Vpliv HRH2 promotor polimorfizma na odklonskega metilacija DNK DAPK in CDH1in želodca epithelium

vpliv HRH2
promotor polimorfizma na odklonskega metilacija DNK DAPK
in CDH1
v želodcu epitela
Abstract
Ozadje
odklonski vzorci metilacije na otoku CpG znano, da so vplivni v genski utišanja. Histamin igra pomembno vlogo fizioloških v zgornjem delu gastrointestinalnega trakta in deluje preko receptorja H2. Poročamo preiskavo učinka HRH2
promotorja polimorfizma (rs2607474 G > A) na metitiranjem DAPK
in CDH1
metod
so Non rakave želodca vzorcev sluznice, pridobljenih iz. 115 bolniki z rakom želodca (GC) in 412 nerakave predmetov (non-GC). Stanje metilacija genov smo določili s PPN. Genotipizacijo rs2607474 smo izvedli s PCR-SSCP.
Rezultati
metilacija DAPK
in CDH1
so opazili pri 296 in 246 predmetov, v tem zaporedju. Pogostost CDH1
metilacije v osebah z GC bil raka poškodbe bistveno nižje kot v non rakasto sluznice, medtem ko je DAPK
metilacije ni bilo drugače. Porazdelitev alelna od rs2607474 je 401GG, 119GA in 7aa. GG homozigoti je bila povezana z bistveno povečanim tveganjem za metilacije tako DAPK
in CDH1
(p < 0,0001 in p = 0.0009, v tem zaporedju). V ne-GC predmetov ali več kot 60 let, je bil GG homozigoti tesneje povezana s tako DAPK
in CDH1
metilacije. Vendar pa ta genotip ni pokazala povečano tveganje za razvoj metiliranjem obeh genov pri bolnikih z GC. V H. pylori
negativnih osebah, GG homozigoti pokazala povečano tveganje za metilacije tako DAPK
in CDH1
(p = 0,0074 in p = 0,0016, v tem zaporedju), ker je bila ta genotip povezano s povečano tveganje za razvoj DAPK
metilacije v H. pylori
pozitivne teme (p = 0,0018). Poleg tega so bili atrofija in metaplazijo rezultati pri osebah, starejših od 60 let, bistveno višja pri GG homozigotu (p = 0,011 in p = 0,039, v tem zaporedju) sta bila ugotovljena in pomembna korelacija med starostjo in atrofijo ali metaplazijo.
sklepi
Naši rezultati kažejo, da rs2607474 GG homozigoti daje bistveno večje tveganje za starostno in povezane z vnetjem DAPK
in CDH1
metilacije.
Ključne besede
HRH2
Genski polimorfizem Aberrant DNA metilacije ozadje
raka želodca, je eden izmed najpogostejših rakov po vsem svetu in je povezana z visoki stopnji umrljivosti [1, 2]. Številne vrste raka, vključno z želodčnih tumorjev, kažejo metilacije več genov, vključno z e-kadherina (CDH1
),
-smrtni povezan protein kinaze (DAPK
) in 2A zaviralec kinaze ciklin-odvisne (CDKN2A
) [3, 4]. Metiliranjem promotorja CpG otokov vodi DNA strukturnih sprememb in posledično, genska inaktivacija [5]. Številne študije so ugotovili to utišanje s metilacije DNA kot mehanizem, ki je odgovoren za zaviralnih inaktivacijo. Vendar pa so nekateri geni metiliramo tudi v ne-neoplastičnih tkiva zaradi staranja [6, 7] in je bilo predlagano tudi, da se pojavi gen metilacija med kroničnim vnetjem v različnih tkivih [8-10]. V želodčne sluznice, je bilo domnevajo, da metilacija otoka CpG je povzročena s Helicobacter pylori
(H. pylori
) okužb pri ne-rakavo sluznici [11, 12] in šteje kot predrakavih pogoji v želodcu karcinogeneze [ ,,,0],13]. Med več genov, DAPK
, CDH1
in CDKN2A
je znano, da se pogosto metiliramo v ne-neoplastične želodčne sluznice in to metilacija je povezana s starostjo, H. pylori
okužba, histološka stopnja gastritis in rak želodca [11, 13, 14].
pa histamin, eno od aktivnih aminov, sproščenih v odgovor na različne fizioloških dražljajev, ki je razširjen v prebavnem traktu, vključno z želodcem in je vključen v patogenezo gastrointestinalnega razjed dvanajstnika in želodca, vnetje [15]. V želodcu, H2 receptorjev čeprav razširjen v telesnih tkivih, se zdi, da imajo osrednjo vlogo pri uravnavanju izločanja želodčne kisline, kot je bilo potrjeno z razširjeno uporabo zaviralcev receptorjev H2 pri zdravljenju motenj, povezanih z kisline [16, 17] . Histamin igra pomembno vlogo v želodcu vnetja, ki deluje preko receptorja H2, čeprav H. pylori
okužba je eden izmed glavnih faktorjev ki prispeva k razvoju gastrointestinalnega dvanajstniku vnetja [18]. Nedavno je bila povezava med genetskih polimorfizmov receptorjev genov histamin in dovzetnosti za shizofrenijo in klinični odziv na zdravljenje klozapina raziskali [19]. Ta preiskava polimorfizmov HRH2
, ki kodira receptorje H2, razkriva povezave med genotipom na HRH2
-1018 G /A locus (rs2607474) in klinični odziv na klozapin zdravljenja. Poleg tega je to poročilo pokazalo, da se rs2607474 nahaja v spodbujevalcev element v HRH2
promotor gena [19, 20], zato je verjetno, da je ta varianta povzroča spremembe v izražanju receptorjev. Po HapMap-JPT, obstaja le ena povezava neravnotežje (LD) bloka, ki ga sestavljajo rs686874, rs2067474, rs678591, rs645574, rs2890892 in rs11954815 v HRH2. Vse druge SNP so manjše polimorfizmi. Zato smo predvidevali, da je ta LD blok vplivajo na ekspresijo in /ali funkcije receptorja histamina H2 in izbranih rs2607474 kot Tag SNP. Tam še ni bilo nobenega poročila o rs2607474 vpliva na razvoj in napredovanje bolezni prebavil. Domnevali smo, da lahko rs2607474 vpliva na razvoj zmotna DNK vzorci metilacije v želodčne sluznice.
V tej študiji smo raziskovali odnos med HRH2
promotorja polimorfizma (rs2607474) in DNA metilacije DAPK
in CDH1
in ne-rakavo želodčnega epitela. Razlika statusa DNA metilacije med pacienti želodca z rakom in ne-rakave predmetov so raziskovali tudi.
Metode
vzorce tkiva, ekstrakcija DNA, in status Helicobacter pylori okužbe
našega vzorčnega ki obsegajo 527 predmeti (412 brez maligne tumorjev in 115 z rakom želodca) zaposlili od endoskopskih centra University Hospital Fujita zdravja ali University Hospital Kanazawa Medical. Bolniki s sistemskimi hudimi boleznimi so bili izključeni iz te študije. Tisti z aktivnimi razjedami želodca ali dvanajstnika so prav tako izključene. Vse teme doživela zgornja endoskopijo z biopsijo iz ne-rakasto sluznice. Pri 115 bolnikih z rakom želodca, je biopsije vzorec dobimo tudi od raka lezijo. Deli vsakega primerka bile takoj zamrznemo in shranimo pri -80 ° C, medtem ko so nekateri drugi strani določena v 10% formalinu zapufrani in vdelali v parafin. Kasneje je bil genomske DNK povzeta neposredno iz zamrznjenih vzorcev z uporabo standardne metode fenol /kloroform po proteinaze K prebavo. Pri 296 412 osebah brez raka želodca, je bila resnost kroničnega gastritisa so razvrščena glede na posodobljen sistem Sydney [21], ki ga je patolog, ki ni imel dostop do vseh kliničnih podatkov. H. pylori
stanje okužbe je bila ocenjena s serologijo, histologijo, ali test urea izdihanega zraka. Predmeti so diagnosticirali kot okužena, ko je bil vsaj eden od diagnostičnih testov pozitiven.
Odbori za etiko Univerze Fujita zdravja in Kanazawa Medical University odobril protokol, in preden je bila napisana privolitev pridobljena iz vseh sodelujočih subjektov.
Bisulfite sprememba in metilacije specifične PCR (MSP)
Da bi preverili DNA metilacije, je genomsko DNA, obdelan z natrijevim bisulfitom uporabo BislFast DNA modifikacija Kit za metiliranih odkrivanje DNK (TOYOBO, Co., Ltd, Osaka, Japonska). MSP za DAPK
in CDH1
so bile izvedene z uporabo metod, ki jih Katzenellenbogen et al poročali. [22] Herman sod. . [23], in sicer
Na kratko, PPN reakcije so bile izvedene z naslednjimi primarnih parov, ki uporabljajo EX Taq HS (Takara Bio, Inc., Šiga, Japonska)
primarni pari.
DAPK: methylated naprej; 5 '- ggatagtcggatcgagttaacgtc-3 "
obratno; 5 '- ccctcccaaacgccga-3 "
DAPK: nemetiliran naprej; 5 '- ggaggatagttggattgagttaatgtt-3 "
obratno; 5 '- caaatccctcccaaacaccaa-3 "
CDH1: metilira naprej; 5 '- ttaggttagagggttatcgcgt-3 "
obratno; 5 '- taactaaaaattcacctaccgac-3 "
CDH1: nemetiliran naprej; 5 '- taattttaggttagagggttattgt-3 "
obratno; 5 '- cacaaccaatcaacaacaca-3 "
temperature žarjenja in časi so bili določeni s pomočjo DNK iz periferne krvi mladega posameznika brez H. pylori
okužbe kot negativno kontrolo in to DNA metiliramo z SssI methylase (New England BioLabs Inc, Beverly, MA) kot pozitivne kontrole. PDČ smo izvedli v volumnu 20μL vsebuje 0,1 pg-bisulfita modificirani DNK. DNA smo denaturirali pri 95 ° C za 5 minut, čemur sledi 35 ciklov pri 95 ° C 30 sekund, 64 ali 65 ° C (za CDH1
ali DAPK
oz) za 1 min in 72 ° C C 1 minuto s končno razširitvijo pri 72 ° C 5 minut. Pasovih v PPN so odkrili z elektroforezo v 3,0% agaroznem gelu, obarvanih z ethdium bromida. Hypermethylation bil definiran kot prisotnost pozitivnega metilacijskega pasu kaže signale približno enake ali večje kot pri velikosti označevalca (10 ng /xl: 100 bp DNA Lestev, Takara Bio, Inc., Shiga, Japonska), ne glede na prisotnost nemetiliran trakovi [4].
Genotipizacija HRH2 polimorfizma
bil rs2607474 genotipizacijo s PCR-SSCP, kot smo že poročali [24, 25]. Za odkrivanje genotip, ob uporabi primerske par (naprej: 5 '- acctgacccttttctgaaaaagtttgtc-3 ', in obratno: 5 '- ctactcctctgaagtgctgagaaccat-3 "), PCR smo izvedemo v volumnu 20 ul, ki vsebujejo 0,1 ig genomske DNA. DNA smo denaturirali pri 95 ° C 3 minute, čemur sledi 35 ciklov pri 96 ° C 15 sekund, pri 60 ° C 30 sekund in 72 ° C za 30 sekund, s končno razširitvijo pri 72 ° C 5 minut. Nato smo 2 xl PCR produkta denaturiran z 10 ml formamida (Sigma-Aldrich Co., St. Louis, USA), pri 95 ° C 5 minut. SSCP je bila izvedena na 6 ° C, z uporabo sistema za ločevanje GenePhor DNA z GeneGel Excel 12,5 /24 (GE Healthcare, ZDA), po katerem so bile odkrite v denaturirani single strand DNA pasovi z uporabo DNK obarvanje s srebrom Kit (GE Healthcare). Potrdili smo, da so bili posamezni sklop DNA jasno ločeni od tega pogoja [25]. Rezultati SSCP so bili potrjeni s pomočjo pozitivne fragmentov DNK iz ugnezdenih-PCR, pripravljenih kot smo že poročali [24, 26].
Statistična analiza
dobe in dopolnjenih Sydney točk sistema so izražene kot povprečje ± SD. Povprečni starosti med dvema skupinama smo primerjali s testom t
študenta. Razmerje med spolom, so H. pylori
okužba in DNA metilacija v primerjavi z uporabo Fisherjev test. Grofje alelov smo primerjali tudi med methylated in v nemetiliran skupine po Fisherjev test. Prilagojene oddaljene regije so bile izračunane z uporabo logistične regresijske analize po prilagoditvi za starost, spol in H. pylori
stanje okužbe. Vsak posodobljene Sydney rezultati sistema med 2 skupinama smo primerjali s Mann Whitney U
-test. Korelacija med starostjo in vsako posodobljeno oceno Sydney sistema je bila ocenjena z ANOVA. Za vse analize, je raven pomembnosti, določene na str
< 0,05.
Rezultati
predmeti
A skupaj 412 nerakave (non-GC) teme in 115 raka želodca (GC), bolniki sodelovali v tej študiji. Te značilnosti so povzete v tabeli 1. povprečna starost in moški /ženski razmerje skupine GC bile precej višje od tistih v ne-GC skupino. H. pylori
pozitivno razmerje skupine GC je tudi znatno višja od ne-GC skupino. Poleg tega so bile frekvence CpG metilacije tako DAPK
in CDH1
v skupini GC bistveno višja kot v ne-GC group.Table 1 Značilnosti predmetov in frekvence genov metilacije
na splošno
non-GC
GC
vrednost p *
število predmetov
527
412
115
povprečna starost ± SD
61,0 ± 13,7
60,0 ± 13,8
66,2 ± 9,7
0,0019
moški: ženski
319: 208
235: 177
84:31
0,0018
H. pylori pozitivno razmerje
338/527
249/412
89/115
0,00091
DAPK methylated razmerje
296/527
201/412
95/115
< 0,0001
CDH1 methylated razmerje
246/527
150/412
96/115
< 0,0001
*. non-GC skupine v primerjavi z GC skupine
pogostnosti rs2607474 genotipov med DAPK metilni in nemetiliran skupin
porazdelitev tega genotipa pri vseh 527 bolnikih je bila 401GG, 119GA in 7aa in je bil v Hardy -Weinberg ravnotežje (p = 0,70). Povprečna starost je bila H. pylori
pozitivno razmerje in GC /non-GC razmerje znatno višja v DAPK
methylated kot v nemetiliran skupinah, medtem ko razmerju moški /ženske med obema skupinama ni pomembno razlikovala ( tabela 2). Mladoletna alel frekvenca rs2607474 v metiliranega skupini je znatno nižji od tistega v nemetiliran skupini (p < 0,0001, vzpostavitev alfa = 0,05, 1-βpower = 0.978). Poleg tega je bila pogostost GG homozigotu v metiliranega skupini bistveno višja kot v nemetiliran skupini (p < 0,0001) .table 2 Frekvence genotipov med DAPK metilni in nemetiliran skupin
DAPK nemetiliran

DAPK methylated
vrednost p *
število predmetov
231
296
povprečna starost ± SD
59,6 ± 13,4
62.1 ± 13,8
0,035
moški: ženski
137: 94
182: 114
NS
H. pylori pozitivnost
122/231
216/296
< 0,0001
non-GC: GC
211: 20
201: 95
< 0,0001
HRH2 rs2607474 genotip
GG
155
246
< 0,0001 #
GA
72
47
AA
4
3
A alelov frekvenco
17,3%
9,0%
< 0,0001
*:.. nemetiliran vs. metiliranega, #: pogostost GG homozigotu
NS: ni pomembno
pogostnosti rs2607474 genotipov med CDH1 metilni in nemetiliran skupin
H. pylori
pozitivno razmerje in GC /non-GC razmerje je bilo v CDH1
metiliranega skupine bistveno višje kot v nemetiliran skupini, medtem ko je povprečna starost in moški /ženski razmerje med obema skupinama ni bila bistveno drugačna (tabela 3). Mladoletnik alel frekvenca rs2607474 v metiliranega skupini je bila precej nižja kot v nemetiliran skupini (p = 0,0004, v katerem so alfa = 0,05, 1-βpower = 0.946) in frekvenco GG homozigotu je bila bistveno višja v metiliranega skupini kot v nemetiliran skupini (p = 0,013) .table 3 frekvence genotipov med CDH1 metilni in nemetiliran skupin
CDH1 nemetiliran
CDH1 metilira
p vrednost *

število predmetov
281
246
povprečna starost ± SD
60,6 ± 14,0
61,4 ± 13,3
NS
moški: ženski
165: 116
154: 92
NS
H. pylori pozitivnost
152/281
186/246
< 0,0001
non-GC: GC
262 : 19
150: 96
< 0,0001
HRH2 rs2607474 genotip
G /G
197
204
0,013 #
G /A
78
41
A /A
6
1
alela frekvenca
16,0%
8,7%
0,0004
*: nemetiliran vs. metiliranega, #: frekvenca GG homozigotu
NS:.. ni pomembna
tveganje, povezano z rs2607474 GG homozigotu za DAPK in CDH1 metilacije
na splošno, rs2607474 GG homozigoti prenese zelo pomembno povečano tveganje za razvoj DAPK
metilacije ( ALI, 2,43; 95% IZ, 1,60-3,69; p lt; 0,0001; Tabela 4). V ne-GC osebah je GG homozigoti pokazala tudi močno povečano tveganje za razvoj DAPK
metilacije (OR, 2,61; 95% IZ, 1,62-4,20; p < 0,0001). Vendar pa je prikazana niti veliko tveganje v rakasto sluznice niti poškodbe raka pri osebah z GC (preglednica 4). Pogostost DAPK
metilacije ni pomembno razlikujejo med dolgoročnimi rakasto sluznici in raka poškodbe pri osebah z GC (95/115 vs 104/115, p = 0,12) .table 4 Nevarnost -1018 GG homozigotu za razvoj DAPK metilacija
Na splošno (527)
GG
GA
AA
GG vs prevoznika; ALI (95% CI)
p vrednost
nemetiliran (231)
155
72
4
reference -
metilira (296 )
246
47
3
2.43 (1.60-3.69)
< 0,0001
non-GC (412)
nemetiliran (211)
138
69
4
reference -
metilira (201)
167
31
3
2,61 (1,62-4,20)
< 0,0001
GC (115)
(non rakaste sluznica)
nemetiliran (20)
17
3
0
reference -
methylated (95)
79
16
0
0.825 (0,379-3,73)
0,78
(poškodba rak)
nemetiliran (11)
10
1
0
sklic -
metilira (104)
86
18
0
0,598 (0.069-5.19)
0,64
jih logistično regresijsko analizo po prilagoditvi glede na starost, spol in okužba s H. pylori statusa
().. število predmetov
po drugi strani je bilo rs2607474 GG homozigoti povezan z znatno povečano tveganje za razvoj CDH1
, kot tudi DAPK
, metilacija (OR, 2.07; 95% IZ, 1,35-3,17; p = 0,0009; Tabela 5). V ne-GC osebah, je bila GG homozigoti povezana tudi z bistveno povečanim tveganjem za razvoj CDH1
metilacije (OR, 2,25; 95% IZ, 1,35-3,75; p = 0,0019). Vendar pa je razstavljen niti znatno tveganje v non rakasto sluznice niti poškodbe raka pri osebah z GC (tabela 5). Pogostost CDH1
metilacije v osebah z GC bil raka poškodbe bistveno nižje kot v non rakasto sluznice (78/115 primerjavi 96/115, p = 0,009) .table 5 Nevarnost -1018 GG homozigoti za razvoj od CDH1 metilacije
na splošno (527)
GG
GA
AA
GG vs prevoznika; ALI (95% CI)
p vrednost
nemetiliran (281)
197
78
6
reference -
metilira (246 )
204
41
1
2,07 (1,35-3,17)
0.0009
non-GC (412)
nemetiliran (262)
180
76
6
reference -
metilira (150)
125
24
1
2,25 (1,35-3,75)
0,0019
GC (115 )
(non rakaste sluznica)
nemetiliran (19)
17
2
0
referenčni -
metilira (96)
79
17
0
0,579 (0,120-2,80)
0,50
(poškodba rak)
nemetiliran (37)
30
7
0
reference
-
metilira (78)
66
12
0
1.50 (0.507-4.42)
0,47
jih logistično regresijsko analizo po prilagoditvi za starost, spol in H. stanje pylori okužbe
(). število predmeta
Tveganje, povezano z rs2607474 GG homozigoti za razvoj metilacije DNA pri osebah nad in pod 60 let starosti
pri osebah, mlajših od 60 let. , rs2607474 GG homozigoti podeli rahlo, vendar občutno, povečano tveganje za DAPK
metilacije (ALI 2.12; 95% IZ, 1,13-3,98; p = 0.020, Tabela 6), medtem ko ne CDH1
metilacije. Vendar pa je GG homozigoti pokazale bistveno večje tveganje za razvoj tako DAPK
in CDH1
metilacije pri osebah, starejših od 60 let (OR 2,72, 95% IZ, 1,55-4,80; p = 0,0005 in OR, 2,81; 95% iZ, 1,53-5,17; p = 0,0009, oziroma, Tabela 6) .table 6 Nevarnost rs2697474 GG homozigotu pri mlajših in starejših bolnikih
DAPK metilacija



= < 60 (233)
GG
GA
AA
GG vs GA + AA; ALI (95% CI)
p vrednost
nemetiliran (115)
80
32
3
reference -
metilira (118)
96
21
1
2,12 (1,13-3,98)
0.020
60 < (294)
nemetiliran (116)
75
40
1
referenčni -
metiliranih (178)
150
26
2
2,72 (1,55-4,80)
0,0005
CDH1 metilacijo
= < 60 (233)
GG
GA
AA
GG vs prevoznika; ALI (95% CI)
p vrednost
nemetiliran (121)
88
29
4
reference -
metilira (112)
88
24
0
1.55 (0,827-2,91)
0,17
60 < (294)
nemetiliran (160)
109
49
2
reference -
metilira (134)
116
17
1
2,81 (1,53-5,17)
0,0009
jih logistično regresijsko analizo po prilagoditvi za starost, spol in H. pylori stanje okužbe
():.. število predmetov
Tveganje, povezano z rs2607474 GG homozigoti za razvoj metilacije DNA v H. pylori negativne ali pozitivne teme
v H. pylori
negativnih osebah, je bila rs2607474 GG genotip povezana s povečanim tveganjem za metilacije tako DAPK
in CDH1
(OR, 2,70; 95% interval zaupanja, 1,31-5,57; p = 0,0074 in OR, 4,43; 95% interval zaupanja, 1,76-11,1; p = 0,0016, oziroma, tabela 7). Vendar pa je GG homozigoti prikaže povečano tveganje za razvoj DAPK
metilacije v H. pylori
pozitivnim (ali 2,29, 95% CI, 1.36-3.86; p = 0,0018), vendar ne za CDH1
methylation.Table 7 Nevarnost rs2607474 GG homozigotu v H. pylori, pozitivne ali negativne predmete
DAPK metilacija


H. pylori negativna ( 189)
GG
GA
AA
GG vs GA + AA; ALI (95% CI)
p vrednost
nemetiliran (109)
73
35
1
referenčni -
metiliranih (80)
67
12
1
2,70 (1,31-5,57)
0,0074
H. pylori pozitivno (338)
nemetiliran (122)
82
37
3
reference -
metilira (216)
179
35
2
2,29 (1,36-3,86)
0,0018
CDH1 gen metilacija
H. pylori negativna (189)
GG
GA
AA
GG vs prevoznika; ALI (95% CI)
p vrednost
nemetiliran (129)
86
41
2
referenčni -
metiliranih (60)
54
6
0
4,43 (1,76-11,1)
0,0016
H. pylori pozitivno (338)
nemetiliran (152)
111
37
4
reference -
metilira (186)
150
35
1
1,50 (0,900-2,51)
0,12
jih logistično regresijsko analizo po prilagoditvi glede na starost in spol
():.. število predmetov
zveza med Sydney rezultati sistema in rs2607474
na splošno ni bilo pomembnih razlik v atrofija ali metaplazijo točk med GG homozigotu in genotipom GA + AA (slika 1). Vendar pa sta bili obe rezultati pri osebah, starejših od 60 let, bistveno višja pri GG homozigotu kot v genotipom GA + AA. Slika 1 Primerjava Sydney točk sistema med GG homozigotu in GA + AA genotip. Na splošno so bili niti atrofija niti metaplazijo rezultati bistveno razlikujejo med GG homozigotu in GA + AA genotip. Vendar pa so pri predmetih, starejših od 60 let, oba rezultati v GG homozigotu bistveno višja kot v GA + genotipom AA
Obe atrofija in metaplazijo rezultati so močno povezane s starostjo v GG homozigotu (tako p. ≪ 0,0001 s ANOVA Slika 2a, b), medtem ko je bila takšna korelacija med starostjo in bodisi rezultat ni v genotipom GA + AA (p = 0,76 in p = 0,69, oziroma, slika 2c, d). Slika 2 Zveza med rs2607474 in želodca atrofijo sluznice. A: Korelacija med starostjo in atrofija rezultat v GG rezultat homozigoti atrofija je pomembno povezana s starostjo (p = 0,0001 s ANOVA, n = 233). b: Korelacija med starostjo in metaplazijo rezultat v GG rezultat homozigoti metaplazijo je pomembno povezana s starostjo (p < 0,0001 s ANOVA). c: Korelacija med starostjo in oceno atrofija v GA + genotipom AA. Ni bilo pomembno korelacije (p = 0,47 s ANOVA, n = 63). d: Korelacija med starostjo in oceno metaplazijo v GA + genotipom AA. Ni bilo pomembno korelacije (p = 0,48 s ANOVA).
Debato
smo že poročali, da CpG otok metilacija tako DAPK
in CDH1
, v ne-neoplastične želodčne sluznice, je ustrezalo povečano tveganje za raka želodca [4]. V tej študiji je bila pogostnost metilacije v obeh genov bistveno višja pri osebah z GC kot brez GC. Vendar pa je bila pogostnost CDH1
metilacije v raka, poškodbe bistveno nižji kot v ne rakasto sluznice v osebah z GC, čeprav je pogostost DAPK
metilacije ni bilo. Iz teh ugotovitev se zdi, da CDH1
metilacija, da se malo sodelujejo pri nastanku raka želodca. V naših preučevanih predmetov, gen metilacija morda ne odražajo izražanje proteina ali mRNA, čeprav so nekatere prejšnje študije kažejo, da ti genov methylations prispevajo k zmanjševanjem stopnje beljakovin in mRNA [27-30]. Druga možnost je, da se tumor razvije preko E-kadherina neodvisnih poti za rakotvornost. Mehanizem kancerogenosti s pomočjo genske metilacije je še vedno nejasno. Vendar pa smo pozorni na to, da kopičenje genov metilacije dejansko kaže na povečano tveganje za nastanek raka, kot mnoge študije so pokazale [3, 4, 6, 7, 11-14, 31, 32], čeprav metilacija CDH1
ne more neposredno vplivati ​​na razvoj tumorjev.
obstaja nekaj poročil, ki kažejo vpliv polimorfizmov v HRH2
na tveganje za človekove motnje, ampak tiste so poročilo nobene povezave med rs2607474 in nevrološke ali psiholoških motenj, kot kot shizofrenijo ali Parkinsonovo boleznijo [19, 20, 33]. Mi se ne zavedajo vseh prejšnjih poročil o pridružitvi med tem polimorfizem in želodca disorders.In pričujoči študiji smo raziskovali povezavo med rs2607474 in razvoj za CpG otoku metilacije tako DAPK
in CDH1
v ne-rakave želodčne sluznice. Naša trenutna študija razkriva, da je bila rs2607474 GG genotip pozitivno povezana z razvojem CpG otoku metilacije obeh genov. Poleg tega smo tudi kažejo, da je v želodcu sluznice atrofija hujši v relativno starejši GG homozigotu kot GA + genotip AA, in da je v želodcu atrofije sluznice napreduje z leti samo v GG homozigotu.
Eden od najpomembnejših dejavnikov, ki povzročajo genske metilacije v želodec je H. pylori
okužba [4]. Okužba s H. pylori
najprej povzroči kronično površno gastritis, ki lahko privedejo do kronične atrofični gastritis, intestinalno metaplazijo in displazije, ki lahko povzroči želodčne raka [34]. Dejavniki, ki spodbujajo H. pylori
pogojenega želodčne atrofije so nekoliko bolj sporna. H. pylori
Rezultati okužbe na vzpetini ravni serum gastrin v, v zgodnji fazi okužbe, in nadaljuje z razvojem atrofični gastritis. Večina kliničnih študij, pa so sprejele, da zaviralci protonske črpalke (PPI), ki inducirajo aklorhidrija in hipergastrinemijo, pospeši pojav atrofični gastritis v H. pylori
pozitivnih bolnikih [35-37]. Zato se zdi, da hipergastrinemijo spodbujanje želodčne sluznice atrofijo, ki je pod vplivom H. pylori
okužbe. Interstingly, dolgotrajno zdravljenje podgan in miši z loxtidine, antagonisti a močan H2 receptorjev za povzročanje ECL celic hiperplazijo, (tako kot omeprazol), ni prišlo do izgube parietalnih celic, ampak verjetno posledica povečane parietalnih celic [38, 39]. Poleg tega, HDC knockout miši hranijo na nizko-histamina dieto pokazala bazen razširili parietalnih celic, kljub temu kažejo, označeno hipergastrinemijo [40]. Ti rezultati kažejo, da je navzgor regulacija histamina, ne aklorhidrija niti hipergastrinemijo, da prispeva k postopni navzdol regulaciji števila parietalnih celic in želodca atrofijo. V naši tej študiji, želodca sluznice atrofija napredovala z leti v rs2607474 GG homozigoti kohorte, medtem ko je v genotipa AA GA + ni. Poleg tega je bila stopnja želodčne atrofije sluznice večja pri starejših osebah, ki so bile GG homozigoti, kot pri tistih, ki so bili genotip GA + AA. V prejšnji raziskavi, je bila potrjena povezava med intestinalno metaplazijo in genske metilacija različnih genov [4]. Zato predlagamo, da gen metilacija hitreje napreduje vzporedno z želodčne sluznice atrofijo v GG homozigotu kot v genotipom GA + AA. Nadalje je možno, da je delovanje histamina navzgor regulirano v GG homozigotu. Vendar pa ni bilo študij za posledice rs2607474 na funkcijo ali izražanje H2 receptorjev in naš genetski statistični raziskavi jih ni razkrila. To je ena izmed omejitev v naši raziskavi.

• Maščobnokislinska sestava podkožnega maščobnega tkiva in želodčne sluznice: obstaja povezava z razjede želodca
• Lokalna ponovitev raka želodca po odstranitvi celotnega želodca: nenavadna predstavitev