Proteomikai módosulása Gyomor adenocarcinoma japán beteg

Proteomikai módosulása Gyomor adenocarcinoma japán betegeknél katalógusa Abstract Background katalógusa katalógusa Gyomor adenocarcinoma tartalmazzák az egyik leggyakoribb típusú rák az ázsiai ország, köztük Japán. Átfogó fehérje profiling párosított sebészeti mintákban a primer gyomor adenokarcinómák és a nem-tumoros nyálkahártyákon származó japán betegeknél végeztük segítségével kétdimenziós gél elektroforézissel (2D-EP) és folyadék-kromatográfiás-elektrospray ionizációs tandem tömegspektrometria (LC-ESI-MS) létrehozására gyomorrák-specifikus fehérjék feltételezett klinikai biomarkerek és molekuláris célpontokat kemoterápia. katalógusa Eredmények
Viszonylag gyakori elváltozások fehérje expresszióját mutattuk be a daganatos szövetek. Növeli a mangán diszmutázt és nonhistone kromoszómális fehérje HMG-1 (HMG-1) volt megfigyelhető, míg a csökkenés szénsav anhydrases I és II, glutation-S-transzferáz és foveolin prekurzor (gastrokine-1) (FOV), egy 18 kDa-os gyomor -specifikus fehérje feltételezett tumor szuppresszor aktivitást, detektáltunk. RT-PCR elemzés azt is kimutatta, jelentős down-regulációja FOV mRNS expresszió a tumor szövetekben.
Következtetés
Egy lehetséges patológiai szerepe down-regulációja FOV a gyomor karcinogenezis volt kimutatható. A fajlagos csökkenését gén és fehérje expresszióját FOV betegeknél lehet használni, mint a klinikai biomarkerek hatékony diagnózis és értékelése a gyomorrák. Katalógusa Háttér katalógusa Gyomor adenocarcinoma tartalmazzák az egyik leggyakoribb típusú rák ázsiai országban Japán, mivel a második csak a tüdőrák, mint a halálozások száma okoz. Annak ellenére, hogy a közelmúltbeli fejlődés diagnosztikai technikák, a legtöbb gyomorrákos betegek diagnosztizáltak előrehaladott stádiumban, és van egy nagyon alacsony ötéves túlélési arány (kevesebb, mint 10%) [1]. Ez részben annak köszönhető, hogy hiányzik a specifikus és érzékeny biomarkerek diagnosztizálására és megfigyelésére betegség előrehaladás egy korai szakaszban, bár egyes gyomor tumormarkerek, beleértve a karcinoembrionális antigén, már használt és részben hatásos. Mivel a gyomor carcinogenesis egy többlépcsős folyamat, átfogó elemzés is szükséges egyedi esetekben, amelyekben különböző molekuláris események történnek az egyes rákkeltő folyamatban. Katalógusa Nemrégiben proteomikai analízis használtak, hogy átfogóan vizsgálja fehérje expresszió testnedvek, szövetek és sejtek [ ,,,0],2-4]. Ez a megközelítés, mivel a klinikai proteomika, nagyon hasznos azonosítására betegséggel asszociált proteinek, amelyek azt mutatják expressziójának megváltozása és a módosítás megfelel egy kóros állapot [5, 6]. Ezek a betegséggel kapcsolatos fehérjék várhatóan biomarkerek a diagnózis és a feltételezett célzott fehérjék kezelésére [7-9]. Másrészt, átfogó elemzését transcriptomes tumor szövetekben különböző rákos betegek DNS alkalmazásával microarray és gén chipek végeztek az elmúlt években [10]. Azonban hiánya közötti korreláció változások mRNS és karcinogenezis igazolták, és a mennyiségi és minőségi változásai poszttranszlációsan módosított fehérjék, mint végső géntermékek úgy, hogy több informatív, mint a mRNS-ek a tumor szövetekben tanulmányozására a molekuláris események kialakulásában. Proteomikai vizsgálatok azonosítására tumorasszociált fehérjék gyomorrák növekednek, és proteomot adatbázisokat gyomor szövetek [11] és sejtvonalak [12] kerültek kialakításra. Legtöbbjük az adott fehérjét vagy antigént, amelyek tükrözik a kemo- és hőálló tulajdonságokkal gyomorrákban [13-15], és amelyek kapcsolatban vannak Helicobacter pylori katalógusa [16, 17]. A jelen vizsgálatban végeztünk átfogó proteom elemzést tumor és a nem-tumoros szövetekben japán betegeknél gastricus karcinómák, és az azonosított különböző fehérjéket, amelyek az expressziós szintek általában megváltozott a klinikai esetben. Különösen az expresszióját gastrokine-1 (GKN-1) javasolták alatt mind transzkripciós és transzlációs kontroll.
Eredménye
fehérjék elválasztása és azonosítása
ábra az 1A ábrán egy kép áttekintést egy tipikus mester gél a gyomor daganatos szövetet. Mintegy 200 fehérje foltok Coomassie Brilliant Blue (CBB) R-250 jól elkülönülnek az gélek. A számozott foltok ábrán 1b és 1c kivágtuk a gél, tripszinnel kezeljük, majd alávetjük folyadék kromatográfia-elektronikus permetképző ionizációs tandem tömegspektrométer (LC-ESI-MS /MS) elemzést. Hetvenkét közülük képviselő 69 különböző fehérje fajokat azonosítottuk. Az 1. táblázat felsorolja az azonosított fehérjék révén peptid megfelelő a Mascot keresési algoritmus. A pontosság protein profilalkotás értékelték pontérték (a fenti 37). 1. ábra (A) ábra egy mester 2D gél képét a tumor származó szövetet egy beteg a gyomor adenokarcinóma. (B) és (C) A számozott fehérje foltokat úgy azonosítottuk, hogy az LC-ESI-MS /MS és a fehérje megfelelő, az ábrán látható nagyítva számok.
Táblázat 1 fehérje profilját detektáltunk tumorszövetben származó japán beteg a gyomor adenocarcinoma.
Spot szám Matton Példányazonosító
Protein azonosító katalógusa
Mass Matton SC (%) Matton pI Matton Pontszám Matton 1 katalógusa 24308169 katalógusa axonemal nehézlánc dyneinproteineket 3. típusú katalógusa 473776 katalógusa 0 katalógusa 6,04
37 katalógusa 2

• Le szabályozása Thrombospondin2 jósolja rossz prognózisú betegeknél gyomorrák
• A katekolamin up-szabályozza MMP-7 expresszió aktiválásával AP-1 és STAT3 a gyomor cancer