As sequências do vírus SARS-CoV-2 podem ser identificadas a partir de esfregaços de superfície hospitalar

Um novo estudo realizado por pesquisadores da UC Davis confirma a baixa probabilidade de que a contaminação por SARS-CoV-2 em superfícies de hospitais seja infecciosa. O estudo, publicado em 24 de junho em PLOS ONE, é o relatório original sobre a recuperação de sequências quase completas do genoma SARS-CoV-2 diretamente de swabs de superfície.

p Nossa equipe foi a primeira a demonstrar que as sequências do vírus SARS-CoV-2 podiam ser identificadas a partir de swabs ambientais coletados em superfícies de hospitais. "

Angela Haczku, imunologista respiratório e autor sênior do estudo

Alteração dos protocolos de limpeza e UTI vinculados à redução da contaminação por SARS-CoV-2

p Em abril de 2020, um surto de COVID-19 entre a equipe do hospital levou uma equipe interdisciplinar de pesquisadores da UC Davis a investigar se havia contaminação por vírus de superfícies frequentemente utilizadas em pacientes atendendo na UTI e nas áreas de reunião da equipe no UC Davis Medical Center. Naquela época, o papel dos fômites (superfícies) na disseminação da doença era altamente debatido. Eles coletaram várias amostras durante a primeira (abril de 2020) e a segunda (agosto de 2020) ondas de COVID-19 de superfícies e filtros HVAC no hospital.

p Os pesquisadores analisaram os esfregaços de superfície para o ARN do SARS-CoV-2 e a infecciosidade e avaliaram a adequação do ARN para sequenciação.

p Apesar de um aumento significativo no número de pacientes hospitalares com COVID-19 durante a segunda onda, a equipe descobriu que apenas 2% dos esfregaços testaram positivo em agosto, ante 11% das amostras coletadas em abril.

p "A redução na contaminação por vírus foi provavelmente devido à melhoria no gerenciamento de pacientes da UTI e nos protocolos de limpeza, "Haczku disse. Haczku é um professor de medicina, diretor do UC Davis Lung Center e reitor associado de pesquisa translacional na UC Davis School of Medicine.

Sequência do genoma do coronavírus encontrada em superfícies

p O estudo demonstrou que, por sequenciamento do genoma, O SARS-CoV-2 pode ser detectado até mesmo em amostras com resultados negativos (indetectáveis) pelos testes de PCR comumente usados. Os resultados também confirmaram que o RNA SARS-CoV-2 foi coletado de uma superfície, embora contenha sequência genômica quase intacta, não era infeccioso. Esse achado apóia a hipótese de que superfícies contaminadas podem não ser uma forma importante de disseminação da doença COVID-19.

p "Pela primeira vez, para nosso conhecimento, fomos capazes de determinar a sequência do genoma viral a partir de amostras de esfregaço de superfície obtidas em um ambiente hospitalar, "disse David Coil, cientista do projeto no UC Davis Genome Center e o primeiro autor do estudo. "Encontramos SARS-CoV-2 em amostras que foram negativas por RT-PCR, sugerindo que a tecnologia de sequenciamento é superior para detecção de vírus em amostras ambientais. "

p De acordo com Coil, o sequenciamento do genoma realizado nas amostras de esfregaço de superfície do hospital é muito importante. Ao obter sequências genômicas virais precisas, os pesquisadores puderam rastrear a origem e descobrir como uma infecção se move.

p "Nossos dados indicaram que as sequências determinadas para o RNA viral das superfícies eram idênticas às derivadas dos pacientes hospitalizados na UTI no momento da coleta da amostra. A capacidade de identificar sequências do genoma viral a partir de amostras ambientais pode ter alto significado para a saúde pública na vigilância de surtos e monitoramento da disseminação de novas variantes virais, "Haczku disse.

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