Контролируемое исследование о влиянии генотипа аполипопротеина Е на риск развития рака желудка и progression

A исследовании случай-контроль о влиянии генотипа аполипопротеина Е на риск развития рака желудка и прогрессии
Аннотация
Справочная информация
аполипопротеина Е ( АпоЕ) представляет собой многофункциональный белок играет как ключевую роль в метаболизме холестерина и триглицеридов, а также в восстановлении тканей и воспаление. В APOE
ген (19q13.2) состоит из трех основных изоформ, кодируемых е2, е3 и аллеля Е4 с аллеля Е4, связанной с гиперхолестеринемией и аллеля с е2 противоположным эффектом. Обратная зависимость между уровнем холестерина и раком желудка (GC) уже сообщалось ранее, хотя отношения между APOE
генотипов и GC не была исследована до сих пор.
Методы
Сто пятьдесят шесть рака желудка случаи и 444 управления больницы для генотипирования полиморфизма гена аРОЕ (е3, е2, £ 4 аллеля). Отношения между GC и предполагаемыми факторами риска измеряли с использованием скорректированных шансов (ОШ) и их 95% доверительный интервал (ДИ) от логистического регрессионного анализа. Анализ взаимодействия генов и окружающей среды была проведена. Влияние генотипов ароЕ на выживание от GC была исследована с помощью анализа Каплана-Мейера и Кокса пропорциональной модели регрессии опасности.
Результаты
Субъекты, несущие по меньшей мере, один APOE
Е2- аллель имеют значительное 60% снижение GC риска (OR = 0,40, 95% ДИ: 0,19 - 0,84) по сравнению с е3 гомозигот. Никакого значительного взаимодействия не Возникшие между или Е4 и аллеля е2 воздействия окружающей среды, ни Е2- или аллели пораженные epsi; 4 Медиана времени выживания, даже после коррекции по возрасту, полу и стадиона.
Выводы
Наше исследование отчеты за первый раз защитный эффект против аллеля е2 GC, который может быть частично связано с более высокими антиоксидантными свойствами, по сравнению с е2 е3 или на ε 4 аллели. Учитывая размер выборки в исследования, необходимы дальнейшие исследования, чтобы подтвердить наши выводы.
Ключевые слова
Рак желудка алипопротеина Генетическая эпидемиология полиморфизм генов-среда фона взаимодействия
аполипопротеина Е (АроЕ) представляет собой небольшой гликопротеин, который играет главную роль в клиренса крови холестерина богатых частиц, известный как остаточные липопротеины [1]. К тому же его хорошо узнаваемым роль в метаболизме липидов, АпоЕ было показано, участвует в нескольких патофизиологических процессах, в том числе антиоксидантным и иммунную активность, а также модулирующее действие на ангиогенез, рост опухолевых клеток и метастазирование индукции [2]. Структурный ген (19q13.2) для апоЕ
полиморфен с двумя однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) в пределах кодирующей области, в результате трех различных аллелей (ε2, ε3,) и Е4 шесть APOE
генотипами (три гомозиготы epsi; 4 /ε4, ε3 /ε3 и /е2 е2, и три гетерозиготы ε4 /ε3, ε3 /ε2, ε4 /ε2), каждый из которых показаны различные способности рецептор-связывающие [3, 4]. Мета-анализ сообщили почти линейную зависимость между APOE
генотипов и уровни общего и LDL холестерина в сыворотке крови (LDL-C), когда шесть генотипов упорядочены следующим образом: ε2 /ε2, ε2 /ε3, ε2 /ε4, ε3 /ε3, ε3 /ε4, ε4 /ε4 [5]. В целом, по сравнению с частными лицами с г3 аллеля, уровни общего и LDL-C, как правило, ниже, для тех, с аллелем и г2 выше для носителей epsi; 4 [6]. За последние два десятилетия, Поперечные исследования и перспективные сообщили, что низкий уровень холестерина в сыворотке крови связаны с более высоким без сердечно-сосудистого риска, особенно риска развития рака [7-10], таким образом, пациенты с уровнем общего холестерина в сыворотке крови низкий, более вероятно, страдают от рака. На сегодняшний день точная причина такого вывода остается до сих пор неясно. Различные объяснения могут быть заданы как: (я) эта ассоциация могла бы теоретически отражать прямую причинную роль холестерина в этиологии рака, или это быть связано (II) с некоторыми искажающих факторов, которые вызывают как низкий уровень холестерина и рака, или (III) к ' обратная причинно-следственной связи ", как низкий уровень холестерина может быть просто эффект от рака, а не причины [11].
Чтобы полностью ответить на вопрос, существует ли причинно-следственная связь между низким уровнем холестерина и раком, альтернативный подход эпидемиологическим под названием" менделирующей рандомизации "может быть использован для решения проблемы обратной причинности и вмешивающимся. В соответствии с этим подходом, генетической изменчивости (например, ароЕ
), который служит в качестве надежного прокси для экологически модифицируемых воздействия (например, сывороточный уровень холестерина) может быть использован для того, чтобы сделать выводы о причинной болезни [12]. Бенн и др. [13] недавно показали, что низкий уровень LDL-C было жестко связано с раком в крупном исследовании датской когорты, в то время как снижение ЛПНП, вызванное ОНП, включая апо E
, не было. Приняв подход Менделевское рандомизации, Бенн пришел к выводу, что его результаты в соответствии с тем, возникли из когорты пожилых пациентов, получавших правастатин [14] и от риска атеросклероза в сообществах когортного исследования [15], все свидетельствует низкий уровень ЛПНП, вероятно, из-за на доклинической стадии рака и сами по себе
не вызывают рак.
роль APOE
генотипов по раку желудка (GC) этиология не была exlpored до сих пор, как и Бенн и др. [13] рассмотрел все рак желудочно-кишечного тракта, не особым акцентом на GC. На сегодняшний день четыре когортных исследования [10, 16-18] исследовали взаимосвязь между уровнем холестерина в сыворотке крови и развитие GC. Среди них два японских когортные исследования [10, 18] и шведское исследование [16] сообщили, что низкий уровень холестерина в сыворотке крови являются независимыми факторами риска развития рака желудка, особенно кишечника histotype. Ни одна ассоциация, однако, не было сообщено в большом финском исследовании когорты [17]. Так как вопрос о том, является ли hypocholesterolemia является предрасполагающим фактором для ГХ или доклинической стадии ГХ не была полностью решена, наша больница на основе исследование случай-контроль направлен на преодоление этой проблемы, непосредственно глядя на отношения между APOE
генотипов и GC, а также их взаимодействие с потенциальными модификаторов эффекта.
Результаты
Общие характеристики исследуемой популяции в том числе 156 случаев GC и 444 управления представлены в таблице 1. потребление алкоголя было связано с повышенным риском ГХ с ОШ 1,84 (95% ДИ = 1.10-3.07) и 3,29 (95% ДИ = 1.36-7.98) для средних и тяжелых пьющих, соответственно. Почти в два раза риск GC (OR = 1,95, 95% ДИ: 1,06 - 3,60) был обнаружен среди лиц курение более 25 пачек сигарет в год. Кроме того, в семейном анамнезе рака желудка привело быть связано с повышенным риском GC (OR = 3,14, 95% ДИ: 1,17 - 8,44; таблица 1). В таблице 2 показано распределение шести аро Е
генотипов среди больных ГЦ и контрольной группой с ε3 /ε2 генотип будучи реже представлены в случаях (9,87%), чем в контрольной группе (15,67%). Таблица 1 Отношение шансов (95 % CI) для рака желудка в зависимости от выбранных переменных и их распределение частот среди 156 случаев рака желудка и 444 управления

случаи

Controls

OR (95% ДИ) †


п (%)

п (%)


Возраст (среднее ± стандартное отклонение)
67,05 ± 11,33 59,04 ±
16.00
Мужской пол
82 (53,2)
261 (58,8)
0.50 (0.30-0.83)
алкоголиков
0-6 г /день
60 (40,5) <бр> 251 (57,6)
1 *
7-29 г /сут
71 (48,0)
163 (37,4)
1.84 (1.10- 3.07)
> = 30 г /день
17 (11,5) 22
(5.0)
3.29 (1.36- 7.98)
статус курения
никогда не
Результаты 78 (50,7)
238 (54,2) <бр> 1 *
Всегда
76 (49,3)
201 (45,8)
1,51 (0.94- 2.45)
Pack-лет курения
0
74 (51,7)
245 (57,0)
1 *
1-25
31 (21.7)
111 (25,8)
1.40 (0.78- 2.50)
> 25
38 (26,6)
74 (17.2)
1,95 (1.06- 3.60)
Фрукты и овощи впускном
Высокое ‡
41 (27.5)
116 (27,2)
1 *
Low
108 (72,5)
310 (72,8)
1,18 (0.70- 1,98)
Жареное мясо
Low ^
106 (75,7)
314 (81,1 )
1 *
High
34 (24,3) 73
(18,9)
1,25 (0.72- 2,15)
Физическая активность
Любой
29 (18,6)
93 (20,9)
1 К *
None
127 (81,4)
351 (79,1)
0.81 (0.45- 1.45)
Семейная история рака
нет
87 (62,2)
291 (71,2)
1 *
Семейная история рака желудка
10 (7.1)
14 (3.4)
3.14 (1.17- 8,44) <бр> Семейная история другого рака
43 (30,7)
104 (25.4)
1.09 (0.66- 1.81)
частота аллеля АпоЕ
ε3
130 (85,5)
322 (80,1)
ε2
8 (5.3)
39 (9.7)
ε4
14 (9.2)
41 (10.2)
† или скорректированы по возрасту, полу , потребление алкоголя (как непрерывная переменная), packyears курения, потребление мяса на гриле и истории Familiy рака.
* справка категории.
‡ по меньшей мере, три порции фруктов и овощей в день.
^ меньше в четыре раза /месяц.
Таблица 2 Распределение ApoE полиморфизма среди случаев рака желудка и органов управления

случаи ‡

Controls ^

Все случаи

Кишечный (п = 79)

Диффузный (п = 57)

п (%)

п (%)

OR (95% ДИ) †

OR (95% CI) †

OR (95% CI) †

ε3 /ε3
109 (71,71)
253 (62,94)
1 *
1 * 1 *

ε3 /ε2
15 (9,87)
63 (15,67)
0,43 (0,21 -0.91)
0,34 (0,13 - 0,92)
0,57 (0,23 - 1,40)
ε3 /ε4
27 (17,76)
75 (18,66)
0,70 (0,37 - 1,30)
0,75 (0,35 - 1,60)
0,64 (0,27 - 1,47)
ε2 /ε2
0 (0.00)
5 (1,24)
NC NC

NC
ε2 /ε4
1 (0.66)
5 (1,24)
1,25 (0,10 - 15,10)
2.54 (0.21 - 31.17)
NC
ε4 /ε4
0 (0.00)
1 (0.25)
NC NC

NC
ε3 /ε2 или ε2 /ε2
15 (12,10)
68 (21,18)
0,40 (0,19 - 0,84) <бр> 0,31 (0,11 - 0,83)
0,53 (0,21 - 1,30)
ε3 /ε4 или ε4 /ε4
27 (19,85)
76 (23.10)
0,68 (0,36 - 1,26)
0,71 (0,34 - 1,53)
0,62 (0,27 - 1,43).
‡ аполипопротеина генотипа была измерена в 152 случаях
^ аполипопротеина генотип был измерен в 402 управления
† или отрегулированы по возрасту,. .., пол, потребление алкоголя (как непрерывная переменная), packyears курения, потребление мяса на гриле и семейной истории рака желудка
* Эталонная категория
NC: не Вычислимое из-за нескольких значений многих
Частота ароЕ.
генотипы уважали Харди-Вайнберга (HWE) в контрольной группе (р
-value > 0.05, данные не показаны). Из многофакторного анализа, физические лица, несущие по меньшей мере один APOE
аллель имел е2 значительное 60% снижение риска GC (OR = 0,40, 95% ДИ: 0,19 - 0,84) по сравнению с теми, гомозиготные по дикого типа (ε3 /ε3) (Таблица 2). Когда результаты были разделены в соответствии с опухолевой гистология, а также значимая связь между APOE
ε2 аллеля носителей и рака желудка, как представляется, ограничивается типом кишечника, с ОШ 0,31 (95% ДИ: 0,11 - 0,83; Таблица 2). Контроль качества показывает 100% -ное соответствие между методом рестрикционных фрагментов полиморфизма длины (ПДРФ) и секвенирования ДНК.
Результаты анализа взаимодействия генов и окружающей среды представлены в таблице 3. Отсутствие статистически значимого взаимодействия возникло между или Е4 аллеля (е2 р-
ценность с точки зрения взаимодействия > 0,05), пол, возраст, употребление алкоголя или фруктов и овощей intake.Table 3 взаимодействие между ароЕ генотипов и отдельные демографические и образа жизни переменные на GC риск
переменные

случаи

Controls

Любые e2

случаи

Controls

Any e4:

<бр> OR (95% CI) †:

OR (95% ДИ) †

Гендер
Женский, e3 /e3

51 ( 34,69)
96 (65,31)
1 *
51 (34,69)
96 (65,31)
1 *
Женский, вариант
8 (27,59)
21 (72.41)
0,58 (0,20 - 1,65)
12 (24,00)
38 (76.00)
0,55 (0,23 - 1,32)
Мужчины, e3 /e3

57 (26.64)
157 (73,36)
0,48 (0,27 - 0,88)
57 (26.64)
157 (73.36)
0,49 (0,27 - 0,89)
Мужчины, вариант <бр> 7 (12,96)
47 (87,04)
0,49 (0,11 - 2,18)
14 (26,92)
38 (73.08)
1,52 (0,44 - 5,27)
P значение для взаимодействие °

0,347
0,660
Возраст
&л; 60 лет, e3 /e3

25 (17,73)
116 (82,27)
1 *
25 (17,73)
116 (82,27)
1 *
&л; 60 лет, вариант
4 (12.50)
28 (87,50)
0,35 (0,07 - 1,68 )
7 (21,21)
26 (78.79)
0,70 (0,18 - 2,66)
≥60 лет, e3 /e3

84 (38,01)
137 (61,99 )
2,85 (1,53 - 5,28)
84 (38,01)
137 (61,99)
2,84 (1,54 - 5,26)
≥60 лет, вариант
11 (21,57) <бр> 40 (78,43)
1,24 (0,21 - 7,26)
20 (28,57)
50 (71.43)
0,97 (0,21 - 4,36)
P значение для взаимодействия

0,807
0,964
Употребление алкоголя
Никогда, e3 /e3

45 (24,06)
142 (75,94)
1 *
45 (24,06)
142 (75,94)
1 * не
никогда, вариант
5 (12.50)
35 (87,50)
0,29 (0,08 - 1,04)
12 (18,18)
54 ( 81.82)
0,62 (0,28 - 1,37)
Когда-либо, e3 /e3

64 (36,57)
111 (63,43)
1,59 (0,88 - 2,86)
64 ( 36,57)
111 (63,43)
1,46 (0,81 - 2,62)
Когда-либо, вариант
10 (23,26)
33 (76,74)
1,78 (0,37 - 8,50)
15 (40,54)
22 (59.46)
1,28 (0,35 - 4,66)
P значение для взаимодействия

0,468
0,707
статус курильщика
Никогда, e3 /e3

54 (29,03)
132 (70,97)
1 *
54 (29,03)
132 (70,97)
1 *
Никогда, вариант <бр> 8 (20,51)
31 (79,49)
0,48 (0,18 - 1,28)
13 (20.00)
52 (80.00)
0,53 (0,23 - 1,23)
Когда-нибудь, e3 /e3

54 (31,40)
118 (68,60)
1.41 (0.80 - 2.50)
54 (31.40)
118 (68.60)
1,39 (0,79 - 2,45 )
Когда-нибудь, вариант
7 (16,28)
36 (83,72)
0,68 (0,15 - 2,98)
13 (36,11)
23 (63.89)
1,98 (0,59 - 6,73)
значение P для взаимодействия

0,609
0,271
Фрукты и овощи впускном
низкий, e3 /e3
28 (29,47)
67 (70.53)
1 *
28 (29,47)
67 (70,53)
1 *
низкий, вариант
2 (9,09)
20 (90.91)
0,14 (0,02 - 0,87)
9 (32,14)
19 (67.86)
0,84 (0,28 - 2,49)
High, e3 /e3
78 (31,08)
173 (68,92) <бр> 1,17 (0,61 - 2,23)
78 (31,08)
173 (68,92)
1.12 (0.59 - 2.13)
высокий, вариант
11 (19,30)
46 (80,70)
2.83 (0.38 - 21.05)
16 (22,86)
54 (77,14)
0,62 (0,16 - 2,37)
P значение для взаимодействия

0,309
0,487
† или скорректированы по возрасту, полу, употребление алкоголя (как непрерывная переменная), packyears курения, приготовленные на гриле потребление мяса и история Familiy рака желудка.
* справка категории.
° с помощью теста отношения правдоподобия. <бр> Медиана выживаемости от гастрэктомии составила 19 месяцев без каких-либо статистически значимых различий для APOE
ε2 или ε4 аллеля носителей (p-
значение лог-рангового > 0,05), даже тогда, когда анализ был ограничен до 1 года и 2 года после хирургического вмешательства (данные не показаны). Кокс регрессионный анализ не показал существенной разницы в соответствии с апоЕ
после корректировки по возрасту, полу и стадион, даже после того, как стратификация по histotype рака.
Обсуждение
Наш случай-контроль исследование 156 случаев рака желудка и 444 больницы -На управления оценивали впервые эффект APOE
генотипов и их взаимодействия с отдельными демографических и факторов образа жизни на риск развития рака желудка среди итальянского населения. По нашим результатам, APOE
ε2 аллель ассоциируется с 60% статистически значимое снижение риска GC по сравнению с диким типом г3 аллеля. Этот защитный эффект был особенно силен для кишечника histotype. Нам не удалось, однако, обнаружить значимые взаимодействия между APOE
аллели и факторы образа жизни. Кроме того, APOE
генотипы, кажется, не влияют на продолжительность жизни после хирургического вмешательства, даже когда анализ был ограничен конкретными опухолевые histotypes.
Перед тем как интерпретировать наши результаты, некоторые ограничения исследования должны быть приняты во внимание. Во-первых, на основе распространенность APOE
аллели в нашей контрольной популяции, это исследование имеет априори
90% мощности для обнаружения или 0,40 за эффект APOE
аллеля (е2 на 5% уровень значимости). Размер выборки В исследовании ограничивает возможность обнаружить статистически значимые взаимодействия генов и окружающей среды, однако, нам нужно увеличить размер выборки для того, чтобы подтвердить наши результаты. Во-вторых, данные о уровни холестерина в сыворотке не доступны в нашем исследовании населения, хотя их полезность будет ограничено в связи с тем, такие уровни страдают от самого рака.
Эффект APOE
генотипов было ранее исследованы в отношении рака молочной железы, толстой и прямой кишки, желчных путей, простаты, рак головы и шеи, и гематологических злокачественных опухолей [19-24], с противоречивыми результатами. Недавно опубликованное исследование Менделевское рандомизации рассмотрел нерешенной вопрос о причинной роли холестерина в этиологии рака путем изучения, если некоторые ОНП включая апоЕ
, все связанные с пожизненным снижается в плазме LDL-C, каузально связаны с повышенным риском развития рака среди два крупных датских общие демографические исследования [13]. Результаты показывают обратную зависимость между заболеваемостью раком или уровнями смертности и холестерина, в то время как никакого эффекта не было продемонстрировано для APOE
аллели. Даже с некоторыми ограничениями по выбранной группе, авторы приходят к выводу, что существует значительная нехватка причинного влияния холестерина на риск развития рака, включая желудочно-кишечных раковых образований. Соответственно, очевидное противоречие между результатами, касающихся уровня холестерина в плазме крови и риск развития рака по отношению к апо E
, может свидетельствовать о доклинической стадии рака, связанного с повышенное поглощение холестерина из крови для роста и пролиферации клеток, тем самым снижая холестеринемию до клинического диагноза рака.
Что касается рака желудка, два японских когортных исследований [10, 18] и шведском исследовании когорты [16] сообщили сильную обратную связь между уровнем холестерина в сыворотке крови и риском развития рака желудка. Японские исследования, однако, нашли связь гораздо менее сильной после исключения из ранних 3-летних случаев заболевания и более сложных случаев, таким образом, что предполагает развитие рака желудка само по себе приводит к снижению общего уровня холестерина. Для преодоления проблем, связанных с обратной причинной или вмешивающимся факторами образа жизни, мы решили уточнить роль уровней холестерина на GC риска при использовании менделевскую рандомизации подход, а именно путем изучения непосредственно эффект APOE
генотипов на большой серии случаев итальянских GC и контроля. Наши результаты показывают статистически значимое 60% снижение риска GC, связанного с аллеля е2.
Так как носители имеют Е2- низшую холестеринемию сыворотки, чем не-носителей е2, наш вывод противоречит ранее сообщалось о наблюдении, что низкий уровень холестерина в сыворотке крови увеличивают риск GC [10, 16, 18]. АпоЕ, тем не менее, имеет много других функций, помимо своей известной роли в метаболизме липидов, которые потенциально вовлеченные в риск развития рака, поскольку он участвует в восстановлении тканей, воспалительных и иммунный ответ, клеточный рост и ангиогенез [2], и показывает антиокислитель свойства [25]. Важное значение, АпоЕ белок обладает определенными антиоксидантными свойствами, с уменьшением антиоксидантной активностью в порядке и е2 ГТ; ε3 > аллели Е4 [25]. Даже если молекулярные механизмы, ответственные за антиоксидантные свойства ароЕ
еще не выяснены, ряд исследований изучали механизмы, посредством которых APOE
генотипы могут повлиять на статус-зависимые окислительные медиаторов или биомаркеров окислительного стресса [26 -28]. APOE
курения ε2 носителей лиц, которые подвергаются воздействию никотина, является важным источником окислительного стресса, имеют почти на 30% выше общего антиоксидантного статуса по сравнению с APOE
е3-носителей, определяемая как способность ингибировать пероксидазу -опосредованного формирование 2,2-Азино-бис-3-ethylbensthiazoline-6-сульфокислоты (БЕСТ +) радикал, в то время как APOE
предметы показывают Е4 30% увеличилась окисленный LDL [26].
окислительный стресс учитывая дисбаланс между увеличением производства активных форм кислорода и значительному снижению способности антиоксидантных функций. Производство пероксидов и свободных радикалов, связанные с изменениями в нормальном редокс-состояния тканей может вызвать токсические эффекты, включая окислительных повреждений ДНК, что наряду с гипоксией и ацидозом, могут быть в значительной степени участвуют в патогенезе GC, как это можно считать причиной, как а также вследствие прогрессирования опухоли [29, 30]. Некоторые данные показали широкий величину окислительного стресса в тех случаях, если GC по сравнению со здоровыми лицами, о чем свидетельствует повышенный уровень продуктов перекисного окисления липидов и истощению ферментативной и неферментативного антиоксидантов [31, 32]. С учетом всех этих выводов, результаты нашего исследования, в котором сообщается защитный эффект APOE
аллеля на е2 GC, может объясняться улучшенными антиокислительными свойствами по сравнению аллеля е2 с е3 или аллеля Е4, и это доказательства могут быть особенно верно для GC, чьи патогенез сильно зависит от связанных с курением окислительного стресса [33]. Если наша модель верна, мы ожидаем, что взаимодействие между APOE
ε2 аллеля и курение статуса, однако ограниченная сила нашего анализа взаимодействия, возможно, затемнение ее.
Выводы
В заключение, наше исследование дает для впервые свидетельство возможного защитного эффекта против аллеля е2 GC. Необходимы дальнейшие исследования, чтобы подтвердить наши результаты и выяснить, если защитный эффект опосредуется пониженным уровнем холестерина или лучше антиоксидантными свойствами.
Методов
Исследование населения
были выбраны Испытуемых в соответствии с случай-контроль изучить конструкцию, как описано ранее [34-36]. Если коротко, то случаи были последовательными желудочных больных первичные аденокарциномы, с гистологическим подтверждением, который подвергся целебное гастрэктомию в "А. Джемелли" учебной больнице в период 2002-2010 годов. Органы управления были выбраны из пациентов без рака, с широким диапазоном диагнозов, допущенных к той же больнице в течение одинакового периода времени.
Ближе деталей, около 50% нашей контрольной популяции состоит из крови доноров, а другая половина сделан из пациентов, перенесших хирургические вмешательства, как лапароскопической холецистэктомии или аппендицит или паховая грыжа и меньшая часть пациентов, страдающих хроническими заболеваниями, как гипертония или хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ), подвергающегося периодический медосмотр.
Все предметы были кавказцы родились в Италия. Размер исследования Выборка состояла из 156 случаев и 444 управления, со скоростью участия 98% среди случаев и 93% в контрольной группе. Согласно классификации Lauren, большинство (58,1%) из желудка случаев рака были кишечные [37]. Опухоли были расположены в антральном (44,5%), в корпусе (14,8%), в антральном /корпус (21,1%), в кардии (3,1%), пней (5,5%), в fundum (1,6% ), в кардии /корпус (6,3%), а всего желудка (3,1%). На основании цитологических и архитектурных atypisms, а также гисто-патологических отчетов [38], опухолей пациентов были классифицированы соответственно: 70,0% едва ли дифференцируются (G3), 27,6% умеренно дифференцированной (G2), 3,4% хорошо дифференцированной (G1 ), в то время как 51,7% были поставлены I-II и 48,3% в постановке III-IV.
Письменное информированное согласие было получено от всех субъектов исследования, после чего каждый субъект предоставил образце венозной крови, которую собирали в ЭДТА покрытием труб. Это исследование было выполнено в соответствии с Хельсинской декларацией и было одобрено этическим комитетом Католический университет Святого Сердца.
Генотипирования
ДНК выделяли из лимфоцитов периферической крови, а также генотипирование апоЕ
была выполнена с помощью рестрикционных фрагментов полиморфизма длины (ПДРФ). Вкратце, 20 нг геномной ДНК амплифицировали с использованием олигонуклеотидных праймеров 5'-TCC AAG GAG CTG CAG GCG GCG СА-3 'и 5'-НКУ CCG НКУ TGG TAC ACT НКУ А-3'. Реакции денатурировали в течение 3 мин при 95 ° С, с последующими 35 двухступенчатых циклов, состоящих из 10 секунд при 95 ° С, затем 10 секунд при 66 ° C. После того, как циклы были завершены окончательное продление 5 минут при 95 ° С была выполнена. 10 мкл аликвоты каждого ПДРФ продукта расщепляли 5 Ед AFL
III и отдельную 10 мкл аликвоты расщепляли 5 Ед Hae
II. Оба APOE
ε2 и APOE
е3 аллели были вырезаны с AFL
III, чтобы получить продукты 50 и 168 б.п., в то время как APOE
ε4 аллель остается режиссерский на 218 базисных пунктов. Использование Хэ
II, как ароЕ
ε3and ароЕ аллели дают Е4 продукты 23 и 195 базисных пунктов, в то время как APOE
ε2 аллель остается режиссерский на 218 базисных пунктов. Шесть возможных генотипа были назначены на основе анализа структуры, созданные ограничения дайджеста. Что касается контроля качества, 5% образцов были также секвенируют, со стандартными образцами ДНК для каждого APOE
генотипа, посланного Seripa и др. [39].
Данные Коллекция
Корпуса и элементы управления были опрошены обученными врачами с использованием структурированного вопросника для сбора информации о демографических данных, курение сигарет, питьевой истории, привычек питания, физической активности и семейной истории рака с А Особое внимание уделяется раку желудка. Участникам было предложено сосредоточить внимание на год до диагноза (для контроля за год до даты собеседования), отвечая на вопросы, касающиеся образа жизни привычек. Статус курения был отнесен к категории, как никогда и постоянно курильщики (включая как текущие, так и бывших курильщиков). Пакет лет рассчитывались как лет выкуренных умножается на текущий номер (или предыдущий номер, для тех, кто ушел) из выкуриваемых сигарет в день, поделенное на 20.
фруктов и овощей потребления был отнесен к категории высокой, если по меньшей мере тремя порциями фрукты и овощи были израсходованы ежедневно в то время как потребление мяса на гриле был определен как низкий, если потребление было меньше, чем в 4 раза /месяц. Семейная история рака называют родителей, братьев, сестер и потомства. Данные, касающиеся предыдущего хеликобактерной
инфекции были доступны только для желудка случаев рака. Быстродействие для завершения интервью было 92% случаев и 97% в контрольной группе, за исключением данных, относящихся к жареным потребление мяса (неизвестной в 10% случаев и 12,8% в контрольной группе) и семейной историей рака (неизвестно в 10% случаев и 8% контрольных).
Статистический анализ
Взаимосвязь между раком желудка и предполагаемыми факторами риска были измерены с использованием скорректированных шансов (ОШ) и их 95% доверительный интервал (ДИ), полученные из логистики регрессионный анализ с использованием программного обеспечения STATA (версия 10.0). Возможные факторы риска считались усложняющих, если добавление этой переменной в модели изменили или с 10% или более, и, как только был идентифицирован confounder любого оцененной основного эффекта, она хранилась во всех моделях. Исходя из этих критериев, мы контролировали возраста, пола, алкоголя и жареного потребления мяса, курение сигарет (пачка-лет) и семейной истории рака желудка. Χ 2-тест Харди-Вайнберга (HWE) для трех APOE
аллелями проводился в контрольной группе. Для того чтобы исследовать, если эффект выбранных полиморфизмов был изменен некоторыми факторами окружающей среды, стратифицированной логистический регрессионный анализ был проведен, корректировки на вмешивающихся ранее идентифицированных. Анализ взаимодействия генов и окружающей среды проводили с использованием тех, несущий гомозиготный дикого типа генотип (ε3 /е3, связанные с APOE
г3 изоформы) в качестве контрольной группы. В этом анализе, генотипы были классифицированы следующим образом: наличие по крайней мере одного APOE
аллеля или е2 присутствии по меньшей мере одного APOE
аллеля (£ 4 генотипом ε2 /ε4 не был включен в одну категорию), обеспечивая . два других APOE
изоформы (апо E
2 и апо E
4)
В этом анализе, возраст был отнесен к категории биномиально (&л; 60 и ≥ 60 лет), статус курения считался никогда /никогда не курильщики, а также употребление алкоголя в пьющих /трезвенники (последний в том числе лиц, у которых потребление алкоголя составляло менее 7 г /сут). Для того чтобы проверить взаимодействие между двумя переменными воздействия, был использован тест отношения правдоподобия, с лицами, гомозиготными для дикого типа генотип (ε3 /г3), а не подвергаются переменным интерес, используемой в качестве контрольной группы. В целом
кривые выживаемости были рассчитаны с помощью предельного продукта методом Каплана-Мейера с момента постановки диагноза до смерти. Если пациент не умер, выживание было подвергнуто цензуре во время последнего визита. Тест журнала ранг был использован для оценки различий между подгруппами. Риск смерти, связанной с АроЕ изоформ была оценена по пропорциональной модели опасности Кокса. Отношения риска (HR) были скорректированы с учетом возраста, пола, и стадион, с диким типом генотипа (ε3 /г3) в качестве контрольной группы. Кроме того, анализы были разделены в соответствии с histotype рака (кишечная /диффузного)
Источник поддержки
Нет поддержки финансирования не должны быть объявлены
Сокращения
ИЛИ:..
Отношение шансов <Все авторы читали и одобрили окончательный вариант рукописи.

• Иммуногистохимическое согласованность между первичной опухоли и метастазов в лимфоузлах желудка нейроэндо…
• Изменения Е-кадгерина и бета-катенин при раке желудка