Polymorfismia TGFB1 ja VEGF-geenien ja selviytymistä potilaalla on mahasyöpä

Polymorfismit TGFB1
ja VEGF
geenejä ja eloonjäämistä potilailla, joilla on mahalaukun syövän
Abstract
tausta
Jotkut TGFB1
ja VEGF
polymorfismien uskotaan olevan funktionaalinen. Koska nämä geenit ovat mukana kasvaimen kasvuun ja etenemiseen lukien angiogeneesi, levittäminen ja invasiivisuus, me arveltu, että nämä polymorfismit liittyisi selviytymisen potilailla mahalaukun syövän. Tool Menetelmät
Me genotyyppi TGFB1
-509 C > T, +1869 T > C, ja +915 G > C ja VEGF
-1498T > C, -634G > C ja + 936C > T 167 potilailla, joilla on mahalaukun syöpä. Kaplan ja Meier menetelmä, log-rank testejä, ja Coxin suhteellinen vaara malleja, arvioimme yhdistysten keskuudessa TGFB1
ja VEGF
variantteja yleisten, 1 vuoden ja 2-vuoden eloonjäämisluvut.
Tulokset
Vaikka ei ollut merkittäviä eroja kokonaiselossaoloaikaa keskuudessa kaikki polymorfismien testattu, potilaalla on TGFB1
+ 915CG ja CC genotyyppien oli huonompi 2 vuoden pysyvyys (oikaistu riskisuhde (HR), 3,06; 95%: n luottamusväli (CI), 1,09-8,62; P
= 0,034) kuin potilailla, joilla oli GG-genotyyppi oli. Lisäksi potilaat heterotsygoottinen VEGF
-634CG oli myös huonompi 1-vuoden eloonjäämisen (oikaistu HR, 2,08; 95% CI, 1,03-4,22; P
= 0,042) kuin potilailla, joilla on -634GG genotyyppi.
Johtopäätös
Meidän tutkimuksessa todettiin, että TGFB1
+ 915CG /CC ja VEGF
-634CG genotyypit voi liittyä lyhyen aikavälin elinkelpoisuuden mahalaukun syöpäpotilailla. Kuitenkin suurempia tutkimuksia tarvitaan tarkistaa näitä havaintoja.
Johdanto
mahalaukun caner, potilailla, joilla on samat ennusteeseen viittaavia ominaisuudet ja samat hoitoyhdistelmien voi olla eri kliinisiä tuloksia. Vaikka vaihe on paras saatavissa oleva toimenpide kasvaimen aggressiivisuutta ja ennuste on selvästi merkittäviä eroja jopa saman kasvaimen vaiheessa [1, 2]. Siksi olisi hyödyllistä parantaa ennustetekijöiden tarkkuutta tunnistamalla helposti molekyylimarkkereina jotka ennustavat jotkut vaihtelua kliinisiä tuloksia. Viime vuosikymmenen aikana monet tutkimukset ovat osoittaneet, että geneettisiä muutoksia rooleja kehittymistä ja etenemistä mahasyövän [3]. Näistä molekyylimarkkereita, yhden emäksen monimuotoisuus (SNP: t) ovat yleisimmin tutkitaan geneettistä vaihtelua, joka voi edistää potilaiden hoitotuloksia [4].
Epidemiologisia ja kliiniset tutkimukset ovat ehdottaneet, että molemmat TGF-β1 ja VEGF saattaa olla tärkeä rooli synnyssä mahan [5, 6]. Esimerkiksi TGFB1
ja VEGF
variantit liittyvät muuttuneeseen proteiinia tuotteita, jotka saattavat edistää vaihtelu yksittäisissä syöpäalttiuteen ja kliinisiin tuloksiin [4]. Sekä TGFB1
ja VEGF
geenit ovat erittäin polymorfisia, kuulemma ottaa 168 ja 140 versioita, vastaavasti, mutta vain harvat Näiden varianttien kuuluvat promoottori tai koodaavia alueita, jotka voivat olla mahdollisesti funktionaalisia http: //www. NCBI. NLM. NIH. gov /SNP /. Näiden varianttien useita SNP on kuvattu tärkeänä modulaatioon geenifunktioiden [7-9] ja tiettävästi mukana etiologiassa erilaisten syöpien [10-13].
TGF-β1 reitti on kriittisesti mukana kasvainten kehittymiseen ja etenemiseen. Kasvaimen soluviljelmissä, TGF-β1 on antiproliferatiivisia vaikutuksia ja se voi estää syövän etenemisen varhaisessa vaiheessa, kun taas se voi myös kiihdyttää invaasio ja etäpesäkkeiden myöhemmissä vaiheissa syövän etenemisen [14, 15]. Eräs kokeellinen tutkimus kertoo, että TGF-β1-välitteisen Alk 5-Smad 3-reitti on välttämätöntä Shh-proteiini edistää liikkuvuutta ja invasiivisuus mahasyövän soluissa [16]. Hiiren kokeet osoittivat myös, että muuttunut TGF-β1 liittyi piilevä TGF-β1 sitovia proteiineja, jotka voivat aiheuttaa tulehduksen ja kasvaimia [17] ja että häiritsi TGF-β1 polku voi johtaa kasvaimen kasvua lisäämällä tuumoriangiogeneesin aiheuttama vähentynyt ilmentyminen trombospondiinin-1 [18]. Ihmisillä TGF-β1 oli suurempi herkkyys kuin Karsinogeenisyys alkioantigeenit kasvainsoluissa mahalaukun syöpäpotilaiden [16]. Lisäksi sekä kokeellisia ja kliinis-patologisten tutkimukset ovat osoittaneet rooli VEGF-perheen proteiinien etäpesäkkeiden kautta imunestejärjestelmän ja kliinisissä tuloksissa useissa ihmisen kiinteiden kasvainten, mukaan lukien mahasyöpä [19].
Tässä tutkimuksessa olemme valitsin genotyyppiin valittu yhteiseen (eli pienet alleelifrekvensseiltään > 0,05) TGFB1
ja VEGF
SNP: joka joko johtaa ei-synonyymi aminohapon muutokset [20], tai on liitetty alemman ekspressiotasot näiden geenien [ ,,,0],8, 21], jotka merkitsevät nämä SNP voi olla toimiva. Oletimme, että potentiaalisesti toiminnallinen polymorfismeilla TGFB1 ja VEGF liittyisi kliinisiä tuloksia potilailla, joilla on mahalaukun syöpä. Erityisesti me
arvioitiin yhteydestä kliinisiin tuloksiin mahasyövän, kuten kokonaiselinaika, ja kullakin seuraavista SNP: kolme TGFB1
SNP, joista yksi promoottori SNP (-509 C > T) ja kaksi eksonin 1 SNP (+869 T > C ja +915 G > C) ja kolme VEGF
SNP, joista yksi promoottori SNP (-1498T > C), yksi 5'-transloimaton alue SNP (-634G > C) ja yksi 3' transloimaton alue SNP (+936 C > T). Tool menetelmät
Tutkimuskanta
ennakoiva analyysi koostui 167, joilla on vasta diagnosoitu ja histologisesti varmennettu mahasyövän, joka hoidettiin Teksasin yliopiston MD Anderson Cancer center, Houston, Texas huhtikuusta 2003 heinäkuussa 2008. tutkimusprotokolla hyväksyi meidän Institutional Review Board (IRB) ja kaikki potilaat antoivat tietoon perustuva suostumus käyttämällä IRB-hyväksytty tietoisen suostumuksen muodossa. Hylkäämisperusteet mukana ne eivät äskettäin diagnosoitu ja ne on käsitelty muualla ennen tuloaan M. D. Anderson. Nämä potilaat kuuluivat tähän analyysiin, sillä niiden varastoida verinäytteitä oli saatavissa DNA: n eristämiseksi.
Genotyypin
Genominen DNA uutettiin buffy coat osa verinäyte kunkin potilaan käyttämällä Veri Mini Kit (Qiagen, Valencia, CA) valmistajan ohjeiden mukaisesti. DNA puhtaus ja pitoisuudet määritettiin spektrofotometrisesti absorbanssin mittaus 260 ja 280 nm: ssä UV-spektrofotometrillä. Kolme valittua TGFB1
SNP [yksi (-509 C > T /rs1800469) promoottorissa ja kaksi (+869 T > C /rs1800470 ja +915 G > C /rs1800471) eksonissa 1] ja kolme promoottori VEGF
SNP: [yksi (-1498T > C /rs833061) on promoottori, joka on yksi (-634G > C /rs2010963) 5'-transloimaton alue ja yksi (+ 936C > T /rs3025039) on 3'- alue] genotyypitettiin käyttäen polymeraasiketjureaktiota (PCR) - restriktiofragmentin pituuden polymorfismi (RFLP) -menetelmää. Genotyypit TGFB1
SNP: määritettiin, kuten aikaisemmin on kuvattu [22], ja määritykset VEGF
SNP: tä myös aiemmin raportoitu [23]. PCR-RFLP-pohjainen genotyypitysmääritys kaksi tutkimusapulaisia ​​itsenäisesti lukemaan geeli kuvia, ja toistuvat määritykset suoritettiin, jos ne eivät pääse sopimukseen testattujen genotyyppi. Lisäksi, toistuvat määritykset suoritettiin satunnaisesti valittu 10% näytteistä valittiin satunnaisesti suorittaa toistuvia määrityksiä tulosten ollessa 100% sopusoinnussa.
Tulokset tiedonkeruun
Kaikki 167 mahasyövän potilaalla oli käytettävissä seuraavat up tiedot tuloksista. Koko elinaika laskettiin rekisteröintipäivämäärästä at M. D. Anderson, jona viimeinen kosketus tai kuoleman. Potilaat, jotka olivat vielä elossa viime kontakti oli pidettävä sensuroitu tapahtuma analyysissä. Ikä diagnoosin, sukupuoli, ja tyyppi hoitoja (eli leikkaus ja kemoterapia) käytettiin covariates analyysissä. Ikä diagnoosin luokiteltiin kahteen ryhmään sen mukaan, keski-ikä (≤ 57 ja > 57 vuotta).
Tilastollinen analyysi
Kaksipuoliset chi-neliö ja t
suoritettiin määrittämään tilastollisesti merkittäviä eroja jakaumat kategorisen muuttujien (esim TGFB1
ja VEGF
alleelit ja genotyyppien) mukaan demografiset muuttujat ja kliiniset piirteet ja keinot jatkuvia muuttujia (esim ikä ja elinaika), tässä järjestyksessä. Jakaumat genotyyppien testattiin poikkeama Hardy-Weinberg tasapaino (HWE), ja haplotyyppien varten varianttien saman geenin todentaa PHASE-ohjelman [9], jonka jokaisen yksilön todennäköisyys, jolla on tietty haplotyyppiparin oli arvioitu, ja haplotyyppiparin kanssa Suurin arvioitu todennäköisyys määrättiin yksittäisten. Pearsonin Khin neliö tai globaalin testin käytettiin testaamaan selviytymisen eroja potilaiden kaikkien haplotypes. Kaiken eloonjääneiden kolmesta genotyyppiryhmien kunkin SNP analysoitiin käyttämällä Kaplan-Meier menetelmällä, ja log-rank-testiä käytettiin testaamaan yhdenvertaisuutta elossapysymisaikajakaumat stratifioituna genotyypit. Käytimme yhden ja usean Coxin suhteellisten riskien mallia arvioida vaikutus kullakin genotyypin eloonjäämiseen läsnäollessa muiden covariates. Molemmat ikä diagnoosin ja välinen aika rekisteröinti ja diagnoosin päivämäärä (sairauden vahvistus tauti) käsiteltiin numeerinen covariates Coxin mallissa. Vahvista oletus suhteellinen vaarojen Coxin regressiomallin lisäsimme ajasta riippuva muuttuja malliin, ja oletus vahvistettiin. Hazard suhde (t) ja niiden vastaavat 95%: n luottamusväli (CI) laskettiin säätö muita covariates samaan malliin. Yhteinen vaikutukset TGFB1
ja VEGF
SNP ja niiden vuorovaikutusta tupakointi ja juominen on mahalaukun syövän riski arvioitiin myös. Kaikki tilastolliset testit olivat 2-puolinen, jossa P
arvo 0,05 pidettiin merkittävinä ja kaikki laskettiin käyttäen SAS-ohjelmiston (versio 9.1; SAS Institute, Cary, NC).
Tulokset
Ominaisuudet tutkimusperusjoukon
kliiniset ja patologiset ominaisuudet 167 potilaalla, jotka osallistuivat tähän tutkimukseen on esitetty taulukossa 1. oli 114 urosta (68,3%) ja 53 naisilla (31,7%), joiden ikä vaihteli 32-89 vuotta. Coxin regressioanalyysin välistä suhdetta eloonjäämisaste ja ennusteeseen viittaavia ominaisuuksia, huomasimme, että kumpikaan ikä, sukupuoli, kansallisuus, tupakointi, eikä alkoholin tila oli tilastollisesti liittyy yleiseen eloonjäämiseen (P
= 0,339, 0,988, 0,297, 0,475, 0,809, tässä järjestyksessä) .table 1 Ominaisuudet tutkimuksen sairastavien potilaiden populaatiosta mahasyöpä
Ominaisuudet
No. Potilaiden
No. of Kuolleet
MST (kk)
P
*
Yhteensä aiheista
Ikä (keskiarvo) B 167
60
0,339
≤57 vuotta
68
27
21,2
> 57 vuotta
99
33
31,0
Sukupuoli
0,988
Male
114
41
23,3
Female
53
19
28,9
Alkuperä
0,297
White
117
45
28,8
kuin White †
50
15
19,1
Smoke
0,475
koskaan
34
14
20,6
koskaan
133
46
30,1
Alkoholi
0,809
koskaan
62
23
23,2
koskaan
105
37
29,3
Location
0,069
Vatsa
118
36
24,3
Ruokatorven
25
13
27,2
GEJ
24
11
16,6
Histologia
0,356
Suoliston
118
45
28,1
sinettisormus
49
15
24,6
erilaistuminen
0,694
huono
96
37
21,8
Kohtalainen-köyhä
28
10
29,8
Kohtalainen-Well
42
13
22,6
Clinical Stage
< 0,001
I + II
65
9
30,4
III + IV
101
51
22,7
Etäpesäke
< 0,001
kyllä ​​
90
49
21,2
ei
77
11
34,2
Kemoterapia
< 0,001
kyllä ​​
121
54
26,3
ei
46
6
10,4
Surgery
< 0,001
kyllä ​​
63
11
39,2
ei
104
49
18.4
Lyhenteet: MST, Keskimääräinen elinaika; GEJ, gastroesofageaalinen risteykseen.
* Chi-square test.
† Mukana 13 aasialaiset, 16 mustat, 19 latinot, ja 2 intiaanit.
Kasvainten 118 (70,7%) potilaista oli sijaitsee mahan ja ne, 49 (29,3%) potilaalla oli sijaitsee gastroesofageaalinen risteykseen (GEJ). Riippumatta kasvaimen sijainti, kaikki potilaat olivat adenokarsinooma. Näistä 118 (70,7%) potilaista oli suoliston ja 49 (29,3%) sinettisormus. Ryhmittelimme tyypit eriyttäminen seuraaviin kolmeen luokkaan: heikko, kohtalainen-köyhä ja kohtalaisen hyvin, ja määrä ja prosenttiosuus näistä kolmesta ryhmästä oli 96 (57,8%), 28 (16,9%) ja 42 (25,3%), vastaavasti. Kaikilla potilailla, kliinis-patologinen ominaisuudet kuten kasvain sijainti, histologian ja erilaistumista asema ei merkittävästi liittynyt yleistä selviytymistä yhden muuttujan analyysissä (P
= 0,069, 0,356 ja 0,694, tässä järjestyksessä). Kliininen kasvaimen vaiheiden mukaan International Union Against Cancer (UICC) kriteerit olivat seuraavat: 65 (38,9%) oli vaiheen I + II ja 101 (61,1) oli vaiheen III + IV (taulukko 1).
Joukossa 167 potilasta , 121 (72,4%) saaneet kemoterapiaa, ja 63 (37,7%) sai leikkausta; lopussa seuranta-aikana, 60 (35,9%) potilaalla oli kuollut. Keskimääräinen seuranta-aika oli 18,0 ± 13,3 kuukautta potilaiden, jotka olivat vielä elossa, ja keskimääräinen elinaika kaikille potilaille oli 29,4 kuukautta. Edennyt pitkälle, etäpesäkkeitä, kemoterapia ja kirurgia olivat kaikki liittyy yleiseen eloonjäämiseen (P
< 0,001 kaikissa) (taulukko 1). Esimerkiksi keskimääräinen eloonjääminen oli 34,2 kuukautta potilailla ilman etäpesäkkeitä ja 21,2 kuukautta niille, joilla on etäpesäkkeitä. Ne, jotka saivat kemoterapiaa ja kirurgian oli pitempi keskimääräinen elinaika kuin ne, jotka eivät (26,3 kuukautta vs. 10,4 kuukautta kemoterapiaa ja 39,2 kuukautta vs. 18,4 kuukautta leikkauksen).
HWE, kytkentäepätasapaino- ja haplotyyppien TGFB1 ja VEGF
sillä TGFB1
, yksi kolmesta SNP: iden (rs1800469C > T, rs1800470T > C ja rs1800471G > C) ei ollut HWE (P
< 0,05 rs1800469C > T), mikä viittaa mahdollisen valinnan bias, mutta mikään VEGF
SNP (rs833061T > C, rs2010963G > C ja rs3025039C > T) poikennut HWE (P
> 0,05 kaikille). Yksikään paria TGFB1
tai VEGF
SNP oli korkea kytkentäepätasapainossa (ts r 2 välillä 0,039 ja 0,541, kaikki < 0,08). Vain neljä TGFB1
haplotypes ja viisi VEGF
haplotypes oli alleelin tiheys > 0,05 (CTG, 0,570, CCG, 0,190, TCG, 0,167 ja CCC, 0,063 varten TGFB1
ja CGC, 0,344, TCC, 0,287; TGC, 0,192, CGT, 0,072 ja TCT, 0,051 VEGF
). Koska pieni otoskoko, emme laskea diplotypes.
TGFB1 ja VEGF genotyyppi jakaumat ja eloonjäämiseen
Kun kaikki mahasyöpäpotilaista analysoitiin kokonaiselinaika, ei havaittu merkittävää eroa jakaumissa keskimääräinen eloonjääminen aikaa genotyyppejä minkään polymorfismien tutkittu. Koska siellä oli muutamia osallistujia vähäinen homotsygoottinen variantti ryhmiä, yhdistimme heterotsygoottinen ja vähäinen muunnos homotsygoottisia genotyyppien yhdessä lisäanalyysi, olettaen hallitseva geneettinen malli, mutta ei ollut vielä yhdistyksen välillä havaita polymorfismien ja kokonaiselinaikaa (ks Additional tiedosto 1) . Lisäksi kun mahasyöpäpotilaista stratifioitiin iän, sukupuolen, etnisen alkuperän, ja metastaattinen tila, eroa jakelussa mukaan keskimääräinen elinaika, jonka kuusi SNP todettiin niiden joukossa alaryhmiin (ks Additional tiedosto 1).
TGFB1 ja VEGF genotyyppi jakaumat ja 1-ja 2-vuoden eloonjääneiden
Koska ennuste on yleensä huono edenneiden mahasyöpä, eloonjäämismediaani harvoin lähestyy 1 tai 2 vuoden [2]. Esillä olevassa tutkimuksessa, useimmissa tapauksissa oli vaiheessa IV (101/167), jossa keskimääräinen eloonjäämisaika vain 16,2 kuukautta (95% CI, 12,8-24,9). Siksi me myös lasketaan 1 vuoden ja 2-vuoden eloonjäämisluvut potilailla, joilla on eri genotyypit (ks Additional tiedosto 2). Yleistä 1 vuoden ja 2 vuoden eloonjääneiden kaikki potilaat olivat 51,5% ja 22,1%, vastaavasti. Vaikka ei ollut merkittäviä eroja eloonjäämisluvuissa välillä eniten genotyyppien, potilailla, joilla on TGFB1 +
915CG /CC genotyyppien oli parempi 1 vuoden ja 2-vuoden pysyvyys kuin ne, joilla oli GG-genotyyppi (oikaistu HR, 2,13; 95% CI , 0,76-6,01; P
= 0,122 ja oikaistun HR, 3,06; 95% CI, 1,09-8,62; P
= 0,034, vastaavasti) (kuvio 1). Lisäksi potilaille heterotsygoottinen VEGF
-634CG oli myös parempi 1 vuoden pysyvyys (oikaistu HR, 2,08; 95% CI, 1,03-4,22; P
= 0,042) kuin ne, joilla VEGF
- 634 GG-genotyyppi. Kuva 1 Kumulatiivinen selviytyminen toiminnot genotyyppien TGFB1 +915 G > C (rs1800471) ja VEGF -634G > C (rs2010963).
Lisäksi analyysit yhdistämällä alleelit, genotyypit, ja haplotyyppien saman geenin eivät perustelleet havaintojen yhden lokuksen analyysi (tuloksia ei esitetty), osittain siksi, että alhaisen LD joukossa SNP ja pienessä tutkimuksessa koko, joka ei salli edelleen kerrostuminen analyysiä.
keskustelu
etiologia mahasyöpä on monitekijäinen, multigenetic ja monivaiheinen [24, 25]. On tunnettua, että aikana, karsinogeneesiä, TGF-β voi siirtyä tuumorisuppressori kasvaimen edistäjän myöhemmissä vaiheissa syöpä [26]. Dual rooli syövän kehittymisessä, on suurta kiinnostusta analysoida rooli geneettistä vaihtelua TGFB1
syövän etenemiseen ja potilaan eloonjäämiseen. Esimerkiksi TGFB1
-509C > T ja rs1982073 (tai rs1800470) polymorfismit on osoitettu olevan yhteydessä rintasyöpään selviytymisen kiinalaisessa väestöstä [27-30] ja kemosädehoito vaste 175 Suomen potilaalla on pään ja niskan levy- syöpä [31], tässä järjestyksessä. Kumpikaan ei kuitenkaan TGFB1
+ 869T > C eikä + 915G > C polymorfismien osoitti mitään yhteyttä kasvaimen uusiutumisen ja eteneminen rakkokasvaimista ilman lihasten invasiivisia on Espanjan väestöstä [32]. Vaikka korealainen tutkimus osoitti, että muunnos T genotyypit TGFB1
-509C > T SNP liittyi pienempi riski sairastua keuhkosyöpään [33], kiinalainen tutkimus 414 potilasta ja 414 valvontaa [34] ilmoitetaan, että genotyypit ei liittynyt yleistä riski sairastua mahalaukun syöpään, mutta vähentynyt riski riski vaiheen I tai II mahasyövän. Ei kuitenkaan selviytyminen analyysit esiteltiin näissä tutkimuksissa.
Kuten huomataan, emme löytäneet mitään tilastollista näyttöä tukemaan Merkitsevä yhteys TGFB1
polymorfismien ja eloonjäämiseen mahasyövän. Kuitenkin merkittävä assosiaatio TGFB1 +
915 CG /CC-genotyyppien ja 2 vuoden eloonjääminen kaikkien mahasyöpäpotilaista viittaa siihen, että tämä TGFB1
variantti voi olla heikennetty rooli TGF-β1 tuumorisuppressorina aikaisemmassa vaiheessa syövän etenemisen. On myös tunnettua, että TGF-β1 voi siirtyä tuumorisuppressori kasvaimen edistäjän myöhään vaiheessa syöpä [26]. Kun kasvaimet olivat kasvaneet isompi ja tulla metastaattinen, tuloksena kasvu somaattisista mutaatioista tai voittoja kopiot onkogeenien saattanut suuremmat roolin vaimentimen varianttien loppuvaiheissa kasvain, mikä eroa eloonjäämisaste potilaiden eri genotyypit TGFB1 +
915 G > C SNP. Tämä keinottelu on validoitu tiukemmin suunnitelluissa tutkimuksissa, joissa on paljon suurempi otoskoko ja lisätietoja mutaatio spektrin kasvaimissa.
VEGF, keskeisenä välittäjänä angiogeneesin, on myös tärkeä rooli kehitettäessä syövät. VEGF
polymorfismien on myös osoitettu olevan yhteydessä selviytymistä sekä mahasyövän ja peräsuolen syöpä [35, 36]. Kuitenkin julkaistujen tutkimusten tulokset jäävät ristiriidassa sijaan ratkaisevia. Kreikkalaisessa mahasyövän tutkimus viisi VEGF
SNP (-2578C > A, -1154G > A, -634G > C, -460T > C ja + 936C > T) 312 potilaalla [36], VEGF
-2578 AA, -634 CC ja + 936TT genotyypit liittyi merkitsevästi pienempi HR (parempi eloonjääminen) 6 vuoden pysyvyys peräsuolen syöpiä. Mielenkiintoista, toinen varhainen kreikkalaistutkimus 100 mahasyöpäpotilaista ehdotettiin ainoastaan ​​VEGF
-634CC /CG genotyypit liittyy alentunut (huonompi selviytyminen) 10 vuoden pysyvyys, verrattuna GG genotyypin [35]. Meidän tiedot 167 mahasyöpäpotilaista osoitti, että VEGF
-634CC /CG harjoittajat todellakin ollut huono 1 vuoden eloonjääminen kuin VEGF
-634 GG-genotyyppi. Amano et al. [37] Lisäksi on raportoitu, että mitään merkittävää yhteyttä ei havaittu taajuudet VEGF
-460T > C, + 405g > C, ja 936C > T genotyypit ja 3 vuoden taudista vapaan eloonjäämisen kohtukarsinooma potilaita Japani tutkimus 105 kohtukarsinooma potilaille. Koska kaikki nämä tutkimukset, myös meidän, ovat olleet suhteellisen pieniä, oli rajallinen kyky suorittaa tehokkaampi haplotyyppi perustuva analyysi että analyysi yhden alleelin tai lokuksen vaikutus [34].
Tämä on ensimmäinen raportti, jotta Tietääksemme johon TGFB1
ja VEGF
polymorfismien ja selviytymisen mahasyöpäpotilaista pääasiassa koostuu valkoihoinen väestö; oli kuitenkin joitakin rajoituksia tässä tutkimuksessa. Vaikka yritimme kerätä toistumista tietoja näistä potilaista, emme voineet tutkia tätä päätepisteenä puuttuessa ennalta määritellyn seurannan suunnitelma. Toinen rajoitus oli se, että me vain mukana kolme yhteistä TGFB1
SNP ja kolme VEGF
SNP. On mahdollista, että muita tärkeitä SNP: tä jäänyt tai että havaitut yhdistykset voivat johtua myös muista polymorfismit LD kanssa SNP tutkimme. Myös ole tietoja seerumin /plasman proteiineihin tasot olivat käytettävissä genotyyppi-fenotyyppi korrelaatio analyysi, koska vain DNA näytteet olivat saatavilla näistä potilaista. On muitakin geenejä lisäksi TGFB1
ja VEGF
että myös tärkeä rooli solujen kasvun ja angiogeneesin, mikä monimutkainen vuorovaikutus monien aktivoivan ja estävä tekijät [38]. Lisäksi Helicobacter pylori
infektion läsnäolo tai puuttuminen, jota ei ole raportoitu tässä tutkimuksessa, katsotaan olevan syynä progressiivisen kerääntymisen genotyyppimuutoksia mahasyövän, joka voi johtaa satunnaisten mahasyövän karsinogeneesiä [39 ]. Lisäksi tutkimuksessa koko oli liian pieni saada riittävästi tehoa havaita pieniä tuntia. Esimerkiksi meidän jälkeinen tehon laskeminen ehdotti, että otos on sama määrä (n = 55) potilaista kussakin genotyypistä kussakin SNP, valta havaita HR = 2 oli < 0,4, mutta > 0,8 varten HR 3,4 varten seuranta-aika 5 vuotta. Siksi vain toteaminen tuntiin 2-vuoden pysyvyys TGFB1
+ 915G > C olisi riittävä teho, mikä viittaa paljon suurempi tutkimus olisi tarpeen tehokkaasti testata hypoteesia vaikutusten kokonaiselinaika.
johtopäätös
Yhteenvetona, olemme havainneet, että jotkut polymorfismit TGFB1
ja VEGF
voi liittyä 1- tai 2-vuoden eloonjäämisluvut mahalaukun syöpäpotilailla. Kuitenkin tässä tutkimuksessa on pieni, ja erilaiset geneettiset ja epigeneettiset tapahtumat voivat myös johtanut yhdistyksen välillä TGFB1
ja VEGF
polymorfismien ja mahasyövän ennustetta ja selviytymistä. Siksi suurempia ja paremmin suunniteltuja tutkimuksia edellytetään rajoitusten voittamiseksi esillä olevassa tutkimuksessa (erityisesti tiedot helikobakteeri
infektio) ja edelleen vahvistavat havaintojemme.
Lyhenteet
TGF-β1
:
Transforming kasvutekijä beeta 1
VEGF
:
endoteelikasvutekijä
LD:
kytkentäepätasapaino-
PCR-RFLP:
polymeraasiketjureaktio-restriktiofragmenttipituuspolymorfismin
OR:
riskisuhde
HR:
riskisuhde
CI:
luottamusväli
SNP:
yhden emäksen monimuotoisuus.
julistukset
Kiitokset
Tämä tutkimus tukee osittain National Institutes of Health myöntää R01 ES 11740-07 ja CA 131274-01 (kohteeseen QW) ja CA 16672 (MD Anderson Cancer Center). Kiitämme Margaret Lung ja Kathryn Patterson niiden apua rekrytointiin aiheista; Li-E Wang, Zhensheng Liu, Yawei Qiao, Min Zhao, Jianzhong hän, ja Kejin Xu heidän laboratorio apua; ja Diane Hackett ja Maude Veechfor tieteelliseen muokkausta.
Elektroninen oheismateriaali
13046_2009_181_MOESM1_ESM.doc Additional tiedosto 1: TGFB1 ja VEGF genotyyppi jakaumat ja kokonaiselossaolo. Tiedot tarjotaan edustavat tilastollinen analyysi TGFB1 ja VEGF genotyyppi jakaumat ja kokonaiselossaolo. (DOC 69 KB) 13046_2009_181_MOESM2_ESM.doc Muita tiedosto 2: TGFB1 ja VEGF genotyyppi jakaumat ja 1-ja 2-vuoden eloon jäämisestä. Tiedot tarjotaan edustavat tilastollinen analyysi TGFB1 ja VEGF genotyyppi jakaumat ja 1-ja 2-vuoden eloon jäämisestä. (DOC 66 KB) Tekijät "alkuperäiset toimitti asiakirjat kuville
Alla linkkejä kirjoittajien alkuperäiset toimitti asiakirjat kuville. 13046_2009_181_MOESM3_ESM.pdf Kirjoittajien alkuperäinen tiedosto kuvio 1 Kilpailevat edut
Kirjoittajat ilmoittavat, että heillä ei ole kilpailevia intressejä.

• Validoinnin uutta menetelmää yhdistyvät sekä HER2 immunohistokemia ja HER2 dual-väri hopea in situ yhtä dia mahakarsinoo- testing
• Todennäköisyyspäätelmä päättely mallia diagnosointiin imusolmuke etäpesäke mahasyövän