Hele genomstudie av IBD hos afroamerikanere avslører et annet genetisk risikolandskap

Hos afroamerikanere, det genetiske risikolandskapet for inflammatorisk tarmsykdom (IBD) er veldig forskjellig fra mennesker med europeisk aner, ifølge resultatene fra den første helgenomstudien av IBD hos afroamerikanere. Forfatterne sier at fremtidig klinisk forskning på IBD må ta hensyn til aner.

Funnene fra multisenterstudien, som analyserte hele genomene på mer enn 1, 700 berørte personer med Crohns sykdom og ulcerøs kolitt og mer enn 1, 600 kontroller, ble publisert 17. februar i American Journal of Human Genetics .

Som en del av deres analyse, forskerne utviklet en algoritme som korrigerer for aner når de beregner en IBD -polygen risikoscore. Polygen risikoscore er verktøy for å beregne genbasert risiko for sykdom, som brukes for IBD, så vel som andre komplekse tilstander som koronarsykdom.

Selv om sykdomsmålet ser det samme ut, befolkningen ser veldig annerledes ut, når det gjelder hvilke spesifikke gener som bidrar til risiko for IBD. Det viser at du ikke kan utvikle en polygen risikoscore basert på en populasjon og bruke den på en annen. "

Subra Kugathasan, MD, Hovedforfatter

Kugathasan er vitenskapelig direktør for det pediatriske IBD-programmet og direktør for Children's Center for Transplantation and Immune-mediated Disorders at Children's Healthcare of Atlanta, i tillegg til Marcus professor i pediatri og menneskelig genetikk ved Emory University School of Medicine.

Den første forfatteren av avisen er genetikeren Hari Somineni, PhD, som tok sin doktorgrad ved å jobbe med Kugathasan på Emory, og jobber nå på Goldfinch Bio i Massachusetts.

De viktigste stedene for å rekruttere studiedeltakere var Emory, Cedars-Sinai og Rutgers, sammen med Johns Hopkins og Washington University i Saint Louis. Sammen med Kugathasan, forfatterne og medarrangørene av studien var Steven Brant, MD fra Rutgers og Dermot McGovern, MD, PhD fra Cedars-Sinai.

"Et av våre mål med behandling av IBD er å gå mot en mer personlig tilnærming, "sier McGovern, Joshua L. og Lisa Z. Greer-stol i genetisk genetikk i inflammatorisk tarmsykdom på Cedars-Sinai. "Å tyde den genetiske arkitekturen er en viktig del av denne innsatsen. Studier som denne er avgjørende for å sikre at mangfoldige befolkninger, inkludert afroamerikanere, dra nytte av de enorme fremskrittene som genomisk medisin lover. "

Å ha en førstegrads slektning med en form for IBD gir en større risiko enn noen kjent miljøfaktor. Afroamerikanere antas konvensjonelt å ha mindre risiko for IBD, men Kugathasan sier at dette synet kan gjenspeile forskjeller i diagnose og tilgang til helsetjenester.

Studien viste at det viktigste genetiske risikosituset for IBD hos afroamerikanere - PTGER4 - er relativt liten i europeiske aner -populasjoner, Sier Kugathasan. I motsetning, to genlokus som er store hos europeere - NOD2 og IL23R - spiller mindre roller hos afroamerikanere.

Det er en viss overlapping i genetiske risikofaktorer basert på at den afroamerikanske befolkningen historisk sett har omtrent 20 prosent europeisk genetisk bakgrunn, med kjente IBD -risikofaktorer som IL23R som kommer fra europeisk side.

I 2016, forskerteamet publiserte den første genomomfattende assosiasjonsstudien av IBD hos afroamerikanere, identifisere regioner av genomet assosiert med ulcerøs kolitt bare hos mennesker av afrikansk avstamning.

Fremtidige kliniske studier av IBD -behandlinger må ta hensyn til den genetiske bakgrunnen til spesifikke populasjoner, Sier Kugathasan. Flere terapier utvikles for IBD rettet mot IL23 -reseptorveien, delvis fordi IL23R er en viktig genetisk risikofaktor, med lite fokus på PTGER4. Det må endres, han sier.

Den nåværende studien identifiserte også sjeldne genetiske varianter som gir IBD -risiko som er spesifikke for afroamerikanere, som ikke var observert i tidligere studier. Varianter er koblet til genet som koder for calbindin 2 (CALB2), et protein involvert i signalsystemet i nervesystemet.

Det studien ikke fant - skuffende forskerne - var en rekke sjeldne genetiske varianter som forklarer den "manglende arveligheten" i IBD blant afroamerikanere. I genom-brede assosiasjonsstudier, manglende arvelighet refererer til sykdomsrisiko som ikke er regnskapsført av vanlige genvarianter.

For fremtiden for IBD -feltet, Kugathasan sier studier av gen -miljøinteraksjoner - undersøker faktorer som diett, mikrobiom, eller giftige eksponeringer-kan gi innsikt som genomeomfattende foreningsstudier ikke har.

• Land med eldre befolkninger har høyere SARS-CoV-2 infeksjoner og dødsfall,
• Husdyr som sannsynligvis ikke overfører SARS-CoV-2,