Последовательности вируса SARS-CoV-2 можно идентифицировать по мазкам с поверхности больниц

Новое исследование ученых из Калифорнийского университета в Дэвисе подтверждает низкую вероятность того, что заражение SARS-CoV-2 на больничных поверхностях является заразным. Изучение, опубликовано 24 июня в PLOS ONE, это оригинальный отчет о восстановлении почти полных последовательностей генома SARS-CoV-2 непосредственно из мазков с поверхности.

<цитата>

Наша команда была первой, кто продемонстрировал, что последовательности вируса SARS-CoV-2 можно идентифицировать по мазкам из окружающей среды, собранным с поверхностей больниц ».

Анжела Хачку, респираторный иммунолог и старший автор исследования

Изменение протоколов очистки и интенсивной терапии, связанных с уменьшением заражения SARS-CoV-2

В апреле 2020 г. Вспышка COVID-19 среди персонала больницы привела к тому, что междисциплинарная группа исследователей Калифорнийского университета в Дэвисе провела расследование на предмет наличия вирусного заражения часто используемых поверхностей у пациентов, обслуживающих ОИТ, и в зонах встреч персонала в Медицинском центре Калифорнийского университета в Дэвисе. В то время широко обсуждалась роль фомитов (поверхностей) в распространении болезни. Они собрали несколько образцов во время первой (апрель 2020 г.) и второй (август 2020 г.) волн COVID-19 с поверхностей и фильтров HVAC в больнице.

Исследователи проанализировали мазки с поверхности на РНК SARS-CoV-2 и инфекционность и оценили пригодность РНК для секвенирования.

Несмотря на значительное увеличение количества госпитализированных пациентов с COVID-19 во время второго всплеска, команда обнаружила, что только 2% мазков дали положительный результат в августе, по сравнению с 11% проб, собранных в апреле.

"Снижение заражения вирусом, вероятно, было связано с улучшением протоколов ведения пациентов в отделении интенсивной терапии и очистки, "Сказал Хачку. Хачку - профессор медицины, директор Центра легких Калифорнийского университета в Дэвисе и заместитель декана по трансляционным исследованиям Медицинской школы Калифорнийского университета в Дэвисе.

Последовательность генома коронавируса обнаружена на поверхности

Исследование показало, что путем секвенирования генома SARS-CoV-2 может быть обнаружен даже в образцах, которые в противном случае оказались отрицательными (неопределяемыми) с помощью обычно используемых тестов ПЦР. Результаты также подтвердили, что РНК SARS-CoV-2 собрана с поверхности, хотя и содержит почти неповрежденную геномную последовательность, не было заразным. Этот вывод подтверждает гипотезу о том, что зараженные поверхности не могут быть основным путем распространения болезни COVID-19.

"В первый раз, насколько нам известно, мы смогли определить последовательность вирусного генома из образцов мазков с поверхности, полученных в условиях больницы, "сказал Дэвид Койл, научный сотрудник Центра генома Калифорнийского университета в Дэвисе и первый автор исследования. «Мы обнаружили SARS-CoV-2 в образцах, которые оказались отрицательными с помощью ОТ-ПЦР, предполагая, что технология секвенирования лучше подходит для обнаружения вирусов в образцах окружающей среды ».

Согласно Coil, Секвенирование генома, выполненное на образцах мазков с поверхности больниц, очень важно. Получая точные вирусные геномные последовательности, исследователи могли отследить источник и выяснить, как распространяется инфекция.

«Наши данные показали, что последовательности, определенные для вирусной РНК с поверхностей, были идентичны последовательностям, полученным от пациентов, госпитализированных в отделение интенсивной терапии во время сбора образцов. Возможность идентифицировать последовательности вирусного генома из образцов окружающей среды может иметь большое значение для общественного здравоохранения. в эпиднадзоре за вспышками и мониторинге распространения новых вирусных вариантов, "Сказал Хачку.

• Исследователи UTHSC публикуют новые данные о том, как ожирение влияет на лечение рака
• Смесь полисахаридов дрожжевого происхождения эффективно подавляет начало