Studija čitavog genoma IBD-a kod Afroamerikanaca otkriva drugačiji krajolik genetskog rizika

Iako odredište bolesti izgleda isto, populacije izgledaju vrlo različito, u smislu koji specifični geni doprinose riziku od IBD -a. To pokazuje da ne možete razviti poligenski skor rizika na temelju jedne populacije i primijeniti ga na drugu. "

Subra Kugathasan, DOKTOR MEDICINE, Glavni autor

Kugathasan je znanstveni voditelj pedijatrijskog programa IBD-a i ravnatelj Dječjeg centra za transplantaciju i imunosno posredovane poremećaje pri dječjoj zdravstvenoj njezi u Atlanti, kao i profesor pedijatrije i humane genetike Marcus na Medicinskom fakultetu Sveučilišta Emory.

Prvi autor rada je genetičar Hari Somineni, Doktor znanosti, koji je doktorirao radeći s Kugathasanom u Emoryju, i sada radi u Goldfinch Bio u Massachusettsu.

Primarna mjesta za regrutiranje sudionika istraživanja bili su Emory, Cedari-Sinaj i Rutgers, zajedno s Johnsom Hopkinsom i sveučilištem Washington u Saint Louisu. Uz Kugathasana, suviši autori i suorganizatori studije bili su Steven Brant, Dr. Med. Iz Rutgersa i Dermota McGoverna, DOKTOR MEDICINE, Doktorirao na Cedars-Sinai.

"Jedan od naših ciljeva u liječenju IBD -a je prelazak na personaliziraniji pristup, "kaže McGovern, Joshua L. i Lisa Z. Greer, katedra za genetiku upalnih bolesti crijeva na Cedars-Sinai. "Dešifriranje genetske arhitekture važan je dio ovog napora. Studije poput ove od vitalnog su značaja kako bi se osiguralo da različite populacije, uključujući Afroamerikance, imati koristi od ogromnog napretka koji obećava genomska medicina. "

Imati rođaka prvog stupnja s oblikom IBD-a predstavlja veći rizik od bilo kojeg poznatog čimbenika okoliša. Uobičajeno se smatra da su Afroamerikanci manje izloženi riziku od IBD-a, ali Kugathasan kaže da to gledište može odražavati razlike u dijagnostici i pristupu zdravstvenoj zaštiti.

Studija je pokazala da je najvažniji genetski rizik za IBD u Afroamerikanaca - PTGER4 - relativno mali u populaciji europskog porijekla, Kugathasan kaže. U kontrastu, dva genska lokusa koji su glavni u Europljana - NOD2 i IL23R - igraju manje uloge u Afroamerikanaca.

Postoji neko preklapanje u genetskim čimbenicima rizika na temelju afroameričke populacije koja povijesno ima oko 20 posto europskog genetskog podrijetla, s poznatim čimbenicima rizika za IBD kao što je IL23R koji dolaze s europske strane.

Godine 2016. istraživački tim objavio je prvu udruženu studiju IBD-a na čitavom genomu kod Afroamerikanaca, identificiranje regija genoma povezanih s ulceroznim kolitisom samo u osoba afričkog podrijetla.

U budućim kliničkim studijama liječenja IBD -a potrebno je uzeti u obzir genetsku podlogu određene populacije, Kugathasan kaže. Razvija se nekoliko terapija za IBD koje ciljaju na receptorski put IL23, dijelom zato što je IL23R glavni genetski faktor rizika, s malim fokusom na PTGER4. To treba promijeniti, on kaže.

Ova je studija također identificirala rijetke genetske varijante koje prenose rizik od IBD -a, a koje su specifične za Afroamerikance, što nije primijećeno u prethodnim studijama. Varijante su povezane s genom koji kodira kalbindin 2 (CALB2), protein uključen u signalizaciju živčanog sustava.

Ono što studija nije otkrila - razočarajući istraživače - bio je niz rijetkih genetskih varijanti koje objašnjavaju "nestalu nasljednost" kod IBD -a među Afroamerikancima. U istraživanjima udruživanja za cijeli genom, Nedostatak nasljednosti odnosi se na rizik od bolesti koji se ne objašnjava uobičajenim varijantama gena.

Za budućnost polja IBD -a, Kugathasan kaže da studije interakcija gen -okolina - ispitivanje čimbenika poput prehrane, mikrobiom, ili toksične izloženosti-može donijeti uvide koje studije udruživanja u genomu nemaju.

• Zemlje sa starijom populacijom imaju veće infekcije i smrtnost od SARS-CoV-2,
• Domaći psi za koje nije vjerojatno da će prenijeti SARS-CoV-2,