Frankräich hire Restaurant an molekulare bestemmt vun gastric Cancers zu Asians

Frankräich hire Restaurant an molekulare bestemmt vun gastric Cancers zu Asians VerfÜgung méiglech VerfÜgung Gastric Kriibs (GC) ass eng absolut heterogenic Krankheet, an et ass déi zweet Virwaat Ursaach vum Kriibs Doud vun der Welt. Gemeinsam Chimioen sinn net ganz effikass fir GC, déi oft Kaddoen den Diplôme oder metastatic Krankheet op Diagnos. Behandlung Optioune sinn limitéiert, an déi hätt fir fortgeschratt GCs ass aarmséileg. D'Landschaft vun Frankräich hire Restaurant zu GCs kierzlech duerch verschidden international Kriibs Nepgen Programmer charakteriséiert gewiescht, inklusiv Studien, déi exklusiv op GCs zu Asians konzentréiert. Dës Studien grouss onbekannt Chauffer kennen identifizéiert a gëtt neie Abléck an der mutational heterogeneity a genetesch Profiler vun GCs. Eng Analyse vun der Gentherapie Ausdrock Daten vun der Asian Cancer Research Group (ACRG) weider sënnlech véier verschidde molekulare bestemmt mat gutt-definéiert Medeziner Fonctiounen an hir intersections mat actionable genetesch hire Restaurant op déi cibléiert therapeutesch Agenten sinn entweder schonn sinn oder ënner Medeziner Entwécklung. An dësem Artikel, review mir de ACRG GC Projet. Mir diskutéieren och de Konsequenzen vun de genetesch a molekulare Conclusiounen aus verschiddenen GC Frankräich Studie mat Respekt méi preziser Diagnosen zu den Entwécklungslänner a Behandlung Approche fir GCs. VerfÜgung Schlësselwieder VerfÜgung Gastric Kriibs Cancer Nepgen cuisine subtyping Heterogeneity Oncogenic Automobilisten geziilte Therapie Background
Gastric Kriibs (GC) ass de véiert stäerkste gemeinsam Kriibs an der zweeter Virwaat Ursaach vum Kriibs Doud vun der Welt [1, 2]. Obwuel GC Heefegkeet vun de entwéckelt Welt an de leschte puer Joerzéngten ofgeholl huet, och weider d'Heefegkeet vun den Entwécklungslänner, besonnesch an asiatesch Länner, ze klammen. Joer, si bal eng Millioun nei festgestallte, an 72.000 Leit vun GC stierwen. Gastric Kriibs an China eleng Konte fir iwwer 40% vun all nei Fäll vun der Welt, an der veruerteelt an China ass e puer Mol méi héich wéi déi global Duerchschnëtt [3-5]. De GC Heefegkeet ass schlecht iwwert déi nächst 40 Joer an China wéi d'Populatioun Alterskategorien kontinuéierlech ze klammen. VerfÜgung Gastric Cancers weisen héich heterogeneity a verschiddene pathobiology ganze geographesch Regiounen, ethnicities, a Geschlechter, déi wahrscheinlech de verschiddenen etiologies flénke GC Entwécklung spigelen [6, 7]. GC ass Traditionell an zwee Haaptgrënn histological bestemmt séiert, diffusen an intestinal, baséiert op anatomic Plazen um proximal an distal Mo. Regiounen, bzw.. Intestinal GCs sinn dacks mat Helicobacter pylori VerfÜgung Wonn, ongesonder Ernährung, an Tubak, verbonne deen zu den Entwécklungslänner asiatesch Länner gemeinsam sinn [7]. Op der aner Hand, éischter diffusen GCs mat genetesch abnormalities [6] verbonne ginn. Déi meescht GC Fäll vun entwéckelte Länner si wéi den diffusen subtype festgestallte hierkommen meeschte Fäll an asiatesch Länner un der intestinal subtype gehéieren [6]. D'heterogeneity vun GCs ass weider duerch de Mangel vun Ekzeptioun akzeptéiert Behandlung Optiounen an der Welt erëmfannen. Verschiddene Länner adoptéieren typesch ënnerschiddlech Behandlung regimens, an e puer Klassifikatioun ofgeséchert fir GCs si proposéiert [6, 7]. VerfÜgung dene leschte puer Joerzéngten, Efforten de Medeziner Resultater fir GC Patienten, wéi fréi ze erkennen duerch d'national Präventiounsprogramm ze verbesseren a radikal Agrëff, hunn d'Iwwregens hätt vun GC zu Japan verbessert a Korea, wou eng héich GC Heefegkeet misst eng Natioun-grouss Präventiounsprogramm [6]. Moment, komplett chirurgesch resection representéiert just Potential curative Behandlung fir fréi-Etapp GCs. Allerdéngs, d'Majoritéit vun de GC Patienten präsent mat fortgeschratt Krankheeten bei Diagnos an China an aneren Entwécklungslänner datt en fortschrëttlechen Gesondheetswiesen Infrastruktur opgepasst, besonnesch am ländleche Raum. Trotz Efforten am Traitement Ufuerderungen, Chimiotherapie an radiotherapy hunn net vill déi fir Patiente 5-Joer Iwwerliewe Taux verbessert mat fortschrëttlechen (Etappen III a IV) Krankheeten [1, 8]. Dëst opgepasst wesentleche Fortschrëtt am Chimiotherapie an radiotherapy ass net ganz onerwaarten wéi dës Therapien typesch blanner an hir Aktivitéit géint proliferating Zellen sinn; och, goufen dës Therapien mat keng Rücksicht vun Kriibs heterogeneity entwéckelt. Individuell GCs bewisen héich heterogeneity, souwuel de histological a molekulare Niveauen, a Frankräich studéiert. Dëst heterogeneity sécherlech spillt eng wichteg Roll net nëmmen am Krankheet Werdegang mä och an der Äntwert op eng Therapie an dono Entstoe vun Resistenz. Zum Beispill, verbessert an enger subpopulation vun GC Patienten mat ERB-B2 receptor tyrosine kinase 2 (ERBB2 VerfÜgung) amplification, déi nieft vu Stad zu Standard 5-fluorouracil a Platin Chimiotherapie vill Punkto Iwwerliewe [9]. Dëst brengt ënnersträicht d'Wichtegkeet vun, wéi och de Besoin fir, molekulare characterization an subtyping vun GCs sécher a méi efficacious Behandlung Optiounen ze entwéckelen. VerfÜgung rezenten Ausdrock nächste-Generatioun sequencing an der Gentherapie Studien op GC profiling hunn ugefaangen eng ëmfaassend ze etabléieren Landschaft vu Frankräich hire Restaurant. Si hunn och eng Rei vun actionable genetesch Automobilisten als Drogenofhängeger Ziler oder diagnostic biomarkers identifizéiert. Ausserdeem, ass klinesch relevant molekulare bestemmt vun GC definéiert der Kombinatioun vun global Ausdrock Gentherapie mat longitudinal Medeziner Donnéeën profiling. An dësem Artikel, diskutéieren mer d'asiatesch Cancer Research Group (ACRG) GC Projet an Highlight bedeitendst Conclusiounen a molekulare Abléck datt fir Entwécklungslänner méi effikass geziilte Therapien an korrekt diagnostic Approche fir GC. VerfÜgung Frankräich hire Restaurant zu GCs zu Asians benotzt ka
fir d'Frankräich Basis an Basisdaten genetesch heterogeneity vun GCs dissect, erausgewielt ACRG engem diffusen GC-beräichert Kohort vun Samsung Medical Center, Korea. D'ACRG dann standing ganzt-Nepgen sequencing (WGS) op 49 Fäll vun fortgeschratt Etapp erhéijen (Etapp IV, 19 Fäll; Etapp III, 29 Fäll; a Etapp II, 1 Fall) mat héije entholl Zell Inhalter a reagéiert Randerscheinung Bluttprouwen [10 ]. Drësseg-eent entholl Echantillon waren diffusen, a 18 goufen intestinal, microsatellite stabil (Camion wäit) GC. VerfÜgung Deep WGS identifizéiert genetesch hire Restaurant a weider verroden stattfannen heterogeneity an Ënnerscheeder tëscht der diffusen an intestinal bestemmt vun GC, engem molekulare Basis suergt fir hir ënnerscheedlecher pathobiology an Iwwregens hätt. D'Zuel vun somatic Varianten vun den eenzelne Kriibs Nepgen schwankt daitlech, rangéiert vun 172 bis 38.328 mat enger Steiren vun 9036 Varianten pro entholl. Eng total vun 4528 somatic kennen an 2553 Genen huet festgestallt, mat 384 Genen vun op d'mannst zwee erhéijen mutated. Eng Analyse vun bedeitend mutated Genen bekannt kennen GCs confirméiert datt virdrun identifizéiert, wéi entholl FAQ 53 (TP53 VerfÜgung), OP-räiche interaktiv Domain 1A (ARID1A VerfÜgung) gouf, transforméiert Wuesstem Faktor Beta receptor 2 (TGFβR2 VerfÜgung), an cadherin 1 (CDH1 VerfÜgung). D'Analyse sënnlech och nei vill Genen mutated, dorënner spectrin widderhuelen-haltege, nuklear Enveloppe 1 (SYNE1 VerfÜgung; n VerfÜgung = 10, 20%) an transmembrane protease, serine 2 (TMPRSS2 VerfÜgung; n VerfÜgung = 3, 6%) vun dëser koreanesch Kohort [10]. Der biologescher Bedeitung vun der SYNE1 VerfÜgung an TMPRSS2 VerfÜgung kennen GCs bleift experimentally a klinesch lant gin. Onbekannt SYNE1 VerfÜgung kennen sech éischter an Gehirtumoren multiforme (GBM) erhéijen identifizéiert [11]. SYNE1 VerfÜgung polymorphism ass mat invasiv epithelial spillt Kriibs Risiko verbonnen [12]. Spannen, Kierzunge association Analyse vun somatic kennen an Gentherapie Ausdrock Ännerungen am GBM identifizéiert SYNE1 als eng grouss Node VerfÜgung; SYNE1 VerfÜgung kennen hun drastesche Auswierkungen op den Ausdrock vun 543 Genen, dorënner net fonnt Reparatur Genen MutS homolog 6 (MSH6 VerfÜgung) an MutL homolog 1 (MLH1 VerfÜgung). Hir Auswierkungen sinn nëmmen zweet bis den Auswierkunge vun isocitrate dehydrogenase 1 (IDH1 VerfÜgung) kennen [13]. Clonal Analyse vun der somatic Variatioune verroden, datt de intestinal subtype vun GC huet bedeitend méi héich ploidy an clonality wéi den diffusen subtype [10]. Déi niddreg clonality am diffusen subtype vun GC observéiert Kuuscht Präsenz vun bedeitend Zollformalitéiten-entholl heterogeneity, déi fir d'Entstoe vun Drogenofhängeger Resistenz Medeziner Konsequenzen huet. D'Resultater och eng plausibel Erklärung fir déi Aarm hätt vun der diffusen subtype vun GC. D'Zollformalitéiten-entholl heterogeneity an clonality zu GCs sech och zu engem Frankräich profiling Etude vun GC Patienten am Norden China gewisen, datt WGS Donnéeën vun zwee GC Patienten mat abegraff, all mat dräi Primärschoule erhéijen an zwee passende metastatic lymph Wirbelen [14]. VerfÜgung d'intestinal subtype vun GC weist och méi strukturell Variatiounen wéi den diffusen subtype [10]. Dës Ännerungen och Gentherapie Fusioun, br, a kopéieren Zuel Variatiounen (CNVs). Acyl-Coa-verbindlech Domain-haltege 5-Zénk Fanger E-Box-verbindlech homeobox 1 (ACBD5 VerfÜgung -ZEB1 VerfÜgung), héieren widderhuelen-haltege FAQ 52 (WDR52 VerfÜgung) -TGFβR2 VerfÜgung, Sine oculis-verbindlech FAQ homolog-mesenchymal-epithelial Transitioun Faktor (SOBP VerfÜgung -MET VerfÜgung), an lactation-nik FAQ 1 (LACE1 VerfÜgung) -MET VerfÜgung fusions vun ëmgedréint Transkriptiouns-polymerase Kette Reaktioun bestätegt goufen (RT-Hinnen alleguer) an Sanger sequencing. D'overexpression vun epidermal Wuesstem Faktor receptor (EGFR VerfÜgung), kennegeléiert VerfÜgung an ERBB2 VerfÜgung amplifications waren esouwuel unisse zu situ hybridization an immunohistochemistry validéiert. Dës genetesch Verännerungen waren an der TP53 VerfÜgung -mutant Hannergrond haaptsächlech un Observatiounsongenauegkeeten, a si beaflosse sech géigesäiteg exklusiv. Am Allgemengen hunn, Kriibs Zellen vun der diffusen subtype manner genetesch hire Restaurant a si meeschtens behënnerte. Projet'en am CDH1 VerfÜgung, catenin alpha-1 (CTNNA1 VerfÜgung), oder phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase, Katalysator subunit alpha (PIK3CA VerfÜgung) sinn och mat der diffusen subtype verbonne ginn bekannt vun ierflech GC [10]. Déi héich stattfannen opbauen an doraus Tendenz-antigens sinn am entholl immun Äntwert agebonne [15]. Am Accord, onbekannt programmed Doud-ligand (Haaptleit VerfÜgung -L VerfÜgung) 1 VerfÜgung an Haaptleit VerfÜgung -L2 VerfÜgung Gentherapie amplifications sech identifizéiert, besonnesch am Epstein-Barr Virus-positiv (EBV +) intestinal GCs [16]. Dës Méiglechkeet ass ganz interessant aus dem medezineschen Perspektiv, an et ass wichteg Donnéeën fir effikass immunotherapy fir GCs entwéckelen. Allerdéngs huet e rezent Retrospektiv Analyse vun iwwer 1000 GC Gentherapie Ausdrock profiling Donnéeën datt GCs am Western an asiatesch Länner an hir immun Äntwert Ënnerschrëfte ënnerscheeden. GCs am westlechen Länner, déi méi oft vun der diffusen subtype sinn, gi mat enger Beräicherung vum entholl-infiltrating T Zellen [17] assoziéiert. Obwuel d'Resultater vun dëser grouss Retrospektiv Analyse spezielle sinn, mussen se duerch mèi Studien validéiert ginn, déi speziell heifir sinn geographesch Effekter ze vergläichen. De Litige Entwécklung vun immun Bomm inhibitors, programmed Doud 1 (Haaptleit-1) an Haaptleit-L1 monoclonal antibodies, an GCs hëlleft definéieren, wéi Frankräich hire Restaurant der entholl immun Äntwert Afloss. VerfÜgung d'Passerelle-Analys weist dat onbekannt kennen geschéien zu verschiddene Zell Haftung, axon Orientatioun, an transforméiert Wuesstem Faktor β (TGFβ) Weeër [10]. TGFβ sécher reguléieren Zell Prolifératioun an Hien der immun Äntwert, an déi kennen dat Passerelle sinn och an aneren GC Frankräich Studien identifizéiert [14, 18]. Et ass interessant, dass TGFβR2 VerfÜgung vun der ACRG identifizéiert Projet'en sinn inactivating kennen net [10]. D'Bedeitung vun onbekannt TGFβR2 VerfÜgung genetesch hire Restaurant am Kontext vun immunotherapy brauch weiderhin ze ginn. Axon Orientatioun Molekülle sinn zu Regulatioun Zell Wanderung an apoptosis zu Kriibs agebonne [19]. Projet'en vun dësen Molekülle sech virdrun an pancreatic ductal adenocarcinoma observéiert [20]. An dëser Koreanesch GC Kohort, axon Orientatioun Passerelle kennen ephrins, netrins, semaphorins, an Schlitzer sech duerchaus verwandelt an zu 59% (n VerfÜgung = 29) vun de analyséiert erhéijen [10] observéiert. Géigensäiteg exklusiv Projet'en am ephrins an Sai glycoprotein /Rond receptor (Sai ​​/Kontributiounen) Passerelle Genen weg datt se Chauffer kennen Kriibs Entwécklung sinn. Inactivation vun Sai homolog 2 (SLIT2 VerfÜgung) vun RNS Amëschen (RNAi) ënnerstëtzt GC Zell Wuesstem datt duerch Aktivatioun vun FAQ kinase B /catenin, Beta 1 (AKT /CTNNB1) sécher [21] mediated ass. D'axon Orientatioun sécher Passerelle e Potential Roman Kriibs therapeutesch Zil ass. VerfÜgung Aner Frankräich Studie vun GC VerfÜgung Als zesummegefaasst Table 1, eng grouss Lëscht vu Frankräich Etüden, inklusiv der ACRG Projet, goufen onofhängeg duerchgefouert [10, 14, 16-18, 22-31]. D'Majoritéit vun dëse Studien hunn zu Korea op GCs do [10, 17, 22-25], China [14, 17, 18, 26], Singapur [17, 22, 27], a Japan [28], bidden d'medezinesch Bedeitung vun GCs an dëse Länner. D'molekulare Conclusiounen aus dës Studie bestätegen déi genetesch heterogeneity vun GCs. Si z'identifizéieren och eng gemeinsam Formatioun vun genetesch hire Restaurant, wéi CDH1 VerfÜgung an Ras homolog Familljemember A (RhoA VerfÜgung) Projet'en, datt mat der diffusen subtype vun GCs aus verschiddene geographeschen Regiounen verbonne sinn, wat beweist, datt d'Cancers engem deelen gemeinsam genetesch Hierkonft. Als CDH1 VerfÜgung an RhoA VerfÜgung Zell motility regléieren, déi kennen an dëse Genen Offer engem mechanistic Basis fir d'héich malignant phenotype vun Pro ënnerscheet Zellen, dorënner groussaarteg einfach an stromal Aféierungs- vun diffusen GCs. Dës Frankräich Conclusiounen sinn konsequent mat Observatioune datt den diffusen subtype vun GC ass mat genetesch abnormalities verbonnen, an e puer vun dësen sinn ierflech. Wéinst dem, ass den intestinal subtype vun GC méi verbonne mat Ëmwelt- factors.Table 1. Satz vun Frankräich Studien op gastric Kriibs (GC)
Sample Gréisst
Herkunft VerfÜgung Referenz
zu Histologie (Lauren d'Zort)
Technology Plattform VerfÜgung cuisine subtype
Intestinal
Firwat
Bréissel VerfÜgung
net spezifizéierter
Wes
WGS
RNAseq
SNP /Nummer microarray Kopie
geziilte sequencing
Gene Ausdrock microarray VerfÜgung DNA methylation profiling
[10] zu 49 (Camion wäit nëmmen) VerfÜgung koreanesch VerfÜgung 18 zu 31 zu 0 VerfÜgung 0
√ VerfÜgung NA VerfÜgung [14] zu 294 VerfÜgung Northern Chinese VerfÜgung 139 zu 155 VerfÜgung 0 VerfÜgung 0 VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung High clonality an niddreg clonality VerfÜgung [16] zu 75 VerfÜgung asiatësch VerfÜgung 196 VerfÜgung 69 zu 19 zu 11 VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung EBV +, MSI, GS, an Cin 220 VerfÜgung non-asiatësch VerfÜgung [17] zu 890 VerfÜgung asiatësch VerfÜgung 0
VerfÜgung 0 0 VerfÜgung 1016 VerfÜgung √ VerfÜgung NA VerfÜgung 126 VerfÜgung non-asiatësch VerfÜgung [18] zu 100 VerfÜgung Chinese (Hong Kong) VerfÜgung 57
29 zu 14 zu 0 VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung NA VerfÜgung [22] zu 386 VerfÜgung Singaporean VerfÜgung 253
183 VerfÜgung 82 VerfÜgung 3 VerfÜgung √ VerfÜgung Frankräich intestinal a Frankräich diffuse
65
Korean
70
Australian
[23]
19
Korean
5
14
0
0
√
√
NA VerfÜgung [24] zu 300 VerfÜgung Koreanesch VerfÜgung 150 zu 142 VerfÜgung 8 VerfÜgung 0 VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung Camion wäit /TP53- , Camion wäit /TP53 +, Camion wäit /EMT, an MSI VerfÜgung [25] zu 103 VerfÜgung koreanesch VerfÜgung 61 zu 36 VerfÜgung 5 zur VerfÜgung 1 VerfÜgung √ VerfÜgung √
NA VerfÜgung [26] zu 22 VerfÜgung Chinese (Hong Kong) VerfÜgung 18 VerfÜgung 2 VerfÜgung 2 VerfÜgung 0 VerfÜgung √ VerfÜgung NA VerfÜgung [27 ] VerfÜgung 15 VerfÜgung Singaporean VerfÜgung 11 VerfÜgung 3 VerfÜgung 1 VerfÜgung 0 VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung NA VerfÜgung [28] VerfÜgung japanesch 87
0 VerfÜgung 87 VerfÜgung 0 VerfÜgung 0 VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung NA VerfÜgung [29] zu 36 VerfÜgung non-asiatësch <12 br> 10 zu 14 zu 0 VerfÜgung √ VerfÜgung Proximal Net-diffusen, diffusen, an distal Net-diffusen VerfÜgung [30] zu 17 VerfÜgung non-asiatësch VerfÜgung 0 VerfÜgung 0 VerfÜgung 0 VerfÜgung 51 VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung √ VerfÜgung NA VerfÜgung 34 VerfÜgung Vietnamesesch VerfÜgung [31] zu 116 VerfÜgung non-asiatësch VerfÜgung 12 zu 24 zu 0 VerfÜgung 80 VerfÜgung √ VerfÜgung NA VerfÜgung Wes VerfÜgung ganzt-exome sequencing, WGS VerfÜgung ganzt-Nepgen sequencing , RNAseq VerfÜgung RNS sequencing, SNP VerfÜgung Single-Nukleotid polymorphism, Camion wäit VerfÜgung stabil microsatellite, VerfÜgung NA net sinn, EBV VerfÜgung, Epstein-Barr Virus, MSI VerfÜgung microsatellite Instabilitéit, GS
genomically stabil, Cin VerfÜgung chromosomal Instabilitéit, TP53 VerfÜgung entholl FAQ 53, EMT VerfÜgung epithelial-ze-mesenchymal Transitioun VerfÜgung awer, Frankräich Studien op GCs aus China, Korea, Japan, an Russland och identifizéiert Net-phpNuke, vill Genen mutated oder Weeër an verschidden cohorts verännert. Zum Beispill, identifizéiert der ACRG Etude SYNE1 VerfÜgung kennen an 20% vun GCs als eng wiesentlech mutated Kriibs Gentherapie [10], déi interessant biologescher Konsequenzen huet wéi virun diskutéiert. Eng Etude vun engem anere Koreanesch Kohort entdeckt B Zell lymphoma 2 wéi 1 (BCL2L1 VerfÜgung) amplification zu 18,4% a Läsche vun Liewer Kriibs 1 (DLC1 VerfÜgung) kennen an 10,9% vun GC Fäll [25]. Déi Frankräich hire Restaurant zu BCL2L1 VerfÜgung an DLC1 VerfÜgung Afloss Drogenofhängeger Empfindlechkeet vun GCs. BCL2L1 VerfÜgung amplification gewësse Sensibilitéit fir d'BLC2L1 inhibitor wann a Kombinatioun mat chemotherapeutic Agenten benotzt. DLC1 VerfÜgung kennen Promotioun Aktivatioun vun Rho /Rho-verbonne FAQ kinase (ROCK) kinase Aktivitéit a maachen Zellen géintiwwer kinase inhibitors zu ROCK [25]. Zousätzlech, e Studium op enger Kohort aus North China standing identifizéiert heefeg Projet'en am neuregulin 1 (NRG1 VerfÜgung) an ERBB4 VerfÜgung Genen [14]. Roman Frankräich hire Restaurant duerch verschidden Etuden identifizéiert weider d'Komplexitéit an heterogeneity vun GCs hindeiten, wat och de Spekulatiounen hin, datt zousätzlech Frankräich hire Restaurant bleift identifizéiert ginn. Et ass ze bemierken, datt d'Echantillonen an dës GC Frankräich Studien sinn kleng; d'Echantillonen och normalerweis manner wéi 100 Fäll. Nëmmen profiléiert der Cancer Genom Atlas (TCGA) Projet eng grouss Kohort vun Patienten (n VerfÜgung = 295); 75% vun de Patienten goufen Caucasians (Russen, Amerikaner, Polen, Ukrainer, an Däitschen), an de Rescht Patienten goufen Asians (South Süd an Hotel) [16]. Nieft Schwieregkeeten mat klengen Echantillonen, Differenzen am Frankräich Technologie Quaien an Bioinformatik aneren kann ënnert d'Studien identifizéiert am Frankräich hire Restaurant op d'Differenzen matgehollef hunn. Iwwerhaapt, Li et al. [32] standing eng Retrospektiv, integréiert Analyse vun 544 GC Frankräich Donnéeën Echantillon vun virdrun Frankräich Studien eng verbessert Bioinformatik da mat vill mutated Genen ze identifizéieren. Dës Analyse identifizéiert sechs virdrun unreported, vill mutated Genen an 12 Genen onbekannt mutated datt héich prevalence weise wéi virdrun realiséiert. Dës Conclusiounen hindeit datt méi profiling Studien déi grouss Echantillonen fir all Patient Populatioun deeër selwechter fortgeschratt Frankräich profiling Plattform a Bioinformatik da benotzt waren kann globaalt fir festzestellen a Frankräich hire Restaurant op verschiddene GC cohorts Markenzeeche. VerfÜgung cuisine subtyping vun GCs zu Asians VerfÜgung déi héich molekulare heterogeneity vun GCs, wéi am Frankräich Studien bewisen, ënnersträicht weider de Besoin fir molekulare subtyping vun GCs Iwwregens hätt, Diagnos, a Behandlung Resultater ze verbesseren. Molekulare subtyping vun heterogen erhéijen, wéi Broscht an haett Cancers, huet enorme Medeziner Virdeeler dës Distanz an huet Behandlung Praktiken definéiert. Broscht Kriibs war am Ufank an véier grouss bestemmt séiert, luminal, Mënsch epidermal Wuesstem Faktor 2 (HER2) -enriched, basal-wëll, an normal Broscht-wëll, baséiert op der Gentherapie Ausdrock Musteren no cDNA microarrays [33]. D'bestemmt sech dono weider verbessert, an si sinn am Moment als luminal A, luminal B, HER2-beräichert, an basal-wëll bestemmt [34] bekannt. An de leschte Joer, fënnef Roman Gentherapie Ausdrock prognostic Tester fir Broscht Kriibs entwéckelt goufen. Dës Tester déi méi verléisslech a reproducible Resultater wéi immunohistochemistry-baséiert assays mat Respekt ze behandelen Optioun Auswiel [34]. Déi vill mutated Genen a Weeër an dës bestemmt weider d'Entwécklung vun Therapien guidéiert hunn, datt géint dës genetesch hire Restaurant cibléiert ginn. Nieft der CSSF WGS Etude vun 49 gastric entholl uplanzen VerfÜgung datt d'mutational Landschaft vun GC évaluéieren, zeechent d'ACRG 251 zousätzlech Primärschoul gastric erhéijen vun der Gentherapie Ausdrock profiling, Nepgen-grouss Kopie Zuel microarrays, a cibléiert Gentherapie sequencing ze identifizéieren a klinesch relevant molekulare bestemmt duerch integréiert Analyse vun Frankräich hire Restaurant, Survival Resultat, an um Terrain Donnéeën [24] definéieren. D'ACRG kritt 300 Primärschoul GC entholl uplanzen vun Samsung Medical Center, déi op der Basis vun iwwer 60% histological Rengheet an Disponibilitéit vun langfristeg Suivi Donnéeën ausgewielt goufen. Prinzip Volet (PC1-3) Analyse gouf op der Ausdrock Donnéeën gesuergt, an d'Resultater goufen am Verglach mat engem klenge Pre-géissen vun der Gentherapie Ausdrock Ënnerschrëfte fir d'epithelial-ze-mesenchymal Transitioun (EMT), microsatellite Instabilitéit (MSI), cytokine sécher, Zell Prolifératioun, DNA methylation, TP53 Aktivitéit, an déi normal gastric Otemschwieregkeeten [35]. D'Analyse klassifizéiert den 300 gastric entholl uplanzen an de folgende véier molekulare bestemmt: MSI (n VerfÜgung = 68), Camion wäit /EMT (n VerfÜgung = 46), Camion wäit /TP53 + (n VerfÜgung = 79), a Camion wäit /TP53 - (n VerfÜgung = 107). D'TCGA och GCs séiert an véier bestemmt, dorënner EBV +, MSI, genomically stabil (GS), an chromosomal Instabilitéit (Cin). Wichteg, huet de ACRG subtype Klassifikatioun och an der Gentherapie Ausdrock konsultéieren vun der TCGA Kohort [16] an engem Singapur Kohort [36], obwuel den Undeel vun all molekulare subtype variéiert ganze konsultéieren kopéiert. Dës Variant kann de bekannte geographescher heterogeneity vun GCs spigelen. VerfÜgung D'ACRG molekulare bestemmt mat verschidde Krankheete Charakteristike vun GC verbonne ginn [24]. D'Majoritéit vun Camion wäit /EMT subtype GC Fäll (> 80%) huet als diffusen Typ op der Bühn III /IV festgestallte a Priedegt vill jonk Alterskategorien wéi déi aner bestemmt. Wéinst dem Accident vum MSI subtype Kannerbetreiung um antrum (75%), an iwwer 60% goufen als déi intestinal subtype an op eng fréi Etapp (I /II) diagnostizéiert. Ausserdeem, ass EBV Wonn méi dacks am Camion wäit /TP53 - Grupp wéi an anere Gruppen. Survival Analyse weisen eng substantiell Ënnerscheed tëschent véier molekulare bestemmt; de Camion wäit /EMT subtype zougedréckt Schlëmmst hätt, an de Camion wäit subtype zougedréckt a dem beschten hätt, déi duerch de Camion wäit /TP53 + a Camion wäit /TP53 duerno war - bestemmt. Doriwwer eraus, huet de Camion wäit /EMT Grupp och eng héich Taux vun Terrain, wéi d'Grupp MSI. De Camion wäit /EMT Grupp no ​​engem héije Prozentsaz (64%) vun der éischter Plaz vun den Terrain mat peritoneal Morden an engem nidderegen Prozentsaz vun Liewer Metastasen (4,6%) wéi aner Gruppen. E Verglach vum ACRG bestemmt [24] mat der TCGA bestemmt [16] souvill zougedréckt a dem erhéijen mat MSI an eng Beräicherung vun der TCGA GS, EBV +, an Cin bestemmt an der ACRG Camion wäit /EMT, Camion wäit /TP53 +, a Camion wäit /TP53 - bestemmt wou souwuel konsultéieren applizéiert. Allerdéngs goufen d'TCGA Cin an GS bestemmt presentéieren an all ACRG bestemmt an der ACRG Donnéeën. D'TCGA Kohort no engem nidderegen Prozentsaz vun diffusen subtype Fäll wéi déi ACRG Kohort (24% zu TCGA vs. 45% vun ACRG). Spannen, huet d'Majoritéit vun der TCGA diffusen subtype Fäll (57%) an der TCGA GS subtype, mä just 27% vun de Fäll präsent waren an der ACRG Camion wäit /EMT subtype, suggeréiert, dass d'TCGA diffusen subtype Fäll manner heterogen goufen. D'Analyse hindeit, datt d'ACRG molekulare Klassifikatioun vun GCs eenzegarteg ass a klinesch relevant. VerfÜgung geziilte sequencing an CNV Analyse Teamchef molekulare bestemmt mat Duerchsetze somatic hire Restaurant verbonne sinn, sinn der vill, déi klinesch relevant a actionable [24]. D'MSI subtype Schatzkummer zwéinHyperfeinstrukturniveaue-stattfannen mat verwandelt Projet'en am Kirsten Grenzwäerter sarcoma Haren oncogene homolog (KRAS VerfÜgung; 23,3%), phosphoinositide 3 kinase-phosphatase an tensin homolog-mechanistic Zilscheif vun rapamycin (PI3K-PTEN-mTOR) Passerelle Genen (50,6%), anaplastic lymphoma kinase (ALK VerfÜgung; 16,3%), an ARID1A VerfÜgung (44.2%). Par contre, Schatzkummer de Camion wäit /EMT subtype eng niddreg Zuel vun Projet'en. De Camion wäit /TP53 - subtype hu méi CNVs a war mat onbekannt Brennwäit amplification zu ERBB2 VerfÜgung, EGFR VerfÜgung, Cyclin E1 (CCNE1 VerfÜgung), Cyclin D1 (CCND1 VerfÜgung), murine verbonne duebel Minutt 2 (MDM2 VerfÜgung), Rondpoint homolog 2 (ROBO2 VerfÜgung), Gata-verbindlech FAQ 6 (GATA6 VerfÜgung), an v-Myc Vullegripp myelocytomatosis Haren oncogene homolog (MYC VerfÜgung). Wichtegst, ERBB2 VerfÜgung, EGFR VerfÜgung, CCNE1 VerfÜgung, an CCND1 VerfÜgung amplifications sinn géigensäiteg exklusiv, wat beweist, datt se Chauffer hire Restaurant sinn. D'Identifikatioun vun Frankräich hire Restaurant an molekulare bestemmt, wéi am Frankräich Studien zu dësem Artikel diskutéiert gesuergt, déi wichteg biologescher Abléck an der Biologie vun GCs. D'Asiicht dann hëlleft d'Entwécklung vun geziilte Therapien Guide datt effektiv bestemmt vun GC (Table 2) .Table 2 Satz vun klinesch relevant a actionable Frankräich hire Restaurant an molekulare bestemmt vun GC VerfÜgung Ënnergrupp Plëséier kann VerfÜgung Key kennen VerfÜgung
Key CNV Evenementer VerfÜgung Brunel Entwécklung
MSI VerfÜgung KRAS, PIK3CA (H1047R), PTEN, mTOR, ARID1A VerfÜgung ganz puer hire Restaurant VerfÜgung MEK- Erk an PI3K-mTOR Passerelle inhibitors, immunotherapies VerfÜgung Camion wäit /EMT VerfÜgung PIK3CA, RhoA VerfÜgung CCNE1 VerfÜgung PI3K-mTOR, CDK2, an ROCK inhibitors VerfÜgung Camion wäit /TP53- VerfÜgung TP53
CCND1, CCNE1, ERBB2, EGFR, KRAS, MYC VerfÜgung RTK-Schwéierpunkt Agenten, MEK-Erk, CDK4 /6, an CDK2 inhibitors VerfÜgung Camion wäit /TP53 + VerfÜgung ARID1A, PIK3CA (E542 /545K)
CCNE1, KRAS VerfÜgung MEK-Erk, CDK2, an PI3K-mTOR Passerelle inhibitors VerfÜgung CNV VerfÜgung Kopie Zuel Variant, Kirsten Grenzwäerter sarcoma Haren oncogene homolog, PIK3CA VerfÜgung phosphatidylinositol-4,5 VerfÜgung KRAS -bisphosphate 3-kinase, Katalysator subunit alpha, PTEN VerfÜgung phosphatase an tensin homolog, mTOR VerfÜgung mechanistic Zilscheif vun rapamycin, ARID1A VerfÜgung oP-räiche interaktiv Domain 1A, MEK VerfÜgung mitogen-ageschalt FAQ kinase kinase, Erk VerfÜgung extracellular Signal-reegelen kinase, phosphoinositide 3 kinase VerfÜgung PI3K, RhoA VerfÜgung Ras homolog Familljemember A, CCNE1 VerfÜgung cyclin E1, CDK VerfÜgung cyclin-ofhängeg kinase, ROCK VerfÜgung Rho- assoziéiert FAQ kinase, CCND1 VerfÜgung cyclin D1, ERBB2 VerfÜgung ERB-B2 receptor tyrosine kinase 2, EGFR VerfÜgung epidermal Wuesstem Faktor receptor, MYC VerfÜgung v-Myc Vullegripp myelocytomatosis Haren oncogene homolog, RTK VerfÜgung receptor tyrosine kinase. Aner Ofkierzungen wéi an Table 1 VerfÜgung Konklusiounen VerfÜgung D'ACRG GC genomics Projet globaalt charakteriséiert 300 Patient erhéijen mat longitudinal Suivi Medeziner Daten vun enger Kombinatioun vun WGS, ganzt-exome sequencing, CNV Analyse, cibléiert sequencing, an Gentherapie Ausdrock profiling Approche [10, 24]. Zesumme, hien huet d'Etude weider der heterogeneity vun GCs um molekulare a genetesch Niveauen, eng ëmfaassend mutational Landschaft etabléiert, a klinesch relevant molekulare bestemmt vun GC mat actionable oncogenic Automobilisten definéiert. An Tatsaach, fonnt mir dass ongeféier 80% vun GCs an dësem Koreanesch Kohort Hafe mannst ee klinesch relevant Frankräich änneren [10]. Heefegsten, klinesch relevant hire Restaurant Afloss Zell Zyklus /Wuesstem (p53 VerfÜgung, cyclin-ofhängeg kinase inhibitor 2A [CDKN2A VerfÜgung], CCND1 VerfÜgung, CCNE1 VerfÜgung, Aurora kinase A [AURKA VerfÜgung], cyclin-ofhängeg kinase 6 [CDK6 VerfÜgung], c VerfÜgung -Myc VerfÜgung, an TGFβR2 VerfÜgung); receptor tyrosine kinase (RTK) sécher (KRAS VerfÜgung, neuroblastoma RAS Haren oncogene homolog [NRAS VerfÜgung], kennegeléiert VerfÜgung, fibroblast Wuesstem Faktor receptor [FGFR VerfÜgung], EGFR VerfÜgung, ERBB2 VerfÜgung PTEN, VerfÜgung, PIK3CA VerfÜgung, an BRaf VerfÜgung); DNA Reparatur (Broscht Kriibs [BRCA VerfÜgung] 1/2 VerfÜgung, mutated esouguer telangiectasia [ophieft VerfÜgung], an MDM2 VerfÜgung); an epigenetics (ARID1A VerfÜgung, gemëscht-antike Leukämie FAQ 2 [MLL2 VerfÜgung], an DNA-methyltransferase 2A [DNMT2A VerfÜgung]). D'Identifikatioun vun onbekannt oncogenic Chauffeuren zu Kriibs huet d'Entwécklung vun enger neier Generatioun vu geziilte Kriibs Therapien, wéi EGFR tyrosine kinase inhibitors aktivéiert, wat d'Behandlung Praktiken fir eng Zuel vun Cancers dramatesch geännert hunn [34, 37]. Vill geziilte Kriibs Therapien dass dës Weeër Zil sinn entweder sinn fir aner Zeechen oder ënner fortgeschratt Medeziner Entwécklung. Déi Frankräich Conclusiounen aus dës Studie wäert d'Entwécklung vun effikass geziilte Therapien fir GCs informéieren an accéléréieren. Dës Frankräich Studien sinn och verständlech preclinical Studien op molekulare Mechanismen Basisdaten der pathobiology vun GC zu relevant Krankheet Modeller, wéi Patient-ofgeleet xenograft (PDX) Modeller [38] zu Promotioun erwaart. Dës preclinical a Krankheete Studie wäert weider eisem Verständnis vun GC Viraus an d'Entwécklung vu méi preziser diagnostic Approche a méi sécher, méi efficace Behandlung Optiounen Boost. Schlussendlech wäert personaliséiert Medezin benotzt ginn d'Resultater vun eenzelne GC Patienten ze verbesseren. Mir sinn am Moment zu enger neier, spannend Ära vun GC Fuerschung, dorënner Drogenofhängeger Entwécklung, well vun der rapid Fortschrëtt am Frankräich Technologien. VerfÜgung Deklaratioune VerfÜgung Auteuren 'Bäitrag zur VerfÜgung XSY un d'Konzept Kader dréit a Nerve der Virbereedung vun déi mëttelalterlech Handschrëft; CY derzou d'Konzept Kader vun der mëttelalterlech Handschrëft a bereet Table 1 an Referenzmaterial Lëscht; AA derzou d'Konzept Kader vun der mëttelalterlech Handschrëft a bereet Table 2; CR derzou d'Konzept Kader vun der mëttelalterlech Handschrëft; all Auteuren un der Virbereedung an Revisioun vun der mëttelalterlech Handschrëft. All Auteuren liesen an guttgeheescht der Finale mëttelalterlech Handschrëft. VerfÜgung Merci VerfÜgung Mir wéi géif Dr. Laura Benjamin an Dr. Sheng-Bin Peng Merci fir genau déi mëttelalterlech Handschrëft iwwer a fir hir wertvoll feedbacks liesen. VerfÜgung Wettsträit Interessen
d'Auteuren erklären, datt se keng Competitioun Interessen hunn VerfÜgung Open AccessThis Artikel ënnert de Bedingunge vun der Creative Commons Attribution 4.0 International Lizenz (http verdeelt ass:.. //creativecommons org /Lizenzen /déi /4. 0 /), déi bereet benotzen Genehmegungen, Distributioun, an Reproduktioun vun all mëttelgrouss, gëtt Iech passenden Kredit fir d'original Auteur (s) an d'Quell ginn, e Link fir d'Lizenz Creative Commons bidden, an weg wann Ännerungen gemaach goufen . Der Creative Commons Public Domain Engagement waiver (http:. //Creativecommons org /publicdomain /null /1. 0 /) zielt zu den Donnéeë vun dësem Artikel sinn gemaach, wann et net anescht dohinnergestallt VerfÜgung.

• Ausdrock vun multidrug Resistenz-verbonne Proteinen an hir Relatioun zu Thes individuell Chimiotherapie zu gastric cancer
• Feele vun Helicobacter pylori héich tetracycline resistent 16S rDNA AGA926-928TTC genotype zu gastric Fro uplanzen aus dyspeptic Patienten vun enger Stad an der Ariichtung vun São Paulo, Brasilien