Tyrimai sieja SARS-CoV-2 paplitimą,

ligoninės paviršiai ir paciento mikrobiomos Tyrėjai nustatė didesnę bakterijų įvairovę SARS-CoV-2 pacientų kambariuose ir kambario paviršiuose, rodo, kad bakterijų įvairovė gali turėti įtakos viruso perdavimui.

Sunkus ūminis kvėpavimo sindromas koronavirusas 2 (SARS-CoV-2), COVID-19 pandemijos sukėlėjas, plinta daugiausia per orą, kvėpavimo lašeliuose arba aerozoliuose. Išmatų perdavimas yra dar vienas galimas viruso plitimo būdas.

Kitas plitimo būdas yra tada, kai žmonės liečia viruso turinčius lašelius, kurie patenka ant įvairių paviršių, pvz. durų rankenos, ir skaitiklius. SARS-CoV-2 buvo aptikta ant įvairių paviršių, įskaitant plastiką, kartonas, plienas, ir metalai.

Bakterijų sudėtis prognozuoja SARS-CoV-2 būklę nares, kaktos, išmatų ir grindų grindų mėginiai. Atsitiktinių miškų klasifikatorių prognozės pagal SARS-CoV-2 būklę kiekvienam mėginio tipui buvo įvertintos naudojant AUROC (A) ir AUPRC (B) narams (n =76), kaktos (n =79), išmatos (n =44), ir vidinis aukštas (n =107), taikant 100 kartų kryžminio patvirtinimo metodą (žr. metodus). (C) 100 funkcijų, labiausiai prognozuojančių SARS-CoV-2 būseną nares, EMPress grafikas, kaktos, išmatų ir grindų grindų mėginiai, kur buvo nustatytas vienas ASV, 100% suderintas su Rothia dentocariosa visų tipų mėginiuose. Top 100 atsitiktinių miškų svarbos reitingų ir „GreenGenes“ taksonomija iš nares, kaktos, išmatos, ir vidaus grindų pavyzdžiai yra S2. D) mėginių, kuriuose yra labai nuspėjama Rothia dentocariosa ASV, dalis dabartinio tyrimo SARS-CoV-2 teigiamuose ir neigiamuose mėginiuose, ir nuo (30) (ICU 2016 pre263 COVID19)

Pavojus užsikrėsti SARS-CoV-2 virusu yra didesnis patalpose nei lauke, ypač blogai vėdinamose vietose. Vidinis mikrobiomas gali būti unikalus, priklausomai nuo aplinkos, daugiausia dominuoja žmonių išsklaidyti mikrobai.

Paprastai mikrobai yra bakterijos, tačiau patalpose taip pat gali būti virusų, kai yra sergančių žmonių. Buvo žinoma ir ištirta virusų ir bakterijų sąveika, pavyzdžiui, gyvūnuose, žarnyno bakterijų ir žarnyno virusų sąveika. Žarnyno bakterijos gali paveikti virškinamojo trakto viruso užkrečiamumą, pagerindamos virusų termostabilumą ir aplinkos stabilumą. Virusų ir bakterijų sąveika taip pat pastebėta viršutiniuose kvėpavimo takuose. Vadinasi, gali būti, kad tokia sąveika yra net patalpose.

Paciento (n =16) demografiniai rodikliai (A), antibiotikų vartojimas (B), gretutinės ligos (C).

Mikrobiomas SARS-CoV-2 pacientų kambariuose

Kalifornijos universiteto mokslininkai, San Diego, IBM, T. J. Watsono tyrimų centras ir „IBM-Almaden“ ištyrė, ar patalpoje esantys mikrobai gali paveikti SARS-CoV-2 infekciją. Jie pranešė apie savo rezultatus straipsnyje, paskelbtame medRxiv * išankstinio spausdinimo serveris.

Autoriai iš UCSD medicinos centro pacientų ir sveikatos priežiūros darbuotojų gavo tamponų mėginius. Jie nušluostė odą, kvėpavimo takus, išmatos, ir įvairūs paviršiai, su kuriais susidūrė pacientai ir sveikatos priežiūros darbuotojai, norėdami surinkti 972 žmonių mėginius ir 734 ligoninių paviršių pavyzdžius.

Iš paviršiaus pavyzdžių, apie 13% buvo teigiami dėl SARS-CoV-2. Grindys šalia paciento lovos turėjo daugiausiai virusų. Kai kurie virusai taip pat buvo rasti pacientams, kurių viruso testas buvo neigiamas, ir patalpose, išvalytose po to, kai jas užėmė teigiamas pacientas.

Naudojant 16S rRNR testą, jie mėginiuose nustatė skirtingus mikrobus. Jie rado skirtingas mikrobų grupes ant grindų, išmatos, ir šnervės/kaktos mėginiai. Paviršiai, kuriuos dažnai liečia sveikatos priežiūros darbuotojai, turėjo mikrobiomas, panašias į jų mikrobiomas, o tie, kuriuos palietė pacientai, turėjo mikrobiomas, panašias į pacientus.

Vidutinė rūšių įvairovė paviršiaus mėginiuose buvo daug didesnė, ypač grindys, nei žmonių mėginiuose, SARS-CoV-2 teigiamų mėginių įvairovė yra didesnė. Analizuojant teigiamuose mėginiuose esančius mikrobus, rado autoriai Clostridiales būti išmatų mėginiuose esanti grupė, panaši į tą, kuri nustatyta atliekant nuotekų tyrimus. Actinomyces, Anaerococcus, Dialistas, Gemella, ir Schaalia buvo matyti kaktos ir šnervės mėginiuose.

Jie rado Rothia dentocariosa būti įprasta ant kaktos, šnervė, išmatos, ir grindų mėginiai ir buvo labiau paplitęs su SARS-CoV-2 teigiamais mėginiais. Rothia paprastai nėra ligoninės mėginiuose, rado autorius, palyginus ankstesnį ligoninės mikrobiomos tyrimą, ir buvo būdingas SARS-CoV-2.

Ili standartinio ligoninės (ne ICU) ir intensyviosios terapijos skyriaus (ICU) kambario erdvinis žemėlapis. „Heatmap“ vaizduoja kiekvienoje vietoje surinktų mėginių, kurie buvo teigiami SARS CoV-2, procentą.

Asociacija tarp SARS-CoV-2 ir patalpų bakterijų

Nors SARS-CoV-2 virusas buvo aptiktas patalpų aplinkoje pacientų kambariuose, nežinoma, ar nustatyti virusai buvo gyvybingi. Kadangi daugumos mėginių Ct vertės yra didelės ir ligonius prižiūrinčių sveikatos priežiūros darbuotojų nėra infekcijos, autoriai daro išvadą, kad teigiami paviršiai buvo mažai tikėtini virusinės infekcijos šaltiniai tirtose ligoninėse, kai buvo naudojama tinkama asmens apsauga. Tačiau, turi būti laikomasi veiksmingų valymo būdų, kad būtų reguliariai valomi paviršiai, kad sumažėtų perdavimo tikimybė.

Buvimas Rothia buvo pastebėta ankstesniuose SARS-CoV-2 tyrimuose, rodo stiprų ryšį su virusu, nors mechanizmas nėra aiškus. Rothia rūšys buvo pastebėtos žmogaus burnos ir virškinimo trakto mikrobiome ir rodo didesnį peroralinį išmatų perdavimą, būdinga COVID-19. Rothia taip pat buvo pastebėta didesnė COVID-19 pacientų, sergančių širdies ir kraujagyslių ligomis, tačiau tai taip pat pastebėta širdies ir kraujagyslių ligomis sergantiems pacientams, kuriems nėra COVID-19. Reikia daugiau tyrimų, kad suprastume šią asociaciją ir ar ji gali būti naudojama SARS-CoV-2 perdavimo mažinimo metodams.

Tarp visų pavyzdžių kaktos, šnerves, išmatos, bakterija Rothia dentocariosa buvo labai nuspėjama ir susijusi su SARS-CoV-2 infekcija. Asociacija gali atsirasti dėl tiesioginės bakterijų sąveikos su virusu arba netiesiogiai dėl poveikio šeimininkui, tai rodo, kad galbūt perduodamas COVID-19 liga bakterijų ir virusų sinergija.

*Svarbus pastebėjimas

medRxiv skelbia preliminarias mokslines ataskaitas, kurios nėra recenzuojamos ir todėl, neturėtų būti laikomas galutiniu, vadovauti klinikinei praktikai/su sveikata susijusiam elgesiui, arba traktuojama kaip nustatyta informacija.

• Lytiniai steroidai gali atlikti apsauginį vaidmenį sergant COVID-19,
• Antimikrobinės medžiagos, esančios muiluose, pablogina pelių riebalinę kepenų ligą