SARS-CoV-2-virussekvenssit voidaan tunnistaa sairaalan pintatyynyistä

Tiimimme osoitti ensimmäisenä, että SARS-CoV-2-virussekvenssit voidaan tunnistaa sairaalan pinnoilta kerätyistä ympäristöpyyhkeistä. "

Angela Haczku, hengityselinten immunologi ja tutkimuksen vanhempi kirjoittaja

Muuttuvat puhdistus- ja ICU-protokollat, jotka liittyvät alempaan SARS-CoV-2-kontaminaatioon

Huhtikuussa 2020, COVID-19-epidemia sairaalan henkilökunnan keskuudessa johti UC Davisin tutkijoiden monitieteisen ryhmän tutkimaan, onko usein käytettyjen pintojen virussaastumista potilailla, jotka palvelevat ICU:ta ja UC Davis Medical Centerin henkilökunnan kokousalueita. Tuolloin fomiittien (pintojen) roolista taudin leviämisessä kiisteltiin paljon. He keräsivät useita näytteitä ensimmäisen (huhtikuun 2020) ja toisen (elokuun 2020) COVID-19-aallon aikana sairaaloiden pinnoilta ja LVI-suodattimilta.

Tutkijat analysoivat SARS-CoV-2-RNA:n ja tarttuvuuden pintatyynyjä ja arvioivat RNA:n sopivuutta sekvensointiin.

Huolimatta COVID-19-tautia sairastavien potilaiden määrän huomattavasta lisääntymisestä toisen aallon aikana, tiimi havaitsi, että vain 2% pyyhkeistä oli positiivisia elokuussa, verrattuna 11 prosenttiin huhtikuussa kerätyistä näytteistä.

"Viruksen saastumisen väheneminen johtui todennäköisesti parantuneesta tehohoidon potilashallinnasta ja puhdistuskäytännöistä, "Haczku sanoi. Haczku on lääketieteen professori, johtaja UC Davis Lung Centerissä ja apulaisdekaani translaatiotutkimukseen UC Davis School of Medicine.

Pinnoilta löytyy koronaviruksen genomisekvenssi

Tutkimus osoitti, että genomin sekvensoinnilla, SARS-CoV-2 voidaan havaita jopa näytteistä, jotka muuten olivat negatiivisia (ei havaittavissa) yleisesti käytetyillä PCR-testeillä. Tulokset vahvistivat myös, että SARS-CoV-2-RNA nousi pinnalta, vaikka se sisältää lähes ennallaan olevan genomisen sekvenssin, ei ollut tarttuvaa. Tämä havainto tukee hypoteesia, jonka mukaan saastuneet pinnat eivät ehkä ole merkittävä tapa levittää COVID-19-tautia.

"Ensimmäistä kertaa, tietääksemme, pystyimme määrittämään viruksen genomisekvenssin sairaalaympäristössä saaduista pinnanäytteistä, "sanoi David Coil, projektitutkija UC Davis Genome Centerissä ja tutkimuksen ensimmäinen kirjoittaja. "Löysimme SARS-CoV-2:n näytteistä, jotka testattiin negatiivisiksi RT-PCR:llä, mikä viittaa siihen, että sekvensointitekniikka on parempi virusten havaitsemiseen ympäristönäytteistä. "

Coilin mukaan genomin sekvensointi, joka suoritetaan sairaalan pintanäytteille, on erittäin tärkeä. Saamalla tarkat viruksen genomiset sekvenssit, tutkijat voisivat seurata lähdettä ja selvittää, kuinka infektio liikkuu.

"Tietomme osoittivat, että pinnoilta viruksen RNA:lle määritetyt sekvenssit olivat identtisiä niiden sekvenssien kanssa, jotka saatiin potilailta, jotka olivat sairaalahoidossa teho -osastolla näytteenottohetkellä. Kyvyllä tunnistaa virusgenomisekvenssit ympäristönäytteistä voi olla suuri kansanterveydellinen merkitys taudinpurkausten seurannassa ja uusien virusvarianttien leviämisen seurannassa, "Haczku sanoi.

• UTHSC:n tutkijat julkaisevat uusia havaintoja siitä, miten liikalihavuus vaikuttaa syövän hoitoon
• Hiivapohjainen polysakkaridiseos estää tehokkaasti puhkeamisen,