Karakteristike Epstein-Barrov virus varijante povezane s želučanog karcinoma in Southern Tunisia

Karakteristike Epstein-Barrov virus varijante povezane s želučanog karcinoma u južnom Tunisu
apstraktne pregled backgroud pregled EBV-povezan karcinom želuca (EBVaGC) ima različitih kliničkih obilježja a njegova učestalost je promjenjiva u svijetu. pregled Rezultati
Kako utvrditi prevalenciju EBVaGC u Tunisu, mali RNA (Eber) izraz EBV-kodiran je procijenjena u 81 želučanog karcinoma (GC) primjeraka. Izraz nuklearna Eber je otkriven u 12 od 81 GC slučajeva (14,81%) i podudarnost između rezultata rasponu Eber bojenje i broju EBV DNK kopija što je procjena od strane qPCR primjećeno. S druge strane, otkrili smo da EBVaGC čvrsto povezan s dobi kod dijagnoze, te slabo sa tumora diferencijacije i venska invaziju.
Nadalje, EBVaGC uzorci su podvrgnuti odrediti EBV DNA polimorfizama. Naši rezultati pokazuju jedinstvenu genetski profil sojeva EBV u vezi tipa A i D, F prototip, zadržavanje Xho pregled, ja restrikcije i 30 bp del-LMP1 varijanta. Prema našim ranijim studijama nazofarinksa karcinom (NPC), predložili smo da EBV sojevi vezane uz GC i NPC dijeli neke sličnosti u tuniskih pacijenata. Pregled Zaključak
Prevalencija EBVaGC je 14,81% u južnom Tunisu i da zajednička EBV soj povezani su s obje NPC i GC koji su vjerojatno da će se razlikovati od azijskih vrsta. Naši rezultati stoga podržavaju određenu geografsku raspodjelu naprezanja EBV koja nije ograničena na EBV-povezana malignih bolesti. Pregled Ključne riječi pregled, karcinom želuca EBV Eber polimorfizama Pozadina pregled, karcinom želuca (GC) je drugi vodeći uzrok smrti od raka svijetu [1]. Incidencija GC varira od jedne geografske regije u drugu, što ukazuje da su genetski i okolišni čimbenici, uključujući Helicobacter pylori pregled infekcije smatra da doprinese želučane karcinogeneze [2, 3]. U južnom Tunisu, godišnja incidencija GC varira od 2.6 do 4.8 /100 000 osoba. [4] U nekoliko posljednjih godina, brojni izvještaji istraživali povezanost između Epstein-Barrov virus (EBV) infekcije i GC [5-9]. EBV-povezana GC (EBVaGC) je dokazano prisustvo jedinstvene ekspresije EBV-kodirani male RNA (Eber) u GC stanicama [10], otkrivanje monoklonskih EBV episomi u GC stanicama [11] i povećanjem seruma antitijela protiv virusnog kapsidni [12]. Incidencija EBVaGC varira od 2 do 18%, kao što je izvijestio prethodnih studija [13-20]. Osim toga, klinička obilježja EBVaGC su muška prevlast, relativno mlađu dob i položaj u proksimalnom želucu [9, 21]. EBVaGC pokazuje nižu stopu uključenosti limfnih čvorova i ima relativno povoljnu prognozu u odnosu na EBV-negativne jednom [22].
U EBVaGC, infekcija tumorskih stanica karakterizira tipa I uzorak latencije, u kojem izraz virusnih latentnih gena je ograničena na Epstein-Barr nuklearnog antigena (eBNA) -1, Eber, latentna membranski protein LMP-2A i transkripti iz Bam pregled HI u desno okvir (BARF) -0 i -1 [11, 23]. Budući EBV proizvode tipa I latentne infekcije su pokazali da su uključene u EBV posredovanu tumorogenesis, predloženo je da se proces onkogeni EBVaGC može da vodi različitim mehanizmima od onih konvencionalnog GC. Nakon toga, EBVaGC zloćudni tumor može se smatrati drugi entitet među GC što zahtijeva veću pozornost na poboljšanje skrbi o pacijentima.
Ova studija je provedena s ciljem da se utvrdi učestalost EBVaGC u južnom Tunisu i potom analizirati specifične EBV polimorfizama u tumor izolata.
materijal i metode
karakteristike pacijentove
ukupno 81. primarnih želučanog karcinoma su prikupljeni, u razdoblju od siječnja 1999. do prosinca 2009. godine, od pacijenata koji su se podvrgnuli radikalne kirurške resekcije na Odjel probavnih kirurgiju Habib Bourguiba Klinička bolnica (Sfax, Tunis). Svi pacijenti dali pristanak prije Prikupljanje uzoraka prema institucionalnim smjernicama. Niti jedan od bolesnika imalo je prethodno operativno ili postoperativne kemoterapije. Kliničko patološke parametre, kao što su spol, dob, anatomske stranice, histološkog tipa, patološkog stadiju, veličini tumora i venske invazije su ocijenjeni pregledom medicinske tablice i patološke zapisa. U vrijeme operacije, starost bolesnika kretala se u rasponu od 18 do 94 godina (srednja vrijednost: 59.58 godina). Anatomska mjesto tumora je određen u skladu s dominantnim mjesto lezije kao kardija (n = 8), tijelo (n = 22.), i antruma (n = 48). Histološki podtipovi su klasificirane prema kriterijima Lauren [24] što je crijevna tipa (n = 47) i difuzni tip (n = 34), ali i od Svjetske zdravstvene organizacije kao što je slabo diferencirani (n = 43), umjereno diferencirani (n = 26) i dobro diferencirani (n = 9). Klinički stadij bolesti određen je prema tumora, čvor i metastaze (TNM) klasifikaciji Zajedničkog odbora američke protiv raka [25]. Naš kohorta sadrži 9 bolesnika s pozornice I ili II i 47 bolesnika u stadiju III ili IV.
In-situ hibridizacije pregled EBV se prepoznati po izrazu EBV-kodiran male RNA (Eber). Ukratko, u situ hibridizacije pregled (ish) Test je izveden na 3 um parafinski blok sekcija s EBV oligonukleotidnih sondi koje su komplementarne prema Eber-1 i -2, prema uputama proizvođača (PNA otkrivanje ISH kit, Dako Cytomation). U hibridizacije signale se vizualizira s diaminobenzidin (DAB) i pozitivnog nuklearnog signal je bio prepoznat kao tamno smeđe nuklearnog mrlja pod svjetlosnim mikroskopom. Kao pozitivna kontrola, korišten je sekcija iz poznatog Eber pozitivne NPC tkiva. Bojenje ocijenjen je od 1 do 3 prema postotku obojenog stanica nukleusa u presjecima tkiva. Ocjena 3 se pripisuje odnosno dok se pozitivni signal u više od 75%, rezultat 2 u 75 do 50% i rezultat 1 u manje od 50% stanica. Vađenje pregled DNA pregled DNA je izvađen iz formalinom fiksna, parafin ugrađene tkiva. Nakon identifikacije tumora na hematoksilinom-eozinom umrljan slajdova, tumorskih područja su kopirani od 40 um debele parafinskim rezovima. Prikupljeni su de-voskom pranjem u ksilena i ispiru u etanolu. Osušene tkiva su razgrađeno je s proteinazom K, u prisutnosti SDS pri 55 ° C preko noći, nakon čega slijedi ekstrakcija fenol /kloroform kao što je prethodno opisano [26]. Količina DNA je provjeren spektrofotometrijski i pohranjeni na -20 ° C za daljnju upotrebu.
PCR- RFLP i sekvenciranje pregled pet regije EBV genoma meta polimorfizma analiza pomoću PCR RFLP ili slijed. U polimorfizama proučavali obuhvatiti tip A ili B u genu EBNA-3C, C odnosno tip D u BamHI-W1 /I1 regiji, prototip F ili F varijantu u BamHI-F regiji, gubitak jednog Xhol
i mjesto u prvom eksona BNLF1gene (Xho i-
gubitak varijanti) i 30 brisanje bp u trećeg egzona isti gen (30 bp del-LMP1 varijanta). Genotipiziranje je provedeno na DNA iz GC pacijenata EBV-pozitivnih i, kao kontrola, analiziramo 10 uzoraka DNA od nazofarinksa sluznicu pozitivni EBV, pregled PCR amplifikacija je provedena na 200 ng DNA u konačne reakcijske smjese od 50 ul, koji sadrži 0.2 uM svakog primera, 200 uM dNTP, 2 mM MgCl2, 1 x PCR pufer i 1 jedinica Taq DNA polimeraze (Fermantas). Sekvencijama i veličina PCR proizvoda prikazani su u tablici 1.Table 1. Sažetak sekvencijama obuhvaća vrste EBV i varijante pregled EBV gena i regije
(vrste ili varijante )
sekvencijama (5'-3 ')
veličine proizvoda (bp)
EBNA-3C gen pregled (tip A ili b) pregled F : AGAAGGGGAGCGTGTGTTGT pregled R: GGCTCGTTTTTGACGTCGGC pregled, PCR produkti pregled 153: tip A pregled 246: Vrsta B pregled BamH1-W područje
(tipa C ili D)
F: ACCTGCTACTCTTCGGAAAC
R: TCTGTCACAACCTCACTGTC pregled PCR + Bam
HI probava pregled 205: tip C pregled 130 + 75: tip D pregled regije Netlogu BamH1-f (f varijanta) pregled f: TCCCACCTGTTACCACATTC pregled, R: GGCAATGGGACGTCTTGTAA pregled PCR + Bam pregled HI probava pregled 198: F varijanta pregled 127 + 71: f varijanta pregled Egzon 1 BNLF1 gena Netlogu (Xhol varijanta)
f: ACAATGCCTGTCCGTGCA pregled, R: AGAAACACGCGTTACTCT pregled PCR + Xhol pregled sam probavu pregled 497: Xhol pregled I- pregled 340 + 157: Xhol pregled I + pregled eksona 3 od BNLF1 gen pregled (30bpdel-LMP1) pregled F: TGGAGGGAGAGTCAGTCAGGC pregled, R: ATTGACGGAAGAGGTTGAAAAC pregled PCR proizvoda pregled 224: 30bpdel-LMP1 pregled 254: mas-LMP1 pregled F: Naprijed primer
R: Obrnuti primer pregled C /D i F /f tipkanje temelji se na BamHI pregled probavu svake PCR produkta. Enzimatskih reakcije su izvedene u konačnom volumenu od 20 ul koji sadrži 10 ul PCR proizvoda, 1X pufera za digestiju i 10 jedinica BamHI pregled enzima (Fermantas). Nakon inkubacije tijekom noći pri 37 ° C, produkti su analizirani na 2% -tnom agaroznom gelu i vizualizirano bojenjem pomoću etidijeva bromida, pod UV osvjetljenjem. Isti uvjeti gore opisani procjenjuje identificirati Xhol pregled položaj u prvoj eksona BNLF1gene. DNA iz B95.8 (GenBank pristupni No.V01555) i stanične linije C666-1 (GenBank pristupni br ABV54173) su korišteni kao kontrola za tipove EBV i varijanti. Stanična linija C666-1 izvedena iz kineskog NPC koji luka tipove A /c, varijanta, Xhol pregled I-gubitka varijante i 30 bp del-LMP1 varijanti. Pregled DNA sekvenciranje je izvedena na pročišćenih PCR proizvoda treća eksona BNLF1 gena pomoću SV gel Purification kit (Promega). Ciklusa sekvenciranja su provedena pomoću ABI PRISM Dye Terminator Big Cycle Sequencing Kit (Applied Biosystems) u skladu s uputama proizvođača. Sve sekvencije su izvedene dvosmjerno. Rezultati sekvenciranja su potom uspoređeni s EBV sekvenci B95.8 (GenBank pristupni No.V01555), kineski NPC (CaO stanica [27], C666-1 stanica (GenBank pristupni br ABV54173) i NPC10 biopsije [28] i tuniskih NPC primjerci (CV4, CV5 i CV6 [29]). pregled, u stvarnom vremenu kvantitativni PCR pregled Q-PCR ciljanje BamHI-W regiju EBV genoma je provedeno na 12 EBV-pozitivnih uzoraka prikazuju nuklearne bojenje i 6 EBV negativne primjerci. Reakcije su bile izvedene na iCycler iQ ™ realnom vremenu PCR sustavu (BioRad), pomoću klica koje omeđuju mjesto BamHI-W regiju EBV genoma i TaqMan probe kao što je opisano [30]. alikvot 1 ug DNA je korištena za pojačanje u ukupnom reakcijskom volumenu od 25 ul, koji sadrži 300 nM svakog primera, 25 nM TaqMan sonde, 1X PCR pufer, 2mM MgCl2, 200 uM svakog dNTP i 1 jedinice GoTaq hot start polimeraze (Promega). standardna krivulja se pripravi upotrebom serijske 10-struko razrjeđenje rekombinantnog plazmida pGEMT /BamHI-W. Uzorci su u duplikatu, a rezultati u prosjeku za izračun EBV viremija izraženu u primjeraka po reakciji.
Statistička analiza pregled Statistička analiza je provedena pomoću SPSS 13.0 statističkog softverskog programa za Windows (SPSS Inc., Chicago, Illinois, USA ). P-vrijednost manja od 0,05 smatrala se statistički značajno. Pregled Rezultati
Prevalencija EBVaGC i povezanosti s kliničko-patološka obilježja pregled osamdeset jedan primjerci GC su testirani na EBV pozitivnost pomoću Eber in situ
hibridizacija. Učestalost EBVaGC 14,8% (12 od 81), u kojem Eber pozitivni signal bio je ograničen na jezgrama stanica karcinoma (Slika 1). U EBVaGC primjerci imaju varijabilnu postotak obojenih stanica tumora pokazuje više od 75% u šest slučajeva (rezultat 3), između 50 i 75% u tri slučaja, a manje od 50% u tri preostala slučaja. U EBVaGC slučajevi bili su povezani s dobi u vrijeme postavljanja dijagnoze (P = 0,009 pregled, tablica 2). Doista, 9 od 12 bolesnika s EBVaGC su bili u dobi između 45 do 60 godina. Osim toga, trend udruživanja uočen s tumora diferencijacije i venska invazije kao statički značajna vrijednost nije postignuta (P
= 0,07 i P = pregled 0,09 odnosno, tablica 2). Slika 1 Detekcija Epstein-Barr virus kodirane malih RNA (Ebers) in situ hibridizacije u želučanom tkivu karcinoma. A: H &E bojanja. B: Intenzivna Eber pozitivno bojanje (imuno-ocjena 3+) u jezgrama stanica tumora (izvorno povećanje × 40). C: Umjereno Eber pozitivno bojanje (imuno-score 2+) u jezgrama tumorskih stanica (izvorno povećanje × 40). D: Slab Eber pozitivno bojanje (imuno-score 1+) u jezgrama stanica tumora (izvorno povećanje × 40). E: Pozitivna kontrola koju zastupa poznati Eber-pozitivne NPC tkiva (izvorno povećanje × 40). F: karcinom želuca tkiva negativne za Eber (izvorno povećanje × 10) pregled Tablica 2. Korelacija EBVaGC i kliničko-patoloških parametara pregled Kliničke značajke pregled N
EBV izraz *
pregled pregled negativan (%)
Pozitivna (%) pregled
Spol
pregled Muški pregled 48 pregled, 42 (87,5) pregled, 6. (12.5) pregled Ženski pregled 33 pregled, 27 (81,8) pregled, 6. (18.2) pregled, p-vrijednost pregled, pregled 0,47
doba
< 45 pregled 17 pregled 17 (100) pregled, 0 (0)
45-60 pregled 30 pregled 21 (70.) pregled, 9. (30) izvoznici > 60 pregled, 34 pregled, 31 (91.2) pregled, 3 (8.8), pregled, p-vrijednost pregled, pregled 0,009 pregled TNM
I-II pregled, 9
9 (100)
0 (0) pregled, III-IV
47 pregled, 40 (87,1) pregled, 7 (14,9) pregled, p-vrijednost pregled, pregled 0.216 pregled Anatomska lokacija
antruma pregled 48 pregled, 41 (85,4) pregled, 7 (14,6) pregled tijela
22 pregled, 19 (86,4) pregled 3 ( 13.6) pregled, kardija
8 pregled 6 (75) pregled, 2 (25) pregled, p-vrijednost pregled, pregled 0,72 pregled diferencijacije
Poor
43 pregled, 36 (83,7) pregled, 7 (16,3) pregled Umjereno pregled 26 pregled, 25 (96,2) pregled, 1 (3,8) pregled Pa
9 pregled 6 (66,7) pregled, 3 (33,3) pregled, p-vrijednost pregled, pregled 0,075 pregled Lauren tipa
crijeva pregled 47 pregled, 38 (80,9) pregled, 9 (19,1) pregled difuznu pregled 34 pregled 31 (91.2) pregled, 3 (8.8), pregled, p-vrijednost pregled, pregled 0.197 veličina pregled tumora
< 5 cm
9
8 (88,9)
1 (11.1) izvoznici > 5 cm
65 pregled, 54 (83,1)
11 (16,9) pregled, p-vrijednost pregled, pregled 0,658 pregled Venska invazija
Negatif pregled 61
54 (88,5) pregled, 7 (11,5)
positif pregled 18 pregled, 13 (72,2) pregled 5 (27,8) pregled, p-vrijednost pregled, pregled 0.09
* EBV bila je određena pomoću Eber in-situ hibridizacije. Negativni slučajevi pokazuju rezultat = 0 i pozitiva slučajevi pokazali su rezultat = 1+ za 3+ pregled kvantitativna procjena EBV u GC pregled Q-PCR analiza je provedena na 18 uzoraka karcinoma želuca. među njima i 12 prikazuju Eber pozitivnost ograničena na stanice jezgrama i 6 bili su negativni.
Virusna broj DNK kopija procijenjena je apsolutna metoda kvantifikacije pomoću serijskog razrjeđenje rekombinantne DNA plazmida (pGEMT /BamHI-W), kao vanjskog standarda. Standardna krivulja je utvrđeno crtanjem polazni plazmid broj kopija na prag ciklusa (CT), pokazuje linearnu kvantifikaciju u rasponu od 10 6 do 10 kopija po reakciji.
Tipični primjeri su prikazani na slici 2 gdje su slučajevi GC10 i GC3 (Ct = 15 i 22 respektivno) pokazuju snažnu Eber nuklearne bojenje dok GC8 (Ct = 30) pokazuje slabu Eber izraz (slika 2). Podaci o Q-PCR je u skladu s Eber in situ pregled rezultata hibridizacije. Doista, 6 primjerci s intenzivnim Eber bojenja (gol 3+), pokazali su visoku EBV broj kopija DNA, dok slučajevi sa slabim Eber izraz (score 1+) odgovara niskoj virusne DNA kopiju (tablica 3). Slika 2 Određivanje EBV DNA broj kopija Q-PCR. Reprezentativni primjeri GC slučajeva s visokim (GC10), srednji (GC3) i niske (GC8) EBV DNK kopije broju. Horizontalna linija označava prag koji se koristi za procjenu Ct vrijednosti. Pregled Tablica 3 EBV broj DNK kopija i Eber bojenje rezultat u 12 EBV pozitivnih uzoraka i 6 negativni slučajevi pregled GC Kućišta
Histološki pregled Tip
tumora pregled stranice
Ct * pregled (prosjek) pregled
EBV DNA *
kopija /J..lg
Eber bojenje
postići
10 pregled crijeva pregled antruma pregled 15 pregled 6,105 pregled 3+ pregled 3
crijevnih pregled antruma pregled 22 pregled 4,103 pregled 3+ pregled 12 pregled, crijevna pregled antruma pregled 23 pregled 103 pregled 3+ pregled, 9
difuznu pregled antruma pregled, 22.8 pregled 103 pregled 3+ pregled 2 pregled crijeva pregled tijela
25 pregled 5,102 pregled 3+ pregled, 4
crijevnih pregled antruma pregled 26 pregled 102 pregled 3+ pregled 6 pregled crijevnih pregled aproksimalnim
27 pregled 8,101 pregled 2+ pregled 7 pregled difuznim pregled tijela
28 pregled 5,101 pregled 2+ pregled 11 pregled crijeva pregled aproksimalnim
28 pregled 5,101 pregled 2+ pregled 1 pregled crijeva pregled antruma pregled 30 izvoznici < 10 pregled 1+ pregled 5 pregled crijevnih pregled antruma pregled 30 izvoznici < 10 pregled 1+ pregled osam pregled difuznim pregled tijela
30 izvoznici < 10 pregled 1+ pregled 13 pregled difuznu pregled antruma pregled ND pregled ND
0 pregled 14 pregled difuznu pregled Body pregled ND ND pregled pregled, 0 pregled 15 pregled difuzna pregled antruma pregled ND pregled ND
0 pregled 16 pregled difuznu pregled antruma pregled ND pregled ND
0 pregled 17 pregled crijeva pregled antruma pregled ND pregled ND
0 pregled 18 pregled crijeva pregled Body pregled ND pregled ND pregled 0 pregled * broj kopija EBV DNK procijenjena je Q-PCR pomoću apsolutne metode kvantifikacije. CT: prag ciklusa. ND: Non-Određuje pregled genotipizacija sojeva EBVaGC
Kako bi se dodatno istražiti EBVaGC u naših 12 tuniskih primjeraka, ispitali smo genetski profil sojeva EBV određivanje različitih tipova i varijanti. Jedinstveni profil kod svih ispitanih uzoraka je primijetio (Slika 3). Karakteriziran je tipa A /D, prototip F, zadržavanje Xhol pregled sam restrikcije i 30. bp del-LMP1 varijantu. Napominjemo da su tipovi A i B oblikuju dvije različite sojeve EBV pronađena su u jednom slučaju EBVaGC uzoraka (slika 3). Slika 3 genotipizacija sojeva EBVaGC. A: PCR -RFLP od BamHI-F regiji koji prikazuje f varijantu (prisutnost dvaju bendova od 128 bp i 71 bp) za kontrolnu C666-1 staničnoj liniji (stupac 1) i jedan bend 199 bp za F varijantu za slučajevi GC2 da GC6 (staza 2 do 6). B: PCR-RFLP u BamHI-W1 /I1 regiji. DNA fragmenti su s BamHI pregled daje dvije trake od 139 i 67 bp (Tip D) za GC2 da GC6 (lane 2 do 6) ili jednom trakom 245 bp (tip C) za kontrolu C666-1 stanične linije ( stupac 1). C: EBNA3C područje. EBV sojevi tipa A i B odgovaraju DNA fragment 153 i 246 bp respektivno. Slučaj GC6 pokazuje dvostruku infekciju s oba tipa A i B virusa. B95.8 je tip virusa koji je korišten kao kontrola (stupac 1). D: Xhol pregled polimorfizma u eksonu 1 gena BNLF1. PCR produkt probavljaju Xhol Netlogu kako bi se dobio dvije granice 343 bp i 154 bp u Xhol
+ varijanti za GC2 na GC6 (traka 2 do 6). C666-1 stanična linija je pozitivan gubitke Xhol pregled varijanti (stupac 1).
Analiza EBV DNA također je provedena djelomična sekvenciranja na trećem eksona od BNLF1 dekodiraju gene aminokiselinama 328 do 376 od LMP1 proteina. Kako bi se potvrdila 30 bp brisanje koja kodira aminokiseline 343 do 352 od LMP1 proteina, poravnanje sekvencija pokazala sedam aminokiselina promjene u odnosu na referentni soj B95.8. Ona je stalno nalazi na kodona Q334R, L338S i S366A u svim EBVaGC primjeraka. Preostale amino kiseline supstitucije, međutim, posebno su pronađeni u jednom ili dva EBVaGC uzorka: H358L i L359V (GC2) P360H (GC9-10) i G365R (GC6). Što se tiče naše prethodne podatke o tuniskih NPC primjeraka, pronašli smo slične rezultate o tri stalne aminokiselina zamjene. Osim toga, sojevi EBV nose S366A ulazak pojaviti više povezana s tuniskih uzoraka u odnosu na one koji su definirani Kini (Slika 4). Slika 4. Usporedba izvedenih aminokiselinskih sljedova iz Tunisa GC s B95.8 prototipa i prije objavljene LMP1 sljedova: Cao: NPC stanična linija od Shangai [27]; C666-1 (GenBank pristupni broj ABV54173) NPC 10 iz Hong Konga [28] i tuniskih NPC uzoraka: CV4, CV5, CV6 [29]. Simboli (---) ukazuju aminokiselina brisanja.
U zdravih EBV prijevoznika, polimorfizam analiza pokazala je također tipa A i D, prototip F i Xhol + varijantu, kao slične identificirati u EBVaGC uzoraka (podaci nisu prikazani). pregled Rasprava pregled U ovom istraživanju, 81 slučajeva GC pacijenata u južnom dijelu Tunisa su ispitivani na prisutnost EBV i prevalencije EBVaGC bio 14,8% (12 od 81). Bilo je dobro poznato da je prevalencija EBVaGC varira od jedne geografske regije u drugu i najviša frekvencija zabilježena je u Njemačkoj (18%), dok je najniža (3,9%) je otkriven u Peruu [13-20, 31].
Eber in situ hibridizacije pregled je najpouzdaniji metod objavljene u literaturi za otkrivanje latentne EBV u GC. U stvari, sve gore navedene studije su provedena nakon ovog postupka, uključujući i naše studije. Varijabilna proporcije tumorskih stanica nuklearnih koje izražavaju Eber prikazivanje u našem istraživanju također su izvedeni od strane Truong i sur., Koji sugeriraju da se odnose s EBV infekcije javlja u onkogenim proces EBVaGC [32]. Međutim, daljnja istraživanja treba provoditi pojasniti ovu opasku.
Osim toga, pokazali smo da su heterogeni podaci Eber izraza može biti povezana s brojem EBV DNK kopija prema procjeni Q-PCR podržava da ova metoda je pouzdana kao ranije izvijestili [33].
s obzirom na kliničko-patološka obilježja EBVaGC, bio je opažen jaka povezanost s dobi u vrijeme postavljanja dijagnoze (P Netlogu = 0,009, Tablica 3). U stvari, EBVaGC se češće nalaze u skupini bolesnika u dobi između 45 i 60 godina, što je u skladu s prethodnim istraživanjima [19, 34]. Niti jedna druga statistička povezanost nađena, osim tendencijom s tumora diferencijacije i venska invazije (P
= 0,075 i P pregled = 0.09 respektivno). Raniji izvještaji su pokazali da je EBVaGC su česti u muškaraca, proksimalni želuca i tumora difuznog tipa [9, 14, 16, 35-39]. Nedavno je u velikom meta-analizu, Carmago i sur., Potvrđuje ove udruge uz dob pri dijagnozi [38]. U našoj studiji, nismo pronašli razlike u raspodjeli EBV u muški u odnosu na pacijentice, u proksimalnim vs distalnom želucu i difuznim vs crijevne Histotip. Ove razlike između podataka može objasniti doprinos lokalnih rizičnih čimbenika u patogenezi EBV i po veličini i charasteristics u skupini. Pregled Polimorfizam analiza EBVaGC slučajeva 12 pokazuju isključivo tipa D, prototip F, Xhol pregled, i-zadržavanje i 30 bp del-LMP1 varijanta. S obzirom na polimorfizam gena EBNA-3C, pronašli smo jedan tip kod svih EBVaGC slučajevima i kombinaciju tipa A i B, pronađeno je samo u jednom slučaju. Ovi rezultati su u skladu s nedavnom istraživanju provedenom na četiri EBVaGC slučajevima iz središnjeg dijela Tunisa [34].
Prevlast tip A i prototip F Također je pokazano u prethodnim izvješćima, neovisno na geografsko porijeklo EBVaGC kao u južnoj Kina [35], na jugu Japana [40], i latinoameričkih zemalja [41]. Zanimljivo, varijanta f je posebno opisano u NPC povezan sojeva EBV južne Azije [42]. U ovom području, prevlast tipa C i gubitke Xhol pregled varijanti uočeno je u bolesnika s EBVaGC ili NPC [35, 40], za razliku od našeg sadašnjeg stanja i prethodnih podataka o tuniskih NPC bolesnika [29, 43]. pregled, kako bi se bolje definirali genotipom sojeva EBVaGC i usporediti ih s one povezane s NPC, proveli smo djelomičnu sekvenciranje eksona 3 gena BNLF1 te ih u odnosu na prototip B95-8 i drugi objavljen sekvence iz azijskih i Tuniski sojevi NPC EBV [29, 43]. Q334R, L338S i L338P pronađeni su u svim našim EBV izolira i već su prijavili u sojevima EBV povezane s NPC podrijetlom iz Kine ili Tunisu [29, 44]. Međutim, S366A je specifično za EBV izolata povezana s tuniskom NPC i GC .. Doista, a temelji se na prethodno izvješće o Edwards i sur. [44] opisuje sedam filogenetski različite sojeve LMP1, može predložiti koja Tunisian izolati predstavljaju dodatnu skupinu s određenim potpisom (T366A), no ova hipoteza treba potvrde sekvenciranjem cijelog BNLF1 gena u ovim izolatima. Prema tom datumu, predlažemo da polimorfizma u genu BNLF1 predstavljaju dodatni argument u skladu s drugima EBV polimorfizama (tipa D, prototip F i Xhol +) koji podržavaju različitost sojeva EBV između dvije geografske regije. Pregled Na S druge strane, mi smo opisali ranije pregled drugima del-LMP1 varijante (69 bp i 81 bp brisanje u rasponu kodona 334-353 i 345-371, respektivno) u tuniskih NPC bolesnika [29, 43]. Te varijante nisu pronađene i samo 30 bp del-LMP1 varijanta je identificiran u svim slučajevima EBVaGC kao što je već prijavili Chen i sur., U velikom istraživanju provedenom na kineski GC bolesnika [35].
Naša polimorfizma analizu EBV izolatima kod zdravih prijevoznika otkrila je identičan genotip na one EBVaGC i NPC sugerira da zajednički sojevi geografski raspoređene, ali nije povezana s određenim malignosti. U stvari, razvoj EBV povezana malignih bolesti može se dovesti u vezu sa varijacijama potencijalne imunološkog priznanja u različite populacije i pojedinaca, kao što je predložio Edwards et al, [44]. Pregled Zaključak
prevalenciju EBVaGC u bolesnika s južne Tunis je 14,8%, što je u dometu s prikazanim podacima. EBVaGC pretežno se nalaze u skupini bolesnika u dobi od 45 do 60 godina, a tu razinu EBV DNK odražavaju stanje Eber u želučanom karcinomu.
Nadalje, EBV sojevi povezane s tuniske bolesnika s GC ili NPC dijeli neke sličnosti koje ukazuju da vjerojatno isto EBV soja su povezane s oba tumorima. Sve u svemu, naši rezultati podržavaju različite geografsku raspodjelu naprezanja EBV, ali ne i svoje ograničenje na pridruženom malignosti. Pregled Izjave pregled Zahvale
Ovaj rad je podržan od strane grant Ministarstva tuniskog visokog obrazovanja i znanstvenog istraživanja , Želimo se zahvaliti gospodinu M Jaoua za sekvenciranje objekata.
Autora originalne dostavljeni datoteke za slike
Ispod su linkovi na autora izvornika dostavljenih datoteka za slike. 'Izvorne datoteke za sliku 1 12985_2011_1593_MOESM2_ESM.tiff autorovih 12985_2011_1593_MOESM1_ESM.tiff autora izvorne datoteke za sliku 2 12985_2011_1593_MOESM3_ESM.tiff autorskim izvorne datoteke za sliku 3 12985_2011_1593_MOESM4_ESM.tiff autora izvorna datoteka za slike 4 suprotstavljenih interesa
Autori izjavljuju da su nema suprotstavljenih interesa. pregled

• Povećanje integrina vezanog kinaze ne-kanonski prenosi sa NF-kB posredovane prednosti rasta na želučane stanicama raka aktiviranjem ERK1 /2
• Epstein-Barr virus okužen želučanog adenokarcinoma izražava latentne i litičke viralnih transkripata i ima izrazitu ljudski genetski profil izlučivanja