Polimorfizem TGFB1 in VEGF genov in preživetje bolnikov z rakom želodca

Polimorfizem TGFB1
in VEGF
geni in preživetje bolnikov z rakom želodca
Abstract
Ozadje
Nekateri TGFB1
in VEGF
polimorfizmov so verjeli, da lahko deluje. Glede na to, da so ti geni vključeni v rast in napredovanje tumorjev, vključno z angiogenezo, razširjanje in invazivnosti, smo predpostavili, da bi bili ti polimorfizmi povezana s preživetjem pri bolnikih z rakom želodca.
Metode
genotipizacijo smo TGFB1
-509 C > T 1869 T >C in 915 G >C in VEGF
-1498T > C -634G > C do + 936C > T 167 bolnikov z rakom želodca. Z metodo Kaplan in Meier, log-rank testi in Cox modeli sorazmerna nevarnosti, smo ovrednotili zveze med TGFB1
in VEGF
variante s splošnim, 1 leto in 2-letno stopnjo preživetja.
Rezultati
Čeprav ni bilo bistvenih razlik v splošne stopnje preživetja pri vseh polimorfizmov testiranih so imeli bolniki s TGFB1
+ 915CG in CC genotipov slabšo 2-letno preživetje (razmerje prilagojena ogroženosti (HR), 3,06; 95% interval zaupanja (CI) 1,09-8,62; P
= 0,034) kot pri bolnikih z GG genotipom imel. Poleg tega so imeli bolniki heterozigotnih za VEGF
-634CG tudi slabšo 1-letno preživetje (prilagojeno VP, 2.08; 95% CI, 1,03-4,22; P
= 0,042) kot pri bolnikih z -634GG genotipom <. br> Zaključek
naše raziskave kažejo, da se TGFB1
+ 915CG /CC in VEGF
-634CG genotipi lahko povezana s kratkoročno preživetje pri bolnikih z rakom želodca. Vendar pa so potrebne večje študije za preverjanje te ugotovitve.
Uvod
V želodcu CANER, imajo lahko bolniki z enakimi clinicopathologic značilnosti in enake zdravljenj različnih kliničnih rezultatov. Čeprav stopnja je najboljša razpoložljiva klinično merilo tumorja agresije in prognozo, očitno obstajajo pomembne razlike celo v isti stopnji tumorja [1, 2]. Zato bi bilo koristno, da se izboljša napovedno točnost z opredelitvijo preprosto dostopne molekularnih označevalcev, ki predvideti nekatere razlike v kliničnih izidov. V zadnjih desetletjih so številne študije pokazale, da genetske spremembe igrajo vlogo pri razvoju in napredovanju raka želodca [3]. Med temi molekularnih markerjev, polimorfizmi enega nukleotida (SNP), so najbolj pogosto raziskovali genetske variacije, ki lahko prispevajo k kliničnih izidov pacientov [4].
Epidemiološke in klinične raziskave so pokazale, da lahko tako TGF-β1 in VEGF igrajo pomembno vlogo pri onkogenezo želodca [5, 6]. Na primer, TGFB1
and VEGF
variante povezana s spremenjenimi beljakovinskih izdelkov, ki lahko prispevajo k za spremembe v posamezni dovzetnosti za raka in kliničnih izidov [4]. Oba TGFB1
in VEGF
geni so zelo polimorfna, menda ima 168 in 140 variant, oziroma, ampak samo nekaj od teh variant so v promotor ali kodiranje regije, ki so lahko potencialno funkcionalno http: //www. NCBI. NLM. NIH. gov /SNP /. Od teh različicah, je bilo več SNP opisal kot pomembno pri modulaciji funkcije genov [7-9] in domnevno vpletenih v etiologiji različnih vrst raka [10-13].
TGF-β1 pot The je kritično vključen v razvoj tumorjev in napredovanje. V tumorskih celičnih kultur, TGF-β1 je antiproliferacijsko učinke in lahko blokira napredovanje tumorja v povojih, ker lahko pospeši tudi invazijo in metastaze v kasnejših fazah napredovanja tumorja [14, 15]. Ena eksperimentalna študija je poročala, da je TGF-β1-posredovane aktivacije ALK5-SMAD 3 poti bistvenega pomena za Pst beljakovine spodbujajo gibljivost in invazivnosti v želodčnih rakavih celic [16]. Mišje eksperimenti prav tako pokazala, da je bil spremenjen TGF-β1 povezana z latentnimi TGF-β1 vezavnih proteinov, ki lahko povzročajo vnetja in tumorje [17], in da lahko moten TGF-β1 pot vodi do tumorske rasti s povečanjem angiogenezo tumorja z zmanjšano ekspresijo inducirano od trombospondina-1 [18]. Pri ljudeh, je bilo TGF-β1 večjo občutljivost kot antigene carcino-zarodkov v tumorskih celicah pri pacientih želodca z rakom [16]. Poleg tega sta obe eksperimentalni in klinično-patološko študije kažejo vlogo za družino VEGF proteinov v metastaz preko limfnega sistema in na klinične izide v več človeških solidnih tumorjev, vključno z rakom želodca [19].
V tej študiji smo odločil, da genotip izbrano pogosti (to je manjša alel frekvenca > 0,05) TGFB1
in VEGF
SNP, ki bodisi vodijo do sprememb, ki niso sinonim amino kislin [20], ali so bila povezana z nižjo stopnjo izraženosti teh genov [ ,,,0],8, 21], kar pomeni, ti SNP lahko funkcionalno. Domnevali smo, da bi se lahko funkcionalne polimorfizmi v TGFB1 in VEGF povezana z klinične izide pri bolnikih z rakom želodca. Konkretno smo PODJETJA
ocenili povezavo med klinične izide pri bolnikih z rakom želodca, vključno s celokupno preživetje, in vsako od naslednjih SNP: tri TGFB1
SNP, vključno z enim promotor SNP (-509 C > T) in dve eksonu 1 SNP (869 T >C in 915 G > C) in tri VEGF
SNP, ki vključuje eno promotorsko SNP (-1498T > C), eni 5'-neprevedene regije SNP (-634G > C) in eno 3' neprevedena regija SNP (936 C > T)
metod
Študija prebivalstva
Ta prospektivni analizi sestavljalo 167 bolnikih z na novo diagnosticirano in histološko potrjeni raka na želodcu, ki so bili obdelani na Univerzi v Teksasu MD Anderson Cancer. center, Houston, Texas med aprilom 2003 in julijem 2008 je bil protokol študije odobriti naša Review Board institucionalni (IRB) in vseh bolnikih dal soglasja, z uporabo IRB-odobril, obveščati obrazec za soglasje. Merila za izključitev vključene tiste, ki niso na novo diagnosticiranih in tiste, ki so bili obdelani na drugem mestu pred prihodom v M. D. Anderson. Ti pacienti so bili vključeni v to analizo, ker ni bilo na voljo za ekstrakcijo DNK.
Genotipizacija
Genomsko DNA smo ekstrahirali iz buffy coat frakciji vzorca krvi vsakega bolnika z uporabo krvi Mini Kit (Qiagen njihove shranjenih vzorcev krvi, Valencia, CA), v skladu z navodili proizvajalca. čistost DNA in koncentracije smo določili s spektrofotometričnim merjenjem absorbance pri 260 in 280 nm UV spektrometra. Trije izbrani TGFB1
SNP [en (-509 C > T /rs1800469) v promotor in dva (869 T > C /rs1800470 in 915 G > C /rs1800471) v eksonu 1], in treh promotorja VEGF
SNP [on (-1498T > C /rs833061) v promotor, eno (-634G > C /rs2010963) v 5'-neprevedene regije in eno (+ 936C > T /rs3025039) v 3'-neprevedeno regija] so genotipizacijo s pomočjo verižne reakcije s polimerazo (PCR) - dolžina fragment polimorfizma (RFLP) postopek za določitev omejitev. Genotipov TGFB1
SNP smo določili kot je opisano prej [22], in testi na VEGF
SNP so tudi že poročali [23]. Na osnovi PCR-RFLP genotipizacije testom, dve raziskovalni pomočniki samostojno brati gel slike, in so bile izvedene ponovljene analize, če se ne strinjajo o testirane genotipa. Poleg tega so bile ponovljene teste izvedli na naključno izbranih 10% vzorcev so bili naključno izbrani za opravljanje ponavljajočih teste z rezultati pa 100% skladnih.
Zbiranje podatkov Izid
vseh 167 bolnikov z rakom želodca je imel na voljo nadaljnjih do podatkov o izidu. Skupni čas preživetja je bila izračunana od datuma prijave na doktor Anderson do dneva zadnjega stika ali smrti. Bolniki, ki so bile v zadnjem stiku še živi, ​​so bile obravnavane kot cenzurirani dogodek v analizi. Starost ob diagnozi, spolu in vrsti zdravljenja (to je operacijo in kemoterapijo), so bili uporabljeni kot spremenljivk v analizi. Starost ob diagnozi je razvrščene v dve skupini glede na povprečno starost (≤ 57 in > 57 let).
Statistična analiza
Obojestransko hi-kvadrat in t
testi so bili izvedeni za določitev koli statistično pomembne razlike v razdelitve kategorialnih spremenljivk (npr TGFB1
in VEGF
alelov in genotipov) po demografskih spremenljivkah in kliničnih znakov ter v obliki zveznih spremenljivk (npr, starost in čas preživetja), v tem zaporedju. Razporejenost genotipa smo testirali za odstopanje od Hardy-Weinberg ravnotežju (HWE), pa so rekonstruirali haplotipov za variante istega gena v skladu s programom FAZA [9], s katero je verjetnost vsakega posameznika, ki imajo posebno haplotip par je bila ocenjena in haplotip par z najvišje ocenjene verjetnosti je bila dodeljena posamezniku. Pearsonov hi-kvadrat ali globalni preizkus smo uporabili za testiranje razlik preživetju med bolniki z vseh haplotipov. Splošne preživelih med tremi genotipov skupin vsakega SNP so bili analizirani po metodi Kaplan-Meier, in test log-rank smo uporabili za testiranje enakosti porazdelitve preživetja s genotipov stratificirano. smo uporabili univariatne in multivariatne Cox modele sorazmerna nevarnosti, oceniti učinek vsakega genotipa na preživetje v prisotnosti drugih spremenljivk. Oba starost ob diagnozi in časovni interval med registracijo in datumom diagnoze (patološki potrditve bolezni), so bili obravnavani kot numeričnih spremenljivk v modelu Cox. Da bi potrdili predpostavko sorazmernih nevarnosti v Cox regresijski model smo dodali časovno odvisne spremenljivke v modelu, in predpostavka je bila potrjena. razmerja ogroženosti (ur) in njihove ustrezne 95% intervali zaupanja (CIS) smo izračunali s prilagoditvijo drugih spremenljivk v istem modelu. Skupni učinki teh TGFB1
in VEGF
SNP in njihovih interakcij s kajenjem in pitjem za raka na želodcu so bili ocenjeni. Vsi statistični testi so bili 2-sided, s P
vrednosti 0,05 ocenjena kot pomembna in vsi so bili izračunani s pomočjo SAS programske opreme (različica 9.1; SAS Institute, Cary, NC).
Rezultati
Značilnosti prebivalstva študijskega
Klinične in patološke značilnosti 167 bolnikov, vključenih v tej študiji, so prikazani v tabeli 1. bilo 114 moških (68,3%) in 53 samic (31,7%), katerih starost v razponu od 32 do 89 let. Uporaba Cox regresijsko analizo odnosa med celokupno preživetje in clinicopathologic lastnosti, smo ugotovili, da niti starost, spol, etnično pripadnost, kajenje, niti stanje alkohola so bile statistično povezana s celokupno preživetje (P
= 0,339, 0,988, 0,297, 0,475, 0,809, v tem zaporedju) .table 1 Značilnosti študijske populacije bolnikov z rakom želodca
Lastnosti
No. bolnikov
No. o Smrti
MST (mesecev)
P
*
Skupaj teme
Age (srednji)
167
60
0,339
≤57 let
68
27
21,2
> 57 let
99
33
31,0
Spol
0,988
Moški
114
41
23,3
ženska
53
19
28,9
Etičnost
0,297
Bela
117
45
28.8
Non-bela †
50
15
19,1
Dim
0.475
Nikoli
34
14
20,6
Ever
133
46
30,1
Alkohol
0,809
Nikoli
62
23
23,2
kdaj
105
37
29.3
Lokacija
0,069
Želodec
118
36
24,3
Ezofagus
25
13
27,2
gej
24
11
16,6
histologijo
0.356
črevesne
118
45
28,1
pečatni prstan
49
15
24,6
razlikovanje
0.694
Poor
96
37
21,8
Zmerna revnih
28
10
29,8
Zmerno-No
42
13
22,6
Clinical Stage
< 0,001
I + II
65
9
30,4
III + IV
101
51
22,7
metastaze
< 0,001
da
90
49
21,2
ne
77
11
34,2
kemoterapijo
< 0,001
da
121
54
26,3
ne
46
6
10,4
Surgery
< 0,001
da
63
11
39,2
ne
104
49
18.4
Okrajšave: MST, srednji čas preživetja; Gej, gastroezofagealno stičišča.
* Hi-kvadrat test.
† Vključeni 13 Azijcev, 16 črna, 19 Hispanics in 2 Native Indijanci.
Tumorje 118 (70,7%), ki so jih bolniki nahaja na želodec in tistih 49 (29,3%) bolnikov je bilo nahaja na gastroezofagealnem prehodu (gej). Ne glede na lokacijo tumorja, so imeli vsi bolniki adenokarcinom. Od tega je bilo 118 (70,7%) bolnikov črevesnih in 49 (29,3%) pečat obroč. Mi združeni vrste diferenciacije v naslednje tri kategorije: revne, zmerno revnih in zmerno-dobro, ter število in delež teh treh skupin je bilo 96 (57,8%), 28 (16,9%) in 42 (25,3%), oz. Pri vseh bolnikih, klinično-patološke značilnosti vključno z lokacijo tumorja, histologijo in status diferenciacije niso bile pomembno povezana s celokupno preživetje v univariantne analizo (P
= 0,069, 0.356 in 0.694, v tem zaporedju). Klinični tumor stopnje po merilih Mednarodne zveze za boj proti raku (UICC), so bili naslednji: 65 (38,9%) je imela stopnjo I + II in 101 (61,1) je imela faza III + IV (tabela 1)
Med 167 bolniki. , 121 (72,4%) s kemoterapijo, in 63 (37,7%) je prejelo operacijo; na koncu spremljanja obdobju, je 60 (35,9%) bolnikov je umrlo. Spremljanje-up čas povprečje je 18,0 ± 13,3 mesecev pri bolnikih, ki so bili še živi, ​​in čas pomeni preživetje vseh bolnikov je bila 29,4 mesecev. Zaključna faza, metastaze, kemoterapija in kirurgija bilo vse povezano s celokupno preživetje (P
< 0,001 za vse) (tabela 1). Na primer, je bil povprečen čas preživetja 34,2 mesecev pri bolnikih brez metastaz in 21,2 mesecev za tiste z metastazami. Tisti, ki so prejemali kemoterapijo in operacijo je imel daljši povprečni čas preživetja kot tisti, ki tega niso storili (26,3 meseca v primerjavi 10,4 mesecev za kemoterapijo in 39,2 meseca v primerjavi z 18,4 meseca za operacijo).
HWE, povezave, neravnotežja in haplotipov TGFB1 in VEGF
za TGFB1
, eden od treh SNP (rs1800469C > T, rs1800470T > C in rs1800471G > C) ni bil v HWE (P
< 0,05 za rs1800469C > T), kar kaže na morebitno izbiro pristranskosti, vendar nobena za VEGF
SNP (rs833061T > C, rs2010963G > C in rs3025039C > T) odšla z HWE (P
> 0,05 za vse). Nobena od parov TGFB1
ali VEGF
SNP so bili v visoko genetsko neravnostežje (to je, r 2 med 0.039 in 0.541, vse < 0,08). Le štiri TGFB1
haplotipov in pet VEGF
haplotipov imela alelov frekvenco > 0,05 (CTG, 0.570; CCG, 0.190; TCG, 0.167 in CCC, 0.063 za TGFB1
in CGC, 0.344, TCC, 0,287; TGC, 0,192, CGT, 0.072 in TCT, 0,051 za VEGF
). Zaradi majhnega vzorca, nismo izračun diplotypes.
TGFB1 in VEGF genotip distribucije in celokupno preživetje
Ko so bili analizirani vsi bolniki z rakom želodca za celokupno preživetje, ni bilo bistvene razlike najdemo v razdelitve povprečno preživetje čas, ki ga genotipov za katerega koli od polimorfizmov proučevanih. Ker je bilo nekaj udeležencev v manjših homozigotno variantnih skupin, smo združili heterozigotnih in manjše variant homozigotni genotipov skupaj za dodatno analizo, ob predpostavki, da prevladujoč genetskega modela, vendar pa še vedno ni bilo nobene povezave med odkritih polimorfizmov in celokupno preživetje (glej dodatno datoteke 1) . Poleg tega, ko so bili bolniki z rakom želodca razdeljeni glede na starost, spol, etnično pripadnost in metastatsko stanje, ni razlike v distribuciji po srednji čas preživetja po šestih SNP je bilo med podskupin (glej dodatno datoteke 1).
TGFB1 in VEGF genotip distribucije in 1-in 2-letno preživelih
Ker je prognoza splošno slabo v naprednih primerov raka želodca, mediana preživetja redko približa 1 ali 2 leti [2]. V tej študiji je bila večina primerov faza IV (101/167) z mediano časa preživetja le 16,2 mesecev (95% CI, 12,8-24,9). Zato smo izračunali tudi stopnjo preživetja na 1 leto in 2-letno pri bolnikih z različnimi genotipi (glej dodatno datoteko 2). Skupni 1 leto in 2-letno preživelih za vse bolnike je bila 51,5% in 22,1%, v tem zaporedju. Čeprav ni bilo bistvenih razlik v stopnjah preživetja med večino genotipov so imeli bolniki s TGFB1 +
915CG /CC genotipi boljši 1 leto in 2-letno preživetje kot tisti z GG genotip (prilagojeno VP, 2.13; 95% CI , 0,76-6,01; P
= 0,122 in prilagojena HR, 3,06; 95% IZ, 1,09-8,62; P
= 0.034, v tem zaporedju) (slika 1). Poleg tega so imeli tudi bolniki heterozigotnih za VEGF
-634CG boljše 1-letno preživetje (prilagojena HR, 2,08; 95% IZ, 1,03-4,22; P
= 0,042), kot tisti z VEGF
- 634 GG genotip. Slika 1 Kumulativni funkcije preživetja genotipa TGFB1 915 G > C (rs1800471) in VEGF -634G >. C (rs2010963)
Dodatne analize združuje alelov, genotipov in haplotipov istega gena ni utemeljila ugotovitev iz enotni analiza locus (podatki niso prikazani), delno zaradi med SNP in majhnosti študijskega nizko LD, ki niso omogočale nadaljnjo analizo stratifikacije.
Razprava
etiologiji raka želodca je več dejavnikov, multigenetic in večstopenjski [24, 25]. Znano je, da pri karcinogenezi lahko TGF-β preklopiti iz tumorja supresorski na ojačevalec tumorja v kasnejših stopnjah raka [26]. Z dvojno vlogo pri razvoju raka, obstaja velik interes za analizo vloge genetske variacije v TGFB1
pri napredovanju raka in preživetju bolnikov. Na primer, v TGFB1
-509C > so bile T in rs1982073 (ali rs1800470) polimorfizmi pokazala, da je povezana s preživetjem raka dojke v kitajskega prebivalstva [27-30] in odgovor kemoterapijo pri 175 finskih bolnikih z glave in vratu ploščatocelični rak [31] oz. Vendar pa niti TGFB1
+ 869T > C ali + 915G > C polimorfizmi pokazala nobene povezave z tumorja ponovitve in napredovanja v mehurju tumorjev brez mišične invazivnih v španski prebivalstva [32]. Medtem ko je korejski Študija je pokazala, da so genotipi varianta T v TGFB1
-509C > so T SNP povezana z zmanjšanim tveganjem za nastanek pljučnega raka [33], kitajski študiji 414 bolnikov in 414 kontrol [34] je poročal, da genotipa niso bile povezane s skupno tveganje za razvoj raka želodca, vendar z manjšim tveganjem za tveganje stopnji I ali raka II želodca. Vendar pa ni preživetja analize so bili predstavljeni v teh študijah.
Kot je bilo ugotovljeno, nismo našli nobenega statistične dokaze za pomembno povezavo med TGFB1
polimorfizmov in celokupno preživetje pri raku želodca. Vendar pa je pomembna povezava med TGFB1 +
915 CG /CC genotipi in 2-letnega preživetja pri bolnikih z rakom želodca kaže, da so te TGFB1
varianta lahko oslabila vlogo TGF-β1 kot supresorski tumorja v zgodnji fazi napredovanja tumorja. Znano je tudi, da lahko TGF-β1 preklopiti iz tumorja supresorski na ojačevalec tumorja v poznem stadiju raka [26]. Ko so se tumorji zrasla večji in postane metastatskega, lahko posledično povečanje somatskih mutacij ali dobičkov v izvodov onkogeni so odtehtala vlogo variant za zaviranje v poznih fazah tumorja, ki vodi k ni razlike v celotnem preživetju bolnikov z različnimi genotipov TGFB1 +
915 G > C SNP. Vendar pa je to špekulacije, da bo potrjen v bolj natančno izdelanih študij z veliko večji velikosti vzorca in več informacij o spektru mutacij v tumorjih.
VEGF, kot ključnega posrednika angiogenezo, prav tako igra pomembno vlogo pri razvoju raka. VEGF
polimorfizmi so tudi pokazale, da je povezana s preživetjem v obeh rakom želodca in debelega črevesja [35, 36]. Vendar pa so rezultati iz objavljenih študij še vedno v neskladju namesto prepričljivi. V grški želodčne študiji raka petih VEGF
SNP (-2578C > A, -1154G > A, -634G > C, -460T > C in + 936C > T) pri 312 bolnikih, [36], VEGF
-2578 AA, -634 CC in + 936TT genotipi so bili povezani z bistveno nižjo VP (boljše preživetje) za 6-letno preživetje debelega črevesa in raka. Zanimivo je, da še en zgodnji grški študiji 100 bolnikov z rakom želodca je predlagal, da so bile le VEGF
-634CC /CG genotipi povezana z zmanjšanim (slabše preživetje) 10-letno preživetje, v primerjavi z GG genotipa [35]. Naši podatki o 167 bolnikih z rakom želodca je pokazala, da so imele VEGF
-634CC /CG prevozniki slabo 1-letno preživetje je, kot tiste z VEGF
-634 GG genotip. Amano sod. [37] tudi poročali, da niso opazili pomembne povezave med frekvencami VEGF
-460T > C, + 405G > C in 936C > T genotipi in 3-letno preživetje brez bolezni pri bolnikih karcinoma endometrija v japonščini študija 105 bolnikov karcinoma endometrija. Ker vseh teh študijah, tudi naša, so bili relativno majhna, je bilo omejeno zmožnost za opravljanje močnejši analizo, ki temelji na haplotip, da je analiza ene same alel ali procesnega učinka [34].
To je prvo poročilo, da naše znanje, ki vključuje TGFB1
and VEGF
polimorfizmov in preživetje pri bolnikih želodca z rakom v glavnem sestavljeni iz kavkaškega prebivalstva; Vendar pa je bilo nekatere omejitve za te študije. Čeprav smo poskušali zbrati podatke ponovitve na teh bolnikov, nismo mogli raziskati to končno točko zaradi pomanjkanja vnaprej določenega spremljanja načrta. Druga omejitev je dejstvo, da smo vključili le tri skupne TGFB1
SNP in tri VEGF
SNP. Možno je, da so bile nekatere druge pomembne SNP zgrešil ali da so lahko opaženi združenja zaradi drugih polimorfizmi v LD s SNP smo preučevali. Prav tako so bili na voljo za analizo genotip-fenotipa primerjalno Ni podatkov o ravni beljakovin v serumu /plazmi, ker so bili na voljo od teh bolnikov je le vzorce DNK. Obstajajo še drugi geni poleg do TGFB1
in VEGF
, ki prav tako igrajo vlogo pri rasti celic in angiogenezo, ki predstavljajo kompleksno prepletanje številnih aktiviranje in zaviralnih dejavnikov [38]. Poleg tega je Helicobacter pylori
okužbe, prisotnost ali odsotnost, ki ni bilo v tej raziskavi, velja, da je vzrok za postopno kopičenje genotipskimi spremembami raka želodca, ki lahko privede do sporadične želodca rakotvornost raka [39 ]. Končno je velikost študija premajhna, da bi imeli dovolj moči za odkrivanje majhnih ur. Na primer, naš izračun po moči je predlagal, da je velikost vzorca za enako število (n = 55) oseb, v vsaki genotipa vsakega SNP, moč zaznati HR 2, je bil < 0,4, a > 0,8 za HR od 3.4 za časa sledenja 5 let. Zato je le ugotovitev HRS za 2-letno preživetje TGFB1
+ 915G > C bi imel dovolj moči, kar kaže, bi bila potrebna veliko večja študija za učinkovito testiranje našo hipotezo za učinke celotnega preživetja
. Zaključek
Če povzamemo, smo ugotovili, da so nekateri polimorfizmi TGFB1
in VEGF
je lahko povezan z 1- ali 2-letne stopnje preživetja bolnikov z rakom želodca. Vendar pa je ta študija je majhen, in različnih genetskih in epigenetske dogodki lahko privedlo tudi do povezave med TGFB1
in VEGF
polimorfizmov in želodca prognoza in preživetje raka. Zato so potrebna za odpravo omejitve v tej študiji (zlasti podatke o Helicobacter pylori
okužbe) in dodatno potrjujejo naša stališča, večja in bolj izdelane študije.
Kratice
TGF-β1
:
Preoblikovanje rastni faktor beta 1
VEGF
:
žilnega endotelija rastnega faktorja
LD:
vezavno neravnotežje
PCR-RFLP:
polimerazo dolžina odziva omejitev fragment polimorfizem
ALI: razmerje
kvote
HR:
razmerje ogroženosti
CI:
interval zaupanja
SNP.
polimorfizma posameznih nukleotidov
deklaracij
Zahvala
Ta študija je bila podprta delno National Institutes of Health podeljuje R01 scenarija 11740-07 in CA 131274-01 (na QW) in CA 16672 (na MD Anderson Cancer Center). Zahvaljujemo Margaret Lung in Kathryn Patterson za njihovo pomoč pri zaposlovanju predmete; Li-E Wang, Zhensheng Liu, Yawei Qiao, Min Zhao, Jianzhong On in Kejin Xu za njihovo laboratorijsko pomoči; in Diane Hackett in Maude Veechfor znanstveno urejanje
Electronic dodatnega materiala
13046_2009_181_MOESM1_ESM.doc Dodatna datoteka 1:. TGFB1 in VEGF genotip distribucije in celokupno preživetje. Podatki, ki predstavljajo statistično analizo TGFB1 in VEGF genotipov distribucije in celotnem preživetju. (DOC 69 KB) 13046_2009_181_MOESM2_ESM.doc Dodatne datoteke 2: TGFB1 in VEGF genotip distribucij in 1-in 2-letno preživelih. Podatki, ki predstavljajo statistično analizo TGFB1 in VEGF genotipov distribucije in 1 in 2-letno preživelih. (DOC 66 KB) avtorjev originalnih predloženi datoteke za slike
Spodaj so povezave do avtorjev prvotna predloženih spisov za slike. Izvirna datoteka 13046_2009_181_MOESM3_ESM.pdf avtorjev na sliki 1 Konkurenca interesov
Avtorji izjavljajo, da nimajo konkurenčnih interesov.

• Validacija nove metode, ki združuje tako HER2 imunohistokemično in HER2 dual-srebrni barvi in ​​situ hibridizacije na eno stekelce za raka želodca testing
• Dokazno sklepanje model, ki temelji na diagnozo bezgavkah metastaze raka želodca