Polimorfizmi TGFB1 i VEGF gena i preživljavanje pacijenata sa želučanim cancer

polimorfizama TGFB1 pregled i VEGF pregled gena i preživljavanje pacijenata s rakom želuca
apstraktne pregled pozadine
Neki TGFB1 pregled i VEGF
polimorfizmi se vjeruje da su funkcionalne. S obzirom da su ti geni uključeni u rast tumora i napredovanje uključujući angiogeneze, širenje i invazivnosti, pretpostavili smo da su ovi polimorfizmi će biti povezan s preživljavanje u bolesnika s karcinomom želuca.
Metode pregled Mi genotipiziran TGFB1 pregled -509 C > T, 1869 T C i 915 G > C i VEGF pregled -1498T > C, -634G > C i + 936C > T u 167 bolesnika s karcinomom želuca. Koristeći metodu Kaplan i Meier, log-rank testa, i Cox proporcionalni modeli rizika, istražili smo povezanost između TGFB1 pregled i VEGF pregled varijanti s ukupnom poretku, 1-godišnje, a stopa preživljavanja 2 godine. Pregled Rezultati pregled, iako nije bilo značajne razlike u ukupnom postotku preživljavanja između svih polimorfizama ispitanih, bolesnici s TGFB1 pregled + 915CG i CC genotipa imali lošiju 2-godišnje preživljenje (omjer prilagođena opasnosti (HR), 3,06; 95% interval pouzdanosti (CI), 1,09-8,62; P pregled = 0,034) od bolesnika s GG genotipom imali. Osim toga, pacijenti heterozigotni za VEGF pregled -634CG imao lošiju 1-godišnje preživljenje (prilagođeni HR, 2.08; 95% CI, 1,03-4,22, P pregled = 0,042) nego bolesnici s genotipom -634GG <. br> Zaključak pregled naša studija sugerira da TGFB1 pregled + 915CG /CC i VEGF pregled -634CG genotipovi mogu biti povezani s kratkoročnim preživljavanje u bolesnika s rakom želuca. Međutim, veće studije su potrebne kako bi potvrdili ove rezultate.
Uvod pregled U želučane Caner, pacijenti s istim kliničko karakteristikama i istim režimima liječenja mogu imati različite kliničke ishode. Iako fazi je najbolje dostupne kliničke mjera tumora agresije i prognozu, jasno je da postoje značajne razlike čak i unutar istog fazi tumora [1, 2]. Dakle, bilo bi korisno da se poboljša prognostičke točnosti identifikacije lako dostupne molekularne markere koji predviđaju neke od varijacija u kliničkim rezultatima. U posljednjih nekoliko desetljeća, mnoge studije su pokazale da genetski promjene igraju ulogu u razvoju i progresiji karcinoma želuca [3]. Među tim molekularnih markera, polimorfizama (SNP-ova) su najčešće istražuju genetske varijacije koje mogu doprinijeti kliničkim ishodima pacijenata [4]. Pregled Epidemiološka i klinička istraživanja su pokazala da su i TGF-β1 i VEGF može igrati važnu ulogu u onkogenezom u želucu [5, 6]. Na primjer, TGFB1 pregled i VEGF pregled varijante povezane s promijenjenim proteinskih proizvoda, koji mogu doprinijeti na varijacije u pojedinim osjetljivost na rak i kliničkih ishoda [4]. Oba TGFB1 pregled i VEGF pregled, geni su vrlo polimorfni, navodno imaju 168 i 140 varijante, odnosno, već samo nekoliko od tih varijanti unutar promotora ili regije kodiranja koji mogu biti potencijalno funkcionalno http: //www. NCBI. NLM. NIH. gov /SNP /. Od tih varijanti, nekoliko SNP bili su opisani kao važna za modulaciju funkcije gena [7-9] i navodno su uključeni u etiologiju raznih vrsta raka [10-13].
TGF-β1 put je kritički uključen u razvoj tumora i napredovanjem. U kulturama tumorskih stanica, TGF-β1 ima anti-proliferativna učinke i može blokirati napredovanje tumora u ranoj fazi, a to također može ubrzava invaziju i metastaziranje u kasnijim fazama napredovanja tumora [14, 15]. Jedna eksperimentalna studija je izvijestio da TGF-β1-posredovana aktivacija ALK5-Smad 3 puta je bitno za Psst proteina za promicanje pokretljivost i invazivnost u želučanim stanicama raka [16]. Miš eksperimenti također su pokazali da izmijenjen TGF-β1 je bio povezan s latentnim TGF-β1 vezujući proteini koji mogu izazvati upalu i tumore [17] te da je poremećen TGF-β1 put može dovesti do rasta tumora povećanjem angiogenezu tumora izazvano smanjenje ekspresije trombospondina-1 [18]. Kod ljudi, TGF-β1 imao veću osjetljivost od karcinoma-embrionalne antigena u stanicama tumora u bolesnika s rakom želuca [16]. Nadalje, obje eksperimentalne i kliničko-patoloških ispitivanja ukazuju na ulogu ovog VEGF proteina u metastaze kroz limfni sustav i u kliničkim rezultatima u nekoliko humanih solidnih tumora, uključujući rak želuca [19].
U ovoj studiji mi izabrao da genotip odabrane česte (tj manja alel frekvencija > 0,05) TGFB1 pregled i VEGF pregled SNP da ili dovesti do ne-sinonim promjena aminokiselina [20] ili su povezane s nižim razinama ekspresije tih gena [ ,,,0],8, 21], što implicira ovih SNP-ova može biti funkcionalna. Mi smo pretpostavili da je potencijalno funkcionalni polimorfizam u TGFB1 i VEGF će biti povezana s kliničkim ishodima u bolesnika s karcinomom želuca. Naime,
vrednovati povezanost kliničkih rezultata kod raka želuca, uključujući i ukupno preživljavanje, a svaki od sljedećih SNP: Tri TGFB1 pregled, SNP, uključujući jednog promotora SNP (-509 C > T) i dva eksona 1 SNP (869 T > C i 915 G C), a tri VEGF pregled SNP-ova, uključujući jedan promotor SNP (-1498T > C), jednog 5 'netranslatirane regije (SNP -634G > C) i jednog 3' SNP netranslatirano područje (936 C > T) pregled metoda
stanovništvo Studija pregled ovog obećavajućeg analiza se sastojala od 167 bolesnika s nedavno dijagnosticiran i histološki potvrđeno raka želuca, koji su bili tretirani na Sveučilištu Texas MD Anderson Cancer. Centar, Houston, Texas između travnja 2003. i srpnja 2008. godine protokol istraživanja je odobren od strane naših Institutional Review Board (IRB) i svih pacijenata dali pristanak korištenjem IRB-odobreni obrazac informiranog pristanka. Kriteriji za isključenje uključene i one koje nisu nedavno dijagnosticiran i onih što se liječio na drugo mjesto prije dolaska u M. D. Anderson. Ovi pacijenti bili su uključeni u ovu analizu jer njihove spremljeni uzorci krvi bili su dostupni za DNA ekstrakcije. Pregled Genotipizacija pregled Genomska DNA bila je ekstrahirana iz Serumska frakcija krvi u uzorku za svakog bolesnika uporabom Blood Mini Kita (Qiagen, Valencia, CA), u skladu s uputama proizvođača. čistoća DNA i koncentracije su određena spektrofotometrijskom mjerenje apsorbancije pri 260 i 280 nm UV spektrofotometra. Tri odabrane TGFB1 pregled SNP [on (-509 C > T /rs1800469) u promotora i dva (869 T-C /rs1800470 i 915 G &C /rs1800471) u eksonu 1] i tri promotora VEGF
SNP [on (-1498T > C /rs833061) u promotoru on (-634G > C /rs2010963) u 5'-netranslatiranu regiju, a on (+ 936C > T /rs3025039) u 3'-netransliranoj regija] genotipizirane pomoću lančane reakcije polimeraze (PCR) - polimorfizam duljine fragmenta (RFLP) metodu za ograničenje. Genotipova TGFB1 pregled SNP određene su kao što je prethodno opisano [22], a testovi na VEGF pregled SNP također su ranije izvijestili [23]. Za genotipizacija testa PCR-RFLP-based, dva znanstvena novaka samostalno čitati gel slike, a ponovljeni testovi provedeni su, ako se ne slaže na testiranom genotip. Osim toga, ponovljena ispitivanja vrše se na nasumično odabranim 10% uzoraka su nasumce izabrani za obavljanje ponovio testove a rezultati su 100% podudaraju.
Prikupljanje Ishod podataka pregled svih 167 pacijenata s rakom želuca imao na raspolaganju sljedećim do podataka o ishodu. Ukupno vrijeme preživljavanja je izračunata od dana upisa u M. D. Anderson do datuma zadnjeg kontakta ili smrti. Pacijenti koji su još uvijek živi u zadnji kontakt se smatrati cenzurirani događaj u analizi. Dob pri dijagnozi, spolu i vrsti tretmana (tj operacije i kemoterapije) su korišteni kao kovarijanata u analizi. Dob pri dijagnozi svrstani u dvije skupine prema srednjem dobu (≤ 57 i > 57 godina). Pregled, Statistička analiza
Dvostrani hi-kvadrat i t
Ispitivanja su provedena kako bi se utvrdilo bilo statistički značajne razlike u distribucijama kategoričke varijable (npr TGFB1 Netlogu i VEGF pregled alela i genotipova) po demografskim varijablama i kliničke slike te u sredstvima za kontinuirane varijable (npr dobi i vrijeme preživljavanja), respektivno. Raspodjela genotipova ispitani su odstupanja od Hardy-Weinberg ravnoteže (HWE) i haplotipovi za varijante istog gena su rekonstruirani prema stupnju programu [9], za koji je vjerojatnost svakog pojedinca da ima određenu haplotip par procijenjeno je, a haplotip par s najvišim procijenjenu vjerojatnost je dodijeljen pojedincu. Pearsonov hi-kvadrat ili globalni test je korišten za testiranje razlike preživljavanja među pacijentima od strane svih haplotipova. Ukupni sačuvani između tri genotipa skupinama svakog SNP su analizirani pomoću Kaplan-Meier metodi i log-rank test je korišten za testiranje jednakosti distribucija preživljavanja stratificiran prema genotipova. Koristili smo univarijantna i multivarijatna Cox proporcionalnih rizika modela za procjenu učinka svakog genotipa na preživljavanje u prisustvu drugih kovarijanata. I starost u vrijeme dijagnoze i vremenski interval između upisa i datum dijagnostike (patološka potvrda bolesti) su tretirani kao numeričkih kovarijanata u Cox modelu. Za potvrdu pretpostavku proporcionalnih rizika u Cox regresijska modela, dodali smo vremenski ovisne varijable u modelu, a pretpostavka je potvrđena. omjeri opasnosti (HRS) i njihove odgovarajuće interval pouzdanosti 95% (CIS) izračunati su uz prilagodbu za ostale kovarijanata u istom modelu. Također su ocijenjeni Zajednički učinak od TGFB1 pregled i VEGF pregled SNP-ova i njihove interakcije s pušenja i pijenja na rizik od raka želuca. Svi statistički testovi su 2-sided, s P
vrijednosti od 0,05 smatra značajnim i sve izračunate su korištenjem softvera SAS (verzija 9.1, SAS Institute, Cary, NC). | Rezultati
Karakteristike ispitivane populacije
kliničkih i patoloških obilježja 167 pacijenata uključenih u ovoj studiji prikazani su u tablici 1. Nije bilo 114 muških (68,3%) i 53 ženskih (31,7%), čiji su dob u rasponu od 32 do 89 godina. Korištenje Cox regresijska analiza odnosa između ukupnog preživljavanja i kliničko karakteristike, otkrili smo da ni dob, spol, etnicitet, pušenje, niti status alkohol su statistički povezana s ukupno preživljavanje (P Netlogu = 0.339, 0.988, 0.297, 0,475, 0,809, respektivno) .table 1 Karakteristike ispitivane populacije bolesnika s rakom želuca pregled Karakteristike pregled
br pacijenata
br smrtnih slučajeva

MST (mjeseci)
P Netlogu *
Ukupno tema pregled doba (srednja)
167 pregled 60 pregled 0.339 pregled ≤57 godina
68 pregled, 27 pregled 21.2 izvoznici > 57 godina
99 pregled, 33 pregled 31,0 pregled Spol pregled 0.988
Muški
114 pregled 41 pregled 23.3 pregled ženskih pregled, 53 pregled, 19 pregled 28.9 pregled pripadnost pregled 0,297 pregled White
117 pregled 45
28.8 pregled Non-bijeli † pregled 50
15 Netlogu 19,1 pregled Dim pregled 0,475 pregled Nikad pregled 34 pregled, 14 pregled 20,6
ikada
133 pregled 46 pregled 30.1 pregled Alkohol pregled 0,809 pregled Nikad
62
23
23,2 pregled ikad
105 pregled 37 pregled 29.3 pregled Lokacija
0,069 pregled želuca pregled 118 pregled 36 pregled 24.3 pregled jednjak pregled 25 pregled, 13 pregled 27.2 pregled GEJ pregled 24
11 pregled 16.6 pregled, histologiju pregled 0,356 pregled crijevnih pregled 118 pregled 45 pregled 28.1 pregled, pečatni prsten pregled, 49 pregled, 15 pregled 24.6 pregled Diferencijacija pregled 0,694 pregled Poor pregled, 96 pregled, 37 pregled 21.8
Umjereno siromašan Netlogu 28 pregled, 10 pregled 29,8
Umjereno-Pa pregled 42
13 pregled 22.6 pregled Klinički Stage izvoznici < 0.001 pregled, I + II
65 pregled, 9
30,4 pregled III + IV pregled 101 pregled 51 pregled 22.7
metastaza Netlogu < 0.001 pregled, da pregled 90 pregled, 49 pregled 21.2 pregled ne pregled, 77 pregled, 11 pregled 34.2 pregled Kemoterapija izvoznici < 0.001 pregled, da pregled 121 pregled 54
26,3 pregled ne
46 pregled 6
10,4 pregled Kirurgija izvoznici < 0,001 pregled da
63 pregled, 11 pregled 39.2 pregled ne
104 pregled 49 pregled 18.4 pregled Kratice: MZT, srednja vrijednost vremena preživljenja; GEJ, gastroezofagealnog spoja. Pregled * Hi-kvadrat test. Pregled † Uključeno 13 Azijata, 16 crnci, 19 Latino, te 2 Indijanaca.
Tumora 118 (70,7%), pacijenti su bili nalazi pri želuca i one od 49 (29,3%) bolesnika bili su smješteni na gastroezofagealnog spoja (GEJ). Bez obzira na mjesto tumora, svi su bolesnici imali adenokarcinom. Od tog broja, 118 (70,7%) bolesnika su crijevne i 49 (29,3%), pečatni prsten. grupirani Mi vrste diferencijacije u sljedeće tri kategorije: siromašne, umjereno-siromašnih i umjereno-dobro, a broj i postotak od tih triju skupina bili su 96 (57,8%), 28 (16,9%) i 42 (25,3%), odnosno. U svih bolesnika, kliničko-patološka obilježja uključujući lokaciju tumora, histologiju i statusa pripadnosti nije bila značajno povezana s ukupnom preživljavanju u univarijantne analize (P Netlogu = 0,069, 0,356 i 0,694, respektivno). Klinički stadij tumora prema Međunarodnoj unije protiv raka (UICC) kriteriji su sljedeći: 65 (38,9%) imalo je stadij I + II i 101 (61.1) imala stadij III + IV (Tablica 1)
Među 167 pacijenata. , 121 (72,4%) primila kemoterapiju, a 63 (37,7%) dobila operaciju; na kraju perioda praćenja, 60 (35,9%) bolesnika je umrlo. Srednja follow-up vrijeme je 18.0 ± 13,3 mjeseci za bolesnike koji su još živi, ​​a prosječno vrijeme preživljavanja svih bolesnika bila je 29,4 mjeseci. Poodmakloj fazi, metastaze, kemoterapije i operacije su sve povezane s ukupno preživljavanje (P izvoznici < 0,001 za sve) (tablica 1). Na primjer, prosječno vrijeme preživljenja bilo je 34.2 mjeseci za pacijente bez metastaza i 21.2 mjeseci za one s metastazama. Oni koji su primili kemoterapiju i operacije imao više srednje vrijeme preživljenja od onih koji nisu (26,3 mjeseci u odnosu 10,4 mjeseci za kemoterapiju i 39.2 mjeseci u odnosu na 18,4 mjeseci za operacije).
HWE, poluge neravnoteže i haplotipova TGFB1 i VEGF
za TGFB1 pregled, jedan od tri SNP-a (rs1800469C > T, rs1800470T &C i rs1800471G &C) nije bio u HWE (P izvoznici < 0,05 za rs1800469C > t), što upućuje na moguću pristranost selekcije, ali nijedan VEGF pregled SNP (rs833061T &C, rs2010963G &C i rs3025039C > T) napustili HWE (P izvoznici > 0,05 za sve). Niti jedan od parova TGFB1 pregled ili VEGF pregled SNP bili u visokom disekvilibriju vezanosti (tj r 2 između 0,039 i 0,541, sve < 0,08). Samo četiri TGFB1 pregled haplotipovi i pet VEGF
haplotipovi imao alela učestalost > 0,05 (CTG, 0.570, CCG, 0.190, TCG, 0.167 i CCC, 0.063 za TGFB1 pregled i CGC, 0,344; TCC, 0,287; TGC, 0.192, CGT, 0.072 i TCT, 0.051 za VEGF Netlogu). Zbog male veličine uzorka, nismo izračunati diplotypes. Pregled TGFB1 i VEGF genotip distribucija i ukupno preživljenje pregled Kad su analizirani svi pacijenti s rakom želuca za ukupno preživljavanje, nema značajne razlike u distribucijama srednje preživljavanje vrijeme po genotipovima za neko od navedenih polimorfizama studirao. Budući da je bilo nekoliko sudionika u manjim homozigota varijante grupa, u kombinaciji smo heterozigota i manje varijante homozigotna genotipova zajedno za dodatne analize, uz pretpostavku dominantni genetski model, ali još uvijek nije povezanost između otkrivenih polimorfizama i ukupno preživljavanje (vidjeti dodatne datoteke 1) , Nadalje, kada su pacijenti s rakom želuca su poredani po dobi, spolu, nacionalnosti, i metastatski status, nema razlike u raspodjeli prema prosječno vrijeme preživljavanja od strane šest SNP-ova je pronađena među podskupinama (vidjeti dodatne datoteke 1). Pregled TGFB1 i VEGF genotip distribucija i 1-i 2-godišnje sačuvani
Budući da je prognoza je obično loša u naprednim slučajeva raka želuca, medijan preživljenja rijetko se približava 1 ili 2 godine [2]. U ovom istraživanju, većina slučajeva bila faza IV (101/167) s medijanom vremena preživljavanja od samo 16,2 mjeseci (95% CI, 12,8 do 24,9). Zbog toga smo također izračunali 1 godine i 2-godišnje cijene preživljavanja za pacijente s različitih genotipova (vidi dodatne datotečne 2). Ukupni 1 godina i 2-godišnje sačuvani za sve pacijente bili su 51,5% i 22,1%, respektivno. Iako nije bilo značajne razlike u postotku preživljavanja između većine genotipova, bolesnici s TGFB1 + pregled 915CG /CC genotipa je bolje 1 godina i 2-godišnje preživljavanje od onih s GG genotipom (prilagođeni HR, 2.13; 95% CI , 0,76-6,01; P pregled = 0,122 i prilagođen HR, 3.06; 95% CI, 1,09-8,62; P = 0,034 pregled, respektivno) (slika 1). Nadalje, bolesnici heterozigotni za VEGF pregled -634CG imao bolji 1-godišnje preživljenje (prilagođena HR, 2.08; 95% CI, 1,03-4,22; P pregled = 0,042) od onih s VEGF Netlogu - 634 GG genotipa. Slika 1 Kumulativna funkcija preživljavanja genotipova TGFB1 915 G &C (rs1800471) i VEGF -634G >. C (rs2010963) pregled, daljnje analize kombinirajući alele, genotipova i haplotipova istog gena nije potkrijepio nalazima iz jedini locus analiza (podaci nisu prikazani), djelomično zbog niske LD među SNP-ova i male veličine studije koja ne dopušta daljnju analizu stratifikacije. pregled Rasprava pregled etiologiji karcinoma želuca je više činilaca, multigenetic i višestupanjska [24, 25]. Poznato je da je tijekom karcinogeneze, TGF-β može prebaciti s prigušivačem tumora na pojačivač tumora u kasnijim fazama raka [26]. S dvostrukom ulogom u razvoju raka, postoji veliki interes u analizi uloge genetskih varijacija u TGFB1 pregled u progresiji karcinoma i preživljavanje pacijenta. Na primjer, u TGFB1 pregled -509C > T i rs1982073 (ili rs1800470) polimorfizmi su pokazala da je povezan s preživljavanje raka dojke u kineskoj populaciji [27-30] i kemoradioterapiji odgovora u 175 finskih pacijenata s glave i vrata pločastih rak [31], respektivno. Međutim, niti TGFB1 pregled + 869T > C, niti + 915G > C polimorfizama pokazali nikakvu povezanost s recidiv tumora i napredovanje u tumorima mokraćnog mjehura, bez mišića invazivnih u španjolskom stanovništva [32]. Dok korejski studija pokazala je da varijanta T genotipova TGFB1 pregled -509C > T SNP bili su povezani sa smanjenim rizikom od raka pluća [33], kineski studiji 414 bolesnika i 414 kontrola [34] izvijestili da genotipova nisu bili povezani s ukupnim rizikom od razvoja raka želuca, ali sa smanjenim rizikom od rizika od pozornice i ili II rakom želuca. Međutim, nema opstanka analize predstavljeni su u tim istraživanjima.
Kao što je navedeno, nismo pronašli nikakvu statističke dokaze da podrži značajnu povezanost između TGFB1 pregled polimorfizama i ukupnog preživljavanja kod raka želuca. Međutim, značajna povezanost između TGFB1 +
915 CG /CC genotipova i 2-godišnje preživljenje za sve bolesnike s rakom želuca sugerira da je ovaj TGFB1 pregled varijanta može imati oslabljena uloga TGF-β1 kao supresor tumora u ranijoj fazi napredovanja tumora. Također je poznato da je TGF-β1 može prebaciti s prigušivačem tumora na pojačivač tumora u kasnoj fazi raka [26]. Nakon što su tumori narasli veći i postati metastatski, rezultanta povećanje somatskih mutacija ili dobitke u kopijama onkogena možda nadmašuje ulogu varijanti potiskuju u kasnim stadijima tumora, što je dovelo do nema razlike u ukupnom preživljavanju bolesnika s različitim genotipovima u TGFB1 + pregled 915 G &C SNP-a. Međutim, ova nagađanja treba validirati u rigorozno dizajniranih studija s mnogo većeg uzorka i više informacija o mutacije spektra u tumorima.
VEGF, kao ključni posrednik angiogeneze, također igra važnu ulogu u razvoju karcinoma. VEGF pregled polimorfizmi su također pokazala da je povezan s preživljavanjem u oba raka želuca i raka debelog crijeva [35, 36]. Međutim, rezultati iz objavljenih studija ostaju u suprotnosti nego uvjerljiv. U grčkoj želučane studiji raka od pet VEGF
SNP (-2578C > A, -1154G > A, -634G > C, -460T > C do + 936C > T) u 312 bolesnika [36], VEGF
-2578 AA, -634 CC i + 936TT genotipova povezan sa značajno nižom HR (bolje preživljavanje) za 6-godišnje preživljavanje kolorektalnog karcinoma. Zanimljivo, još rano grčka studija od 100 pacijenata s rakom želuca sugerirao da su samo VEGF pregled -634CC /CG genotipova povezana sa smanjenim (lošije preživljenje) 10-godišnje preživljenje u usporedbi s GG genotipom [35]. Naši podaci o 167 pacijenata s rakom želuca pokazala da VEGF pregled -634CC /CG nosači doista imali slabu 1-godišnje preživljavanje od onih s VEGF pregled -634 GG genotipa. Amano et al. [37] Također je izvijestio da nema značajne povezanost je zabilježeno između frekvencija VEGF pregled -460T &C, + 405G-C i 936C > T genotipova i opstanak tri godine bez bolesti pacijenata karcinoma endometrija u japanskom studija 105 pacijenata karcinoma endometrija. Zbog svih tih studija, uključujući i naše, su relativno mali, bilo je ograničena sposobnost za obavljanje snažnije haplotip na bazi analize da je analiza jednog alela ili locus efekt [34].
Ovo je prvo izvješće, koje naše znanje, koje uključuju TGFB1 pregled i VEGF pregled polimorfizma i preživljavanje u bolesnika s rakom želuca uglavnom sastoje od bijele populacije; Međutim, bilo je nekih ograničenja ovog istraživanja. Iako smo pokušali prikupiti podatke ponavljanje tih bolesnika, nismo mogli istražiti ovaj krajnje točke zbog nedostatka unaprijed definiran follow-up plan. Drugo ograničenje bila je činjenica da smo uključeni samo tri uobičajene TGFB1 pregled SNP-ova i tri VEGF pregled SNP-ova. Moguće je da su neke druge važne SNP propustili ili da je opaženi udruge mogu biti zbog drugih polimorfizama u LD s SNP smo proučavali. Također, nema podataka o razinama proteina u serumu /plazmi bile su dostupne za korelacije genotipa-fenotipa, jer samo DNA uzorci su dostupni od tih bolesnika. Postoje i drugi geni, pored TGFB1 pregled i VEGF pregled koji također igraju ulogu u rastu stanica i angiogeneze, što predstavlja složene interakcije mnogih aktiviranje i inhibitornih faktora [38]. Nadalje, Helicobacter pylori infekcija pregled, prisutnost ili odsutnost koji nije naveden u ovom istraživanju, smatra se da je uzrok progresivnog nakupljanja genotipske promjene karcinoma želuca, što može dovesti do sporadičnog rak želuca karcinogeneze [39 ]. Konačno, veličina je studija bila premala da ima dovoljno snage da otkrije male sati. Na primjer, naš proračun post-power predložio da se veličina uzorka za jednaki broj (n = 55) ispitanika u svakoj genotipa svake SNP, moć za otkrivanje HR od 2 bio < 0,4, a > 0,8 za HR od 3.4 za vrijeme od 5 godina praćenja. Stoga, samo nalaz sati za 2 godine opstanka TGFB1 pregled + 915G > C će imati dovoljno snage, što ukazuje na mnogo veći studija će biti potrebno da se učinkovito testirati hipotezu za učinaka ukupno preživljenje pregled. Zaključak pregled Ukratko, otkrili smo da su neki polimorfizmi TGFB1
i VEGF pregled može biti povezana s 1- ili 2-godišnje stope preživljavanja oboljelih od raka želuca. Međutim, ova studija je mali, i razni genetski i Epigenetske događaji također su dovele do povezanosti TGFB1 pregled i VEGF pregled polimorfizama i rak želuca prognozu i opstanak. Stoga, veće i bolje dizajnirane studije su potrebne za prevladavanje ograničenja u ovom istraživanju (posebice podatke o Helicobacter pylori pregled infekcije), a dodatno potvrđuju naše primjedbe. Pregled Kratice pregled TGF-β1
: pregled, transformirajući faktor rasta beta 1
VEGF pregled: pregled vaskularnog endotelnog faktora rasta
LD:
povezanost ravnoteže
PCR-RFLP: polimorfizam duljine reakcija-restrikcijski pregled polimeraze lanca
Ili: omjer
koeficijenti
HR: pregled, omjer rizika
CI: pregled, interval pouzdanosti
SNP:. pregled polimorfizma jednostrukog nukleotida
deklaracijama
Zahvale
Ova studija je podržan u sklopu koje National Institutes of Health daje R01 ES 11740-07 i CA 131274-01 (na QW) i CA 16672 (na MD Anderson Cancer Center). Zahvaljujemo Margaret pluća i Kathryn Patterson za pomoć u zapošljavanju podanike; Li-E Wang, Zhensheng Liu, Yawei Qiao, Min Zhao, Jianzhong On i Kejin Xu za svoje laboratorijske pomoći; i Diane Hackett i Maude Veechfor za znanstvena uređivanje pregled Elektronski dodatnog materijala pregled 13046_2009_181_MOESM1_ESM.doc Dodatna datoteka 1. TGFB1 i VEGF genotip distribucija i ukupno preživljenje. Dobiveni podaci predstavljaju statističku analizu TGFB1 i VEGF genotipa distribucija i ukupno preživljenje. (DOC 69 KB) 13046_2009_181_MOESM2_ESM.doc dodatne datotečne 2: TGFB1 i VEGF genotip distribucija i 1-i 2-godišnje preživljavanju. Dobiveni podaci predstavljaju statističku analizu TGFB1 i VEGF genotipa distribucija i 1 i 2 godine preživjelima. (DOC 66 KB) autora originalnih dostavljeni datoteke za slike
Ispod su linkovi na autora izvornika dostavljenih datoteka za slike. 13046_2009_181_MOESM3_ESM.pdf autora izvorna datoteka za Slika 1 suprotstavljenih interesa
Autori izjavljuju da nemaju konkurentne interese. Pregled

• Validacija novu metodu koja kombinira oba HER2 imunohistokemija i HER2 srebro dual-boje in situ hibridizacije na jednom slajdu za ispitivanje karcinom želuca
• Dokazna rezoniranje temelji model za dijagnosticiranje limfnih čvorova metastaza kod raka želuca