Polimorfizmas iš TGFB1 ir VEGF genai ir išlikimas pacientams, sergantiems skrandžio cancer

polimorfizmas iš TGFB1 parsisiųsti ir VEGF
genų ir išlikimo pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu
tezės
Background pervežimas Kai TGFB1 parsisiųsti ir VEGF
polimorfizmas yra manoma, kad būti funkcionalus. Atsižvelgiant į tai, kad šie genai dalyvauja naviko augimą ir progresavimą, įskaitant angiogenezę, platinimas ir invazijos, mes iškėlė hipotezę, kad šie polimorfizmas būtų susijęs su išgyvenimo pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu.
Metodai
Mes genotipiškai TGFB1
-509 C > T, 1869 T > C, ir 915 G > C temperatūroje ir VEGF
-1498T > C, -634G > C ir + 936C > T 167 pacientams, sergantiems skrandžio vėžio. Naudojant Kaplan ir Meier metodą, log-rank bandymus ir Cox proporcinės pavojingumo modeliai, Mes įvertinome asociacijas tarp TGFB1 parsisiųsti ir VEGF
variantus su bendra 1 metų ir 2-jų metų išgyvenimo.
Rezultatai
Nors nebuvo jokių reikšmingų skirtumų bendrojo išgyvenamumo procentas tarp visų tirtų polimorfizmas, pacientai, sergantys TGFB1
+ 915CG ir CC genotipų turėjo blogesnę 2 metų išgyvenamumas (pakoreguota šanso santykis (ŠS), 3,06; 95% pasikliautinasis intervalas (PI), 1,09-8,62; P
= 0,034), nei pacientams su GG genotipą turėjo. Be to, pacientams Heterozigotinių už VEGF
-634CG taip pat turėjo blogesnę 1 metų išgyvenamumas (Pritaikytas vyriausiajam įgaliotiniui, 2,08; 95% CI, 1,03-4,22; P
= 0,042), nei pacientams su -634GG genotipo <. Br> Išvada
Mūsų tyrimas parodė, kad TGFB1
+ 915CG /CC VEGF
-634CG genotipai gali būti susijęs su trumpalaikio išgyvenimo skrandžio vėžiu sergantiems pacientams. Tačiau didesnės tyrimai yra reikalingi patikrinti šias išvadas.
Įvadas
skrandžio Caner, pacientai su pačiais clinicopathologic charakteristikų ir tų pačių gydymo režimus gali turėti skirtingus klinikinius rezultatus. Nors etapas yra pats geriausias įmanomas klinikinė priemonė naviko agresijos ir prognozei, yra aiškiai svarbūs skirtumai netgi toje pačioje naviko stadijos [1, 2]. Todėl būtų naudinga pagerinti prognostinę tikslumą nustatant lengvai prieinamas molekulinius žymenis, kad prognozuoti kai kurių klinikinių rezultatų variacijos. Pastaraisiais dešimtmečiais daugelis tyrimų parodė, kad genetiniai pakitimai žaisti vaidmenis plėtrą ir progresavimo skrandžio vėžiu [3]. Tarp šių molekulinių žymenų, vieno nukleotido polimorfizmas (SNP) yra dažniausiai tiriama genetinės variacijos, kad gali prisidėti prie pacientų klinikinių rezultatų [4].
Epidemiologiniai ir klinikiniai tyrimai parodė, kad tiek TGF-β1 ir VEGF gali atlikti svarbų vaidmuo skrandžio onkogenezei [5, 6]. Pavyzdžiui, TGFB1 parsisiųsti ir VEGF
variantai yra susiję su pakitusiu baltymų produktų, kurie gali prisidėti prie svyravimas individualaus jautrumo vėžio ir klinikinių rezultatų [4]. Tiek TGFB1 parsisiųsti ir VEGF
genai yra labai polimorfinės, kaip pranešama, turintys 168 ir 140 variantus, atitinkamai, tačiau tik nedaugelis iš šių variantų yra per steigėjui arba kodavimo regionus, kurie gali būti potencialiai funkcionalus http: //www. ncbi. NLM. NIH. valst /SNP /. Iš šių variantų, keletą SNP buvo apibūdinamas kaip svarbus moduliavimo genų funkcijas [7-9] ir pranešama, dalyvauja įvairių vėžio [10-13] etiologijos.
TGF-β1 kelias yra kritiškai dalyvauti auglių vystymuisi ir progresavimą. Naviko ląstelių kultūrų, TGF-β1 turi anti antiproliferacinės poveikį ir gali blokuoti naviko progresavimo savo veiklos pirminiuose etapuose, o jis taip pat gali pagreitina invazija ir metastazes vėlesniuose etapuose naviko progresavimo [14, 15]. Vienas eksperimentinis tyrimas "pranešė, kad TGF-β1 tarpininkaujant aktyvavimo Alk5-SMAD 3 kelio yra būtina, kad Ša baltymų skatinti judrumą ir invaziškumo skrandžio vėžio ląstelių [16]. Pelės eksperimentai parodė, kad pakitęs TGF-β1 buvo susijęs su paslėptų TGF-β1 surišančių baltymų, gali sukelti uždegimą ir navikai [17] ir kad sutrinka TGF-β1 kelias gali sukelti naviko augimą didinant naviko angiogenezę sukelto sumažėjusio išraiškos iš thrombospondin-1 [18]. Žmonėms, TGF-β1 turėjo didesnį jautrumą nei kancerogenezės-embriono antigenų vėžinių ląstelių nuo skrandžio vėžiu sergančių pacientų [16]. Be to, abu eksperimentiniai ir Klinikos-patologinių tyrimų pasiūlė vaidmenį VEGF šeimos baltymų metastazių per limfinę sistemą ir klinikinių rezultatų keliose žmogaus solidinių navikų, įskaitant skrandžio vėžio [19].
Šiame tyrime mes pasirinko genotipo pasirinktą dažni (ty nepilnametis alelio dažnis > 0,05) TGFB1 parsisiųsti ir VEGF
SNP, kad arba sukelti ne tapatinti aminorūgščių pakeitimų [20] arba buvo susiję su mažesnėmis ekspresijos lygio šių genų [ ,,,0],8, 21], kuris reiškia šiuos SNP gali būti funkcionalus. Mes iškėlė hipotezę, kad potencialiai funkciniai polimorfizmas į TGFB1 ir VEGF būtų susijęs su klinikiniais rezultatais pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu. Tiksliau, mes
įvertino tarp klinikinių rezultatų skrandžio vėžio, įskaitant bendro išgyvenamumo asociaciją, ir kiekvienas iš šių VNP-ai: trys TGFB1
VNP-ai, įskaitant vieną promotoriaus SNP (-509 C > T) ir dviejų Exon 1 VNP-ai (869 T > C ir 915 G > C) ir trijų VEGF
VNP-ai, įskaitant vieną promotoriaus SNP (-1498T > C), vienas 5'-netransliuojamoje regionas SNP (-634G > C) ir vieną 3'- neišverstas regionas SNP (936 C > T),
metodai
tyrimas gyventojų
Svetainės perspektyvinę analizę sudarė 167 pacientų, sergančių naujai diagnozuota ir histologiškai patvirtinta skrandžio vėžio, kurie buvo gydomi Texas MD Anderson vėžio universitete. centras, Hiustonas, Teksasas tarp 2003 balandžio ir 2008 liepos tyrimo protokolas buvo patvirtintas mūsų institucinės priežiūros valdyba (IRB) ir visiems pacientams suteikė informuoti sutikimą, taikydamos IRB-patvirtintą informuotas sutikimas formą. Atmetimo kriterijai įtraukti tuos, kurie naujai diagnozuota ir tie, kurie buvo gydomi kitur prieš atvykdami į M. D. Anderson. Šie pacientai buvo įtraukti į šią analizę, nes jų saugomi kraujo mėginiai buvo galima DNR ekstrakcijai.
Genotipo
Genomo DNR buvo išgaunamas iš Leukocitų kailio frakcija kraujo mėginį kiekvienam pacientui naudojant Kraujo Mini Kit (Qiagen, Valensija, Kalifornija), pagal gamintojo instrukcijas. DNR grynumas ir koncentracija buvo nustatomas pagal spektrofotometru matuojant absorbciją prie 260 ir 280 nm UV spektrofotometru. Trys pažymėtus TGFB1
SNP [vienas (-509 C > T /rs1800469) į promotoriaus ir du (869 T > C /rs1800470 ir 915 G > C /rs1800471) egzono 1] ir trijų promotoriaus VEGF
SNP [vienas (-1498T > C /rs833061) į rengėjas, vienas (-634G > C /rs2010963) į 5'-neišverstas regione, ir vienas (+ 936C > T /rs3025039) į 3'-neišverstas regionas] buvo nustatytas genotipas naudojant polimerazės grandininė reakcija (PGR) - apribojimas fragmentas ilgio polimorfizmo (aleliai) metodą. Genotipai iš TGFB1
VNP-ai buvo nustatyti, kaip aprašyta anksčiau [22], taip pat buvo pranešta anksčiau tiriant VEGF
VNP-ai [23]. Dėl PGR RFLP įsikūrusio genotipo nustatymo tyrimai, du mokslinių tyrimų asistentai nepriklausomai skaityti gelio nuotraukas, ir buvo atlikti pakartotiniai tyrimai, jei jie nesutiko išbandyto genotipą. Be to, pakartotiniai tyrimai buvo atlikti atsitiktinai atrinktų 10% mėginių buvo atsitiktinai atrinkti atlikti pakartotinius tyrimus, atliekamus su rezultatai yra 100% Współbrzmieniowy.
Rezultatai duomenų rinkimą
Visi 167 skrandžio vėžio pacientų buvo prieinama tolimesni iki duomenimis apie rezultatus. Bendras išgyvenamumas laikas buvo skaičiuojamas nuo įregistravimo dienos, M. D. Anderson su praėjusių kontakto ar mirties datos. Pacientai, kurie vis dar buvo gyvi paskutinę kontakto buvo laikomi cenzūruojamos įvykio analizei. Amžius, diagnozės, lyties, ir tipo gydymo (t.y. chirurgijos ir chemoterapijos) buvo naudojami kaip kintamųjų analiz. Amžius, diagnozė buvo suskirstyti į dvi grupes pagal amžiaus vidurkis (≤ 57 ir > 57 metai).
Statistinė analizė
Dvipusis chi kvadrato ir buvo atlikta T
testai, siekiant nustatyti statistiškai reikšmingų skirtumų tarp kategorinių kintamųjų (pvz į TGFB1 parsisiųsti ir VEGF
alelių ir genotipų) demografinių kintamųjų ir klinikiniais požymiais paskirstymo ir tolydžiojo kintamųjų (pvz, amžius ir išgyvenimo laikas), atitinkamai priemonėmis. Iš genotipų pasiskirstymas buvo analizuotos nukrypimas nuo Hardy-Weinberg pusiausvyros (HWE), ir dėl tos pačios geno variantų haplotipas buvo rekonstruota pagal fazės programą [9], kuriuo kiekvieno individo tikimybė turėti tam tikrą haplotipas pora buvo apskaičiuota ir haplotipas pora su didžiausia apskaičiuota tikimybė buvo priskirtas individualiai. Pearson chi-kvadrato ar pasaulio testas buvo naudojamas patikrinti, išgyvenimo skirtumų tarp pacientų pagal visus haplotipų. Bendras išlikimą tarp trijų genotipo grupių kiekvieno SNP buvo analizuojami naudojant Kaplan-Meier metodu, o log-rank testas buvo naudojamas tyrimas išgyvenimo paskirstymo suskirstyti pagal genotipus lygybės. Mes naudojome vienmatės ir daugiamatis Cox proporcinės rizikos modelius įvertinti kiekvieno genotipo įtaką išlikimo kitų kintamųjų buvimą. Tiek diagnozės amžius ir laiko intervalas tarp registracijos ir diagnostika datos (patologinis patvirtinimo ligos) buvo traktuojami kaip skaitinius kintamuosius į Cox modelis. Norėdami patvirtinti proporcingas pavojų prielaidą A Cox regresijos modelį, mes pridėjome laiko priklausomą kintamąjį modelio, o prielaida buvo patvirtinta. Rizikos santykis (HRS) ir jų atitinkami 95% patikimumo intervaluose (CIS) buvo apskaičiuojamas koreguojant kitų kintamųjų to paties modelio. Taip pat buvo įvertintos bendros poveikį atitinkamai TGFB1 parsisiųsti ir VEGF
VNP-ai ir jų sąveikos su rūkymas ir alkoholio vartojimas skrandžio vėžio riziką. Visi statistiniai testai buvo 2-sided, su P, pervežimas vertės 0,05 laikomas svarbiu ir visi buvo apskaičiuotas naudojant SAS programinę įrangą (versija 9.1; SAS Institute, Cary, NC).
Rezultatai
Charakteristikos tiriamos populiacijos
klinikiniai požymiai ir patologiniai bruožai 167 pacientų, dalyvavusių šiame tyrime yra parodyta 1 lentelėje nebuvo 114 vyrai (68,3%) ir 53 moterys (31,7%), kurių amžius svyravo nuo 32 iki 89 metų. Naudojant Cox regresijos analizę tarp bendro išgyvenamumo ir clinicopathologic savybių santykį, mes nustatėme, kad nei amžius, lytis, tautybė, rūkymas, nei alkoholio statusas, buvo statistiškai susijęs su bendram išgyvenamumui (p
= 0.339, 0.988, 0.297, 0.475, 0,809, atitinkamai) .table 1 Charakteristikos tiriamos populiacijos pacientams, sergantiems skrandžio vėžiu
Info
Nr Ligonių
kodas mirčių

MST (mėnesiais) pervežimas pervežimas P
*

Viso temų
Amžius (vidurkis) pervežimas 167
60
0.339
≤57 metų
68
27
21,2
> 57 metai
99
33
31,0
Lytis
0.988 pervežimas Vyras
114
41
23,3
Moteris
53
19
28,9
Tautybė
0,297
Balta
117
45
28,8
nebaltaodžių †
50 15
19,1
Rūkymas
0.475
Niekada
34
14
20,6
Ever
133
46
30,1
Alkoholis
0,809
Niekada
62 23
23,2
kada
105
37
29,3
kur
0,069
Skrandžio
118
36
24,3
stemple
25
13
27,2
seks
24
11
16,6
histologijos
0,356
žarnyno
118
45
28,1
Sygnet
49
15
24,6
diferenciacija
0.694
Poor
96
37
21,8 pervežimas vidutinio prasta
28
10
29,8 pervežimas vidutinio Na
42
13
22,6
Klinikinė stadija
< 0.001
I + II
65
9
30,4
III + IV
101
51
22,7 pervežimas metastazių
< 0.001
taip
90
49
21,2
ne
77
11 34,2
Chemoterapija
< 0.001
taip
121
54
26,3
ne
46
6 10,4
chirurgijos
< 0.001
taip
63
11
39,2
ne
104
49 18,4
Santrumpos: MST, išgyvenamumo mediana laikas; Seks, gastroezofaginio sankryžos.
* Chi kvadrato testas.
† Įtraukta 13 azijiečių, 16 juodi, 19 lotynų ir 2 Gimtoji indėnai.
118 (70,7%), navikai pacientai buvo įsikūręs skrandžio ir tie 49 (29,3%) pacientų buvo įsikūręs gastroezofaginio sankryžos (seks). Nepriklausomai nuo naviko vietos, visi pacientai turėjo adenokarcinoma. Iš jų 118 (70,7%) pacientai žarnyno ir 49 (29,3%) antspaudo žiedas. Mes sugrupuoti diferenciacijos tipus į šias tris kategorijas: Blogas, vidutinio skurdžių ir vidutinio gerai, o skaičius ir procentas šių trijų grupių buvo 96 (57,8%), 28 (16,9%) ir 42 (25,3%), atitinkamai. Visiems pacientams, Klinikos-patologinis charakteristikas, įskaitant naviko vietą, histologijos ir diferenciacijos statuso nebuvo reikšmingai susijęs su bendro išgyvenamumo į vieną požymį analizė (P
= 0,069, 0,356 ir 0.694, atitinkamai). Klinikiniai auglio stadijos pagal Tarptautinius Sąjunga nuo vėžio (UICC) kriterijai buvo tokie: 65 (38,9%) turėjo I etapas ir II ir 101 (61,1) buvo etapas III + IV (1 lentelė)
Tarp 167 pacientų. 121 (72,4%) gavo chemoterapiją, ir 63 (37,7%) gavo operacijos; ties tolesnių laikotarpio pabaigoje, 60 (35,9%) pacientai mirė. Vidutinė tolesnių laikas buvo 18,0 ± 13,3 mėnesio, o pacientams, kurie dar buvo gyvi, o vidutinis išgyvenamumo laikas visiems pacientams buvo 29,4 mėnesių. Išplėstinė etapas, metastazės, chemoterapinis ir chirurgija visi buvo susiję su bendrojo išgyvenamumo (p
< 0,001 visi) (1 lentelė). Pavyzdžiui, vidutinis išlikimo laikas buvo 34,2 mėnesių pacientams be metastazių ir 21,2 mėnesiai turintiems metastazių. Tie, kurie gavo chemoterapiją ir chirurgija buvo ilgesnis Vidutinė gyvenimo trukmė nei tie, kurie to nepadarė (26.3 mėnesius lyginant su 10,4 mėnesių chemoterapijos ir 39.2 mėnesius, palyginti su 18,4 mėnesių operacijos).
HWE, susiejimo disbalansui ir haplotipų TGFB1 ir VEGF
dėl TGFB1
, vienas iš trijų VNP-ai (rs1800469C > T rs1800470T > C ir rs1800471G > C) nebuvo HWE (p
< 0,05 rs1800469C > T), tai rodo galimą atrankos paklaidą, tačiau nė vienas VEGF
VNP-ai (rs833061T > C, rs2010963G > C ir rs3025039C > T) nukrypo nuo HWE (P, pervežimas > 0,05 visiems). Nė vienas iš TGFB1
arba VEGF
VNP-ai porų buvo didelė šarnyro sutrikimą (t, R 2 tarp 0.039 ir 0.541, visi < 0,08). Tik keturios TGFB1
haplotipas ir penki VEGF
haplotipas turėjo alelėms dažnį > 0,05 (CTG, 0.570; CCG, 0.190; TCG, 0.167 ir CCC, 0,063 už TGFB1 parsisiųsti ir CGC, 0,344; TCC, 0,287; TGC, 0,192; CGT, 0.072 ir TCT, 0,051 už VEGF
). Dėl mažo imties dydžio, mes ne apskaičiuoti diplotypes.
TGFB1 ir VEGF genotipas paskirstymus ir bendras išgyvenamumas
Kai visi skrandžio vėžiu sergantiems pacientams buvo analizuojami bendrojo išgyvenamumo, nėra reikšmingas skirtumas randamas vidutinis išlikimo paskirstymo laikas genotipų už bet kurį iš polimorfizmas mokėsi. Nes ten buvo keletas dalyvių nedidelių homozigotinių variantas grupėms, mes sujungėme heterozigotinės ir smulkius variantas homozigotiniai genotipus kartu papildomą analizę, darant prielaidą, kad dominuojančią genetinę modelį, tačiau vis dar nebuvo ryšio tarp nustatytų polimorfizmas ir bendrojo išgyvenamumo (žr Papildoma failą 1) , Be to, kai skrandžio vėžiu sergančių pacientų buvo suskirstyti pagal amžių, lytį, tautybę ir metastazių, jokio skirtumo distributyve pagal Vidutinė gyvenimo trukmė Iki šešių VNP-ai buvo rastas tarp pogrupių (žr Papildoma failą 1).
TGFB1 ir VEGF genotipas skirstiniai ir 1-ir 2-jų metų išgyvenamumo
Kadangi prognozės paprastai yra menkas pažangių atvejais skrandžio vėžiu, išgyvenamumo mediana retai priartėja 1 ar 2 metų [2]. Šiame tyrime, dauguma atvejų buvo IV stadijos (101/167) su išgyvenamumo mediana laiko tik 16,2 mėnesių (95% PI 12,8-24,9). Todėl mes taip pat apskaičiavo 1 metų ir 2-jų metų išgyvenimo pacientams, sergantiems skirtingų genotipų (žr Papildoma failą 2). Bendras 1 metų ir 2 metų išgyvenamumo visiems pacientams buvo 51,5% ir 22,1%, atitinkamai. Nors nebuvo jokių reikšmingų skirtumų tarp išgyvenimo tarp daugumos genotipų, pacientai, sergantys TGFB1 +
915CG /CC genotipų turėjo 1 metų ir 2 metų išgyvenamumas geriau nei tie su GG genotipą (Pritaikytas vyriausiajam įgaliotiniui, 2.13; 95% PI , 0,76-6,01; P
= 0,122 ir pakoreguota HR 3,06; 95% PI, 1,09-8,62; P
= 0,034, atitinkamai) (1 pav.) Be to, pacientai Heterozigotinių už VEGF
-634CG taip pat turėjo geresnį 1 metų išgyvenamumas (pritaikytas RS, 2,08; 95% PI, 1,03-4,22; P
= 0,042), nei tie, su VEGF UAB - 634 VS genotipas. 1 pav Suvestiniai išgyvenimo funkcijos genotipų TGFB1 915 G > C (rs1800471) ir VEGF -634G >. C (rs2010963)
toliau analizuota derinant aleliai, genotipus ir haplotipų to paties geno nepagrindė išvados iš vienintelis lokusas analizė (duomenys neparodyti), iš dalies dėl mažo LD tarp VNP-ai ir mažų studijų dydžio, kad neleido toliau stratifikacijos analizės.
Diskusijos
skrandžio vėžio etiologiją yra daugiaveiksnė, multigenetic ir daugiapakopis [24, 25]. Ji yra žinoma, kad kancerogenezėje metu, TGF-β gali pereiti iš auglio slopinamojo į naviko stipriklis vėlesnėse stadijose vėžio [26]. Su dvejopą vaidmenį vėžio išsivystymo, yra didelis susidomėjimas analizuojant genetinės variacijos vaidmenį TGFB1
vėžio progresavimo ir pacientų išgyvenimo. Pavyzdžiui, TGFB1
-509C > Įrodyta T ir rs1982073 (arba rs1800470) polimorfizmas turi būti susijęs su krūties vėžio išgyvenimo Kinijos gyventojų [27-30] ir chemoradioterapija atsako 175 Suomijos pacientams, sergantiems galvos ir kaklo suragėjusių vėžys [31], atitinkamai. Tačiau nei TGFB1
+ 869T > C, nei + 915G > C polimorfizmas parodė jokios asociacijos su naviko recidyvo ir progresavimo pūslės navikų be raumenų invazinis Ispanijos gyventojų [32]. Nors korėjiečių tyrimas parodė, kad variantas T genotipų iš TGFB1
-509C > T SNP buvo susijęs su mažesniu plaučių vėžio rizika [33], Kinijos studijos 414 pacientų ir 414 kontrolės [34] pranešė, kad genotipų nebuvo susijęs su bendra rizika susirgti skrandžio vėžį, bet su sumažėjo rizika rizika I etapas arba II skrandžio vėžio. Tačiau nė išlikimo analizės buvo pristatyta šių tyrimų.
Kaip minėta, neradome jokių statistinių įrodymų, pagrindžiančių didelę asociaciją tarp TGFB1
polimorfizmas ir bendro išgyvenamumo skrandžio vėžio. Tačiau reikšmingas ryšys tarp TGFB1 +
915 CG /CC genotipų ir 2 metų išgyvenamumas visiems skrandžio vėžiu sergančių pacientų rodo, kad šio TGFB1
variantas galėjo susilpnintas kaip naviko slopintuvas į ankstesniame etape į TGF-β1 vaidmenį naviko progresavimo. Ji taip pat žinoma, kad TGF-β1 gali pereiti iš auglio slopinamojo į naviko stipriklis pabaigoje etape vėžio [26]. Kai augliai išaugo daugiau ir tapti metastazavusiu, dėl to padaugėjus somatinių mutacijų ar laimėjimų onkogenų kopijų galėjo didesnė už slopinamąjį variantų vėlesniuose etapuose naviko vaidmenį, todėl nėra bendro išgyvenamumo pacientų skirtumą su skirtingų genotipų į TGFB1 +
915 G > C SNP. Tačiau tai spekuliacijos turi būti patvirtintas griežčiau skirtos tyrimų su daug didesniu imties dydžio ir daugiau informacijos apie mutacijos spektro navikai.
VEGF, kaip pagrindinis tarpininkas angiogenezę, taip pat vaidina svarbų vaidmenį kuriant vėžio. taip pat buvo įrodyta VEGF
polimorfizmas turi būti susijęs su išlikimo tiek skrandžio vėžio ir gaubtinės ir tiesiosios žarnos vėžio [35, 36]. Tačiau rezultatai iš paskelbtų tyrimų likti nenuosekli, o ne galutiniai. Be graikų skrandžio vėžiu ir tyrimo penkių VEGF pervežimas VNP-ai (-2578C > A -1154G > A -634G > C -460T > C iki + 936C > T) 312 pacientų [36], VEGF
-2578 AA -634 CC + 936TT genotipai buvo susijęs su žymiai mažesnę HR (geriau išgyvenimo) 6 metų išlikimo storosios žarnos vėžio. Įdomu tai, kad dar anksti Graikų tyrimas 100 skrandžio vėžiu sergančių pacientų teigė, kad tik VEGF
-634CC /CG genotipai buvo susijęs su sumažėjusiu (prastesne išlikimo) 10 metų išgyvenamumas, palyginti su GG genotipą [35]. Mūsų duomenys apie 167 skrandžio vėžiu sergančių pacientų nurodė, kad VEGF
-634CC /CG vežėjai iš tiesų turėjo prastą 1 metų išgyvenamumas nei tie, su VEGF
-634 GG genotipą. Amano ir kt. [37] taip pat pranešė, kad joks reikšmingas ryšys buvo pastebėtas tarp VEGF
-460T >dažnių C + 405G > C ir 936C > T genotipų ir 3 metų ligos reiškinių išgyventas Gimdos gleivinės vėžio pacientų japonų tyrimas 105 endometriumo karcinoma sergantiems pacientams. Nes visų šių tyrimų, įskaitant mūsų, buvo santykinai nedideli, ten buvo ribotas gebėjimas atlikti daugiau galingas haplotipas pagrindu analizę, kad iš vieno alelio ar locus poveikio [34] analizė.
Tai pirmoji ataskaita, kuri mūsų žinios, įtraukiant TGFB1 parsisiųsti ir VEGF
polimorfizmas ir išlikimas skrandžio vėžiu sergančių pacientų, daugiausia sudarytus iš Kaukazo gyventojų; Tačiau, ten buvo tam tikri apribojimai, šio tyrimo. Nors mes bandėme surinkti pasikartojimo duomenis apie šių pacientų, mes negalėjome ištirti šį galutinį tašką dėl iš anksto apibrėžta tolesnio plano trūkumas. Antrasis apribojimas buvo tai, kad mes įtraukti tik tris bendrus TGFB1
SNP ir tris VEGF
SNP. Tai yra įmanoma, kad kai kurie kiti svarbūs SNP buvo praleista, arba kad pastebėtas asociacijos gali būti dėl kitų polimorfizmas LD su VNP-ai mes studijavo. Be to, nėra duomenų apie serumas /plazmos baltymų lygį buvo galima už genotipo-fenotipas koreliacijos analizę, nes tik DNR mėginiai buvo gauti iš šių pacientų. Yra ir kitų genų to į TGFB1 parsisiųsti ir VEGF
, kad taip pat vaidina svarbų vaidmenį ląstelių augimą ir angiogenezę, atstovaujantys sudėtingą sąveiką daugelio įjungti ir slopinamasis veiksnių [38]. Be to, Helicobacter pylori
infekcija, buvimą arba nebuvimą, kurios nebuvo pranešė, kad šiame tyrime, yra manoma, kad būti laipsniškai kaupimo kodonų skrandžio vėžio priežastis, kurios gali sukelti atsitiktinio skrandžio vėžio kancerogenezėje [39 ]. Galiausiai tyrimas dydis buvo per mažas, kad turėtų pakankamą galią aptikti mažus val. Pavyzdžiui, mūsų po Galios apskaičiavimas pasiūlė, kad imties dydis vienodo skaičiaus (n = 55) tiriamųjų kiekvienoje kiekvieno SNP genotipo, maitinimo aptikti iš 2 valandą buvo < 0,4, bet > 0,8 dėl HR 3.4 už tolesnę laiko 5 metus. Todėl tik HRS 2 metų išlikimo TGFB1
+ 915G >išvada C turės pakankamai galios, o tai rodo daug didesnis tyrimas būtų reikalingas siekiant veiksmingai patikrinti mūsų hipotezę dėl poveikio bendrajam išgyvenamumui
. Išvada
Apibendrinant, mes nustatėme, kad kai polimorfizmas TGFB1 parsisiųsti ir VEGF
gali būti susijęs su 1 ar 2 metų išgyvenimo skrandžio vėžiu sergantiems pacientams. Tačiau ši studija yra mažas, ir įvairių genetinių ir Epigenetiniai renginiai taip pat galėjo lemti tarp TGFB1 parsisiųsti ir VEGF
polimorfizmas ir skrandžio vėžio prognozei ir išlikimo asociacijos. Todėl didesnis ir geriau skirtos studijos privalo įveikti šioje studijoje apribojimų (ypač informacija apie Helicobacter pylori
infekcijos) ir toliau patvirtina savo pastabas.
Santrumpos
TGF-β1
: Rīga, transformuojantis augimo faktorius Beta 1
VEGF
: Rīga, kraujagyslių endotelio augimo faktoriaus
LD:
susiejimas pusiausvyros sutrikimo
PGR RFLP: Rīga, polimerazės grandininė reakcija-apribojimas fragmentas ilgio polimorfizmo
arba: Rīga, šansų santykis
HR: Rīga, rizikos santykis
PI:
pasikliautinasis intervalas
SNP:.
vieno nukleotido polimorfizmas
deklaracijų
Padėka
šiame tyrime buvo iš dalies remiamą nacionalinių sveikatos institutų suteikia R01 PS 11740-07 ir CA 131274-01 (į QW) ir CA 16672 (į MD Anderson Cancer Center). Dėkojame Margaret plaučių ir Kathryn Patterson už jų pagalbą įdarbinant dalykus; Li-El Wang Zhensheng Liu Yawei Qiao Min Zhao, Jianzhong Jis ir Kejin Xu jų laboratorinei pagalbą; ir Diane Hackett ir Maude Veechfor mokslo redagavimo
Elektroninės papildoma medžiaga
13046_2009_181_MOESM1_ESM.doc Papildoma failą 1:. TGFB1 ir VEGF genotipas paskirstymus ir bendras išgyvenamumas. Pateikti duomenys atstovauti statistinę analizę TGFB1 ir VEGF genotipo paskirstymo ir bendrą išgyvenamumą. (DOC 69 KiB) 13046_2009_181_MOESM2_ESM.doc Papildoma failą 2: TGFB1 ir VEGF genotipas paskirstymus ir 1-o 2-jų metų išlikimas. Pateikti duomenys atstovauti statistinę analizę TGFB1 ir VEGF genotipo paskirstymo ir 1-o 2-jų metų išlikimas. (DOC 66 KiB) Autorių originalios pateikti failai vaizdų
Žemiau išvardintos nuorodos į autorių originalus pateiktų failų vaizdų. 13046_2009_181_MOESM3_ESM.pdf Autorių originalus failas 1 pav konkuruojančių interesų Viesbutis The autoriai deklaruoja, kad jie neturi jokių konkuruojančių interesų.

• Naujo metodo, apimantį HER2 imunohistocheminis ir HER2 dvejopo sidabrinė in situ hibridizacijos ant vienos skaidrės skrandžio karcinoma bandymų patvirtinimas
• Įrodymų vertinimo motyvai grindžiamas modelis diagnozuoti limfmazgių metastazių skrandžio vėžio