Polymorphismes de TGFB1 et des gènes VEGF et la survie des patients atteints de cancer

gastrique polymorphismes de TGFB1
et les gènes VEGF et de la survie des patients atteints de cancer gastrique
Résumé de l'arrière-plan
Certains TGFB1
et VEGF
polymorphismes sont soupçonnés d'être fonctionnelle. Étant donné que ces gènes sont impliqués dans la croissance et la progression tumorale, y compris l'angiogenèse, la diffusion et l'invasivité, nous avons supposé que ces polymorphismes seraient associés à la survie chez les patients atteints de cancer gastrique.
Méthodes
Nous génotypés TGFB1
-509 C > T, 1.869 T > C et 915 G > le -1498T >C et VEGF; C, -634G > C et + 936C > T dans 167 patients atteints de cancer gastrique. Les résultats obtenus en utilisant la méthode de Kaplan et Meier, log-rank essais, et Cox modèles de risques proportionnels, nous avons évalué les associations entre TGFB1
et les variantes VEGF de avec l'ensemble, 1 an, et le taux de survie à 2 ans. de
Bien qu'il n'y avait pas de différences significatives dans les taux de survie globale entre tous les polymorphismes testés, les patients avec + 915CG de TGFB1 et CC génotypes avaient une moins bonne 2 ans la survie (hazard ratio ajusté (HR), 3,06; intervalle de confiance à 95% (CI), 1,09 à 8,62; P = 0,034
) que les patients avec le génotype GG avait. En outre, les patients hétérozygotes pour VEGF de la -634CG ont également eu un taux de survie (HR ajusté, 2,08; IC 95%, 1,03 à 4,22; P = 0,042
) les plus pauvres de 1 an que les patients avec le génotype -634GG <. br> Conclusion
Notre étude suggère que + 915CG /la CC de TGFB1 et génotypes -634CG de VEGF peuvent être associés à la survie à court terme chez les patients atteints de cancer gastrique. Cependant, des études plus importantes sont nécessaires pour vérifier ces résultats.
Présentation
Dans caner gastrique, les patients présentant les mêmes caractéristiques clinico-pathologiques et les mêmes schémas de traitement peuvent avoir des résultats cliniques. Bien que le stade est la meilleure mesure clinique disponible de l'agression de la tumeur et le pronostic, il existe clairement des différences importantes, même dans le même stade de la tumeur [1, 2]. Par conséquent, il serait utile d'améliorer la précision pronostique en identifiant des marqueurs moléculaires facilement accessibles qui prédisent une partie de la variation des résultats cliniques. Au cours des dernières décennies, de nombreuses études ont montré que des altérations génétiques jouent un rôle dans le développement et la progression du cancer gastrique [3]. Parmi ces marqueurs moléculaires, les polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) sont la variation génétique la plus couramment étudiée qui peuvent contribuer à des résultats cliniques des patients [4] de. Les enquêtes épidémiologiques et cliniques ont suggéré que les deux TGF-β1 et VEGF peuvent jouer un rôle important rôle dans l'oncogenèse de l'estomac [5, 6]. Par exemple, les variantes de TGFB1
et VEGF sont associés à des produits protéiques modifiés, qui peuvent contribuer à la variation dans la sensibilité individuelle au cancer et les résultats cliniques [4]. TGFB1 deux hôtels et les gènes VEGF sont de très polymorphes, apparemment ayant 168 et 140 variantes, respectivement, mais seulement quelques-unes de ces variantes entrent dans le promoteur ou des régions qui peuvent être potentiellement fonctionnel codant http: //www. NCBI. nlm. nih. gov /SNP /. Parmi ces variantes, plusieurs SNP ont été décrits comme important dans la modulation des fonctions des gènes [7-9] et aurait impliqués dans l'étiologie de divers cancers [10-13].
La voie TGF-β1 est impliqué de manière critique dans le développement tumoral et la progression. Dans les cultures de cellules tumorales, le TGF-β1 a des effets anti-prolifératifs et peut bloquer la progression des tumeurs à un stade précoce, alors qu'il peut également accélère l'invasion et les métastases dans les derniers stades de la progression tumorale [14, 15]. Une étude expérimentale a rapporté que l'activation de TGF-β1 à médiation par la voie 3 ALK5-Smad est essentielle pour la protéine Shh pour favoriser la mobilité et le caractère invasif des cellules de cancer gastrique [16]. expériences souris ont également montré que modifié le TGF-β1 a été associée à des protéines de liaison de TGF-β1 latent qui peuvent provoquer une inflammation et des tumeurs [17] et que la voie du TGF-β1 perturbé peut conduire à une croissance tumorale en augmentant l'angiogenèse tumorale induite par la diminution de l'expression de la thrombospondine-1 [18]. Chez l'être humain, le TGF-β1 a une plus grande sensibilité que les antigènes carcinoembryonnaire dans les cellules tumorales de patients atteints de cancer gastrique [16]. En outre, les deux études expérimentales et clinico-pathologiques ont suggéré un rôle pour la famille de VEGF des protéines dans les métastases à travers le système lymphatique et des résultats cliniques dans plusieurs tumeurs solides humaines, y compris le cancer gastrique [19].
Dans cette étude, nous a choisi de génotype commune choisie (ie, mineur fréquence >allèle; 0,05) TGFB1
et VEGF de les SNP qui soit conduisent à changements d'acides aminés non synonymes [20] ou ont été associés à des niveaux d'expression plus faibles de ces gènes [ ,,,0],8, 21], ce qui implique ces SNP peut être fonctionnel. Nous émettons l'hypothèse que les polymorphismes potentiellement fonctionnels dans TGFB1 et VEGF seraient associés à des résultats cliniques chez les patients atteints de cancer gastrique. Plus précisément, nous
évalué l'association entre les résultats cliniques dans le cancer gastrique, y compris la survie globale, et chacun des SNP suivants: trois TGFB1
SNP, y compris un promoteur SNP (-509 C > T) et deux exon 1 SNP (869 T > C et 915 G > C) et trois VEGF
SNP, y compris un promoteur SNP (-1498T > C), une région SNP 5'-non traduite (-634G > C) et un 3'- région SNP non traduite (936 C > T) la population de l'étude de méthodes de
Cette analyse prospective se composait de 167 patients nouvellement diagnostiqués et histologiquement confirmé le cancer gastrique, qui ont été traités à l'Université du Texas MD Anderson cancer. Center, Houston, Texas entre Avril 2003 et Juillet 2008. le protocole d'étude a été approuvé par notre conseil Institutional Review (CISR) et tous les patients ont donné leur consentement éclairé à l'aide du formulaire de consentement éclairé IRB approuvé. Les critères d'exclusion ceux qui ne nouvellement diagnostiqués et ceux qui ont été traités ailleurs avant de venir à M. D. Anderson. Ces patients ont été inclus dans cette analyse car leurs échantillons de sang stockés sont disponibles pour l'extraction d'ADN de génotypage
ADN génomique de. On a extrait de la fraction de la couche leucocytaire de l'échantillon de sang de chaque patient en utilisant un kit Blood Mini Kit (Qiagen, Valencia, CA) selon les instructions du fabricant. la pureté et la concentration de l'ADN ont été déterminées par mesure spectrophotométrique de l'absorbance à 260 et 280 nm par un spectrophotomètre UV. Les trois sélectionnés TGFB1
SNPs [un (-509 C > T /rs1800469) dans le promoteur et deux (869 T > C /rs1800470 et 915 G > C /rs1800471) dans l'exon 1] et trois promoteur VEGF
SNPs [one (-1498T > C /rs833061) dans le promoteur, l'un (-634G > C /rs2010963) dans la région 5 'non traduite, et un (+ 936C > T /rs3025039) à l'extrémité 3' non traduite région] ont été génotypes en utilisant une réaction en chaîne par polymérase (PCR) - méthode de restriction de longueur des fragments de polymorphisme (RFLP). Les génotypes des SNP du TGFB1 ont été déterminés comme décrit précédemment [22] et des tests sur les SNP du VEGF ont également été rapportés précédemment [23]. Pour le test de génotypage basé sur la PCR-RFLP, deux assistants de recherche lus indépendamment les images de gel, et les essais répétés ont été effectués, si elles ne sont pas d'accord sur le génotype testé. En outre, des essais répétés ont été effectués sur un choisi au hasard 10% des échantillons ont été choisis au hasard pour effectuer les essais répétés avec les résultats étant 100% concordante.
Collecte de données Résultat
Tous les 167 patients atteints de cancer gastrique ont suivi disponibles les données sur les résultats. La durée de survie globale a été calculée à partir de la date d'enregistrement au M.D. Anderson à la date du dernier contact ou la mort. Les patients qui étaient encore en vie au dernier contact ont été considérés comme un événement censuré dans l'analyse. L'âge au moment du diagnostic, le sexe et le type de traitements (par exemple, la chirurgie et la chimiothérapie) ont été utilisés comme covariables dans l'analyse. L'âge au moment du diagnostic a été classé en deux groupes en fonction de l'âge moyen (≤ 57 et > 57 ans). Analyse statistique de
recto verso chi carré et t
tests ont été effectués pour déterminer quelle statistiquement des différences significatives dans les distributions de variables catégoriques (par exemple, le TGFB1
et VEGF de allèles et génotypes) par les variables démographiques et les caractéristiques cliniques et dans les moyens de variables continues (par exemple, l'âge et le temps de survie), respectivement. Les distributions des génotypes ont été testés pour la déviation de Hardy-Weinberg (HWE) et les haplotypes pour les variants du même gène ont été reconstruits en fonction du programme PHASE [9], par lequel la probabilité d'avoir une paire d'haplotypes particulière de chaque individu a été estimé, et la paire d'haplotypes avec la probabilité estimée la plus élevée a été attribuée à l'individu. test de chi carré ou mondial de Pearson a été utilisé pour tester les différences de survie entre les patients par tous les haplotypes. survivances globales entre les trois groupes de génotypes de chaque SNP ont été analysés en utilisant la méthode de Kaplan-Meier, et le test du log-rank a été utilisé pour tester l'égalité des distributions de survie stratifiées par les génotypes. Nous avons utilisé des modèles de risques proportionnels de Cox univariée et multivariée pour estimer l'effet de chaque génotype sur la survie en présence d'autres covariables. Tant l'âge au moment du diagnostic et de l'intervalle de temps entre l'enregistrement et la date de diagnostic (confirmation pathologique de la maladie) ont été traités comme covariables numériques dans le modèle de Cox. Pour confirmer l'hypothèse des risques proportionnels dans un modèle de régression de Cox, nous avons ajouté une variable dépendant du temps au modèle, et l'hypothèse a été confirmée. Les ratios de risque (RR) et leurs intervalles de confiance à 95% correspondant (IC) ont été calculés avec ajustement pour les autres covariables dans le même modèle. Les effets conjugués de la TGFB1
et VEGF de les SNP et leurs interactions avec le tabagisme et l'alcool sur le risque de cancer gastrique ont également été évalués. Tous les tests statistiques étaient 2 faces, avec une valeur de 0,05 P
considéré comme significatif et tous ont été calculés à l'aide du logiciel SAS (version 9.1; SAS Institute, Cary, NC). Des résultats de Caractéristiques de la population étudiée
caractéristiques cliniques et pathologiques des 167 patients inclus dans cette étude sont présentés dans le tableau 1. Il y avait 114 hommes (68,3%) et 53 femmes (31,7%), dont l'âge variait de 32 à 89 ans. En utilisant l'analyse de régression de Cox de la relation entre la survie globale et les caractéristiques clinico-pathologiques, nous avons constaté que ni l'âge, le sexe, l'origine ethnique, le tabagisme, ni le statut de l'alcool ont été statistiquement associés à la survie globale (P
= 0,339, 0,988, 0,297, 0,475, 0,809, respectivement) .Table 1 Caractéristiques de la population étudiée des patients atteints de cancer gastrique
Caractéristiques
No.
No. des patients Décès de
MST (mois)
P
*
Total des sujets: âge (moyenne)
167
60
0,339 68
27
21,2
>le
≤57 ans; 99
33
31,0
Sexe 57 ans
0,988
Homme
114
41
23,3
Femme de 53
19
28,9
Ethnicité
0,297
Blanc
117
45
28,8
non-blanc †
50
15
19,1
Smoke
0,475
jamais 34
14
20,6
Ever
133
46
30,1
alcool
0,809
jamais 62
23
23,2
jamais 105
37
29,3
Lieu
0,069
estomac
118
36
24,3
Oesophage
25
13
27,2
GEJ
24
15
24,6 de
118
45
28,1
Signet l'anneau de 0,356
Intestinal de> 11
16,6
histologie Différenciation
96
37
21,8
Modéré pauvres
0,694 Poor 28
10
29,8
Modéré-Well
42
13
22,6
stade clinique
< 0,001
I + II
65
9
30,4
III + IV
101
51
22,7
Métastase
< 0,001
oui
90
49
21,2
pas
77
11
34,2
Chimiothérapie
< 0,001
oui
121
54
26,3
pas
46
6
10.4
Chirurgie
< 0,001
oui
63
11
39,2
pas
104
49
18,4
abréviations: MST, durée médiane de survie; GEJ, gastroesophageal jonction.
* Test du chi carré.
† Inclus 13 Asiatiques, 16 noirs, 19 Hispaniques et 2 Indiens autochtones.
Les tumeurs de 118 (70,7%), les patients ont été situé à la estomac et ceux de 49 (29,3%) patients étaient situés à la jonction gastro-oesophagien (GEJ). Indépendamment de l'emplacement de la tumeur, tous les patients avaient un adénocarcinome. Parmi ceux-ci, 118 (70,7%) patients étaient intestinale et 49 (29,3%) chevalière. Nous avons regroupé les types de différenciation dans les trois catégories suivantes: pauvres, modérée pauvres et modérée bien, et le nombre et le pourcentage de ces trois groupes étaient 96 (57,8%), 28 (16,9%) et 42 (25,3%), respectivement. Chez tous les patients, les caractéristiques clinico-pathologiques, y compris localisation de la tumeur, l'histologie et de l'état de différenciation ne sont pas significativement associés à la survie globale dans l'analyse univariée (P = 0,069
, 0,356 et 0,694, respectivement). stades tumoraux cliniques selon les critères (UICC) International Cancer Union Against étaient les suivants: 65 (38,9%) avaient stade I stade + II et 101 (61,1) avaient III + IV (tableau 1)
Parmi les 167 patients. , 121 (72,4%) ont reçu une chimiothérapie et 63 (37,7%) ont subi une chirurgie; à la fin de la période de suivi, 60 (35,9%) patients étaient décédés. Le temps de suivi moyen était de 18,0 ± 13,3 mois pour les patients qui étaient encore en vie, et le temps moyen pour tous les patients de survie était de 29,4 mois. stade avancé, les métastases, la chimiothérapie et la chirurgie ont tous été associés à la survie globale (P
< 0,001 pour tous) (tableau 1). Par exemple, la durée moyenne de survie était de 34,2 mois pour les patients sans métastases et de 21,2 mois pour ceux qui ont des métastases. Ceux qui ont reçu la chimiothérapie et la chirurgie a eu une plus longue durée de survie moyenne que ceux qui ne l'a pas (26,3 mois contre 10,4 mois pour la chimiothérapie et 39,2 mois versus 18,4 mois pour la chirurgie).
HWE, déséquilibre de liaison et haplotypes TGFB1 et VEGF
pour TGFB1
, l'un des trois SNP (rs1800469C > T, rs1800470T > C et rs1800471G > C) n'a pas été en HWE (P
< 0,05 pour rs1800469C > T), ce qui suggère un biais de sélection possible, mais aucun des SNP du VEGF (rs833061T > C, rs2010963G > C et rs3025039C > T) quittaient HWE (P
> 0,05 pour l'ensemble). Aucun des paires de TGFB1
ou VEGF de les SNP étaient en déséquilibre de liaison élevée (à savoir, r 2 entre 0,039 et 0,541, tout < 0,08). Seuls quatre TGFB1
haplotypes et cinq VEGF
haplotypes avaient une fréquence allélique de > 0,05 (CTG, 0,570; GCC, 0,190; TCG, 0,167 et CCC, 0,063 pour TGFB1
et CGC, 0,344; TCC, 0,287; TGC, 0,192; CGT, 0,072 et TCT, 0,051 pour le VEGF
). En raison de la petite taille de l'échantillon, nous ne calculons les diplotypes.
TGFB1 et VEGF distributions génotypiques et la survie globale
Lorsque tous les patients atteints de cancer gastrique ont été analysés pour la survie globale, aucune différence significative n'a été trouvée dans les distributions de survie moyenne temps de génotypes pour l'une quelconque des polymorphismes étudiés. Parce qu'il y avait peu de participants dans les groupes de variantes homozygotes mineures, nous avons combiné les variantes génotypes homozygotes hétérozygotes et mineures ensemble pour une analyse supplémentaire, en supposant un modèle génétique dominant, mais il n'y avait toujours pas d'association entre les polymorphismes détectés et la survie globale (voir fichier complémentaire 1) . En outre, lorsque les patients atteints de cancer gastrique ont été stratifiés selon l'âge, le sexe, l'origine ethnique et l'état métastatique, aucune différence dans la distribution en fonction de la durée moyenne de survie par les six SNP a été trouvée parmi les sous-groupes (voir fichier supplémentaire 1).
TGFB1 et VEGF distributions génotypiques et 1-et survies 2 ans
Parce que le pronostic est généralement médiocre dans les cas avancés de cancer de l'estomac, la survie médiane se rapproche rarement 1 ou 2 ans [2]. Dans la présente étude, la plupart des cas étaient de stade IV (101/167) avec une durée médiane de survie de seulement 16,2 mois (IC à 95%, de 12,8 à 24,9). Par conséquent, nous avons également calculé les 1 an et 2 ans le taux de survie des patients atteints de différents génotypes (voir fichier supplémentaire 2). Les 1 an et 2 ans survivances globaux pour tous les patients étaient de 51,5% et 22,1%, respectivement. Bien qu'il n'y avait pas de différences significatives dans les taux de survie entre la plupart des génotypes, les patients avec TGFB1 +
915CG /CC génotypes avaient mieux de 1 an et 2 ans de survie que ceux avec le génotype GG (HR ajusté, 2,13; IC à 95% , 0,76 à 6,01; P = 0,122
et ajusté HR, 3,06; IC 95%, 1,09 à 8,62; P = 0,034
, respectivement) (figure 1). En outre, les patients hétérozygotes pour VEGF de la -634CG avaient également un meilleur taux de survie à 1 an (RR ajusté, 2,08; IC à 95%, de 1,03 à 4,22; P = 0,042
) que ceux avec le VEGF
- 634 génotype GG. Figure 1 Fonctions de survie cumulatifs des génotypes TGFB1 915 G > C (rs1800471) et VEGF -634G >. C (rs2010963)
analyses complémentaires combinant les allèles, génotypes et haplotypes du même gène n'a pas étayé les conclusions de l'analyse de locus unique (données non présentées), le rapport de partie à cause de la faible LD entre les SNP et la petite taille de l'étude qui n'a pas permis une analyse plus approfondie de la stratification.
l'étiologie du cancer gastrique est multifactorielle, multigenetic et plusieurs étages [24, 25]. Il est connu que lors de la carcinogenèse, le TGF-β peut passer d'un gène suppresseur de tumeur à un agent favorisant la tumeur dans les derniers stades du cancer [26]. Avec double rôle dans le développement du cancer, il y a un grand intérêt pour l'analyse du rôle de la variation génétique dans TGFB1
dans la progression du cancer et la survie des patients. Par exemple, -509C >du TGFB1; T et rs1982073 (ou rs1800470) les polymorphismes ont été montrés pour être associés à la survie du cancer du sein dans une population chinoise [27-30] et la réponse de la radiochimiothérapie dans 175 patients finlandais avec la tête et le cou squameux le cancer [31], respectivement. Cependant, ni TGFB1
+ 869T > C, ni + 915G > C polymorphismes ont montré une association avec la rechute et la progression tumorale dans les tumeurs de la vessie sans invasive musculaire dans une population espagnole [32]. Alors qu'une étude coréenne a montré que les génotypes variante T de -509C et le gt du TGFB1; T SNP ont été associés à un risque réduit de cancer du poumon [33], une étude chinoise de 414 patients et 414 contrôles [34] ont rapporté que les génotypes ne sont pas associés à un risque global de développer un cancer gastrique, mais avec une diminution du risque de risque de stade I ou II de cancer gastrique. Cependant, aucune des analyses de survie ont été présentés dans ces études.
Comme indiqué, on n'a pas trouvé de preuves statistiques pour soutenir une association significative entre TGFB1 de les polymorphismes et la survie globale dans le cancer gastrique. Cependant, l'association significative entre TGFB1 +
915 CG génotypes /CC et la survie de 2 ans pour tous les patients atteints de cancer gastrique suggère que la variante de ce TGFB1 peut avoir atténué le rôle du TGF-β1 comme un suppresseur de tumeur dans le stade antérieur de la progression tumorale. Il est également connu que le TGF-β1 peut passer d'un gène suppresseur de tumeur d'un activateur de tumeur à la fin du stade du cancer [26]. Une fois que les tumeurs avaient grossi et devenir métastatique, l'augmentation résultante de mutations ou de gains dans les copies des oncogènes somatiques peut avoir emporté sur le rôle des variantes suppresseurs dans les derniers stades de la tumeur, conduisant à aucune différence dans la survie globale des patients avec différents génotypes du TGFB1 +
915 G > C SNP. Cependant, cette spéculation doit être validée dans des études plus rigoureusement conçus avec une taille d'échantillon beaucoup plus large et plus d'informations sur le spectre de mutation dans les tumeurs.
VEGF, comme un médiateur clé de l'angiogenèse, joue également un rôle important dans le développement des cancers. VEGF par les polymorphismes ont également été démontré être associé à la survie tant dans le cancer gastrique et le cancer colorectal [35, 36]. Cependant, les résultats des études publiées restent incompatibles plutôt que concluante. Dans une étude grecque gastrique du cancer de cinq VEGF
SNPs (de -2578C > A, -1154G > A, -634G > C, -460T > C et + 936C > T) chez 312 patients [36], VEGF
-2578 AA, -634 CC et + 936TT génotypes ont été associés à une HR significativement plus faible (meilleure survie) pour la survie de 6 ans des cancers colorectaux. Fait intéressant, une autre étude grecque précoce de 100 patients atteints de cancer gastrique a suggéré que seuls les génotypes -634CC /CG
le VEGF ont été associés à une diminution (faible taux de survie) survie à 10 ans, par rapport au génotype GG [35]. Nos données sur 167 patients atteints de cancer gastrique indiqué que les transporteurs -634CC /CG de VEGF avaient en effet un faible taux de survie à 1 an que ceux avec -634 GG génotype du VEGF. Amano et al. [37] ont également signalé qu'aucune association significative n'a été observée entre les fréquences de -460T et le gt du VEGF; C, + 405g > C et 936C > T génotypes et la survie sans maladie à 3 ans des patients atteints de cancer de l'endomètre dans un japonais étude de 105 patients atteints de carcinome de l'endomètre. Parce que toutes ces études, y compris la nôtre, ont été relativement faibles, il y avait une capacité limitée d'effectuer l'analyse sur la base de haplotype-plus puissant que l'analyse d'un seul allèle ou pour effet de locus [34].
Ceci est le premier rapport, notre connaissance, impliquant les polymorphismes de TGFB1
et VEGF et la survie chez les patients atteints de cancer gastrique consistant principalement en une population de race blanche; cependant, il y avait des limites à la présente étude. Bien que nous avons essayé de recueillir des données de récurrence sur ces patients, nous ne pouvions pas enquêter sur ce point final en raison de l'absence d'un plan de suivi prédéfini. Une deuxième limite est le fait que nous ne avons inclus trois SNP communs TGFB1
et trois SNP VEGF
. Il est possible que d'autres SNP importants ont été manqués ou que les associations observées peuvent être dues à d'autres polymorphismes dans LD avec les SNP que nous avons étudié. En outre, aucune donnée sur les taux de protéines sériques /plasmatiques étaient disponibles pour l'analyse de corrélation génotype-phénotype, car seuls des échantillons d'ADN étaient disponibles auprès de ces patients. Il existe d'autres gènes en plus de TGFB1
et VEGF
qui jouent également un rôle dans la croissance cellulaire et l'angiogenèse, ce qui représente une interaction complexe de nombreux facteurs d'activation et d'inhibition [38]. En outre, l'infection de Helicobacter pylori, la présence ou l'absence de ce qui n'a pas été rapportée dans la présente étude, est considérée comme la cause d'une accumulation progressive de changements génotypiques dans le cancer gastrique, ce qui peut conduire à sporadique carcinogenèse du cancer gastrique [39 ]. Enfin, la taille de l'étude était trop petit pour avoir une puissance suffisante pour détecter de petites HRs. Par exemple, notre calcul post-puissance suggéré que la taille de l'échantillon pour un nombre égal (n = 55) des sujets de chaque génotype de chaque SNP, le pouvoir de détecter un HR de 2 était < 0,4, mais > 0,8 pour un HR de 3,4 pour une période de suivi de 5 ans. Par conséquent, seule la constatation de RSS pour la survie de 2 ans de + 915G >TGFB1; C aurait une puissance suffisante, ce qui suggère une étude beaucoup plus serait nécessaire pour tester efficacement notre hypothèse pour les effets de la survie globale
. Conclusion
En résumé, nous avons constaté que certains polymorphismes TGFB1
et VEGF
peuvent être associés à des taux de survie à 1 ou 2 ans des patients atteints de cancer gastrique. Cependant, la présente étude est de petite taille, et divers événements génétiques et épigénétiques peut aussi avoir conduit à une association entre TGFB1
et VEGF de les polymorphismes et le pronostic du cancer gastrique et la survie. Par conséquent, des études plus grandes et mieux conçues sont nécessaires pour surmonter les limites de la présente étude (en particulier les informations sur Helicobacter pylori
infection) et de confirmer davantage nos observations.
Abréviations
TGF-β1
:
facteur de croissance transformant bêta 1
VEGF
:
facteur de croissance vasculaire endothéliale
LD:
déséquilibre de liaison
PCR-RFLP: longueur des fragments de réaction de restriction
chaîne par polymérase polymorphisme
OU: rapport de cotes

HR:
hazard ratio
CI:
intervalle de confiance
SNP:.
polymorphisme nucléotidique simple
Déclarations Remerciements
Cette étude a été soutenue en partie par les Instituts nationaux de la santé accorde R01 ES 11740-07 et CA 131274-01 (à QW) et CA 16672 (MD Anderson Cancer Center). Nous remercions Margaret Lung et Kathryn Patterson pour leur aide dans le recrutement des sujets; Li-E Wang, Liu Zhensheng, Yawei Qiao, Min Zhao, Jianzhong Il, et Kejin Xu pour leur aide en laboratoire; et Diane Hackett et Maude Veechfor pour l'édition scientifique
matériel supplémentaire électronique
13046_2009_181_MOESM1_ESM.doc fichiers supplémentaires 1:. TGFB1 et VEGF distributions génotypiques et la survie globale. Les données fournies représentent l'analyse statistique des TGFB1 et VEGF distributions génotypiques et la survie globale. (DOC 69 Ko) 13046_2009_181_MOESM2_ESM.doc fichier complémentaire 2: TGFB1 et VEGF distributions génotypiques et 1 et 2 ans survivances. Les données fournies représentent l'analyse statistique des TGFB1 et VEGF distributions génotypiques et survies 1 et 2 ans. (DOC 66 Ko) Auteurs de fichiers originaux soumis pour les images
Voici les liens vers les auteurs originaux soumis les fichiers pour les images. fichier original 13046_2009_181_MOESM3_ESM.pdf Auteurs pour la figure 1 Intérêts concurrents
Les auteurs déclarent qu'ils ont aucun conflit d'intérêts.

• La validation d'une nouvelle méthode combinant à la fois HER2 immunohistochimie et HER2 double couleur argent hybridation in situ sur une lame pour les tests de cancer de l'estomac
• Un modèle de preuve de raisonnement à partir pour le diagnostic de métastases ganglionnaires dans le cancer gastrique