Het ernstige acute respiratoire syndroom coronavirus 2 (SARS-CoV-2), de veroorzaker van de COVID-19-pandemie, verspreidt zich voornamelijk via de lucht, hetzij in ademhalingsdruppels of aerosolen. Fecale overdracht is nog een mogelijke manier waarop het virus zich verspreidt.
Een andere verspreidingsmethode is wanneer mensen virusbevattende druppeltjes aanraken die op verschillende oppervlakken vallen, zoals tafels, deur knoppen, en tellers. SARS-CoV-2 is gedetecteerd op verschillende oppervlakken, inclusief kunststof, karton, staal, en metalen.
Bacteriële samenstelling is voorspellend voor de SARS-CoV-2-status in neusgaten, voorhoofd, ontlasting en binnenvloermonsters. De voorspellingsprestaties van Random Forest-classificaties op de SARS-CoV-2-status voor elk monstertype werden beoordeeld met behulp van AUROC (A) en AUPRC (B) voor neusgaten (n=76), voorhoofd (n=79), ontlasting (n=44), en binnenvloer (n=107), in een 100-voudige kruisvalidatiebenadering (zie methoden). (C) EMPress-plot van de 100 is het meest voorspellend voor de SARS-CoV-2-status in neusgaten, voorhoofd, ontlasting en binnenvloermonsters, waarbij een enkele ASV met 100% afstemming op Rothia dentocariosa werd geïdentificeerd voor alle monstertypen. Top 100 rangschikkingen van willekeurig bosbelang en GreenGenes-taxonomie van nares, voorhoofd, stoel, en binnenvloermonsters zijn beschikbaar in S2. (D) Percentage monsters dat de zeer voorspellende Rothia dentocariosa ASV bevat in positieve en negatieve SARS-CoV-2-monsters uit het huidige onderzoek, en vanaf (30) (ICU 2016 pre263 COVID19) Het risico om het SARS-CoV-2-virus op te lopen is binnenshuis groter dan buitenshuis, vooral in slecht geventileerde ruimtes. Een binnenmicrobioom kan uniek zijn, afhankelijk van de omgeving, meestal gedomineerd door microben van menselijke stal.
De microben zijn over het algemeen bacteriën, maar binnenruimtes kunnen ook virussen bevatten als er zieke mensen aanwezig zijn. De interactie van virus en bacteriën is bekend en bestudeerd, bijvoorbeeld, bij dieren, de interactie tussen darmbacteriën en darmvirussen. Darmbacteriën kunnen de infectiviteit van het gastro-intestinale virus beïnvloeden door de thermostabiliteit en omgevingsstabiliteit van virussen te verbeteren. Interacties tussen virussen en bacteriën zijn ook waargenomen in de bovenste luchtwegen. Vandaar, het is mogelijk dat dergelijke interacties zelfs in binnenruimten aanwezig zijn.
Patiënt (n=16) demografie (A), antibiotica inname (B), comorbiditeiten (C). Onderzoekers van de Universiteit van Californië, San Diego, IBM, T.J. Watson Research Center en IBM-Almaden onderzochten of de microben die aanwezig zijn in een binnenomgeving SARS-CoV-2-infectie kunnen beïnvloeden. Ze rapporteerden hun resultaten in een paper gepubliceerd op de medRxiv * preprint-server.
De auteurs verkregen uitstrijkjes van patiënten en gezondheidswerkers in het UCSD Medical Center. Ze veegden de huid af, luchtwegen, stoel, en verschillende oppervlakken waarmee de patiënten en gezondheidswerkers in contact kwamen om 972 monsters van mensen en 734 monsters van ziekenhuisoppervlakken te verzamelen.
Van de oppervlaktemonsters, ongeveer 13% was positief voor SARS-CoV-2. Vloeren bij het bed van een patiënt hadden het meeste virus. Er werd ook enig virus aangetroffen bij patiënten die negatief waren getest op het virus en in kamers die werden schoongemaakt nadat ze door een positieve patiënt waren bezet.
Met behulp van de 16S rRNA-test, ze identificeerden de verschillende microben in de monsters. Ze vonden verschillende clusters van microben op de vloer, stoel, en neusgat-/voorhoofdmonsters. Oppervlakken die vaak worden aangeraakt door gezondheidswerkers hadden microbiomen die vergelijkbaar waren met hun microbioom, en degenen die door patiënten werden aangeraakt, hadden meer microbiomen die vergelijkbaar waren met de patiënten.
De gemiddelde soortendiversiteit was veel hoger in de oppervlaktemonsters, vooral de vloer, dan in steekproeven van mensen, waarbij de diversiteit meer is in SARS-CoV-2-positieve monsters. Analyse van de microben die aanwezig zijn in positieve monsters, de auteurs vonden Clostridiales een groep zijn die in hoge mate aanwezig is in de ontlastingsmonsters, vergelijkbaar met die gevonden in afvalwateronderzoeken. Actinomyces, anaerokok, kiezer, Gemella, en Schaalia werden gezien in het voorhoofd en neusgatmonsters.
Ze vonden Rothia dentocariosa gebruikelijk zijn op het voorhoofd, neusgat, stoel, en vloermonsters en kwam vaker voor in SARS-CoV-2-positieve monsters. Rothia is over het algemeen niet aanwezig in ziekenhuismonsters, vond de auteurs, na vergelijking van een eerdere microbioomstudie in een ziekenhuis, en was specifiek voor SARS-CoV-2.
Ili' ruimtelijke mapping van standaard ziekenhuis (niet-ICU) kamer en intensive care unit (ICU) kamer. Heatmap toont het percentage monsters dat op elke locatie is verzameld en dat positief was voor SARS CoV-2. Hoewel het SARS-CoV-2-virus werd gedetecteerd in de binnenomgeving in patiëntenkamers, het is niet bekend of de gedetecteerde virussen levensvatbaar waren. Vanwege de hoge Ct-waarden van de meeste monsters en het gebrek aan infectie bij de gezondheidswerkers die voor de patiënten zorgen, de auteurs concluderen dat positieve oppervlakken onwaarschijnlijke bronnen van virale infectie waren in de onderzochte ziekenhuisomgeving wanneer de juiste persoonlijke bescherming werd gebruikt. Echter, Om de kans op overdracht te verkleinen, moeten effectieve reinigingspraktijken worden gehandhaafd om oppervlakken routinematig te reinigen.
De aanwezigheid van Rothia is gezien in eerdere onderzoeken naar SARS-CoV-2, suggereert een sterke associatie met het virus, hoewel het mechanisme niet duidelijk is. Rothia soorten zijn waargenomen in het menselijke orale en gastro-intestinale microbioom en suggereert verhoogde orale-fecale transmissie, een kenmerk van COVID-19. Rothia is ook hoger waargenomen bij COVID-19-patiënten met hart- en vaatziekten, maar het is ook waargenomen bij cardiovasculaire patiënten zonder COVID-19. Er zijn meer studies nodig om deze associatie te begrijpen en of deze kan worden gebruikt in methoden om de overdracht van SARS-CoV-2 te verminderen.
Onder alle monsters, voorhoofd, neusgaten, stoel, de bacterie Rothia dentocariosa was zeer voorspellend voor en geassocieerd met SARS-CoV-2-infectie. De associatie kan het gevolg zijn van directe interactie van de bacterie met het virus of indirect door effecten op de gastheer, wat suggereert dat er misschien een rol is weggelegd voor synergie tussen bacteriën en virussen bij de overdracht van COVID-19-ziekte.
medRxiv publiceert voorlopige wetenschappelijke rapporten die niet peer-reviewed zijn en, daarom, mag niet als definitief worden beschouwd, begeleiden klinische praktijk/gezondheidsgerelateerd gedrag, of behandeld als gevestigde informatie.
Aanwezigheid van bepaalde darmbacteriën bij moeders kan baby's beschermen tegen voedselallergieën
Wees niet bang voor de colonoscopie
Gedomesticeerde honden zullen waarschijnlijk SARS-CoV-2 niet overbrengen,
Nieuwe tool om het darmmicrobioom te ontcijferen
De eerste bevindingen van het Human Microbiome Project leidden tot 'honderden vervolgonderzoeken'
Schimmels en bacteriën in de darm kunnen evenzeer van invloed zijn op de menselijke gezondheid als op de ernst van de ziekte
Het vaginale microbioom kan de werkzaamheid van hiv-preventietherapie beïnvloeden
Een nieuwe studie uitgevoerd door Dr. Nichole Klatt van de Universiteit van Minnesota, en collegas, heeft aangetoond dat vaginale microbiële gemeenschappen verband houden met een verhoogd risico op hi
Wetenschappelijk symposium op LABVOLUTION richt zich op kernthema's in de levenswetenschappen
Het Wetenschappelijk Symposium op LABVOLUTION zal zich richten op belangrijke kwesties in de levenswetenschappen. Overeenkomstig, een hoge bezoekersvraag wordt verwacht. Het Scientific Sy
Studie koppelt consumptie van gefermenteerde groenten aan lage COVID-19-sterfte
Een intrigerende nieuwe studie door onderzoekers in Europa suggereert dat de sterftecijfers voor coronavirusziekte 2019 (COVID-19) waarschijnlijk lager zullen zijn in landen waar het dieet rijk is aan