Vårt team var det första som visade att SARS-CoV-2-virussekvenser kunde identifieras från miljöpinnar samlade från sjukhusytor. "
Angela Haczku, andningsimmunolog och seniorförfattare på studien
I april 2020, ett utbrott av covid-19 bland sjukhuspersonal ledde ett tvärvetenskapligt team av UC Davis-forskare för att undersöka om det fanns viruskontaminering av ofta använda ytor på patienttjänst ICU och personalmöten vid UC Davis Medical Center. Då var fomiternas (ytor) roll i spridningen av sjukdomen mycket debatterad. De samlade in flera prover under de första (april 2020) och andra (augusti 2020) vågorna av COVID-19 från ytor och HVAC-filter på sjukhuset.
Forskarna analyserade ytpinnarna för SARS-CoV-2 RNA och infektivitet och bedömde lämpligheten för RNA för sekvensering.
Trots en signifikant ökning av antalet sjukhuspatienter med COVID-19 under den andra ökningen, laget fann att endast 2% av pinnarna testade positivt i augusti, jämfört med 11% av proverna som samlades in i april.
"Minskningen av virusföroreningarna berodde troligen på förbättrad ICU -patienthantering och rengöringsprotokoll, "Sade Haczku. Haczku är professor i medicin, direktör vid UC Davis Lung Center och associerad dekan för translationell forskning vid UC Davis School of Medicine.
Studien visade att genom genom -sekvensering, SARS-CoV-2 kunde detekteras även från prover som annars testade negativa (odetekterbara) med vanliga PCR-tester. Resultaten bekräftade också att SARS-CoV-2 RNA togs upp från en yta, även om den innehåller nästan intakt genomisk sekvens, var inte smittsam. Detta fynd stöder hypotesen att förorenade ytor kanske inte är ett viktigt sätt att sprida COVID-19-sjukdom.
"För första gången, så vitt vi vet, vi kunde bestämma den virala genomsekvensen från ytprovprover som erhållits i en sjukhusmiljö, "sa David Coil, projektforskare vid UC Davis Genome Center och den första författaren till studien. "Vi hittade SARS-CoV-2 i prover som testades negativa med RT-PCR, tyder på att sekvenseringstekniken är överlägsen för virusdetektering i miljöprover. "
Enligt Coil, genomsekvensen som utförs på provtagningsproverna på sjukhusytan är mycket viktig. Genom att få exakta virala genomiska sekvenser, forskarna kunde spåra källan och ta reda på hur en infektion rör sig.
"Våra data indikerade att sekvenserna som bestämdes för viralt RNA från ytor var identiska med de som härstammade från patienter som var inlagda på ICU vid tidpunkten för provtagning. Möjligheten att identifiera virala genom -sekvenser från miljöprover kan ha stor betydelse för folkhälsan vid övervakning av utbrott och övervakning av spridningen av nya virusvarianter, "Sa Haczku.
Cryptosporidios förvärrades av vanligt förekommande probiotika
Män som äter yoghurt två gånger i veckan är mindre benägna att utveckla tarmcancer
Neil Bell utses till Chief Development Officer för Avacta Life Sciences
Forskare utvecklar 3D -tryckt piller som provar bakterier som finns i tarmen
Snabbmat kan vara den främsta boven i tonårsdepression
Genetik kan påverka sammansättningen av mikrobiomet mer än miljöfaktorer
Genetiskt justerade tarmbakterier minskar risken för kolorektal cancer hos möss, finner studie
Forskare har funnit att redigering av generna hos de bakterier som finns i tarmarna hos möss kan hjälpa till att minska inflammationen och därmed förenad risk för kolorektal cancer. Forskningen från U
Vanlig svamp som finns på huden kan orsaka inflammatorisk tarmsjukdom
Terapier som riktar sig mot vissa svampar kan ge ett nytt sätt att behandla inflammatorisk tarmsjukdom (IBD), enligt LA -forskare. Bakgrund | Shutterstock IBD kännetecknas av förändringar
Transplantation av vaginal vätska kan hjälpa till att behandla återkommande bakteriell vaginos
Bakteriell vaginos är ett vanligt och jobbigt problem för många kvinnor. Nu har forskare funnit att transplanterande vaginalvätskor från en frisk kvinna till kvinnor med besvärlig bakteriell vaginos k