Diferencijalna ekspresija gena u mišjem želuca fundusa nedostaje intersticijske stanice izražavanja Cajal

Diferencijalni gena u mišjem želuca fundusa nedostaje intersticijske stanice Cajal pregled Sažetak
Pozadina pregled mišića slojeva mišje želučane fundusa nemaju intersticijske stanice Cajal na razini mienterijskom pleksusu i posjeduju samo intramuskularne intersticijske stanice, što tkivo ne generira električne sporih valova. Nepostojanje intramuskularne intersticijske stanice u W /W pregled V pregled mutanata pruža jedinstvenu priliku za proučavanje molekularne promjene koje su povezane sa gubitkom tih interkalacijskih stanica. Pregled metoda
gen izraz profil želučanog fundusa divljeg tipa i W /W pregled V pregled miševa je ispitan pomoću mišje analize mikropolja prikazuje ukupno 8734 elemenata. Upita geni iz analize microarray potvrđeni su polu-kvantitativni reverzne transkripcije-lančane reakcije polimeraze. Pregled Rezultati
dvadeset i jednog gena različito izražena u divlji tip i W /W
V Netlogu miševa. Jedanaest transkripti imali 2.0-2.5 puta veću ekspresiju mRNA u W /W
V pregled želuca fundusa u usporedbi s divljim tkiva tipa. Deset transkripti imali 2.1-3.9 puta niži izraz u W /W pregled V pregled mutanti u usporedbi sa životinjama divljeg tipa. Niti jedan od tih gena ikad bili uključeni u bilo kojoj funkciji crijeva motilitet. Pregled Zaključci
tih podataka može zaključiti da je nekoliko važnih gena značajno su se promijenili u mišjem fundusa W /W
V Netlogu mutanti koji nemaju intramuskularne intersticijske stanice Cajal i imaju smanjeni trbušni tifus motora neurotransmisije. pregled pozadini pregled međuprostorne stanice Cajal (ICC) su gastrointestinalni (GI) pacemaker stanica i posrednici u gastroinertne motora transmisije u GI traktu [1, 2 ]. ICC express KIT pregled /c-kit pregled i ovise o signalizaciju putem gena proteina proizvod, pribor, tirozin kinaze receptora koji je ključan za razvoj i održavanje MKS fenotipa [3]. Mutacije u bijelim uočavanje
lokusa (tj W /W pregled V
) dovodi do smanjene ekspresije KIT. Ove mutantne životinje razvijaju nekoliko ICC na razini mienterijskom pleksusu (IC-MY) u tankom crijevu i smanjeni broj ICC je povezan s gubitkom sporih valova aktivnosti. Intramuskularne ICC (IC-IM) koja se nalazi u želucu, donji ezofagealni i pilorusa sfinktera su odsutni u W /W
V pregled mutiranih životinja [4]. Smanjeni broj ICC-a također su zabilježene u nekoliko poremećaja GI motorike, kao što su kronične intestinalne pseudo-opstrukcije [5, 6], infantilno hipertrofična stenoza pilorisa [7-9], Hirschsprungova Bolest [10-12] slow-tranzitni zatvor i određeni oblici gastropareza [13, 14].
povezanost poremećaja motiliteta i gubitak određenih populacija ICC sugerira da potpunije razumijevanje molekularne i stanične biologije ICC mreža unutar probavnog trakta može pomoći u razumijevanju etiologije nekih GI motornih patologija. Cilj ovog istraživanja bio je okarakterizirati genetske sekvence koje su izražene u ICC želuca koja može kodirati važne funkcionalne elemente sustava GI pejsmejker /motora neurotransmisije. potjeru smo hipotezu da takvi geni mogu pokazati diferencijalnu ekspresiju u malim crijevima miševa i divljih W /W pregled v pregled miševa [15, 16]. Mi smo ranije identificiran petnaest poznatih i novih gena koji su različito izražene u tankom crijevu divljeg tipa i W /W pregled V pregled, miševi, koje se razvijaju nekoliko IC-MY korištenjem metode diferencijal Gene Expression [17, 18].
u ovom istraživanju smo pretpostavili da postoji svibanj također biti diferencijal ekspresija gena u želučanoj fundusa w /w
v pregled, miševi, gdje IC-IM su izgubili. Naš gen microarray analiza uspješno identificirali 21 gena koji su različito izraženi u fundus w /w
v pregled miševa. Diferencijalne ekspresije tih miševa potvrdila je polu-kvantitativno reverzne transkripcije-lančanom reakcijom polimeraze (RT-PCR). Pregled Metode
Životinje i Priprava tkiva pregled uporabe i obrade eksperimentalnih životinja je odobren od strane smjernicama uređuje Animal odbor eksperimenta na Sveučilištu u Yamanashi Medicinskog fakulteta i Sveučilišta u Nevadi School of medicine. Šest odrasli mužjak WBB6F1 - + /+ miševi (divlji tip) i dobi šest odraslih muških WBB6F1-W /W
V pregled, miševi, težine 20 do 30 g, kupljeni su od Japana SLC Inc (Shizuoka Japan). Oni su anestetizirani s eterom ili inhalacijom ugljikova dioksida i žrtvovani cervikalnom dislokacijom. Za analize gena, želuci su uklonjeni iz životinja i sluznica s priloženom submukozi brzo oštar izrezanim iz tunike muscularis Netlogu. Tkiva su zatim smrznute u tekućem dušiku (-196 ° C). Tkiva su pohranjene na -80 ° C do Izolacija RNA provedena je [18]. Pregled RNA Priprema i Microarray Analiza podataka
za gen analize mikropolja, poli (A) + RNA je izolirana iz svakog uzorka tkiva Trizol ( Life Technologies, Inc., Gaithersburg, MD, USA) i poli (a) + Izolacija Kit iz ukupne RNA (ISOGEN, Nippon gene, Tokyo, Japan). 18 Prije početka analize microarray, diferencijal genska ekspresija KIT
između želučane fundusnih tkivima miševa divljeg tipa i onih W /W pregled v pregled, mutirani miševi su potvrđeni polu-kvantitativnog RT-PCR (vidi odjeljak semi-kvantitativna RT-PCR
) (Sl. 1). Microarrays su hibridizirani, skeniranje i analiza slike je izvršena kako je ranije [19, 20] opisano. Ukratko, promjene u ekspresiji gena su ocijenjeni reverznom transkripcijom poli (A) + RNA u prisustvu Cy3 ili Cy5 fluorokromi slijedi hibridizaciju mišem GEM 1 microarray čips (Incyte genomike, Inc., Porter Drive Palo Alto, CA, SAD). Za potvrdu valjanosti pokusa, eksperimenti su provedeni u duplikatu. U 8734 cDNA smo koristili predstavlja 7854 jedinstvenih gena /UniGene klastera: 3205 su obilježene i 4649 su unannotated sekvence. dodijeljena smo cut-off vrijednosti, pomoću analize varijance, na microarray slajd. Geni čija Cy3- i Cy5-intenziteta signala bile su niže od odrezanih vrijednosti su isključeni iz daljnje istrage. Uravnotežena diferencijal bila je određena za kontrolu divljih miševa u odnosu na W /W pregled V pregled mutiranih miševa. Vrijednosti koje su bile < -2.0 Ili > 2.0 u oba dva neovisna pokusa u obzir značajan i izračunate srednje vrijednosti relativnog omjera fluorescencije za svaki gen. Slika 1 A. Ekspresija KIT pregled gena pomoću semi-kvantitativnog RT-PCR, u želučanim fundusnih tkiva iz divljeg tipa i W /W
V pregled mutiranih miševa održava pod bile na dijeti pregled uvjetima. GAPDH pregled u serumu je mjerena kao kontrola. B. Reprezentativna slika DNA microarray hibridizacije. Promjene u ekspresiji gena koje su predstavljene omjera intenziteta fluorescencije izmjerene Cy3 i Cy5 fluorokromi. Izraz profili su ocijenjeni reverznom transkripcijom poli (A) + RNA iz želuca fundusnih mišića iz divljeg tipa i w /w pregled V
miševa u prisutnosti Cy3 i Cy5 fluorescentno obilježavanje boje, nakon čega slijedi hibridizacijom miša GEM 1 niza. Slika pokazala je proizveden od nanizanih CY5 fluorescencije slike (pseudo boje zelene koji predstavlja nivo ekspresije RNA iz tunica muscularis
W /W pregled V
fundusa) i fluorescencija slika Cy3 (pseudo- crvene boje koji predstavlja izraz RNA od divljih tkiva tipa). Nizovi su prebrojane s DAPI (plava). C. Potvrda o pouzdanosti podataka microarray semi-kvantitativnog RT-PCR. Reprezentativni primjeri RT-PCR analize, u fundusnih tkiva od šest divljeg tipa i šest W /W
V pregled mutirani miševi održava pod izgladnjele uvjetima. Izražavanje CPO
gena znatno je smanjen u fundus w /w pregled V
miševa u odnosu na odgovarajuće starosti, kod divljeg tipa miševa, dok je MCM7 pregled gena pokazala porast ekspresije u W /W pregled v pregled miševa. D. Razina Relativna izraz CPO Netlogu (CPO pregled /GAPDH
) i MCM7 pregled (MCM7
/GAPDH Netlogu) u fundusnih tkiva od šest divljeg tipa i šest W /W
V pregled mutiranih miševa. Podaci predstavljaju srednju vrijednost (± SD) od šest različitih RT-PCR eksperimenti koriste šest divlji tip ili W
/W pregled V pregled fundusa RNK predložaka. Pregled, Semi-kvantitativna RT-PCR
razine ekspresije mRNA koje su smanjiti ili povećati po > 2.0 puta ili više, potvrđeni su semi-kvantitativni RT-PCR iz fundusa 6 svakog divljeg tipa miševa i w /w
v pregled miševa. RT-PCR je izveden kako je prethodno opisano [18]. Ukratko, 2 ug ukupne RNA alikvoti tretiranih DNase I (Roche Diagnostics, Basel, Švicarska) iz miševa fundusnih tkiva su korišteni da sintetiziraju jednolančanih cDNA. Te se cDNA su korištene kao kalupi za PCR u termalni ciklički uređaj (PerkinElmer, Shelton, CT, USA) korištenjem primera navedenih u tablici 1 ili KIT
(5'-ACG ATG TCA TGA AGA CTT GCT-3 'i 5' -CTA CCC TGG AAT ATG AGG CA-3 ') i GAPDH pregled specifičnih primera seta (5'-GACAACAGCCTCAAGATCATCA-3' i 5'-GGTCCACCACTGACACTGTG-3 '). Izražavanje GAPDH Netlogu služio kao interna kontrola. Klice su izvedeni iz različitih eksona u istom genu, kada je odgovarajući slijed genoma miša je dostupna u to vrijeme. PCR reakcije su optimizirane za broj ciklusa da bi se osiguralo intenzitet proizvoda unutar linearnog faze amplification.Table 1 početnicu koji služi za polu-kvantitativno RT-PCR. Pregled Naziv Gene
pristupni broj
Forward primer pregled
zadnji primer
Predviđeno pregled AA185701 pregled CGA AAG CCT TGA GGT TGA AG pregled TAG GAA AAC AGG CGT CAC TG pregled Predviđeno pregled AA166336 pregled GAA GAA AAG GCT OKS Gat CG pregled CAA GAG OKS AAG AGC AAT CC pregled EST pregled AA021806 pregled CAC GAA tTG CAG GAC tac CT pregled ACC TGC ACT GTA GGC TGA GT pregled MCM7
Q61881 pregled GCC CAC TGG ATT GTG AAG AT
AGG AGA CTG GTC CAC ACC AC pregled P160 ROCK2
pregled U58513 pregled AAG AAC CTG TCA AGC GTG GT pregled TCC AGG GTC ATC TGG AGT TC pregled EST pregled W18585 pregled AGA CTT GGT GGC AGA GGA GA pregled OKS GCT MAČKA GAC AGA ACA CC pregled EST pregled AA403748 pregled CCT AAA OKS ACC CAA CCT GA pregled TAG CCT TAT GGG ACC TGG TG pregled BST1 /BP3
Q64277 pregled GAT TTC TTG AGC TGG TGT CG
AAA ACC CTC TCG TGG GAT AG pregled EST pregled AA024250 pregled CAG ATA GAG CAA GGG ATG GA
CTG AGC CCA AAC CAG TAG AA
RBP2 pregled
Q08652 pregled GAC GAA GGA CCA AAA TGG AA
CGG TGA AAT CCA GGT CGT AG pregled Predviđeno pregled W46016 pregled AGC AAC AAC AGC TGG Zakona TC pregled ACC TTC TGT TTG GTG CTG AG pregled BP1 /6C3
S30398 pregled TAT CGG CCT MAČKA CTA ACC AG
ATC TTC AAG CAG CAC CTG AC
EST
AI552444
CAT GCG ATA CTG GAA MAČKA GA
TGA CTC CAA ATA GCC CTC AG pregled EST pregled AA108876 pregled TGG AGC AAG aga GGA AAG TG pregled CTA GAC CTG AGC tTG CCT TG pregled EST pregled AA049294
ACG TGG AGA AAG TTC TCG TG pregled OKS ATA GTG TCA CCG AAT CC pregled Predviđeno pregled AA254777 pregled GCC CTG gag TTG aga CTG TA pregled TGA CAA GCT OKS CAG TAA CC pregled RHAMM
AF031932 OKS GAA GGA GGA OKS GAG TG
OKS GTG ACG TCC CTC aga CT
EST
AA002293
AAG TCT TTG TGT GGG CTG AG pregled AGG AAG CTT CGT CTC TCC AT pregled EST pregled AI595081 pregled CAC CAG Gat GTC TGC CTA CT pregled, CCG AGA TCA TGT TCT TCA CC pregled CPO
D16333 pregled GAA GAC CAA GAT GGA GCT GA
CAG AAA GAT TCC CAT GAA CG pregled EST pregled AA000304 pregled TTC ATC TGC TGC TCC TTC TC pregled TTA oznaku ACC TTC CCG CAC AG pregled Rezultati
microarray analize i Polu -quantitative RT-PCR
za identifikaciju gena koji mogu biti selektivno povezane s IC-IM, usporedili smo genske ekspresije u uzorcima želučane fundusnih tkiva dobivenih od divljeg tipa i w /w
v pregled miševa koriste metoda gen mikropostrojima [19, 20]. Mišji fundusa bez epitelnih tkiva dobivenih od divljeg tipa i W /W pregled V pregled miševa čuvani pod uvjetima koje su gladovale pregled je korišten za dobivanje poli (A) + mRNK za analize mikropolja pomoću miša GEM 1 mikročipa , Rezultati ovog eksperimenta, s naglaskom na gene koji ponovljivo su smanjiti ili povećati po > 2.0 puta ili više, su prikazani u tablici 2 i na slici. 1B. Nekoliko poznatih i novi geni su različito izražena u fundus W /W pregled V pregled miševa (> 2,0 uravnotežen diferencijal izraz). Za potvrdu diferencijalne ekspresije profila, možemo dodatno ispitati razinu ekspresije u mišje fundusa mRNA izvedene iz divljih vrsta i W /W pregled V pregled, miševi održava pod bile na dijeti pregled uvjetima kao predloške, koristeći polu-kvantitativna RT-PCR analiza (Reprezentativni podaci prikazani su na Sl. 1C, 1D. Svi primera koji služi za potvrđivanje navedeni su u tablici 1). Ekspresija deset gena znatno smanjena u želučanoj fundusa W /W pregled V pregled miševa u odnosu na odgovarajuće starosti divljeg tipa miševa. Još jedanaest geni su pokazali povećanje ekspresije u postili W /W pregled V pregled mice.Table 2 Analiza ekspresije gena u fundus divljeg tipa i w /w pregled V
miševa
Genea imenom
W /W omjer pregled V pregled /divljeg tipa (a)
pristupni broj
subeelularnim lokacija (b)
Cytoband (c)
EST pregled 2.5 pregled AA185701 pregled EST pregled 2.5 pregled AA166336
EST
2.4 pregled AA021806 pregled MCM7 pregled: DNA replikacije licenciranje Factor pregled 2.4 pregled Q61881 pregled jezgra pregled 7q21.3-q22.1 pregled P160 ROCK2
: Rho-protein kinazu povezanu pregled 2.3 pregled U58513 pregled citoskelet pregled 2p24 pregled EST
2.3 pregled W18585 pregled EST pregled 2.3 pregled AA403748
BST1 /BP3 pregled: ADP-ribozil ciklaza 2 Prekursor pregled 2.0 pregled Q64277 pregled membrane pregled 4p15 pregled EST
2,0 pregled, AA024250 pregled RBP2 pregled: obvezujući retinol proteina 2, stanični pregled 2.0 pregled Q08652 pregled citoplazmi pregled 3q23 pregled EST
2,0 pregled, W46016 pregled BP1 /6C3
: glutamil Aminopeptitase
- 2,1 pregled, S30398 pregled membranu pregled 16 pregled EST
-2,2 pregled AI552444 pregled EST pregled -2,3 pregled AA108876 pregled EST
-2,4
AA049294 pregled EST pregled -2,4 pregled AA254777 pregled RHAMM pregled: hijaluronske posrednika pokretljivosti receptora pregled -2,5 pregled AF031932 pregled membrane pregled 5q33.2-qter
EST pregled -2,5 pregled AA002293 pregled EST
-3,4 pregled AI595081 pregled CPO pregled: Coproporphyrinogen oksidaze pregled -3,6
D16333
mitohondrija
3q12 pregled EST pregled -3,9 pregled AA000304 pregled (a) Balanced diferencijal izraz za kontrolu divljeg tipa miševa vs W /W pregled V
mutiranih miševa. Vrijednosti koje su smanjena ili povećana > 2 puta veća ili u oba dva neovisna pokusa u obzir značajan, a srednje vrijednosti izračunate su. Svi rezultati su potvrđeni s polu-kvantitativnog RT-PCR korištenjem fundusa tkiva od šest divljeg tipa i šest W /W
V
mutiranih miševa. (B) subeelularnim položaj određuje source program http:. //Izvor Stanford edu.. (C) Ljudski kromosomske lokalizacije gena. Pregled Rasprava
Usporedba različito izražene gene iz fundusa W /W pregled V pregled miševa pomoću DNA microarray analiza pokazala je da je izraz jedanaest geni transkripti su značajno viša u W /W pregled v pregled, miševi, dok je deset gena transkripti su dramatično potisnute u tim životinjama. Potvrdili smo ove rezultate sa semi-kvantitativnog RT-PCR tkiva sa šest svaki od divljeg tipa i w /w
v pregled miševa. Podaci dobiveni iz tih pokusa sugeriraju da je ekspresija gena su posebno regulirani W /W pregled v pregled miševa.
Jedanaest gene koji su up-regulirana u želučanoj fundusa W /W
v pregled, miševi su identificirani kao MCM7 pregled, P160 ROCK2 pregled, BST1 /BP3
, RBP2 Netlogu i još sedam unannotated transkripata. MCM7 je homolog sisavca kvasca nuklearnog proteina MCM2 /CDC47, za koju se smatra da igraju važnu ulogu u dva ključna koraka staničnog ciklusa, to jest početak replikacije DNA i diobe [21, 22]. P160 ROCK2, koji je izozim u ROCK1 je meta za male GTP-aze, Rho [23]. ROCK2 je serin /treonin kinaza koja regulira citokineze, kontrakciju glatkih mišića, formiranje aktina stresnih vlakna i žarišnih prianjanja i aktivaciju FOS odgovora seruma elementa [24]. Up-regulacija P160 ROCK2 može imati kompenzira učinak za gubitak ICC-ovisne mehanizme u želučanoj fundusa. BST1 /BP3, koštane srži strome stanični površinski antigen je varijabilno glikozilirani glikozil-fosfatidil-inozitol (GPI), čija je molekula koja selektivno se izražava rano B i T stanica i loza diskretne subpopulacija retikularni stanica u perifernim limfnim organima. Također je izražen na četkastog brida epitelnim stanicama crijeva, luminalnoj površini bubrega prikupljanja tubulima i zrelih mijeloidnih stanica [25]. Ovaj protein je trebalo da pripadaju ADP-ribozil ciklaze obitelji [26]. Cellular RBP2 je u izobilju 134-ostatak protein prisutan u malom epitel crijeva [27]. Smatra se da doprinosi absorpciji i /ili unutarstanični metabolizam vitamina A i pripada obitelji proteina koji sadrži protein masnih kiselina iz jetre se veže. Vitamin A je loj topljivi vitamin neophodan za rast, reprodukciju, diferencijaciju epitelnih tkiva, te vizije. Sisavci ovise o crijevne apsorpcije tog vitamina za njihov opstanak. RBP2, koji je zatvoren u velikoj mjeri tankog crijeva enterocit, vjerojatno igra važnu ulogu u crijevnoj apsorpciji i /ili metabolizmu vitamina A [27].
Također je potvrdio-naniže deset gena u W /W
v pregled, miševi: BP1 /6C3
, RHAMM
, CPO
, a još sedam unannotated EST. Mišji β-limfocitni antigen diferencijacije, BP1 /6C3 je karakteriziran glutamil aminopeptidazom, koji je prikazan na služe kao stanični diferencijacije marker lymphomyelocytic loza i mogu biti uključeni u staničnoj aktivaciji, prijenosa signala i adhezije stanica-matriks. Također je izražena kapilarnih endotelnih stanica, placentu i epitelnim stanicama crijeva i proksimalnim renalnim tubulima [28]. RHAMM pregled kodira protein hijaluronan receptora [29]. Kada hijaluronan veže na RHAMM, fosforilaciju velikog broja proteina, uključujući fokalne adhezije kinaze pp125-FAK javlja [30]. To je nužan korak za rastavljanje žarišnih kontakata i naknadne pokretljivosti. CPO je šesti enzim hem biosinteze. Ovaj topivi protein je lokaliziran u intermembrane prostoru mitohondrija i katalizira pretvorbu dvije propionat skupina na pozicijama dva i četiri coproporphyrinogen III dvije vinilne skupine protoporfirinogcn IX [31]. To je izvijestio da pacijenti coproporphyria (CPO nedostatak) pokazali su zatvor i abnormalni kolike da su glavni simptomi ove bolesti [32]. Značajno povišen coproporphyria u izmetu razlikovati stanje iz švedskog tipa u kojem stolica porfirini su obično normalni i od išarati porfirije u kojem su oba coproporphyrin i protoporfirinogcn frakcije povećana u stolici [33].
U 21 gena identificiranih, odredili smo subeelularnim lokalizaciju i ljudskog kromosoma od 7 poznatih gena u koriste kao izvor programa. http:. //izvor Stanford edu (tablica 2). Ovi geni su pokazali različite stanične lokalizacije, uključujući 3 membrane 2 citoplazmi, 1 mitohondrijske i 1 proteina jezgre. Daljnje analize ovih gena može nam omogućiti da se objasne ne samo njihov odnos s KIT, receptora tirozin kinaze, ali i molekularne aspekte GI pejsmejkera sustava.
Smo prethodno identificiran petnaest gene koji su različito izražene u malim crijevima divljeg tipa i W /W pregled v pregled, miševi, koji se razvijaju nekoliko IC-MY pomoću metode izraz diferencijal gen [17, 18]. ™ @ Nijedan od tih 15 gena nađene su u popisu od 21 gena koje su s različitiom ekspresijom u želučanoj fundusa divljeg tipa i W /W
v pregled miševa koji razviju nekoliko IC-IM korištenjem cDNA mikročipa. Kao što smo potvrdili diferencijalne ekspresije gena KIT Netlogu između tankog crijeva /želučani fundusa tkiva divljeg tipa i one w /w
V pregled mutanta miševa semi-kvantitativnog RT-PCR, naša eksperimentalna sustav može otkriti genetske aberacije u W /W
v pregled miševa. Stoga naši rezultati mogu odražavati razliku od staničnog entitet dvije vrste ICC-a, IC-Moja i IC-IM-a ili razlika od staničnog sastava između tankog crijeva i fundusa. Za pruža konačan dokaz koji bi podržao ove spekulacije, izraz profil pomoću pročišćenog mRNA iz izoliranih pojedinačnih intersticijske stanice mogu biti vrlo korisni u sljedećem istraživanju.
U današnje vrijeme mi ne znamo da li su ovi geni su važni za funkciju želučani stimulator /aparat neurotransmisije ili su bili na dolje ili gore regulirana kao rezultat gubitka ICC-a. Ovi podaci, međutim, jasan su sistemski genetski dokaz da je nekoliko važnih proteina koji imaju ulogu u staničnom ciklusu, citokineze i formiranje citoskeleta, stanični metabolizam, metabolizam kisika, stanične adhezije, te razvoj i diferencijaciju stanicama crijeva značajno promijenila u želučanoj fundusa W /W pregled v pregled miševa. Generacija transgeničnih životinja koje pokazuju tkivno specifični ekspresiju gena kandidata, kao i gene knockout životinje moglo biti korisno za razjašnjenje uloge svakog gena u gastrointestinalnog motiliteta.
Otkriće čitava čovjeka i miša gena kroz genom projekt trebao revolucionirati biološke lijekove uključujući molekularnu dijagnostiku različitih bolesti i razvoj novih tretmana. Informacije u kombinaciji s visokom propusnosti tehnologije, kao što su DNA microarray i SNP analizi tipkanja će ubrzati otkrivanje gena podložnih ili uzrokuje razne bolesti i pridonose projekciju novih lijekova koji ciljaju ove bolesti genskih produkata. U tom smislu, trud projekta molekularne profiliranje u kojima ćemo pokušati otkriti genetske aberacije u životinjskim modelima bolesti kao što su W /W pregled V pregled, miševi će generirati vrlo promjenjive sredstva za daljnje izučavanje poremećaja motiliteta , Kao smanjeni broj ICC-a također su zabilježene u nekoliko poremećaja GI motorike, kao što su kronične intestinalne pseudo-opstrukcije [5, 6] slow-tranzitni zatvor i pojedinih oblika gastropareza [13, 14], te informacije gen trebao pomoći u razvoju novih molekularnih ciljane terapije za ove bolesti, a također može odrediti dijagnostičke molekularne markere za ove bolesti. pregled Zaključak pregled identificirali smo dvadeset i jednu gene koji kodiraju funkcionalne proteine ​​koji su znatno gore ili prema dolje regulirana u Tunica muskularis pregled želučanog fundusa w /w pregled v pregled miševa. S obzirom da nijedna od ovih gena je umiješan u bilo kojem aspektu GI pokretljivosti, predlažemo da mnogi nepoznata geni mogu biti uključeni u stanični promjenama koje dovode do poremećaja motiliteta povezanim s gubitkom ICC. Gene microarray analiza je učinkovita metoda za probir na promjene koje se događaju u izraz uzoraka gena kao odgovor na spontanim ili genetske mutacije koje dovode do gubitka određene vrste stanica. Primjena ove tehnike može omogućiti prepoznavanje obrazaca ekspresije gena koji su zajednički za nekoliko poremećaja motiliteta u kojem su ICC izgubili, čime se osigurava novi uvid u molekularne mehanizme odgovorne za selektivno gubitak ICC populacija.
Bilješke
Yataro Daigo, Ichiro Takayama doprinijeli jednako na ovom poslu
Popis kratica pregled BP1 /6C3.
glutamil aminopeptidaza
BST1 /BP3:
strome koštane srži antigen 1 (alias ADP-ribosylcyclase 2 prekursor)
CPO: pregled coproporphyrinogen oksidaze
DMP: pregled duboka mišićna pleksus
EST:
izražene slijed oznake
Riba:
fluorescentne in situ hibridizacije pregled Netlogu
GI: pregled gastrointestinalnog
ICC:
intersticijske stanice Cajal
IC- DMP: pregled, ICC na razini dubokog mišića pleksusa
IC-IM: pregled, intramuskularno ICC
IC-MY : pregled, ICC na razini mienterijskom pleksusa
MCM7: pregled, održavanje minichromosome 7
MY: pregled mienteričkim pleksus
P160 ROCK2: pregled P160 Rho-povezane, spiralno-spiralnu formira protein kinazu 2
RBP2: vezanje pregled retinol proteina 2, stanični
RHAMM: pregled hijaluronan posredovana receptorom motilitet
RT-PCR:
preokrenuti lanca transkripcija-polimeraze reakcija
SNP: pregled jednostrukih nukleotidnih polimorfizama
deklaracijama
Zahvale
podržane od 08457165 (MF) iz japansko Ministarstvo obrazovanja, znanosti, kulture i sporta, Japan i DK 57.236 (SW) i PO1 DK41315 (SW i KS) iz National Institutes of Health, USA.
autora na originalni podnio datoteke za slike
Ispod su linkovi na autora originalnih dostavljenih datoteka za slike. Izvorna datoteka 12876_2002_51_MOESM1_ESM.ppt autora za sliku 1 suprotstavljenih interesa pregled Nitko objavljene. pregled

• Regulacija Amylin puštanje iz kulturan zečjih želučanih fundusnih stanica sluznice
• Umnožavanje cista pyloroduodenal kanala: rijedak uzrok neonatalnog želuca izlazne opstrukcije: slučaj report