alteração proteômica em adenocarcinomas gastic de patients

japonesa proteômica alteração em adenocarcinomas gastic de pacientes japoneses da arte abstracta
Fundo
adenocarcinomas gástricos constituem um dos tipos mais comuns de câncer em países asiáticos, incluindo o Japão. perfis de proteínas completas de espécimes cirúrgicos emparelhados de adenocarcinomas gástricos primários e não tumorais mucosas derivadas de pacientes japoneses foi realizada por meio de duas dimensões electroforese em gel (2D-PE) e cromatografia de electropulverização A espectrometria de massa em tandem iónico líquido (LC-ESI-MS) para estabelecer proteínas específicas do câncer gástrico como biomarcadores clínicos putativos e alvos moleculares para a quimioterapia.
resultados
alterações relativamente comum na expressão da proteína foram revelados nos tecidos tumorais. Foram observados aumentos significativos na superóxido de manganês e proteína cromossómico nonhistone HMG-1 (HMG-1), enquanto diminui em anidrase carbónica I e II, glutationa-S-transferase e precursor foveolin (gastrokine-1) (FOV), o estômago 18 kDa espec�ico proteína com actividade supressora de tumores putativo, foram detectados. A análise por RT-PCR revelou igualmente significativa a infra-regulação da expressão de mRNA em tecidos tumorais FOV.
Conclusão
Um papel patológico possível para a sub-regulação de FOV na carcinogénese gástrica foi demonstrada. Avaliação das reduções específicas na expressão gênica e proteica de FOV em pacientes podem ser utilizados como biomarcadores clínicos para diagnóstico e avaliação de câncer gástrico eficaz.
Fundo
adenocarcinomas gástricos constituem um dos tipos mais comuns de câncer em países asiáticos, incluindo Japão, sendo apenas a segunda do cancro do pulmão quanto ao número de mortes que provoca. Apesar do recente desenvolvimento das técnicas de diagnóstico, a maioria dos pacientes com câncer gástrico são diagnosticados numa fase avançada e têm uma taxa de sobrevivência de cinco anos muito baixa (menos de 10%) [1]. Isto é parcialmente devido a uma falta de biomarcadores específicos e sensíveis para o diagnóstico e monitoramento de progresso da doença em um estágio inicial, embora alguns marcadores tumorais gástricas, incluindo o antígeno carcinoembrionário, foram usados ​​e são parcialmente eficazes. Como carcinogénese gástrica é um processo de múltiplos passos, a análise global também é necessária para os casos individuais, em que os eventos moleculares diferentes ocorrer em cada processo carcinogénico.
Recentemente, proteomic análise foi utilizado para examinar a expressão de proteína de forma abrangente em fluidos corporais, tecidos e células [ ,,,0],2-4]. Esta abordagem, como proteómica clínicos, é muito útil para a identificação de proteínas associadas a doença que mostram mudanças na expressão de modificação e que corresponde a uma condição de doença [5, 6]. Estas proteínas relacionadas com a doença são esperados ser biomarcadores para diagnóstico e proteínas-alvo putativo para o tratamento [7-9]. Por outro lado, as análises detalhadas de transcriptomes em tecidos tumorais de vários doentes com cancro utilizando microarrays de ADN e chips de genes foram realizados em anos recentes [10]. No entanto, a falta de correlação entre as alterações dos mRNAs e carcinogénese foi demonstrada, e alterações quantitativas e qualitativas de proteínas pós-translacionalmente modificados como produtos finais do gene são considerados como sendo mais informativos do que os de ARNm em tecidos de tumor para estudar os acontecimentos moleculares em carcinogênese. estudos de proteômica para a identificação de proteínas associadas a tumores em cancro gástrico estão aumentando, e os bancos de dados do proteoma de tecidos gástricos [11] e linhas celulares [12] foram construídos. A maioria deles dizem respeito proteínas ou antigénios específicos que reflectem as propriedades quimio e termo-resistente do cancro do estômago [13-15], e que estão associadas com Helicobacter pylori
[16, 17]. No presente estudo, foi realizada a análise do proteoma abrangente de tecidos tumorais e não tumorais em pacientes japoneses com carcinomas gástricos, e identificaram várias proteínas de que os níveis de expressão são normalmente alteradas nos casos clínicos. Em particular, a expressão de gastrokine-1 (GKN-1) foi sugerido para ser ambos sob o controlo transcricional e translacional.

Resultados da separação de proteínas e de identificação
Figura 1A mostra uma vista geral da imagem de um gel típico mestre por um tecido de tumor gástrico. Cerca de 200 spots de proteínas coradas com azul brilhante de Coomassie (CBB) R-250 foram bem separadas nos géis. Os pontos numerados na Figura 1B e 1C foram excisados ​​a partir de gel, tratou-se com tripsina e depois submetido a cromatografia em espectrómetro de massa de ionização por pulverização electrónica-líquido em tandem análise (LC-ESI-MS /MS). Setenta e dois deles representando 69 espécies de proteínas diferentes foram identificados. A Tabela 1 lista todas as proteínas identificadas através correspondente péptido com o algoritmo de busca Mascot. A precisão em perfis de proteínas foi avaliada como o valor pontuação (acima de 37). A Figura 1 (A) uma vista geral de uma imagem mestre gel de 2D para tecido de tumor derivado de um paciente com um adenocarcinoma gástrico. (B) e (C) Os pontos numerados de proteína foram identificados por LC-ESI-MS /MS e proteína correspondente, como mostrado como números aumentados.
Perfil Tabela 1 A proteína detectada em tecido de tumor derivado de um paciente japonês com um gástrico adenocarcinoma.
Ponto No.
número Adesão
identificação de proteínas

Massa
SC (%)
PI
Pontuação
1 | 24308169
axonemais cadeia pesada dineína tipo 3
473.776
0
6,04
37 Página 2
15.010.550
calor precursor gp96 proteína de choque
90.309
7
4,73
62 Sims 3
72222
proteína de choque térmico 90 -β
83.584
14
4,97
176 4
5.729.877
choque térmico de 70 kDa proteína 8 isoforma 1 | 71082
19
5,37
283
5
38.044.288
gelsolina isoforma b
80.876
5
5,58
63
6
4.826.960
glutaminilo-tRNA sintetase
88.655
1 | 6,71
44
7
4.501.867
aconitase 2
86113
10
7.36
231
8
119717
ezrin
69470
7
5.94
75
9
4557871
transferrin
79280
9
6.81
97
10
16507237
heat chocar 70 kDa 5
72402
15
5,07
165
11
24.234.686
proteína de choque térmico de 70 kDa proteína 8
53598
16
5,62
160
12
4.885.431
choque térmico 70 1B kDa
70.267
11
5,48
143
13
1.082.886
tumor necrose tipo fator 1 proteína associada ao receptor TRAP-1 | 75.694
13
8,43
288
14
31.542.947
chaperonin, P1 proteína da matriz mitocondrial, proteína linfócito P60
61187
13
5,7
299
15
28592
soro albumin
71316
23
6.05
292
16
340219
vimentin
53738
18
5.03
79
17
4503729
similar a proteína de ligação FK506 4
49031
5
5.6
36
18
32709
IFP53
53559
21
5.93
277
19
4502643
chaperonin-containing TCP1, subunit6A (zeta 1)
58.444
6
6,23
79
20
7.106.439
tubulina, β5
50095
14
4.78
125
21
37492
α-tubulin
50810
13
5.02
94
22
125604
pyruvate cinase, M2 isozyme
58447
5
7.95
234
23
4557014
catalase
59947
6
6.9
120
24
4503483
eukaryotic Tradução alongamento fator 2
96.246 4
6,41
56
25
179279
ATP sintase β subunidade
56861
5
5,39
59
26
7.657.041
regulada para baixo na metástase
320846 Página 2
7,07
40
27
4.504.169
glutationa sintetase, GSH synthetase
52523
5
5.67
99
28
12017952
GE36
73327
2
5.2
37
29
34234
laminin-binding proteína
31888
12
4,84
51
30
16.359.158
actina, beta
42.078
14
5,29
171
31
6.635.125 proteína
KIAA0284
161.473 Página 2
6,36
47
32
5.803.225
14-3-3 epsilon
29326
8
4,63
49
33
4.504.707
inositol polifosfato-4-fosfatase, tipo II, 105 kD
105749
1 | 5,87
37
34
35.038.601
proteína hipotética DKFZp761A078
74864
2
7.27
47
35
12017952
GE36
73327
1
5.2
38
36
4505877
plectin 1 isoforma 1 | 520.111
1 | 5,57
44
37
38.158.018
proteína centrosomal 1, centríolo associados proteínas, centriolin
269874
1 | 5,44
39
38
30.157.438
CTD-vinculativo rA9 proteína SR-like
180.240
1 | 9,15
41
39
4.503.471
factor de alongamento tradução eucariótica 1 α1
50451
12
9,1
191
40
4.757.810
ATP sintase
59828
17
9.16
178
41
693.933
2-phosphopyruvate-hidratase α-enolase
47421
22
7,01
240
42
123.576
47 kDa precursor proteína de choque térmico
46352
14
8,27
177
43
5.032.069
splicing fator 3b, subunidade 4
44414 Sims 3
8,54
58
44
4.503.471
eucariótica tradução alongamento fator 1 α1
50451 4
9,1
47
45
5.921.789
citrato sintase, precursor mitocondrial
51959
12
8,13
114
46
4.505.763
fosfoglicerato quinase 1 | 44985
14
8,3
87
47
4.504.069
aspartato aminotransferase 2 precursor
47844
6
9,14
52
48
7.669.492
gliceraldeído-3-fosfato desidrogenase
36201
13
8,57
49
49
4.757.756
anexina A2
38808
9
7,57
87
50
6.648.067
malato desidrogenase, precursor mitocondrial
3

• regulação para baixo dos Thrombospondin2 prediz mau prognóstico em pacientes com câncer gástrico
• Catecolamina up-regula MMP-7 expressão ativando AP-1 e STAT3 no câncer gástrico