Razlika izražanje genov v mišje želodčnega fundusa primanjkuje vmesne celice Cajal

diferencialnega izražanja genov v mišje želodčnega fundusa primanjkuje vmesne celice Cajal
Abstract
Ozadje
mišičnih plasti mišje želodčnega fundusa nimajo vmesne celice Cajal na ravni myenteric pleteža le imajo intramuskularnih vmesnih celic in to tkivo ne generira električni počasi valove. Odsotnost intramuskularno intersticijskih celic v W /W
V
mutanti ponuja edinstveno priložnost za študij molekularne spremembe, ki so povezane z izgubo teh interkalacijski celic.
Metoda
gen izraz profil želodčnega fundusa divjega tipa in W /W
v
miši smo analizirali s mišje analize mikromrež prikazuje skupno 8734 elementov. Poizvedba geni iz analize mikromrež so bili potrjeni s semi-kvantitativno reakcijo reverzne transkripcije-polimerazo verige.
Rezultati
enaindvajset genov so različno izražena v W /W
V
divji tip in miši. Enajst prepisi imel 2,0-2,5-krat večje, mRNA izraz v W /W
V
želodčnega fundusa v primerjavi z tkiv divjega tipa. Deset prepisi imel 2.1-3.9 krat manjšo ekspresijo v W /W
V
mutantov v primerjavi z živalmi divjega tipa. Nobena od teh genov so kdaj bili vpleteni v katero koli funkcijo črevesne gibljivosti.
Sklepi
Te podatke predloži dokaze, da je več pomembnih genov bistveno spremenila v mišje fundusa z W /W
V
mutanti, ki nimajo intramuskularnih vmesne celice Cajal in imajo zmanjšano enterično motorja živčni.
ozadju
vrinjeni celice Cajal (ICC), so gastrointestinalne (GI) pacemaker celice in posredniki v enteralne motornega živčnega v prebavilih [1, 2 ]. ICC express KIT
/c-kit
in so odvisne od signalizacijo preko proteina gena izdelka, KIT, receptorja tirozin kinaze, ki je bistvenega pomena za razvoj in vzdrževanje fenotipa ICC [3]. Mutacije v belo-spotting
zemljišču (tj W /W
V
) rezultata zmanjšano izražanje KIT. Ta mutant živali razvijejo nekaj ICC na ravni myenteric pleteža (IC-MY) v tankem črevesu in manjšega števila ICC je povezan z izgubo aktivnostjo počasnih valov. Intramuskularna ICC (IC-IM), ki se nahajajo v želodcu, nižje požiralnika in pilorično mišice zapiralke so odsotni v W /W
V
mutirane živali [4]. Nižje število ICC so poročali tudi v več motenj GI gibljivosti, kot so kronične črevesne psevdo-obstrukcija [5, 6], infantilno hipertrofična piloricne stenoze [9/7] Hirschsprung boleznijo [10-12], počasi tranzitni zaprtje in nekatere oblike gastroparezo [13, 14].
povezava med motnjami gibljivosti in izgubo določenih populacij ICC kažejo, da lahko bolj popolno razumevanje molekularne in celične biologije omrežij ICC v prebavnem traktu pomaga pri razumevanju etiologije nekaterih GI motornih patologij. Namen te študije je bila značilna genske sekvence, ki so izražene v ICC želodca, ki lahko kodiranje pomembnih funkcionalnih elementov sistema GI spodbujevalnik /pogonsko nevrotransmisije. Sledili smo hipotezo, da bi takšni geni kažejo diferencialno izražanje v tanko črevo miši divjega tipa in W /W
V
miši [15, 16]. prej smo ugotovili petnajst znane in nove gene, ki so različno izražene v tanko črevo divjega tipa in W /W
V
miši, ki se razvijejo nekaj IC-MY z metodo izraz razlika genov [17, 18].
v tej študiji smo predpostavili, da lahko obstaja tudi razlika izražanje genov v želodčni fundusa m /m
v
miši, kjer so IC-IM izgubili. Naša gen mikromrež analiza uspešno identificirati 21 genov, ki so različno izražene v fundusa m /m
V
miši. Razlika v izražanje teh miših je bila potrjena s semi-kvantitativno reverzno transkripcijo-verižni reakciji s polimerazo (RT-PCR).
Metode
Živali in tkiv Priprava
Uporaba in zdravljenje poskusnih živali je odobril smernico urejajo odbor preizkusa živali na Univerzi v Yamanashi School of Medicine in na Univerzi v Nevadi School of Medicine. Šest odraslih moških WBB6F1 - + /+ miši (divji tip) in starost ujema šest odraslih moških WBB6F1-W /W
V
miši, ki tehtajo od 20 do 30 g, so bile kupljene iz Japonske SLC Inc (Šizuoka , Japonska). So bili anestezirali z etrom ali ogljikovim dioksidom inhalacijo in žrtvovali s cervikalno dislokacijo. Za analize genov, so bili želodci odstrani iz živali in sluznice s priloženim submucosa hitro oster raztelesiti iz tunike muscularis
. Tkiva smo nato zamrznemo v tekočem dušiku (-196 ° C). Tkiva smo hranili pri -80 ° C, dokler je merodajen izolacijo RNA [18].
RNA Priprava in Mikromrežni Data Analysis
Za analizo genske mikromrež, poli (A) + RNA smo izolirali iz vsakega vzorca tkiva z TRIzola ( life Technologies, Inc., Gaithersburg, MD, ZDA) in poli (A) + Izolacija Kit iz Celotna RNA (ISOGEN, Nippon gene, Tokio, Japonska). 18 pred začetkom analize mikromrež, razlika izražanje genov KIT
med želodca fundic tkiva miši divjega tipa in tiste W /W
v
mutant miši so bile potrjene z semi-kvantitativno RT-PCR (glej razdelek semi-kvantitativno RT-PCR
) (sl. 1A). Mikromreže hibridiziramo in preišče in slikovna analiza je bila izvedena kot prej [19, 20] je opisano. Na kratko so spremembe v izražanju genov ovrednotili z reverzno transkripcijo poli (A) + RNA v prisotnosti Cy3 in Cy5 fluorokromi čemur sledi hibridizacija z miško GEM 1 mikromrež žetonov (Incyte Genomics, Inc., Porter Drive Palo Alto, CA, ZDA). Da potrdi veljavnost testa so bili poskusi izvedemo v dvojniku. V 8734 cDNA smo jih uporabili predstavljajo 7854 edinstvene gene /UniGene skupin: 3205 so označeni in 4649 so brez oznak sekvence. dodeljena smo cut-off vrednostjo, z analizo variance, na mikromrežnem drsniku. Geni, katerih Cy3- in intenzivnost Cy5-signala je bila nižja od vrednosti cut-off so bili izključeni iz nadaljnje preiskave. Uravnotežena razlika izraz je bil določen za nadzor divjih miših v primerjavi z W /W
V
mutiranih miši. Vrednosti, ki so < -2,0 Ali > 2.0 v obeh dveh neodvisnih poskusov, so bile obravnavane pomembne in so bile izračunane povprečne vrednosti relativno razmerje fluorescence za vsak gen. Slika 1 A. Izražanje KIT
gen uporabo semi-kvantitativno RT-PCR, v želodcu fundic tkiv W /W
V divji tip in
mutant miši vzdržuje pod tešče
pogoji. GAPDH
vrednosti so bile izmerjene za kontrolo. B. predstavnik slika DNA mikromrež hibridizacije. Spremembe v izražanju genov, ki so bile predstavljene z razmerjem intenzitete fluorescence merjeno z uporabo Cy3 in Cy5 fluorokromi. Izraz profili so bili ocenjeni z reverzno transkripcijo poli (A) + RNA iz želodca fundic mišic iz w /w
V
miših divjega tipa in v prisotnosti Cy3 in Cy5 fluorescenčnih barvil za označevanje, ki mu sledi hibridizacija na miško GEM 1 mikromreže. Na sliki je produciral prekrivanje fluorescence sliko Cy5 (pseudo-obarvan zeleno, ki predstavlja nivo ekspresije RNA iz tunica muscularis
v W /W
V
fundusa) in fluorescence slika Cy3 (Pseu- rdeče barve, ki predstavlja RNA izraz iz tkiv divjega tipa). Polja so jih nasprotno z DAPI (modra). C. Potrditev zanesljivost podatkov mikromrež ga semi-kvantitativno RT-PCR. Reprezentativni primeri analizo RT-PCR, v fundic tkiv iz šestih W /W
V šestih divjega tipa in
mutant miši ohranjajo na podlagi sestradana pogoji. Izražanje UVK
gena znatno zmanjša fundusa m /m
V
miših v primerjavi s starostjo ujema divje miši tipa, medtem ko naj bi MCM7
gen pokazala povečanje izražanja v W /W
v
miši. D. Relativna izraz raven UVK
(UVK
/GAPDH
) in MCM7
(MCM7
/GAPDH
) v fundic tkivih od šestih divjega tipa in šest W /W
V
mutant miši. Podatki predstavljajo povprečje (± SD) šestih različnih eksperimentov RT-PCR z uporabo W
/W
V
očesnega ozadja RNA kot predloge šest divjega tipa ali.
Semi-kvantitativno RT-PCR
raven mRNA izražanja, ki so se zmanjšale ali povečale za > 2,0-krat ali več, so bili potrjeni s semi-kvantitativno RT-PCR iz fundusa z dne 6. vsake miši divjega tipa in w /w
V
miši. RT-PCR smo izvedli kot je bilo prej [18] opisano. Na kratko smo uporabili 2 mikrogramov alikvote celotne RNA, zdravljenih s DNazo (Roche Diagnostics, Basel, Švica) iz miši fundic tkiv sintetizirati single pramenov cDNA. Te cDNA smo uporabili kot predloge za PCR v toplotno ciklerja (PerkinElmer, Shelton, CT, USA), s pomočjo začetnih oligonukleotidov, navedenih v tabeli 1 ali KIT
(5'-ATG ACG TCA TGA AGA CTT GCT-3 'in 5' -CTA CCC TGG AAT AGG ATG CA-3 '), in GAPDH
specifičnih oligonukleotidov kompleti (5'-GACAACAGCCTCAAGATCATCA-3' in 5'-GGTCCACCACTGACACTGTG-3 '). Izražanje GAPDH
služil kot notranji nadzor. Primerji so bili pridobljeni iz različnih eksonov v enakem genu, ko je bila ustrezna miš genomsko zaporedje takrat na razpolago. Reakcije PCR bila optimizirana za število ciklov, da se zagotovi intenzivnosti izdelkov v linearni fazi amplification.Table 1 primerjem sklopov, ki se uporablja za semi-kvantitativno RT-PCR.
Gene Ime
pristopna št
Forward Primer
Proste Povratne temeljni premaz
Predvideni
AA185701
CGA AAG SCT TGA GGT TGA AG
TAG GAA AAC AGG CGT CAC TG
Predvideni
AA166336
GAA GAA AAG GCT GCA gat CG
CAA GAG GCA AAG AGC AAT CC
EST
AA021806
CAC GAA TTG CAG GAC Celotni dovoljeni ulov CT
ACC TGC ACT GTA GGC TGA GT
MCM7
Q61881
GCC CAC TGG ATT GTG AAG AT
AGG AGA CTG GTC CAC ACC AC
P160 ROCK2

U58513
AAG AAC CTG TCA AGC GTG GT
TCC AGG GTC ATC TGG AGT TC
EST
W18585
AGA CTT GGT GGC AGA GGA GA
GCA GCT CAT GAC AGA ACA CC
EST
AA403748
SCT AAA GCA ACC CAA SCT GA
TAG SCT TAT GGG ACC TGG TG
BST1 /BP3
Q64277
GAT TTC TTG AGC TGG TGT CG
AAA ACC CTC TCG TGG GAT AG
EST
AA024250
OAS ATA GAG CAA GGG ATG GA
CTG AGC CCA AAC OAS TAG AA
RBP2

Q08652
GAC GAA GGA CCA AAA TGG AA
CGG TGA AAT CCA GGT CGT AG
Predvideni
W46016
AGC AAC AAC AGC TGG Zakon TC
ACC TTC TGT TTG GTG CTG AG
BP1 /6C3
S30398
TAT CGG SCT CAT CTA ACC AG
ATC TTC AAG OAS CAC CTG AC
EST
AI552444
CAT GCG ATA CTG GAA CAT GA
TGA CTC CAA ATA GCC CTC AG
EST
AA108876
TGG AGC AAG Aga GGA AAG TG
CTA GAC CTG AGC TTG SCT TG
EST
AA049294
ACG TGG AGA AAG TTC TCG TG
GCA ATA GTG TCA CCG AAT CC
Predvideni
AA254777
GCC CTG gag TTG Aga CTG TA
TGA CAA GCT GCA OAS HA CC
RHAMM
AF031932 GCA GAA GGA GGA GCA GAG TG
GCA GTG ACG TCC CTC AGA CT
EST
AA002293
AAG TCT TTG TGT GGG CTG AG
AGG AAG CTT CGT CTC TCC AT
EST
AI595081
CAC OAS gat GTC TGC CTA CT
CCG AGA TCA TGT TCT TCA CC
UVK
D16333
GAA GAC CAA GAT GGA GCT GA
OAS AAA GAT TCC CAT GAA CG
EST
AA000304
TTC ATC TGC TGC TCC TTC TC
TTA oznako ACC TTC CCG CAC AG
Rezultati
mikromrež analize in Semi količinskih RT-PCR
Za identifikacijo genov, ki jih je mogoče selektivno, povezanih z IC-IM, smo primerjali izražanje genov vzorce v želodcu fundic tkiv, pridobljenih iz m /m
v
miših z uporabo divji tip in metoda gen mikromrež [19, 20]. Murine fundus brez epitelijskih celic, pridobljenih iz divjega tipa in W /W
V
miši ohranjajo na podlagi tešče
pogoji so bili uporabljeni za izdelavo poli (A) + mRNA za analizo mikromrež pomočjo mikromrež miške GEM 1 . Rezultati tega poskusa, s poudarkom gene, ki so ponovljive zmanjšala ali povečala za > 2,0-krat ali več, so prikazani v tabeli 2 in sl. 1B. Več znanih in novih genov so različno izražena v fundusa W /W
V
miši (> 2.0 uravnotežena razlika izražanje). Za potrditev profile razlika izražanja, smo podrobneje proučiti stopnje izraženosti v mišje fundic mRNA izvira iz divjih vrst in W /W
V
miši ohranjajo na podlagi tešče
pogoji, kot so predloge, ki uporabljajo semi-kvantitativno analiza RT-PCR (Reprezentativni podatki so bili prikazani na sl. 1C, 1D. Vsi oligonukleotidov kompleti, ki se uporabljajo za potrditev so bili navedeni v tabeli 1). Izražanje deset genov se je močno zmanjšala v želodčni fundusa W /W
V
miši v primerjavi s starostno primerljivimi miših divjega tipa. Še enajst genov je pokazala povečanje izražanja v postili W /W
V
mice.Table 2 Analiza izražanja genov v fundusa m /m
V
miših divjega tipa in
Gene Ime mi
W /W razmerje
V
/divjetipskega (a)
pristop No.
subceličnih lokacija (b)
Cytoband (c)
EST
2,5
AA185701
EST
2,5
AA166336
EST
2.4
AA021806
MCM7
: DNA Replication Licensing Factor
2.4
Q61881
jedro
7q21.3-q22.1
P160 ROCK2
: Rho-Associated protein kinaza
2.3
U58513
citoskelet
2p24
EST
2.3
W18585
EST
2.3
AA403748
BST1 /BP3
: ADP-ribozil ciklaze 2 predhodnikov
2.0
Q64277
membrano
4p15
EST
2.0
AA024250
RBP2
: vezave retinol protein 2, cellular
2,0
Q08652
citoplazmo
3q23
EST
2.0
W46016
BP1 /6C3
: glutamil Aminopeptitase
- 2.1
S30398
membrano
16
EST
-2,2
AI552444
EST
-2,3
AA108876
EST
-2,4
AA049294
EST
-2,4
AA254777
RHAMM
: hialuronan-posredovano motiličnost Receptor
-2,5
AF031932
membrano
5q33.2-qter
EST
-2,5
AA002293
EST
-3,4
AI595081
UVK
: koproporfirinogen oksidaza
-3,6
D16333
mitohondrije
3q12
EST
-3,9
AA000304
(a) Balanced razlika izraz za nadzor divjega tipa miši vs W /W
v
mutiranih miši. Vrednote, ki so se zmanjšale ali povečale za > 2-krat ali več v obeh dveh neodvisnih poskusov, so bile obravnavane pomembne in so bile izračunane povprečne vrednosti. Vsi rezultati so bili potrjeni s semi-kvantitativno RT-PCR z uporabo fundic tkiva iz šestih W /W
V
mutant miši šest divji tip in. (B) subceličnih lokacija ob VIR programa http določena. //Vir Stanford edu.. (C) človeške kromosomske lokalizacijo gena.
Razprava
Primerjava različno izraženih genov iz fundusa W /W
V
miši s pomočjo analize DNK mikromrež je pokazala, da je izraz enajst geni prepisi občutno so se regulirane v W /W
v
miši, medtem ko deset genov prepisi so dramatično potlačenih pri teh živalih. te rezultate z semi-kvantitativno RT-PCR tkiv Potrdili smo od šestih vsakega W /W
V
miših divjega tipa in. Podatki, pridobljeni iz teh poskusov kažejo, da je bilo izražanje genov v posebej urejeni W /W
V
miši.
Enajstih genov, ki so up-urejena v želodčni fundusa W /W
V
miši so bile opredeljene kot MCM7
, P160 ROCK2
, BST1 /BP3
, RBP2
, in še sedem brez oznak prepisov. MCM7 je homolog sesalcih kvasa jedrske proteina MCM2 /CDC47, ki se domneva, da igrajo pomembno vlogo pri dveh ključnih stopnjah celičnega cikla, in sicer nastop replikacije DNK in celične delitve [21, 22]. P160 ROCK2, ki je izoencima ROCK1 je cilj za majhne GTPase, Rho [23]. ROCK2 je serin /treonin kinaze, ki regulira cytokinesis, krčenja gladkih mišic, nastanek aktinskih stresa vlaken in kontaktne adhezije in aktivacije odzivnega serumu elementa FOS [24]. Up-ureditev P160 ROCK2 ima lahko kompenzira učinek za izgubo mehanizmov ICC odvisnega v želodčnem fundusa. BST1 /BP3, površinski antigen stromalni celica kostnega mozga, je spremenljivo glikoziliran glikozil-fosfatidilinozitol (GPI)-vezana molekula, ki je v začetku B in T rodovno celic in diskretnih podskupini reticular celic v perifernih limfatičnih organov selektivno izražena. To je izraženo tudi na meji s čopičem črevesnih epitelijskih celic, luminalno površini ledvičnih zbiranje tubulov in zrelih mieloidnih celic [25]. Ta beljakovina naj pripadajo ADP-ribozil ciklazno družine [26]. Cellular RBP2 je bogat protein 134-ostanek prisoten v tankega črevesa epitela [27]. To je misel, da sodelujejo pri uvajanju in /ali znotrajcelično presnovo vitamina A in spada v družino proteinov, ki vsebuje jetra maščobnih kislin vezavni protein. Vitamin A je v maščobi topen vitamin potrebna za rast, razmnoževanje, diferenciacijo epitelijskih celic, in vizijo. Sesalci so odvisni od črevesno absorpcijo tega vitamina za njihovo preživetje. RBP2, ki je v glavnem omejeno na tankega črevesa enterocitov, verjetno igra pomembno vlogo v črevesno absorpcijo in /ali presnovo vitamina A [27].
Prav tako so potrdili navzdol ureditev deset genov v W /W
V
miši: BP1 /6C3
, RHAMM
, CPO
, in še sedem brez oznak ESTI. Glodalski β-limfocitov razlikovanje antigen, BP1 /6C3 so označeni kot glutamil aminopeptidaze, ki je poročal, da služijo kot celično diferenciacijo označevalec lymphomyelocytic linij in je lahko vključena v aktivacijo celic, prenos signala, in celice matrike oprijema. To je izraženo tudi s kapilarno endotelijskih celic, posteljice in epitelnih celic črevesja in proksimalnih ledvičnih tubulov [28]. RHAMM
kodira protein hialuronan receptor [29]. Ko hialuronan veže na RHAMM, fosforilacijo več beljakovin, vključno z goriščno oprijema kinaze pp125-FAK zgodi [30]. To je nujen korak za demontažo kontaktnih kontaktov in kasnejše gibljivost. UVK je šesta encim heme biosintezne poti. Ta topna beljakovina, ki je lokaliziran v intermembrane prostoru mitohondrijev in katalizira pretvorbo dveh propionat skupin na mestih dveh in štirih koproporfirinogen III dveh vinilnih skupin protoporfirinogen IX [31]. Je bilo, da pacienti koproporfirije (pomanjkljivost UVK) je pokazala, zaprtje in nenormalno kolike, ki so glavni simptomi te bolezni [32]. Markirana zvišanje koproporfirije v blatu razlikuje pogoj iz švedske enote, v katerih se blato porfirini običajno normalno in je popestrila porfirijo, v katerem sta coproporphyrin in protoporfirinogen frakcije povečala v blatu [33].
V 21 genov ugotovljenih smo določili subceličnih lokalizacije in človeško kromosomsko kartiranje 7 znanih genov, ki uporabljajo programsko izvorno http:.. //vir Stanford edu (tabela 2). Ti geni so pokazali različne celične lokalizacije vključno 3 membrano, 2 citoplazme, 1 mitohondrijske in 1 jedrskih proteinov. Nadaljnje analize teh genov bi nam omogočajo, da se pojasni, ne samo njihov odnos z KIT, receptor tirozin kinaze a, temveč tudi molekularne vidike GI srčnega spodbujevalnika sistema.
Prej Identificirali smo petnajst genov, ki so različno izražene v majhnih črevesju W /W divjega tipa in
v
miši, ki razvijajo nekaj IC-MY z metodo razlika izražanja genov [17, 18]. ™ @ Nobena od teh 15 genov so jih našli na seznamu 21 genov ki so bili različno izražena v želodčni fundusa z W /W
v
miših divjega tipa in ki so razvili nekaj IC-IM uporabo cDNA mikromrež. Kot smo potrdili diferencialno izražanje genov za KIT
med tanko črevo /želodčne fundic tkiva divjega tipa in tiste W /W
V
mutirane miši s semi-kvantitativno RT-PCR, naša eksperimentalna sistem lahko zazna genetsko odstopanje v W /W
v
miši. Zato bi lahko naši rezultati odražajo razliko celičnega subjekta dveh vrst ICC, IC-MY in IC-IM, ali za razliko od celične sestave med tankem črevesu in fundusa. Da bi zagotovili trden dokaz, ki podpira te špekulacije, izraz profila uporabi očiščenega mRNA iz izoliranih posameznih vmesnih celic lahko zelo koristno v naslednji raziskavi.
Trenutno ne vemo, ali so ti geni pomembno funkcijo od želodca spodbujevalnik /nevrotransmisija aparat ali so navzdol ali navzgor urejena kot posledica izgube ICC. Ti podatki pa zagotoviti jasne sistemske genetske dokaze, ki so več pomembnih beljakovin, ki imajo vlogo v celičnega cikla, cytokinesis in oblikovanje skeleta, celični metabolizem, presnovo kisika, adhezijo celic in razvoj in diferenciacijo črevesnih celic bistveno spremenila v želodčni fundusa od W /W
V
miši. Generacija transgenih živali, ki kažejo tkivno specifične čezmerno genov kandidatk, kakor tudi gen knockout živalih, ki so lahko v pomoč pri pojasnjevanju vloge posameznega gena v prebavnem gibljivost.
Odkritju celotnih človeških in mišjih genov prek genom projekt naj bi korenito biološko zdravilo, vključno z molekularno diagnostiko različnih bolezni in razvoj novih zdravljenja. Informacije v kombinaciji z visoko tehnologijo pretoka, kot mikromrež DNA in SNP analize tipkanje bo pospešila odkritje genov, dovzetnih ali povzročajo razne bolezni in prispevali k pregledu novih zdravil, ki ciljajo na te bolezni, genske produkte. V tem smislu je napor projekta molekularne profiliranje, v katerem smo poskušali odkriti genetsko odstopanje pri modelih bolezni živali, kot so W /W
V
miši bodo doseženi zelo spremenljive vire za nadaljnje pojasnitve motenj gibljivosti . Kot so poročali tudi zmanjšano število ICC v več motnjami GI gibljivosti, kot so kronične črevesne psevdo-obstrukcija [5, 6], počasi tranzitni zaprtje in nekaterih oblik gastroparezo [13, 14], je treba te genske informacije, pomoč pri razvoju novih ciljno molekularnih-terapij za te bolezni, lahko pa tudi prepoznati diagnostične molekularnih markerjev za te bolezni.
Zaključek
smo prepoznani enaindvajset gene, ki kodirajo funkcionalne proteine, ki so občutno navzgor ali navzdol, urejena v tunica muscularis
na želodčni fundusa z W /W
v
miši. Glede na to, da je bil nobeden od teh genov vpletenih v katerem koli vidiku GI gibljivost, vam predlagamo, da se lahko veliko neznanih genov, vključenih v celičnih sprememb, ki vodijo do motenj gibljivosti, povezanih z izgubo ICC. Analiza gen mikromrež je učinkovita metoda za pregledovanje sprememb, ki se pojavljajo v ekspresijskih vzorcev genov v odziv na spontane ali genskih mutacij, ki vodijo do izgube določenega tipa celic. Uporaba te tehnike lahko dovoli priznanje vzorcih izražanja genov, ki so skupna za več motenj gibljivosti, v katerih so ICC izgubile, kar omogoča nove vpoglede v molekularnih mehanizmov, ki so odgovorni za selektivno izgubo populacij ICC.
Ugotavlja
Yataro Daigo, Ichirō Takayama prav tako prispevali k temu delu
Seznam kratic
BP1 /6C3.
glutamil aminopeptidaze
BST1 /BP3:
strome kostnega mozga antigen 1 (alias ADP-ribosylcyclase 2 predhodnik)
UVK:
koproporfirinogen oksidaza
DMP:
globoko v mišicah pleksus
ESTI:
izražena zaporedje oznak
FISH:
fluorescence in situ
hibridizacije

GI:
prebavil
ICC:
intersticijske celice Cajal
IC- DMP:
ICC na ravni globoko mišično pleteža
IC-IM:
intramuskularna ICC
IC-MY :
ICC na ravni myenteric pleteža
MCM7:
kromosom vzdrževanje 7
MY:
myenteric pleksus
P160 ROCK2:
P160 Rho-povezan, navito-coil tvori protein kinazo 2
RBP2: vezavo
retinol protein 2, cellular
RHAMM:
-hialuronan posredovano gibljivost receptor
RT-PCR:
reverzne transkripcije-polimerazo reakcija
SNP:
polimorfizma posameznih nukleotidov
deklaracij
Zahvala PODJETJA
Podprti ga 08457165 (na MF) iz japonskega ministrstva za izobraževanje, znanost, šport in kulturo, Japonska in DK 57.236 (za SW) in PO1 DK41315 (za SW in KS) iz National Institutes of Health, ZDA.
Avtorji "prvotna predložiti datoteke za slike
Spodaj so povezave s prvotno predloženih spisov avtorjev za slike. Izvirna datoteka 12876_2002_51_MOESM1_ESM.ppt avtorjev za sliko 1 Konkurenca interesov
Noben prijavljeni.

• Uredba o sprostitvi amilin iz kultivirani zajcev želodčnih fundic celic sluznice
• Podvajanje cista na piloroduodenalno kanala: redek vzrok neonatalne obstrukcije želodca izstopne: prikaz primera