Nízka Helicobacter pylori primárnej odolnosť voči klaritromycínu v žalúdočných biopsiou z dyspeptických pacientov mesto v interiéri Sao Paulo, Brazil

nízka Helicobacter pylori primárnej odolnosť voči klaritromycínu v žalúdočných biopsiou z dyspeptických pacientov mesta vo vnútrozemí Sao Paulo, Brazília
abstraktné
pozadia
klaritromycín, amoxicilín a inhibítor protónovej pumpy sú najbežnejšie lieky odporúčané ako prvá línia trojkombinácia pre H. pylori
liečbu, čo má za následok elimináciu sadzieb takmer 80% , ktoré sa líšia regionálne, a to predovšetkým z dôvodu naliehavých prípadoch a zvyšovanie rezistentných kmeňov klaritromycínu. Nukleotidových substitúciou na H. pylori
domény V frakcie 23S rRNA sa podieľajú na makrolidové odporu a A2142G a A2143G mutácie sú prevládajúce v klinických izolátov celom svete, vrátane v Brazílii. Ako H. pylori
kultúra je náročný, sme skúmali primárny výskyt H. pylori
A2142G a A2143G rDNA 23S mutácií pomocou molekulárnej prístup priamo na žalúdočných biopsiách dyspeptických pacientov postupne sa zúčastnili v nemocnici das Clínicas z Marilia, Sao Paulo, Brazília.
metódy
biopsia vzorky získanej z 1137 dyspeptických pacientov, boli podrobené histopathology a H. pylori
diagnóza histológie a PCR. PCR /RFLP test bol použitý na detekciu A2142G a A2143G bodové mutácie v doméne V ​​H. pylori
23S rDNA spojené s rezistencie na klaritromycín. Prostredníctvom vyvinutého testu sa 768 bp PCR amplikón zodpovedajúce to1728 do 2495 párov báz 23S rDNA H. pylori
je obmedzený MboII
pre detekciu mutácií A2142G a s BsaI
pre detekciu mutácie A2143G. Výskyt 23S rDNA výsledky A2142G v dvoch DNA fragmentov (418 a 350 bp) a z 23S rDNA výsledkov A2143G v troch fragmentov DNA (108, 310 a 350pb), v dôsledku konzervované restrikčné miesto BsaI
.
Výsledky
metódou PCR slúži na diagnostiku H. pylori
prezentované citlivosti, špecifickosť a presnosť 77,6%, 79,3% a 78,6% v uvedenom poradí, v porovnaní s histológia, zlatého štandardu spôsobu H. pylori
diagnóza použitý v našej rutiny. Prevalencia H. pylori
s genotypov odolných voči klaritromycínu 2,46%, s prevahou A2143G 23S rDNA bodové mutácie.
Závery
PCR /RFLP bol rýchly a presný H. pylori
diagnostická a klaritromycín metóda na stanovenie odolnosti vhodná pre bežnej praxi. Ako prevalencia primárnej rezistencie H. pylori
klaritromycínu z dôvodu A2142G a A2143G mutácie zostáva na nízkej úrovni v Marilia, štandardné klaritromycín obsahuje trojkombináciu je stále platný.
Kľúčové
Helicobacter pylori
rezistencie na klaritromycín Helicobacter pylori
23S rDNA žalúdočnej choroby nukleovej kyseliny založené diagnostické pozadie
je všeobecne uznáva, že Helicobacter pylori
, gramnegatívne baktérie microaerophylic, sa podieľa na niekoľkých podmienkach klinických zažívacieho traktu, ako je chronické gastritídy, žalúdočných a dvanástnikových vredov , karcinómu žalúdka a lymfoproliferatívne poruchy [1]. Liečba infekcie H. pylori
vedie k hojeniu vredov a vo zníženie rizika rakoviny žalúdka a lymfómu
Akonáhle je baktéria H. pylori
je detekovaná v pozmenenej žalúdočnej sliznice [2, 3]., udávaná liečba pozostáva z trojitej liečby antibiotikami vrátane methronidazol, klaritromycín, amoxicilín, tinidazol, tetracyklínu a fluorochinolónov spojené s inhibítory protónovej pumpy, ako je omeprazol, lansoprazol alebo pantoprazol [4-6]. H. pylori
eradikáciu ceny s počtom kombinovaných agentov a režimy sa blíži 80% [7-9], ktoré sa líši od krajiny ku krajine a regionálne, v rámci jednotlivých krajín [10]. Niekoľko faktorov prispieva k tejto nízkej rýchlosti H. pylori
rán, vrátane neúčinnosti prenikaniu antibiotika v žalúdočnej sliznici, inaktivácia antibiotiká u sekrécie kyseliny v žalúdku [11], nedostatočná na spoluprácu pacienta [12] a hlavne, núdzové prípady a rastúce antibiotikám rezistentné kmene H. pylori
[13]. Tak, regionálne H. pylori
odpor dohľad má veľký význam pre testovacie a liečebných stratégií.
V Brazílii, krajine kontinentálnych rozmerov, väčšina praktizujúcich klinickí lekári používajú klasickú trojitý režim zložený z klaritromycín, amoxicilín a na inhibítor protónovej pumpy počas siedmich dní ako liečba prvej voľby pre prekonanie infekcie H. pylori
[5, 14]. Tento režim bolo preukázané, aby sa stala neefektívna po celom svete, a to najmä v dôsledku vzniku a rastu H. pylori
kmeňov rezistentných voči klaritromycínu, čo znižuje účinnosť liečby baktérie od 55% do 100%, [15-18]. Medzi brazílskych lokalitách, H. pylori
klaritromycín rezistencia predstavuje vysokú prevalenciu, sa pohybuje od 7-16% u dospelých [19-22] a 27% u detí [23]. V súlade s tým, vzhľadom na klinický význam primárnej H. pylori
odolnosť proti klaritromycín, jeho prevalencia je potrebné zvážiť pred výberom eradikáciu režimami [24].
Stanovenie H. pylori in vitro
citlivosti na antibiotiká môže byť vykonaná štandardnými technikami, ako je agar, agar difúzia riedenie a vývar mikrozřeďovací metód a E-testu. Avšak, vzhľadom k pomalému rastu a osobitných požiadaviek na H. pylori
kultúry, tento prístup nie je spoľahlivý pre použitie vo väčšine bežných klinických laboratóriách, najmä v rozvojových krajinách. Z tohto dôvodu, molekulárne testy zamerané na H. pylori
odpor spojený génových mutácií priamo z žalúdočných biopsiou majú potenciál pre použitie v rozsiahlych štúdiách [25-29].
Molekulárna mechanizmus zapojené do rezistencie na klaritromycín sa skladá z mutácií sekvencie baktérie H. pylori
domény v frakcie 23S rRNA, ktorá sa podieľa na peptiltransferase miesto väzby ribozómov bráni ligácia makrolidu s rRNA [30]. Hlavné charakterizované bodové mutácie sú A na G v polohe 2142 a 2143, A až C na 2142 [31-33], A na T v 2144 [34], T na C v 2717 [35], a C na A v 2694 [ ,,,0],36]. V A2142G a A2143G mutácie sú prevládajúce v klinických izolátov celom svete, vrátane v Brazílii [21, 37-40]. Tak, aby sa vykonalo šetrenie vo veľkom meradle klaritromycínu primárneho odporu priamo z biopsiou z 1137 pacientov sa zúčastnilo v nemocnici das Clínicas z Marilia, mesto v interiéri Sao Paulo, Brazília, sme vyvinuli polymerázovej reťazovej reakcie spojené s obmedzením fragment dĺžka polymorfizmus (PCR-RFLP) test pre detekciu A2142G a A2143G nukleotidov substitúcie v doméne V. H. pylori
23S rDNA.
Metódy
pacientov
1137 dospelých pacientov s bydliskom v meste Marilia, São Paulo Stav Brazílii, vo veku 19 až 91 rokov, ktorí mali za sebou podrobený Ezofagogastroduodenoskopie (EGD) pre bolesť v nadbrušku alebo dyspeptických príznakov od februára 2003 do decembra 2006 na gastroenterologickej ambulancii nemocnice das Clínicas z Marília Medical School, boli zaradení v tejto štúdii.
Endoskopia a biopsia
EGD bolo vykonané fibroendoscope (GIF-XP20, GIF-XQ20) alebo video endoskopu (GIF-100), a to ako z Olympu, Shinjuku-ku, Tokyo, Japonsko. Žalúdočný alebo dvanástnikové vredy diagnostické bola definovaná endoskopicky a dva fragmenty antra boli odobraté na vykonanie rýchlej ureázy a histopatologických testov. Biopsia slúži k rýchlemu ureasového testu bol ďalej predložený na extrakciu DNA. Použitý protokol je v súlade s Helsinskou deklaráciou a bola schválená etickou komisiou v ľudskom výskumu z Marilia Medical School, pod referenčným číslom 388/01. V Etický výbor schválil výskum protokol písomný informovaný súhlas od každého pacienta v rámci tejto štúdie bolo upustené ako všetky žalúdočné biopsia analyzovaných vzoriek boli rovnaké biopsia bežne používané pre ureázy rýchlym testom v rámci gastroenterológia ambulantné služby v nemocnici das Clínicas z Marilia Medical School a tak žiadny zvláštny zásah pacienta bolo nutné pre zápis do tohto návrhu štúdie. V súlade s tým, zrieknutie sa písomného informovaného súhlasu nebolo nepriaznivo ovplyvnené práva a dobré životné podmienky osôb zahrnutých v tomto výskume, ako aj dôvernosť identity pacientov bol zaručený.
Histológia
Jedna antrálnej vzorky bola stanovená v roztoku formol na 10%, a vložené do parafínu. Rezy boli zafarbené Giemsa pre H. pylori
vyhodnotenia a boli zafarbené hematoxilinem a eosínu pre vyhodnotenie histopatologických zmien [41].
Polymerázová reťazová reakcia, reštrikčné analýza a sekvenovanie
rovnaké biopsia použitý pre rýchle ureázu test bol predložený na extrakciu DNA sa zamestnávaním extrakčný súpravy GFX DNA zakúpené od Amersham /Pharmacia Biotech, podľa pokynov výrobcu. DNA bola kvantifikovaná elektroforézou na agarózovom géle s použitím Invitrogen, Grand Island, New York, USA, nízkou hmotnosťou a rebrík 50-100ug celkovej DNA boli použité v PCR reakciách s oligonukleotidy: Hp23Sr6 zmysle, (5 '') a CACACAGGTAGATGAGATGAGTA3 Hp23Sr7 antisencie (CACACAGAACCACCGGATCACTA3 "), ktorá amplifikuje fragment 768pb zodpovedajúce domény v H. pylori
23S rDNA (obrázok 1). Na prekonanie problémov rozsiahleho genetického polymorfizmu pre presnú detekciu PCR H. pylori
oligonukleotid stavba bola vykonaná po porovnávacej analýzy 23S rDNA z H. pylori stroje a súvisiacich organizmov k dispozícii v Genebank o softvéri MegAlign Lasergene , Podmienkou PCR bola 94 ° C 5 'nasleduje 40 cyklov pri teplote 94 ° C, 30 "/60 ° C 30" /72 ° C 30 "a jeden cyklus pri teplote 72 ° C, 7', s celkovým objemom 25 ul s obsahom 1 x PCR pufor, 200 uM dNTPs, 2,0 mM MgCl 2, 1 uM každého oligonukleotidy, 1,25 U Taq DNA Polimerase Platinum Brazília (Invitrogen). Vo všetkých reakciách PCR negatívne a pozitívna kontrola boli použité zodpovedajúce, v tomto poradí, sterilná voda a H. pylori
PCR pozitívny žalúdočných biopsiách. Amplifikované fragmenty sa štiepili MboII stroje a BsaI
(New England Biolabs). Tieto enzýmy rozlišovať mutácie v H. pylori
domény V 23S rDNA v polohách 2142 a 2143, resp. V prítomnosti mutácie A2142G výsledné fragmenty DNA obmedzenia sú 418 bp a 350 bp, a v prítomnosti mutácie A2143G výsledné fragmenty sú 108, 310 e 350 bp. Ako kontrola MboII
trávenie sme použili PCR amplifikovanej DNA fragment o 601 bp, ktorý zodpovedá Leishmania major
chitinasy génu, ktorý obsahuje reštrikčné miesto pre MboII
. Konzervovanú BsaI
reštrikčné miesto na 768 bp PCR amplikónu je pozitívna kontrola pre trávenie sa tento enzým produkujúce fragmenty DNA o 108 a 660 bp v neprítomnosti A2143G mutácie. Výrobky z reakcií PCR a reštrikčnej analýzy boli vyriešené 1,5% agarózových géloch, zafarbia etidiumbromidom a fotografované pod UV svetlom. 23S rDNA 768 bp PCR amplikóny zo štyroch žalúdočných biopsiou (dve pozitívne a dve negatívne pre H. pylori
histologické test) sa klaritromycín citlivé MboII
a BsaI
obmedzenia vzorom, a od desať žalúdočných biopsiou rezistentnými MboII clarytromycin
(tri vzorky) a BsaI
(sedem vzoriek) obmedzenie vzory boli podrobené sekvenovania s DyeTM Terminátor v3.0 Cycle Sequencing Ready Reaction súpravou a ABI-3100 počítače zakúpené od Applied Biosystems, v súlade s pokynmi výrobcu. Stanovenie nukleotidovej sekvencie bolo vykonané v duplikátu a porovnávacia analýza bola vykonaná základná vyrovnanie nukleotidu BLAST [42]. Obrázok 1 Molekulárna diagnostika Helicobacter pylori pomocou PCR a RLFP detekciu domény V mutácií 23S rRNA A2142G a A2143G zodpovedné za rezistencie na klaritromycín. A. Zastúpenie H. pylori
23S génu kódujúceho (Genbank: HPU27270), poloha primérov použitých pre PCR a A2142 a A2143 od frakcie V 23S rDNA, veľkosť fragmentov získaných reštrikčnými enzýmami BsaI a MboII
v PCR fragmentov, ktoré obsahujú mutácie A2142G a A2143G, a interné BsaI
restrikčné miesto amplikónu o 768 bp, sú označené. B, C a D. agarózovom géli farbené etidiumbromidom, ktorý obsahuje diagnostickú analýzu PCR, reštrikčné analýza 768pb amplikónu s MboII stroje a BsaI
, v danom poradí. 1-10 zodpovedajú rôznym vzoriek ľudskej biopsie; C-, negatívna kontrola PCR, M-100 bp rebrík zakúpený od firmy Invitrogen. Veľkosti fragmentov DNA sú uvedené na ľavej alebo na pravej strane každého gélu obrázku.
Štatistická analýza
H. pylori
diagnostické testy boli hodnotené na základe výpočtu citlivosti, špecifickosť a presnosť využívajúce histológia ako zlatý štandard.
Výsledky a diskusia
Toto je prvá štúdia brazílskej vo veľkom meradle na H. pylori
diagnóza a klaritromycín odpor priamo z biopsiou z roku 1137 po sebe idúcich pacientov predložených hornej gastroskopia, po dobu štyroch rokov, v meste, v vnútro Sao Paulo, Brazília.
žalúdočné výsledok ochorenia všetkých pacientov zaradených do tejto štúdie sa zúčastnilo na gastroenterologickej ambulancii nemocnice das Clínicas z Marília bol vyšetrovaný endoskopie a histopatológie. Endoskopické nálezy peptického alebo dvanástnikové vredovým ochorením (PUD) bola prítomná u 123 pacientov. Rôzne stupne chronickej gastritídy (CG) boli pozorované histopatológie v 706 pacientov a normálne žalúdočnej sliznicou, spojené alebo nie refluxnej choroby pažeráka (GERD) bola nájdená vo 290 pacientov. Osemnásť pacientov bolo diagnostikovaných, že adenokarcinóm (15) a sladu lymfómu (3) a zo štúdie boli vylúčení. . Epidemiologická analýza, klinický výsledok a H. pylori
prevalencia týchto vzoriek boli nedávno zverejnené [43]
Detekcia H. pylori
bola vykonávaná priamo z biopsiou tromi rôznymi skúškami: histológia, domácnosť rýchlu Ureáza testu a PCR s primermi Hp23Sr6 /R7, ktoré rozširujú baktérie fragment 768 bp domény v 23S rDNA. Histológia je zlatý štandard H. pylori
diagnostický test bol použitý v našej klinickej praxi, ktorá spolu s histopatologické analýzy sa používa sa rozhodnúť pre H. pylori
eradikačnej terapie. Test pre domácnosť rýchly Ureáza ukázal veľmi nízku pozitívnu prediktívnu hodnotu H. pylori
spojená ochorenie žalúdka a vysoký rozdiel v porovnaní s histológiu; V dôsledku toho tieto údaje boli vylúčené zo štúdie (dáta nie sú uvedené). Metóda 23S rDNA PCR detegovaný H. pylori
vo 488 žalúdočných biopsií exemplárov, kde histológie bol pozitívny na 451 biopsia vzoriek. Porovnávacia analýza testu PCR bola vykonaná s Hp23Sr6 /R7 s histologicky ukázali, citlivosť, špecifickosť a presnosť 77,6%, 79,3% a 78,6%, v danom poradí (tabuľka 1). Pretože oba testy boli vykonávané na jednom a inú biopsiou a H. pylori infekcie
predstavuje ohniskovej charakteristiku infekcie [44, 45], presnosť 78,6% je prijateľné pre dôveryhodný diagnostický test. To môže byť preukázaná konzistencie s H. pylori
detekcie pomocou PCR a histológia zamestnaných v CG (53,1% a 52,7%, v uvedenom poradí) a PUD (61,2% a 62,6% v uvedenom poradí) pacientov (tabuľka 1). PCR detekovaný H. pylori Br &12,75% u pacientov s normálnou žalúdočnej sliznici, zatiaľ čo histológie bol pozitívny iba 0,8% vzoriek. Tieto výsledky možno vysvetliť citlivejší charakteristikou metódy na báze nukleových kyselín. S cieľom zlepšiť diagnózu H. pylori
niektorí autori uvádzajú analýzu viac biopsiou [44]. S cieľom potvrdiť špecifickosť PCR fragmentov získaných amplikónov, z dvoch vzoriek histologickej skúškou pre H. pylori
pozitívnych a dvoch vzoriek sa histologické vyšetrenie na H. pylori
negatívne boli sekvenované. BLASTN analýza všetkých štyroch biopsiou amplifikovaných fragmentov PCR s 23S rDNA H. pylori
špecifickými primery [Genbank: KF680642, Genbank: KF680643, Genbank: KF680644 a génovej banke: KF680645] odhalil totožnosť 100% s 23S rDNA referent k rôznym kmene H. pylori
. V súlade s tým vyvinutý test PCR je rýchle a presné, a môžu byť použité ako praktický spôsob pre detekciu H. pylori
infection.Table 1 klinickým výsledkom a porovnanie H. pylori diagnostické metódy
PUD ( n = 123)
CG (n = 706)
N (n = 290)
Jeho +
his-
His +
His
His +
his-

T
PCR +
63
13
76
286
89
375
1
36
37
488
PCR-
14
33
47
86
245
331
1
252
253
631
T
77
46
123
372
334
706
2
288
290
1119
CG
chronickej gastritídy, PUD
vredovej choroby, N
normálne žalúdočnej sliznice spojené, alebo nie refluxná choroba pažeráka (GERD), PCR
polymerázovú reťazovú reakciou, jeho
histológie. odporúča sa
antibiotickú liečbu žalúdočných chorôb keď H. pylori
diagnózy je pozitívny a je predpísané baktérie klasické eradikačná terapia v zložení klaritromycínu, amoxicilínu a inhibítora protónovej pumpy. Zvolená terapia je vysoký zlyhanie H. pylori
miery eradikácie v oblastiach, kde rezistencia na klaritromycín je vyššia ako 15%, pravdepodobne v reakcii na široké využitie tohto antibiotiká pre infekcie dýchacích ciest, najmä u detí [9]. Globálne primárne odpor H. pylori
na klaritromycínu pohybuje od 1 do 29% [46]. V Brazílii, niekoľko štúdií vykázali rezistencie na klaritromycín prevalenciu 7-16% u dospelých [19, 20, 22, 47] a 27% u detí [23]. Tak, aby sa zlepšila empirický výber H. pylori
spojené terapiu ochorení, sme skúmali regionálnu mieru H. pylori
rezistencie na klaritromycín prostredníctvom detekcie hlavné súvisiace bodových mutácií, A2142G a A2143G v doméne V H. pylori
23S rDNA.
Takže všetky 488 H. pylori
PCR pozitívne vzorky boli analyzované pomocou RFLP na 768 bp PCR fragmentu získaného s primermi Hp23Sr6 /7 reštrikčnými enzýmami MboII
a BsaI
, sa detekujú mutácie A2142G a A2143G v doméne V. H. pylori
23S rDNA, respektíve (obrázok 1). Iba 12 vzoriek (2,46%) ukázala, že mutované reštrikčné vzor, ​​troch (25%), nesúci mutáciu A2142G, sedem (58,3%), A2143G a jedna vzorka (8,7%) ukázala, ako mutácie rDNA bod v PCR 23S rDNA fragment 768 bp. U jednej vzorky čiastočným štiepením enzýmom MboII
(Obrázok 1). Tieto bodové mutácie A2142G a A2143G z amplikónov získaných z troch [Genbank: KF680646, Genbank: KF680647 a Genbank: KF680647] a sedem [Genbank: 680.649, Genbank: 680.650, Genbank: 680.651, Genbank: 680.652, Genbank: 680.653, Genbank: 680654 a Genbank: 680655] rôzne vzorky biopsie, v danom poradí, boli potvrdené sekvenovaním. Nebol zistený žiadny vzťah medzi klaritromycínu mutácie bod odporu H. pylori
s vekom alebo pohlavím (dáta nie sú uvedené) pacientov.
Prevalencia H. pylori
rezistencie na klaritromycín nájsť v našom regióne bol podobný tomu, ktorý našiel vo vyspelých krajinách, ako je Taliansko a [7] Nemecku a v rozvojovej krajine juhoamerickej Paraguaja [48]. Tieto výsledky potvrdzujú vysokú regionálnu variabilitu H. pylori
odolnosť voči antibiotikám a napriek zvýšeniu rezistencie na klaritromycín po celom svete, v Marilia, nízka miera rezistencie bola udržiavaná po dobu štyroch rokov. Navyše PCR /RFLP bola rýchla a presná metóda pre detekciu rezistencie na klaritromycín prostredníctvom mutácií génu priamo vo vzorkách žalúdočné biospsy a môžu byť použité spolu s histologicky rozhodovať o predpis na klaritromycín režimu obsahujúceho terapiu.
H. 23S rRNA domény V A2142G a A2143G bodové mutácie pylori
sú hlavnými mutácie nájdené v H. pylori
klinické izoláty rezistentné na klaritromycín. Zistili sme vyšší výskyt A2143G v porovnaní s A2142G mutácie v našich vzoriek, čo je v zhode s väčšinou brazílskych štúdií zahŕňajúcich štátov Minas Gerais, Sao Paulo a Recife [20, 34, 36]. A2143G ale nie A2142G bodová mutácia ukazuje synergický efekt klaritromycín alebo amoxicilín, ktoré boli použité spoločne v prvej línii H. pylori
režim [49], posilňuje nutnosť, aby túto záležitosť vyšetrila klaritromycín 23S rDNA bodovú mutáciu pred liečbou. Jedna vzorka kryl obe A2142G a A2143G mutácií v doméne V. H. pylori
23S rDNA, ktorá bola tiež nájdená v troch H. pylori
izolátov získaných od pacientov brazílskeho štátu Minas Gerais [20]. Tieto výsledky spolu s výskytom čiastočným štiepením časti 768 bp 23S rDNA PCR fragmentu (obrázok 1), môže byť indikatívne pre žalúdka kolonizácie viac kmeňov H. pylori
[50]. V
Minas Gerais, Brazília, klaritromycín rezistencie sa zvýšila z 4,48% v roku 1996 na 19,05% v roku 2000 [20], pravdepodobne v dôsledku použitia makrolidov v liečbe iných infekčných ochorení. Nezistili sme žiadny významný rozdiel vo vzorkách odolných voči klaritromycínu v závislosti na obdobie štúdie (dáta nie sú uvedené). Tieto dáta ukazujú, že v našom regióne predpisovaní a využitie makrolidov sa nevykonáva na vysokej úrovni. Ďalšie štúdie sú potrebné potvrdiť túto hypotézu.
Klaritromycín odpor znižuje klinickú účinnosť klaritromycínu na báze trojkombinácia. Avšak, ako prevalencia primárnej rezistencie H. pylori
klaritromycínu kvôli rDNA 23s A2142G a A2143G nukleotidových substitúciou zostáva na nízkej úrovni v Marilia, štandardné klaritromycín obsahuje trojkombináciu je stále platný ako najúčinnejší empirického prvej línie eradikačnej terapie pre H. pylori infekcie
.
závery
vyvinuté PCR cielenú na 23S rDNA génu baktérie H. pylori
je rýchle a presné, a môžu byť použité ako praktický spôsob pre detekciu H .pylori
infekcie priamo na žalúdočných biopsiou. Okrem toho H. pylori
23S rDNA PCR fragment získaný môže byť použitá na detekciu bodových mutácií od 1728 do 2495 bp domény V H. pylori
23S rDNA spojené so rezistencie na klaritromycín. Prevalencia primárnej rezistencie H. pylori
klaritromycínu z dôvodu 23s rDNA A2142G a A2143G nukleotidových substitúciou zostáva na nízkej úrovni v Marilia, tak štandardné klaritromycín obsahuje trojkombináciu je stále platný ako najúčinnejší empirického prvej línii k eradikačnej liečbe H. pylori
infekcie
Skratky
PUD :.
vredová choroba
CG:
Chronická gastritída

GERD:
refluxná choroba
PCR:
polymerázovej reťazovej reakcie
RFLP:
polymorfizmus dĺžky reštrikčných fragmentov.
deklarácia
Poďakovanie
sme vďační Dr. Adriana Augusta Pimenta de Barros za jej starostlivosť o všetci pacienti zaradení do štúdie a Alex Gusmão da Silva za jeho prínos v prevedení štatistickej analýzy. Táto práca bola podporená Fundação de Amparo Pesquisa robiť Estado de Sao Paulo (FAPESP), výskumných grantov 03 /01223-0, 08 /01394-4; Štipendiá Rabla 2008 /01395-0, GACL 2005 /02482-6, THH 2003 /03675-7.
Autori ďalej len "pôvodné predložený súbory obrazov
Nižšie sú uvedené odkazy na autorov pôvodnej predložených súborov pre obrázky. 12876_2013_1025_MOESM1_ESM.pdf autorov pôvodný súbor na obrázku 1 protichodnými záujmami
Autori vyhlasujú, že nemajú žiadnu konkurenčnú záujem.
Autorov príspevkov
RBS vykonávané spracovanie vzoriek, molekulárnej štúdie, interpretácia dát a podieľal na návrhu rukopisu. Rabla, GACL a THH vykonáva molekulárnej štúdie a prispel k získavaniu a interpretácie molekulárnych údajov; MAS navrhol experimenty, prispel k analýze dát a navrhol rukopis. Všetci autori čítať a schválená konečná rukopis.

• Nediferencovanej typu adenokarcinóme žalúdka: prognostický dopad troch histologických typov
• Bezpečnosť a predbežné výsledky perioperačnej chemoterapie a Hypertermická intraperitoneálna chemoterapia (hipec) u vysoko rizikových pacientov s rakovinou žalúdka