Fuerschung verbënnt SARS-CoV-2 Prävalenz,

Spidoloberflächen a Patientemikrobiome D'Fuerscher hunn eng méi héich bakteriell Diversitéit an de SARS-CoV-2 Patientesäll an Uewerflächen am Raum fonnt, suggeréiert datt bakteriell Diversitéit eng Roll bei der Virusiwwerdroung spille kann.

De schwéiere akuten Atmungssyndrom Coronavirus 2 (SARS-CoV-2), den causative Agent vun der COVID-19 Pandemie, verbreet sech haaptsächlech duerch Loftiwwerdroung, entweder an Atmungsdrëpsen oder Aerosolen. Fecal Iwwerdroung ass eng méi méiglech Manéier duerch déi de Virus sech verbreet.

Eng aner Verbreedungsmethod ass wann d'Leit Virus-enthaltend Tropfen upaken, déi op verschidde Surfacen falen wéi Dëscher, Türknäpper, a Konter. SARS-CoV-2 gouf op ville Surfacen festgestallt, inklusiv Plastik, Kartong, Stol, a Metaller.

Bakteriell Zesummesetzung ass viraussiichtlech vum SARS-CoV-2 Status an Nares, Stir, Hocker a bannenzeg Buedemproben. D'Prognoseperformance vu Random Forest Klassifizéierer um SARS-CoV-2 Status fir all Probe-Typ gouf mat AUROC (A) an AUPRC (B) fir Nares (n =76) bewäert, Stir (n =79), Hocker (n =44), a bannenzege Buedem (n =107), an enger 100-facher Kräiz-Validatioun Approche (kuckt Methoden). (C) EMPress Plot vun den 100 Feature am meeschte viraussiichtlech vum SARS-CoV-2 Status an Nares, Stir, Hocker a bannenzeg Buedemproben, wou en eenzegen ASV mat 100% Ausriichtung op Rothia dentocariosa iwwer all Probezorten identifizéiert gouf. Top 100 zoufälleg Bëschwichtegkeet Ranks a GreenGenes Taxonomie vun Nares, Stir, Hocker, a bannenzeg Buedemproben sinn am S2 verfügbar. (D) Undeel u Proben, déi déi héich viraussiichtlech Rothia dentocariosa ASV a SARS-CoV-2 positiv an negativ Proben aus der aktueller Studie enthalen, a vu (30) (ICU 2016 virum 263 COVID19)

De Risiko fir de SARS-CoV-2 Virus opzehuelen ass méi grouss dobannen wéi dobaussen, besonnesch a schlecht gelëfter Beräicher. En Bannenmikrobiom kann eenzegaarteg sinn ofhängeg vun der Ëmwelt, meeschtens dominéiert vu mënschlech vergiessene Mikroben.

D'Mikroben si meeschtens Bakterien, awer Indoor Beräicher kënnen och Virussen hunn wa krank Leit präsent sinn. D'Interaktioun vu Virus a Bakterien ass bekannt a studéiert, zum Beispill, bei Déieren, d'Interaktioun tëscht Darmbakterien an Darmvirussen. Gutt Bakterien kënnen d'Gastrointestinal Virusinfektioun beaflossen andeems d'Thermostabilitéit an d'Ëmweltstabilitéit vu Virussen verbessert gëtt. Virus-Bakterien Interaktioune goufen och am ieweschten Atmungstrakt beobachtet. Dofir, et ass méiglech datt esou Interaktiounen och an Indoorraim präsent sinn.

Patient (n =16) Demographie (A), Antibiotike -Intake (B), Komorbiditéiten (C).

Mikrobiom a SARS-CoV-2 Patientesäll

Fuerscher vun der University of California, San Diego, IBM, TJ Watson Research Center an IBM-Almaden exploréiert ob d'Mikroben, déi an engem Indoor Ëmfeld präsent sinn, d'SARS-CoV-2 Infektioun beaflosse kënnen. Si hunn hir Resultater gemellt an engem Pabeier publizéiert op der medRxiv * Virdruck Server.

D'Auteuren hunn Täscheproblemer vu Patienten a Gesondheetsariichter am UCSD Medical Center kritt. Si hunn d'Haut geschloen, Atmungstrakt, Hocker, a verschidde Surfacen mat deenen d'Patienten an d'Gesondheetsariichter a Kontakt komm sinn fir 972 Proben vu Leit a 734 Proben vun de Spidoloberflächen ze sammelen.

Vun den Uewerflächenproben, ongeféier 13% ware positiv fir SARS-CoV-2. Floors bei engem Patientbett haten am meeschte Virus. E puer Virus gouf och bei Patienten fonnt, déi negativ fir de Virus getest hunn an an Zëmmer gebotzt nodeems se vun engem positiven Patient besat waren.

Benotzt vum 16S rRNA Test, si identifizéieren déi verschidde Mikroben an de Proben. Si hu verschidde Cluster vu Mikroben um Buedem fonnt, Hocker, an Nostril/Stir Proben. Surfaces dacks beréiert vun de Gesondheetsariichter haten Mikrobiome ähnlech wéi hir Mikrobiome, an déi vu Patienten beréiert méi haten Mikrobiome ähnlech wéi d'Patienten.

Déi duerchschnëttlech Aart Diversitéit war vill méi héich an den Uewerflächenproben, besonnesch de Buedem, wéi a Proben vu Leit, mat der Diversitéit méi a SARS-CoV-2 positive Proben. Analyse vun de Mikroben, déi a positiven Proben präsent sinn, d'Auteuren fonnt Clostridiales eng Grupp ze sinn, déi an engem groussen Undeel un den Hockerproben präsent ass, ähnlech wéi déi, déi an Ofwaasserstudien fonnt goufen. Actinomyces, Anaerococcus, Dialekter, Gemella, an Schaalia goufen an der Stir an an der Nase gesinn.

Si hunn fonnt Rothia dentocariosa allgemeng op der Stir ze sinn, Nues, Hocker, a Buedemproben a war méi verbreed an de SARS-CoV-2 positive Proben. Rothia ass normalerweis net an de Spidolsproben präsent, hunn d'Auteuren fonnt, nodeems Dir eng vireg Spidolsmikrobiomstudie vergläicht, a war spezifesch fir SARS-CoV-2.

Ili 'raimlech Kartéierung vum Standard Spidol (Net-ICU) Raum an der Intensivfleeg Eenheet (ICU) Raum. Heatmap weist de Prozentsaz vun de Proben, déi op all Site gesammelt goufen, positiv op fir d'SARS CoV-2.

Associatioun tëscht SARS-CoV-2 an Indoor Bakterien

Och wann de SARS-CoV-2 Virus am Indoor Ëmfeld a Patientesäll festgestallt gouf, et ass onbekannt ob d'Virdeeler, déi festgestallt goufen, liewensfäeg waren. Wéinst den héije Ct Wäerter vun de meeschte Proben a Mangel un Infektioun bei de Gesondheetsariichter, déi sech ëm d'Patienten këmmeren, d'Auteuren schléissen datt positiv Uewerflächen onwahrscheinlech Quelle vun enger viraler Infektioun am Spidolsëmfeld waren studéiert wa passenden perséinleche Schutz benotzt gouf. Wéi och ëmmer, effektiv Reinigungspraxis sollt erhale bleiwen fir routinesch propper Flächen ze botzen fir d'Chance vun der Iwwerdroung ze reduzéieren.

D'Präsenz vun Rothia gouf a fréiere Studien iwwer SARS-CoV-2 gesinn, suggeréiert eng staark Associatioun mam Virus, och wann de Mechanismus net kloer ass. Rothia Arten goufen am mënschleche mëndlechen a gastrointestinalen Mikrobiom gesi a suggeréiert eng erhéicht mëndlech-fecal Iwwerdroung, eng Charakteristik vum COVID-19. Rothia gouf och méi héich gesinn bei COVID-19 Patienten mat kardiovaskulärer Krankheet, awer et gouf och bei kardiovaskuläre Patienten ouni COVID-19 observéiert. Méi Studien si gebraucht fir dës Associatioun ze verstoen a wa se a Methode kënne benotzt gi fir d'SARS-CoV-2 Iwwerdroung ze reduzéieren.

Ënnert all de Proben, Stir, Nues, Hocker, d'Bakterie Rothia dentocariosa war héich viraussiichtlech a verbonne mat SARS-CoV-2 Infektioun. D'Associatioun kéint e Resultat sinn vun enger direkter Interaktioun vun de Bakterien mam Virus oder indirekt duerch Effekter op den Host, suggeréiert datt et vläicht eng Roll vu Bakterien-Virus Synergie bei der COVID-19 Krankheet Iwwerdroung ass.

*Wichteg Notiz

medRxiv verëffentlecht virleefeg wëssenschaftlech Berichter déi net peer-iwwerschafft sinn an, dofir, soll net als schlussendlech ugesi ginn, guidéiert d'klinesch Praxis/gesondheetlech Verhalen, oder als etabléiert Informatioun behandelt.

• Sexsteroiden kënnen eng Schutzroll am COVID-19 spillen,
• Antimikrobiell fonnt a Seife verschlechtert d'Fettleberkrankheet bei Mais