Polymorfismer av TGFB1 og VEGF gener og overlevelse av pasienter med mage cancer

polymorfismer av TGFB1 Hotell og VEGF
gener og overlevelse av pasienter med magekreft
Abstract
Bakgrunn
Noen TGFB1 Hotell og VEGF
polymorfismer antas å være funksjonell. Gitt at disse genene er involvert i tumorvekst og progresjon inkludert angiogenese, formidling, og invasivitet, hypotese vi at disse polymorfismer ville bli assosiert med overlevelse hos pasienter med magekreft.
Metoder
Vi genotypet TGFB1
-509 C > T, 1869 T > C, og 915 G > C og VEGF
-1498T > C, -634G > C, og + 936C > T i 167 pasienter med magekreft. Bruk av Kaplan og Meier metoden, log-rank tester, og Cox proporsjonal hazard modeller, vi evaluert assosiasjoner blant TGFB1
og VEGF
varianter med generelle, 1-årig og 2-års overlevelse.
Resultater
Selv om det var ingen signifikante forskjeller i total overlevelse blant alle polymorfismer testet, pasienter med TGFB1
+ 915CG og CC genotyper hadde en dårligere to-års overlevelse (justert hazard ratio (HR) 3,06, 95% konfidensintervall (CI), 1,09 til 8,62; P
= 0,034) enn pasienter med GG genotype hadde. I tillegg har pasienter heterozygote for VEGF
-634CG hadde også et dårligere ett-års overlevelse (justert HR, 2,08; 95% CI, 01.03 til 04.22; P
= 0,042) enn pasienter med -634GG genotype <. br> Konklusjon
Vår studie antydet at TGFB1
+ 915CG /CC og VEGF
-634CG genotyper kan være assosiert med kortsiktig overlevelse i mage kreftpasienter. Imidlertid er større studier er nødvendig for å bekrefte disse funnene.
Innledning
I mage Caner, kan pasienter med de samme clinicopathologic egenskaper og de samme behandlingsregimer har ulike kliniske resultater. Selv om scenen er den beste tilgjengelige kliniske mål på svulst aggresjon og prognose, det er helt klart store forskjeller selv innen samme tumorstadium [1, 2]. Derfor ville det være nyttig å forbedre den prognostiske nøyaktigheten ved å identifisere lett tilgjengelige molekylære markører som forutsier noen av variasjonen i kliniske resultater. I de siste tiårene, har mange studier vist at genetiske endringer spille roller i utvikling og progresjon av magekreft [3]. Blant disse molekylære markører, enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) er de mest undersøkte genetiske variasjonen som kan bidra til pasientenes kliniske resultater [4].
Epidemiologiske og kliniske undersøkelser har antydet at både TGF-β1 og VEGF kan spille en viktig rolle i onkogenesen av magen [5, 6]. For eksempel er TGFB1 Hotell og VEGF
varianter assosiert med endrede proteinprodukter, som kan bidra til variasjon i individuell mottakelighet for kreft og kliniske resultater [4]. Både TGFB1 Hotell og VEGF
gener er svært polymorfe, angivelig å ha 168 og 140 varianter, henholdsvis, men bare noen få av disse variantene er innenfor arrangøren eller koding områder som kan være potensielt funksjonell http: //www. NCBI. NLM. NIH. gov /SNP /. Av disse variantene har flere SNP'er blitt beskrevet som viktige i modulering av genfunksjoner [7-9] og velig er involvert i etiologien av ulike kreftformer [10-13].
TGF-β1 reaksjonsveien er kritisk involvert i tumorutvikling og progresjon. I kreftcellekulturer, har TGF-β1 anti-proliferative effekter og kan blokkere tumorprogresjon i en tidlig fase, mens det kan også akselererer invasjon og metastasering i de senere stadier av tumorprogresjon [14, 15]. En eksperimentell studie rapporterte at TGF-β1-mediert aktivering av ALK5-Smad 3 veien er vesentlig for den Shh protein for å fremme motilitet og invasivitet i magekreftceller [16]. Mus Forsøkene viste også at forandrede TGF-β1 var forbundet med de latente TGF-β1 bindingsproteiner som kan forårsake betennelse og svulster [17], og at den avbrutt TGF-β1 vei kan føre til tumorvekst ved å øke tumor-angiogenese indusert av redusert ekspresjon av thrombospondin-1 [18]. Hos mennesker, TGF-β1 hadde en høyere sensitivitet enn carcinomaoppfinnelse-embryonale antigenene i tumorceller fra magekreftpasienter [16]. Videre har både eksperimentelle og klinisk-patologiske studier antydet en rolle for VEGF familien av proteiner i metastase gjennom lymfesystemet og i kliniske resultater i flere menneskerettighets solide tumorer, inkludert magekreft [19].
I denne studien har vi valgte å genotype valgt vanlige (dvs. mindre allel frekvens > 0,05) TGFB1
og VEGF
SNP'er som enten fører til ikke-synonyme aminosyre-endringer [20] eller har vært forbundet med lavere ekspresjonsnivåer av disse genene [ ,,,0],8, 21], som innebærer disse SNPs kan være funksjonell. Vi antok at potensielt funksjonelle polymorfismer i TGFB1 og VEGF ville bli assosiert med kliniske resultater hos pasienter med magekreft. Nærmere bestemt, etter vi evaluert sammenhengen mellom kliniske resultater i magekreft, inkludert total overlevelse, og hver av de følgende SNPs: tre TGFB1
SNPs, inkludert en promoter SNP (-509 C > T) og to ekson 1 SNPs (869 T > C og 915 G > C) og tre VEGF
SNPs, inkludert en promoter SNP (-1498T > C), en 5'-utranslaterte område SNP (-634G > C) og en 3' uoversatt region SNP (936 C > T)
Metoder
Study befolkningen
Dette prospektiv analyse besto av 167 pasienter med nylig diagnostisert og histologisk bekreftet magekreft, som ble behandlet ved The University of Texas MD Anderson Cancer. center, Houston, Texas mellom april 2003 og juli 2008. studien protokollen ble godkjent av vår Institutional Review Board (IRB) og alle pasienter ga informert samtykke ved bruk av IRB-godkjent informert samtykke skjema. Eksklusjonskriterier inkludert de som ikke nylig diagnostisert og de som har blitt behandlet andre steder før du kommer til M. D. Anderson. Disse pasienter ble inkludert i denne analysen, fordi de lagrede blodprøvene var tilgjengelige for DNA-ekstraksjon genotyping
Genomisk DNA.
Ble ekstrahert fra buffy coat fraksjonen av blodprøven for hver pasient ved hjelp av en Blood Mini Kit (Qiagen, Valencia, CA) i henhold til produsentens instruksjoner. DNA renhet og konsentrasjon ble bestemt ved spektrofotometrisk måling av absorbans ved 260 og 280 nm ved UV-spektrofotometer. De tre utvalgte TGFB1
SNPs [en (-509 C > T /rs1800469) i arrangøren og to (869 T > C /rs1800470 og 915 G > C /rs1800471) i ekson 1] og tre promoter VEGF
SNP'er [ett (-1498T > C /rs833061) i promoteren, en (-634G > C /rs2010963) i det 5'-utranslaterte område, og en (+ 936C > T /rs3025039) i det 3'-utranslaterte region] ble genotypet ved bruk av polymerase kjedereaksjon (PCR) - rflp (RFLP) -metoden. Genotyper av TGFB1
SNP ble bestemt som tidligere beskrevet [22], og analyser av VEGF
SNP ble også tidligere rapportert [23]. For PCR-RFLP-basert genotyping analysen, to forskningsassistenter uavhengig lese gel bildene, og de gjentatte analyser ble utført, hvis de ikke er enige om testet genotype. I tillegg ble gjentatt analyser utført på en tilfeldig valgt 10% av prøvene ble tilfeldig utvalgt til å utføre gjentatte analyser med de resultatene som er 100% konkordant.
Utfall datainnsamling
Alle 167 magekreftpasienter som hadde tilgjengelig føl- kopiere data på utfallet. Den totale overlevelsestiden ble beregnet fra tidspunktet for registrering ved M.D. Anderson til datoen for siste kontakt eller død. Pasienter som fortsatt var i live på den siste kontakten ble ansett som en sensurert hendelse i analysen. Alderen ved diagnose, kjønn og type behandlinger (dvs. kirurgi og kjemoterapi) ble brukt som kovariater i analysen. Alderen ved diagnose ble kategorisert i to grupper etter gjennomsnittsalderen (≤ 57 og > 57 år). Statistical Analysis
Tosidig chi-square og t
tester ble utført for å fastslå noen statistisk signifikante forskjeller i fordelingen av kategoriske variabler (for eksempel den TGFB1
og VEGF
alleler og genotyper) av demografiske variabler og kliniske funksjoner og i hjelp av kontinuerlige variabler (for eksempel alder og overlevelse tid), henholdsvis. Fordelingen av genotypene ble testet med hensyn til avvik fra Hardy-Weinberg likevekt (HWE), og de haplotypene for varianter av det samme genet ble rekonstruert i henhold til den PHASE programmet [9], ved hvilken hver enkelt sannsynlighet for å ha en spesiell haplotype par var anslått, og haplotype paret med høyest beregnet sannsynlighet ble tildelt den enkelte. Pearsons chi-kvadrat eller global test ble anvendt for å teste for overlevelse forskjeller mellom pasienter ved alle haplotyper. Totalt overlevelse blant de tre genotypgruppene av hver SNP ble analysert ved hjelp av Kaplan-Meier-metoden, og den log-rank test ble brukt til å teste for likestilling mellom overlevelse distribusjoner stratifisert etter genotyper. Vi brukte univariable og multivariat Cox modeller for å beregne effekten av hver genotype på overlevelse i nærvær av andre kovariabler. Både alder ved diagnose og tidsintervallet mellom registrering og diagnose dato (patologisk bekreftelse av sykdom) ble behandlet som numeriske kovariater i Cox modell. For å bekrefte antagelsen om proporsjonale farer i en Cox regresjonsmodell, la vi en tidsavhengig variabel i modellen, og antagelsen ble bekreftet. Hazard ratio (HRS) og tilhørende 95% konfidensintervall (CIS) ble beregnet med justering for andre kovariater i samme modell. Den felles effekter av TGFB1 Hotell og VEGF
SNPs og deres samspill med røyking og drikking på magekreft risiko ble også vurdert. Alle statistiske tester ble 2-sidig, med en P
verdi på 0,05 anses vesentlig, og alle ble beregnet ved hjelp av SAS programvare (versjon 9.1, SAS Institute, Cary, NC).
Resultater
Kjennetegn på studiepopulasjonen
Kliniske og patologiske egenskaper ved de 167 pasienter som deltok i denne studien er vist i tabell 1. Det var 114 menn (68,3%) og 53 kvinner (31,7%), hvis alder varierte fra 32 til 89 år. Bruke Cox regresjonsanalyse av sammenhengen mellom total overlevelse og clinicopathologic egenskaper, fant vi at verken alder, kjønn, etnisitet, røyking eller alkohol status var statistisk assosiert med total overlevelse (P
= 0,339, 0,988, 0,297, 0,475, 0,809, henholdsvis) .table 1 Kjennetegn på studiepopulasjonen av pasienter med magekreft
Kjennetegn
No. av pasienter
No. dødsfall
MST (måneder)
P product: *
Totalt fag
Alder (gjennomsnitt)
167
60
0,339
≤57 år
68
27
21,2
> 57 år
99
33
31,0
Kjønn
0,988
Mann
114
41
23,3
Kvinne
53
19
28,9
Hvit
117
45
Etnisitet
0,297 28.8
Non-White †
50
15
19,1
Smoke
0,475
aldri
34
14
20,6
Ever
133
46
30,1
Alkohol
0,809
aldri
62
23
23,2
Ever
105
37
29,3
Sted
0,069
magen
118
36
24,3
spiserør
25
13
27,2
GEJ
24
11
16,6
Histologi
0,356
Tarm
118
45
28,1
Signet ring
49
15
24,6
differensiering
0,694
dårlig
96
37
21,8
Moderat fattig
28
10
29,8
Moderat-Well
42
13
22,6
klinisk Stage
< 0.001
I + II
65
9
30,4
III + IV
101
51
22,7
metastaser
< 0.001
ja
90
49
21,2
ingen
77
11
34,2
Kjemoterapi
< 0.001
ja
121
54
26,3
ingen
46
6
10,4
kirurgi
< 0.001
ja
63
11
39,2
ingen
104
49
18,4
Forkortelser: MST, median overlevelse; GEJ, gastroøsofageal krysset. Product: * Chi-kvadrat test.
† Inkludert 13 asiater, 16 svarte, 19 latinamerikanere, og 2 indianere indianere.
Svulstene av 118 (70,7%) av pasientene ble plassert på mage og de av 49 (29,3%) av pasientene ble plassert på gastroøsofageal krysset (GEJ). Uavhengig av tumor beliggenhet, alle pasientene hadde adenokarsinom. Av disse 118 (70,7%) av pasientene var tarm og 49 (29,3%) signetring. Vi gruppert typer differensiering i følgende tre kategorier: fattige, moderat fattige og moderate-brønn, og antallet og andelen av disse tre gruppene var 96 (57,8%), 28 (16,9%) og 42 (25,3%), henholdsvis. Hos alle pasienter, ble klinisk-patologiske egenskaper inkludert svulst plassering, histologi og differensiering status ikke signifikant assosiert med total overlevelse i univariat analyse (P
= 0,069, 0,356 og 0,694, henholdsvis). Kliniske kreft etapper i henhold til International Union Against Cancer (UICC) kriterier var som følger: 65 (38,9%) hadde stadium I + II og 101 (61,1) hadde stadium III + IV (tabell 1)
Blant de 167 pasientene. , 121 (72,4%) fikk kjemoterapi, og 63 (37,7%) fikk kirurgi; ved slutten av oppfølgingsperioden, hadde 60 (35,9%) pasienter døde. Gjennomsnittlig oppfølgingstid var 18,0 ± 13,3 måneder for pasienter som fortsatt var i live, og bety overlevelse for alle pasienter var 29,4 måneder. Avansert stadium, metastaser, kjemoterapi og kirurgi var alle tilknyttet total overlevelse (P
< 0,001 for alle) (tabell 1). For eksempel, den midlere overlevelsestiden var 34,2 måneder for pasienter uten metastase og 21,2 måneder for de med metastasering. De som fikk kjemoterapi og kirurgi hadde en lengre bety overlevelse tid enn de som ikke gjorde det (26,3 måneder versus 10,4 måneder for kjemoterapi og 39,2 måneder versus 18,4 måneder for kirurgi).
HWE, koblingsulikevekt og haplotyper TGFB1 og VEGF
for TGFB1
, en av de tre SNPs (rs1800469C > T, rs1800470T > C og rs1800471G > C) var ikke i HWE (P
< 0,05 for rs1800469C > T), noe som tyder på en mulig utvalg bias, men ingen av VEGF
SNPs (rs833061T > C, rs2010963G > C og rs3025039C > T) vek fra HWE (P
> 0,05 for alle). Ingen av parene av TGFB1
eller VEGF
SNPs var i høy koblingsulikevekt (dvs. r 2 mellom 0,039 og 0,541, alle < 0,08). Bare fire TGFB1
haplotyper og fem VEGF
haplotyper hadde et allel frekvensen av > 0,05 (CTG, 0,570, CCG, 0.190, TCG, 0,167 og CCC, 0,063 for TGFB1 Hotell og CGC, 0,344, TCC, 0,287, TGC, 0,192, CGT, 0.072 og TCT, 0,051 for VEGF
). På grunn av den lille størrelsen på utvalget, hadde vi ikke
TGFB1 og VEGF genotype distribusjoner og total overlevelse
Når alle magekreftpasienter ble analysert for total overlevelse, ble ingen signifikant forskjell funnet i fordelinger av gjennomsnittlig overlevelse beregne diplotypes. tid ved genotyper for hvilken som helst av polymorfismer studert. Fordi det var få deltakere i de mindre homozygote variant grupper, vi kombinert heterozygote og mindre variant homozygote genotyper sammen for ytterligere analyse, forutsatt en dominant genetisk modell, men det var fortsatt ingen sammenheng mellom oppdagede polymorfismer og total overlevelse (se tilleggsfiler 1) . Videre, når mage kreftpasienter ble fordelt etter alder, kjønn, etnisitet og metastatisk status, ingen forskjell i fordelingen etter bety overlevelse tid av de seks SNPs ble funnet blant undergrupper (se tilleggsfiler 1).
TGFB1 og VEGF genotypen distribusjoner og en-og to-års overlevelse
fordi prognosen er generelt dårlig i avanserte tilfeller av magekreft, median overlevelse sjelden nærmer 1 eller 2 år [2]. I denne studien, de fleste av tilfellene var stadium IV (101/167) med en median overlevelse på bare 16,2 måneder (95% KI, 12,8 til 24,9). Derfor har vi også beregnet en-årige og 2-års overlevelse for pasienter med ulike genotyper (se tilleggsfiler 2). De overordnede 1-årig og 2-års overlevelse for pasientene var 51,5% og 22,1%, henholdsvis. Selv om det var ingen signifikante forskjeller i overlevelse mellom de fleste genotyper, pasienter med TGFB1 +
915CG /CC genotyper hadde bedre 1-års og to års overlevelse enn de med GG genotype (justert HR, 2,13; 95% CI , 0,76 til 6,01; P
= 0,122 og justert HR 3,06, 95% KI, 1,09 til 8,62; P
= 0,034, henholdsvis) (figur 1). Videre pasienter heterozygote for VEGF
-634CG hadde også en bedre en-års overlevelse (justert HR, 2,08; 95% CI, 01.03 til 04.22; P
= 0,042) enn de med VEGF Anmeldelser - 634 GG genotype. Figur 1 Akkumulert overlevelse funksjoner av genotypene TGFB1 915 G > C (rs1800471) og VEGF -634G >. C (rs2010963)
Videre analyser kombinere lene, genotyper, og haplotyper av samme genet ikke underbygge funnene fra enkelt locus analyse (data ikke vist), delvis på grunn av den lave LD blant SNPs og liten studie størrelse som ikke tillater for videre stratifisering analyse.
diskusjon
Årsakene til magekreft er multifaktoriell, multigenetic og flertrinns [24, 25]. Det er kjent at under carcinogenesis, kan TGF-β skifte fra en tumor suppressor til en svulst forsterker i de senere stadier av kreft [26]. Med dobbel rolle i kreftutvikling, er det stor interesse for å analysere rollen av genetisk variasjon i TGFB1
i kreft progresjon og pasient overlevelse. For eksempel TGFB1
-509C > har T og rs1982073 (eller rs1800470) polymorfismer vist seg å være assosiert med brystkreft overlevelse i en kinesisk befolkning [27-30] og kjemoradioterapi respons i 175 finske pasienter med hode- og nakke plateepitel kreft [31], respektivt. Men verken TGFB1
+ 869T > C eller + 915G > C polymorfismer viste noen sammenheng med tumor tilbakefall og progresjon i blæren svulster uten muskel invasiv i en spanske befolkningen [32]. Mens en koreansk studie viste at varianten T genotyper av TGFB1
-509C > T SNP ble assosiert med en redusert risiko for lungekreft [33], en kinesisk studie av 414 pasienter og 414 kontroller [34] rapporterte at genotypene var ikke forbundet med en samlet risiko for å utvikle magekreft, men med en redusert risiko for risiko for stadium i eller II magekreft. Men analyser ingen overlevelse ble presentert i disse studiene.
Som nevnt, vi fant ikke noe statistisk bevis for å støtte en signifikant sammenheng mellom TGFB1
polymorfismer og total overlevelse i magekreft. Men det signifikant sammenheng mellom TGFB1 +
915 CG /CC genotyper og 2-års overlevelse for alle magekreftpasienter tyder på at dette TGFB1
variant kan ha svekket rolle TGF-β1 som en tumor suppressor i tidligere stadium for tumorprogresjon. Det er også kjent at TGF-β1 kan veksle fra en tumor suppressor til en svulst enhancer i sent stadium av kreft [26]. Når tumorene hadde vokst større og blir metastatisk, kan den resulterende økningen i somatiske mutasjoner eller gevinster i kopiene av onkogener har oppveies rolle suppressor-variantene i de sene stadier av tumoren, noe som fører til ingen forskjell i total overlevelse av pasientene med ulike genotyper av TGFB1 +
915 G > C SNP. Men denne spekulasjon å få den godkjent i mer grundig designede studier med et mye større utvalg og mer informasjon om mutasjonen spektrum i svulstene.
VEGF, som en viktig formidler av angiogenese, spiller også en viktig rolle i utviklingen av kreft. VEGF
polymorfismer har også vist seg å være forbundet med overlevelse i både mage kreft og kolorektal kreft [35, 36]. Men resultatene fra publiserte studier forbli inkonsekvent enn absolutt. I en gresk ventrikkelkreftstudien av fem VEGF
SNPs (-2578C > A, -1154G > A, -634G > C, -460T > C, og + 936C > T) i 312 pasienter [36], VEGF
-2578 AA, -634 CC og + 936TT genotyper var assosiert med en betydelig lavere HR (bedre overlevelse) for 6-års overlevelse av kolorektal kreft. Interessant, en annen tidlig gresk studie av 100 mage kreftpasienter foreslått at bare den VEGF
-634CC /CG genotyper ble assosiert med en redusert (dårligere overlevelse) 10-års overlevelse, sammenlignet med GG genotype [35]. Våre data om 167 mage kreftpasienter indikerte at VEGF
-634CC /CG bærere faktisk hadde en dårlig 1-års overlevelse enn de med VEGF
-634 GG genotype. Amano et al. [37] rapporterte også at ingen signifikant sammenheng ble observert mellom frekvensene av VEGF
-460T > C, + 405G > C, og 936C > T genotyper og 3 års sykdomsfri overlevelse for livmorkreft pasienter i en japansk studie av 105 endometrial carcinoma pasienter. Fordi alle disse studier, inkludert våre, har vært forholdsvis liten, var begrenset evne til å utføre den mer kraftige haplotype basert analyse at analysen av et enkelt allel eller locus effekt [34].
Dette er den første rapporten, for å vår kunnskap, som involverer TGFB1 Hotell og VEGF
polymorfismer og overlevelse i magekreftpasienter i hovedsak består av en kaukasiske befolkningen; Men var det noen begrensninger i denne studien. Selv om vi prøvde å samle tilbakefall data på disse pasientene, kan vi ikke undersøke dette endepunktet på grunn av mangel på en forhåndsdefinert oppfølgingsplan. En annen begrensning var at vi bare tatt tre vanlige TGFB1
SNPs og tre VEGF
SNPs. Det er mulig at noen andre viktige SNPs ble savnet eller at de observerte foreninger kan skyldes andre polymorfismer i LD med SNPs vi studerte. Også ingen data om serum /plasmaproteinnivået var tilgjengelige for genotype-fenotype korrelasjonsanalyse, fordi bare DNA-prøvene var tilgjengelig fra disse pasientene. Det er andre gener i tillegg til TGFB1
og VEGF Hotell som også spiller en rolle i cellevekst og angiogenese, som representerer et komplekst samspill av mange aktiverende og hemmende faktorer [38]. Videre er Helicobacter pylori-infeksjon
, tilstedeværelse eller fravær av dem var ikke rapportert i den foreliggende undersøkelse, som anses for å være årsaken til en progressiv akkumulering av genotypiske endringer i magekreft, noe som kan føre til sporadiske magekreft carcinogenese [39 ]. Endelig studien størrelsen var for liten til å ha tilstrekkelig kraft til å oppdage små timer. For eksempel vår post-styrkeberegning antydet at utvalgsstørrelsen for et likt antall (n = 55) av pasientene i hver genotype av hver SNP, makt til å oppdage en HR på 2 var mindre enn 0,4, men > 0.8 for en HR på 3,4 for en oppfølgingstid på 5 år. Derfor er det bare funn av timer for 2-års overlevelse av TGFB1
+ 915G > C ville ha en tilstrekkelig kraft, noe som tyder på en mye større studie ville være nødvendig for å effektivt teste vår hypotese for effekter av total overlevelse
. Konklusjon
Oppsummert fant vi at noen polymorfismer TGFB1 Kjøpe og VEGF
kan være forbundet med 1- eller 2-års overlevelse av magekreftpasienter. Imidlertid er denne studien liten, og ulike genetiske og epigenetiske hendelser kan også ha ført til en sammenheng mellom TGFB1 Hotell og VEGF
polymorfismer og magekreft prognose og overlevelse. Derfor blir større og bedre designede studier er nødvendig for å overvinne begrensninger i denne studien (særlig informasjon om Helicobacter pylori
infeksjon) og videre bekrefte våre observasjoner.
Forkortelser
TGF-β1
:
Transforming growth factor beta 1
VEGF
:
Vaskulær endotelial vekstfaktor
LD:
koblingsulikevekt
PCR-RFLP:
polymerase chain reaction-rflp
OR:
odds ratio
HR:
hasardratio
CI:
konfidensintervall
SNP.
enkeltnukleotidpolymorfi
Erklæringer
Takk
Denne studien ble støttet delvis av National Institutes of Health gir R01 ES 11740-07 og CA 131274-01 (til QW) og CA 16672 (til MD Anderson Cancer Center). Vi takker Margaret Lung og Kathryn Patterson for deres hjelp i å rekruttere fagene; Li-E Wang, Zhensheng Liu, Yawei Qiao, Min Zhao, Jianzhong han, og Kejin Xu for deres laboratorium assistanse; og Diane Hackett og Maude Veechfor for vitenskapelig redigering
Electronic supplerende materiale
13046_2009_181_MOESM1_ESM.doc tilleggsfiler. 1: TGFB1 og VEGF genotype distribusjoner og total overlevelse. Dataene representerer statistisk analyse av TGFB1 og VEGF genotype distribusjoner og total overlevelse. (DOC 69 KB) 13046_2009_181_MOESM2_ESM.doc tilleggsfiler 2: TGFB1 og VEGF genotype distribusjoner og en-og to-års overlevelse. Dataene representerer statistisk analyse av TGFB1 og VEGF genotype distribusjoner og en-og 2-års overlevelse. (DOC 66 KB) Forfatternes opprinnelige innsendte filer for Images Nedenfor er linkene til forfatternes opprinnelige innsendte filer for bilder. 13046_2009_181_MOESM3_ESM.pdf Forfatteroriginalfilen for figur 1 Konkurrerende interesser
Forfatterne hevder at de ikke har noen konkurrerende interesser.

• Validering av en ny metode som kombinerer både HER2 immunhistokjemi og HER2 dual-farge sølv in situ hybridisering på ett lysbilde for magekreft testing
• En bevis resonnement basert modell for diagnostisering av lymfeknutemetastaser i magekreft