Bevindingen van de multi-center studie, die de hele genomen van meer dan 1 analyseerde 700 getroffen personen met de ziekte van Crohn en colitis ulcerosa en meer dan 1, 600 controles, werden op 17 februari gepubliceerd in de American Journal of Human Genetics .
Als onderdeel van hun analyse, de onderzoekers ontwikkelden een algoritme dat corrigeert voor afkomst bij het berekenen van een IBD polygene risicoscore. Polygene risicoscores zijn hulpmiddelen voor het berekenen van het op genen gebaseerde risico voor een ziekte, die worden gebruikt voor IBD en andere complexe aandoeningen zoals coronaire hartziekte.
Ook al ziet de ziektebestemming er hetzelfde uit, de bevolking ziet er heel anders uit, in termen van welke specifieke genen bijdragen aan het risico op IBD. Het laat zien dat je geen polygene risicoscore kunt ontwikkelen op basis van de ene populatie en deze op een andere kunt toepassen."
Subra Kugathasan, MD, Hoofdauteur
Kugathasan is wetenschappelijk directeur van het pediatrische IBD-programma en directeur van het Children's Center for Transplantation and Immune-mediated Disorders bij Children's Healthcare of Atlanta, evenals Marcus hoogleraar kindergeneeskunde en menselijke genetica aan de Emory University School of Medicine.
De eerste auteur van het artikel is geneticus Hari Somineni, doctoraat, die zijn doctoraat behaalde bij Kugathasan in Emory, en werkt nu bij Goldfinch Bio in Massachusetts.
De belangrijkste plaatsen om studiedeelnemers te rekruteren waren Emory, Ceders-Sinai en Rutgers, samen met Johns Hopkins en de Washington University in Saint Louis. Samen met Kugathasan, de co-senior auteurs en mede-organisatoren van de studie waren Steven Brant, MD van Rutgers en Dermot McGovern, MD, PhD van Cedars-Sinai.
"Een van onze doelen bij de behandeling van IBD is om te evolueren naar een meer persoonlijke benadering, " zegt McGovern, de Joshua L. en Lisa Z. Greer Chair in Inflammatory Bowel Disease Genetics bij Cedars-Sinai. "Het ontcijferen van de genetische architectuur is een belangrijk onderdeel van deze inspanning. Studies zoals deze zijn van vitaal belang om ervoor te zorgen dat diverse populaties, inclusief Afro-Amerikanen, profiteren van de enorme vooruitgang die wordt beloofd door genomische geneeskunde."
Het hebben van een eerstegraads familielid met een vorm van IBD brengt een groter risico met zich mee dan enige bekende omgevingsfactor. Van Afro-Amerikanen wordt traditioneel gedacht dat ze minder risico lopen op IBD, maar Kugathasan zegt dat die mening de verschillen in diagnose en toegang tot gezondheidszorg kan weerspiegelen.
De studie toonde aan dat de belangrijkste genetische risicolocus voor IBD bij Afro-Amerikanen - PTGER4 - relatief klein is in populaties van Europese voorouders, zegt Kugathasan. In tegenstelling tot, twee genloci die belangrijk zijn bij Europeanen - NOD2 en IL23R - spelen een kleinere rol bij Afro-Amerikanen.
Er is enige overlap in genetische risicofactoren op basis van de Afro-Amerikaanse bevolking die historisch ongeveer 20 procent Europese genetische achtergrond heeft, met bekende IBD-risicofactoren zoals IL23R die van Europese kant komen.
in 2016, het onderzoeksteam publiceerde de eerste genoombrede associatiestudie van IBD bij Afro-Amerikanen, het identificeren van regio's van het genoom geassocieerd met colitis ulcerosa alleen bij mensen van Afrikaanse afkomst.
Toekomstige klinische studies van IBD-behandelingen moeten rekening houden met de genetische achtergrond van specifieke populaties, zegt Kugathasan. Er worden verschillende therapieën ontwikkeld voor IBD die zich richten op de IL23-receptorroute, deels omdat IL23R een belangrijke genetische risicofactor is, met weinig focus op PTGER4. Dat moet veranderen, hij zegt.
De huidige studie identificeerde ook zeldzame genetische varianten die IBD-risico's opleveren die specifiek zijn voor Afro-Amerikanen, die in eerdere onderzoeken niet waren waargenomen. De varianten zijn verbonden met het gen dat codeert voor calbindin 2 (CALB2), een eiwit dat betrokken is bij de signalering van het zenuwstelsel.
Wat de studie niet vond - teleurstellend voor de onderzoekers - waren een groot aantal zeldzame genetische varianten die de "ontbrekende erfelijkheid" in IBD onder Afro-Amerikanen verklaren. In genoombrede associatiestudies, ontbrekende erfelijkheid verwijst naar ziekterisico dat niet wordt verklaard door gemeenschappelijke genvarianten.
Voor de toekomst van het IBD-veld, Kugathasan zegt studies van gen-omgevingsinteracties - onderzoeken van factoren zoals voeding, microbioom, of toxische blootstellingen -- kan inzichten opleveren die genoomwijde associatiestudies niet hebben.
Dieet en voeding beïnvloeden het microbioom in het colonslijmvlies
Voedsel beïnvloedt selectief darmmicroben, vindt onderzoek
Probiotica als adjuvante therapie voor COVID-19-patiënten
Mannen die twee keer per week yoghurt eten, hebben minder kans op darmkanker
Melkzuurbacteriën en darmbacteriën dragen bij aan de gezondheidsvoordelen van rogge,
Ernstige COVID-19-complicaties die verband houden met de afbraak van de darmbarrière
Rotavirus speelt rol bij ontwikkeling van type 1 diabetes
Een nieuw artikel gepubliceerd in het tijdschrift PLOS Pathogens op 10 oktober, 2019, beweert dat het gewone rotavirus verantwoordelijk kan zijn voor sommige gevallen van type 1 diabetes, een vorm van
Voedselreacties worden bepaald door het darmmicrobioom,
vindt nieuwe studie Uit een deze week gepubliceerde studie blijkt dat de interacties van bacteriën in onze darm (het darmmicrobioom) met het voedsel dat we eten aanzienlijk verschilt tussen individuen
Ontdekking van 100 nieuwe genen kan helpen bij onderzoek naar pigmentatieziekten
Een nieuwe studie onder leiding van onderzoekers van Kings College London en Erasmus MC Universitair Medisch Centrum Rotterdam heeft 124 genen blootgelegd die een sleutelrol spelen bij het bepalen van