Det alvorlige akutte respiratoriske syndrom coronavirus 2 (SARS-CoV-2), årsagen til COVID-19-pandemien, spredes hovedsageligt ved luftbåren transmission, enten i åndedrætsdråber eller aerosoler. Fækal overførsel er endnu en mulig vej, hvorpå virussen spredes.
En anden spredningsmetode er, når folk rører ved virusholdige dråber, der falder på forskellige overflader som borde, dørhåndtag, og tællere. SARS-CoV-2 er blevet påvist på en række forskellige overflader, herunder plast, pap, stål, og metaller.
Bakteriesammensætning er forudsigende for SARS-CoV-2-status i nares, pande, afføring og indvendige gulvprøver. Forudsigelsespræstationen for Random Forest-klassifikatorer på SARS-CoV-2-status for hver prøvetype blev vurderet ved hjælp af AUROC (A) og AUPRC (B) for nares (n =76), pande (n =79), skammel (n =44), og indvendigt gulv (n =107), i en 100-fold krydsvalideringsmetode (se metoder). (C) EMPress-plot af de 100 funktioner, der er mest forudsigende for SARS-CoV-2-status i nares, pande, afføring og indvendige gulvprøver, hvor en enkelt ASV med 100% tilpasning til Rothia dentocariosa blev identificeret på tværs af alle prøvetyper. Top 100 vilkårlige skovbetydningsranger og GreenGenes -taksonomi fra nares, pande, skammel, og indvendige gulvprøver fås i S2. (D) Andel af prøver, der indeholder den meget forudsigelige Rothia dentocariosa ASV i SARS-CoV-2 positive og negative prøver fra den aktuelle undersøgelse, og fra (30) (ICU 2016 før 263 COVID19) Risikoen for at pådrage sig SARS-CoV-2-virussen er større indendørs end udendørs, især i dårligt ventilerede områder. Et indendørs mikrobiom kan være unikt afhængigt af miljøet, domineres for det meste af menneskeskabte mikrober.
Mikroberne er generelt bakterier, men indendørs områder kan også have vira, når syge mennesker er til stede. Interaktionen mellem virus og bakterier har været kendt og undersøgt, for eksempel, hos dyr, interaktionen mellem tarmbakterier og tarmvira. Tarmbakterier kan påvirke gastrointestinal virusinfektion ved at forbedre termostabilitet og miljøstabilitet af vira. Virus-bakterie-interaktioner er også blevet observeret i de øvre luftveje. Derfor, det er muligt, at sådanne interaktioner er til stede selv i indendørs rum.
Patient (n =16) demografi (A), indtag af antibiotika (B), komorbiditeter (C). Forskere fra University of California, San Diego, IBM, T. J. Watson Research Center og IBM-Almaden undersøgte, om mikroberne i et indendørs miljø kan påvirke SARS-CoV-2-infektion. De rapporterede deres resultater i et papir offentliggjort på medRxiv * fortryksserver.
Forfatterne indhentede podeprøver fra patienter og sundhedspersonale ved UCSD Medical Center. De tørrede huden, luftrør, skammel, og forskellige overflader, patienterne og sundhedspersonale kom i kontakt med for at indsamle 972 prøver fra mennesker og 734 prøver af hospitalsoverflader.
Af overfladeprøverne omkring 13% var positive for SARS-CoV-2. Gulve nær en patients seng havde mest virus. Der blev også fundet en vis virus hos patienter, der havde testet negativt for virussen og i værelser rengjort efter at have været optaget af en positiv patient.
Ved hjælp af 16S rRNA -testen, de identificerede de forskellige mikrober i prøverne. De fandt forskellige klynger af mikrober på gulvet, skammel, og næsebor/pandeprøver. Overflader, der ofte berøres af sundhedspersonale, havde mikrobiomer, der lignede deres mikrobiomer, og dem, der blev berørt af patienter mere, havde mikrobiomer, der lignede patienterne.
Den gennemsnitlige artsdiversitet var meget højere i overfladeprøverne, især gulvet, end i prøver fra mennesker, med mangfoldigheden mere i SARS-CoV-2 positive prøver. Analyse af mikroberne i positive prøver, fandt forfatterne Clostridiales at være en gruppe til stede i stor andel afføringsprøver, ligner den, der findes i spildevandsundersøgelser. Actinomyces, Anaerococcus, Dialister, Ædelsten, og Schaalia blev set i pande- og næseborprøver.
De fandt Rothia dentocariosa at være almindelig på panden, næsebor, skammel, og gulvprøver og var mere udbredt i SARS-CoV-2 positive prøver. Rothia er generelt ikke til stede i hospitalsprøver, fandt forfatterne, efter at have sammenlignet en tidligere hospitalsmikrobiomundersøgelse, og var specifik for SARS-CoV-2.
Ilis rumlige kortlægning af standard hospital (ikke-ICU) værelse og intensiv afdeling (ICU) værelse. Heatmap viser procentdelen af prøver indsamlet på hvert sted, der var positive for SARS CoV-2. Selvom SARS-CoV-2-virus blev påvist i indendørsmiljøet i patientrum, det er ukendt, om de påviste vira var levedygtige. På grund af de høje Ct -værdier for de fleste prøver og mangel på infektion hos sundhedspersonale, der tager sig af patienterne, forfatterne konkluderer, at positive overflader var usandsynlige kilder til viral infektion i hospitalsmiljøet undersøgt, når passende personlig beskyttelse blev brugt. Imidlertid, effektive rengøringsmetoder bør opretholdes for rutinemæssigt at rengøre overflader for at reducere chancen for transmission.
Tilstedeværelsen af Rothia er set i tidligere undersøgelser af SARS-CoV-2, tyder på en stærk tilknytning til virussen, selvom mekanismen ikke er klar. Rothia arter er blevet set i det humane orale og gastrointestinale mikrobiom og tyder på øget oral-fækal transmission, karakteristisk for COVID-19. Rothia har også vist sig at være højere hos COVID-19-patienter med hjerte-kar-sygdomme, men det er også blevet observeret hos hjerte-kar-patienter uden COVID-19. Flere undersøgelser er nødvendige for at forstå denne sammenhæng, og om den kan bruges i metoder til at reducere SARS-CoV-2-transmission.
Blandt alle prøverne er pande, næsebor, skammel, bakterien Rothia dentocariosa var stærkt forudsigelig for og forbundet med SARS-CoV-2 infektion. Foreningen kan være et resultat af bakteriens direkte interaktion med virussen eller indirekte gennem virkninger på værten, hvilket tyder på, at der måske er en rolle for bakterie-virussynergi i overførsel af COVID-19 sygdom.
medRxiv udgiver foreløbige videnskabelige rapporter, der ikke er peer-reviewed og, derfor, ikke skal betragtes som afgørende, vejlede klinisk praksis/sundhedsrelateret adfærd, eller behandles som etablerede oplysninger.
Foranstaltninger til at forhindre SARS-CoV-2-transmission gennem spildevand i fattige regioner
Plantebaseret kost forbedrer hjertesundheden via tarmmikrobiomet
Perfectus Biomed udstiller på IPS -konference i Liverpool
Ny beregningsmodelleringsmetode forudsiger, hvordan tarmmikrober ændrer sig over tid
Nyopdagede store fager slører grænsen mellem liv og ikke-liv
Spiserørskræftrisiko kan reduceres med esomeprazol og lavdosis aspirin
Ulcerøs colitis og en manglende mikrobe i tarmen
Ulcerøs colitis er en alvorligt invaliderende inflammatorisk sygdom i tarmen, der fører til lammende symptomer, der kan påvirke livskvaliteten alvorligt. Forskere fra Stanford University School of Med
Biologisk terapi kan reducere risikoen for alvorlig COVID-19
En nylig observationsundersøgelse foretaget af spanske forskere, i øjeblikket tilgængelig på medRxiv* fortryksserver, tyder på, at patienter med immunmedierede sygdomme, der modtager biologisk terap
En vegansk kost kan øge tarmmikrober, der hjælper med vægttab
Skift til en vegansk kost kan hjælpe folk med at tabe næsten et kilo i vægt hver uge og reducere deres risiko for diabetes markant, ifølge en undersøgelse, der for nylig blev præsenteret på dette års