I polimorfismi di TGFB1 e geni VEGF e la sopravvivenza dei pazienti con cancer

gastrica polimorfismi di TGFB1
e VEGF
geni e la sopravvivenza dei pazienti con cancro gastrico
Abstract
sfondo
Alcuni TGFB1
e VEGF
polimorfismi sono da ritenersi funzionale. Dato che questi geni sono coinvolti nella crescita tumorale e nella progressione tra cui l'angiogenesi, la diffusione, e invasività, abbiamo ipotizzato che questi polimorfismi potrebbero essere associati con la sopravvivenza in pazienti con carcinoma gastrico.
Metodi
Abbiamo genotipizzazione TGFB1
-509 C > T, 1869 T > C, e 915 G > C e VEGF
-1498T > C, -634G > C e + 936C > T in 167 pazienti con cancro gastrico. Utilizzando il metodo di Kaplan e Meier, log-rank test, e Cox modelli di rischio proporzionale, abbiamo valutato le associazioni tra TGFB1
e VEGF
varianti con complessiva, di 1 anno, e il tasso di sopravvivenza a 2 anni.
Risultati
Anche se non ci sono state differenze significative nei tassi di sopravvivenza globale tra tutti i polimorfismi testati, i pazienti con TGFB1
+ 915CG e genotipi CC ha avuto un povero di 2 anni di sopravvivenza (hazard ratio aggiustato (HR), 3,06; 95% intervallo di confidenza (CI), 1,09-8,62; P = 0.034
) rispetto ai pazienti con il genotipo GG aveva. Inoltre, i pazienti eterozigoti per VEGF
-634CG aveva anche un 1 anno di sopravvivenza (HR aggiustato, 2,08; 95% CI, 1,03-4,22; P = 0,042
) più poveri rispetto ai pazienti con genotipo -634GG <. br> Conclusione
Il nostro studio ha suggerito che TGFB1
+ 915CG /CC e VEGF
genotipi -634CG possono essere associati con la sopravvivenza a breve termine in pazienti affetti da cancro gastrico. Tuttavia, sono necessari studi più ampi per verificare questi risultati.
Introduzione
In Caner gastrica, i pazienti con le stesse caratteristiche clinico-patologiche e gli stessi regimi di trattamento possono avere diversi esiti clinici. Sebbene fase è la migliore disponibile misura clinica di aggressione del tumore e la prognosi, ci sono chiaramente importanti differenze anche all'interno di una stessa fase del tumore [1, 2]. Pertanto, sarebbe utile per migliorare l'accuratezza prognostica individuando marcatori molecolari facilmente accessibili che prevedono alcune delle variazioni nei risultati clinici. Negli ultimi decenni, molti studi hanno dimostrato che alterazioni genetiche svolgono un ruolo nello sviluppo e nella progressione del cancro gastrico [3]. Tra questi marcatori molecolari, polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) sono la variazione genetica più comunemente indagato che possono contribuire a esiti clinici dei pazienti [4]
. Epidemiologici e indagini cliniche hanno suggerito che sia TGF-β1 e VEGF possono svolgere un importante ruolo nella oncogenesi dello stomaco [5, 6]. Ad esempio, TGFB1
e VEGF
varianti sono associati con prodotti proteici alterati, che possono contribuire alla variazione suscettibilità individuale al cancro e gli esiti clinici [4]. Sia TGFB1
e VEGF
geni sono altamente polimorfici, avendo riferito 168 e 140 varianti, rispettivamente, ma solo pochi di queste varianti sono all'interno del promotore o regioni codificanti che possono essere http potenzialmente funzionale: //www. NCBI. nlm. NIH. gov /SNP /. Di queste varianti, diverse SNPs sono stati descritti come importante nella modulazione delle funzioni dei geni [7-9] e secondo come riferito coinvolti nella eziologia di vari tumori [10-13].
Il percorso di TGF-β1 è criticamente coinvolti nello sviluppo del tumore e la progressione. In colture di cellule tumorali, TGF-β1 ha effetti anti-proliferativi e può bloccare la progressione del tumore nelle sue fasi iniziali, mentre può anche accelera invasione e metastasi nelle fasi successive della progressione tumorale [14, 15]. Uno studio sperimentale ha riportato che l'attivazione del TGF-β1-mediata del ALK5-Smad 3 percorso è essenziale per la proteina Shh per promuovere la motilità e l'invasività in cellule di cancro gastrico [16]. esperimenti mouse hanno inoltre dimostrato che alterata TGF-β1 è stato associato con le latenti proteine ​​leganti TGF-β1 che possono causare infiammazioni e tumori [17] e che il percorso di TGF-β1 interrotto può portare alla crescita del tumore, aumentando l'angiogenesi tumorale indotta da diminuita espressione di trombospondina-1 [18]. Negli esseri umani, TGF-β1 aveva una sensibilità maggiore di antigeni di cancerogenesi-embrionali in cellule tumorali di pazienti affetti da cancro gastrico [16]. Inoltre, entrambi gli studi sperimentali e clinico-patologici hanno suggerito un ruolo per la famiglia del VEGF di proteine ​​in metastasi attraverso il sistema linfatico e nei risultati clinici in diversi tumori solidi umani, tra cui il cancro gastrico [19].
In questo studio, abbiamo ha scelto di genotipo comune, selezionato (per esempio, la frequenza dell'allele minore > 0,05) TGFB1
e VEGF
SNPs che o portano a cambiamenti di aminoacidi non-sinonime [20] o sono stati associati a più bassi livelli di espressione di questi geni [ ,,,0],8, 21], che implicano questi SNP può essere funzionale. Abbiamo ipotizzato che polimorfismi potenzialmente funzionali in TGFB1 e VEGF sarebbero associati con gli esiti clinici in pazienti con cancro gastrico. In particolare, abbiamo
valutato l'associazione tra i risultati clinici nel carcinoma gastrico, tra cui la sopravvivenza globale, e ciascuno dei seguenti SNPs: tre TGFB1
SNP, tra cui uno promotore SNP (-509 C > T) e due esone 1 SNPs (869 T > C e 915 G > C) e tre VEGF
SNP, tra cui uno promotore SNP (-1498T > C), una regione 5'-non tradotta SNP (-634G > C) e uno 3' regione SNP non tradotta (936 C > T)
Metodi
Studio popolazione
Questa analisi prospettica consisteva di 167 pazienti con nuova diagnosi e istologicamente confermato cancro gastrico, che sono stati trattati presso l'Università del Texas MD Anderson Cancer. center, Houston, Texas tra aprile 2003 e luglio 2008. il protocollo di studio è stato approvato dal nostro Institutional Review Board (IRB) e tutti i pazienti hanno dato consenso informato utilizzando il modulo di consenso informato IRB approvato. I criteri di esclusione includevano quelli non nuova diagnosi e quelli essere stati trattati altrove prima di venire a M. D. Anderson. Questi pazienti sono stati inclusi in questa analisi perché i loro campioni di sangue conservati sono stati disponibili per l'estrazione del DNA
. Genotipizzazione
DNA genomico è stato estratto dalla frazione buffy coat del campione di sangue di ciascun paziente utilizzando un kit di sangue Mini (Qiagen, Valencia, CA) secondo le istruzioni del produttore. purezza DNA e concentrazioni sono state determinate mediante misura spettrofotometrica dell'assorbanza a 260 e 280 nm allo spettrofotometro UV. I tre TGFB1
SNP selezionati [uno (-509 C > T /rs1800469) nel promotore e due (869 T > C /rs1800470 e 915 G > C /rs1800471) in esone 1] e tre promotore VEGF
SNP [uno (-1498T > C /rs833061) nel promotore, uno (-634G > C /rs2010963) nella regione 5'-non tradotta, e uno (+ 936C > T /rs3025039) nel 3'-non tradotta regione] sono stati genotipizzati mediante reazione a catena della polimerasi (PCR) - metodo rflp (RFLP). Genotipi della TGFB1
SNP sono stati determinati come descritto in precedenza [22], e saggi sul VEGF
SNPs sono stati anche segnalati in precedenza [23]. Per il test di genotipizzazione PCR-RFLP-based, due assistenti di ricerca leggere in modo indipendente le immagini di gel, e sono stati eseguiti i test ripetuti, se non erano d'accordo sul genotipo testato. Inoltre, saggi ripetuti state effettuate su un selezionato casualmente 10% dei campioni sono stati selezionati casualmente per eseguire i test ripetuti con i risultati sono in sintonia 100%.
Raccolta dati Esito
Tutti 167 pazienti di cancro gastrico disponevano follow il backup dei dati su esito. Il tempo di sopravvivenza globale è stato calcolato a partire dalla data di registrazione presso M.D. Anderson alla data dell'ultimo contatto o di morte. I pazienti che erano ancora in vita l'ultimo contatto sono stati considerati come un evento censurato nell'analisi. L'età alla diagnosi, il sesso ed il tipo di trattamenti (cioè, la chirurgia e chemioterapia) sono stati utilizzati come covariate nell'analisi. L'età al momento della diagnosi è stata classificata in due gruppi in base all'età media (≤ 57 e > 57 anni).
Analisi statistica
due lati del chi-quadro e test t
sono stati eseguiti per determinare qualsiasi statisticamente significative differenze nelle distribuzioni delle variabili categoriali (ad esempio, il TGFB1
e VEGF
alleli e genotipi) di variabili demografiche e le caratteristiche cliniche e nei mezzi di variabili continue (ad esempio, l'età e il tempo di sopravvivenza), rispettivamente. Le distribuzioni dei genotipi sono stati testati per deviazione dal Hardy-Weinberg (HWE), e gli aplotipi per le varianti dello stesso gene sono state ricostruite secondo il programma PHASE [9], per cui la probabilità di ciascun individuo di avere una particolare coppia aplotipo è stato stimato, e la coppia aplotipo con la più alta probabilità stimata è stato assegnato per l'individuo. test chi-quadrato o globale di Pearson è stato utilizzato per verificare le differenze di sopravvivenza tra i pazienti da parte di tutti gli aplotipi. sopravvivenze globale tra i tre gruppi genotipo di ciascun SNP sono stati analizzati utilizzando il metodo di Kaplan-Meier e il log-rank test è stato utilizzato per verificare l'uguaglianza delle distribuzioni di sopravvivenza stratificati per genotipi. Abbiamo usato modelli di rischio proporzionale univariata e multivariata di Cox per stimare l'effetto di ogni genotipo sulla sopravvivenza in presenza di altre covariate. Sia l'età alla diagnosi e l'intervallo di tempo tra la registrazione e la data di diagnosi (conferma patologica della malattia) sono stati trattati come covariate numerici nel modello di Cox. Per confermare l'assunzione di rischi proporzionali in un modello di regressione di Cox, abbiamo aggiunto una variabile dipendente dal tempo al modello, e l'assunzione è stato confermato. Gli hazard ratio (HR) e le loro corrispondenti al 95% intervallo di confidenza (IC) sono stati calcolati con aggiustamento per altre covariate nello stesso modello. Sono stati inoltre valutati gli effetti congiunti della
TGFB1 e VEGF
SNP e le loro interazioni con fumare e bere sul rischio di cancro gastrico. Tutti i test statistici erano 2 lati, con un valore di P
di 0.05 considerati significativi e tutti sono stati calcolati utilizzando il software SAS (versione 9.1, SAS Institute, Cary, NC).
Risultati
Caratteristiche della popolazione in studio
caratteristiche cliniche e patologiche dei 167 pazienti arruolati in questo studio sono riportati nella tabella 1. ci sono stati 114 maschi (68,3%) e 53 femmine (31,7%), di età compresa tra 32 e 89 anni. Utilizzando l'analisi di regressione di Cox del rapporto tra sopravvivenza globale e le caratteristiche clinico-patologiche, abbiamo scoperto che né l'età, sesso, etnia, il fumo, né lo status di alcol erano statisticamente associati con la sopravvivenza generale (P = 0,339
, 0,988, 0,297, 0,475, 0,809, rispettivamente) .table 1 Caratteristiche della popolazione in studio di pazienti con cancro gastrico
Caratteristiche
No. di pazienti
No. di decessi
MST (mesi)
P
*
totali
Age (media)
167
60
0,339
≤57 anni
68
27
21,2
> 57 anni
99
33
31,0
genere
0,988
maschio
114
41
23,3
femminile
53
19
28,9
Razza
0,297
White
117
45
28.8
non-White †
50 | 15
19,1
fumo
0.475
Mai
34
14
20,6
ever
133
46
30,1
alcool
0,809
Mai
62
23
23,2
mai
105
37
29,3
Località
0,069
stomaco
118
36
24,3
Esofago
25
13
27,2
GEJ
24
11
16,6
Istologia
0,356
intestinale
118
45
28,1
Sigillo anello
49
15
24,6
differenziazione
0,694
Poor
96
37
21.8
moderato-poveri
28 10
29,8
moderato-Well
42
13
22,6
clinico fase
< 0.001
I + II
65
9
30,4
III + IV
101
51
22,7
Metastasi
< 0.001
sì
90
49
21,2
non
77
11
34,2
chemioterapia
< 0.001
sì
121
54
26,3
non
46
6
10,4
Chirurgia
< 0.001
sì
63
11
39,2
non
104
49
18,4
Abbreviazioni: MST, tempo mediano di sopravvivenza; GEJ, giunzione gastroesofagea.
* Test chi-quadro.
† Incluso 13 asiatici, 16 neri, ispanici, 19 e 2 indiani nativi.
I tumori di 118 (70,7%) dei pazienti si trovavano al stomaco e quelli di 49 (29,3%) pazienti erano situati a livello della giunzione gastroesofagea (GEJ). Indipendentemente dalla localizzazione del tumore, tutti i pazienti avevano un adenocarcinoma. Di questi, 118 (70,7%) pazienti erano intestinale e 49 (29,3%), anello con sigillo. Abbiamo raggruppato i tipi di differenziazione nelle seguenti tre categorie: poveri, moderata-poveri e moderata-bene, e il numero e la percentuale di questi tre gruppi sono stati 96 (57,8%), 28 (16,9%) e 42 (25,3%), rispettivamente. In tutti i pazienti, le caratteristiche clinico-patologici, tra cui localizzazione del tumore, l'istologia e lo stato di differenziazione non sono risultati significativamente associati con la sopravvivenza generale nell'analisi univariata (P = 0.069
, 0,356 e 0,694, rispettivamente). stadi tumorali clinico secondo le (UICC) criteri Unione internazionale contro il cancro sono stati i seguenti: 65 (38,9%) avevano stadio I + II e 101 (61,1) aveva stadio III + IV (Tabella 1)
Tra i 167 pazienti. , 121 (72,4%) ha ricevuto la chemioterapia, e 63 (37,7%) ha ricevuto un intervento chirurgico; al termine del periodo di follow-up, 60 (35.9%) pazienti erano morti. Il tempo medio di follow-up è stata di 18,0 ± 13,3 mesi per i pazienti che erano ancora in vita, e il tempo medio di sopravvivenza per tutti i pazienti era 29,4 mesi. stadio avanzato, le metastasi, chemioterapia e chirurgia sono stati tutti associati con la sopravvivenza generale (P
< 0,001 per tutti) (Tabella 1). Ad esempio, il tempo di sopravvivenza media è stata di 34,2 mesi per i pazienti senza metastasi e 21.2 mesi per quelli con metastasi. Coloro che hanno ricevuto la chemioterapia e la chirurgia ha avuto un più lungo tempo medio di sopravvivenza di quelli che non ha fatto (26,3 mesi contro 10,4 mesi per la chemioterapia e 39,2 mesi rispetto a 18,4 mesi per la chirurgia).
HWE, linkage disequilibrium e aplotipi TGFB1 e VEGF
per TGFB1
, uno dei tre SNPs (rs1800469C > T, rs1800470T > C e rs1800471G > C) non è stato in HWE (P
< 0,05 per rs1800469C > T), suggerendo un possibile bias di selezione, ma nessuno del VEGF
SNP (rs833061T > C, rs2010963G > C e rs3025039C > T) partivano da HWE (P
> 0.05 per tutti). Nessuna delle coppie di TGFB1
o VEGF
SNP erano in forte linkage disequilibrium (vale a dire, r 2 tra 0,039 e 0,541, tutto < 0,08). Solo quattro TGFB1
aplotipi e cinque VEGF
aplotipi avevano un allele frequenza di > 0,05 (CTG, 0.570, CCG, 0.190; TCG, 0,167 e CCC, 0,063 per TGFB1
e CGC, 0,344; TCC, 0,287; TGC, 0,192; CGT, 0,072 e TCT, 0,051 per VEGF
). A causa della piccola dimensione del campione, non abbiamo calcoliamo i diplotypes.
TGFB1 e VEGF distribuzioni genotipo e la sopravvivenza globale
Quando tutti i pazienti affetti da cancro gastrico sono stati analizzati per la sopravvivenza globale, nessuna differenza significativa è stata trovata nelle distribuzioni di sopravvivenza media volta da genotipi per uno qualsiasi dei polimorfismi studiati. Perché c'erano pochi partecipanti nei gruppi variante omozigoti minori, abbiamo unito la variante genotipi omozigoti eterozigoti e minori insieme per ulteriori analisi, ipotizzando un modello genetico dominante, ma non vi era ancora alcuna associazione tra polimorfismi rilevate e la sopravvivenza globale (vedi file aggiuntivo 1) . Inoltre, quando i pazienti affetti da cancro gastrico sono stati stratificati per età, sesso, etnia, e lo stato metastatico, nessuna differenza nella distribuzione in base al tempo medio di sopravvivenza dai sei SNPs è stato trovato tra i sottogruppi (vedi file supplementare 1).
TGFB1 e VEGF distribuzioni genotipo e 1-e sopravvivenza a 2 anni
Poiché la prognosi è generalmente scarsa in casi avanzati di cancro gastrico, la sopravvivenza mediana raramente si avvicina a 1 o 2 anni [2]. Nel presente studio, la maggior parte dei casi erano in stadio IV (101/167) con un tempo di sopravvivenza mediana di soli 16,2 mesi (95% CI, 12,8-24,9). Pertanto, abbiamo anche calcolato i tassi di sopravvivenza a 1 anno e 2 anni per i pazienti con differenti genotipi (vedi file supplementare 2). I complessivi sopravvivenza a 1 anno e 2 anni per tutti i pazienti erano 51,5% e 22,1%, rispettivamente. Anche se non ci sono state differenze significative nei tassi di sopravvivenza tra la maggior parte dei genotipi, i pazienti con genotipi TGFB1 +
915CG /CC avevano una migliore sopravvivenza a 1 anno e 2 anni rispetto a quelli con il genotipo GG (HR aggiustato, 2.13; 95% CI , 0,76-6,01; P = 0,122
e aggiustato HR, 3,06; 95% CI, 1,09-8,62; P = 0.034
, rispettivamente) (Figura 1). Inoltre, i pazienti eterozigoti per VEGF
-634CG avevano anche una migliore 1 anno tasso di sopravvivenza (HR aggiustato, 2,08; 95% CI, 1,03-4,22; P = 0,042
) rispetto a quelli con il VEGF
- 634 GG genotipo. Figura 1 funzioni di sopravvivenza cumulativa dei genotipi TGFB1 915 G > C (rs1800471) e VEGF -634G >. C (rs2010963)
ulteriori analisi che unisce gli alleli, genotipi e aplotipi dello stesso gene non giustificare i risultati di l'analisi singolo locus (dati non riportati), in parte a causa della bassa LD tra gli SNP e la dimensione piccolo studio che non ha permesso per ulteriori analisi stratificazione.
Discussione
l'eziologia del cancro gastrico è multifattoriale, multigenetic e multistadio [24, 25]. È noto che durante la carcinogenesi, TGF-β può passare da un soppressore tumorale ad un enhancer tumore nelle fasi successive di cancro [26]. Con duplice ruolo nello sviluppo del cancro, vi è grande interesse per analizzare il ruolo della variazione genetica in TGFB1
nella progressione del cancro e la sopravvivenza del paziente. Ad esempio, il TGFB1
-509C > T e rs1982073 (o rs1800470) polimorfismi hanno dimostrato di essere associato con la sopravvivenza del cancro al seno in una popolazione cinese [27-30] e la risposta chemioradioterapia in 175 pazienti finlandesi con testa e del collo squamoso cancro [31], rispettivamente. Tuttavia, né TGFB1
+ 869T > C né + 915G > C polimorfismi hanno mostrato alcuna associazione con recidive e la progressione tumorale nei tumori della vescica senza invasiva muscolare in una popolazione spagnola [32]. Mentre uno studio coreano ha dimostrato che i genotipi variante T del TGFB1
-509C > T SNP sono stati associati ad un ridotto rischio di cancro al polmone [33], uno studio cinese di 414 pazienti e 414 controlli [34] ha riferito che i genotipi non sono stati associati ad un rischio complessivo di sviluppare il cancro gastrico, ma con una diminuzione del rischio di rischio di stadio I o II cancro gastrico. Tuttavia, nessuna sopravvivenza analisi sono stati presentati in questi studi.
Come notato, non abbiamo trovato alcuna evidenza statistica per sostenere una significativa associazione tra TGFB1
polimorfismi e la sopravvivenza globale nel cancro gastrico. Tuttavia, la significativa associazione tra TGFB1 +
915 CG genotipi /CC e sopravvivenza a 2 anni per tutti i pazienti affetti da cancro gastrico suggerisce che questo TGFB1
variante può aver attenuato il ruolo di TGF-β1 come un soppressore del tumore nella fase precedente di progressione del tumore. È anche noto che TGF-β1 può passare da un soppressore tumorale ad un enhancer tumore nella fase tardiva di cancro [26]. Una volta che i tumori erano cresciuti più grande e diventare metastatico, il conseguente aumento mutazioni somatiche o aumenti di copie di oncogeni potrebbe aver superato il ruolo delle varianti soppressori nelle ultime fasi del tumore, che porta a nessuna differenza nella sopravvivenza complessiva dei pazienti con differenti genotipi della TGFB1 +
915 G > C SNP. Tuttavia, questa speculazione deve essere convalidato in studi più rigorosamente disegnati con un campione molto più grande e più informazioni sullo spettro di mutazione nei tumori.
VEGF, come un mediatore chiave dell'angiogenesi, svolge anche un ruolo importante nello sviluppo dei tumori. VEGF
polimorfismi hanno anche dimostrato di essere associati con la sopravvivenza sia in cancro gastrico e il cancro colorettale [35, 36]. Tuttavia, i risultati di studi pubblicati rimangono in contrasto piuttosto che conclusivi. In uno studio greco cancro gastrico di cinque VEGF
SNPs (-2578C > A, -1154G > A, -634G > C, -460T > C e + 936C > T) in 312 pazienti [36], VEGF
-2578 AA, CC -634 e + 936TT genotipi sono stati associati con un HR significativamente inferiore (migliore sopravvivenza) per 6 anni la sopravvivenza dei tumori colorettali. È interessante notare che un altro studio greca iniziale di 100 pazienti di cancro gastrico ha suggerito che solo il VEGF
genotipi -634CC /CG sono stati associati con una diminuzione (sopravvivenza più poveri) sopravvivenza a 10 anni, rispetto al genotipo GG [35]. I nostri dati su 167 pazienti affetti da cancro gastrico indicato che VEGF
vettori -634CC /CG infatti avevano una scarsa sopravvivenza ad 1 anno rispetto a quelli con il VEGF
genotipo GG -634. Amano et al. [37] hanno riportato anche che nessuna associazione significativa è stata osservata tra le frequenze del VEGF
-460T > C, + 405g > C e 936C > genotipi T e sopravvivenza a 3 anni libera da malattia di pazienti con carcinoma endometriale in un giapponese studio di 105 pazienti con carcinoma dell'endometrio. Perché tutti questi studi, compreso il nostro, sono stati relativamente piccola, non vi era limitata capacità di svolgere il più potente analisi dell'aplotipo-based che l'analisi di un singolo allele o un effetto locus [34].
Questo è il primo rapporto, a la nostra conoscenza, coinvolgendo TGFB1
e VEGF
polimorfismi e la sopravvivenza nei pazienti con cancro gastrico costituita principalmente da un popolazione caucasica; tuttavia, c'erano alcune limitazioni al presente studio. Anche se abbiamo cercato di raccogliere dati di ricorrenza in questi pazienti, non siamo riusciti a indagare su questo punto finale a causa della mancanza di un piano pre-definito di follow-up. Un secondo limite è stato il fatto che abbiamo incluso solo tre comuni TGFB1
SNP e tre VEGF
SNP. E 'possibile che alcuni altri SNP importanti sono stati mancati o che le associazioni osservate possono essere dovuti ad altri polimorfismi in LD con lo SNP abbiamo studiato. Inoltre, non ci sono dati sui livelli di proteine ​​del siero /plasma erano disponibili per l'analisi di correlazione genotipo-fenotipo, perché solo campioni di DNA erano disponibili da questi pazienti. Ci sono altri geni in aggiunta a TGFB1
e VEGF
che svolgono anche un ruolo nella crescita cellulare e l'angiogenesi, che rappresentano una complessa interazione di molti di attivazione e fattori inibitori [38]. Inoltre, Helicobacter pylori
infezione, la presenza o assenza della quale non è stata riportata nel presente studio, è considerata la causa di un progressivo accumulo di cambiamenti genotipici nel cancro gastrico, che può portare alla carcinogenesi sporadici cancro gastrico [39 ]. Infine, la dimensione studio era troppo piccola per avere una potenza sufficiente per rilevare piccole HR. Ad esempio, il calcolo post-potere suggerito che la dimensione del campione per un numero uguale (n = 55) dei soggetti in ciascun genotipo di ogni SNP, il potere di rilevare un HR di 2 era <, 0,4, ma > 0,8 per un HR di 3.4 per un tempo di follow-up di 5 anni. Pertanto, solo il ritrovamento di ore per 2 anni la sopravvivenza di TGFB1
+ 915G > C avrebbe una potenza sufficiente, il che suggerisce uno studio molto più grande sarebbe necessario per testare in modo efficace la nostra ipotesi per gli effetti della sopravvivenza globale
. conclusione
In sintesi, abbiamo trovato che alcuni polimorfismi TGFB1
e VEGF
può essere associata a tassi di sopravvivenza a 1 o 2 anni di pazienti affetti da cancro gastrico. Tuttavia, questo studio è piccolo, e vari eventi genetici ed epigenetici può anche aver portato ad una associazione tra TGFB1
e VEGF
polimorfismi e la prognosi del cancro gastrico e la sopravvivenza. Pertanto, gli studi più grandi e meglio progettati sono necessari per superare i limiti del presente studio (in particolare le informazioni su Helicobacter pylori
infezione) e confermare ulteriormente le nostre osservazioni.
Abbreviazioni
TGF-β1
:
fattore di crescita trasformante beta 1
VEGF
:
fattore di crescita vascolare endoteliale
LD:
linkage disequilibrium
PCR-RFLP:
a catena della polimerasi lunghezza dei frammenti di reazione di restrizione polimorfismo
O: rapporto
odds
HR: hazard ratio

CI:
intervallo di confidenza
SNP:.
polimorfismo a singolo nucleotide
Dichiarazioni
Ringraziamenti
Questo studio è stato supportato in parte dal National Institutes of Health concede R01 ES 11.740-07 e CA 131.274-01 (a QW) e CA 16672 (al MD Anderson Cancer center). Ringraziamo Margaret Lung e Kathryn Patterson per la loro assistenza nel reclutare i soggetti; Li-E Wang, Zhensheng Liu, Yawei Qiao, Min Zhao, Jianzhong Lui, e Kejin Xu per la loro assistenza di laboratorio; e Diane Hackett e Maude Veechfor per l'editing scientifico
materiale supplementare elettronica
13046_2009_181_MOESM1_ESM.doc sui file. 1: TGFB1 e VEGF distribuzioni genotipo e la sopravvivenza globale. I dati forniti rappresentano l'analisi statistica dei TGFB1 e VEGF distribuzioni genotipo e la sopravvivenza globale. (DOC 69 KB) 13046_2009_181_MOESM2_ESM.doc sui file 2: TGFB1 e VEGF distribuzioni genotipo e sopravvivenze 1-e 2 anni. I dati forniti rappresentano l'analisi statistica dei TGFB1 e VEGF distribuzioni genotipo e sopravvivenze 1 e 2 anni. (DOC 66 KB) degli autori fascicoli presentati originali per
di seguito sono riportati i link ai file degli autori originali inviati per le immagini. file originale 13046_2009_181_MOESM3_ESM.pdf degli autori per la Figura 1 in competizione interessi
Gli autori dichiarano di non avere interessi in gioco.

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