Polygen risknivå är inte bättre på att förutsäga psykosresultat än skriftliga rapporter,

undersökningsfynd Med hjälp av banbrytande datorprogram, forskare vid Icahn School of Medicine vid Mount Sinai gick igenom de genetiska och medicinska journalerna för mer än 8, 000 schizofrenipatienter. De fann att ett verktyg som vanligtvis används i forskning för att utvärdera en persons genetiska risk för en sjukdom, kallas en polygen riskpoäng, var inte bättre på att förutsäga utfallet av en patients sjukdom över tid än skriftliga rapporter. Resultaten väcker viktiga frågor om användningen av polygena riskpoäng i verkliga världen, kliniska situationer, och föreslår också att en läkares skriftliga rapport kan vara en outnyttjad källa till förutsägbar information.

"Att behandla schizofrenipatienter är en hjärtskärande upplevelse. En av de svåraste delarna med att ta hand om patienter är att försöka avgöra om varje patients tillstånd kommer att förvärras eller förbättras. Om vi ​​kunde göra det, då kan vi hjälpa till att lindra det lidande som patienterna och deras nära och kära upplever, "sa Alexander W. Charney, MD, Doktorsexamen, Biträdande professor vid institutionerna för psykiatri och genetik och genomvetenskap vid Icahn Mount Sinai och seniorförfattaren till studien publicerad i Naturmedicin . "Våra resultat visar att för de psykiska sjukdomar som är djupast karakteriserade på genetisk nivå, det nuvarande tillståndet inom genetisk forskning kan inte lösa detta problem ännu. "

Påverkar cirka 20 miljoner människor världen över, schizofreni är en livsförkortande psykisk störning som förändrar hur en person tänker, handlingar, och uppfattar verkligheten. Vanligtvis, symtomen uppträder i slutet av tonåren till början av trettiotalet och kan vara livet ut. Vissa patienter kan reagera bra på behandlingen, andra inte alls.

Även om det är en mycket ärftlig sjukdom, majoriteten av fallen kan inte kopplas till en enda gen. Istället, forskare har funnit att risken för schizofreni påverkas av en komplex kombination av normala genetiska varianter, ingen av dem på egen hand bidrar till stor risk men står tillsammans för många fall. För närvarande, nästan 300 sådana varianter har associerats med schizofreni.

Den polygena riskpoängen är en vanlig metod för att sammanfatta den genetiska komponenten i en persons risk för en sjukdom. Under det senaste decenniet har många stora studier har visat att riskpoängen för schizofrenipatienter är betydligt högre än för friska kontroller. Liknande resultat har setts i studier om andra sjukdomar som hypertoni och diabetes.

"Den polygena riskpoängen summerar i princip alla egenskaper som är förknippade med en komplex sjukdom. Ursprungligen var den utformad för att vara ett beskrivande verktyg. Mer nyligen har forskare har föreslagit att det kan vara ett effektivt verktyg för precisionsmedicin där en persons genetik används för att diagnostisera sjukdomar och förutsäga resultat, "sa Isotta Landi, Doktorsexamen, en postdoktor i Dr. Charneys laboratorium och huvudförfattaren till studien. "I den här studien ville vi noggrant testa om den polygena riskpoängen också kan vara ett prediktivt verktyg."

I början, forskarna jämförde de genetiska och medicinska journalerna för 762 schizofrenipatienter som lagrats i Mount Sinai Health Systems BioMe ™ BioBank -program. Specifikt, de testade om en patients polygena riskpoäng för schizofreni kunde förutsäga sex dåliga resultat för varje patient bättre än den information som härrör från de medicinska rapporter som skrivits av läkare.

Att göra detta, Dr Landi arbetade tillsammans med andra för att utveckla avancerade datorprogram som beräknar polygena riskpoäng från en patients genetiska data och använder bearbetningsverktyg för naturligt språk för att extrahera information från skriftliga rapporter.

De fann att två av resultaten-; aggressivt beteende och behovet av sjukhusvistelse-; var signifikant associerade med högre polygena riskpoäng. Dock, poängen var inte mer effektiva att förutsäga dessa resultat än den information som härrör från de skriftliga rapporterna, och att kombinera de två förändrade inte förutsägbarheten.

Uppföljningsexperiment stödde dessa resultat. Till exempel, forskarna såg ingen förändring i resultaten när de försökte förutsäga resultat endast hos personer med de högsta polygena riskpoängen.

Till sist, de såg samma trend när de analyserade genetiska och medicinska register över 7, 779 patienter lagrade i Genomic Psychiatry Cohort, ett stort National Institutes of Health-finansierat projekt. Ännu en gång, de polygena riskpoängen förbättrades inte med kliniska data för att förutsäga dåliga resultat.

Våra resultat tyder på att mer arbete behöver göras för att utnyttja den potential som genetik har för att förbättra behandlingen av schizofrenipatienter. Resultaten tyder också på att de detaljerade medicinska rapporter som läkare skriver kan innehålla mycket mer värdefull och förutsägbar information än vi ursprungligen förväntade oss. "

Dr Alexander W. Charney, MD, Doktorsexamen, Biträdande professor vid institutionerna för psykiatri och genetik och genomvetenskap vid Icahn Mount Sinai

• Studien pekar på ett helt nytt tillvägagångssätt för behandling av gallres atresi
• Enkel,