Mūsų komanda pirmoji pademonstravo, kad SARS-CoV-2 viruso sekas galima identifikuoti iš aplinkos tepinėlių, surinktų iš ligoninės paviršių.
Angela Haczku, kvėpavimo takų imunologas ir vyresnysis tyrimo autorius
2020 m. Balandžio mėn. COVID-19 protrūkis tarp ligoninės darbuotojų paskatino tarpdisciplininę „UC Davis“ tyrėjų komandą ištirti, ar dažnai naudojamų paviršių virusai neužteršti pacientai, aptarnaujantys ICU, ir personalo susitikimų vietos UC Davis medicinos centre. Tuo metu buvo daug diskutuojama apie fomitų (paviršių) vaidmenį plintant ligą. Jie surinko kelis mėginius per pirmąją (2020 m. Balandžio mėn.) Ir antrąją (2020 m. Rugpjūčio mėn.) COVID-19 bangas iš paviršių ir ŠVOK filtrų ligoninėje.
Mokslininkai išanalizavo paviršinius tamponus SARS-CoV-2 RNR ir užkrečiamumui bei įvertino RNR tinkamumą sekos nustatymui.
Nepaisant to, kad per antrąjį antplūdį labai padidėjo ligoninių, sergančių COVID-19, skaičius, komanda nustatė, kad tik 2% tepinėlių rugpjūčio mėn. balandžio mėn., palyginti su 11% mėginių.
„Viruso užterštumo sumažėjimą greičiausiai lėmė patobulinti ICU pacientų valdymo ir valymo protokolai, "Haczku sakė. Haczku yra medicinos profesorius, UC Davis plaučių centro direktorius ir UC Davis medicinos mokyklos vertimo tyrimų dekanas.
Tyrimas parodė, kad atlikus genomo seką, SARS-CoV-2 buvo galima aptikti net iš mėginių, kurie kitaip buvo neigiami (neaptinkami), naudojant dažniausiai naudojamus PGR tyrimus. Rezultatai taip pat patvirtino, kad SARS-CoV-2 RNR pakilo nuo paviršiaus, nors ir turi beveik nepažeistą genominę seką, nebuvo užkrečiama. Ši išvada patvirtina hipotezę, kad užteršti paviršiai gali būti ne pagrindinis būdas plisti COVID-19 ligai.
"Pirmą kartą, mūsų žiniomis, mums pavyko nustatyti viruso genomo seką iš paviršinių tamponų mėginių, gautų ligoninės aplinkoje, “, - sakė Davidas Coilis. projekto mokslininkas UC Davis genomo centre ir pirmasis tyrimo autorius. "Mes nustatėme SARS-CoV-2 mėginiuose, kurie buvo neigiami RT-PCR, tai rodo, kad sekos nustatymo technologija yra pranašesnė už virusų aptikimą aplinkos mėginiuose “.
Pasak Coil, genomo sekos nustatymas ligoninės paviršiaus tepinėlių mėginiams yra labai svarbus. Gavę tikslią viruso genomo seką, tyrėjai galėtų sekti šaltinį ir išsiaiškinti, kaip juda infekcija.
"Mūsų duomenys parodė, kad sekos, nustatytos viruso RNR iš paviršių, buvo identiškos sekoms, gautoms iš pacientų, hospitalizuotų ICU tuo metu, kai buvo imami mėginiai. Galimybė nustatyti viruso genomo sekas iš aplinkos mėginių gali turėti didelę reikšmę visuomenės sveikatai stebint protrūkius ir stebint naujų virusų variantų plitimą, “ - sakė Haczku.