Súlyos akut légúti szindróma 2-es koronavírus (SARS-CoV-2), a COVID-19 világjárvány kórokozója, főleg légi úton terjed, légzőcseppekben vagy aeroszolokban. A széklet továbbítása a vírus terjedésének további lehetséges útja.
Egy másik terjedési módszer az, amikor az emberek megérintenek vírusokat tartalmazó cseppeket, amelyek különböző felületekre, például asztalokra esnek, kilincsek, és számlálók. A SARS-CoV-2-t számos felületen észlelték, beleértve a műanyagot, karton, acél, és fémek.
A baktériumok összetétele előre jelzi a SARS-CoV-2 állapotát a körmökben, homlok, széklet és belső padlóminták. A véletlenszerű erdei osztályozók előrejelzési teljesítményét a SARS-CoV-2 állapotra vonatkozóan minden mintatípus esetében az AUROC (A) és az AUPRC (B) alkalmazásával értékelték ki a csülök esetében (n =76), homlok (n =79), széklet (n =44), és a belső padló (n =107), 100-szoros kereszt-érvényesítési megközelítésben (lásd módszerek). (C) A SARS-CoV-2 állapotot leginkább előrejelző 100 funkció EMPS-ábrája a körmökben, homlok, széklet és a padló belső mintái, ahol egyetlen ASV -t azonosítottak 100% -ban a Rothia dentocariosa -hoz igazodva minden mintatípusban. A legjobb 100 véletlenszerű erdei fontossági rang és GreenGenes rendszertan a naresből, homlok, szék, és a belső padlóminták S2 -ben kaphatók. (D) A nagyon prediktív Rothia dentocariosa ASV-t tartalmazó minták aránya a jelenlegi vizsgálat SARS-CoV-2 pozitív és negatív mintáiban, és (30) -tól (ICU 2016 pre263 COVID19)A SARS-CoV-2 vírus fertőzésének kockázata nagyobb beltéren, mint a szabadban, különösen rosszul szellőző helyeken. A beltéri mikrobióma egyedi lehet a környezettől függően, többnyire emberhámló mikrobák uralják.
A mikrobák általában baktériumok, de a beltéri területeken is lehetnek vírusok, ha betegek vannak jelen. A vírus és a baktérium kölcsönhatását ismerték és tanulmányozták, például, az állatokban, a bélbaktériumok és a bélvírusok kölcsönhatása. A bélbaktériumok befolyásolhatják a gasztrointesztinális vírus fertőzőképességét azáltal, hogy javítják a vírusok hőstabilitását és környezeti stabilitását. Vírus-baktérium kölcsönhatásokat is megfigyeltek a felső légutakban. Ennélfogva, lehetséges, hogy ilyen kölcsönhatások még beltéri terekben is jelen vannak.
A betegek (n =16) demográfiai adatai (A), antibiotikum bevitel (B), társbetegségek (C).A Kaliforniai Egyetem kutatói, San Diego, IBM, A T. J. Watson Research Center és az IBM-Almaden azt vizsgálta, hogy a beltéri környezetben található mikrobák befolyásolhatják-e a SARS-CoV-2 fertőzést. Eredményeikről a folyóiratban megjelent cikkben számoltak be medRxiv * preprint szerver.
A szerzők tamponmintákat szereztek az UCSD Orvosi Központ betegeitől és egészségügyi dolgozóitól. Megtörölték a bőrt, légutak, szék, és különböző felületeket érintettek a betegek és az egészségügyi dolgozók, hogy 972 mintát gyűjtsenek emberekből és 734 mintát a kórházi felületekről.
A felszíni minták közül körülbelül 13% -uk pozitív volt a SARS-CoV-2-re. A beteg ágya közelében lévő padlókon volt a legtöbb vírus. Néhány vírust azoknál a betegeknél is találtak, akiknél a vírus negatív volt, és azokban a helyiségekben, amelyeket pozitív beteg elfoglalása után takarítottak ki.
A 16S rRNS teszt segítségével azonosították a különböző mikrobákat a mintákban. Különféle mikrobák halmazát találták a padlón, szék, és orrlyuk/homlok minták. Az egészségügyi dolgozók által gyakran megérintett felületek mikrobiomái hasonlóak a mikrobiomokhoz, és azok, akiket a betegek jobban érintettek, a betegekhez hasonló mikrobiomákkal rendelkeztek.
A fajok átlagos diverzitása sokkal nagyobb volt a felszíni mintákban, főleg a padló, mint az emberek mintáiban, a SARS-CoV-2 pozitív mintákban a változatosság nagyobb. A pozitív mintákban található mikrobák elemzése, találták a szerzők Clostridiales a székletmintákban nagy arányban jelen lévő csoport, hasonló ahhoz, amit a szennyvíztanulmányokban találtak. Actinomyces, Anaerococcus, Tárcsázó, Gemella, és Schaalia a homlok- és orrlyukmintákban voltak láthatók.
Megtalálták Rothia dentocariosa gyakori a homlokon, orrlyuk, szék, és padlóminták, és gyakoribb volt a SARS-CoV-2 pozitív mintákban. Rothia általában nincs jelen a kórházi mintákban, megtalálta a szerzőket, egy korábbi kórházi mikrobiológiai vizsgálat összehasonlítása után, és specifikus volt a SARS-CoV-2-re.
Ili térbeli térképezése a standard kórházi (nem ICU) és intenzív osztályon (ICU). A Heatmap az egyes helyeken gyűjtött minták azon százalékát ábrázolja, amelyek pozitívak voltak a SARS CoV-2-re.Bár a SARS-CoV-2 vírust a betegszobák beltéri környezetében észlelték, nem ismert, hogy a kimutatott vírusok életképesek -e. A legtöbb minta magas Ct értékei és a betegeket gondozó egészségügyi dolgozók fertőzéshiánya miatt, a szerzők arra a következtetésre jutnak, hogy a pozitív felületek nem voltak valószínű vírusfertőzések forrásai a vizsgált kórházi környezetben, amikor megfelelő személyi védelmet használtak. Azonban, hatékony tisztítási gyakorlatokat kell tartani a felületek rutinszerű tisztításához, hogy csökkentsék az átvitel esélyét.
Jelenléte Rothia a SARS-CoV-2-vel kapcsolatos korábbi vizsgálatokban erős összefüggést sugall a vírussal, bár a mechanizmus nem világos. Rothia fajokat észleltek az emberi orális és gasztrointesztinális mikrobiomban, és az orális-széklet átvitel fokozódására utalnak, a COVID-19 jellemzője. Rothia a szív- és érrendszeri betegségekben szenvedő COVID-19 betegeknél is magasabbnak bizonyult, de megfigyelték a COVID-19 nélküli kardiovaszkuláris betegeknél is. További vizsgálatokra van szükség ahhoz, hogy megértsük ezt az összefüggést, és ha fel lehet használni a SARS-CoV-2 átvitel csökkentésére szolgáló módszerekben.
Az összes minta között homlok, orrlyukak, szék, a baktérium Rothia dentocariosa erősen előre jelezte és összefüggésben volt a SARS-CoV-2 fertőzéssel. Az asszociáció lehet a baktériumok és a vírus közvetlen kölcsönhatásának eredménye, vagy közvetve a gazdaszervezetre gyakorolt hatás révén, ami arra utal, hogy a baktérium-vírus szinergiának talán szerepe van a COVID-19 betegség átvitelében.
medRxiv előzetes tudományos jelentéseket tesz közzé, amelyeket nem vizsgálnak felül, és ezért, nem tekinthető döntőnek, irányítja a klinikai gyakorlatot/az egészséggel kapcsolatos viselkedést, vagy megállapított információként kezelik.