Nová štúdia vedená rakovinovým centrom Rogel University of Michigan kombinovala jednobunkové sekvenovanie RNA s dvoma ďalšími vyšetrovacími technikami, aby sa vytvoril údajne najrobustnejší a najpodrobnejší portrét siete interakcií, ktoré potláčajú imunitnú odpoveď tela v a okolo nádorov pankreasu.
Zistenia tímu, ktoré sa objavujú v denníku Rakovina prírody, dať nový dôraz na to, do akej miery sa imunitná odpoveď líši od pacienta k pacientovi a od nádoru k nádoru -; ktoré bude potrebné vziať do úvahy, pretože sa vyvíjajú nové kombinácie imunoterapie proti smrteľnej chorobe.
Rakoviny pankreasu jednoducho neboli citlivé na imunitnú terapiu, a tí z nás v tejto oblasti sa pokúšajú vyriešiť, prečo je to tak, čím je táto rakovina taká odlišná. To, čo chýbalo, je dokonca základné pochopenie rozmanitosti a individuálnych rozdielov v imunitnej odpovedi medzi pacientmi. “
Marina Pasca di Magliano, Ph.D., študovať hlavného autora, profesor chirurgie a bunkovej a vývojovej biológie v Michiganskej medicíne
Nový výskum položil základy pre budúce translačné štúdie a klinické skúšky, s konečným cieľom jedného dňa byť schopný použiť personalizované molekulárne profily na určenie, ktoré imunoterapie by boli najväčším prínosom pre každého pacienta, dodáva.
Roky sa pripravujú, štúdia predstavuje snahu takmer 40 U-M klinikov a vedcov z praxe, ktorí úzko spolupracujú na vytvorení súboru údajov, z ktorých môžu výskumné skupiny v tejto oblasti čerpať v nasledujúcich rokoch, hovorí tím.
Spolu s jednobunkovou analýzou skupina používala multiplexnú imunofluorescenciu a hmotnostnú cytometriu s vysokým rozlíšením -; ktorý kombinuje hmotnostnú spektrometriu a prietokovú cytometriu -; hodnotiť komplexnú biológiu vzoriek nádorov niekoľkými spôsobmi.
„Myslím si, že kľúčovou lekciou pre mňa ako klinika je, že začať imunoterapiu na liečbu tejto choroby bude aj naďalej náročné, pretože existujú komplikácie, ktoré si ešte len začíname uvedomovať, “hovorí spoluautor štúdie Filip Bednar, M.D., odborný asistent chirurgie. "Táto práca otvára dvere k porozumeniu týchto zložitostí a k zisteniu, ako by sme ich mohli prekonať."
Jedným z kľúčových zistení štúdie bol nový potenciálny biomarker, ktorý sa ukázal v krvnom obehu podskupiny pacientov s rakovinou pankreasu -; imunitný receptor nazývaný TIGIT (pre imunoreceptor T -buniek s doménami Ig a ITIM.)
„Keď ľudia hovoria o imunoterapii, v prvom rade hovoria o zacielení na niekoľko špecifických molekúl -; PD-1 a CTLA4, “hovorí spoluautor Howard Crawford, Ph.D., profesor molekulárnej a integratívnej fyziológie a vnútorného lekárstva. "Tieto výskumné snahy ukázali, že existuje oveľa viac než len títo dvaja zlí aktéri, ktorí brzdia imunitný systém a prispievajú k neúčinnosti imunitnej terapie. TIGIT bol sotva zásahom do radaru."
Dôležité je, vedci zistili, že expresia TIGITu v krvi pacientov úzko korešponduje s jeho aktivitou v nádoroch.
„To naznačuje, že by mohol existovať neinvazívny spôsob testovania jednotlivých pacientov, aby sa zistilo, či môžu byť kandidátmi na budúcu terapiu zameranú na konkrétny receptor kontrolného bodu -; čo by bolo významným pokrokom k súčasnému štandardu starostlivosti, “hovorí Nina Steele, Ph.D., postdoktorandský výskumný pracovník v laboratóriu Pasca di Magliano a jeden zo štyroch prvých autorov štúdie.
Ďalším unikátnym aspektom štúdie bola šírka a hĺbka odobratých vzoriek, poznamenávajú vedci.
Neobvykle, analýza zahŕňala významný počet vzoriek od pacientov s pokročilým karcinómom pankreasu. Len asi 1 zo 4 pacientov s rakovinou pankreasu je kandidátom na chirurgický zákrok, tí, ktorí majú ochorenie v skoršom štádiu, sú v mnohých štúdiách výrazne zastúpení, pretože sa spoliehajú na vzorky odobraté počas chirurgického zákroku, vysvetľuje spoluautorka prvej knihy Eileen Carpenterová, M.D., Ph.D., gastroenterológ.
Na začiatku svojej cesty proti rakovine však, väčšina pacientov má vzorku tkaniva odobratú ihlovou biopsiou, aby lekári mohli získať definitívnu diagnózu -; Carpenter preto koordinoval zber vzoriek výskumu súčasne.
Od pacientov boli odobraté aj vzorky krvi, umožniť vedcom skúmať zmeny v imunitných bunkách cirkulujúcich v krvi a korelovať ich s tým, čo sa deje v mikroprostredí nádoru pacienta, dodáva spoluautorka knihy Samantha Kempová, postgraduálny študent študujúci molekulárnu a bunkovú patológiu.
„Myslím si, že medzi výskumnými laboratóriami a klinikami často dochádza k prekvapivému prerušeniu, dokonca aj v niečom takom jednoduchom, ako je zber biologických vzoriek, „Tesár poznamenáva.“ Myslím si, že mosty, ktoré sme dokázali postaviť, a príspevky toľkých rôznych laboratórií skutočne hovoria o prostredí spolupráce na University of Michigan. Existuje dôvod, prečo sme tu mohli túto prácu dokončiť. “
Spolu s klinickým a laboratórnym úsilím analýza údajov bola pre štúdiu zásadná, Pasca di Magliano zdôrazňuje. Tieto snahy viedla spoločnosť Steel, Kemp a Veerin Sirihorachai, absolvent biológie rakoviny.
„Zvlášť pri jednobunkovom sekvenovaní, skutočné získavanie údajov je relatívne jednoduché, ale potom je analýza údajov neuveriteľne zložitá, „Hovorí Pasca di Magliano.
Pri jednobunkovej analýze priestorové informácie o bunkách sa stratia. Takže skupina, pod vedením spoluautora Timothyho Frankela, M.D., odborný asistent chirurgie, používal aj techniku nazývanú multiplexná imunohistochémia, ktorý umožňuje identifikáciu viacerých typov buniek v tkanivovom sklíčku pri zachovaní polohy nádorových buniek vzhľadom na zložky mikroprostredia.