Lo studio dell'intero genoma dell'IBD negli afroamericani rivela un diverso panorama del rischio genetico

Negli afroamericani, il panorama del rischio genetico per la malattia infiammatoria intestinale (IBD) è molto diverso da quello delle persone con origini europee, secondo i risultati del primo studio sull'intero genoma dell'IBD negli afroamericani. Gli autori affermano che la futura ricerca clinica sull'IBD deve tenere conto dell'ascendenza.

Risultati dello studio multicentrico, che ha analizzato l'intero genoma di più di 1, 700 individui affetti da morbo di Crohn e colite ulcerosa e più di 1, 600 controlli, sono stati pubblicati il ​​17 febbraio nel Giornale americano di genetica umana .

Come parte della loro analisi, i ricercatori hanno sviluppato un algoritmo che corregge l'ascendenza durante il calcolo di un punteggio di rischio poligenico IBD. I punteggi di rischio poligenico sono strumenti per calcolare il rischio genetico per una malattia, che vengono utilizzati per l'IBD e altre condizioni complesse come la malattia coronarica.

Anche se la destinazione della malattia sembra la stessa, le popolazioni hanno un aspetto molto diverso, in termini di quali geni specifici contribuiscono al rischio di IBD. Dimostra che non è possibile sviluppare un punteggio di rischio poligenico basato su una popolazione e applicarlo a un'altra".

Subra Kugathasan, dottore, Autore principale

Kugathasan è direttore scientifico del programma IBD pediatrico e direttore del Children's Center for Transplantation and Immune-mediated Disorders at Children's Healthcare di Atlanta, così come Marcus professore di pediatria e genetica umana presso la Emory University School of Medicine.

Il primo autore dell'articolo è il genetista Hari Somineni, dottorato di ricerca, che ha conseguito il dottorato lavorando con Kugathasan a Emory, e ora lavora presso Cardellino Bio in Massachusetts.

I siti primari per reclutare i partecipanti allo studio erano Emory, Cedars-Sinai e Rutgers, insieme a Johns Hopkins e alla Washington University di Saint Louis. Insieme a Kugathasan, i co-autori senior e co-organizzatori dello studio erano Steven Brant, MD di Rutgers e Dermot McGovern, dottore, PhD da Cedars-Sinai.

"Uno dei nostri obiettivi nel trattamento dell'IBD è quello di passare a un approccio più personalizzato, "dice McGovern, la cattedra Joshua L. e Lisa Z. Greer in genetica delle malattie infiammatorie intestinali al Cedars-Sinai. "Decifrare l'architettura genetica è una parte importante di questo sforzo. Studi come questo sono vitali per garantire che popolazioni diverse, compresi gli afroamericani, beneficiare degli enormi progressi promessi dalla medicina genomica".

Avere un parente di primo grado con una forma di IBD conferisce un rischio maggiore rispetto a qualsiasi fattore ambientale noto. Gli afroamericani sono convenzionalmente considerati meno a rischio di IBD, ma Kugathasan dice che questa visione può riflettere le disparità nella diagnosi e nell'accesso all'assistenza sanitaria.

Lo studio ha dimostrato che il più importante luogo di rischio genetico per IBD negli afroamericani - PTGER4 - è relativamente minore nelle popolazioni di origine europea, dice Kugathasan. In contrasto, due loci genici che sono principali negli europei - NOD2 e IL23R - giocano un ruolo minore negli afroamericani.

C'è una certa sovrapposizione nei fattori di rischio genetico in base al fatto che la popolazione afroamericana ha storicamente circa il 20% di sfondo genetico europeo, con noti fattori di rischio IBD come IL23R provenienti da parte europea.

Nel 2016, il team di ricerca ha pubblicato il primo studio di associazione sull'intero genoma dell'IBD negli afroamericani, identificare le regioni del genoma associate alla colite ulcerosa solo nelle persone di origine africana.

I futuri studi clinici sui trattamenti per l'IBD devono tenere conto del background genetico di popolazioni specifiche, dice Kugathasan. Sono in fase di sviluppo diverse terapie per l'IBD mirate alla via del recettore IL23, in parte perché IL23R è un importante fattore di rischio genetico, con poca attenzione a PTGER4. che deve cambiare, lui dice.

L'attuale studio ha anche identificato varianti genetiche rare che conferiscono rischio IBD che sono specifiche per gli afroamericani, che non era stato osservato negli studi precedenti. Le varianti sono collegate al gene che codifica per la calbindina 2 (CALB2), una proteina coinvolta nella segnalazione del sistema nervoso.

Ciò che lo studio non ha trovato - deludendo i ricercatori - è stata una serie di rare varianti genetiche che spiegano "l'ereditarietà mancante" nell'IBD tra gli afro-americani. Negli studi di associazione sull'intero genoma, l'ereditarietà mancante si riferisce al rischio di malattia che non è giustificato da varianti genetiche comuni.

Per il futuro del settore IBD, Kugathasan afferma che gli studi sulle interazioni gene-ambiente - esaminando fattori come la dieta, microbioma, o esposizioni tossiche - possono fornire intuizioni che gli studi di associazione sull'intero genoma non hanno.

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