TCGA mokslininkai nustatome keturias potipių skrandžio cancer

301-496-6641

Skrandžio vėžio galima suskirstyti į keturias skirtingas molekulių potipių mokslininkai su Vėžys genomo Atlas (TCGA) tinklo rasiu. Tyrime, kuris buvo paskelbtas internete liepos 23, 2014 m Nature, mokslininkai teigia, kad šis atradimas gali pakeisti, kaip mokslininkai galvoti apie kuriant gydymo skrandžio vėžio, taip pat vadinamas skrandžio vėžio ar skrandžio adenokarcinoma.

Vietoj atsižvelgiant skrandžio vėžys kaip vieną ligos, kaip buvo daroma anksčiau, mokslininkai dabar galės ištirti gydymo apibrėžtose rinkinių pacientams, kurių navikai turi specifinių genomo anomalijos. Skrandžio adenokarcinoma yra pagrindinė priežastis, dėl vėžio susijusio mirtingumo visame pasaulyje, todėl maždaug 723,000 mirčių kasmet.

Ankstesni bandymai išnagrinėti klinikinių charakteristikų skrandžio vėžio buvo trukdoma kaip skirtingai vėžinės ląstelės gali atrodyti po mikroskopu, net tada, kai iš to paties auglio. Mokslininkai tikisi, kad nauja klasifikavimo sistema tarnaus kaip vertingas priedas prie dabartinės patologija klasifikavimo sistemą, kuri turi dvi kategorijas:. Paplitusia ir žarnyno

"Svarbiausia iš anksto su šiuo projektu yra tai, kad mes turime identifikuoti ir sukūrė daug daugiau naudingos klasifikavimo sistema rasti grupes skrandžio vėžio, kuris turi atskirą molekulinius funkcijas, ir tuo pačiu metu, mes taip pat nustatė pagrindinius tikslus siekti įvairiose pacientų grupėse, "sakė Adomas Bass, MD, Harvardo medicinos mokykla, Dana- Farber vėžio institutas, platus institutas, Bostonas, ir vienas iš švino tyrėjams apie projektą. "Tai bus suteikti tvirtą pagrindą kategorijas ligą ir už tai į tai, kaip mes galime sukurti klinikinius tyrimus remiantis kai kurių kritinių molekulinių pokyčių, kurie vairavimo skirtingų klasių vėžio."

mokslininkus nustatė naujus pogrupius per sudėtingas statistines analizes molekulinių duomenų iš 295 navikai. Jie naudojami šeši molekulinės analizės platformų, įskaitant DNR sekos, RNR sekos ir baltymų matricos.

Augliai pirmoje grupės, kuri sudarė 9 proc navikų, buvo teigiami Epstein-Barr viruso (EBV) ir turėjo keletą kiti molekuliniai bendrumai. Navikai antrą pogrupio (22 proc navikų) turėjo aukštą mikrosatelitinio nestabilumą (MSI), kuris yra tendencija, kad mutacijos kauptis pakartotinių sekų DNR. Likusios pogrupiai skyrėsi somatinių kopija skaičius pokyčių (SCNAs), kuris gali atsirasti dubliavimo arba naikinimui skyriuose genomo lygmenyje. Į trečią pogrupio navikai, kurią sudarė 20 procentų auglių, buvo laikoma, kad žemo lygio SCNAs ir buvo vadinami genomically stabili. Likę 50 procentų navikų buvo klasifikuojami kaip chromosomų nestabili, su aukšto lygio SCNAs.

EBV teigiamas pogrupis navikų buvo ypač svarbus. EBV yra geriausiai žinomas Jungtinėse Valstijose kaip infekcinė mononukleozė priežastis, kuriai būdingas karščiavimas, gerklės skausmas ir patinę limfmazgiai, ypač kaklo. Baro taip pat įtariama, kad gali sukelti tam tikrų vėžio formų, įskaitant nosiaryklės karcinomą ir kai limfoma tipų. Ankstesni tyrimai parodė, kad EBV galima aptikti iš skrandžio adenokarcinomos mažumos ir kad EBV genai yra išreikšti šių navikų. Tačiau, šis tyrimas nustatė, kad EBV buvimas skrandžio navikų yra susijęs su kitų molekulinių savybių skaičius.

Pirma, mokslininkai pastebėjo, kad EBV-teigiamas navikai rodomas aukštą dažnį mutacijų į PIK3CA geno, kuris koduoja baltymą PI3-kinazės, kuris yra būtinas ląstelių augimui ir dauginimuisi ir daug kitų ląstelinių veiklas, kurios yra svarbios vėžio komponentas. Nors 80 proc EBV-teigiamas navikų priglaudė baltymų keičiasi pokyčiui PIK3CA, PIK3CA mutacijos buvo rasta 3 procentų iki 42 procentų navikų kitų skrandžio vėžio potipiai. Mokslininkai teigė, kad EBV-teigiamas navikai gali reaguoti į PI3-kinazės inhibitorių, iš kurių kai kurie yra ankstyvosiose stadijose bandymų klinikinių tyrimų metu, bet dar nėra JAV Maisto ir vaistų administracija patvirtino bendro naudojimo.

Kai kurios EBV-teigiamas pogrupio navikai taip pat parodė, daugiau genų kopijos gaminamas chromosomų regione, kuriame yra JAK2 geno. JAK2 baltymų palengvina ląstelių augimą ir dalijimąsi, o padidėjo išraiška JAK2 gali netinkamai aktyvuoti ląstelių augimą. Papildyta regionas taip pat pateikiamos dėl dviejų baltymų, PD-L1 ir PD-L2, kuris slopina imuninį atsaką genus; padidėjus jų ekspresija gali padėti navikai, kad išvengtų sunaikinimo, kad imuninė sistema. Tyrėjai teigė, kad šios išvados remti JAK2 inhibitorių ir PD-L1 /2 antagonistais vertinimą už EBV-teigiamas skrandžio vėžio gydymo.

Ir EBV-teigiamas pogrupis parodė gerokai didesnę paplitimą DNR hypermethylation nei koks kitas vėžys potipis pranešė TCGA mokslininkai. Metilinimas yra pridedant metilo grupes, kurios DNR, kuri sumažina genų ekspresiją procesas. Hypermethylation atsitinka, kai šis mechanizmas toliau nenormaliai, nusiraminimas genus, kurie turi būti aktyvus. Į EBV-teigiamas naviko pogrupyje hypermethylation dažniausiai buvo pastebėta promotoriaus regionuose genų, kurios galėtų užkirsti kelią genų ekspresiją

". Įgyti šias įžvalgas tarp EBV ir skrandžio vėžio ryšį yra tipo novatoriškų tyrimų, kad NIH lankosi malonu būti dalis. Mes laukiame potencialių klinikinių pasekmių šio atradimo, " sakė Nacionalinio sveikatos instituto direktorius Pranciškus S. Collinsas, MD, Ph.D.

"Šis tyrimas sustiprina požiūrį mes, naudojant studijuoti genomo įvairovės ir panašumo tarp navikų įvairių rūšių vėžio vertę", sakė NVI direktorius Haroldas Varmus MD "Tik tokia sisteminė analizė galėjo davė pastabas apie tarpusavio EBV ir keletą provokuojančių molekulinių savybių asociacijos."

Svarbūs įžvalgos taip pat atėjo iš analizes kitų trijų skrandžio vėžio pogrupius. Pavyzdžiui, auglių genomically stabilios potipio esančius dažnai mutacijas genas pavadinimu RHOA, kurio produktas sąveikauja su kitais korinio baltymų, siekiant padėti ląstelės keisti formą ir migruoti, kurie gali būti svarbūs auglio augimas. Ši išvada rodo galimus tikslus gydyti auglius šio potipis. Ir auglių chromosomų nestabilios potipio esančius dažnai amplifikaoija genų, kurie koduoja receptorių baltymus ant ląstelės išorės, po kurio buvo nukrypusiu nuo normos ląstelių augimo skatinimo. Narkotikai jau yra pažaboti kai kuriuos iš šių baltymų aktyvumą.

"Tai naujausias TCGA tyrimas vėl demonstruoja savo išsamią dizaino svarbą, sakė NHGRI direktorius Ericas Žalios, M. D., mokslų daktaras "Šie rezultatai mums svarbių naujų genomo įžvalgas į mirtino vėžio formų priežastis ".

TCGA kartu valdo Nacionalinio vėžio instituto (NVI) ir Nacionalinio žmogaus genomo tyrimų instituto (NHGRI) abu National Institutes of Health (NIH) dalys, visapusiškai apibūdinti daugiau nei 30 rūšių vėžio genomus. TCGA tyrimų tinklas sukurtas duomenis ir paskelbti analizuoja nuo vėžio skaičių, kurie visi gali būti rastos TCGA svetainėje, http://www.cancergenome.nih.gov.
###

Nuoroda: vėžys genomo atlasas tyrimų tinklas. Išsami Molekulinė apibūdinimas skrandžio adenokarcinoma. . Gamta
Prisijungę liepos 23 2014 Doi: 10,1038 /nature13480

TCGA sukurtas duomenys yra laisvai prieinami iš anksto skelbiant prie TCGA duomenų portale http: //tcga-duomenys. nci.nih.gov/tcga ir CGHub, https://cghub.ucsc.edu. TCGA tyrimų tinklas apima daugiau nei 150 mokslo darbuotojams dešimtys įstaigų visoje šalyje. Dalyvių sąrašas yra prieinamas ne http://cancergenome.nih.gov/abouttcga/overview. Daugiau informacijos apie TCGA, įskaitant Faktai, Q & A, grafika, žodynėlis, trumpas vadovas genomikos ir medijos bibliotekos vaizdų galima rasti http://cancergenome.nih.gov
.