Študija celovitega KVČB pri Afroameričanih razkriva drugačno pokrajino genetskega tveganja

Pri Afroameričanih, krajina genetskega tveganja za vnetno črevesno bolezen (KVČB) se zelo razlikuje od tiste pri ljudeh z evropskim poreklom, glede na rezultate prve celoslovenske študije KVČB pri Afroameričanih. Avtorji pravijo, da morajo prihodnje klinične raziskave o KVČB upoštevati prednike.

Ugotovitve večcentrične študije, ki so analizirali celotne genome več kot 1, 700 prizadetih posameznikov s Crohnovo boleznijo in ulceroznim kolitisom in več kot 1, 600 kontrol, so bile objavljene 17. februarja v American Journal of Human Genetics .

Kot del svoje analize so raziskovalci so razvili algoritem, ki popravlja prednike pri izračunu ocene poligenskega tveganja za KVČB. Poligenske ocene tveganja so orodja za izračun gensko zasnovanega tveganja za bolezen, ki se uporabljajo za KVČB, pa tudi za druga kompleksna stanja, kot je koronarna bolezen.

Čeprav je cilj bolezni enak, populacije so videti zelo različne, glede na to, kateri specifični geni prispevajo k tveganju za KVČB. Kaže, da ocene poligenskega tveganja ne morete razviti na podlagi ene populacije in jo uporabiti za drugo. "

Subra Kugathasan, MD, Glavni avtor

Kugathasan je znanstveni direktor pediatričnega programa za KVČB in direktor Otroškega centra za presaditve in imunsko posredovane motnje pri zdravstvenem varstvu otrok v Atlanti, pa tudi profesor pediatrije in humane genetike Marcus na Medicinski fakulteti Univerze Emory.

Prvi avtor prispevka je genetik Hari Somineni, Doktor znanosti, ki je doktoriral pri delu s Kugathasanom v Emoryju, in zdaj dela v Goldfinch Bio v Massachusettsu.

Primarna spletna mesta za zaposlovanje udeležencev študije so bili Emory, Cedre-Sinaj in Rutgers, skupaj z Johnsom Hopkinsom in Washington University v Saint Louisu. Skupaj s Kugathasanom, so-starejša avtorja in soorganizatorja študije sta bila Steven Brant, Dr.Rutgers in Dermot McGovern, MD, Doktor znanosti iz Cedars-Sinai.

"Eden od naših ciljev pri zdravljenju KVČB je prehod na bolj prilagojen pristop, "pravi McGovern, Joshua L. in Lisa Z. Greer, katedra za genetiko vnetnih črevesnih bolezni na Cedars-Sinai. "Dešifriranje genetske arhitekture je pomemben del teh prizadevanj. Študije, kot je ta, so bistvene za zagotovitev, da bodo različne populacije, vključno z Afroameričani, izkoristite izjemen napredek, ki ga obljublja genomska medicina. "

Imeti sorodnika prve stopnje z obliko KVČB pomeni večje tveganje kot kateri koli znani okoljski dejavnik. Običajno velja, da so Afroameričani manj ogroženi zaradi KVČB, vendar Kugathasan pravi, da lahko pogled odraža razlike v diagnozi in dostopu do zdravstvenega varstva.

Študija je pokazala, da je najpomembnejši genetski lokus tveganja za KVČB pri Afroameričanih - PTGER4 - razmeroma majhen v populaciji evropskih prednikov, Kugathasan pravi. V nasprotju, dva genska lokusa, ki sta glavna pri Evropejcih - NOD2 in IL23R - igrata manjše vloge pri Afroameričanih.

Obstaja nekaj prekrivanja genetskih dejavnikov tveganja, ki temeljijo na afroameriški populaciji, ki ima v preteklosti približno 20 odstotkov evropskega genetskega ozadja, z znanimi dejavniki tveganja za KVČB, kot je IL23R, ki prihajajo z evropske strani.

Leta 2016 je raziskovalna skupina je objavila prvo genomsko povezano študijo KVČB pri Afroameričanih, identificiranje regij genoma, povezanih z ulceroznim kolitisom, samo pri ljudeh afriškega porekla.

Prihodnje klinične študije zdravljenja KVČB morajo upoštevati genetsko ozadje določenih populacij, Kugathasan pravi. Razvija se več terapij za KVČB, ki ciljajo na receptorsko pot IL23, deloma zato, ker je IL23R glavni genetski dejavnik tveganja, z majhnim poudarkom na PTGER4. To je treba spremeniti, on reče.

Sedanja študija je odkrila tudi redke genetske variante, ki prenašajo tveganje za KVČB, značilne za Afroameričane, ki jih v prejšnjih študijah niso opazili. Različice so povezane z genom, ki kodira kalbindin 2 (CALB2), beljakovina, ki sodeluje pri signalizaciji živčnega sistema.

Kar študija ni ugotovila - razočaralo raziskovalce - je bila vrsta redkih genetskih variant, ki pojasnjujejo "manjkajočo dednost" pri KVČB med Afroameričani. V genomsko povezanih študijah, manjkajoča dednost se nanaša na tveganje bolezni, ki ga ne upoštevajo običajne genske variante.

Za prihodnost področja KVČB, Kugathasan pravi, da študije interakcij gensko okolje - preučujejo dejavnike, kot je prehrana, mikrobiom, ali strupene izpostavljenosti-lahko prinese vpogled, ki ga študije asociacije na celotnem genomu niso.

• Države s starejšim prebivalstvom imajo višje okužbe s SARS-CoV-2 in smrt,
• Domači psi verjetno ne bodo prenašali SARS-CoV-2,