A Michigani Egyetem Rogel Rákközpontja által vezetett új tanulmány az egysejtes RNS-szekvenálást két másik vizsgálati technikával kombinálta, hogy megteremtse az eddigi legerősebb és legrészletesebb portrét a szervezet immunválaszát elnyomó interakciók hálózatáról. és a hasnyálmirigy daganatok körül.
A csapat megállapításai, amelyek megjelennek a folyóiratban Természeti rák, tegyen új reflektorfényt arra, hogy az immunválasz nagymértékben változik betegekenként és daganatonként -; amelyeket figyelembe kell venni, mivel új immunterápiás kombinációkat fejlesztenek ki a halálos betegség ellen.
A hasnyálmirigyrák egyszerűen nem volt érzékeny az immunterápiára, és mi, akik a területen dolgozunk, megpróbáljuk megoldani, miért van ez, mitől más ez a rák. Hiányzik még az alapvető megértés is a páciensek közötti immunválasz változatosságáról és egyéni különbségeiről. "
Marina Pasca di Magliano, Ph.D., tanulmány vezető szerzője, a sebészet és a sejt- és fejlődésbiológia professzora a Michigan Medicine -ban
Az új kutatás megalapozza a jövőbeli transzlációs vizsgálatokat és klinikai vizsgálatokat, a végső cél, hogy egy nap személyre szabott molekuláris profilok segítségével határozzuk meg, mely immunterápiák jelentik a legnagyobb hasznot minden beteg számára, - teszi hozzá.
Évek készülőben, a tanulmány közel 40 UM klinikus és padtudós erőfeszítéseit képviseli, akik szorosan együttműködnek egy olyan adathalmaz kifejlesztésében, amelyre a területen dolgozó kutatócsoportok éveken keresztül támaszkodhatnak, - mondja a csapat.
Az egysejtes elemzés mellett a csoport nagyfelbontású multiplex immunfluoreszcenciát és tömegcitometriát alkalmazott -; amely ötvözi a tömegspektrometriát és az áramlási citometriát -; a daganatminták komplex biológiájának többféle módon történő értékelésére.
"Azt hiszem, a legfontosabb tanulság számomra klinikusként az, hogy az immunterápia működése ebben a betegségben továbbra is kihívást jelent, mert vannak olyan bonyolultságok, amelyeket még csak most kezdünk értékelni, "-mondja a tanulmány társszerzője, Filip Bednar, M.D., sebészeti adjunktus. "Ez a munka megnyitja az ajtót, hogy megértsük ezeket a bonyodalmakat, és kitaláljuk, hogyan tudnánk leküzdeni őket."
A vizsgálat egyik kulcsfontosságú megállapítása egy új potenciális biomarker volt, amely a hasnyálmirigyrákos betegek egy csoportjának vérkeringésében jelent meg -; a TIGIT nevű immunreceptor (Ig és ITIM doménnel rendelkező T -sejtes immunreceptorok esetében).
"Amikor az emberek immunterápiáról beszélnek, elsősorban pár specifikus molekula megcélzásáról beszélnek -; PD-1 és CTLA4, "mondja Howard Crawford társszerző, Ph.D., a molekuláris és integratív élettan és a belgyógyászat professzora. "Ezek a kutatási erőfeszítések azt mutatták, hogy sokkal több van, mint az a két rossz szereplő, akik gátolják az immunrendszert, és hozzájárulnak az immunterápia hatástalanságához. A TIGIT alig volt egy csepp a radaron."
Fontos, a kutatók azt találták, hogy a TIGIT expressziója a betegek vérében szorosan megfelel a tumorokban kifejtett aktivitásának.
"Tehát ez azt sugallja, hogy lehet egy nem invazív módszer az egyes betegek vizsgálatára annak megállapítására, hogy ők lehetnek -e jelöltek egy jövőbeni terápiára, amely az adott ellenőrzőpont -receptort célozza meg -ami jelentős előrelépés lenne a jelenlegi ellátási színvonalhoz képest, - mondja Nina Steele, Ph.D., posztdoktori kutató Pasca di Magliano laborjában és a tanulmány első négy szerzőjének egyike.
A vizsgálat másik egyedülálló aspektusa a begyűjtött minták szélessége és mélysége volt, - jegyzik meg a kutatók.
Szokatlanul, az elemzés jelentős számú mintát tartalmazott előrehaladott hasnyálmirigyrákos betegekből. A hasnyálmirigyrákos betegek közül csak körülbelül minden negyedik jelölt műtétre, így a korábbi stádiumú betegségben szenvedők sok vizsgálatban nagymértékben felülreprezentáltak, mivel a műtét során gyűjtött mintákra támaszkodnak, magyarázza társszerzője, Eileen Carpenter, M.D., Ph.D., gasztroenterológiai munkatárs.
Rákútjuk elején, azonban, a legtöbb betegnél szövettani mintát gyűjtöttek tűbiopsziával, hogy az orvosok végleges diagnózist kaphassanak -; így Carpenter egyidejűleg koordinálta a kutatási minták gyűjtését.
Vérmintákat is szedtek a betegektől, lehetővé téve a kutatók számára, hogy megvizsgálják a vérben keringő immunsejtekben bekövetkező változásokat, és összefüggésbe hozzák azokat a páciens tumor mikrokörnyezetében történtekkel, -teszi hozzá társszerző Samantha Kemp, végzős hallgató, aki molekuláris és sejtpatológiát tanul.
"Azt hiszem, gyakran meglepő szakadék van a kutatólaboratóriumok és a klinikák között, még olyan egyszerű dologban is, mint a biológiai mintavétel, "Carpenter megjegyzi." Úgy gondolom, hogy a hidak, amelyeket fel tudtunk építeni, és a különböző laboratóriumok hozzájárulása valóban a Michigani Egyetem együttműködési környezetéhez szólnak. Megvan az oka annak, hogy itt el tudtuk végezni ezt a munkát. "
A klinikai és laboratóriumi erőfeszítések mellett az adatok elemzése kritikus volt a tanulmány szempontjából, Pasca di Magliano hangsúlyozza. Ezeket az erőfeszítéseket Acél vezette, Kemp és Veerin Sirihorachai, rákbiológia végzős hallgató.
"Különösen az egysejtű szekvenálás, az adatok tényleges megszerzése viszonylag egyszerű, de akkor az adatok elemzése hihetetlenül bonyolult, - mondja Pasca di Magliano.
Az egysejtes elemzés során a sejtekre vonatkozó térinformációk elvesznek. Tehát a csoport, Timothy Frankel társszerző vezetésével, M.D., sebészeti adjunktus, a multiplex immunhisztokémia nevű technikát is alkalmazta, amely lehetővé teszi több sejttípus azonosítását egy szövetlemezen belül, miközben megőrzi a tumorsejtek helyzetét a mikrokörnyezet összetevőihez képest.