Viso genomo IBD tyrimas afroamerikiečiams atskleidžia skirtingą genetinės rizikos kraštovaizdį

Nors ligos tikslas atrodo tas pats, populiacijos atrodo labai skirtingai, kalbant apie tai, kokie specifiniai genai prisideda prie IBD rizikos. Tai rodo, kad negalite sukurti poligeniškos rizikos balo pagal vieną populiaciją ir pritaikyti ją kitai “.

Kugathasano subra, MD, Pagrindinis autorius

Kugathasanas yra vaikų IBD programos mokslinis direktorius ir Atlantos vaikų sveikatos priežiūros įstaigos Vaikų transplantacijos ir imuninės sistemos sutrikimų centro direktorius, taip pat Emory universiteto medicinos mokyklos pediatrijos ir žmogaus genetikos profesorius Marcusas.

Pirmasis straipsnio autorius yra genetikas Hari Somineni, Daktaras, kuris įgijo daktaro laipsnį dirbdamas su Kugathasanu Emoryje, ir dabar dirba „Goldfinch Bio“ Masačusetso valstijoje.

Pagrindinės tyrimo dalyvių įdarbinimo vietos buvo Emory, Kedrai-Sinajus ir Rutgersas, kartu su Johns Hopkins ir Vašingtono universitetu Saint Louis. Kartu su Kugathasanu, tyrimo vyresnieji autoriai ir organizatoriai buvo Stevenas Brantas, MD iš Rutgerso ir Dermoto McGoverno, MD, Cedars-Sinai daktaras.

„Vienas iš mūsų tikslų gydant IBD yra pereiti prie labiau individualizuoto požiūrio, “ - sako McGovernas, Joshua L. ir Lisa Z. Greer Cedars-Sinai uždegiminių žarnų ligų genetikos katedra. "Genetinės architektūros iššifravimas yra svarbi šių pastangų dalis. Tokie tyrimai kaip šis yra gyvybiškai svarbūs siekiant užtikrinti, kad įvairios populiacijos, įskaitant afroamerikiečius, gauti naudos iš milžiniškos pažangos, kurią pažadėjo genominė medicina “.

Pirmojo laipsnio giminaitis, turintis IBD formą, kelia didesnę riziką nei bet kuris žinomas aplinkos veiksnys. Tradiciškai manoma, kad afroamerikiečiams yra mažesnė IBD rizika, tačiau Kugathasanas sako, kad šis požiūris gali atspindėti diagnozės ir sveikatos priežiūros paslaugų skirtumus.

Tyrimas parodė, kad svarbiausias genetinis IBD rizikos lokusas afroamerikiečiams - PTGER4 - yra palyginti nedidelis Europos protėvių populiacijose, Kugathasanas sako. Priešingai, du genų lokusai, kurie yra svarbiausi europiečiams - NOD2 ir IL23R - vaidina mažesnius vaidmenis afroamerikiečiuose.

Kai kurie genetiniai rizikos veiksniai sutampa, nes afroamerikiečių populiacija istoriškai turi apie 20 procentų Europos genetinės kilmės, su žinomais IBD rizikos veiksniais, tokiais kaip IL23R, iš Europos pusės.

2016 m. tyrimo grupė paskelbė pirmąjį genomo masto asociacijos tyrimą apie IBD afroamerikiečiams, genomo regionų, susijusių su opiniu kolitu, nustatymas tik afrikiečių kilmės žmonėms.

Būsimuose klinikiniuose IBD gydymo tyrimuose reikia atsižvelgti į konkrečių populiacijų genetinę kilmę, Kugathasanas sako. Kuriamos kelios IBD terapijos, skirtos IL23 receptorių keliui, iš dalies todėl, kad IL23R yra pagrindinis genetinis rizikos veiksnys, mažai dėmesio skiriant PTGER4. Tai reikia keisti, jis sako.

Dabartinis tyrimas taip pat nustatė retus genetinius variantus, sukeliančius IBD riziką, būdingus Afrikos amerikiečiams, ko nebuvo pastebėta ankstesniuose tyrimuose. Variantai yra prijungti prie geno, koduojančio calbindin 2 (CALB2), baltymas, dalyvaujantis nervų sistemos signalizavime.

Tai, ko tyrimas nerado - nuvylė tyrėjus - buvo daugybė retų genetinių variantų, paaiškinančių „trūkstamą paveldimumą“ IBD tarp afroamerikiečių. Viso genomo asociacijos tyrimuose trūkstamas paveldimumas reiškia ligos riziką, kuri nėra atsižvelgiama į įprastus genų variantus.

Dėl IBD srities ateities, Kugathasanas sako, kad atliekami genų ir aplinkos sąveikos tyrimai - tiriami tokie veiksniai kaip dieta, mikrobiomas, ar toksiškos ekspozicijos-gali duoti įžvalgų, kurių genomo masto asociacijos tyrimai neturėjo.

• Šalys, kuriose yra vyresnio amžiaus gyventojų, turi daugiau SARS-CoV-2 infekcijų ir mirčių,
• Naminiai šunys greičiausiai neperduos SARS-CoV-2,