Stomach Health > mave Sundhed >  > Stomach Knowledges > undersøgelser

Differentiel genekspression i den murine gastrisk fundus mangler interstitielle celler af Cajal

Differentiel genekspression i den murine gastrisk fundus mangler interstitielle celler af Cajal
Abstract
Baggrund Salg The muscle lag af murine gastrisk fundus har ingen interstitielle celler af Cajal på niveau med den myenteriske plexus og kun besidder intramuskulære interstitielle celler og dette væv ikke genererer elektriske langsomme bølger. Fraværet af intramuskulære interstitielle celler i W /W
V
mutanter giver en unik mulighed for at studere de molekylære forandringer, der er forbundet med tabet af disse interkalerende celler.
Metode
gen ekspressionsprofil af mavens fundus af vildtype og W /W
V
mus blev analyseret ved murin microarray analyse viser i alt 8734 elementer. Forespørges gener fra microarray analyse blev bekræftet ved semikvantitativ revers transkription-polymerasekædereaktion.
Resultater Salg Enogtyve generne blev differentielt udtrykt i vildtype- og W /W
V
mus. Elleve transkripter havde 2,0-2,5 gange højere mRNA-ekspression i W /W
V
gastrisk fundus sammenlignet med vildtype væv. Ti udskrifter havde 2,1-3,9 gange lavere udtryk i W /W
V
mutanter i sammenligning med vild type dyr. Ingen af ​​disse gener er nogensinde blevet impliceret i nogen tarm motilitet funktion.
Konklusioner
Disse data dokumenterer, at flere vigtige gener har ændret sig væsentligt i den murine fundus af W /W
V
mutanter, der mangler intramuskulære interstitielle celler af Cajal og har reduceret enterisk motor neurotransmission.
Baggrund
interstitielle celler af Cajal (ICC) er gastrointestinale (GI) pacemaker celler og formidlere i enterisk motor neurotransmission i mave-tarmkanalen [1, 2 ]. ICC express KIT-service /c-kit
og afhænger af signalering via genproduktet protein, KIT, en receptortyrosinkinase som er afgørende for udvikling og vedligeholdelse af ICC fænotype [3]. Mutationer i den hvide spotting
locus (dvs. W /W
V
) resultat i reduceret KIT udtryk. Disse mutante dyr udvikler få ICC på niveauet for den myenteriske plexus (IC-MY) i tyndtarmen og de reducerede ICC numre er forbundet med et tab af slow wave aktivitet. Intramuskulær ICC (IC-IM) placeret i maven, lavere esophageal og pylorus lukkemuskler er fraværende i W /W
V
mutant dyr [4]. Reduceret antal ICC er også blevet rapporteret i flere Peristaltikfremmende lidelser, såsom kronisk intestinal pseudo-obstruktion [5, 6], pylorusstenose [7-9], Hirschsprungs sygdom [10-12], langsom-transit forstoppelse og visse former for gastroparese [13, 14].
associering mellem motilitetsforstyrrelser og tab af specifikke populationer af ICC antyder, at en mere fuldstændig forståelse af den molekylære og cellebiologi af ICC net i mavetarmkanalen kan hjælpe med at forstå ætiologien af nogle GI motordrevne patologier. Formålet med den foreliggende undersøgelse var at karakterisere genetiske sekvenser, som udtrykkes i ICC i maven, som kan kode for funktionelle elementer i GI pacemaker /motor neurotransmission system. Vi forfulgte den hypotese, at sådanne gener kan vise forskellen udtryk i tyndtarmen af ​​vildtype mus og W /W
V
mus [15, 16]. Vi har tidligere identificeret femten kendte og hidtil ukendte gener, som blev differentielt udtrykt i tyndtarmen af ​​vildtype og W /W
V
mus, der udvikler få IC-MY anvendelse af en differentiel genekspression metode [17, 18].
i den foreliggende undersøgelse vi den hypotese, at der også kan være differentiel ekspression af gener i det gastriske fundus af W /W Salg V
mus, hvor IC-IM tabt. Vores gen microarray analyse med succes identificeret 21 gener, der blev udtrykkes forskelligt i fundus af W /W
V
mus. Den differentielle ekspression af disse mus blev bekræftet ved semikvantitativ revers transkription-polymerasekædereaktion (RT-PCR).
Metoder Salg Dyr og Vævspræparat
anvendelse og behandling af forsøgsdyr blev godkendt af retningslinje styrende dyreforsøg udvalg på universitetet i Yamanashi School of Medicine og ved University of Nevada School of Medicine. Seks voksne mænd WBB6F1 - + /+ mus (vildtype) og alder matchede seks voksne mandlige WBB6F1-W /W
V
mus, der vejer 20 til 30 g, blev købt fra Japan SLC Inc (Shizuoka , Japan). De blev bedøvet med ether eller kuldioxid indånding og aflivet ved cervikal dislokation. For gen-analyser blev maver fjernet fra dyret og slimhinden med vedlagte submucosa hurtigt skarpe dissekeret fra tunica muscularis
. Væv blev derefter frosset i flydende nitrogen (-196 ° C). Væv blev opbevaret ved -80 ° C indtil isolering af RNA blev præformet [18].
RNA-fremstilling og Microarray Data Analysis Hus Til gen microarray analyse, poly (A) + RNA blev isoleret fra hver vævsprøve af TRIZOL ( Life Technologies, Inc., Gaithersburg, MD, USA) og Poly (A) + Isolation Kit fra totalt RNA (ISOGEN, Nippon Gene, Tokyo, Japan). 18 Før start microarray analyse, differentiel genekspression af KIT
mellem mavens fundiske væv af vildtypemus og de W /W
V
mutant mus blev bekræftet ved semikvantitativ RT-PCR (Se afsnittet af semi-kvantitativ RT-PCR
) (fig. 1A). Mikroarrays blev hybridiseret og scannet, og billedanalyse blev udført som tidligere [19, 20] beskrevet. Kort fortalt, blev ændringer i genekspression vurderet ved revers transkription af poly (A) + RNA'er i nærvær af Cy3 eller Cy5 fluorochromer efterfulgt af hybridisering til muse GEM 1 microarray chips (Incyte Genomics, Inc., Porter Drive Palo Alto, Californien, USA). For at bekræfte gyldigheden af ​​assayet blev udført forsøgene i to eksemplarer. De 8734 cDNA vi brugte repræsenterer 7854 unikke gener /UniGene klynger: 3205 er annoteret og 4649 er fremavlet sekvenser. Vi tildelt en afskæringsværdi, under anvendelse af en variansanalyse til microarray slide. Gener, hvis Cy3- og Cy5-signalintensiteter var lavere end cut-off-værdier blev udelukket fra yderligere undersøgelser. Balanceret forskellen udtryk blev bestemt for kontrol vildtype mus versus W /W
V
mutant mus. Værdier, der var < -2,0 Eller > 2,0 i begge to uafhængige forsøg blev betragtet som signifikante, og middelværdierne for den relative fluorescens ratio for hvert gen blev beregnet. Figur 1 A. Ekspression af KIT
gen ved hjælp af semi-kvantitativ RT-PCR, i gastrisk fundiske væv fra vildtype og W /W
V
mutant mus holdt under fastende
betingelser. GAPDH
niveauer blev målt som en kontrol. B. repræsentativt billede af DNA microarray hybridisering. Ændringer i genekspression, der var repræsenteret ved forholdet mellem intensiteten af ​​fluorescens målt ved anvendelse Cy3 og Cy5 fluorochromer. Udtryk profiler blev evalueret ved revers transkription af poly (A) + RNA fra gastriske fundiske muskler fra vildtype og vægt /vægt
V
mus i nærvær af Cy3 eller Cy5 fluorescerende farvestoffer mærkning efterfulgt af hybridisering med muse GEM 1 microarrays. Billedet viste blev produceret ved at overlejre Cy5 fluorescens billede (pseudo-farvet grønne, der repræsenterer ekspressionsniveauet af RNA fra tunica muscularis
af W /W
V
fundus) og Cy3 fluorescens billede (pseudo- farvet rød, der repræsenterer RNA udtryk fra vild type væv). Arrays blev modfarvet med DAPI (blå). C. Bekræftelse af pålideligheden af ​​de microarray data semi-kvantitativ RT-PCR. Repræsentative eksempler på RT-PCR-analyse, i fundiske væv fra seks vilde type og seks W /W
V
mutant mus holdt under udsultede forhold. Ekspression af CPO
genet blev reduceret betydeligt i fundus af W /W
V
mus sammenlignet med alder matchede vilde type mus, mens MCM7
gen viste en stigning i ekspression i W /W
V
mus. D. Relativ udtryk niveau af rå palmeolie
(CPO
/GAPDH
) og MCM7
(MCM7
/GAPDH
) i fundiske væv fra seks vilde type og seks W /W
V
mutant mus. Dataene repræsenterer middelværdien (± SD) af seks forskellige RT-PCR-forsøg under anvendelse af seks vildtype eller W-service /W
V
fundus RNA som skabeloner.
Semi-kvantitativ RT-PCR
niveauerne af mRNA-ekspression, der blev nedsat eller forhøjet med > 2.0 gange eller mere, blev bekræftet ved semikvantitativ RT-PCR fra fundus af 6 af hver vildtypemus og W /W Salg V
mus. RT-PCR blev udført som tidligere [18] beskrevne. Kort fortalt blev 2 ug aliquoter af totale RNA'er behandlet med DNase I (Roche Diagnostics, Basel, Schweiz) fra musene fundiske væv anvendes til at syntetisere enkeltstrengede cDNA'er. Disse cDNA'er blev anvendt som templates for PCR i et termisk cykliseringsapparat (PerkinElmer, Shelton, CT, USA) under anvendelse af primere, der er opført i tabel 1 eller KIT
(5'-ATG ACG TCA TGA AGA CTT GCT-3 'og 5' -CTA CCC TGG AAT AGG ATG CA-3 '), og GAPDH
specifikke primersæt (5'-GACAACAGCCTCAAGATCATCA-3' og 5'-GGTCCACCACTGACACTGTG-3 '). Angivelse af GAPDH
tjente som en intern kontrol. Primere blev afledt fra forskellige exons i det samme gen, når den tilsvarende mus genomiske sekvens var til rådighed på det tidspunkt. PCR-reaktionerne blev optimeret til antal cyklusser for at sikre produktets intensitet inden for det lineære fase af amplification.Table 1 Primersæt anvendt til semi-kvantitativ RT-PCR.
Gene Name
tiltrædelse No.
Forward Primer myHotelVideo.com: Reverse Primer
EST
AA185701
CGA AAG FTT TGA GGT TGA AG
TAG GAA AAC AGG CGT CAC TG
EST
AA166336
GAA GAA AAG GCT GCA GAT CG
CAA GAG GCA AAG AGC AAT CC
EST
AA021806
CAC GAA TTG CAG GAC TAC CT
ACC TGC ACT GTA GGC TGA GT
MCM7
Q61881
GCC CAC TGG ATT GTG AAG fra Aalborg AGG AGA CTG GTC CAC ACC AC
p160 ROCK2

U58513
AAG AAC CTG TCA AGC GTG GT
TCC AGG GTC ATC TGG AGT TC
EST
W18585
AGA CTT GGT GGC AGA GGA GA
GCA GCT CAT GAC AGA ACA CC
EST
AA403748
FTT AAA GCA ACC CAA FTT GA
TAG FTT TAT GGG ACC TGG TG
BST1 /BP3
Q64277
GAT TTC TTG AGC TGG TGT CG
AAA ACC CTC TCG TGG GAT AG
EST
AA024250
CAG ATA GAG CAA GGG ATG GA
CTG AGC CCA AAC CAG TAG AA
RBP2

Q08652
GAC GAA GGA CCA AAA TGG AA
CGG TGA AAT CCA GGT CGT AG
EST
W46016
AGC AAC AAC AGC TGG ACT TC
ACC TTC TGT TTG GTG CTG AG
BP1 /6C3
S30398
TAT CGG FTT CAT CTA ACC AG
ATC TTC AAG CAG CAC CTG AC
EST
AI552444
CAT GCG ATA CTG GAA CAT GA
TGA CTC CAA ATA GCC CTC AG
EST
AA108876
TGG AGC AAG AGA GGA AAG TG
CTA GAC CTG AGC TTG FTT TG
EST
AA049294
ACG TGG AGA AAG TTC TCG TG
GCA ATA GTG TCA CCG AAT CC
EST
AA254777
GCC CTG GAG TTG AGA CTG TA
TGA CAA GCT GCA CAG TAA CC
RHAMM
AF031932 GCA GAA GGA GGA GCA GAG TG
GCA GTG ACG TCC CTC AGA CT
EST
AA002293
AAG TCT TTG TGT GGG CTG AG
AGG AAG CTT CGT CTC TCC AT
EST
AI595081
CAC CAG GAT GTC TGC CTA CT
CCG AGA TCA TGT TCT TCA CC
CPO
D16333
GAA GAC CAA GAT GGA GCT GA
CAG AAA GAT TCC CAT GAA CG
EST
AA000304
TTC ATC TGC TGC TCC TTC TC
TTA TAG ACC TTC CCG CAC AG
Resultater
microarray analyse og Semi -quantitative RT-PCR
at identificere gener, der kan være selektivt forbundet med IC-IM, vi sammenlignet genekspression mønstre i gastrisk fundiske væv afledt af vildtype og W /W
V
mus udnytte et gen microarray metode [19, 20]. Murin fundus uden epitel væv hidrørende fra vild type og W /W
V
mus opretholdt under fastende
betingelser blev anvendt til at generere poly (A) + mRNA for microarray analyse ved hjælp af musen GEM 1 microarray . Resultaterne af dette eksperiment, fremhæver gener, der var reproducerbart faldt eller steg med > 2.0 gange eller mere, er vist i tabel 2 og fig. 1B. Flere kendte og nye gener udtrykkes forskelligt i fundus af W /W
V
mus (> 2,0 afbalanceret forskellen udtryk). For at bekræfte forskellen udtryk profiler, vi yderligere undersøgt ekspressionsniveauerne i murine fundiske mRNA stammer fra vilde typer og W /W
V
mus holdt under fastende
betingelser som skabeloner, der bruger semikvantitativ RT-PCR-analyse (Repræsentative data er vist i fig. 1C, 1D. Alle primersæt anvendt til bekræftelse blev opført i tabel 1). Angivelse af ti gener blev reduceret betydeligt i den gastriske fundus af W /W
V
mus sammenlignet med alder matchede vilde type mus. En anden elleve gener viste en stigning i udtryk i fastet W /W
V
mice.Table 2 Analyse af genekspression i fundus af vildtype og W /W
V
mus
Gene Name
W /W
V-service /vildtype-forholdet (a)
tiltrædelse No.
Subcellulær placering (b)
Cytoband (c)
EST
2.5
AA185701
EST
2.5
AA166336
EST
2,4
AA021806
MCM7
: DNA Replication Licensing Factor
2.4
Q61881
kerne
7q21.3-q22.1
p160 ROCK2
: Rho-protein kinase
2.3
U58513
cytoskelettet
2p24
EST
2.3
W18585
EST
2.3
AA403748
BST1 /BP3
: ADP-ribosyl cyclase 2 Precursor
2.0
Q64277
membran
4p15
EST
2,0
AA024250
RBP2
: retinol bindende protein 2, cellulære
2,0
Q08652
cytoplasma
3q23
EST
2,0
W46016
BP1 /6C3
: glutamyl Aminopeptitase
- 2.1
S30398
membran
16
EST
-2,2
AI552444
EST
-2,3
AA108876
EST
-2,4
AA049294
EST
-2,4
AA254777
RHAMM
: Hyaluronan-medieret motilitet receptor
-2,5
AF031932
membran
5q33.2-qter
EST
-2,5
AA002293
EST
-3,4
AI595081
CPO
: Coproporphyrinogen Oxidase
-3,6
D16333
mitokondrier
3q12
EST
-3,9
AA000304
(a) Balanced differentieret udtryk for kontrol vildtype mus vs W /W
V
mutant mus. Værdier, der blev nedsat eller forhøjet med > 2 gange eller mere i begge to uafhængige forsøg blev betragtet som signifikante, og middelværdierne blev beregnet. Alle resultater blev bekræftet med semi-kvantitativ RT-PCR under anvendelse af fundiske væv fra seks vildtype og seks W /W
V Salg mutante mus. (B) Subcellulær placering bestemmes af KILDE program http:. //Kilde Stanford edu.. (C) Humant kromosomal lokalisering af genet.
Diskussion
En sammenligning af differentielt udtrykte gener fra fundus af W /W
V
mus ved anvendelse mikromatrice analyse afslørede, at ekspressionen af elleve gener afskrifter var signifikant opreguleret i W /W
V
mus, mens ti gener udskrifter blev dramatisk undertrykt i disse dyr. Vi bekræftede disse resultater med semi-kvantitativ RT-PCR af væv fra seks hver af vildtype og W /W
V
mus. Data opnået fra disse forsøg antyder, at ekspression af generne specifikt reguleret i W /W
V
mus.
De elleve gener, der var opreguleret i det gastriske fundus af W /W
V
mus blev identificeret som MCM7
, p160 ROCK2
, BST1 /BP3
, RBP2
, og yderligere syv fremavlet udskrifter. MCM7 er en mammal homolog af gæren kerneprotein MCM2 /CDC47, der menes at spille en vigtig rolle i to afgørende trin i cellecyklussen, nemlig indtræden af ​​DNA replikation og celledeling [21, 22]. p160 ROCK2, som er et isozym af rock1 er et mål for lille GTPase, Rho [23]. ROCK2 er en serin /threonin-kinase, som regulerer cytokinese, glat muskelsammentrækning, dannelsen af ​​actin stress fibre og fokale adhæsioner, og aktiveringen af ​​FOS serumresponselement [24]. Den opregulering af P160 ROCK2 kan have en kompenserende effekt for tabet af ICC-afhængige mekanismer i mavens fundus. Den BST1 /BP3, en knoglemarvsstromaceller celleoverfladeantigen, er en variabelt glycosyleret glycosyl-phosphatidylinositol (GPI)-bundne molekyle, som selektivt udtrykkes ved tidlig B- og T-afstamningsceller og en diskret subpopulation af retikulære celler i de perifere lymfoide organer. Det udtrykkes også på børstesømmen af ​​intestinale epitelceller, den luminale overflade af renale tubuli indsamling og modne myeloide celler [25]. Dette protein formodes at tilhøre ADP-ribosyl cyclase familie [26]. Cellular RBP2 er en rigelig 134-rest protein til stede i tyndtarmens epitel [27]. Det menes at deltage i optagelsen og /eller intracellulær metabolisme af vitamin A og tilhører en proteinfamilie, som indeholder leveren fedtsyre-bindende protein. Vitamin A er et fedtopløseligt vitamin nødvendig for vækst, reproduktion, differentiering af epitelvæv, og vision. Pattedyr afhænger intestinale absorption af dette vitamin for deres overlevelse. RBP2, som er begrænset i vid udstrækning til tyndtarmens enterocytterne, spiller sandsynligvis en vigtig rolle i den intestinale absorption og /eller metabolisme af vitamin A [27].
Vi bekræftede også nedreguleringen af ​​ti gener i W /W
V
mus: BP1 /6C3
, RHAMM
, CPO
, og yderligere syv fremavlet EST'er. Den murine β-lymfocyt differentiation antigen, BP1 /6C3 blev karakteriseret som glutamyl aminopeptidase, som er rapporteret til at tjene som celle-differentiering markør for lymphomyelocytic afstamninger og kan være involveret i celle-aktivering, signaltransduktion, og celle-matrix adhæsion. Det udtrykkes også ved kapillære endotelceller, placenta, og epitelceller i tarmen og proksimale nyretubuli [28]. RHAMM
koder for et hyaluronanreceptor protein [29]. Når hyaluronan binder til RHAMM, phosphoryleringen af ​​en række proteiner, herunder fokal adhæsionkinase pp125-FAK forekommer [30]. Dette er et nødvendigt skridt for demontering af fokale kontakter og efterfølgende motilitet. CPO er den sjette enzym af hembiosyntesevejen. Denne opløselige protein er lokaliseret i intermembrane rum af mitokondrier og katalyserer omdannelsen af ​​to propionat grupper i positionerne to og fire af coproporphyrinogen III til to vinylgrupper af protoporphyrinogen IX [31]. Det blev rapporteret, at coproporphyria (CPO mangel) patienter viste forstoppelse og unormal kolik, som er de vigtigste symptomer på denne sygdom [32]. Markant stigning af coproporphyria i fæces differentieret tilstand fra den svenske type, hvor afføring porfyriner er normalt normalt og fra broget porfyri, hvor både coproporphyrin og protoporphyrinogen fraktioner øges i afføringen [33].
I de 21 identificerede gener, vi bestemt den subcellulære lokalisering og menneskelig kromosomal kortlægning af de 7 kendte gener ved hjælp af sOURCE program http:.. //kilde stanford edu (tabel 2). Disse gener viste en række cellulære lokalisering herunder 3 membran, 2 cytoplasmisk, 1 mitokondrie og 1 kerneproteiner. Yderligere analyser af disse gener kan gøre det muligt for os at belyse ikke blot deres forhold til KIT, en receptortyrosinkinase, men også de molekylære aspekter af GI pacemaker system.
Vi har tidligere identificeret femten gener, der blev udtrykkes forskelligt i tyndtarmen af vildtype og W /W
V
mus, der udvikler få IC-MY anvendelse af en differentiel genekspression metode [17, 18]. ™ @ Ingen af ​​disse 15 gener blev fundet på listen over 21 gener der blev differentielt udtrykt i det gastriske fundus af vildtype og W /W
V
mus, som udvikler få IC-IM ved anvendelse af et cDNA-mikroarray. Som vi bekræftet differentiel genekspression af KIT
mellem tyndtarmen /gastriske fundiske væv af vild type og dem af W /W
V
mutante mus ved semi-kvantitativ RT-PCR, vores eksperimentelle systemet kunne detektere genetisk afvigelse i W /W
V
mus. vores resultater kan derfor afspejle forskellen af ​​den cellulære enhed af to typer ICCs, IC-MY og IC-IM, eller forskellen af ​​den cellulære sammensætning mellem tyndtarmen og fundus. At give afgørende bevis, som støtter disse spekulationer, udtryk profil ved hjælp renset mRNA fra isolerede enkelt interstitielle celler kan være meget nyttige i næste undersøgelse.
På nuværende tidspunkt ved vi ikke, om disse gener er vigtige for funktionen af gastrisk pacemaker /neurotransmission apparater eller var ned- eller opreguleret som følge af tabet af ICC. Disse data imidlertid give klare systemisk genetiske beviser for, at flere vigtige proteiner, der har roller i cellecyklus, cytokinese og dannelse af cytoskelet, cellulære stofskifte, ilt metabolisme, celleadhæsion, og udvikling og differentiering af tarmceller ændres væsentligt i den gastriske fundus af W /W
V
mus. Generation af transgene dyr, der viser vævsspecifik overekspression af kandidatgener, samt gen-knockout dyr kan være nyttige til at belyse den rolle, som hvert gen i gastrointestinal motilitet.
Opdagelsen af ​​et helt humane og muse-gener gennem genom projekt formodes at revolutionere biologisk medicin, herunder molekylær diagnosticering af forskellige sygdomme og udvikling af ny behandling. De oplysninger kombineret med høj throughput teknologi såsom mikromatrice og SNP typebestemmelse analyse vil fremskynde opdagelsen af ​​gener der er modtagelige for eller forårsager forskellige sygdomme og bidrager til screening af nye lægemidler, der er målrettet disse sygdom-genprodukter. I den forstand, at den indsats af den molekylære profilering projekt, hvor vi forsøger opdage genetisk afvigelse i dyresygdomsmodeller såsom W /W
V
mus vil generere meget variable ressourcer til yderligere belysning af motilitetsforstyrrelser . Som reduceret antal ICC også er blevet rapporteret i flere Peristaltikfremmende lidelser, såsom kronisk intestinal pseudo-obstruktion [5, 6], langsom-transit forstoppelse og visse former for gastroparese [13, 14], bør disse gen information bidrage til udviklingen af hidtil ukendte molekylære målrettede terapier til disse lidelser, og kan også identificere diagnostiske molekylære markører for disse lidelser.
Konklusion
Vi har identificeret enogtyve gener, der koder funktionelle proteiner, der er betydeligt op- eller nedreguleret i tunica muscularis
af mavens fundus af W /W
V
mus. I betragtning af, at ingen af ​​disse gener har været impliceret i ethvert aspekt af GI motilitet, foreslår vi, at mange ukendte gener kan være involveret i de cellulære ændringer, der fører til motilitetsforstyrrelser forbundet med tab af ICC. Gene microarray analyse er en effektiv metode til screening de forandringer, der forekommer i ekspressionsmønstre for gener som reaktion på spontane eller genetiske mutationer, der fører til tab af en specifik celletype. Anvendelse af denne teknik kan tillade anerkendelse af mønstre af genekspression, der er fælles for de forskellige motilitet lidelser, hvor ICC er tabt, hvilket giver ny indsigt i de molekylære mekanismer, der er ansvarlige for den selektive tab af ICC befolkninger.
Notes
Yataro Daigo, Ichiro Takayama bidrog ligeligt til dette arbejde
Liste over forkortelser
BP1 /6C3:.
glutamyl aminopeptidase
BST1 /BP3:
knoglemarv stromale antigen 1 (alias ADP-ribosylcyclase 2 forløber)
CPO:
coproporphyrinogen oxidase
DMP:
dybe muskulære plexus
EST'erne:
udtrykte sekvensmærker
FISH:
fluorescens situ
hybridisering
i
GI:
gastrointestinal
ICC:
interstitielle celler af Cajal
IC- DMP:
ICC på niveau med den dybe muskulære plexus
IC-IM:
intramuskulær ICC
IC-MY :
ICC på niveau med den plexus myentericus
MCM7:
minikromosom vedligeholdelse 7
MY:
myentericus plexus
p160 ROCK2:
p160 Rho-associeret, coiled-coil danner protein kinase 2
RBP2:
retinol binding protein 2, cellulære
RHAMM:
hyaluronan-medieret motilitet receptor
RT-PCR:
revers transkription-polymerasekædereaktion reaktion
SNP:
enkelt nukleotid polymorfisme
erklæringer
Anerkendelser
Støttet af 08457165 (til MF) fra det japanske ministerium for Uddannelse, Videnskab, sport og kultur, JAPAN og DK 57.236 (til SW) og PA1 DK41315 (til SW og KS) fra National Institutes of Health, USA.
Forfattere 'oprindelige indsendt filer til Images of Nedenfor er links til forfatternes oprindelige indsendte filer til billeder. 12876_2002_51_MOESM1_ESM.ppt Forfatternes oprindelige fil til figur 1 Konkurrerende interesser
Ingen erklæret.

Other Languages