A cöliákia egy nem gyakori betegség, amelyben az Ön immunrendszere megtámadja a vékonybelet bélelő sejteket. A reakciót a gliadin váltja ki, a glutén egyik fehérje, amely a búzában és néhány más gabonában található. Az immunreakció gyulladást és a bélnyálkahártya sejtjeinek pusztulását eredményezi. A bélés pusztulása befolyásolja a bélés normális működését, különösen az élelmiszerek felszívódását, beleértve a makrotápanyagokat (zsír, fehérje és szénhidrát) és mikrotápanyagokat (vitaminok és ásványi anyagok). Így, bár a cöliákia néhány tünete a folyamatban lévő gyulladás és pusztulás eredménye lehet, a legtöbb tünet a felszívódási zavar eredménye. A cöliákia jelenlétét általában a tünetek alapján gyanítják, de a diagnózist a vérvizsgálat és a bélbiopszia kombinációja erősíti meg. Férfiaknál és nőknél egyaránt gyakori.
A zsír a leggyakrabban felszívódó makrotápanyag. A zsírfelszívódás csökkenése nagymértékben csökkenti a kalóriabevitelt (ahogy a fehérje és a szénhidrát felszívódási zavara is, bár kisebb mértékben), és ez súlycsökkenést okoz. A disztális bélben felszívódó zsírt a bélbaktériumok emésztik meg. A baktériumok a zsírt kisebb vegyületekre bontják le, amelyek folyadék szekrécióját okozzák a bélben, ami hasmenést okozhat. A cöliákia esetén fellépő hasi puffadás és/vagy gázképződés a szénhidrátok felszívódási zavarának és a bélbaktériumok által a szénhidrátokból történő gázképződésnek tudható be. Az étrendi fehérje felszívódási zavara fehérjehiányhoz vezet a szervezetben, ami izomsorvadáshoz és alacsony véralbuminszinthez (a vérben a legnagyobb mennyiségben előforduló fehérje) vezethet, ami a boka duzzanatához (ödémához) vezet.
A mikrotápanyagok hiányának tünetei a hiánytól függően nagyon eltérőek. A fontosabb hiányosságok közé tartozik a vashiány, amely vérszegénységhez és fáradtsághoz vezethet, valamint a K-vitamin hiánya, amely véralvadási rendellenességekhez és túlzott zúzódásokhoz vagy vérzésekhez vezethet. A kalcium, a magnézium, a B12-vitamin, a tiamin, a pantoténsav és az A-vitamin hiánya neurológiai tünetekhez, míg a kalcium és D-vitamin hiánya csontok legyengüléséhez és törésekhez vezethet.
A cöliákia számos más autoimmun betegséggel jár együtt, amelyek saját tüneteiket okozhatják. Ezek a betegségek közé tartozik a dermatitis herpetiformis, egyfajta bőrkiütés, 1-es típusú cukorbetegség és a pajzsmirigy gyulladása.