Immunohistochemical molekulare phenotypes vun gastric Kriibs baséiert op SOX2 an CDX2 virauszesoen Patient outcome

Immunohistochemical molekulare phenotypes vun gastric Kriibs baséiert op SOX2 an CDX2 Patient Resultat virauszesoen VerfÜgung méiglech VerfÜgung Background VerfÜgung Gastric Kriibs bleift eng sérieux gesondheetlech Bedenken weltwäit. Patienten wier immens aus der Entdeckung vun neien biomarkers Virdeel datt Resultat soe méi korrekt a besser Behandlung erlaben a Suivi Décisiounen. Hei, déi mer eng Retrospektiv, observational Etude d'Expressioun an prognostic Wäert vun der Transkriptiouns Faktoren SOX2 an CDX2 zu gastric Kriibs ze bewäerten. VerfÜgung Method VerfÜgung SOX2, CDX2, MUC5AC an MUC2 Ausdrock vun 201 gastric erhéijen vun immunohistochemistry évaluéieren sech . SOX2 an CDX2 Ausdrock sech mat clinicopathological a Suivi Donnéeën duerchgestrachenem hiren Impakt op entholl gelooss an Resultat ze bestëmmen. Ausserdeem, war vun FISH évaluéieren SOX2 VerfÜgung nët Kopie Zuel Status (N = 21) an Copy Number Variant Assay (N = 62). VerfÜgung Resultater VerfÜgung SOX2 war zu 52% vun der gastric erhéijen ausgedréckt an huet bedeitend verbonne mat männlecht Geschlecht, T Etapp an N Etapp. Desweideren, virausgesot SOX2 Ausdrock aarmen Patient Iwwerliewe, an der Kombinatioun mat CDX2 definéiert zwee molekulare phenotypes, SOX2 + CDX2 - versus SOX2 -CDX2 +, dass daat Schlëmmst an déi bescht Flegeversécherung virauszesoen Begrëff Patienten Resultat. Dës Profiler kombinéiert mat clinicopathological Parameteren stratify Iwwregens hätt vun Patienten mat intestinal an Ausbau erhéijen an déi ouni Zeeche vu Schwächt Invasioun. Endlech, SOX2 VerfÜgung Iwwerhand nët Kopie Zuel sech zu 93% vun der Echantillon Erréchen der amplification loung op 14% an däitlech associating mat FAQ Ausdrock fonnt. VerfÜgung Konklusiounen VerfÜgung Mir weisen, fir d'éischte Kéier, datt SOX2 kombinéiert mat CDX2 Ausdrock Profil an gastric Kriibs Patienten an verschidden prognostic Gruppen segregate, déi clinicopathological Informatiounen ergänzen. Mir weisen weider engem molekulare Mechanismus fir SOX2 Ausdrock vun enger Ziel vun gastric Kriibs Fäll. VerfÜgung Schlësselwieder VerfÜgung SOX2 CDX2 Gastric Kriibs hätt traureg Background VerfÜgung Gastric Kriibs ee vun de stäerkste Toast festgestallte Cancers ass an elo den drëtte Virwaat Doudesursaach vum Kriibs-Zesummenhang mat Doudesfäll an der Welt [1]. Lauren Klassifikatioun trennt gastric Kriibs an zwee Haaptgrënn histological Zorte: intestinal an diffusen [2]. Si presentéieren z'ënnerscheedde morphological, Medeziner an epidemiological Fonctiounen an geduecht sinn aus der Aktivatioun vun onofhängege molekulare Mechanismen ze entwéckelen. Epidemiological Donnéeën weist, datt, am meeschte Fäll, gastric Kriibs beuerteelen net de Novo VerfÜgung aus der normal gastric epithelium, mä éischter Resultater vun enger multistep Prozess, duerch successive genetesch a epigenetic hire Restaurant zu Multiple Genen. Am Géigesaz zu den diffusen Typ, fir déi predisposing lesions net gutt etabléiert sinn, ass d'Nofolleg vun Evenementer zu gastric Kriibs vun der intestinal Typ Virwaat gutt beschriwwen. Laut der CASCADE d'Correa, entwéckelt et zu enger stepwise Manéier, meeschtens duerch eng demagogesch Prozess vun Helicobacter pylori VerfÜgung ausgeléist goufen, déi atrophic gastritis, intestinal metaplasia (IM), dysplasia an endlech adenocarcinoma [3] ze multifocal kann Fortschrëtt.
och wann et weltwäit enger roueger Réckgang vun gastric Kriibs Heefegkeet ginn ass, gesait d'Expansioun an aller vun der Welt d'Populatioun eng Erhéijung vun der Zuel vun de Fäll, an trotz de leschten Entwécklungen am Diagnos a Behandlung, déi hätt vun gastric Kriibs Patienten bleift aarmséileg. Dëst schaaft eng 5-Joer Iwwerliewe Taux vun kee méi wéi 25%, an Europa [4]. Déi meescht gastric Kriibs Patienten hunn Krankheet op Diagnos fortgeschratt fir där déi eenzeg Optioun vun Kur op komplett chirurgesch Entfernung vun der entholl, mat breeder lymph Node dissection berout, datt duerch d'Verwaltung vun neoadjuvant oder adjuvant Chimiotherapie [5] kënnt kann. Déi wichtegst prognostic Faktor beaflossen Iwwerliewe souwéi Behandlung Tromp ass d'TNM Etapp. Mä, wat eng zousätzlech futti vun Komplexitéit vun der Observatiounsplaz dass Patienten mat der selwechter Stadium eng aner Krankheete Evolutioun oft weisen, ervirhiewt der heterogeneity vun gastric Kriibs [6]. Dëst deit drophin, datt eenzegaarteg Ausriichtung biologescher Eegeschafte vun dëse erhéijen vill hir aggressiv potentiellen Impakt kann. Dofir, et ass nach eng dréngend brauchen, fir zousätzlech prognostic biomarkers entdecken méi ze soe Resultat korrekt an, als Konsequenz, ze hëllefen besser informéiert Behandlung Décisioune mat Respekt ze Therapie maachen. Als erhéijen, datt generell behuelen an enger manner aggressiv Moud méi ënnerscheet ginn, gefouert mir d'Relevanz vun zwee dat lues, SOX2 an CDX2, fir der biologescher Behuele vun gastric Cancers. Dës lues sinn differentially laanscht d'Kette vun Evenementer ausgedréckt dass an gastric Kriibs Féierung a sinn enk mat gastric an intestinal dat assoziéiert, bzw. [7]. VerfÜgung CDX2 ass eng Daarm-spezifesch homeobox Transkriptiouns Faktor hir Funktioun garantéiert d'Entwécklung an Ënnerhalt vun intestinal dat am GUT an ectopic Siten, déi och an Déier Modeller gegrënnt gouf [8, 9]. Et ass allgemeng bekannt, datt CDX2 ass am mënschleche intestinal metaplasia vun de Mo a esophagus [10] ausgedréckt. Et huet dës och zu dysplasia ausgedréckt gin also seng Roll als uweist vun Werdegang vun der preneoplastic Etappe vun gastric carcinogenesis verstärkt [11]. VerfÜgung SOX2 engem Member vun der verstinn ass (SRY-Zesummenhang HMG Box) Famill vun Transkriptiouns Facteure , duerch eng héich conserved, eenzel Exon Gentherapie encoded. SOX2 spillt verschiddenste Rollen uechter Entwécklung an Zell dat, éischter de mammalian embryogenesis orchestrating [12], a spéider Contributioun zu der normaler morphogenesis an homeostasis vun der foregut-ofgeleet epithelia vun der esophagus, haett an trachea [13]. An Nesset SOX2 ass an enger Rei vu Stoffer, nämlech am squamous epithelium Doropshin der esophagus an der glandular epithelium vun de Mo. ausgedréckt. Et gouf zu Mais gewisen, datt Sox2 Ausdrock un all d'Zell lineages dréit normalerweis am Mo. fonnt, e wichtege Bäitrag fir gastric dat suggeréiert [14]. Zousätzlech, Manque Ausdrock vun SOX2 gouf zu erhéijen vum Gehir, Broscht, haett an esophagus [15-17] observéiert. Allerdéngs, an der gastric Kriibs Kontext, seng Roll bleift anerer Conclusioun komm a brauch weider Ännerung [18-20]. Ausserdeem, mat CDX2 System léisst bleift onerfuerschten. Eist Zil VerfÜgung war de Medeziner Relevanz vun SOX2 an CDX2 Ausdrock vun gastric Kriibs Biologie ze analyséieren. D'Resultater kritt weisen, datt hir Ausdrock an der Primärschoul erhéijen fir gastric Kriibs Patienten engem relevant prognostic Wäert huet. VerfÜgung Method VerfÜgung Mënscherechter Stoffer an DNA Echantillon VerfÜgung Zwee honnert an ee Fäll vun formalin-fix paraffin-Ënnerbewosstsinn (FFPE ) Echantillon vun Patienten mat Agrëff bei CENTRO Hospitalar S. João, Porto, Portugal tëscht 1988 an 2010 gastric adenocarcinoma waren amgaang studéiert. Fäll ausgewielt goufen, déi mat sinn paraffin-Ënnerbewosstsinn Material, clinicopathological a Suivi Daten aus der wirklech an Surgical Beräicher vun CENTRO Hospitalar S. João kritt. Vun deenen, siechzeg-siwen Echantillon waren als Otemschwieregkeeten microarray (TMA), mat 2 behaapten Placken vun all Prouf gëtt, aus der entholl a Ray Biobank vun der selwechter wirklech Pompjeeën. Klinescher Frankräich DNA (gDNA) kritt aus 62 Fäll op der TMA abegraff. gDNA war och aus FFPE Echantillon vun zwee normal gastric mucosas mat der Frankräich DNA Offäll Kit (Citomed, Lissabon, Portugal) ofgebaut, an den Kontrollen benotzt. All Echantillon vun der Biobank sech mat Awëllegung vun de Patienten kritt. D'Benotzung vun Retrospektiv Echantillon vun deem Awëllegung kann net ass fir Fuerschung Studie vun der portugisescher Gesetz autoriséiert kritt ginn. Dës Etude gouf vun der Ethik Comité vun CENTRO Hospitalar S. João guttgeheescht. VerfÜgung Immunohistochemistry VerfÜgung FFPE Otemschwieregkeeten Sektiounen mat 4 μm aus chirurgesch uplanzen an TMA ënnerworf goufen fir SOX2, CDX2, MUC5AC an MUC2, dëse Standard Méthodologie ze immunohistochemistry. Kuerz, no deparaffination an abordablel, antigen retrieval gouf zu engem IHC-Tek Epitope Retrieval kache Set (IHC World, Woodstock, MD, USA) gesuergt, fir 40 Minutten mat 10 mm citrate Prellbock, pH 6.0 (CDX2) oder 10 mm, pH 8.0 héich (SOX2). Desialylation war bei 37 ° C fir MUC2 erkennen, mat 0,1 U /ml vun Neuraminidase aus Clostridium perfringes VerfÜgung Typ VI (Fläch-Aldrich, St. Louis, MO, USA) vun Natrium acetate gefiermt pH 5.5 fir 2H gesuergt. Endogenous peroxidase war mat 3% Waasserstoff Hem zu methanol fir 10min gespaart. Incubation mat Primärschoul antibodies fir CDX2 (1:50 dilution, CDX2-88 Klon, Biogenex, San Ramon, CA, USA), MUC5AC (1:10 dilution, CLH2 Klon) an MUC2 (1:10 dilution, PMH1 Klon) war gesuergt Iwwernuechtung, bei 4 ° C. Sektiounen sech dann mat engem biotin-Label Kanéngchen anti-Maus Secondaire antibody, gefollegt vun der avidin /biotin-peroxidase erkennen System (Vectastain ABC Kit, Vecteure Laboratoiren, Burlingame, CA, USA) incubated. Fir SOX2 staining, incubation mat der Primärschoul antibody (1:50 dilution, SP76 Klon, Zell Marque, Rockling, CA, USA) war fir 1h op RT standing an erkennen war mat der Dako REAL ™ Stellt ™ Detektioun System Peroxidase /botzt gemaach + (DAKO, Glostrup, Dänemark) no der Taktik vum Produzent. Detektioun vum Ausdrock mat 3,3'-diaminobenzidine (botzt) (Fläch, St. Louis, MO, USA) Otemschwieregkeeten Rubriken huet counterstained mat Gill senger haematoxylin (Leica Microsystems, Amersham, verain, UK), léif, Souzesoen a schéi Leeschtung ass. Normal gastric mucosa war als positive Kontroll fir SOX2 an MUC5AC Ausdrock an normal colonic mucosa benotzt war wéi enger positiver Kontroll fir CDX2 an MUC2 Ausdrock gebraucht. Fäll goufen als positiv, wann méi wéi 5% vun den Zellen mat all antibody mat Konsens vun dräi Observateuren (VC; LD an RA) geschriwwen huet. VerfÜgung Fluorescence An Situ VerfÜgung Hybridization (FISH) VerfÜgung war FISH benotzt fir SOX2 VerfÜgung amplification Status vun 21 Echantillonen, mat engem 2-Faarf assay bewäerten ëmschriwwen vum Bass et al VerfÜgung [17]. A Studiebäihëllefe Rennsport nët 3q26.33 (BAC Klon CTD-2348H10) war benotzt SOX2 ze bestëmmen VerfÜgung Zuel Kopie a gouf mat enger Referenz Studiebäihëllefe hybridizing Verglach zu 3p22.3-3p22.2 (BAC Klon RP11-286G5), kaaft aus Invitrogen (Karlsbad CA, USA). D'Zil Studiebäihëllefe war mat digoxigenin (Déiren-11-UTP, Roche, Mannheim, Däitschland) an erwëscht mat enger Anti-digoxigenin-fluorescein antibody (Roche kinnt GMBH, Mannheim, Däitschland) an der Referenz Studiebäihëllefe war mat biotin (BioPrime® Label ausgezeechent DNA Etikette System, Invitrogen, Karlsbad CA, USA) a mat engem CY 3-Avidin antibody (Jackson Immunoresearch déngt, West Grove, USA) fonnt. VerfÜgung Véier μm drënner aus all Prouf gastric adenocarcinoma sech deparaffinised, rehydrated a fir 10 min an enger Pre-gehëtzter Léisung vun NaSCN 1 m op 80 ° C gesat. Echantillon waren mat 6mg /ml pepsin (Fläch-Aldrich, St. Louis, MO, USA) zu HCl 0.02N, pH 2 fir 30min bei 37 ° C verdaut. Studiebäihëllefe Mëschung zu 50% Dës villt Gedeessems an 2 × SSC war mat nuklear DNA bei 94 ° C fir 3min codenatured. Hybridisation war bei 37 ° C fir 30h duerchgefouert. Kären sech mat DAPI-Vectashield Opriichte Léisung (Vecteure, Burlingame, USA) counterstained. Fir all Fall, sech e Minimum vu 67 Zellen zu engem fluorescence microscope (König Z1 Axio) analyséiert a Biller huet mat enger 1000 × Vergréisserung Qualifikatiounen, e König Axio CAM MRM an der Axiovision Rel benotzt. 4,8 Software. D'Verhältnis tëschent der Zuel vun SOX2 an der Referenz Studiebäihëllefe Signaler war fir vunenee individuell berechent an der Moyenne vun der nennen war fir all Fall alles. Gene amplification war Betruecht kommen der Moyenne ≥2 war. VerfÜgung Copy Number Variant (CNV) Assays VerfÜgung D'CNV assay Leeschtung war mat engem spezifeschen TaqMan® Copy Number Assay (Obwuel Biosystems, Foster City, CA, USA) folgenden der Fabrikant d'Uweisungen. Kuerz, multiplex PCRs fir SOX2 VerfÜgung (Zil-) an Rnase P VerfÜgung (endogenous Kontroll) huet op eng Abi Prism7500 Fast Real-Zäit Hinnen alleguer System mat der Software v2.0 (Obwuel Biosystems, Foster City, CA, USA gesuergt ). Zwanzeg nanograms vun gDNA an engem Net-Skelett Kontroll huet an quadruplicate analyséiert. Normal gastric mucosa Echantillon waren als calibrators benotzt. Quantification vun der Gentherapie Kopie Zuel VerfÜgung SOX2 war mat der ΔΔCt Method an Daten Analys gemaach huet vun der CopyCaller Software v2.0 (Obwuel Biosystems, Foster City, CA, USA) gesuergt. Gene amplification war definéiert kommen der Gentherapie Kopie Zuel gouf 2-fantastesch grouss wéi déi vun der normal gastric mucosa. Fantastesch Erhéijung tëscht 1,5 an 2 war Kopie Zuel gewannen considéréiert. VerfÜgung statistique Analyse VerfÜgung Den Chi-Feld Test benotzt gouf d'Bedeitung vun Differenzen an clinicopathological Charakteristiken ganze Kategorien vun SOX2 an CDX2 Ausdrock, ausser mat Alter ze bewäerten, wou de Bedeitung vun Differenzen an heescht war mat der T VerfÜgung Azeton berechent. Patienten war allgemeng Iwwerliewe berechent der Kaplan-Meier Method an d'Bedeitung vun Differenzen tëscht Brutto Iwwerliewe Kéiren benotzt gouf vun der Läschlëscht-Platz Test getest. Cox proportional Risikoe Modell gouf benotzt univariate an multivariate iwwerschloen nennen ze berechnen. Paracetamol Suivi Zäit fir Eos Patienten huet 62 Méint. D'5- an 10-Joer Iwwerliewe Taux gouf ugeholl d'Liewen-Dësch Method benotzt. Differenzen sech als statistesch relevant kommen d'p VerfÜgung Wäerter waren &Si besteet; 0,05. Analysen benotzt SPSS Software v21.0 (Chicago, IL, USA) an StataLanguage v11 (College Station, Suerge, USA) gesuergt. VerfÜgung Resultater VerfÜgung SOX2 Ausdrock vun gastric carcinomas Clinicopathological Charakteristike vun de 201 gastric Kriibs VerfÜgung Fäll, wéi och d'Expressioun Profiler vun SOX2, CDX2, MUC2 an MUC5AC sinn an Table 1. Nuclear SOX2 Ausdrock zesummegefaasst war zu 52% (104/201) vun gastric carcinomas an den Ausdrock ass heterogen ënner an am erhéijen fonnt (dorënner 1A, B an C). Zu 13% (18/134) vun de Fäll SOX2 Ausdrock war héich um invasiv virun (Dorënner 1D an E) (dës Evaluatioun just zu Fäll Leeschtung war net an der TMA abegraff, wou dës Evaluatioun net méiglech war) .Table 1. Satz vun der clinicopathological Parameter vun gastric Kriibs laut den Ausdrock vun SOX2 an CDX2
SOX2
CDX2
Negativ
positiv VerfÜgung
Negativ
positiv

N
%
N
% VerfÜgung VerfÜgung p
N
%
N
%
p
Age, years1
Mëttler ± Fils VerfÜgung 65,8 ± 12,7 VerfÜgung 63,4 ± 13,5 VerfÜgung 0,2 VerfÜgung 64,1 ± 13,6 VerfÜgung 65,2 ± 12,6 VerfÜgung 0.6 VerfÜgung Paracetamol (Range) VerfÜgung 69 (34- 85) zu 66,5 (24-89) VerfÜgung 69 (24-89) VerfÜgung 67 (36-89) VerfÜgung Sex1 VerfÜgung Männlech VerfÜgung 52 VerfÜgung 41,9 VerfÜgung 72
58,1 VerfÜgung 0,02 VerfÜgung 75 VerfÜgung 60,5 VerfÜgung 49 VerfÜgung 39,5 VerfÜgung 0,1 VerfÜgung Weiblech VerfÜgung 45 VerfÜgung 58,4 VerfÜgung 32 VerfÜgung 41,6 VerfÜgung 38 VerfÜgung 49,4 VerfÜgung 39 VerfÜgung 50,6 VerfÜgung TNM stage2 VerfÜgung ech /II VerfÜgung 35 VerfÜgung 54,7 VerfÜgung 29 VerfÜgung 45,3 VerfÜgung 0,09 VerfÜgung 26
40,6 VerfÜgung 38 VerfÜgung 59,4 VerfÜgung 0,002 VerfÜgung III /IV VerfÜgung 59 VerfÜgung 44,7 VerfÜgung 73 VerfÜgung 55,3 VerfÜgung 83 VerfÜgung 62,9 VerfÜgung 49
37,1 VerfÜgung T stage3 VerfÜgung T1 /T2 VerfÜgung 22 VerfÜgung 62,9 VerfÜgung 13 VerfÜgung 37,1 VerfÜgung 0,03 VerfÜgung 13 VerfÜgung 37,1 VerfÜgung 22 VerfÜgung 62,9
0,007 VerfÜgung T3 /T4 VerfÜgung 75 VerfÜgung 45,5 VerfÜgung 90 VerfÜgung 54,5 VerfÜgung 99 VerfÜgung 60,0 VerfÜgung 66 VerfÜgung 40,0 VerfÜgung N stage1 VerfÜgung N0 VerfÜgung 28 VerfÜgung 62,2 VerfÜgung 17 VerfÜgung 37,8 VerfÜgung 0,03 VerfÜgung 20 VerfÜgung 44,4 VerfÜgung 25 VerfÜgung 55,6 VerfÜgung 0,07 VerfÜgung N + VerfÜgung 69
44,2 VerfÜgung 87 VerfÜgung 55,8 VerfÜgung 93 VerfÜgung 59,6 VerfÜgung 63 VerfÜgung 40,4 VerfÜgung Margins4 VerfÜgung R0 VerfÜgung 85 VerfÜgung 47,5 VerfÜgung 94 VerfÜgung 52,5 VerfÜgung 0,5 VerfÜgung 98 VerfÜgung 54,7 VerfÜgung 81 VerfÜgung 45,3 VerfÜgung 0,2 VerfÜgung R1 VerfÜgung 11 VerfÜgung 55,0 VerfÜgung 9 VerfÜgung 45,0 VerfÜgung 14
70,0 VerfÜgung 6 VerfÜgung 30,0 VerfÜgung wiere invasion4 VerfÜgung Negativ VerfÜgung 39 VerfÜgung 55,7 VerfÜgung 31 VerfÜgung 44,3 VerfÜgung 0,1 VerfÜgung 37 VerfÜgung 52,9 VerfÜgung 33 VerfÜgung 47,1 VerfÜgung 0,5 VerfÜgung positiv VerfÜgung 57 VerfÜgung 44,2 VerfÜgung 72 VerfÜgung 55,8 VerfÜgung 75 VerfÜgung 58,1 VerfÜgung 54 VerfÜgung 41,9 VerfÜgung Láuren5
Intestinal VerfÜgung 44 VerfÜgung 49,4 VerfÜgung 45 VerfÜgung 50,6 VerfÜgung 0,9 VerfÜgung 45 VerfÜgung 50,6 VerfÜgung 44 VerfÜgung 49,4 VerfÜgung 0.3 VerfÜgung Firwat VerfÜgung 20 VerfÜgung 48,8 VerfÜgung 21 VerfÜgung 51,2 VerfÜgung 26 VerfÜgung 63,4 VerfÜgung 15 VerfÜgung 36,6 VerfÜgung Klass VerfÜgung 31 VerfÜgung 46,3 VerfÜgung 36 VerfÜgung 53,7
40 VerfÜgung 59,7 VerfÜgung 27 VerfÜgung 40,3 VerfÜgung Ming6 VerfÜgung vill VerfÜgung 32 VerfÜgung 53,3 VerfÜgung 28 VerfÜgung 46,7 VerfÜgung 0,5 VerfÜgung 28 VerfÜgung 46,7 zu ​​32 VerfÜgung 53,3 VerfÜgung 0,1 VerfÜgung Infiltrative VerfÜgung 60 VerfÜgung 45,8 VerfÜgung 71 VerfÜgung 54,2 VerfÜgung 81 VerfÜgung 61,8 VerfÜgung 50 VerfÜgung 38,2
Klass VerfÜgung 2 VerfÜgung 66,7 VerfÜgung 1 VerfÜgung 33,3 VerfÜgung 1 VerfÜgung 33,3 VerfÜgung 2 VerfÜgung 66,7 VerfÜgung SOX21 VerfÜgung Negativ VerfÜgung 58 VerfÜgung 59,8 zu 39 VerfÜgung 40,2 VerfÜgung 0.3 VerfÜgung positiv VerfÜgung 55 VerfÜgung 52,9 VerfÜgung 49 VerfÜgung 47,1 VerfÜgung CDX21 VerfÜgung Negativ VerfÜgung 58 VerfÜgung 51,3
55 VerfÜgung 48,7 VerfÜgung 0.3 VerfÜgung positiv VerfÜgung 39 VerfÜgung 44,3 VerfÜgung 49 VerfÜgung 55,7 VerfÜgung MUC5AC1 VerfÜgung Negativ VerfÜgung 39 VerfÜgung 44,8 VerfÜgung 48 VerfÜgung 55,2 VerfÜgung 0,4 VerfÜgung 42 VerfÜgung 48,3 VerfÜgung 45 VerfÜgung 51,7 VerfÜgung 0,05 VerfÜgung positiv VerfÜgung 58 VerfÜgung 51,3 VerfÜgung 55 VerfÜgung 48,7
70 VerfÜgung 61,9 VerfÜgung 43 VerfÜgung 38,1 VerfÜgung MUC21 VerfÜgung Negativ VerfÜgung 69 VerfÜgung 48,6 VerfÜgung 73 VerfÜgung 51,4 VerfÜgung 0,9 VerfÜgung 84 VerfÜgung 52,2 zu 58 VerfÜgung 40,8 VerfÜgung 0,1 VerfÜgung positiv VerfÜgung 27 VerfÜgung 48,2 VerfÜgung 29 VerfÜgung 51,8 VerfÜgung 26 VerfÜgung 46,4 VerfÜgung 30 VerfÜgung 53,6
1N = 201; 2N = 196; 3N = 200; 4N = 199; 5N = 197; 6N = 194. VerfÜgung Dorënner 1 SOX2 FAQ Ausdrock vun gastric carcinomas, vun immunohistochemistry fonnt. (A) Heterogeneity vun SOX2 Ausdrock vun gastric erhéijen. An der selwechter entholl Echantillonen, Beräicher mat héije Niveau vun SOX2 observéiert ginn (B) an direkter Noperschaft zu Beräicher mat manner Ausdrock Niveau vun SOX2 (C). (D, E) SOX2 Ausdrock um invasiv virun erhéijen. VerfÜgung Next, évaluéieren mir ob SOX2 Ausdrock mat clinicopathological Charakteristike vun de Fäll soll. Dës Analyse Teamchef SOX2 Ausdrock vill mat männlecht Geschlecht (p VerfÜgung = 0.02) verbonne war, mat héijer T Etapp (p VerfÜgung = 0,03) an der Präsenz vun regional lymph Node Investitiounen (N Etapp) (p VerfÜgung = 0,03). Wéinst clinicopathological Parameteren, déi Alter abegraff, TNM Etapp, entholl Minnen um resection Rand (R Kategorie), wiere Invasioun, Lauren Klassifikatioun an Ming Klassifikatioun sech net vill mat SOX2 Ausdrock (Table 1) assoziéiert. VerfÜgung Zanter SOX2 mat verbonnen ass gastric dat [14] mir studéiert ob dat zu Kriibs haten war, mat MUC5AC als gastric Bissau. Allerdéngs war kee Veräin tëscht SOX2 an MUC5AC Ausdrock fonnt. Anerersäits, war kee ëmgedréint association tëscht SOX2 an CDX2 /MUC2 (benotzt als lues vun intestinal dat) fonnt. Vun Note, war CDX2 Ausdrock vill mat engem nidderegen TNM Etapp (p VerfÜgung = 0.002) an mat engem nidderegen T Etapp (p VerfÜgung = 0.007) assoziéiert. Ausserdeem, wann och net statistesch relevant, war et eng Trend zu engem ëmgedréit, et gesäit Relatioun tëscht CDX2 an MUC5AC (p = VerfÜgung 0,05). Traureg Analyse VerfÜgung De 5-Joer globale Iwwerliewe VerfÜgung, baséiert op de Suivi vun 199 Patienten, war 35% (Zousätzleche Fichier 1: Dorënner S1). Mir observéiert nächst datt SOX2 Ausdrock vun der erhéijen verbonne war, an univariate Analyse, mat engem globale aarmen Iwwerliewe (p VerfÜgung = 0.02), d'Patienten an zwee prognostic Gruppen stratifying (Dorënner 2A), mat engem 5-Joer Iwwerliewe vun 45 % fir Patiente mat SOX2- erhéijen versus 26% fir Patiente mat SOX2 + erhéijen. Am Géigendeel, CDX2 Ausdrock mat engem globale verbessert Iwwerliewe assoziéiert, och wann d'Differenz net Bedeitung erreecht huet (Donnéeën net gewisen). Figur 2 Kaplan-Meier Kéiren d'Wahrscheinlechkeet vum globale Iwwerliewe fir Patiente mat gastric Kriibs laut SOX2 Ausdrock (A) weist an no der molekulare SOX2 phenotypes - /CDX2 + an SOX2 + /CDX2 - (B). VerfÜgung Baséierend op der Associatioun vun SOX2 an CDX2 mat verschlechtert a besser Iwwerliewe wéi och méi oder manner aggressiv clinicopathological Fonctiounen, respektiv, mir weider Patienten Resultat studéiert no der molekulare vun béiden Proteinen definéiert phenotypes. Véier Gruppe vu Patienten definéiert ginn (Zousätzleche Fichier 1: Dorënner S2) vun deenen déi ee mat de beschte Iwwerliewe negativ haten erhéijen fir SOX2 a positiv fir CDX2 (SOX2- /CDX2 +), wobäi d'Iwwerliewe vun de niddregsten an Patienten war ausser erhéijen mat der Réckproduktioun Profil, positiv fir SOX2 an negativ fir CDX2 (SOX2 + /CDX2-) (p VerfÜgung = 0.01) (Zousätzleche Fichier 1: Dorënner S2 an Dorënner 2B). Déi Fäll mat Ausdrock vu béiden SOX2 an CDX2 oder ouni Ausdrock vun entweder Bewaacher Schatzkummer engem ähnlechen a Tëscherapport Iwwerliewe (Zousätzleche Fichier 1: Dorënner S2). D'SOX2- /CDX2 + an SOX2 + /CDX2- molekulare phenotypes, am Verglach mat SOX2 eleng, virauszesoen ähnlecht Iwwerliewe Tariffer am 5-Joer (49% géint 26% an 45% géint 26%, respektiv). der virausgesot 10-Joer Iwwerliewe Taux eleng op SOX2 Ausdrock baséiert awer, ass 34% (SOX2-) vs 22% (SOX2 +) hierkommen, déi SOX2 /CDX2 molekulare phenotypes benotzt, et vs 14% 41% (SOX2- /CDX2 +) gëtt (SOX2 + /CDX2-). VerfÜgung Mir lant weider de Impakt vun Patienten Iwwerliewe vun de molekulare vun SOX2 + definéiert phenotypes vs SOX2-, CDX2 + vs CDX2- an SOX2- /CDX2 + versus SOX2 + /CDX2- stratified no clinicopathological Parameteren. entweder no SOX2 oder CDX2 Status eleng Kriseperiod bedeitendst prognostic Ennerscheeder fir de fréieren, an e puer vun de Punkten (intestinal- an Ausbau-Typ erhéijen) an keng Ennerscheeder fir CDX2 eleng (Zousätzleche Fichier 1 an dësem Fall, Survival plotting: Sauerdall S3 an S4). Table S1: Resultater aus Cox proportional Modell gi vun Weider Fichier 1 presentéiert. Eemol méi, d'Benotze vun den Ausdrock vun SOX2 an CDX2 raffinéiert der viregter Resultater (Dorënner 3). SOX2 + /CDX2 - Profil virausgesot eng wiesentlech méi aarmen Resultat vun Patienten mat intestinal (p VerfÜgung = 0.005) an den Ausbau (p VerfÜgung = 0.002) erhéijen, mat iwwerschloen nennen vun 3,18 an 4,84, bzw. déi a vun ouni Zeeche vu Schwächt Invasioun, (p VerfÜgung = 0.009), iwwerschloen Verhältnis vun 3,84 presentéieren. Obwuel geséchert Net-relevant, engem ähnlechen Trend war an Patienten ouni lymph Node Investitiounen (p VerfÜgung = 0.08) (Well 3) observéiert. Hazard nennen an 95% Vertraue Intervalle fir all Gruppen am Detail zu Table 2 virgestallt a bleiwen bedeitendst no zu enger multivariate Analyse vum Alter a Geschlecht ugepasst. Figur 3 Kaplan-Meier Kéiren d'Wahrscheinlechkeet vum globale Iwwerliewe fir Patiente mat gastric Kriibs no der molekulare phenotypes SOX2 iwwerdriwwener - /CDX2 + an SOX2 + /CDX2 - stratified no clinicopathological Parameteren: Lauren Klassifikatioun (A), Ming Klassifikatioun (B) , eng Schwächt Invasioun (C) an lymph Node Investitiounen (d). VerfÜgung Table 2 Cox proportional Risikoe Models vun Iwwerliewe wéi eng Funktioun vun der molekulare phenotypes (SOX2 + /CDX2- vs SOX2- /CDX2 +) fir all clinicopathological Parameter VerfÜgung Parameter
Hazard Verhältnis (95% CI)

ofgeblennte
P
Adjusteda
P

Allgemeng VerfÜgung 1.95 (1.15-3.31) VerfÜgung 0,01 VerfÜgung 1.90 (1.10-3.28) VerfÜgung 0,02 VerfÜgung Lauren Klassifikatioun VerfÜgung Intestinal-Typ VerfÜgung 3.18 (1.33-7.58)
0,009 VerfÜgung 2.93 (1.21-7.10) VerfÜgung 0,02 VerfÜgung Firwat-Typ VerfÜgung 1,35 (0.35-5.17) VerfÜgung 0,7 VerfÜgung Klass VerfÜgung 1.34 (0.60-3.02)
0,5 VerfÜgung Ming Klassifikatioun VerfÜgung Erweiderung VerfÜgung 4,84 (1.64-14.29) VerfÜgung 0,004 VerfÜgung 4,53 (1.29-15.85) VerfÜgung 0,02 VerfÜgung Infiltrative VerfÜgung 1,13 (0.60-2.13) VerfÜgung 0,7 VerfÜgung wiere Invasioun VerfÜgung Negativ VerfÜgung 3,84 (1.30-11.35) VerfÜgung 0,02 VerfÜgung 3,82 (1.29-11.40) VerfÜgung 0,02 VerfÜgung positiv VerfÜgung 1.10 (0.60- 2.02) VerfÜgung 0,8 VerfÜgung N Etapp VerfÜgung N0 VerfÜgung 2,96 (0.82-10.65) VerfÜgung 0,1 VerfÜgung 3,98 (0.72-21.83) VerfÜgung 0,1 VerfÜgung N + VerfÜgung 1.29 ( 0.72-2.30) VerfÜgung 0,4 VerfÜgung Ofkierzung: CI VerfÜgung Vertrauen nolauschterer eng ugepassten fir Alter a Geschlecht (Multivariate Analyse mat de Cox Réckgang Modell VerfÜgung) VerfÜgung SOX2 amplification VerfÜgung datt Gentherapie Betruecht.. amplification entholl-spezifesch Evenement während malignant Transformatioun ass, an dass SOX2 nët ass zu dësem Verfall vun anere erhéijen ënnerworf, an zwar vun der haett an esophagus [17], Hypothes mir dass SOX2 amplification hiren Ausdrock an heterogeneity erkläre kéint, souwuel bannen an ënnert gastric erhéijen. Ennerstetze Hypothesen, enger Ëmfro op d'Oncomine Datebank gesuergt huet, datt SOX2 mat Kopie Zuel hëlt ënnert d'Top 10% Genen gesaten zu gastric Kriibs (Zousätzleche Fichier 1: Dorënner S5). VerfÜgung Baséierend op immunohistochemistry Donnéeën, mir ausgewielt 14 Fäll mat SOX2 Ausdrock a 7 negativ Fäll vun 2-Faarf FISH assay ze analyséieren. Mir gesinn, datt SOX2 zu 14% Implikatioune war (2/14) vun de Fäll mat Ausdrock an keent vun de Fäll ouni Ausdrock (0/7). E Vertrieder positive Fall souwuel fir SOX2 Ausdrock an amplification zu Dorënner 4A a B. E Fall mat SOX2 Ausdrock gewise gëtt awer kee amplification ass zu Dorënner 4C an D. vergiessen, d'FISH Analyse huet d'Präsenz vun engem héije Mooss vun Kopie Zuel gewannen dës an heterogeneity bannent erhéijen, observéiert net nëmme mat der Zil- Studiebäihëllefe fir SOX2 VerfÜgung nët mee och mat der Referenz Studiebäihëllefe, läit un der 3p Aarm (Zousätzleche Fichier 1: Dorënner S6). Figur 4 Gastric Kriibs Fäll mat SOX2 FAQ Ausdrock (A an C) mat oder ouni SOX2 amplification (B an D, bzw.) presentéieren kënnt vun FISH alles. Green Fortgeschratten Ämter SOX2 VerfÜgung Zil- hierkommen roude Knäppchen Ämter 3p Aarm geschoss. Käre Kierchefënster mat DAPI (blo). (E) siechzeg-zwee gDNA gastric Kriibs Echantillon waren fir SOX2 Kopie Zuel Status évaluéieren an am Verglach zu normalen gastric mucosa (calibrator). (F) SOX2 Kopie Zuel war vill mat FAQ Ausdrock assoziéiert, sech duerch IHC (p VerfÜgung &Si besteet; 0,05). VerfÜgung Fir d'Frequenz vun SOX2 klären VerfÜgung nët Kopie Zuel hire Restaurant zu gastric Kriibs, mir eng Kopie gesuergt -number Hinnen alleguer mat gDNA aus 62 gastric Kriibs Fäll, eng RNAse P VerfÜgung Studiebäihëllefe mat Sëtz zu chromosome 14 als Referenz. D'Majoritéit vun de Echantillon (93%) presentéiert e puer Zorte vun SOX2 VerfÜgung Zuel Variant kopéieren, rangéiert vun 3 bis 9 Exemplairen (Dorënner 4E). Eng bedeitend positive association tëscht Kopie Zuel Mosconi an SOX2 Ausdrock (p VerfÜgung &Si besteet; 0,05). Observéiert (Dorënner 4F) VerfÜgung Diskussioun VerfÜgung Gastric Kriibs ass eng Krankheet mat Multiple Resultater datt net eleng virausgesot ginn duerch clinicopathological Fonctiounen [6]. Demno, d'Identifikatioun vun molekulare biomarkers datt weider Resultat stratification a Behandlung Decisiounen erlaben kann ass vu kritescher Bedeitung. VerfÜgung An dëser Etude mir den Ausdrock vun der Transkriptiouns Faktor SOX2 zu gastric Kriibs charakteriséiert an Zesummenhang mat clinicopathological Fonctiounen an dat lues nämlech MUC5AC (gastric Bissau) an CDX2 an MUC2 (intestinal lues). Dëst Nerve der Identifikatioun vun zwou verschiddene prognostic Gruppen, baséiert op SOX2 Ausdrock, dee weider vun Berécksichtegung vun de kombinéiert Ausdrock mat CDX2 raffinéiert ginn hätt. Endlech, Roll mir de heterogeneity vun SOX2 VerfÜgung nët an chromosome 3 Kopie Zuel vun gastric Kriibs, eng Associatioun tëscht fräi Kopie Zuel an SOX2 FAQ Ausdrock Musiktherapie-. VerfÜgung A Schlëssel Opklärung vun dëser Etude war d'Observatioun, datt SOX2 Ausdrock eleng, a weider duerch d'Kombinatioun mat CDX2 raffinéiert, erlaabt der stratification vun Patienten an subgroups mat vill verschidde Krankheete Resultater. Ausserdeem, wann mir dësen molekulare Profiler mat clinicopathological Donnéeën kombinéiert, ass et evident, datt d'SOX2 + /CDX2 - Profil mat engem aarmen hätt assoziéiert, bannent subsets vun erhéijen, datt e besser hätt am Allgemengen hunn: intestinal-Typ expandéiert-Typ a mat keng Unzeeche vu Schwächt Invasioun [21, 22]. Obwuel keng statistesch relevant, war d'selwecht Tendenz fir erhéijen observéiert presentéieren ouni lymph Node Investitiounen. Dës molekulare Profiler weg enger anerer biologescher Behuele vun der entholl meescht wahrscheinlech wéinst Krankheet Werdegang oder Behandlung Resistenz a kënnen benotzt gin méi effikass Therapie ze dinn oder Suivi horaire. VerfÜgung kann, wéi lymph Node Metastasen eent vun den Haapt Risiko ass Facteure fir Terrain gastric Kriibs, nodeems en R0 Agrëff, all Patienten lymph Node Investitiounen Fotoe kréien adjuvant Therapie [23]. Allerdéngs, weisen eis Resultater dass Patienten ouni dës Risk Faktor, an domat net behandelt, e Contreras schlecht Resultat dobäi wann de entholl mat engem SOX2 Kaddoen + /CDX2 - molekulare Profil. Dëst Ënnerbreet der Hypothes, datt bannent N0 erhéijen, Kranken an dëser molekulare Ënnergrupp vun adjuvant Therapie wahrscheinlech Virdeel wier. Trotzdem, verlaangen dësen Observatioune Confirmatioun am groussen cohorts an et wier och ganz praktesch sinn Medeziner Informatiounen iwwert Patient Behandlung ze erhéichen. VerfÜgung SOX2 schielt och als potentiell Zil fir Roman therapeutesch Interventiounen. Obwuel Transkriptiouns Faktoren Drogenofhängeger Ziler net klassesch sinn, méi no ze SOX2-geziilte Therapie sinn schon am Broscht Kriibs Déclaratioun ass.

• Glutathione S-transferase Gentherapie GSTM1, Gentherapie-Gentherapie Interaktioun, an gastric Kriibs waat: Beweiser aus enger aktualiséiert meta-Analyse
• A Hauch vun frësch Loft: eng Qualitéit-Verbesserung Etude eng Loft-libre Technik versus konventionell Technik vergläichen nasogastric Rouer Viagra ze verhënneren