Egyesület jelenléte /hiánya és be /ki mintázata Helicobacter pylori oipA gén peptikus fekély és a gyomorrák kockázatok: a meta-analízis katalógusa Abstract katalógusa alapon
Vannak növekvő vizsgáló tanulmányok közötti kapcsolat állapotát H. pylori oipA katalógusa gén és a fekélybetegség (PUD) és gyomorrák (GC), de az eredmények kiderül, hogy ellentmondásos. Megpróbáltunk tisztázni, hogy oipA katalógusa gén állapot összefügg mancs és /vagy GC kockázatokat. Katalógusa Módszerek
Egy szisztematikus irodalmi kutatást végeztünk a négy elektronikus adatbázisok. A meghatározott felvételi és kizárási kritériumok, hét cikkből végső soron áll a meta-analízis oipA katalógusa jelenléte /hiánya a mancs és GC és tizenegy cikkek szerepelnek a meta-analízis oipA katalógusa on /off státusz PUD és GC. katalógusa Eredmények
az on /off funkcionális állapot elemzése oipA katalógusa gén, az "on" állapot szignifikáns szervezetek fokozott kockázatával járó mancs (OR = 3,97, 95% CI: 2,89, 5,45; P < 0,001) és GC (OR = 2,43, 95% CI: 1,45, 4,07; P = 0,001), mint a gyomorhurut és funkcionális diszpepszia ellenőrzéseket. Eredmények A homogenitás vizsgálat jelezte eltérő hatásait oipA katalógusa "on" állapot mancs kockázat közötti gyerekek és felnőttek alcsoportok és a GC kockázat közötti PCR-szekvenálás és immunoblot alcsoportok. A jelenléte /hiánya elemzése oipA katalógusa gén találtunk null szövetség jelenléte oipA katalógusa gén kockázatának mancs (OR = 1,93, 95% CI: 0,60, 6,25; P = 0,278) és a GC (OR = 2,09, 95% CI: 0,51, 8,66; p = 0,308), mint a gyomorhurut és funkcionális diszpepszia ellenőrzéseket. katalógusa Következtetések
megállapítható, ha oipA katalógusa létezik, a funkcionális "on" állapotáról ez a gén asszociációt mutatott fokozott kockázatot jelent mancs és GC képest gyomorhurut és FD ellenőrzéseket. Azonban pusztán vizsgálja a jelenléte /hiánya oipA katalógusa volna figyelmen kívül, hogy fontos a funkcionális be /ki állapot és nem lenne megbízható előrejelzésére kockázatát mancs és GC. További nagyszabású és jól megtervezett vonatkozó vizsgálatok on /off állapotának oipA katalógusa van szükség, hogy erősítse meg a meta-analízis eredményeit. Katalógusa Kulcsszavak katalógusa Helicobacter pylori katalógusa OipA katalógusa Gyomorfekély-betegség Gyomorrák Háttér
Helicobacter pylori
(H. pylori
) fertőzés a legfontosabb kockázati tényezője a fejlesztési peptikus fekélybetegség (PUD) és a gyomorrák (GC) [1]. Közel fele a világ lakosságának táplál a H. pylori
azonban mindkét GC és PUD fordul elő csak egy kis részét az említett hordozó H. pylori
[2]. Különbség a következménye a H. pylori katalógusa fertőzés lehet legalább részben magyarázható a nagy változékonysága kolonizáló H. pylori
törzsek és a fogadó válasz erre a mikroba [3]. Amellett, hogy a gazda genetikai hajlam, sorrendben sokfélesége H. pylori katalógusa virulencia faktor gén befolyásolja a Ezek a baktériumok megtelepedni, továbbra is fennállnak, és /vagy indukálják a súlyos betegségeket, és így lehetővé teszi számunkra, hogy előre a következményeit hordozók [4]. katalógusa H. pylori
rendelkezik különböző géneket, amelyek közül néhány virulencia géneket társított gasztroduodenális betegségek. A mai napig több jól leírt virulencia faktorok a H. pylori
beleértve CagA (citotoxin-asszociált gén A termék) és VacA (vacuolating citotoxin A) is kapcsolódik a súlyos gasztroduodenális betegségek, mint a PUD és GC [5]. Eltekintve CagA és VacA, más virulencia faktorok fedezték egymást. Egy tanulmány szerint a Jamaoka Y. et al. 2000-ben és az azt követő vizsgálatok alapján bebizonyosodott, hogy OipA (külső gyulladásos protein) egy másik fontos virulencia faktor kapcsolatban a kockázatok mancs és GC [6]. A oipA
gén (más néven HP0638) kódoló OipA fehérje szabályozza egy kapcsoló (azaz "be" vagy "ki" minták) változtatásával száma CT dinukleotid ismétlődések a szignál-peptid kódoló régió ezen gén . Jamaoka Y. és mtsai jelentését is bontakoznak, hogy az on /off funkcionális állapotát oipA katalógusa van elhelyezve a lecsúszott szál mispairing mechanizmus [4]. Ha van a 6., 9., (1 + 3), (2 + 3), (1 + 2), (1 + 1 + 1), (1 + 1 + 2), vagy más a CT-dinukleotid ismétlődések, hogy tartsa a peptid keret, oipA katalógusa gén "on" állapot. Ellenkező esetben az állapot "off", ami nem funkcionális oipA katalógusa gén [7]. Ez OipA fehérje tűnt, hogy különösen fontos a indukáló interleukin-8 (IL-8) szekrécióját, és elősegíti a baktériumok kolonizációjának gyomorban [1].
Felfedezése óta oipA katalógusa 2000-ben [6], a kapcsolat a állapotának oipA katalógusa gén és kockázatait mancs és GC különösen érdekes. Kétféle tanulmány kapcsolatban oipA
gén feltörekvő, amelyek közül néhány vizsgált jelenlétét /hiányát oipA katalógusa [8-14], míg a többiek megvizsgálta a funkcionális BE /KI állapotát oipA katalógusa [6 , 15-24]. Azonban az említett vizsgálatok eredményei kiderülhet, hogy ellentmondásos elsősorban a viszonylag kis minta. Eddig nem metaanalízis nyújtottak kockázatainak értékeléséhez mancs és GC kapcsolatban oipA katalógusa gén jelenléte /hiánya vagy be /ki állapot. A jelen tanulmány célja, hogy megmagyarázzák a szerepe oipA katalógusa genetikai diverzitás szabályozású kockázatának mancs és /vagy GC, végeztünk egy meta-analízis, hogy vizsgálja meg az összefüggést a jelenléte /hiánya és be /ki állapotának oipA
gén és mancs és GC kockázatokat. katalógusa módszerek katalógusa azonosítása és a jogosultság a vonatkozó tanulmányok katalógusa szisztematikusan keresni az irodalmak elektronikus adatbázisok, beleértve a PubMed, Web of Science, a kínai Nemzeti Knowledge Infrastructure (CNKI) és Wanfang adatbázis segítségével a keresési feltételek "OipA", "külső gyulladásos fehérje a" és "HP0638" angol adatbázisokban és a megfelelő kínai kifejezéseket kínai adatbázisokban. Amikor átfedő adat létezik, akkor csak a legnagyobb és legújabb tanulmány választottuk ki erre a meta-analízis. Felvettük a kapcsolatot a szerző sajátos nyers adatokat, ha a benyújtott adatok a cikk nem voltak egyértelműek. Az utolsó keresés dátum volt december 6., 2012. katalógusa tanulmányok szerepelnek a jelenlegi metaanalízis meg kell felelnie a bevonási kritériumok a következők: megfigyeléses vizsgálatok vonatkozó összefüggést a jelenléte /hiánya (más néven pozitív /negatív) vagy /off állapotának oipA katalógusa gén mancs vagy GC kontroll csoport gastritis vagy funkcionális emésztési zavar (FD); publikált tanulmány angol vagy kínai; tanulmányok a H. pylori-pozitív katalógusa esetek és a kontrollok; tanulmányok elegendő nyers adatok becslésére esélyhányados (OR) és 95% -os konfidencia intervallum (CI). A fő kizáró okok voltak vélemények; Állatkísérletek; ügy sorozat; ismétlődő kiadványok; nincs nyers adatok kapcsolatfelvételt követően a szerző; tanulmányok nem angol vagy kínai; és konferencia. katalógusa Adatgyűjtés katalógusa Két szerző (Jingwei Liu és Caiyun He) kinyert adatot a befogadó tanulmányok függetlenül. A konfliktus megoldódott a vita és konszenzus végre sikerült az összes kinyert adatokat. A következő információt kivont egyes tanulmányok: első szerzője, a megjelenés éve, etnikum, a lakosság számát az esetek és a kontrollok, kimutatására szolgáló módszerek oipA katalógusa gén és a H. pylori fertőzés katalógusa, primerek polimeráz láncreakció ( PCR), forrás H. pylori katalógusa izolátumok, felnőtt vagy gyermek a kísérleti alanyok, és a betegség diagnózisa a kontrollcsoportban. katalógusa értékelése érvényességének szereplő tanulmányok katalógusa használtuk a nyolc elem Newcastle- Ottawa skála (NOS) érvényességének értékelésére a benne tanulmányok [25], amelyben egy tanulmány nyújtható, legfeljebb kilenc csillag tételek kiválasztásával kapcsolatosak (négy csillag), az összehasonlíthatóság (két csillag) és az expozíció ( három csillag). A NOS pontszámok 1-3, 4-6, 7-9 tekintették alacsony, közepes és magas színvonalú volt. Katalógusa Statisztikai analízis katalógusa A statisztikai elemzést végeztünk Stata szoftver (11.0-ás verzió; StataCorp, College Station, TX). Az ereje közötti kapcsolat jelenlétét /hiányát vagy ki /be állapotának oipA katalógusa gén mancs vagy GC értékelték OR és 95% CI. P érték < 0,05 értéket tekintettük statisztikailag szignifikánsnak. Heterogenitás mértük Q statisztika (P < 0,10 jelzi szignifikáns heterogenitás vizsgálatok között) és az I-négyzet (I
2) érték [26]. A rögzített hatások modell alkalmazásával Mantel-Haenszel módszer [27] alkalmazták kiszámításához az egyesített legkülső amikor heterogenitás vizsgálatok közötti nem volt szignifikáns. Ellenkező esetben, egy random-hatás modell segítségével DerSimonian és Laird módszer [28] végeztük. Érzékenységi elemzést végeztünk, hogy vizsgálja meg a heterogenitás, amikor szignifikáns heterogenitás volt feltüntetve. Alcsoportelemzések végeztünk, hogy vizsgálja meg a hatását földrajzi régióban, GU vagy DU, felnőtt vagy gyermek, és oipA katalógusa gén kimutatására szolgáló módszer. Összehasonlítani a hatását oipA katalógusa gén állapotot a kockázatát mancs és GC a különböző alcsoportok, a Breslow-Day-tesztet alkalmaztuk homogenitásának megállapítására stratum specifikus legkülső különböző alcsoportok. Mert Breslow-Day teszt szignifikancia megjegyezte, P ≤ 0,10. Ezen túlmenően, a publikációs torzítás is minőségileg elvégzésével tölcsér parcellák és értékelni kvantitatív Begg-teszt [29], valamint Egger teszt [30], ill. P érték < 0.1 Begg és Egger vizsgálatok azt jelzi, jelentős publikációs torzítás. Katalógusa Eredmények katalógusa Study jellemzők katalógusa Ez a meta-analízis szerint szerveződött a PRISMA nyilatkozat (Plusz fájl 1). Összesen 194 potenciálisan releváns rekordok talált négyig adatbázisait ismétlődések eltávolítása; 176 cikket tovább kizárt fő oka nincs jelentősége, in vitro vagy állatkísérletekkel, áttekintésre, tárgyaló elméleti, adatok szerepelnek más tanulmányok, és nem a nyers adatokat. Végül 18 teljes szövegű cikkeket jogosultság került ebbe a meta-analízis [6, 8-24]. A folyamatábra cikk kiválasztás az 1. ábra mutatja az 1. ábra A folyamatábra irodalmi befogadás és kirekesztés. katalógusa A főbb jellemzői a tanulmányok, beleértve ezt a meta-analízis 1. táblázatban foglaltuk össze, és további információkat az elsődleges vizsgálatok mutattuk Kiegészítő fájl 2: Table S1 és S2 táblázat. Minden szereplő vizsgálatok eset-kontroll tervezték. Mert meta-analízis a be /ki állapotának oipA katalógusa gén, 11 cikkek felelt meg a kritériumoknak [6, 15-24]. Egy cikk által jelentett Jamaoka, Y. japán 2000-ben megállapította, hogy a oipA katalógusa gén állapota 100% -os volt "a" az esetek és a kontrollok, amelyeket nem lehetett elemezni a meta-analízis. Ezért 10 cikkei végül jogosultak a meta-analízis a oipA katalógusa be /ki állapot. Ezek közül a funkcionális BE /KI állapotát oipA katalógusa határoztuk meg a PCR-alapú szekvenálási egy kivételével az Yamaoka, Y és munkatársai tanulmánya [21], amelyben immunoblot arra használták, hogy közvetlenül értékeli a fehérje expresszióját oipA
; adatok nem voltak három földrajzi régiók, köztük Ázsia, Európa és Amerika; és egy cikket [20] részt alanyok két különböző korcsoportok (felnőtt és gyermek). Meta-analízis a jelenléte /hiánya oipA katalógusa gén hét cikkek végső soron jogosult [8-14]. A jelenléte /hiánya oipA
gén tartalmazza cikkekben összes detektáltuk a PCR-alapú elektroforézis ami nem tükrözi a funkcionális állapotát oipA katalógusa. Hat cikkek voltak az ázsiai populáció, kivéve egy cikket érintő tunéziai [9]. Az egyik cikk által jelentett Dabiri, H. et al. [11] részt vevő vizsgálati csoportokban három ázsiai országban. Figyelembe véve a lehetséges szerepét földrajzi hely megváltoztatása oipA katalógusa gén állapot, az adatokat a különböző régiók kezelték külön tanulmányok az alcsoport elemzés. Az adatok a különböző régiók és különböző korcsoportokban kezelték külön tanulmányok az alcsoport analysis.Table 1 Jellemzői kiválasztott tanulmányok oipA gén on /off és jelenlétét /hiányát helyzetelemzése katalógusa Szerző Matton etnikum katalógusa
év Matton Region Matton gastritis vagy FD Matton mancs Matton GU Matton DU Matton GC
katalógusa oipA katalógusa + /összes (%) d Matton oipA katalógusa + /Tota (%) d Matton oipA katalógusa + /összes (%) d
oipA katalógusa + /összes eset (%) d Matton oipA katalógusa + /összes eset (%) d Matton a oipA katalógusa funkcionális állapot (a /off) tanulmányok katalógusa Markovska, R. katalógusa bolgár katalógusa 2011 katalógusa Európa katalógusa 23/35 (65,7%) hotelben 33/34 (97,1%) hotelben /katalógusa /katalógusa /katalógusa Oleastro, M. portugál
2010