Somatic frameshift kennen an de Bloom Syndrom BLM VerfÜgung Gene sinn heefeg zu sporadesch gastric carcinomas mat microsatellite mutator phenotype VerfÜgung méiglech VerfÜgung Background VerfÜgung Frankräich Instabilitéit huet um microsatellite tracts zu puer coding Message gemellt ginn. Mir hunn dat der Gentherapie VerfÜgung Bloom Syndrom BLM dës Distanz an hir coding Regioun eng Zilscheif vun microsatelliteinstability (MSI) an engem kuerzen puer dovun-adenine widderhuelen wellkomm kann. Fir weider d'Bedeelegung vun BLM VerfÜgung zu tumorigenesis Markenzeeche, hu mir kennen an néng Genen wouvun coding microsatellites zu microsatellite mutator phenotype (MMP) positiv an negativ gastric carcinomas (GCs). VerfÜgung Method propagéieren VerfÜgung Mir analyséiert 50 gastric carcinomas (GCs) fir Projet'en am BLM VerfÜgung puer dovun (a) TRACT aswell wéi an der coding microsatellites vun der TGFβ1-RII, IGFIIR, hMSH3, hMSH6, Bax, WRN, RECQL VerfÜgung an CBL VerfÜgung Genen. VerfÜgung Resultater VerfÜgung BLM VerfÜgung kennen sech zu 27% vun MMP + GCs (4/15 Fäll) mee net an enger vun den MMP negativ GCs (0/35 Fäll) fonnt. D'Frequenz vun Projet'en an déi aner aacht coding Regiounen microsatellite war folgend: TGFβ1-RII VerfÜgung (60%), Bax VerfÜgung (27%), hMSH6 VerfÜgung (20%), hMSH3 VerfÜgung (13 %), CBL VerfÜgung (13%), IGFIIR VerfÜgung (7%), RECQL VerfÜgung (0%) an WRN VerfÜgung (0%). Projet'en am BLM VerfÜgung schéngen méi gin oft mat frameshifts zu Bax VerfÜgung an hMSH6 VerfÜgung assoziéiert an /oder hMSH3. VerfÜgung Saachen mat BLM VerfÜgung hire Restaurant eng héich Frequenz vun onbestänneg mono- an trinucleotide presentéieren etabléiert Widerhuelung Regiounen als Verglach mat mutator phenotype erhéijen ouni BLM VerfÜgung frameshifts zu coding. Konklusiounen VerfÜgung BLM VerfÜgung frameshifts sinn heefeg hire Restaurant zu GCs speziell verbonne mat MMP + erhéijen VerfÜgung. Mir proposéieren, dass BLM VerfÜgung Verloscht vun Funktioun vun MSI kann d'genetesch Onstabilitéit vun enger Pré-inexistent onbestänneg genotype zu gastric erhéijen Erhéijung. VerfÜgung Background VerfÜgung Cancer eng progressiv genetesch Krankheet déi ëmmer Heefung vun Projet'en am souwuel coding charakteriséiert ass an Net-coding Message [1]. Simple Haaptrei Widerhuelung oder microsatellites sinn an e puer Mënsch neoplasms héich onbestänneg, enger Klass vun erhéijen mat der microsatellite mutator phenotype (MMP +) Erkenntnesser (fir review gesinn [2]). MMP + hu Zoustand vun Instabilitéit zu méi wéi 30% vun analised microsatellites definéiert ass, och op d'mannst ee mononucleotide (wéi BAT26 oder BAT25) [3]. Microsatellite Instabilitéit (MSI) gouf als heefeg genetesch Verfall vun verschiddenen Mënscherechter staark erhéijen och sporadesch a familial gastric carcinomas (GCs) beschriwwen. An bal all Patienten mat ierflech nonpolyposis colorectal Kriibs (HNPCC), hunn molekulare Studie gewisen datt MSI vun germline kennen Genen ëmmer ass eng Dekodéierungs Proteinen fir DNA fonnt Reparatur (MMR) néideg [4]. Genen wéi hMSH2, hMLH1, PMS1, PMS2 VerfÜgung an hMSH6 /GTBP VerfÜgung [5-8], huet als "caretakers" definéiert, well, wann erofgaangen, si d'Acquisitioun vun Projet'en um héich Frequenz vun e puer Genen dofir och oncogenes an entholl suppressor Genen [9]. Allerdéngs, an engem groussen Ëmwandlung vun sporadesch MMP + erhéijen, huet stattfannen Analyse net d'Identifikatioun vun den Genen responsabel fir MSI erlaabt [2, 10], proposéiert, datt, an esou Fäll, kéint MSI vun epigenetic Mechanismen verursaacht ginn. An Tatsaach, war Gentherapie silencing vum Promoteur hypermethylation fir d'hMLH1 VerfÜgung Gentherapie kuerzem dës [11-13]. VerfÜgung D'Bedeitung vun MSI zu tumorigenesis huet vun der Manifestatioun ënnerstëtzt ginn, dass d'genetesch Onstabilitéit characterizing MMP + gastrointestinal Cancers kuerz Zil- kënnen widderhuelen tracts bannent de coding Regioun vun Genen wichteg fir Zell Iwwerliewe an Prolifératioun. Enregistréiere /Läschen kennen sech an de Genen fir d'transforméiert Wuesstem Faktor-Beta Typ II receptor (TGFβ1-RII VerfÜgung), den Insulin-wëll Wuesstem Faktor Typ II receptor (IGFIIR VerfÜgung), d'DNA fonnt-Reparatur Genen fonnt hMSH3 VerfÜgung an hMSH6, VerfÜgung der proapoptotic Gentherapie Bax VerfÜgung an der Transkriptiouns Faktor E2F-4 VerfÜgung [14-18]. An all de Fäll, mat der Ausnam vun der E2F-4, VerfÜgung der nucleotides Enregistréiere /Läsche vun frameshift kennen an FAQ truncation duerchgesat. Obwuel de biologeschen Bedeitung vun dëse hire Restaurant ass net voll etabléiert, huet et proposéiert, datt d'Feele vun TGFβ1-RII kenne vun der Uewerfläch vun gastrointestinal epithelial Zellen konnt den negative Wuesstem Kontroll vun TGF-β, flénke ongebremste Zell Wuesstem [19] eliminéiert. IGFIIR huet eng Roll am Wuesstem Ennerdréckung vun bindend an der TGFβ1 receptor komplex activating a vun internalization, mat Perquisitiounen ofgeschnidden mediating, vun de Wuesstem Faktor IGF-II [20, 21]. Bax VerfÜgung ënnerstëtzt apoptosis an et gouf confirméiert, datt Bax VerfÜgung inactivation zu rapid entholl Wuesstem féiert [22]. De mënschleche Genen hMSH3 VerfÜgung an hMSH6 VerfÜgung Gentherapie dem bakteriell MutS VerfÜgung homologous si hir Produiten DNA mismatches kruet staarkt-spezifesch Reparatur vun DNA Gedächtnis Feeler [23] ze lancéieren. Somatic an germline kennen hMSH6 VerfÜgung mat sporadesch MMP + colorectal carcinomas an HNPCC [6] verbonne waren. VerfÜgung Mir hunn dat der Gentherapie eng Zilscheif vun MSI [24] kann och VerfÜgung BLM virdrun fonnt. D'frameshifts, zu engem kuerze puer dovun-adenine widderhuelen fonnt, waren e gekierzt an Net-funktionell BLM FAQ ze generéieren virausgesot. Homozygous oder Massa heterozygous Projet'en am BLM VerfÜgung Gentherapie huet dës Distanz de Bloom Syndrom ze féieren (BS; OMIM 210900), e Pre-malignant Zoustand vun chromosomal Onstabilitéit charakteriséiert a fräi mutational Tarif. BS Patienten sinn zu enger grousser Villfalt vu neoplams um fréie Alter festgestallte festneele wellen. Enormen, dorënner 100 neoplasms an der BS Enregistrement opgeholl, 19 goufen gastrointestinal (esophagus, Moo an Colon) an nëmmen zwee sech no der Alter vun 40 [25] diagnostizéiert. Dës Donnéeë weisen, datt Projet'en am BLM VerfÜgung Gentherapie tumorigenesis Promotioun ka VerfÜgung besser Fir d'Roll vun BLM VerfÜgung zu gastrointestinal tumorigenesis definéieren mir e Rot vun MMP + an MMP- gastric carcinomas opgefouert (GCs) fir:. Engem) frameshifts an der coding Regioun microsatellite VerfÜgung BLM a b) fir méiglech Associatiounen mat anere intragenic frameshifts. VerfÜgung Resultater VerfÜgung MSI Status VerfÜgung fir de Moment studéieren, eis Rot vun 50 GCs enthält 15 MMP + erhéijen mat MSI um zwee oder méi loci (Table 2) an 35 GCs MMP- mat Verfall op ee microsatellite (4 erhéijen) oder ouni MSI (31 erhéijen). All d'MMP + Fäll goufen BAT 26 positiv, an BAT 25 Onstabilitéit war vun 13 aus 15 Fäll (ausser Fäll 67R an 27P) fonnt. D'clinico-agebousst Charakteristike vun MMP + erhéijen sinn an Table 1. D'MMP + phenotype beschriwwen war enk mat engem niddregen pTNM Etapp verbonnen a mat engem manner verwandelt nodal Investitiounen (p = 0,02 a p = 0,001 um Fisher genau Test, respektiv, vs.
MMP-erhéijen). An der MMP + Grupp, eng iwwerschësseg vun erhéijen an Grondsteen an ouni lymph Node Metastasen gouf fonnt (10/15 Fäll vs. 10/32 Fäll vun MMP- Fäll, p = 0,02 an 11/15 Fäll vs. 7/32 Fäll vun MMP- Fäll, p = 0,001, bzw.), Daten datt déi proposéiert besser prognostic vun GCs MMP + [33, 34] Ënnerstëtzung. Vun Note, war kee iwwerschësseg vun intestinal Typ ënnert MMP + erhéijen fonnt (12/15 Fäll vs. VerfÜgung 20/32 vun MMP- Fäll) (Table 1), Daten am Aklang mat rezent Studien kee groussen Ënnerscheed an der Heefegkeet vu weisen MSI zu intestinal-Typ an diffusen-Typ carcinomas [26, 35] .Table 1 Histotype an Stadium Parameteren verbonne mat der MMP phenotype an eiser GCsa VerfÜgung
verännerleche
Zuel vu Patienten
P valueb
Total (%) VerfÜgung MMP + (%) VerfÜgung MMP - (%) VerfÜgung Histotype VerfÜgung Intestinal
32 (68.0) zu 12 (37.5) zu 20 (62.5) VerfÜgung Firwat + Bréissel VerfÜgung 15 (32.0) VerfÜgung 3 (20.0) zu 12 (80.0) VerfÜgung NSc VerfÜgung T (Déift vun Mauer einfach) VerfÜgung T1 + T2 VerfÜgung 12 (25.5) zu 6 (50.0) zu 6 (50.0) VerfÜgung T3 + T4 VerfÜgung 35 (74.5 ) VerfÜgung 9 (25.7) zu 26 (74.3) VerfÜgung NS VerfÜgung N (lymph Node Status) VerfÜgung N0 VerfÜgung 18 (38.3) zu 11 (78.5) VerfÜgung 7 (21.5) VerfÜgung N + VerfÜgung 29 (61.7) zu 4 (12.1) zu 25 (87.9) VerfÜgung = 0,001 VerfÜgung M (Investitiounen) VerfÜgung M0 VerfÜgung 40 (85.1 ) VerfÜgung 14 (35.0) zu 26 (65.0) VerfÜgung M + VerfÜgung 7 (14.9) VerfÜgung 1 (14,2) VerfÜgung 6 (85.8) VerfÜgung NS VerfÜgung Stadium
ech + II 20 (42.5)
10 (58.8) VerfÜgung 5 (16,6) 10 (41,2) VerfÜgung III + IV VerfÜgung 27 (57,5) 22
( 83.4) VerfÜgung = 0,02 VerfÜgung Totala VerfÜgung 47 zu 15 zu 32 VerfÜgung enger - Daten fir 47 aus 50 Fäll b sinn sech - am Fisher genau Test c - NS = keng statistesch relevant VerfÜgung Table 2 Status vun der coding microsatellites bannent BLM, WRN, RECQL, CBL, hMSH6, hMSH3, IGFIIR, TGF-βRII VerfÜgung an Bax VerfÜgung Genen an der Serie vun gastric carcinomas mat microsatellite mutator phenotype.
Case
Histotypea
Stagingb
BLM
WRN
REQL
CBL
hMSH6
hMSH3
IGFIIR
TGF-βRII
BAX
No.
| VerfÜgung MSIc
(A)9
(A)8
(A)9
(ATG)6
(C)8
(A)8
(G)8
(A)10
(G)8
31R I I(T2N0M0) 2/5 - - - - - - - - - 57R I IV(T3N1M1) 5/5 - - - - - - - + - 63R I I(T2N0M0) 5/5 - - - - + - - + + 67R I I(T2N0M0) 4/5 - - - - - - - + - 69R D II(T3N0M0) 4/5 + - - + + + - + + 79R I I(T2N0M0) 5/5 - - - - - - - - - 3P I II(T3N0M0) 4/7 + - - - - - - - + 11P I III(T3N1M0) 3/7 + - - - - + + + - 14P M II(T3N0M0) 6/7 + - - + + - - + + 17P I II(T3N0M0) 3/7 - - - - - - - - - 19P D III(T3N1M0) 3/7 - - - - - - - - - 27P I IV(T4N0M0) 2/5 - - - - - - - + - 30P I I(T2N0M0) 3/6 - - - - - - - - - 37P I I(T2N0M0) 3/7 - - - - - - - + - 38P I III(T3N2M0) 3/7 - - - - - - - + - % present Etude (Zuel vun de Fäll) zu 27% zu 0% VerfÜgung 0% zu 13% zu 20% zu 13% VerfÜgung 7 60% VerfÜgung% zu 27 % VerfÜgung kennen VerfÜgung (4/15) VerfÜgung (0/15) VerfÜgung (0/15) VerfÜgung (2/15) VerfÜgung (3/15) VerfÜgung (2 /15) zur VerfÜgung (1/15) VerfÜgung (9/15) VerfÜgung (4/15) VerfÜgung zu Literatur Rapport (an GCs) d VerfÜgung - VerfÜgung - VerfÜgung - VerfÜgung - VerfÜgung 22-52% VerfÜgung 19-64% VerfÜgung 19-24% VerfÜgung 42-83% VerfÜgung 15-64% VerfÜgung eng - ech intestinal Typ =; D = diffusen Typ; M = deer Zort b - laut der TNM Klassifikatioun (Sobin an Wittekind, 1997) c - Zuel vun onbestänneg /total getest microsatellites d - Daten aus der Fusioun iwwerlieft: [17,27,42,50,51,52] BLM frameshifts VerfÜgung Hinnen alleguer amplification vun der microsatellite VerfÜgung BLM réischt Manque Bands, a 4 vun de 15 MMP + erhéijen an d'normal reagéiert DNAs veréiert, (27%) (Figebam. 1). Mir hunn déi sequencing confirméiert, datt de Manque Bande vun engem Extrait vun engem adenine Ermächtegung am puer dovun-adenine TRACT (Reduktioun vu néng bis aacht adenines) verursaacht ginn, wéi virdrun [24] gewisen. D'Frequenz stattfannen an BLM VerfÜgung vläicht e niddereg aschätzen ginn, well mir Fäll ausgeschloss hunn an déi anormal Gruppen zu entholl DNAs gëlt schwaach ass wéi déi normal gelackelt goufen, méiglecherweis zu Konsequenz vun enger grousser kontaminéierte entholl mat nonmalignant Zellen oder vun engem niddregen Deel vun malignant Zellen der Anomalie (Figebam. 1) ginn. Well keen BLM VerfÜgung stattfannen an MMP- erhéijen gesi war, frameshift Projet'en am BLM VerfÜgung Gentherapie schéngen speziell mat gastric MMP + erhéijen assoziéiert gin (Probabilitéit P &Si besteet; 0,01 um Fisher genau Test), ähnlech zu der leschter drun dokumentéiert hire Restaurant zu TGFβ1-RII, IGFIIR, hMSH3, hMSH6 VerfÜgung an Bax VerfÜgung Genen [14, 16, 17, 32]. Dofir, de Repertoire vun verännert Genen ausbaue eis Daten verbonne mat MMP + gastric carcinomas. Figur 1 Vertriederin Beispiller vun am microsatellites um Gentherapie coding Regioune festgestallt kennen. Fall Zuelen sinn virun all passende normal (N) an entholl (T) DNA Puer gewisen. Feiler weg de Manque Museken. Bedenkt datt mir net mutated Echantillon geduecht hunn wou Manque Bands ganz liichtschwaache huet (wéi am BLM VerfÜgung an Bax VerfÜgung Genen vun entholl Prouf 30P). Well vun der Tendenz vun Taq polymerase eng extra Nukleotid um Enn vun der Wierderbuch DNA Fragmenter, Hinnen alleguer Produiten schéngen heiansdo wéi duebel Bands ze erhéichen. Mat der Ausnam vun Bax VerfÜgung frameshift zu entholl 69R, schéngt keen anere stattfannen homozygous gin. Allerdéngs, d'Verhältnis vun malignant Zellen zu entholl Prouf wëssen, hu mir uginn virdrun, datt de BLM VerfÜgung stattfannen an entholl 69R ass och homozygous [24]. VerfÜgung Frameshifts an aner CDRs microsatellites a Relatioune mat BLM frameshifts VerfÜgung d'selwecht Rot vun MMP + erhéijen war och am coding Regioune vun aacht anere Genen (Table 2) wellkomm fir d'Präsenz vun frameshifts zu microsatellites analyséiert. Mir hunn Variant zu Haaptrei Längt fonnt an TGFβ1-RII, IGFIIR, hMSH3, hMSH6 VerfÜgung an Bax VerfÜgung Genen, all déi virdrun am Rapport MMP + GCs geännert gin. Donnéeën iwwert d'TGFβ1-RII VerfÜgung Statut fir aacht (P Serie vun Table 2) vun de fofzéng erhéijen sech virdrun gemellt [27]. D'observéiert stattfannen Ofstänn sech vergläichbar mat deene virdrun fir all dës Genen gemellt, mat der Ausnahm vun IGFIIR, VerfÜgung fir déi mir eng niddereg Prozentsaz vun frameshifts (Table 2) fonnt. Spannen, am Verglach mat BLM VerfÜgung kennen, nëmmen TGFβ1-RII VerfÜgung frameshifts sech méi heefeg (60% vs. 27%, respektiv) an Bax VerfÜgung frameshifts sech sou gutt wéi heefeg (27%). Dës Donnéeë hindeit, datt frameshifts zu BLM VerfÜgung sinn gemeinsam hire Restaurant zu MMP + GCs. A Trend bei enger Associatioun tëscht kennen BLM VerfÜgung a kennen Bax VerfÜgung an hMSH3 VerfÜgung an /oder hMSH6 VerfÜgung war observéiert (Table 2) (P = 0,05 um Fisher genau Test). Mir hunn donieft och d'RecQL, WRN VerfÜgung an CBL VerfÜgung Genen, déi kuerz Widerhuelung vun hire coding Regiounen enthalen. Déi éischt zwee Genen si Membere vun der selwechter helicase Gentherapie Famill als BLM VerfÜgung [36, 37]. Iwwerdeems RecQL VerfÜgung net mat all Mënsch Krankheet, déi kennen der WRN VerfÜgung Gene sinn opgrond vun de Werner Syndrom verbonnen ass (W; OMIM 277700), eng rar autosomal recessive Stéierungen klinesch Zeeche vun virzäitegen Alterungsprozess a fräi Risiko fir eng ganz Rei vun neoplasms, an genetesch duerch Frankräich Onstabilitéit charakteriséiert. CBL VerfÜgung ass eng tyrosine kinase receptor [38], deenen hir Dereguléierung mat oncogenesis verbonne war, [39]. Mir hunn déi kennen nëmmen an den CBL VerfÜgung Gentherapie (Figebam. 1) fonnt. Zwee Echantillon (69R an 14P) waren fonnt engem 3 BP Enregistréiere vun der trinucleotide (ATG) 6 widderhuelen vun der CBL VerfÜgung Gentherapie ze droen (Donnéeën net gewisen). Wéi mer virdrun gemellt hunn [24], well kee frameshift produzéiert gëtt, ka kee funktionell Konsequenz opgrond ginn. Béid kennen sech zu Cancers ginn och BLM VerfÜgung frameshifts (Table 2) fonnt. Et ass wichteg, dass dëst Ziel vun erhéijen an coding Regiounen eng statistesch relevant iwwerschësseg vun MSI weisen wéi mat der MMP + Ziel ouni BLM VerfÜgung hire Restaurant Verglach. (P &Si besteet; 0,001, um Χ 2 Test) (Table 2) Diskussioun VerfÜgung puer Studien hunn dokumentéiert dass alternativ Weeër duerch verschidden baut vun verännert Genen [40] Zeeche vun gastrointestinal MMP + an MMP- Cancers existéieren kann. A moderate Modell vun mutator kennen ( "de mutator dass den Trainer mutator mutates") war sengerzäit den mutator versus der suppressor Weeër an gastrointestinal erhéijen [41] ze definéieren. Vun analyséiert d'timing vun mutational Evenementer zu genetesch onbestänneg GCs, war et proposéiert, datt d'éischt Ziler vun fonnt Reparatur hunn d'mononucleotide tracts vun TGFβ1-RII VerfÜgung an Bax sinn. VerfÜgung D'frameshift Projet'en vun hMSH3 VerfÜgung an hMSH6 VerfÜgung schéngen Secondaire net fonnt Reparatur lesions ze ginn, déi kennen IGFIIR VerfÜgung [42] produzéiert. Déi fannen dass frameshift Projet'en um TGFβ1-RII VerfÜgung den heefegsten sinn an der IGFIIR VerfÜgung der manner heefeg ginn an gastric MMP + erhéijen ënnerstëtzt fir de Modell an déi fréi Evenementer vun der Majoritéit vun erhéijen an spéiden kennen présentéieren soll nëmmen an engem klengen Ëmwandlung [43]. Dat fannen ass och an eisem Studium (Table 2) confirméiert. BLM VerfÜgung frameshift Projet'en si méi oft verbonne mat éischten an zweete Schrëtt hire Restaurant an dësem Modell proposéiert, suggeréiert datt si Secondaire Reparatur Mängel ze fonnt (an hMSH3 VerfÜgung an /oder hMSH6 VerfÜgung) presentéieren an Zellen, déi net do apoptosis (méiglecherweis zu Konsequenz vun Bax VerfÜgung inactivation) forméieren. Objet, am Fall 3P, zousätzlech zu BLM, VerfÜgung der nëmmen frameshifts zu Bax (kuckt VerfÜgung Figur 1) an p53 VerfÜgung Genen fonnt goufen (Donnéeën net gewisen) suggeréiert datt, an e puer Momenter, BLM Verfall ouni hMSH3 VerfÜgung ge- an /oder hMSH6 VerfÜgung kennen, an Zellen mat Manque p53-mediated Passerelle vun apoptotic Äntwert ze DNA net fonnt. D'Abannung vun BLM VerfÜgung zu tumorigenesis ausserhalb BS Patienten VerfÜgung schéngt erdenklech, well dës Gentherapie graphësch niewebäi ze handelen. BLM VerfÜgung Projet'en si bekannt eng fräi Frankräich Instabilitéit duerch eng nik Zuel vun chromosomal ugesprach, gerecht a rearrangements a vun exzessivem Zuel vun Projet'en am souwuel coding an noncoding Regiounen, wahrscheinlech entstanen duerch ongläich Schwëster-chromatid realiséiert, charakteristesch Fonktioun charakteriséiert ze féieren vun de Bloom Syndrom [44, 45]. Geet, geet BS enger Kombinatioun vu Frankräich Onstabilitéit an nik Kriibs Risiko, eng Associatioun och vun Mängel an niewebäi Genen (wéi HNPCC, W, esouguer-telangiectasia an xeroderma pigmentosum) ëmmer an aner Krankheete fonnt. Ähnlech fir d'zu BS fonnt kennen, beschriwwen der frameshifts zu GCs ofschafen der helicase Funktioun vun der BLM FAQ [24]. BLM FAQ huet en bewisen DNA unwinding Aktivitéit [46] an hätt am Prozesser Équipe ginn, datt zu malignant Zellen gestéiert ginn, wéi DNA Gedächtnis, recombination, chromosome Segregatioun, DNA Reparatur an Transkriptiouns. Iwwerhaapt, déi Kärspaltung Happ BLM Gentherapie VerfÜgung homologue (radl2 VerfÜgung + /rqhl VerfÜgung +) huet dës Distanz an der S-Phase Bomm ze regléieren a war bis Koppel chromosomal Integritéit mat Zell Zyklus Werdegang proposéiert [47, 48]. Allerdéngs, generéiert Opklärung vun BLM VerfÜgung kennen MMP + erhéijen e Paradox: BLM VerfÜgung Projet'en si virausgesot chromosomal Instabilitéit ze generéieren iwwerdeems meeschte vun der MMP + erhéijen sinn behënnerte. Trotzdem, sinn e puer MMP + erhéijen aneuploid an BLM VerfÜgung Verloscht-vun-Funktioun kennen pleiotropic Konsequenzen hunn kann, eventuell och d'microsatellite Onstabilitéit Passerelle betrëfft, wéi déi vun der Beschreiwung vun enger fräi Zollformalitéiten-Gentherapie kennen Bloom Syndrom ugeholl [44, 45 ]. An suppoprt un eise Virschlag ass Opklärung datt mir fonnt hunn, datt BLM VerfÜgung zu LoVo Zell Linn mutated ass, souwuel eng Colon Kriibs Zell Linn mat microsatellite an chromosomal inatability [43]. Vill méi, et gouf viru kuerzem gemellt, dass SGS1 VerfÜgung Gentherapie, déi Saccharomyces cerevisiae VerfÜgung homologue vun BLM VerfÜgung an WRN, Hien VerfÜgung Nepgen Onstabilitéit an homeologous recombination an ass mat DNA fonnt Reparatur (MMR) iwwerflësseg fir suppressing consomméiert chromosomal rearrangements an recombination tëscht Duden DNA Message fir suppressing [49]. VerfÜgung Konklusiounen VerfÜgung Eis Resultater weisen, datt BLM VerfÜgung frameshifts heefeg hire Restaurant zu GCs sinn a si speziell mat MMP + erhéijen ginn op d'mannst 2 onbestänneg microsatellites assoziéiert. Projet'en am BLM VerfÜgung schéngen dacks mat frameshifts zu Bax VerfÜgung an hMSH6 VerfÜgung an /oder hMSH3, VerfÜgung an erhéijen mat BLM VerfÜgung hire Restaurant e Zuel vun onbestänneg mono- an trinucleotide Widerhuelung verbonne ginn zu coding Regioune vill méi héich wéi déi vun MMP + erhéijen ouni BLM VerfÜgung frameshifts observéiert wellkomm. Mir proposéieren, dass BLM VerfÜgung Verloscht vun Funktioun vun MSI zu gastric erhéijen ass en Tëscherapport mutational Evenement, déi d'Instabilitéit vun enger Pré-inexistent onbestänneg genotype Erhéijung kann. VerfÜgung Method VerfÜgung entholl Echantillon VerfÜgung fofzeg Primärschoul gastric erhéijen an hir normal vläit Stoffer (Blutt oder normal gastric mucosa) waren op der Basis vun sinn DNA aus engem Rot vu 80 gastric erhéijen ausgewielt (27, Călin G an NEGRINI M Engels Daten). Wa méiglech, Beräicher vun entholl Otemschwieregkeeten mat minimal demagogesch Zellen oder minimal stroma, oder zwee, huet e neoplastic Zell Laaschten méi wéi 50% ze kréien ausgewielt. All Fäll goufen histopathologically als adenocarcinomas identifizéiert. Histotype (laut Lauren d'Klassifikatioun) [28] an haut (no der TNM Klassifikatioun) [29] war fir 47 aus 50 Fäll (94%) (Table 1) bekannt. Drësseg-zwee Fäll goufen vun intestinal histotype a 15 Fäll vun diffusen oder deer Zort. Zwanzeg erhéijen goufen ech oder II Darmstadt, iwwerdeems 27 am Etapp III oder IV goufen. Betreffend de lymph Node Status, goufen uechtzéng Fäll KENG a 29 goufen N-positiv. Keen vun de Patienten an engem Kriibs op eng fréi Alter entwéckelt, a keen huet eng Famill Geschicht suggestiv vun genetesch predisposition zu Kriibs. Héich molekulare Gewiicht DNAs war mat etabléierten Prozeduren isoléiert [30] zu Assessment vun MSI VerfÜgung MSI mat zwee vun anonyme lues um loci verroden huet:. (I) D11S1778, D11S1328, D11S922 VerfÜgung an D11S1318 VerfÜgung [24] oder (II) D2S177, D3S1076, D5S433, D11S904, D17S796 VerfÜgung an D18S59 VerfÜgung [27]. D'primers fir dësen dinucleotide microsatellite loci sech aus Informatiounen sinn duerch d'Genom Datebank kritt. Hinnen alleguer amplifications sech als virdru beschriwwen duerchgefouert [24, 27]. Fir all Echantillon VerfÜgung der BAT25 VerfÜgung an BAT26 microsatellites sech vun Hinnen alleguer amplification analyséiert ëmschriwwen [31]. MSI évaluéieren war wann eng Mobilitéit Verréckelung vun Hinnen alleguer Produiten aus entholl DNA Verglach mat der normal Amtskolleg identifizéiert huet. Nëmmen op d'mannst 2 MSI erhéijen mat (> 30% vun getest microsatellites). Sech als MMP + VerfÜgung Amplification vun microsatellites zu BLM a vun anere coding Regiounen (CDRs) VerfÜgung Den (A) 9 microsatellite um Positioun läit 1610- 1618 vun cDNA Haaptreiestären VerfÜgung BLM war fir all vläit Echantillonen analyséiert. mat 50 NG vun Skelett DNA, 1 μM vun all primer, 1,5 mm vun MgC12, 50 μM all vun dATP, dGTP, an dTTP an 5.0 μM vun dCTP, 0,1 Eenheet vun Taq DNA polymerase kuerz, war d'microsatellite vun Hinnen alleguer Implikatioune verstärkt, an 1 μCi [α33P] dCTP zu 10 μl vun Reaktioun Volume. Hinnen alleguer Reaktioune waren fir een Zyklus vun 94 ° C, déi 35 Zykle vun 94 ° C fir 30 ass duerno fir 5 min duerchgefouert, 60 ° C fir 30 s an 72 ° C fir 30 ass. Hinnen alleguer Produiten aus entholl an entspriechend Kontroll DNAs sech op parallel op 6% acrylamide sequencing gels iwwerlaascht a fir visualization vun autoradiography op Kodak X-ar Filmer ausgesat. Erkennen an déi kennen am CDRs vun aacht anere Genen wellkomm microsatellites (den (A) 10 am TGFβ1-RII, VerfÜgung de (G) 8 am IGFIIR, VerfÜgung de (G) 8 am Bax, zu der (a) 8 am hMSH3, VerfÜgung den (C) 8 am hMSH6, VerfÜgung de (a) 9 am RecQL, VerfÜgung de (a) 8 am WRN, VerfÜgung an der (ATG) 6 am CBL VerfÜgung) gemaach war, wéi virdru beschriwwen [14, 16, 17, 24, 32]. Fir kënnen, war all Hinnen alleguer op d'mannst zweemol widderholl. A mutated allele war vun enger Band Verréckelung vun 1 bis 3 BP aus der normal Band mat Intensitéit ähnlecher oder grouss wéi déi vun den Wildwest-Typ Band (Figebam. 1). VerfÜgung Sequencing vun Manque Produiten VerfÜgung Frankräich DNA Fragmenter vertruede suer- Band unzepassen goufen ënner de selwechte Konditiounen reamplified ausser fir d'ënnerlooss vun Fortgeschratten dCTP. Ier sequencing, goufen d'Hinnen alleguer Produiten sidd entweder direkt oder der Trennung vun engem 2% agarose gelies, QIAGEN Offäll Trikoten benotzt. Béid DNA strands sech mat Hinnen alleguer primers an eng automatiséiert Obwuel Biosystem 377 sequencing Gare Nepgen. Nukleotid Message huet de Wisconsin (GCG) Programm Pak Versioun UNIX--8.1 analyséiert. VerfÜgung statistique Analyse VerfÜgung D'statistesch Analyse vun de Resultater gesuergt huet mat der Χ 2 Test oder Fisher d'exakt Test. AP VerfÜgung Wäert vu &Si besteet;. 0,05 war statistesch relevant als VerfÜgung Deklaratioune VerfÜgung Wat VerfÜgung Dëst Wierk war déi Subventioune vun der Associazione Italiana ënnerstëtzt pro la Ricerca Sul Cancro (AIRC) an deelweis aus der EG BIOMED Kontrakt BMH4-CT95-0914. GC war duerch eng IARC Research Training Gemeinschaft ënnerstëtzt. VerfÜgung Auteuren 'original deposéiert Fichieren fir Biller VerfÜgung sinn ennen d'Linken op d'Auteuren' original deposéiert Fichieren fir Biller. 12863_2001_18_MOESM1_ESM.png 1 Auteuren 'original Datei fir Figur
|