Differentiële genexpressie in muizen maagfundus ontbreekt interstitiële cellen van Cajal

differentiële genexpressie in muizen maagfundus ontbreekt interstitiële cellen van Cajal
De abstracte Achtergrond
spierlagen van murine maagfundus geen interstitiële cellen van Cajal ter hoogte van de myenterische plexus slechts bezitten intramusculaire interstitiële cellen en deze weefsels niet elektrisch trage golven genereren. De afwezigheid van intramusculaire interstitiële cellen in W /W
V
mutanten biedt een unieke gelegenheid om de moleculaire veranderingen die worden geassocieerd met het verlies van deze intercalerende cellen te bestuderen.
Method
Het gen expressie profiel van de maag fundus van wild-type en w /w
V
muizen werd getest door muizen microarray-analyse weergeven van een totaal van 8734 elementen. Opgevraagd genen van de microarray-analyse werden bevestigd door semi-kwantitatieve reverse transcriptie-polymerase kettingreactie.
Resultaten
Eenentwintig genen werden differentieel tot expressie in wild type en W /W
V
muizen. Elf transcripten was 2,0-2,5 maal hoger mRNA expressie in W /W
V
maagfundus vergelijking met wildtype weefsel. Tien transcripties had 2,1-3,9 voudig lagere expressie in W /W
V
mutanten in vergelijking met de wild-type dieren. Geen van deze genen ooit betrokken bij elke darmtransit functie.
Conclusies
Deze gegevens levert het bewijs dat een aantal belangrijke genen aanzienlijk zijn veranderd in de muizen fundus van W /W
V
mutanten die intramusculaire interstitiële cellen van Cajal missen en hebben verminderd enterische motor neurotransmissie. achtergrond
interstitiële cellen van Cajal (ICC) zijn gastro-intestinale (GI) pacemaker cellen en tussenpersonen in enterische motor transmissie in het maagdarmkanaal [1, 2 ]. ICC express KIT
/c-kit Kopen en afhankelijk van signalering via het genproduct eiwit, KIT, een receptor tyrosine kinase dat essentieel is voor de ontwikkeling en het onderhoud van de ICC fenotype [3]. Mutaties in het wit-spotting
locus (dat wil zeggen W /W
V
) leiden tot een verminderde KIT expressie. Deze mutante dieren kregen paar ICC ter hoogte van de myenterische plexus (IC-MY) in de dunne darm en de verminderde ICC nummering geassocieerd met een verlies van trage golfwerking. Intramusculaire ICC (IC-IM) in de maag, slokdarm en lagere pyloric kringspieren afwezig zijn in W /W
V
gemuteerde dieren [4]. Verminderde aantallen ICC zijn ook vermeld voor diverse GI motiliteit aandoeningen, zoals chronische intestinale pseudo-obstructie [5, 6], infantiele hypertrofe pylorusstenose [7-9], ziekte van Hirschsprung [10-12], slow-transit obstipatie en bepaalde vormen van gastroparese [13, 14]. Ondernemingen de associatie tussen motiliteitsstoornissen en verlies van specifieke populaties van ICC stelt een vollediger begrip van de moleculaire en celbiologie ICC netwerken in het maagdarmkanaal kunnen helpen bij het begrijpen van de etiologie van enkele GI motor pathologieën. Het doel van deze studie was om genetische sequenties die worden uitgedrukt in ICC van de maag die belangrijke functionele elementen van de GI gangmaker /motor neurotransmissie systeem coderen karakteriseren. We vervolgden de hypothese dat dergelijke genen differentiële expressie in de dunne darm van wild-type muizen en bewijzen zou W /W
V
muizen [15, 16]. We eerder geïdentificeerd vijftien bekende en nieuwe genen die differentieel werden uitgedrukt in de dunne darm van de wild-type en W /W
V
muizen, die weinig ontwikkeling van IC-MY met behulp van een differentiële genexpressie methode [17, 18].
in de huidige studie hebben we de hypothese dat er ook differentiële expressie van genen kan in de maag fundus van w /w
V
muizen, waar de IC-IM verloren. Onze gen microarray analyse met succes geïdentificeerd 21 genen die differentieel werden uitgedrukt in de fundus van W /W
V
muizen. De differentiële expressie van deze muizen werd bevestigd door semi-kwantitatieve reverse transcriptie-polymerase ketenreactie (RT-PCR).

Methoden Dieren en Tissue Voorbereiding
het gebruik en de behandeling van proefdieren werd goedgekeurd door de richtlijn betreffende dierproef Comité aan de Universiteit van Yamanashi School of Medicine en aan de Universiteit van Nevada School of Medicine. Zes volwassen mannelijke WBB6F1 - + /+ muizen (wild type) en dezelfde leeftijd zes volwassen mannelijke WBB6F1-W /W
V
muizen, met een gewicht van 20 tot 30 g, werden gekocht van Japan SLC Inc (Shizuoka , Japan). Ze werden geanesthetiseerd met ether en kooldioxide inademing opgeofferd door cervicale dislocatie. Voor genanalyses werden magen verwijderd uit het dier en het slijmvlies van de bijgevoegde submucosa snel scherp uitgesneden uit de tunica muscularis
. Weefsels werden vervolgens ingevroren in vloeibare stikstof (-196 ° C). Weefsels werden bewaard bij -80 ° C tot isolatie van RNA werd vooraf gevormd [18].
RNA bereiding en microarray data analyse
Voor gen microarray analyse, poly (A) + RNA werd uit elk weefselmonster geïsoleerd door TRIZOL ( Life Technologies, Inc., Gaithersburg, MD, USA) en poly (A) + Isolation Kit Total RNA (ISOGEN, Nippon Gene, Tokyo, Japan). 18 Voordat microarray analyse, differentiële genexpressie van KIT
tussen de maag fundic weefsels van wild-type muizen en die van w /w
V
mutante muizen werden bevestigd door semi-kwantitatieve RT-PCR (Zie het gedeelte van semi-kwantitatieve RT-PCR
) (figuur 1A.). Microarrays werden gehybridiseerd en gescand en beeldanalyse werd uitgevoerd zoals eerder [19, 20] beschreven. In het kort werden veranderingen in genexpressie beoordeeld door reverse transcriptie van poly (A) + RNA in de aanwezigheid van Cy3 of Cy5 fluorochromen gevolgd door hybridisatie met muizen GEM 1 microarray chips (Incyte Genomics, Inc., Porter Drive Palo Alto, CA, VERENIGDE STATEN VAN AMERIKA). Om de geldigheid van de test te bevestigen, werden de experimenten uitgevoerd in tweevoud. De 8734 cDNAs gebruikten we vertegenwoordigen 7.854 unieke genen /UniGene clusters: 3205 worden geannoteerd en 4649 zijn unannotated sequenties. We toegewezen een drempelwaarde, met een variantie-analyse, de microarray dia. Genen waarvan Cy3- en Cy5-signaal intensiteiten waren lager dan de cut-off-waarden werden uit verder onderzoek uitgesloten. Evenwichtige differentiële expressie werd bepaald voor de controle wild type muizen versus W /W
V
mutante muizen. Waarden die waren < -2.0 Of > 2,0 in beide twee onafhankelijke experimenten werden significant beschouwd en de gemiddelde waarden van de relatieve fluorescentie verhouding voor elk gen berekend. Figuur 1 A. Expressie van KIT gen
middel van semi-kwantitatieve RT-PCR in gastrische fundus weefsels van wildtype en W /W
V
mutante muizen gehandhaafd onder nuchtere omstandigheden
. GAPDH
niveaus werden gemeten als controle. B. representatief beeld van DNA microarray hybridisatie. Veranderingen in genexpressie die werden vertegenwoordigd door de verhouding van fluorescentie-intensiteit gemeten met Cy3 en Cy5 fluorochromen. Expressieprofielen werden beoordeeld door omgekeerde transcriptie van poly (A) + RNA uit de maag fundus spieren wildtype en W /W
V
muizen in aanwezigheid van Cy3 of Cy5 fluorescente kleurstoffen labeling gevolgd door hybridisatie met muizen GEM 1 microarrays. De getoonde afbeelding werd geproduceerd door beeld Cy5 fluorescentie superpositie van (pseudo-gekleurde groen dat expressie van RNA van de tunica muscularis
van W /W
V
fundus vertegenwoordigt) en het imago van de Cy3 fluorescentie (pseudo- gekleurde rood dat RNA-expressie vertegenwoordigt van wild type weefsels). Arrays werden tegengekleurd met DAPI (blauw). C. Bevestiging van de betrouwbaarheid van de microarray data met semi-kwantitatieve RT-PCR. Representatieve voorbeelden van RT-PCR analyse, fundus weefsels zes wildtype en zes W /W
V
mutante muizen onder uitgehongerd omstandigheden gehouden. Expressie van het CPO
gen werd aanzienlijk verminderd in de fundus van W /W
V
muizen in vergelijking met dezelfde leeftijd wild type muizen, terwijl de MCM7
gen toonde een toename van de expressie in W /W
V
muizen. D. Relatieve expressie van CPO
(CPO Twitter /GAPDH
) en MCM7
(MCM7 Twitter /GAPDH
) in fundic weefsels van zes wild-type en zes W /W
V
mutante muizen. De gegevens stellen het gemiddelde (± SD) van zes verschillende RT-PCR-experimenten met behulp van zes wild type of W Twitter /W
V
fundus RNA als templates.
Semi-kwantitatieve RT-PCR
De niveaus van mRNA expressie die werden verlaagd of verhoogd > 2,0-voudig of meer werden bevestigd door semi-kwantitatieve RT-PCR uit fundus van 6 per wildtype muizen en W /W
V
muizen. RT-PCR werd uitgevoerd zoals eerder [18] beschreven. In het kort werden 2 ug monsters van totaal RNA behandeld met DNase I (Roche Diagnostics, Bazel, Zwitserland) vanaf de muizen fundic gebruikte weefsels enkelstrengs cDNA te synthetiseren. Deze cDNAs werden gebruikt als matrijzen voor PCR in een thermische cycler (PerkinElmer, Shelton, CT, USA) met behulp van primers in Tabel 1 of KIT
(genoemde 5'-ATG ACG TGA TCA GCT AGA CTT-3 'en 5' -CTA CCC TGG AAT ATG AGG CA-3 ') en GAPDH
specifieke primer sets (5'- GACAACAGCCTCAAGATCATCA-3' en 5'-GGTCCACCACTGACACTGTG-3 '). Expressie van GAPDH
diende als een interne controle. Primers waren afgeleid van verschillende exons in hetzelfde gen, wanneer de overeenkomstige muis genomische sequentie beschikbaar was op dat moment. De PCR-reacties werden geoptimaliseerd voor het aantal cycli productgroep intensiteit waarborgen in de lineaire fase van amplification.Table 1 Primer sets gebruikt voor semi-kwantitatieve RT-PCR.
Gene Name
Accession nr
Forward Primer
Reverse Primer
EST
AA185701
CGA AAG CCT TGA GGT TGA AG
TAG GAA AAC AGG CGT CAC TG
EST
AA166336
GAA GAA AAG GCT GCA GAT CG
CAA GAG GCA AAG AGC AAT CC
EST
AA021806
CAC GAA TTG CAG GAC TAC CT
ACC TGC ACT GTA GGC TGA GT
MCM7
Q61881
GCC CAC TGG ATT GTG AAG bij
AGG AGA CTG GTC CAC ACC AC
p160 Rock2

U58513
AAG AAC CTG TCA AGC GTG GT
TCC AGG GTC ATC TGG AGT TC
EST
W18585
AGA CTT GGT GGC AGA GGA GA
GCA GCT CAT GAC AGA ACA CC
EST
AA403748
CCT AAA GCA ACC CAA CCT GA
TAG CCT TAT GGG ACC TGG TG
BST1 /BP3
Q64277
GAT TTC TTG AGC TGG TGT CG
AAA ACC CTC TCG TGG GAT AG
EST
AA024250
CAG ATA GAG CAA GGG ATG GA
CTG AGC CCA AAC CAG TAG AA
RBP2

Q08652
GAC GAA GGA CCA AAA TGG AA
CGG TGA AAT CCA GGT CGT AG
EST
W46016
AGC AAC AAC AGC TGG ACT TC
ACC TTC TTG TGT GTG CTG AG
BP1 /6C3
S30398
TAT CGG CCT CAT CTA ACC AG
ATC TTC AAG CAG CAC CTG AC
EST
AI552444
CAT GCG ATA CTG GAA CAT GA
TGA CTC CAA ATA GCC CTC AG
EST
AA108876
TGG AGC AAG AGA GGA AAG TG
CTA GAC CTG AGC TTG CCT TG
EST
AA049294
ACG TGG AGA AAG TTC TCG TG
GCA ATA GTG TCA CCG AAT CC
EST
AA254777
GCC CTG GAG TTG AGA CTG TA
TGA CAA GCT GCA CAG TAA CC
RHAMM
AF031932 GCA GAA GGA GGA GCA GAG TG
GCA GTG ACG TCC CTC AGA CT
EST
AA002293
AAG TCT TTG TGT GGG CTG AG
AGG AAG CTT CGT CTC TCC AT
EST
AI595081
CAC CAG GAT GTC TGC CTA CT
CCG AGA TCA TGT TCT TCA CC
CPO
D16333
GAA GAC CAA GAT GGA GCT GA
CAG AAA GAT TCC CAT GAA CG
EST
AA000304
TTC ATC TGC TGC TCC TTC TC
TTA TAG ACC TTC CCG CAC AG
Resultaten
Microarray Analyse en Semi -quantitative RT-PCR Belgique Om genen die selectief kunnen worden gekoppeld aan IC-IM identificeren, vergeleken we genexpressie patronen in de maag fundus weefsels afgeleid van wildtype en w /w
V
muizen gebruikmaking een gen microarray methode [19, 20]. Murine fundus zonder epitheliale weefsels afgeleid van wildtype en W /W
V
muizen in nuchtere
omstandigheden gehandhaafd werden gebruikt poly (A) + mRNA microarray analyse genereren met de muis GEM 1 microarray . Resultaten van dit experiment nadruk genen die reproduceerbaar zijn verlaagd of verhoogd > 2,0-voudig of meer, zijn weergegeven in Tabel 2 en Fig. 1B. Diverse bekende en nieuwe genen werden differentieel tot expressie in de fundus van W /W
V
muizen (> 2,0 evenwichtige differentiële expressie). Om de differentiële expressie profielen te bevestigen, we verder onderzocht de expressie niveaus in muizen fundic mRNA afgeleid van wilde soorten en W /W
V
muizen onder omstandigheden nuchter
als sjablonen gehandhaafd, met behulp van semi-kwantitatieve RT-PCR analyse (Representatieve gegevens worden getoond in fig. 1C, 1D. Alle primersets voor de bevestiging geplaatst werden in tabel 1). Expressie van tien genen werd aanzienlijk verminderd in de maag fundus van W /W
V
muizen in vergelijking met dezelfde leeftijd wild-type muizen. Nog elf genen vertoonden een toename van de expressie in nuchtere W /W
V
mice.Table 2 Analyse van genexpressie in de fundus van de wild-type en W /W
V
muizen
Gene Name
w /w
V Twitter /wildkleur verhouding (a)
Accession No.
subcellulaire locatie (b)
Cytoband (c)
EST
2.5
AA185701
EST
2.5
AA166336
EST
2.4
AA021806
MCM7 Twitter: Replicatie Licensing Factor
2.4
Q61881
nucleus
7q21.3-q22.1
p160 Rock2
: Rho-geassocieerde eiwit Kinase
2.3
U58513
cytoskelet
2p24
EST
2.3
W18585
EST
2.3
AA403748
BST1 /BP3 Twitter: ADP-ribosyl Cyclase 2 Precursor
2,0
Q64277
membraan
4p15
EST
2,0
AA024250
RBP2 bestellen: retinol bindend eiwit 2, cellulaire
2,0
Q08652
cytoplasma
3q23
EST
2,0
W46016
BP1 /6C3 Twitter: Glutamyl Aminopeptitase
- 2.1
S30398
membraan
16
EST
-2,2
AI552444
EST
-2,3
AA108876
EST
-2,4
AA049294
EST
-2,4
AA254777
RHAMM Twitter: Hyaluron-Mediated Beweeglijkheid Receptor
-2,5
AF031932
membraan
5q33.2-qter
EST
-2,5
AA002293
EST
-3,4
AI595081
CPO Twitter: Coproporphyrinogen oxidase
-3,6
D16333
mitochondria
3q12
EST
-3,9
AA000304
(a) Balanced differentiële expressie voor de controle wild type muizen vs w /w
V
mutante muizen. Waarden die werden verlaagd of verhoogd met > 2-voudig of hoger in beide twee onafhankelijke experimenten werden significant beschouwd en de gemiddelde waarden werden berekend. Alle resultaten werden bevestigd met semi-kwantitatieve RT-PCR met behulp fundus weefsels zes wildtype en zes W /W
V
mutante muizen. (B) subcellulaire locatie bepaald door de bron programma. Http: //bron Stanford edu.. (C) Humaan chromosomale lokalisatie van het gen.
Bespreking
Een vergelijking van differentieel tot expressie gebrachte genen van de fundus W /W
V
muizen met behulp van DNA microarray analyse bleek dat de expressie van elf genen transcripts waren significant up-gereguleerd in w /w
V
muizen, terwijl tien genen transcripten werden sterk onderdrukt in deze dieren. We bevestigden deze resultaten met semi-kwantitatieve RT-PCR van weefsels van elk zes van wildtype en W /W
V
muizen. Gegevens verkregen uit deze experimenten suggereren dat expressie van de genen die specifiek zijn gereguleerd in W /W
V
muizen. Ondernemingen De elf genen die opwaarts gereguleerd in de maag fundus W /W waren
V
muizen werden geïdentificeerd als MCM7
, p160 Rock2
, BST1 /BP3
, RBP2
, en nog eens zeven unannotated transcripten. MCM7 is een zoogdierhomoloog van de gist nucleair eiwit MCM2 /CDC47, waarvan men denkt dat een belangrijke rol spelen in twee belangrijke stappen van de celcyclus, namelijk begin van DNA replicatie en celdeling [21, 22]. p160 Rock2, dat is een isozym van Rock1 is een doelstelling voor de kleine GTPase, Rho [23]. Rock2 is een serine /threonine kinase dat cytokinese, gladde spiercontractie, de vorming van actine stressvezels en focale adhesies, en de activering van de FOS serum responselement [24] regelt. De up-regulatie van p160 Rock2 kan een compenserend effect van het verlies van ICC-afhankelijke mechanismen in het maag fundus hebben. De BST1 /BP3 een beenmerg stromale celoppervlak antigen, een variabel geglycosyleerd glycosyl-fosfatidylinositol (GPI) -gebonden molecuul dat selectief begin B- en T afkomstcellen en een discrete subpopulatie van reticulaire cellen in de perifere lymfoïde organen tot expressie wordt gebracht. Het wordt ook tot expressie gebracht op de borstelgrens van intestinale epitheelcellen, het luminale oppervlak van renale tubuli verzamelen en rijpe myeloïde cellen [25]. Dit eiwit wordt geacht te behoren tot ADP-ribosyl cyclase familie [26]. Cellulaire RBP2 is een overvloedige 134 afvallen eiwit in de dunne darmepitheel [27]. Men denkt deelnemen aan de opname en /of intracellulaire metabolisme van vitamine A en behoren tot een eiwitfamilie die lever vetzuur bindend eiwit bevat. Vitamine A is een in vet oplosbare vitaminen noodzakelijk voor de groei, reproductie, differentiatie van epitheliale weefsels en visie. Zoogdieren afhankelijk intestinale absorptie van deze vitamine om te overleven. RBP2, dat grotendeels beperkt tot de dunne darm enterocyten, speelt waarschijnlijk een belangrijke rol in de intestinale absorptie en /of het metabolisme van vitamine A [27].
Ook bevestigden de neerwaartse regulatie van tien genen in W /W
V
muizen: BP1 /6C3
, RHAMM
, CPO
, en nog eens zeven unannotated EST. Het murine β-lymfocyt differentiatie antigeen BP1 /6C3 werd gekarakteriseerd als glutamyl aminopeptidase, die gerapporteerd dienen als cel-differentiatie marker lymphomyelocytic lijnen en kan betrokken zijn bij cel activatie, signaaltransductie en cel-matrix adhesie. Het wordt ook uitgedrukt door capillaire endotheelcellen, placenta en epitheelcellen van de darm en proximale niertubuli [28]. RHAMM
codeert voor een hyaluronan receptoreiwit [29]. Wanneer hyaluronan bindt aan RHAMM, de fosforylering van een aantal eiwitten, waaronder de focal adhesion kinase pp125-FAK optreedt [30]. Dit is een noodzakelijke stap voor het demonteren van focale contacten en daaropvolgende motiliteit. CPO is de zesde enzym van het heem biosynthese. Deze oplosbare eiwit is gelokaliseerd in het intermembrane ruimte van mitochondria en katalyseert de omzetting van twee propionaat groepen op posities twee en vier coproporphyrinogen III twee vinylgroepen van protoporfyrinogeen IX [31]. Er werd gemeld dat coproporfyrie (CPO-deficiëntie) patiënten vertoonden constipatie en abnormale koliek dat de belangrijkste symptomen van deze ziekte [32] zijn. Duidelijke verhoging van coproporphyria in de feces onderscheiden voorwaarde van de Zweedse type waarin ontlasting porfyrinen doorgaans normaal uit variegate porfyrie waarin zowel coproporfyrine en protoporfyrinogeen fracties worden verhoogd in de ontlasting [33].
In de 21 genen geïdentificeerd we bepaalden de subcellulaire lokalisatie en menselijke chromosomale mapping van de 7 bekende genen met het bronprogramma http:.. //bron stanford edu (tabel 2). Deze genen vertoonden diverse cellulaire lokalisatie waaronder 3 membraan, cytoplasmische 2, 1 en 1 mitochondriale kerneiwitten. Verdere analyse van deze genen kunnen ons in staat stellen om niet alleen hun relatie met de KIT, een receptor tyrosine kinase, maar ook de moleculaire aspecten van GI pacemaker kunnen verduidelijken.
Onze vroegere vijftien genen die differentieel tot expressie gebracht in de dunne darm van wildtype en w /w
V
muizen die weinig IC-MY behulp van een differentiële genexpressie methode [17, 18] te ontwikkelen. ™ @ Geen van deze 15 genen werden gevonden in de lijst van 21 genen die differentieel werden uitgedrukt in de maag fundus van wild-type en w /w
V
muizen die weinig IC-IM te ontwikkelen met behulp van een cDNA microarray. Als we bevestigd differentiële genexpressie van KIT
tussen de dunne darm /maag fundus weefsels van wildtype en die van W /W
V
mutante muizen door semi-kwantitatieve RT-PCR, onze experimentele systeem kan de genetische afwijking op te sporen in w /w
V
muizen. Daarom onze resultaten kan het verschil van de cellulaire eenheid van twee soorten ICC, IC-mijn en IC-IM, of het verschil van de cellulaire samenstelling tussen dunne darm en fundus weerspiegelen. Sluitend bewijs dat deze speculaties ondersteunen expressieprofiel indienen waarbij gezuiverde mRNA geïsoleerd uit één interstitiële cellen zeer nuttig in de volgende studie zou kunnen zijn.
Momenteel weten we niet of deze genen belangrijk voor de functie van de maag pacemaker /neurotransmissie apparatuur of waren beneden of opgereguleerd als gevolg van het verlies van ICC. Deze gegevens echter duidelijke systemische genetisch bewijs dat verscheidene belangrijke eiwitten die een rol in de celcyclus, cytokinese en de vorming van cytoskelet, cellulair metabolisme, zuurstofmetabolisme, celadhesie, en de ontwikkeling en differentiatie van darmcellen significant veranderd in de maag fundus w /w
V
muizen. Genereren van transgene dieren die weefselspecifieke overexpressie van de kandidaatgenen, alsook het gen knockout dieren kan nuttig zijn voor het ophelderen van de rol van elk gen gastrointestinale motiliteit. Ondernemingen De ontdekking van een gehele mens en muis genen via genoomproject zou revolutie biologische geneeskunde zoals moleculaire diagnose van verschillende ziekten en ontwikkeling van nieuwe behandelingsstrategieën. De gegevens gecombineerd met hoge doorvoer technologieën zoals DNA microarray en typen SNP analyse ontdekking van genen gevoelig zijn voor of het veroorzaken verschillende ziekten versnellen en bijdragen tot het screenen van nieuwe geneesmiddelen die deze ziekte-genproducten gericht. In die zin is de inspanning van de moleculaire profilering project waarin we proberen om de genetische afwijking in dierziekte modellen te ontdekken, zoals W /W
V
muizen zullen zeer variabel middelen voor de verdere opheldering van motiliteitsstoornissen genereren . Verminderd aantal ICC zijn ook vermeld voor diverse GI motiliteit aandoeningen, zoals chronische intestinale pseudo-obstructie [5, 6], slow transit obstipatie en bepaalde vormen van gastroparese [13, 14], moeten deze genproducten informatie ontwikkelingshulp van nieuwe moleculaire gerichte therapieën voor deze aandoeningen, en kunnen ook diagnostische moleculaire markers voor deze aandoeningen.
Conclusie
Wij hebben eenentwintig genen die functionele eiwitten die significant op- of neerwaarts gereguleerd zijn in het coderen geïdentificeerd tunica muscularis
van de maag fundus van w /w
V
muizen. Gezien het feit dat geen van deze genen is betrokken bij elk aspect van GI beweeglijkheid, stellen we voor dat veel onbekende genen die betrokken zou kunnen zijn in de cellulaire veranderingen die leiden tot motiliteitsstoornissen geassocieerd met het verlies van ICC. Gene microarray analyse is een effectieve methode voor het screenen van de veranderingen die optreden in de expressiepatronen van genen in reactie op spontane of genetische mutaties die leiden tot het verlies van een specifiek celtype. De toepassing van deze techniek kan de erkenning van patronen van genexpressie die gemeenschappelijk zijn voor de verschillende beweeglijkheid aandoeningen waarbij ICC verloren gaan, waardoor nieuwe inzichten in de moleculaire mechanismen die verantwoordelijk zijn voor de selectieve verlies van ICC populaties mogelijk te maken.
Notes
Yataro Daigo, Ichiro Takayama eveneens bijgedragen aan dit werk Nederlands Lijst van afkortingen
BP1 /6C3.
glutamyl aminopeptidase
BST1 /BP3:
beenmerg stromale antigen 1 (alias ADP-ribosylcyclase 2 precursor)
CPO:
coproporphyrinogen oxidase
DMP:
diepe spieren plexus
EST:
expressed sequence tag
FISH:
fluorescentie in situ hybridisatie

GI:
gastro-intestinale
ICC:
interstitiële cellen van Cajal
IC- DMP:
ICC op het niveau van de diepe spieren plexus
IC-IM:
intramusculaire ICC
IC-MIJN :
ICC op het niveau van de myenterische plexus
MCM7:
minichromosoom onderhoud 7
MY:
myenterische plexus
p160 Rock2:
P160 Rho-geassocieerde, opgerolde-coil vormende proteïne kinase 2
RBP2:
retinol binding eiwit 2, cellulaire
RHAMM:
-hyaluronzuur-gemedieerde motiliteit receptor
RT-PCR:
reverse transcriptie-polymerase chain reactie
SNP:
single nucleotide polymorfismen
verklaringen
Dankwoord
ondersteund door 08457165 (MF) van het Japanse ministerie van Onderwijs, Wetenschap, Sport en Cultuur, Japan en DK 57.236 (SW) en PO1 DK41315 (SW en KS) van de National Institutes of Health, USA.
Authors 'originele ingediende dossiers voor afbeeldingen
Hieronder staan ​​de links naar originele ingediende dossiers van de auteurs voor afbeeldingen. oorspronkelijke bestand 12876_2002_51_MOESM1_ESM.ppt Authors 'voor figuur 1 Competing belangen
geen gemeld.

• Regulering van amyline vrijlating uit gekweekte konijnen maag fundic mucosale cellen
• Verdubbeling cyste van pyloroduodenale kanaal: een zeldzame oorzaak van neonatale maag obstructie: een case report