Utjecaj HRH2 promotora polimorfizma na abcrantnog DNA metilacije DAPK i CDH1in želučani epithelium

Utjecaj HRH2 pregled promotora polimorfizma na abcrantnog DNA metilacije DAPK Netlogu i CDH1 Netlogu u želučanog epitela pregled apstraktne pregled pozadine pregled, do odstupanja, metilacije uzoraka u otoku CpG poznato je da su utjecajni u utišavanja gena. Histamin važne fiziološke uloge u gornjem gastrointestinalnom traktu, a djeluje preko H2 receptora. Prikazujemo istragu o utjecaju HRH2 pregled polimorfizma promotora (rs2607474 G > A) na metilacije DAPK Netlogu i CDH1
Metode pregled Non kancerogen uzorci želučane sluznice dobivenih iz. 115 ispitanika s karcinomom želuca (GC) i 412 ispitanika bez karcinoma (non-GC). Metilacija status gena je određena MSP. Genotipizacija rs2607474 je izvedeno PCR-SSCP. Pregled Rezultati
metilacije DAPK Netlogu i CDH1 Netlogu zabilježeno je u 296 i 246 ispitanika, respektivno. Učestalost CDH1 pregled metilacije u ispitanika s GC bila je značajno niža u lezija raka nego u ne zloćudni sluznice, dok je onaj DAPK pregled metilacije nije bilo drugačije. Distribucija alela od rs2607474 je 401GG, 119GA i 7aa. GG homozigot je povezan sa značajno povećanim rizikom za metilacije oba DAPK Netlogu i CDH1 pregled (p 0,0001 i p = 0,0009, respektivno). U non-GC predmeta ili više od 60 godina, GG homozigot je više usko povezan s oba DAPK Netlogu i CDH1 pregled metilacije. Međutim, taj genotip ne pokazuju povećani rizik za razvoj metilacijom oba gena u bolesnika s GC. U H. pylori pregled negativnim temama, GG homozigot pokazala povećani rizik za metilacije oba DAPK Netlogu i CDH1 pregled (p = 0,0074 i p = 0,0016, respektivno), dok je taj genotip bio je povezan s povećanom rizik za razvoj DAPK pregled metilacije na H. pylori
pozitivnih ispitanika (p = 0,0018). Osim toga, kod osoba starijih od 60 godina, atrofija i metaplazije rezultati su bili značajno viši u GG homozigot (p = 0,011 ip = 0,039, respektivno) i značajna korelacija između dobi i atrofija ili metaplazije. Pregled Zaključci
Naši rezultati pokazuju da rs2607474 GG homozigot prenosi značajno povećan rizik za starenjem i upale povezane s DAPK Netlogu i CDH1 pregled metilacije.
ključne riječi pregled HRH2 pregled Genetski polimorfizam Aberantna DNA metilacije pozadina pregled raka želuca je jedan od najčešćih karcinoma u svijetu, a povezana je s visokom stopom smrtnosti [1, 2]. Nekoliko vrsta raka, uključujući i želučanih tumora, pokazuju metiliranjem više gena uključujući E-kadherina (CDH1
),
protein kinaze smrti povezane s (DAPK
) i ciklin ovisne kinaze inhibitora 2A (lokusu CDKN2A
) [3, 4]. Metilacija promotora CpG otoka dovodi do DNA strukturalnih promjena i, posljedično, gen inaktivacija [5]. Mnoge studije su identificirali ovu utišavanje strane DNA metilacije kao mehanizam odgovoran za tumor supresorski inaktivacije. Međutim, neki geni su metilirani na ne-maligne tkiva zbog starenja [6, 7], a također je predloženo da se gen metilacija dolazi tijekom kronične upale u različitim tkivima [8-10]. U sluznici želuca, pretpostavlja se da se metiliranje otoka CpG inducira Helicobacter pylori (H. pylori

) infekcije u nekanceroznog sluznicu [11, 12] i smatrati prekancerogenim uvjetima u želučanom karcinogeneze [ ,,,0],13]. Od nekoliko gena DAPK
, CDH1
i lokusu CDKN2A pregled Poznato je da se često metilirati u ne-neoplastičnog sluznice želuca i to metiliranje povezanih s dobi, H. pylori infekcija pregled, histološki stupanj gastritis i rak želuca [11, 13, 14].
Međutim, histamin, jedan od aktivnih amina oslobađaju kao odgovor na razne fiziološke podražaje, široko je rasprostranjena u gastrointestinalnom traktu, uključujući želuca i uključen je u patogenezu gastro-duodenalni ulceracija i želučane upale [15]. U želucu, H2 receptora, premda široko rasprostranjeni u tkivima, čini se da imaju središnju ulogu u regulaciji lučenja kiseline, što potvrđuje i široku primjenu blokatora H2 receptora u liječenju poremećaja kiselina povezanih [16, 17] , Histamin igra važnu ulogu u želučanom upalom djeluje preko H2 receptora, premda H. pylori infekcija pregled jedan od glavnih čimbenika koji razvoj gastro-duodenalni upale [18]. Nedavno je povezanost između genetskih polimorfizama receptora gena histamin i podložnost shizofreniji i njegovoj kliničkoj odgovor na klozapinom tretmana je studirao [19]. Ovo istraživanje od polimorfizama HRH2 Netlogu, kodiranje za H2 receptora, otkriva vezu između genotipa na HRH2 pregled -1018 g /a lokusa (rs2607474) i klinički odgovor na klozapinom liječenje. Osim toga, ovo izvješće je pokazalo da rs2607474 se nalazi u pojačivača element HRH2 pregled gena promotora [19, 20] te je stoga vjerojatno da je ova varijanta uzrokuje promjene u ekspresiji receptora. Prema HapMap-JPT, postoji samo jedna veza ravnoteže (LD) blok, sastavljen od rs686874, rs2067474, rs678591, rs645574, rs2890892 i rs11954815 u HRH2. Svi ostali SNP su manje polimorfizama. Dakle, nagađa se da je ovo LD blok utjecati na ekspresiju i /ili funkciju histamin H2 receptora i odabrane rs2607474 kao oznaka SNP-a. Tu još nije bilo izvještaja o poslovanju rs2607474 utjecati na razvoj i progresiju gastrointestinalnih poremećaja. Mi smo pretpostavili da je rs2607474 može utjecati na razvoj neprirodnih DNA metilacije uzorke u sluznici želuca.
U ovoj studiji istraživali smo odnos između HRH2 pregled polimorfizma promotora (rs2607474) i DNA metilacije DAPK Netlogu i CDH1 pregled u ne-kancerozne želučanog epitela. Također je istraženo Razlika od statusa metilacije DNA kod pacijenata oboljelih od raka želuca i ne-kancerogen subjekata.
Metode pregled Uzorci tkiva, ekstrakcija DNA i statusa Helicobacter pylori infekcije
Naša proučavane populacije sastavljene 527 ispitanika (412 bez maligni tumori i 115 s karcinomom želuca) regrutirani iz endoskopiju Centar Fujita zdravstvene sveučilišne bolnice ili sveučilišne bolnice u Kanazawa Medical. Bolesnici s sustavnih teških bolesti bili su isključeni iz ove studije. Oni s aktivnim želučanim ili dvanaesnika također su isključeni. Svi ispitanici su podvrgnuti endoskopskog s biopsijom iz ne-kancerozne sluznice. U 115 ispitanika s karcinomom želuca, biopsije uzorak je također dobiven iz lezija raka. Dijelova svakog uzorka su odmah smrznu i čuvaju na -80 ° C, dok su neki s druge strane je fiksirana u 10% puferiranom formalinu i uklopljene u parafin. Kasnije, DNA je izvađen izravno iz zamrznutih uzoraka pomoću standardne metode fenol /kloroforma nakon digestije proteinazom K. U 296. 412 ispitanika bez karcinoma želuca, težini kroničnog gastritisa je klasificiran prema ažuriranoj Sydney sustava [21] od strane patologa koji nije imao pristup bilo kliničkih informacija. H. pylori pregled, stanje infekcije je procijenjena serologiju, histologiju, ili urea izdisajni test. Ispitanici su bili dijagnosticirani kao inficiranu barem jedna od dijagnostičkih testova je bio pozitivan.
Etičkih povjerenstava za zdravstvo Sveučilišta Fujita i Medicinskom fakultetu Sveučilišta Kanazawa odobrio protokol, a prije, pismeni informirani pristanak dobiven je od svih subjekata koji sudjeluju.
bisulfit modifikacije i metilacija specifični PCR (MSP) pregled za ispitivanje DNA metilacije, genomska DNA je obrađen s natrijevim bisulfitom pomoću BislFast DNA modifikacija komplet za metiliranoj DNA detekcije (Toyobo, Co., Ltd., Osaka, Japan). MSP za DAPK Netlogu i CDH1 pregled se obavlja koristeći metode prijavili Katzenellenbogen et al. [22] i Herman et al. . [23], odnosno
Ukratko, MSP reakcije su provedene sa sljedećim parova početnica koriste EX Taq HS (Takara bio, Inc, Shiga, Japan)
parova početnica.
DAPK: metiliranim naprijed; 5 '- ggatagtcggatcgagttaacgtc 3 '
obrnuto; 5 '- ccctcccaaacgccga 3 ', pregled DAPK: nemetiliran naprijed; 5 '- ggaggatagttggattgagttaatgtt 3 ',
obrnuto; 5 '- caaatccctcccaaacaccaa 3 ', pregled CDH1: metiliran naprijed; 5 '- ttaggttagagggttatcgcgt 3 ',
obrnuto; 5 '- taactaaaaattcacctaccgac 3 ', pregled CDH1: nemetiliran naprijed; 5 '- taattttaggttagagggttattgt 3 ',
obrnuto; 5 '- cacaaccaatcaacaacaca 3 ' pregled Žarenje temperature i vremena su određena pomoću DNA iz periferne krvi mlade osobe bez H. pylori infekcije pregled kao negativna kontrola, a taj DNA metilirati SssI metilazom (New England Biolabs Inc, Beverly, MA) kao pozitivna kontrola. MSP je izvedena u volumenu od 20 ul koji sadrži 0,1 ug bisulfitnog-modificiranog DNA. DNA su denaturirani pri 95 ° C 5 minuta, zatim je slijedilo 35 ciklusa na 95 ° C 30 sekundi, 64 ili 65 ° C (za CDH1
ili DAPK
, respektivno) tijekom 1 minute i 72 ° C C 1 minutu konačno proširenje pri 72 ° C tijekom 5 minuta. Bendovi iz MSP otkrivene su elektroforezom u 3,0% agaroznom gelu obojenih ethdium bromida. Hipermetilacija je definirana kao prisutnost pozitivnog metilacije sastava pokazuje signale približno jednaka ili veća od one markera po veličini (10 ng /ul: 100 bp DNA ljestve, Takara Bio, Inc., Shiga, Japan), neovisno o prisutnosti unmethylated bendovi [4] pregled. genotipizacija polimorfizma HRH2
rs2607474 je genotipiziran PCR-SSCP kao što je prethodno opisano [24, 25]. Za otkrivanje genotipa, koristeći par početnica (naprijed: 5 '- acctgacccttttctgaaaaagtttgtc 3 ', i obrnuto: 5 '- ctactcctctgaagtgctgagaaccat 3 '), provedena je PCR u volumen od 20 ul, koji sadrži 0,1 ug genomne DNA. DNA su denaturirani pri 95 ° C tijekom 3 minute, nakon čega slijedi 35 ciklusa na 96 ° C tijekom 15 sekundi, 60 ° C tijekom 30 sekundi i 72 ° C tijekom 30 sekundi, uz konačno proširenje pri 72 ° C u trajanju od 5 minuta. Nakon toga, 2 ul PCR proizvoda je denaturiran s 10 ul formamidu (Sigma-Aldrich Co., St. Louis, SAD) na 95 ° C tijekom 5 minuta. SSCP je provedeno na 6 ° C koristeći sustav razdvajanja GenePhor DNK s GeneGel Excel 12,5 /24 (GE Healthcare, SAD), nakon čega su ustanovljene denaturirani jednog lanca DNA vrpce pomoću DNK bojanje srebrom Kit (GE Healthcare). Potvrdili smo da jednog lanca DNA su jasno razdvojeni ovog stanja [25]. Rezultati SSCP su potvrđeni pomoću pozitivne fragmenata DNA pripremio ugniježđena-PCR kao što je prethodno opisano [24, 26]. pregled, Statistička analiza pregled doba i ažuriranih Sydney rezultate sustava su izraženi kao srednja vrijednost ± SD. Srednje dobi između dvije skupine uspoređene su s Studentov t
test. Odnos spola, H. pylori pregled, infekcija i DNA metilacije uspoređene su Fisherov egzaktni test. Alela broji su također u odnosu između metilirani a nemetiliranih grupe po Fisher točan test. Prilagođeni ORS su izračunati uz uporabu logističke regresijske analize nakon prilagodbe za dob, spol i H. pylori pregled statusa infekcije. Svaki ažurirani Sydney sustava rezultate među 2 skupine uspoređena Mann Whitney U-test
. Korelacija između dobi i svako obnovljeno Sydney sustava rezultat je procijenjena ANOVA. Za sve analize, razina značajnosti postavljena je na p Netlogu < 0,05. Pregled Rezultati
subjekata
je ukupno 412 ne-raka (non-GC) ispitanika i 115 rakom želuca (GC) pacijenti su sudjelovali u ovom istraživanju. Ove osobine su prikazani u tablici 1. Srednja dob i muško /žensko omjer GC grupi su bili značajno više od onih u ne-GC grupe. Je H. pylori pregled pozitivan omjer GC skupine bila također signifikantno veća nego u ne-GC grupe. Nadalje, frekvencije CpG metilacije oba DAPK Netlogu i CDH1 Netlogu bila je značajno veća u GC skupini nego u ne-GC group.Table 1 Karakteristike ispitanika i učestalosti gena metilacije
Sveukupno
non-GC
GC
vrijednost p *
broj ispitanika pregled 527 pregled 412 pregled 115 pregled srednja dob ± SD pregled 61,0 ± 13,7
60,0 ± 13,8 pregled 66.2 ± 9.7 pregled 0,0019
muško: žensko pregled 319: 208 pregled 235: 177
84:31 pregled 0,0018 pregled pozitivan omjer H. pylori
338/527 pregled 249/412 pregled 89/115 pregled 0,00091 pregled DAPK metiliranim omjer pregled 296/527 pregled 201/412 pregled 95/115 izvoznici < 0.0001 pregled CDH1 metiliran omjer pregled 246/527
150/412 pregled 96/115 Netlogu < 0.0001 pregled. *: non-GC grupe vs GC grupe pregled Učestalost rs2607474 genotipova između DAPK metilnim i nemetiliranih skupina
distribuciju ovog genotipa u svim 527 ispitanika bila 401GG, 119GA i 7aa i bio je u Hardy -Weinberg ravnoteža (p = 0,70). Srednja dob, H. pylori pregled pozitivan odnos i GC /non-GC omjer bile su značajno više u DAPK pregled metilirani nego u nemetiliranih skupinama, dok je muški /ženski odnos između dviju skupina nije se značajno razlikovala ( tablica 2). Manjinski alel frekvencija rs2607474 u metiliranog skupini bio je znatno niži nego u unmethylated skupini (p < 0,0001, podešavanje a = 0,05, 1-βpower = 0,978). Osim toga, učestalost GG homozigot bio je značajno veći u metiliranog skupini nego u unmethylated skupinom (p 0,0001) .table 2 Frekvencije genotipova među DAPK metiliranih i nemetiliranih skupina

DAPK nemetilirani
pregled DAPK metiliran
vrijednost p *
broja ispitanika pregled 231 pregled 296 pregled srednja dob ± SD
59,6 ± 13,4 pregled 62.1 ± 13,8 pregled 0,035 pregled muško: žensko
137: 94 pregled, 182: 114 pregled NS pregled H. pylori pozitivni
122/231 216/296 pregled izvoznici < 0.0001 pregled non-GC: GC pregled 211: 20 pregled 201: 95 izvoznici < 0,0001 pregled HRH2 rs2607474 genotip pregled GG pregled 155 pregled 246 izvoznici < 0.0001 # pregled GA
72
47 pregled AA
4
3 pregled, A frekvencije alela pregled 17,3%
9,0% Netlogu < 0.0001 pregled *:.. nemetiliran vs meliliranom, #: učestalost GG homozigot pregled NS: pregled nije značajan učestalost rs2607474 genotipova između CDH1 metilnim i nemetiliranih skupina
H.pylori
pozitivan odnos i GC /non-GC omjer bile su značajno više u CDH1 pregled meliliranom skupini nego u unmethylated skupini, dok je srednja dob i muško /žensko omjer između te dvije skupine nisu bile značajno različite (Tablica 3). Manjinski alel frekvencija rs2607474 u meliliranom skupini bila je značajno niža nego u unmethylated skupini (p = 0,0004, postavljanje a = 0,05, 1-βpower = 0,946) i frekvenciju GG homozigot je značajno viša u metiliranog skupinu od u unmethylated skupini (p = 0,013) .table 3 frekvencije genotipova između CDH1 metilnim i nemetiliranih skupina
CDH1 unmethylated
CDH1 metilira
p vrijednost * pregled pregled je broj ispitanika pregled 281 pregled 246 pregled srednja dob ± SD pregled 60,6 ± 14,0 pregled 61,4 ± 13,3 pregled NS pregled muško: žensko pregled 165: 116 pregled 154: 92 pregled NS pregled H. pylori pozitivni
152/281 pregled 186/246 izvoznici < 0.0001 pregled non-GC: GC pregled 262 : 19 pregled 150: 96 izvoznici < 0,0001 pregled HRH2 rs2607474 genotip pregled G /G pregled 197 pregled 204 pregled 0,013 # pregled G /A pregled 78
41 pregled a /a pregled 6
1 pregled frekvencija alela pregled 16,0%
8,7%
0,0004 pregled *: nemetiliran vs meliliranom, #: frekvencija GG homozigot pregled NS:.. nije značajna pregled rizika povezane s rs2607474 GG homozigot za DAPK i CDH1 metilacije
svemu, rs2607474 GG homozigot dala je vrlo značajan povećanim rizikom za razvoj DAPK pregled metilacije ( OR, 2,43; 95% CI, 1,60-3,69; p < 0,0001; Tablica 4). U non-GC ispitanika, GG homozigot je također pokazala značajno povećan rizik za razvoj DAPK pregled metilacije (OR, 2,61; 95% CI, 1,62-4,20; p &0.0001). Međutim, to prikazuje niti značajan rizik u non kancerogena sluznicu, ni u raka lezije u ispitanika s GC (Tablica 4). Učestalost DAPK pregled metilacije nije bila značajna različita između non kancerogena sluznice i raka lezije u ispitanika s GC (95/115 vs 104/115, p = 0,12) .table 4 Rizik od -1018 GG homozigot za razvoj DAPK metilacije pregled svega (527)
GG
GA
AA
GG vs prijevoznika; ILI (95% CI)
p vrijednost
nemetiliran (231) pregled, 155 pregled 72
4
referenca
- metilirani (296 )
246 pregled 47 pregled 3 pregled 2.43 (1.60-3.69) izvoznici < 0.0001 pregled non-GC (412) pregled nemetiliran (211) pregled 138
69 pregled 4
referenca
- metiliran (201) pregled, 167 pregled 31 pregled 3
2,61 (1,62-4,20) izvoznici < 0.0001
GC (115) pregled (ne kancerogen sluznice) pregled nemetiliran (20)
17 pregled 3
0 pregled referenca
- metiliran (95) pregled 79 pregled, 16
0 pregled 0,825 (0,379 - 3,73) pregled, 0,78 pregled (raka lezije) pregled nemetiliran (11)
10 pregled 1 pregled 0
referentna
- metiliran (104)
86
18 pregled, 0 pregled 0,598 (0.069-5.19)
0,64
prema logističke regresijske analize nakon prilagodbe za dob, spol i H. pylori infekcije status pregled ().. broj ispitanika pregled s druge strane, rs2607474 GG homozigot je povezan sa značajno povećanim rizikom za razvoj CDH1 Netlogu te DAPK pregled, metilacija (OR, 2,07; 95% CI, 1,35-3,17; p = 0,0009; Tablica 5). U non-GC ispitanika, GG homozigot je također povezan sa značajno povećanim rizikom za razvoj CDH1 pregled metilacije (OR, 2,25; 95% CI, 1,35-3,75; p = 0,0019). Međutim, on je pokazao niti značajan rizik u non kancerogena sluznicu, ni u raka lezije u ispitanika s GC (Tablica 5). Učestalost CDH1 pregled metilacije u ispitanika s GC bila je značajno niža u lezija raka nego u non kancerogena sluznici (78/115 vs 96/115, p = 0,009) .table 5 Opasnost od -1018 GG homozigot za razvoj od CDH1 metilacije
Općenito (527)
GG
GA
AA
GG vs prijevoznika; ILI (95% CI)
p vrijednost
nemetiliran (281) pregled, 197 pregled 78 pregled 6
referenca
- metilirani (246 ) pregled, 204 pregled 41
1 pregled 2,07 (1,35-3,17)
0,0009
non-GC (412) pregled nemetiliran (262) pregled, 180 pregled 76 pregled 6
referenca
- metiliran (150) pregled, 125 pregled 24
1 pregled 2,25 (1,35-3,75) pregled 0,0019 pregled GC (115 ) pregled (ne kancerogen sluznice) pregled nemetiliran (19)
17 pregled 2 pregled, 0 pregled reference
- metiliran (96)
79
17 pregled, 0 pregled 0,579 (0,120 - 2,80) pregled, 0,50 pregled (raka lezije) pregled nemetiliran (37)
30 pregled 7
0 pregled referenca
- pregled metiliran (78)
66 pregled, 12
0 pregled 1.50 (0.507-4.42)
0,47
prema logističke regresijske analize nakon prilagodbe za dob, spol i H. status pylori infekcije pregled (.): broj subjekta pregled rizika povezane s rs2607474 GG homozigoti za razvoj metilacije DNA u ispitanika iznad i ispod 60 godina starosti Netlogu u ispitanika mlađih od 60 godina starosti. , rs2607474 GG homozigot dala je malo, ali značajno, povećani rizik za DAPK pregled metilacije (OR, 2,12; 95% CI, 1,13-3,98; p = 0,020 Tablica 6), dok je ne za CDH1 pregled metilacije. Međutim, GG homozigot pokazali značajno povećan rizik za razvoj oba DAPK Netlogu i CDH1 pregled metilacije u osoba starijih od 60 godina (ili 2,72; 95% CI, 1,55-4,80; p = 0,0005 i OR, 2,81; 95% CI, 1,53-5,17; p = 0,0009, odnosno, Tablica 6) .table 6 Opasnost od rs2697474 GG homozigot kod mlađih ili starijih ispitanika
DAPK metilacije


= < 60 (233) pregled GG pregled GA pregled AA pregled GG vs GA + AA; ILI (95% CI) pregled, p vrijednost pregled unmethylated (115)
80 pregled, 32 pregled 3
referenca
- metiliran (118)
96
21 pregled 1 pregled 2,12 (1,13-3,98) pregled 0.020 pregled 60 < (294) pregled nemetiliran (116)
75 pregled, 40
1 pregled reference
- metiliranog (178)
150 pregled 26 pregled 2
2,72 (1,55-4,80)
0,0005 pregled CDH1 metilacija
= < 60 (233) pregled GG pregled GA pregled AA pregled GG vs prijevoznika; ILI (95% CI) pregled, p vrijednost pregled unmethylated (121)
88 pregled, 29 pregled, 4
referenca
- metiliran (112)
88
24
0 pregled 1,55 (0,827 - 2,91) pregled, 0,17 pregled 60 < (294) pregled nemetiliran (160) pregled, 109 pregled 49
2 pregled, referentna
- metiliran (134) pregled, 116 pregled 17 pregled, 1
2,81 (1,53-5,17) pregled 0,0009 pregled od strane logističke regresijske analize nakon prilagodbe za dob, spol i H. pylori status infekcije pregled ().. broj ispitanika pregled rizika povezane s rs2607474 GG homozigoti za razvoj DNA metilacije na H. pylori negativni ili pozitivni ispitanici
u H. pylori pregled negativnim temama, rs2607474 GG genotipa bila povezana s povećanim rizikom za metilacije oba DAPK Netlogu i CDH1
(OR, 2,70; 95% CI, 1,31-5,57; p = 0,0074, i OR, 4,43; 95% CI, 1,76-11,1; p = 0,0016, odnosno, tablica 7). Međutim, GG homozigot prikazuje povećani rizik za razvoj DAPK pregled metilacije na H. pylori pregled pozitivnih ispitanika (ili 2,29; 95% CI, 1.36-3.86, p = 0,0018), ali ne i za CDH1
methylation.Table 7 Opasnost od rs2607474 GG homozigot u H. pylori pozitivnih ili negativnih ispitanika
DAPK metilacije

H. pylori negativan ( 189)
GG pregled GA pregled AA pregled GG vs GA + AA; ILI (95% CI) pregled, p vrijednost pregled unmethylated (109)
73 pregled, 35
1 pregled reference
- metiliranog (80)
67
12 pregled 1 pregled 2,70 (1,31-5,57)
0.0074 pregled H. pylori pozitivan (338)
nemetiliran (122)
82 pregled 37
3 pregled referenca
- metiliran (216) pregled, 179 pregled 35
2 pregled, 2,29 (1,36-3,86) pregled 0,0018 pregled CDH1 gen metilacije
H. pylori negativan (189) pregled GG pregled GA pregled AA pregled GG vs prijevoznika; ILI (95% CI) pregled, p vrijednost pregled unmethylated (129)
86 pregled, 41 pregled 2 pregled reference
- metiliranog (60)
54
6
0 pregled 4,43 (1,76 - 11,1)
0.0016 pregled H. pylori pozitivni (338) pregled nemetiliran (152) pregled, 111 pregled 37
4
referenca
- metiliran (186) pregled, 150 pregled 35 pregled 1 pregled 1,50 (0,900 - 2,51) pregled, 0,12 pregled od strane logističke regresijske analize nakon prilagodbe za dob i spol pregled ().. broj ispitanika pregled pridruživanju između Sydney rezultate sustava i rs2607474
Sve u svemu, nije bilo značajne razlike u atrofiju ili metaplazije ocjenama između GG homozigot i GA + AA genotipa (slika 1). Međutim, kod osoba starijih od 60 godina, i rezultati su bili značajno viši u GG homozigot nego u GA + AA genotipa. Slika 1 Usporedbe Sydney rezultate sustav među GG homozigot i GA + AA genotipa. Sve u svemu, ni Atrofija, niti metaplazije rezultati su bili značajno različiti među GG homozigot i GA + AA genotipa. Međutim, u ispitanika starijih od 60 godina, i rezultati su bili značajno viši u GG homozigot nego u GA + AA genotipa
Oba atrofija i metaplazije rezultati su bili jako povezan s dobi u GG homozigot (oba p. ≪ 0.0001 by ANOVA Slika 2a, b), dok nije bilo kao korelacija između dobi i bilo rezultat u GA + AA genotipa (p = 0,76 i p = 0,69, odnosno, na slici 2c, d). Slika 2 pridruživanju između rs2607474 i želučane sluznice atrofije. a: Povezanost dobi i atrofije rezultat u GG homozigot atrofije rezultat je značajno korelira s dobi (p = 0,0001 po ANOVA, n = 233). b: Povezanost dobi i metaplazije rezultat u GG homozigot metaplazije rezultat je značajno korelira s dobi (p < 0.0001 by ANOVA). c: Povezanost dobi i atrofije rezultat u GA + AA genotipa. Nije bilo značajne korelacije (p = 0,47 po ANOVA, n = 63). d: Povezanost dobi i metaplazije rezultat u GA + AA genotipa. Nije bilo značajne korelacije (p = 0,48 po ANOVA). Pregled diskusije pregled Mi smo ranije izvijestili da CpG otok metilacije oba DAPK Netlogu i CDH1 Netlogu, u ne-neoplastičnim želučane sluznice, odgovara se na povećani rizik od karcinoma želuca [4]. U ovom istraživanju, učestalost metilacije u oba gena bila je značajno viša u ispitanika s GC nego bez GC. Međutim, učestalost CDH1 pregled metilacije na lezije raka bio je značajno manji nego u ne kancerozne sluznicu kod ispitanika s GC, iako učestalost DAPK pregled metilacije nije. Iz ovih nalaza, CDH1 pregled metilacije izgleda kao da se malo sudjeluje u razvoju raka želuca. U našim proučavanih tema, gen metilacije ne moraju odražavati ekspresiju proteina ili mRNA, iako su neke ranije studije pokazuju da su te genske metilacije doprinose smanjenju razine proteina i mRNA [27-30]. Druga mogućnost je da tumor može razviti kroz E-kadherina nezavisnih putova za karcinogeneze. Mehanizam karcinogeneze putem gena metilacije je još uvijek nejasno. Međutim, mi obratite pozornost na činjenicu da je akumulacija gena metilacije zapravo pokazuje povećani rizik od karcinogeneze, kao što su mnoge studije su pokazala [3, 4, 6, 7, 11-14, 31, 32], čak i ako metiliranje CDH1
ne može izravno utjecati na razvoj tumora.
Postoji nekoliko izvješća koja pokazuju uticaj polimorfizama HRH2 Netlogu na rizik za ljudske bolesti, ali oni postoje izvješća povezanost između rs2607474 i neuroloških i psiholoških poremećaja, kao što kao šizofrenije ili Parkinsonove bolesti [19, 20, 33]. Mi smo svjesni svih prethodnih izvješća o povezanosti ovog polimorfizma i želučanog disorders.In ovoj studiji, istražili smo povezanost između rs2607474 i razvoje CpG otoku metilacije oba DAPK Netlogu i CDH1 Netlogu u ne-kancerogen želučane sluznice. Naše je istraživanje otkriva da rs2607474 GG genotip je pozitivno povezana s razvojem CpG otoku metilacije oba gena. Osim toga, mi također otkrivaju da želučane sluznice atrofija je sve teže u relativno starijoj GG homozigot nego GA + AA genotipa, te da želučane sluznice atrofija napreduje s godinama samo u GG homozigot.
Jedan od najvažnijih faktora uzrokuje gen metilacije u želudac je H. pylori infekcija pregled, [4]. Infekcija s H. pylori
najprije izaziva kronični gastritis površni, što može napredovati do kroničnog atrofični gastritis, crijevne metaplazije i displazije koje mogu dovesti karcinom želuca [34]. Čimbenici koji promoviraju H. pylori pregled posredovano želučane atrofije su nešto sporno. H. pylori | Rezultati infekcija u visini od razine serumskog gastrina, u ranoj fazi infekcije, a nastavlja na razvoj atrofični gastritis. Većina kliničkih studija, međutim, prihvatio je da inhibitori protonske pumpe (IPP), koji izazivaju achlorhydria i hipergastrinemija, ubrzati početak atrofični gastritis u H. pylori pozitivnih bolesnika pregled [35-37]. Stoga, hipergastrinemija izgleda za promicanje želučane sluznice atrofije koja je pod utjecajem H. pylori pregled infekcije. Interstingly, dugotrajno liječenje štakora i miševa s loxtidine, a antagonisti moćan H2 receptora koji izazivaju ECL hiperplazije stanica (kao što to čini omeprazol), nije za posljedicu gubitak parijetalni stanice, ali umjesto toga pojavio rezultirati povećanjem parijetalni stanice [38, 39]. Osim toga, HDC knockout miševa držati na niske histamina dijeta pokazala prošireni parijetalni stanica bazen unatoč izlaže označena hipergastrinemija [40]. Ovi rezultati ukazuju na to da je up-regulacija histamina, ne achlorhydria, niti hipergastrinemija, što pridonosi postupnoj nizvodnom regulacijom broja parijetalni stanice i želučane atrofije. U ovoj studiji, želučane sluznice atrofija napredovala s dobi u rs2607474 GG homozigot skupini, dok je u GA + AA genotipa nije učinio. Osim toga, stupanj želučane sluznice atrofije bio veći kod starijih ispitanika koji su bili GG homozigot nego kod onih koji su GA + AA genotip. U našem prethodnom istraživanju, korelacija između intestinalne metaplazije i genske metilacije različitih gena je potvrđen [4]. Stoga predlažemo da se gen metilacije napreduje brže paralelno s želučane sluznice atrofije u GG homozigot nego u GA + AA genotipa. Nadalje, moguće je da je djelovanje histamina je viša u GG homozigot. Međutim, nije bilo nikakvih istraživanja za učinaka rs2607474 na funkciju ili ekspresiju H2 receptora i našeg genetskog statističke studije nije ih otkriti. To je jedno od ograničenja u našoj studiji.

• Masne kiseline sastav potkožnog masnog tkiva i sluznice želuca: Postoji li veza s želučane ulceracije
• Lokalni recidiv karcinoma želuca nakon ukupnog gastrektomije: neobična prezentacija