + VerfÜgung virstellen VerfÜgung - VerfÜgung - VerfÜgung M4 VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung virstellen VerfÜgung NS VerfÜgung - VerfÜgung M5 VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung virstellen VerfÜgung NS VerfÜgung + VerfÜgung M6 VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung virstellen VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung M7 VerfÜgung NS
+ VerfÜgung virstellen VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung M8 VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung virstellen VerfÜgung NS VerfÜgung - VerfÜgung M9 VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung virstellen VerfÜgung NS VerfÜgung + VerfÜgung M10 VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung virstellen VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung M11 VerfÜgung NS VerfÜgung -
virstellen VerfÜgung NS VerfÜgung - VerfÜgung M12 VerfÜgung + VerfÜgung - VerfÜgung Exons 5/8 VerfÜgung hemi /hetero VerfÜgung NS VerfÜgung + VerfÜgung M13 VerfÜgung + VerfÜgung - VerfÜgung NA VerfÜgung NS VerfÜgung - VerfÜgung S1m VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung virstellen VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung S1i VerfÜgung -
+ VerfÜgung virstellen VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung S2m VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung virstellen VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung S2i VerfÜgung NS VerfÜgung + VerfÜgung Exon 7 VerfÜgung hemi VerfÜgung NS VerfÜgung + VerfÜgung S3m VerfÜgung NS VerfÜgung NS VerfÜgung Exon 8 VerfÜgung hemi VerfÜgung NS VerfÜgung + VerfÜgung S3i VerfÜgung + VerfÜgung - VerfÜgung exons 5/6/8 VerfÜgung hemi VerfÜgung NS VerfÜgung + VerfÜgung A1m VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung virstellen VerfÜgung - VerfÜgung automatesch VerfÜgung A1i VerfÜgung + VerfÜgung - VerfÜgung NA VerfÜgung - VerfÜgung automatesch VerfÜgung A2m VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung virstellen VerfÜgung NS
+ VerfÜgung A2i VerfÜgung + VerfÜgung - VerfÜgung Exon 8 VerfÜgung hemi VerfÜgung NS VerfÜgung + VerfÜgung A3m VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung virstellen VerfÜgung NS VerfÜgung + VerfÜgung A3i VerfÜgung - VerfÜgung - VerfÜgung Exon 5 zur VerfÜgung hemi VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung A4m VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung virstellen VerfÜgung - VerfÜgung automatesch VerfÜgung A4i VerfÜgung NS VerfÜgung NS VerfÜgung Exon 5 zur VerfÜgung hemi VerfÜgung NS VerfÜgung automatesch VerfÜgung A8m VerfÜgung NS VerfÜgung +
virstellen VerfÜgung - VerfÜgung automatesch VerfÜgung A8i VerfÜgung + VerfÜgung - VerfÜgung NA VerfÜgung NS VerfÜgung automatesch VerfÜgung A9m VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung virstellen VerfÜgung - VerfÜgung + VerfÜgung A9i VerfÜgung + VerfÜgung + VerfÜgung Exon 6 VerfÜgung hemi VerfÜgung NS VerfÜgung + VerfÜgung NS = net wichteg; virstellen = wëll Typ; NA = net assessable; hemi = hemizygous; . Hetero = heterozygous VerfÜgung M12, Exon 5: R175H (CGC > CAC), C182C (TGC > TGT), S183L (TCA > TTA); 8 Exon: R267R (CGG > CGA) VerfÜgung S2i, Exon 7: C242F (TGC > TTC) VerfÜgung S3m, Exon 8: R273S (CGT > Agt) VerfÜgung S3i, Exon 5: A161V ( GCC > GTC); Exon 6: T211I (ACT > ATT); 8 Exon: R273S (CGT > Agt) VerfÜgung A2i, Exon 8: R273 H (CGT > CAT) VerfÜgung A3i, Exon 5: A161T (GCC &plain zu Enn) VerfÜgung A4i, Exon 5: IVS5 + 1G > T VerfÜgung A9i, Exon 6: Y220C (Stoffel > TGT) VerfÜgung 3 TP53 stattfannen Musteren Dorënner. A heterozygous stattfannen mat engem groussen Wildwest-Typ Komponent an Exon 8 (A) an engem hemizygous stattfannen an Exon 5 (B) an eng intramucosal Kriibs (# M12). Projet'en am anere iwwerpréift erhéijen sech hemizygous wéi an C (# S2) gewisen. VerfÜgung 4 hir Hëllef ze froen ënnert p53 immunohistochemistry Dorënner, Kopie Zuel vun TP53 a waarm Plaz stattfannen vun TP53. Fir "p53 +" an "p53-", gesitt der Legend an Table 1. "TP53 VerfÜgung +", "TP53 VerfÜgung -" an "TP53 VerfÜgung n /s" weg bedeitendst Copy-Nummer gewannen a Verléiere , a kee groussen änneren, bzw.. Numerals zu parentheses d 'Unzuel vun Echantillon vun invasiv Deeler. Numerals sinn Prouf Zuelen. Numerals zu parentheses d 'Unzuel vun Echantillon vun invasiv Deeler. NA = net assessable. VerfÜgung Wéinst dem, vun der mucosal Echantillonen, déi diffusen /automatesch Muster oft mat Wëld-Typ TP53 VerfÜgung verbonne war. Fir dëst ze fannen ze erklären, huet den MDM2 VerfÜgung Kopie Zuel mat vill CGH Daten iwwerpréift. Vun am Ganzen 22 Echantillonen évaluéieren fir TP53 VerfÜgung stattfannen Analyse, MDM2 VerfÜgung Copy-Nummer Verloscht zougedréckt a 10 vun de 14 Echantillonen mat Wëld-Typ TP53 VerfÜgung an 1 vun den 8 Echantillon mat TP53 VerfÜgung stattfannen . (P = 0.0237) VerfÜgung Diskussioun VerfÜgung an intramucosal Woch, Teamchef chromosomal CGH 8q- an /oder 17p + bei enger Frequenz vun 3 vun 10 erhéijen iwwerpréift; dësen Ännerungen huet méi heefeg an enger viregter Etude dass zoufälleg vernoléissecht Etikette benotzt [18]. Am Moment studéieren, war 8q + dacks festgestallt souwuel intramucosal Cancers (7/10) an invasiv Cancers (7/15); Ee, déi virun-ernimmt virdrun Donnéeën zougedréckt selten 8q +. Dës Vigel kann spigelen Differenzen an der Etikette Methode benotzt; CGH Resultater mat Nick Iwwersetzung Etikette oder zoufälleg vernoléissecht Etikette sech ze FISH Signaler verglach, an et gouf erausfonnt, datt Nick Iwwersetzung Etikette net infrequently falsch-positiv Dumouriez huet [26]. Allerdéngs goufen d'selwecht Etikette Konditiounen, Differenze an der Heefegkeet vu 4q + an 11q + benotzt tëscht fréi an fortgeschratt Cancers fonnt, eventuell Differenzen an genetesch lineages tëscht hinnen bidden. Chromosomal CGH Donnéeën vun fortgeschratt Cancers an dëser Etude sech konsequent mat virdrun chromosomal Donnéeën CGH kritt mat Nick Iwwersetzung Etikette fir fortgeschratt GCs (dh 17p- an 8q + waren relativ heefeg) [27-30]. VerfÜgung zwar klinesch Extrem fréi Cancers sidd allgemeng Betruecht d'Etüd vun fortgeschratt Cancers [5, 6], de intramucosal an invasiv Deeler vun fortgeschratt Woch dacks zougedréckt discordant Kopie Zuelen vun MYC VerfÜgung an TP53 VerfÜgung an dëser Etude: MYC VerfÜgung - an TP53 VerfÜgung + zu 5 vun de 6 Echantillon vun der mucosal Deeler, wéi oft wéi am intramucosal Cancers iwwerpréift, an MYC VerfÜgung + an /oder TP53 VerfÜgung - zu 5 vun de 6 Echantillon vun der invasiv Deeler. Zousätzlech, baséiert op de globale vill CGH Muster vun der mucosal an invasiv Deeler vun erhéijen, engem erauskomm war genetesch antike zu 5 vun de 6 fortgeschratt Cancers fonnt. Dofir, schéngt et, datt de entholl clones an der mucosal Deeler vun der fortgeschratt Cancers net Etüd vun der invasiv Deel huet, mä Minutt intramucosal Cancers datt wahrscheinlech mat der invasiv Cancers coexisted. Et ass confirméiert datt verschidde Minutt Cancers méi heefeg ginn, an der Woch wéi am Strenz-Typ GCs [31]. An fortgeschratt Woch, kéint de intramucosal Virleefer vun engem invasiv Komponent wéinst ulceration am entholl verluer hunn, oder war de Virleefer net iwwerpréift, well se net mat den Deel vun den niddregsten Schouljoer vun atypism, wat d'Analyse vun der mucosal zu noutwennegerweis gemaach Deel vun invasiv GCs war an der presentéieren Etude agespaart. VerfÜgung op der aner Hand, an submucosal Cancers, eng kontinuéierlech genetesch antike war an all déi 3 submucosal erhéijen iwwerpréift fonnt. Et kann well de mucosal Deel gekëmmert an fréi GCs a well d'mucosal Virleefer vun engem invasiv Komponent zougedréckt a dem niddregsten Schouljoer vun atypism zréckgehalen ass a war net ausgeschloss aus dem haitegen vill gebueden. D'mucosal an invasiv Deeler haten gemeinsam Regioune vun Kopie Zuel geometrescher Figur mat concordant breakpoints, an déi vun de Changementer an der mucosal Deel huet zu deene vun der invasiv Deel abegraff. . Op der Gentherapie Niveau, d'Kopie Zuelen vun MYC VerfÜgung an TP53 VerfÜgung tëscht der mucosal an submucosal Deeler an 2 vun den 3 submucosal Cancers konsequent waren VerfÜgung D'TP53 VerfÜgung - an /oder MYC VerfÜgung + war Muster net nëmmen an der invasiv Deeler vun 1 vun der submucosal Cancers erwëscht a Meeschter vun der fortgeschratt Cancers mä och an 3 vun de 13 intramucosal Cancers. An dës erhéijen, zougedréckt p53 immunohistochemistry engem diffusen oder ongëlteg (stattfannen) Muster (Bedeitung 1 an 3) suggeréiert datt de VerfÜgung TP53 - vläicht Loh an der entstoent inactivation vun Wildwest-Typ TP53 VerfÜgung spigelen. Sequencing Analysë vun der stattfannen waarm Flécken vun TP53 VerfÜgung bewisen hunn, dass hemizygous kennen (dh stattfannen an Loh) waren an der mucosal Echantillon vun 1 vun den 3 intramucosal Cancers an 1 submucosal Kriibs mat engem TP53 VerfÜgung fonnt - Muster, wéi souwéi der invasiv Deeler vun der 4 Stéck Cancers datt fir TP53 VerfÜgung stattfannen Analyse praktesch goufen. Esou inactivation vun Wildwest-Typ TP53 VerfÜgung, déi weider Frankräich Onstabilitéit féieren kann, ass am fortgeschratt GCs [15, 17] dacks gemellt. D'MYC VerfÜgung Gentherapie nët ass bekannt och dacks GNU-Zuel hëlt oder amplifications zu verschiddenen fortgeschratt Cancers [32] ze weisen. MYC VerfÜgung + /TP53 VerfÜgung - also kann als d'Ënnerschrëft vun aggressiv GC gerechtfäerdegt ginn VerfÜgung Et gemellt gouf, datt Loh souwéi Projet'en vun TP53 VerfÜgung si méi dacks zu fortgeschratt GCs fonnt wéi am Ufank. GCs [17, 33], an dat, am Ufank GCs, TP53 VerfÜgung kennen méi sinn oft an submucosal Woch fonnt wéi zu intramucosal Woch [34, 35]. Dës Tendenz huet sech och am Moment studéieren observéiert, mä stattfannen Analysë uginn, datt waarm Plaz kennen sech an de mucosal Deel vun der erhéijen net festgestallt, ausser an 1 intramucosal Kriibs (# M12). Zousätzlech, Copy-Nummer Verloscht vun MDM2 VerfÜgung, déi eng Roll an p53 ofgeschnidden spillt [36], mat diffusen p53 overexpression an dem Fehlen vun enger TP53 VerfÜgung stattfannen soll. Dëse Phänomen ass seele gemellt, mä kéint am Ufank GCs eent vun de Mechanisme vun p53 overexpression ginn. Am Ufank Cancers VerfÜgung, kann et deenen an invasiv Komponente wéi och richteg Etüd vun fortgeschratt Cancers ginn. Ënnert dem Ufank vun den haitegen Etude iwwerpréift Cancers, eng invasiv Deel vun 1 entholl (# S3) an 3 intramucosal Cancers (# M11, # M12 an # M13) huet d'Ënnerschrëft vun aggressiv Kriibs (MYC VerfÜgung + an /oder TP53 VerfÜgung -) a reegelméissegen Projet'en vun TP53 VerfÜgung; Ee, an 1 submucosal Kriibs (# S1), huet de invasiv Deeler d'Ënnerschrëft vun deenen Kriibs (MYC VerfÜgung - /TP53 VerfÜgung +).