A pesquisa relaciona a prevalência de SARS-CoV-2,

superfícies de hospitais e microbiomas de pacientes Os pesquisadores descobriram uma maior diversidade bacteriana nos quartos dos pacientes com SARS-CoV-2 e nas superfícies dos quartos, sugerindo que a diversidade bacteriana pode desempenhar um papel na transmissão do vírus.

p A síndrome respiratória aguda grave coronavírus 2 (SARS-CoV-2), o agente causador da pandemia COVID-19, se espalha principalmente por transmissão aérea, tanto em gotículas respiratórias quanto em aerossóis. A transmissão fecal é mais uma via possível pela qual o vírus se espalha.

p Outro método de disseminação é quando as pessoas tocam gotículas contendo vírus que caem em várias superfícies como mesas, maçanetas, e contadores. SARS-CoV-2 foi detectado em uma variedade de superfícies, incluindo plástico, cartão, aço, e metais.

A composição bacteriana é preditiva do status de SARS-CoV-2 em narinas, testa, amostras de fezes e pisos internos. O desempenho de previsão de classificadores Random Forest no status de SARS-CoV-2 para cada tipo de amostra foi avaliado usando AUROC (A) e AUPRC (B) para narinas (n =76), testa (n =79), fezes (n =44), e dentro do piso (n =107), em uma abordagem de validação cruzada de 100 vezes (ver métodos). (C) gráfico EMPress dos 100 recursos mais preditivos do status SARS-CoV-2 em narinas, testa, amostras de fezes e pisos internos, onde um único ASV com 100% de alinhamento com Rothia dentocariosa foi identificado em todos os tipos de amostra. Top 100 classificações aleatórias de importância florestal e taxonomia GreenGenes de nares, testa, Banco, e amostras de piso interno estão disponíveis em S2. (D) Proporção de amostras contendo o ASV Rothia dentocariosa altamente preditivo em amostras positivas e negativas de SARS-CoV-2 do estudo atual, e de (30) (UTI 2016 pre263 COVID19) p O risco de contrair o vírus SARS-CoV-2 é maior em ambientes fechados do que ao ar livre, especialmente em áreas mal ventiladas. Um microbioma interno pode ser único dependendo do ambiente, principalmente dominado por micróbios de galpões humanos.

p Os micróbios geralmente são bactérias, mas as áreas internas também podem conter vírus quando há presença de pessoas doentes. A interação de vírus e bactérias foi conhecida e estudada, por exemplo, em animais, a interação entre bactérias intestinais e vírus intestinais. As bactérias intestinais podem afetar a infectividade do vírus gastrointestinal, melhorando a termoestabilidade e a estabilidade ambiental dos vírus. Interações vírus-bactérias também foram observadas no trato respiratório superior. Portanto, é possível que tais interações estejam presentes mesmo em espaços internos.

Dados demográficos do paciente (n =16) (A), ingestão de antibióticos (B), comorbidades (C).

Microbiome em quartos de pacientes SARS-CoV-2

p Pesquisadores da Universidade da Califórnia, San Diego, IBM, T. J. Watson Research Center e IBM-Almaden exploraram se os micróbios presentes em um ambiente interno podem afetar a infecção por SARS-CoV-2. Eles relataram seus resultados em um artigo publicado no medRxiv * servidor de pré-impressão.

p Os autores obtiveram amostras de esfregaço de pacientes e profissionais de saúde no UCSD Medical Center. Eles esfregaram a pele, trato respiratório, Banco, e várias superfícies com as quais os pacientes e profissionais de saúde entraram em contato para coletar 972 amostras de pessoas e 734 amostras de superfícies de hospitais.

p Das amostras de superfície, cerca de 13% foram positivos para SARS-CoV-2. Os andares próximos à cama de um paciente eram os que mais continham vírus. Algum vírus também foi encontrado em pacientes com teste negativo para o vírus e em quartos limpos após serem ocupados por um paciente positivo.

p Usando o teste 16S rRNA, eles identificaram os diferentes micróbios nas amostras. Eles encontraram diferentes aglomerados de micróbios no chão, Banco, e amostras de narina / testa. Superfícies frequentemente tocadas por profissionais de saúde tinham microbiomas semelhantes aos seus microbiomas, e aqueles mais tocados pelos pacientes tinham microbiomas semelhantes aos dos pacientes.

p A diversidade média de espécies foi muito maior nas amostras de superfície, especialmente o chão, do que em amostras de pessoas, com a diversidade sendo maior em amostras positivas para SARS-CoV-2. Analisando os micróbios presentes nas amostras positivas, os autores encontraram Clostridiales ser um grupo presente em alta proporção nas amostras de fezes, semelhante ao encontrado em estudos de águas residuais. Actinomyces, Anaerococcus, Dialister, Gemella, e Schaalia foram vistos nas amostras de testa e narina.

p Eles encontraram Rothia dentocariosa ser comum na testa, narina, Banco, e amostras de piso e foi mais prevalente em amostras positivas para SARS-CoV-2. Rothia geralmente não está presente em amostras de hospitais, encontrei os autores, depois de comparar um estudo anterior de microbioma hospitalar, e era específico para SARS-CoV-2.

Mapeamento espacial da Ili 'do quarto padrão do hospital (não-UTI) e da unidade de terapia intensiva (UTI). O mapa de calor mostra a porcentagem de amostras coletadas em cada local que foram positivas para SARS CoV-2.

Associação entre SARS-CoV-2 e bactérias internas

p Embora o vírus SARS-CoV-2 tenha sido detectado no ambiente interno dos quartos dos pacientes, não se sabe se os vírus detectados eram viáveis. Por causa dos altos valores de Ct da maioria das amostras e da falta de infecção nos profissionais de saúde que cuidam dos pacientes, os autores concluíram que as superfícies positivas eram fontes improváveis ​​de infecção viral no ambiente hospitalar estudado quando foi usada proteção pessoal adequada. Contudo, práticas de limpeza eficazes devem ser mantidas para limpar superfícies rotineiramente para reduzir a chance de transmissão.

p A presença de Rothia foi visto em estudos anteriores sobre SARS-CoV-2, sugerindo uma forte associação com o vírus, embora o mecanismo não seja claro. Rothia espécies foram vistas no microbioma oral e gastrointestinal humano e sugere aumento da transmissão fecal-oral, uma característica do COVID-19. Rothia também foi observado como sendo maior em pacientes com COVID-19 com doença cardiovascular, mas também foi observado em pacientes cardiovasculares sem COVID-19. Mais estudos são necessários para entender essa associação e se ela pode ser usada em métodos para reduzir a transmissão da SARS-CoV-2.

p Entre todas as amostras, testa, narinas, Banco, a bactéria Rothia dentocariosa foi altamente preditivo e associado à infecção por SARS-CoV-2. A associação pode ser resultado da interação direta da bactéria com o vírus ou indiretamente por meio de efeitos no hospedeiro, sugerindo que talvez haja um papel da sinergia vírus-bactéria na transmissão da doença COVID-19.

*Notícia importante

p medRxiv publica relatórios científicos preliminares que não são revisados ​​por pares e, Portanto, não deve ser considerado conclusivo, orientar a prática clínica / comportamento relacionado à saúde, ou tratadas como informações estabelecidas.

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