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Los polimorfismos de los genes de VEGF y TGFB1 y la supervivencia de los pacientes con cancer

gástrica polimorfismos de TGFB1 Opiniones y VEGF
genes y la supervivencia de los pacientes con cáncer gástrico
Resumen Antecedentes

Algunos TGFB1
y VEGF
polimorfismos se cree que son funcionales. Dado que estos genes están implicados en el crecimiento tumoral y la progresión incluyendo la angiogénesis, la difusión y la invasividad, la hipótesis de que estos polimorfismos estarían asociados con la supervivencia en pacientes con cáncer gástrico.
Métodos
genotipo TGFB1
-509 C > T, 1869 T > C, y 915 G > C y VEGF
-1498T > C, -634G > C, y C +936 > T en 167 pacientes con cáncer gástrico. Utilizando el método de Kaplan y Meier, pruebas
log-rank y modelos de riesgos proporcionales de Cox, se evaluaron las asociaciones entre TGFB1
y VEGF variantes con
general, de 1 año, y las tasas de supervivencia a 2 años. Los resultados
Aunque no hubo diferencias significativas en las tasas de supervivencia global entre todos los polimorfismos analizados, los pacientes con TGFB1
+ 915CG y genotipos CC tenían una peor supervivencia a 2 años (razón de riesgo (HR) ajustado, 3,06; intervalo de confianza del 95% (IC), 1,09 a 8,62; P = 0,034
) que los pacientes con el genotipo GG tenía. Además, los pacientes heterocigotos para VEGF
-634CG también tuvieron una supervivencia (HR ajustado, 2,08; IC del 95%, 1.3 a 4.22; P = 0,042
) más pobre de 1 año que los pacientes con el genotipo -634GG <. br> Conclusión
Nuestro estudio sugiere que TGFB1
+ 915CG /CC y VEGF
genotipos -634CG pueden estar asociados con la supervivencia a corto plazo en pacientes con cáncer gástrico. Sin embargo, se necesitan estudios más grandes para verificar estos hallazgos.
Introducción
En Caner gástrico, los pacientes con las mismas características clínico-patológicas y los mismos regímenes de tratamiento pueden tener diferentes resultados clínicos. Aunque el estadio es la mejor medida clínica disponible de agresión tumoral y el pronóstico, está claro que hay diferencias importantes, incluso dentro de la misma etapa del tumor [1, 2]. Por lo tanto, sería útil para mejorar la precisión de pronóstico mediante la identificación de marcadores moleculares de fácil acceso que predicen algunas de las variaciones en los resultados clínicos. En las últimas décadas, muchos estudios han demostrado que las alteraciones genéticas desempeñan un papel en el desarrollo y progresión del cáncer [3] gástrica. Entre estos marcadores moleculares, polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) son la variación genética más comúnmente investigados que pueden contribuir a los resultados clínicos de los pacientes [4].
Epidemiológicos y las investigaciones clínicas han sugerido que tanto el TGF-β1 y VEGF pueden desempeñar un importante papel en la oncogénesis del estómago [5, 6]. Por ejemplo, TGFB1 Opiniones y VEGF
variantes están asociadas con los productos de proteína alterada, que pueden contribuir a la variación en la susceptibilidad individual al cáncer y los resultados clínicos [4]. Tanto TGFB1
y VEGF
genes son altamente polimórficos, según se informa que tiene 168 y 140 variantes, respectivamente, pero sólo unos pocos de estas variantes están dentro del promotor o regiones que pueden ser potencialmente http funcional de codificación: //www. NCBI. NLM. NIH. gov /SNP /. De estas variantes, varias SNPs se han descrito como importante en la modulación de las funciones de genes [7-9] y se dice que participan en la etiología de diversos tipos de cáncer [10-13].
La vía de TGF-β1 es críticamente implicado en el desarrollo de tumores y la progresión. En cultivos de células tumorales, el TGF-β1 tiene efectos antiproliferativos y puede bloquear la progresión del tumor en sus primeras etapas, que, además, puede acelera la invasión y la metástasis en las últimas etapas de la progresión del tumor [14, 15]. Un estudio experimental informó de que la activación mediada por TGF-β1 de la vía 3 ALK5-Smad es esencial para la proteína Shh para promover la motilidad y la invasión en las células de cáncer gástrico [16]. experimentos con ratones también mostraron que las alteraciones en TGF-β1 se asoció con las proteínas de unión a TGF-β1 latente que puede causar inflamación y tumores [17] y que la vía de TGF-β1 interrumpido puede conducir al crecimiento del tumor mediante el aumento de la angiogénesis del tumor inducida por disminución de la expresión de trombospondina-1 [18]. En los seres humanos, TGF-β1 tuvo una sensibilidad mayor que los antígenos carcinoembrionario en las células tumorales de pacientes con cáncer gástrico [16]. Además, ambos estudios experimentales y clínico-patológicas han sugerido un papel de la familia VEGF de las proteínas en la metástasis a través del sistema linfático y en los resultados clínicos en varios tumores sólidos humanos, incluyendo el cáncer gástrico [19].
En este estudio, se eligió al genotipo común seleccionado (es decir, menor frecuencia de los alelos > 0,05) TGFB1 Opiniones y VEGF
SNPs que, o bien conducen a cambios de aminoácidos no es sinónimo [20] o se han asociado con menores niveles de expresión de estos genes [ ,,,0],8, 21], que implica estos SNPs pueden ser funcionales. La hipótesis de que los polimorfismos potencialmente funcionales en TGFB1 y VEGF podrían estar asociados con los resultados clínicos en pacientes con cáncer gástrico. En concreto, se
evaluó la asociación entre los resultados clínicos en el cáncer gástrico, incluyendo la supervivencia global, y cada uno de los siguientes SNP: TGFB1
tres SNPs, incluyendo un promotor SNP (-509 C > T) y dos SNPs exón 1 (869 T > C y 915 G > C) y tres VEGF
SNPs, incluyendo un promotor SNP (-1498T > C), un SNP región 5 'no traducida (-634G > C) y un 3' SNP región no traducida (936 C > T)
Métodos Estudio de población

Este análisis consistió prospectivo de 167 pacientes con diagnóstico reciente e histológicamente confirmado de cáncer gástrico, que fueron tratados en la Universidad de Texas MD Anderson Cancer. Center, Houston, Texas, entre abril de 2003 y julio de 2008. el protocolo de estudio fue aprobado por el Comité de Revisión Institucional (IRB) y todos los pacientes dieron su consentimiento informado mediante el formulario de consentimiento informado aprobado por el IRB. Los criterios de exclusión incluyeron los que no ha diagnosticado recientemente y aquellos de haber sido tratado en otro lugar antes de llegar al MD Anderson. Estos pacientes se incluyeron en este análisis debido a que sus muestras de sangre almacenadas estaban disponibles para la extracción de ADN.
Genotipado
ADN genómico fue extraído de la fracción de capa leucocitaria de la muestra de sangre de cada paciente utilizando una Blood Mini Kit (Qiagen, Valencia, CA) según las instrucciones del fabricante. pureza del ADN y las concentraciones se determinaron por medición espectrofotométrica de la absorbancia a 260 y 280 nm mediante un espectrofotómetro UV. Los tres seleccionados TGFB1
SNPs [uno (-509 C > T /rs1800469) en el promotor y dos (869 T > C /rs1800470 y 915 G > C /rs1800471) en el exón 1] y tres promotor de VEGF
SNPs [uno (-1498T > C /rs833061) en el promotor, una (-634G > C /rs2010963) en la región 5 'no traducida, y una (C +936 > T /rs3025039) en el 3' no traducida región] se genotipo utilizando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) - método de polimorfismo de longitud de fragmentos de restricción (RFLP). Genotipos de la TGFB1
SNPs se determinaron como se describe anteriormente [22], y los ensayos sobre el VEGF
SNPs También se informó anteriormente [23]. Para el ensayo de genotipado basado en la PCR-RFLP, dos ayudantes de investigación independiente, leyeron las imágenes de gel, y se realizaron los ensayos repetidos, si no se ponen de acuerdo sobre el genotipo probado. Además, los ensayos repetidos se realizaron en un seleccionado al azar 10% de las muestras fueron seleccionados al azar para realizar los ensayos repetidos con los resultados de ser 100% concordante.
Recogida de datos Resultado
Todos los 167 pacientes con cáncer gástrico tuvieron seguimiento disponibles seguridad de los datos sobre el resultado. El tiempo de supervivencia global se calculó a partir de la fecha de inscripción en M. D. Anderson a la fecha del último contacto o la muerte. Los pacientes que todavía estaban vivos en el último contacto se consideraron como un evento censurado en el análisis. La edad al momento del diagnóstico, el sexo, y el tipo de tratamientos (es decir, la cirugía y la quimioterapia) se utilizaron como covariables en el análisis. La edad al momento del diagnóstico se clasifican en dos grupos según la edad media (≤ 57 y > 57 años). Análisis estadístico
chi-cuadrado a doble cara y se realizaron pruebas t
para determinar cualquier estadísticamente diferencias significativas en las distribuciones de las variables categóricas (por ejemplo, la TGFB1
y VEGF
alelos y genotipos) por variables demográficas y las características clínicas y en los medios de las variables continuas (por ejemplo, la edad y el tiempo de supervivencia), respectivamente. Las distribuciones de los genotipos se ensayaron para la desviación de equilibrio de Hardy-Weinberg (HWE), y se reconstruyeron los haplotipos para las variantes del mismo gen de acuerdo con el programa PHASE [9], en la que la probabilidad de cada individuo de tener un par haplotipo particular, se estimó, y el par de haplotipos con la probabilidad más alta estimada fue asignado a la persona. Se utilizó la prueba de chi cuadrado-o global de Pearson para la prueba de las diferencias de supervivencia entre los pacientes de todos los haplotipos. Se analizaron las supervivencias globales entre los tres grupos de genotipos de cada SNP utilizando el método de Kaplan-Meier, y se utilizó la prueba de log-rank para probar la igualdad de las distribuciones de supervivencia estratificados por los genotipos. Se utilizaron modelos de riesgos proporcionales de Cox univariante y multivariante para estimar el efecto de cada genotipo en la supervivencia en presencia de otras variables. Tanto la edad al momento del diagnóstico y el intervalo de tiempo entre el registro y la fecha de diagnóstico (confirmación patológica de la enfermedad) fueron tratados como covariables numéricos en el modelo de Cox. Para confirmar la asunción de riesgos proporcionales en un modelo de regresión de Cox, hemos añadido una variable dependiente del tiempo con el modelo, y la asunción fue confirmado. Las razones de riesgo (HR) y sus correspondientes intervalos de confianza del 95% (IC) se calcularon con ajuste por otras variables en el mismo modelo. También se evaluaron los efectos conjuntos de la TGFB1 Opiniones y VEGF
SNPs y sus interacciones con fumar y beber en el riesgo de cáncer gástrico. Todas las pruebas estadísticas fueron de 2 caras, con un valor de p Red de 0,05 consideró significativo y todos se calcularon utilizando el software SAS (versión 9.1; SAS Institute, Cary, NC).
Resultados
Características de la población de estudio
características clínicas y patológicas de los 167 pacientes incluidos en este estudio se muestran en la Tabla 1. había 114 varones (68,3%) y 53 mujeres (31,7%), con edades comprendidas entre 32 y 89 años. Utilizando el análisis de regresión de Cox de la relación entre la supervivencia global y características clínico, encontramos que ni la edad, el género, el origen étnico, el tabaquismo, el alcohol ni el estado se asociaron estadísticamente con la supervivencia global (p = 0,339
, 0.988, 0.297, 0.475, 0,809, respectivamente) .Tabla 1 Características de la población de estudio de los pacientes con cáncer gástrico
Características
No. Los pacientes de
No. Las muertes de
MST (meses) guía empresas
P *
sujetos totales
Edad (media)
167
60
0,339
≤57 años
68
27
21,2 Hotel > 57 años
99
33
31,0
Sexo Masculino
0,988

114
41
23,3
Mujer
53 página 19
28,9
Etnia
0,297
blanco | 117
45
28.8
no blanco †
50
15
19,1
Humo
0,475
Nunca
34 página 14
20.6
Ever
133
46
30,1
alcohol
0,809
Nunca
62
23
23,2
siempre
105
37
29.3
Ubicación y 0.069
estómago
118
36
24,3
Esófago
25 página 13
27,2
UGE
24
11
16,6
Histología
0,356
intestinal
118
45
28,1
anillo de sello
49
15
24,6
diferenciación
0,694
pobre
96
37
21,8
moderada pobres
28
10
29,8
Moderado-Bueno
42
13
22,6
de estadificación clínica Hotel < 0,001
I + II
65 página 9
30,4
III + IV
101
51
22,7
Metástasis Hotel < 0,001

90
49
21,2
sin
77 página 11
34,2
quimioterapia Hotel < 0,001

121
54
26,3
sin
46 página 6
10,4
Cirugía Hotel < 0.001

63 página 11
39,2
sin
104
49
18,4
Abreviaturas: MST, la mediana de supervivencia; UGE, unión gastroesofágica.
* Prueba de Chi-cuadrado.
† Incluido 13 asiáticos, 16 negros, hispanos, 19 y 2 indios nativos. Empresas El tumores de 118 (70,7%) de los pacientes se encuentra en la parte estómago y los de 49 (29,3%) pacientes se encuentran en la unión gastroesofágica (UGE). Independientemente de la ubicación del tumor, todos los pacientes tenían adenocarcinoma. De ellos, 118 (70,7%) pacientes eran intestinal y 49 en anillo de sello (29,3%). Se agruparon los tipos de diferenciación en las siguientes tres categorías: pobres, moderada pobres y moderado, bueno, y el número y porcentaje de estos tres grupos fueron 96 (57,8%), 28 (16,9%) y 42 (25,3%), respectivamente. En todos los pacientes, las características clínico-patológicas, incluyendo la localización del tumor, histología y estado de diferenciación no se asociaron significativamente con la supervivencia global en el análisis univariado (p = 0,069
, 0,356 y 0,694, respectivamente). tumor etapas clínicas de acuerdo con los criterios Internacional Union Against Cancer (UICC) fueron los siguientes: 65 (38,9%) en estadio I y II y 101 (61,1) en estadio III + IV (Tabla 1): perfil Entre los 167 pacientes. , 121 (72,4%) recibieron quimioterapia, y 63 (37,7%) recibieron la cirugía; al final del período de seguimiento, 60 (35,9%) pacientes habían muerto. El tiempo medio de seguimiento fue de 18,0 ± 13,3 meses para los pacientes que todavía estaban vivos, y el tiempo medio de supervivencia para todos los pacientes fue de 29,4 meses. etapa avanzada, la metástasis, la quimioterapia y la cirugía se asociaron con la supervivencia global (p Hotel < 0,001 para todos) (Tabla 1). Por ejemplo, el tiempo medio de supervivencia fue de 34,2 meses para los pacientes sin metástasis y 21,2 meses para aquellos con metástasis. Los que recibieron la quimioterapia y la cirugía tenido un mayor tiempo de supervivencia que aquellos que no lo hicieron (26,3 meses frente a 10,4 meses para la quimioterapia y de 39,2 meses frente a 18,4 meses para la cirugía) significa.
HWE, desequilibrio de ligamiento y haplotipos TGFB1 y VEGF
para TGFB1
, uno de los tres SNPs (rs1800469C > T, rs1800470T > C y rs1800471G > C) no estaba en HWE (P Hotel < 0,05 para rs1800469C > T), lo que sugiere un posible sesgo de selección, pero ninguno del VEGF
SNPs (rs833061T > C, rs2010963G > C y rs3025039C > T) se iban de HWE (P Hotel > 0,05 para todos). Ninguno de los pares de TGFB1
o VEGF
SNPs se encontraban en alta desequilibrio de ligamiento (es decir, r 2 entre 0,039 y 0,541, todo < 0,08). Sólo cuatro TGFB1
haplotipos y cinco VEGF
haplotipos tuvieron una frecuencia del alelo > 0,05 (CTG, 0.570; CCG, 0.190; TCG, 0,167 y CCC, 0,063 para TGFB1
y CGC, 0.344; TCC, 0,287; TGC, 0,192; CGT, 0,072 y TCT, 0.051 para el VEGF
). Debido al tamaño pequeño de la muestra, no se calculó la diplotypes.
TGFB1 y genotipo distribuciones de VEGF y la supervivencia global
Cuando todos los pacientes con cáncer gástrico se analizaron para la supervivencia general, no se encontraron diferencias significativas en las distribuciones de supervivencia media tiempo por los genotipos para cualquiera de los polimorfismos estudiados. Debido a que hay pocos participantes en los grupos de variantes homocigotos menores, se combinaron las variantes genotipos homocigotos heterocigotos y menores juntos por un análisis adicional, asumiendo un modelo genético dominante, pero aún había ninguna asociación entre polimorfismos detectados y la supervivencia global (véase la disposición 1) . Por otra parte, cuando los pacientes con cáncer gástrico fueron estratificados por edad, sexo, origen étnico, y el estado metastásico, no hay diferencia en la distribución de acuerdo a tiempo medio de supervivencia de los seis SNPs se encontró entre los subgrupos (véase la disposición 1).
TGFB1 y VEGF distribuciones genotípicas y 1-y supervivencias de 2 años
Debido a que el pronóstico es generalmente pobre en casos avanzados de cáncer gástrico, la supervivencia media rara vez se aproxima a 1 o 2 años [2]. En el presente estudio, la mayoría de los casos estaban en estadio IV (101/167) con un tiempo de supervivencia media de sólo 16,2 meses (IC 95%, 12,8-24,9). Por lo tanto, también se calcularon las tasas de supervivencia a 1 año y 2 años para los pacientes con genotipos diferentes (véase la disposición 2). Los 1 año y 2 años supervivencias globales para todos los pacientes fueron 51,5% y 22,1%, respectivamente. Aunque no hubo diferencias significativas en las tasas de supervivencia entre la mayoría de los genotipos, los pacientes con genotipos TGFB1 +
915CG /CC tuvieron mejor de 1 año y 2 años de supervivencia que aquellos con el genotipo GG (HR ajustado, 2,13; IC del 95% , 0,76-6,01; p = 0,122
y ajustado HR, 3,06; IC del 95%, 1,09 a 8,62; P = 0,034
, respectivamente) (Figura 1). Por otra parte, los pacientes heterocigotos para VEGF
-634CG también tuvieron una mejor tasa de supervivencia a 1 año (HR ajustado, 2,08; IC del 95%, 1.3 a 4.22; P = 0,042
) que aquellos con el VEGF CD - 634 genotipo GG. Figura 1 Funciones de supervivencia acumulada de los genotipos TGFB1 915 G > C (rs1800471) y VEGF -634G >. C (rs2010963) guía Otros análisis que combina los alelos, genotipos y haplotipos del mismo gen no corroborar los resultados de el análisis de locus único (datos no mostrados), en parte debido a la baja LD entre los SNPs y el pequeño tamaño del estudio que no permitió un análisis más detallado de la estratificación.
Discusión
la etiología del cáncer gástrico es multifactorial, y multigenética varias etapas [24, 25]. Se sabe que durante la carcinogénesis, TGF-β puede cambiar de un supresor de tumor a un promotor de tumor en las etapas posteriores del cáncer [26]. Con doble papel en el desarrollo del cáncer, existe un gran interés en el análisis del papel de la variación genética en TGFB1
en la progresión del cáncer y la supervivencia del paciente. Por ejemplo, el TGFB1
-509C > T y polimorfismos rs1982073 (o rs1800470) se han demostrado estar asociados con la supervivencia del cáncer de mama en una población china [27-30] y la respuesta quimiorradioterapia en 175 pacientes finlandeses con escamosas de cabeza y cuello cáncer [31], respectivamente. Sin embargo, ni TGFB1
+ 869T > C + 915G ni > C polimorfismos mostraron ninguna asociación con recidiva tumoral y la progresión de los tumores de vejiga invasivo y sin muscular en una población española [32]. Mientras que un estudio coreano mostró que los genotipos variante T de la TGFB1
-509C > T SNP estaban asociados con un riesgo reducido de cáncer de pulmón [33], un estudio chino de 414 pacientes y 414 controles [34] informó de que los genotipos no se asociaron con un riesgo general de desarrollar cáncer gástrico pero con un menor riesgo de riesgo de estadio I o II del cáncer gástrico. Sin embargo, ningún análisis de supervivencia se presenta en estos estudios.
Como se ha señalado, no se encontró ninguna evidencia estadística para apoyar una asociación significativa entre TGFB1
polimorfismos y la supervivencia global en el cáncer gástrico. Sin embargo, la asociación significativa entre TGFB1 +
915 genotipos GC /CC y 2 años de supervivencia para todos los pacientes con cáncer gástrico sugiere que este TGFB1
variante puede haber atenuado el papel de TGF-β1 como un supresor de tumores en la etapa anterior de la progresión tumoral. También se sabe que el TGF-β1 puede cambiar de un supresor de tumor a un promotor de tumor en la etapa tardía de cáncer [26]. Una vez que los tumores habían crecido más grande y convertirse en metastásico, el aumento resultante en mutaciones somáticas o ganancias en las copias de oncogenes puede haber superado el papel de las variantes de supresión en las últimas etapas de la tumor, dando lugar a diferencias en la supervivencia global de los pacientes con diferentes genotipos de la TGFB1 +
915 G > C SNP. Sin embargo, esta especulación necesita ser validado en estudios más rigurosamente diseñados con un tamaño de muestra mucho más grande y más información sobre el espectro de mutaciones en los tumores.
VEGF, como un mediador clave de la angiogénesis, también juega un papel importante en el desarrollo de los cánceres. VEGF
polimorfismos también se han demostrado estar asociados con la supervivencia tanto en el cáncer gástrico y el cáncer de colon [35, 36]. Sin embargo, los resultados de los estudios publicados siguen siendo incompatibles y no conclusiva. En un estudio griego cáncer gástrico de cinco VEGF
SNPs (2578C > A, 1154G > A, -634G > C, -460T > C y C +936 > T) en 312 pacientes [36], el VEGF
-2578 AA, CC -634 y + 936TT genotipos se asociaron con una FC significativamente inferior (mejor supervivencia) para la supervivencia de 6 años de los cánceres colorrectales. Curiosamente, otro estudio griego temprano de 100 pacientes con cáncer gástrico sugirió que sólo el VEGF
genotipos -634CC /CG se asociaron con una disminución (peor supervivencia) supervivencia a 10 años, en comparación con el genotipo GG [35]. Nuestros datos sobre 167 pacientes con cáncer gástrico se indica que el VEGF
portadores -634CC /CG de hecho tenían una pobre supervivencia a 1 año que aquellos con el genotipo VEGF
-634 GG. Amano et al. [37] Asimismo, informó que no se observó ninguna asociación significativa entre las frecuencias del VEGF
-460T > C, + 405g > C y 936C > genotipos T y la supervivencia libre de enfermedad a 3 años de pacientes con carcinoma de endometrio en un japonés estudio de 105 pacientes con carcinoma de endometrio. Debido a que todos estos estudios, incluyendo el nuestro, han sido relativamente pequeña, había una capacidad limitada para llevar a cabo la más potente análisis basado en el haplotipo que el análisis de un único alelo o efecto locus [34].
Este es el primer informe, a nuestro conocimiento, que implica TGFB1 Opiniones y VEGF
polimorfismos y la supervivencia en pacientes con cáncer gástrico que consisten principalmente en una población caucásica; sin embargo, hubo algunas limitaciones en el presente estudio. A pesar de que tratamos de recoger datos de recurrencia en estos pacientes, no pudimos investigar este punto final debido a la falta de un plan de seguimiento predefinido. Una segunda limitación es el hecho de que sólo se incluyeron TGFB1
tres SNPs comunes y VEGF
tres SNP. Es posible que algunos otros SNPs importantes se perdieron o que las asociaciones observadas pueden deberse a otros polimorfismos en LD con los SNPs que estudiamos. Además, no hay datos sobre los niveles de proteína de suero /plasma estaban disponibles para el análisis de correlación genotipo-fenotipo, ya que sólo las muestras de ADN se obtuvieron de estos pacientes. Hay otros genes además a TGFB1
y VEGF
que también juegan un papel en el crecimiento celular y la angiogénesis, lo que representa una compleja interacción de muchos factores inhibidores de activación y [38]. Además, Helicobacter pylori
infección, la presencia o ausencia de los cuales no se informó en el presente estudio, se considera que es la causa de una acumulación progresiva de cambios genotípicos en el cáncer gástrico, lo que puede conducir a la carcinogénesis esporádica cáncer gástrico [39 ]. Por último, el tamaño del estudio fue demasiado pequeño como para tener una potencia suficiente para detectar pequeñas hrs. Por ejemplo, nuestro cálculo posterior a la potencia sugirió que el tamaño de la muestra para un número igual (n = 55) de los sujetos en cada genotipo de cada SNP, el poder de detectar una HR del 2 fue < 0,4, pero > 0,8 para una HR de 3,4 para un período de seguimiento de 5 años. Por lo tanto, sólo el hallazgo de CRI para la supervivencia a 2 años de TGFB1
+ 915G > C tendría una potencia suficiente, lo que sugiere sería necesario un estudio mucho más grande para poner a prueba nuestra hipótesis de manera efectiva para los efectos de la supervivencia global
. conclusión
En resumen, se encontró que algunos polimorfismos VEGF y TGFB1

puede estar asociado con tasas de supervivencia de 1 ó 2 años de los pacientes con cáncer gástrico. Sin embargo, el presente estudio es pequeño, y varios eventos genéticos y epigenéticos también puede haber conducido a una asociación entre TGFB1 Opiniones y VEGF
polimorfismos y el pronóstico del cáncer gástrico y la supervivencia. Por lo tanto, se requieren estudios mejor diseñados y más grande para superar las limitaciones en el presente estudio (en particular, la información sobre Helicobacter pylori
) y confirmar aún más nuestras observaciones.
Abreviaciones
TGF-β1
:
factor de crecimiento transformante beta 1
VEGF
: factor de crecimiento endotelial vascular
LD:
desequilibrio de ligamiento
PCR-RFLP:
cadena de la polimerasa-longitud de los fragmentos de restricción polimórficos reacción
O:
odds ratio
HR: cociente de riesgos instantáneos
IC: intervalo de confianza
SNP:.
polimorfismo de nucleótido único
Declaraciones
Agradecimientos
Este estudio fue apoyado en parte por los Institutos nacionales de Salud subvenciones R01 ES 11740-07 y CA 131274-01 (a QW) y CA 16672 (a MD Anderson Cancer Center). Agradecemos a Margaret pulmón y Kathryn Patterson por su ayuda en el reclutamiento de los sujetos; Li-E Wang, Liu Zhensheng, Yawei Qiao, Min Zhao, Jianzhong Él, y Kejin Xu por su asistencia de laboratorio; y Diane Hackett y Maude Veechfor para la edición científica
material complementario Electrónico
13046_2009_181_MOESM1_ESM.doc archivo adicional 1:. TGFB1 y genotipo distribuciones de VEGF y la supervivencia global. Los datos proporcionados representan el análisis estadístico de TGFB1 y VEGF distribuciones de genotipo y la supervivencia global. (DOC 69 KB) 13046_2009_181_MOESM2_ESM.doc archivo adicional 2: genotipo distribuciones TGFB1 y VEGF y 1-y 2 años supervivencias. Los datos proporcionados representan el análisis estadístico de TGFB1 y VEGF distribuciones genotípicas y supervivencias de 1 y 2 años. (DOC 66 KB) de los autores originales presentados archivos para imágenes
A continuación se presentan los enlaces a los archivos de los autores presentados original para imágenes. 13046_2009_181_MOESM3_ESM.pdf archivo original de los autores para la figura 1 Conflicto de intereses México La autores declaran que no tienen intereses en competencia.

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